
#######################################################
#                                                     #
#                        LGA                          #
#                  ---------------                    #
#                                                     #
#               Local-Global Alignment                #
#        A Method for Finding 3-D Similarities        #
#               in Protein Structures                 #
#                                                     #
#                  ------------ 10/2009               #
#                                                     #
#      Adam Zemla (adamz@llnl.gov)                    #
#      Lawrence Livermore National Laboratory, CA     #
#                                                     #
#######################################################

!!!   License for LGA program has expired  !!!
#   For updated version of the LGA program   #
# please contact Adam Zemla:  adamz@llnl.gov #

# Molecule1: number of CA atoms  159 ( 1222),  selected  131 , name one
# Molecule2: number of CA atoms  131 (  992),  selected  131 , name two
# PARAMETERS: input.pdb  -ie  -3  -d:4  -sda  -swap  -ch1:A  -ch2:A  
# FIXED Atom-Atom correspondence
# GDT and LCS analysis 

LCS - RMSD CUTOFF   5.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:   131       4_A - 151_A       1.59     1.59
  LCS_AVERAGE:    100.00

LCS - RMSD CUTOFF   2.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:   131       4_A - 151_A       1.59     1.59
  LCS_AVERAGE:    100.00

LCS - RMSD CUTOFF   1.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:    37      22_A - 58_A        0.96     1.81
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:    37      65_A - 118_A       0.94     1.63
  LCS_AVERAGE:     24.06

LCS_GDT    MOLECULE-1    MOLECULE-2     LCS_DETAILS     GDT_DETAILS                                                    TOTAL NUMBER OF RESIDUE PAIRS:  131
LCS_GDT     RESIDUE       RESIDUE       SEGMENT_SIZE    GLOBAL DISTANCE TEST COLUMNS: number of residues under the threshold assigned to each residue pair
LCS_GDT   NAME NUMBER   NAME NUMBER    1.0  2.0  5.0    0.5  1.0  1.5  2.0  2.5  3.0  3.5  4.0  4.5  5.0  5.5  6.0  6.5  7.0  7.5  8.0  8.5  9.0  9.5 10.0
LCS_GDT     E     4_A     E     4_A     13  131  131      3    3   37   71   90  106  123  124  129  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     K     5_A     K     5_A     15  131  131     18   86  103  117  120  122  125  127  129  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     T     6_A     T     6_A     15  131  131     59   90  105  117  120  122  125  127  129  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     V     7_A     V     7_A     15  131  131     59   90  105  117  120  122  125  127  129  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     Y     8_A     Y     8_A     15  131  131     59   90  105  117  120  122  125  127  129  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     G     9_A     G     9_A     15  131  131     59   90  105  117  120  122  125  127  129  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     L    10_A     L    10_A     15  131  131     59   90  105  117  120  122  125  127  129  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     N    11_A     N    11_A     15  131  131     59   90  105  117  120  122  125  127  129  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     E    12_A     E    12_A     15  131  131     59   90  105  117  120  122  125  127  129  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     Y    13_A     Y    13_A     15  131  131     59   90  105  117  120  122  125  127  129  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A    14_A     A    14_A     15  131  131     59   90  105  117  120  122  125  127  129  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A    15_A     A    15_A     15  131  131     59   90  105  117  120  122  125  127  129  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     L    16_A     L    16_A     15  131  131     40   90  105  117  120  122  125  127  129  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     D    17_A     D    17_A     28  131  131     22   90  105  117  120  122  125  127  129  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     G    18_A     G    18_A     28  131  131      7   27   84  113  120  122  125  127  129  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     I    19_A     I    19_A     28  131  131      4   14   51  112  120  122  125  127  129  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     N    20_A     N    20_A     28  131  131      4   14   64  112  120  122  125  127  129  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     L    21_A     L    21_A     28  131  131      4   62   99  117  120  122  125  127  129  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     E    22_A     E    22_A     37  131  131      4   46   96  117  120  122  125  127  129  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     V    23_A     V    23_A     37  131  131     59   90  105  117  120  122  125  127  129  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A    24_A     A    24_A     37  131  131     59   90  105  117  120  122  125  127  129  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A    25_A     A    25_A     37  131  131     59   90  105  117  120  122  125  127  129  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     K    26_A     K    26_A     37  131  131     59   90  105  117  120  122  125  127  129  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     L    27_A     L    27_A     37  131  131     59   90  105  117  120  122  125  127  129  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     D    28_A     D    28_A     37  131  131     59   90  105  117  120  122  125  127  129  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     T    29_A     T    29_A     37  131  131     59   90  105  117  120  122  125  127  129  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     G    30_A     G    30_A     37  131  131     59   90  105  117  120  122  125  127  129  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A    31_A     A    31_A     37  131  131     59   90  105  117  120  122  125  127  129  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     K    32_A     K    32_A     37  131  131     59   90  105  117  120  122  125  127  129  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     T    33_A     T    33_A     37  131  131     59   90  105  117  120  122  125  127  129  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A    34_A     A    34_A     37  131  131     59   90  105  117  120  122  125  127  129  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     S    35_A     S    35_A     37  131  131     59   90  105  117  120  122  125  127  129  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     L    36_A     L    36_A     37  131  131     57   90  105  117  120  122  125  127  129  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     S    37_A     S    37_A     37  131  131     52   90  105  117  120  122  125  127  129  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A    38_A     A    38_A     37  131  131     30   90  105  117  120  122  125  127  129  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     R    39_A     R    39_A     37  131  131     29   70  105  117  120  122  125  127  129  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     D    40_A     D    40_A     37  131  131     29   70  105  117  120  122  125  127  129  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     I    41_A     I    41_A     37  131  131     28   71  105  117  120  122  125  127  129  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     K    42_A     K    42_A     37  131  131     20   58  105  117  120  122  125  127  129  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     R    43_A     R    43_A     37  131  131     28   86  105  117  120  122  125  127  129  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     F    44_A     F    44_A     37  131  131     30   90  105  117  120  122  125  127  129  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     K    45_A     K    45_A     37  131  131     30   90  105  117  120  122  125  127  129  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     R    46_A     R    46_A     37  131  131     28   74  105  117  120  122  125  127  129  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     N    47_A     N    47_A     37  131  131     22   75  105  117  120  122  125  127  129  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     G    48_A     G    48_A     37  131  131     28   88  105  117  120  122  125  127  129  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     E    49_A     E    49_A     37  131  131     22   79  105  117  120  122  125  127  129  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     S    50_A     S    50_A     37  131  131     28   90  105  117  120  122  125  127  129  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     W    51_A     W    51_A     37  131  131     37   90  105  117  120  122  125  127  129  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     V    52_A     V    52_A     37  131  131     30   90  105  117  120  122  125  127  129  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     R    53_A     R    53_A     37  131  131     28   71  105  117  120  122  125  127  129  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     F    54_A     F    54_A     37  131  131     29   70  105  117  120  122  125  127  129  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     Y    55_A     Y    55_A     37  131  131     28   65   99  117  120  122  125  127  129  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     L    56_A     L    56_A     37  131  131     29   70  105  117  120  122  125  127  129  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A    57_A     A    57_A     37  131  131     29   75  105  117  120  122  125  127  129  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     I    58_A     I    58_A     37  131  131     24   80  105  117  120  122  125  127  129  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     D    59_A     D    59_A      4  131  131      3    4    4    5   42   62  115  127  129  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A    60_A     A    60_A      4  131  131      6   29   56  105  118  122  125  127  129  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A    61_A     A    61_A      5  131  131      3    6    7   18   69  106  121  126  129  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     H    62_A     H    62_A      5  131  131      3    6   35   88  112  120  125  127  129  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     S    63_A     S    63_A     20  131  131      3   33   60   93  114  121  125  127  129  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     H    64_A     H    64_A     20  131  131      4   13   43   70   87  113  124  127  129  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     P    65_A     P    65_A     37  131  131     12   42   72   96  118  122  125  127  129  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     I    66_A     I    66_A     37  131  131     28   69  105  117  120  122  125  127  129  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     E    67_A     E    67_A     37  131  131     29   72  105  117  120  122  125  127  129  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     R    68_A     R    68_A     37  131  131     30   86  105  117  120  122  125  127  129  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     P    69_A     P    69_A     37  131  131     48   90  105  117  120  122  125  127  129  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     L    70_A     L    70_A     37  131  131     49   90  105  117  120  122  125  127  129  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A    71_A     A    71_A     37  131  131     59   90  105  117  120  122  125  127  129  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     R    72_A     R    72_A     37  131  131     59   90  105  117  120  122  125  127  129  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     V    73_A     V    73_A     37  131  131     59   90  105  117  120  122  125  127  129  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     S    74_A     S    74_A     37  131  131     54   90  105  117  120  122  125  127  129  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     K    75_A     K    75_A     37  131  131     54   90  105  117  120  122  125  127  129  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A    93_A     A    93_A     37  131  131     28   90  105  117  120  122  125  127  129  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     R    94_A     R    94_A     37  131  131     49   90  105  117  120  122  125  127  129  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     P    95_A     P    95_A     37  131  131     59   90  105  117  120  122  125  127  129  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     V    96_A     V    96_A     37  131  131     59   90  105  117  120  122  125  127  129  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     I    97_A     I    97_A     37  131  131     45   90  105  117  120  122  125  127  129  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     E    98_A     E    98_A     37  131  131     45   90  105  117  120  122  125  127  129  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     L    99_A     L    99_A     37  131  131     59   90  105  117  120  122  125  127  129  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     D   100_A     D   100_A     37  131  131     59   90  105  117  120  122  125  127  129  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     I   101_A     I   101_A     37  131  131     59   90  105  117  120  122  125  127  129  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     C   102_A     C   102_A     37  131  131     59   90  105  117  120  122  125  127  129  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     M   103_A     M   103_A     37  131  131     59   90  105  117  120  122  125  127  129  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     G   104_A     G   104_A     37  131  131     59   90  105  117  120  122  125  127  129  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     S   105_A     S   105_A     37  131  131     59   90  105  117  120  122  125  127  129  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A   106_A     A   106_A     37  131  131     59   90  105  117  120  122  125  127  129  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     M   107_A     M   107_A     37  131  131     59   90  105  117  120  122  125  127  129  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     R   108_A     R   108_A     37  131  131     59   90  105  117  120  122  125  127  129  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     S   109_A     S   109_A     37  131  131     59   90  105  117  120  122  125  127  129  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     I   110_A     I   110_A     37  131  131     32   90  105  117  120  122  125  127  129  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     E   111_A     E   111_A     37  131  131     55   90  105  117  120  122  125  127  129  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     V   112_A     V   112_A     37  131  131     59   90  105  117  120  122  125  127  129  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     N   113_A     N   113_A     37  131  131     59   90  105  117  120  122  125  127  129  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     L   114_A     L   114_A     37  131  131     52   90  105  117  120  122  125  127  129  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     T   115_A     T   115_A     37  131  131     30   90  105  117  120  122  125  127  129  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     D   116_A     D   116_A     37  131  131     31   90  105  117  120  122  125  127  129  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     R   117_A     R   117_A     37  131  131      3   77  104  117  120  122  125  127  129  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     S   118_A     S   118_A     37  131  131     59   88  103  117  120  122  125  127  129  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A   119_A     A   119_A     35  131  131      3    3    4    7   12   86  116  127  129  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     F   120_A     F   120_A      4  131  131      3    4   38   65  115  121  125  127  129  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     Q   121_A     Q   121_A     31  131  131      4   16   61  105  118  122  125  127  129  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     Y   122_A     Y   122_A     31  131  131     45   87  104  117  120  122  125  127  129  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     P   123_A     P   123_A     31  131  131     53   90  105  117  120  122  125  127  129  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     L   124_A     L   124_A     31  131  131     59   90  105  117  120  122  125  127  129  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     L   125_A     L   125_A     31  131  131     59   90  105  117  120  122  125  127  129  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     I   126_A     I   126_A     31  131  131     59   90  105  117  120  122  125  127  129  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     G   127_A     G   127_A     31  131  131     59   90  105  117  120  122  125  127  129  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     S   128_A     S   128_A     31  131  131     59   90  105  117  120  122  125  127  129  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     E   129_A     E   129_A     31  131  131     59   90  105  117  120  122  125  127  129  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A   130_A     A   130_A     31  131  131     59   90  105  117  120  122  125  127  129  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     L   131_A     L   131_A     31  131  131     59   90  105  117  120  122  125  127  129  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     K   132_A     K   132_A     31  131  131     59   90  105  117  120  122  125  127  129  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     R   133_A     R   133_A     31  131  131     50   90  105  117  120  122  125  127  129  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     F   134_A     F   134_A     31  131  131     59   90  105  117  120  122  125  127  129  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     D   135_A     D   135_A     31  131  131     59   90  105  117  120  122  125  127  129  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A   136_A     A   136_A     31  131  131     59   90  105  117  120  122  125  127  129  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     L   137_A     L   137_A     31  131  131     59   90  105  117  120  122  125  127  129  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     V   138_A     V   138_A     31  131  131     59   90  105  117  120  122  125  127  129  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     D   139_A     D   139_A     31  131  131     59   90  105  117  120  122  125  127  129  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     P   140_A     P   140_A     31  131  131     50   90  105  117  120  122  125  127  129  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     S   141_A     S   141_A     31  131  131     50   90  105  117  120  122  125  127  129  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     L   142_A     L   142_A     31  131  131     59   90  105  117  120  122  125  127  129  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     K   143_A     K   143_A     31  131  131     59   90  105  117  120  122  125  127  129  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     Y   144_A     Y   144_A     31  131  131     59   90  105  117  120  122  125  127  129  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A   145_A     A   145_A     31  131  131     59   90  105  117  120  122  125  127  129  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A   146_A     A   146_A     31  131  131     58   90  105  117  120  122  125  127  129  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     G   147_A     G   147_A     31  131  131     59   90  105  117  120  122  125  127  129  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     K   148_A     K   148_A     31  131  131     59   90  105  117  120  122  125  127  129  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     P   149_A     P   149_A     31  131  131     59   90  105  117  120  122  125  127  129  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A   150_A     A   150_A     31  131  131     59   88  104  117  120  122  125  127  129  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     C   151_A     C   151_A     31  131  131     59   90  105  117  120  122  125  127  129  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_AVERAGE  LCS_A:  74.69  (  24.06  100.00  100.00 )

GLOBAL_DISTANCE_TEST (summary information about detected largest sets of residues (represented by selected AToms) that can fit under specified thresholds)
GDT DIST_CUTOFF  0.50   1.00   1.50   2.00   2.50   3.00   3.50   4.00   4.50   5.00   5.50   6.00   6.50   7.00   7.50   8.00   8.50   9.00   9.50  10.00
GDT NUMBER_AT     59     90    105    117    120    122    125    127    129    131    131    131    131    131    131    131    131    131    131    131 
GDT PERCENT_AT  45.04  68.70  80.15  89.31  91.60  93.13  95.42  96.95  98.47 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00
GDT RMS_LOCAL    0.31   0.57   0.80   0.97   1.07   1.13   1.25   1.36   1.48   1.59   1.59   1.59   1.59   1.59   1.59   1.59   1.59   1.59   1.59   1.59
GDT RMS_ALL_AT   2.00   1.69   1.60   1.60   1.61   1.61   1.60   1.59   1.59   1.59   1.59   1.59   1.59   1.59   1.59   1.59   1.59   1.59   1.59   1.59

# Checking swapping
#   possible swapping detected:  E    12_A      E    12_A
#   possible swapping detected:  D    59_A      D    59_A
#   possible swapping detected:  E    67_A      E    67_A
#   possible swapping detected:  E    98_A      E    98_A
#   possible swapping detected:  F   120_A      F   120_A
#   possible swapping detected:  Y   122_A      Y   122_A

#      Molecule1      Molecule2  DISTANCE    Mis    MC     All    Dist_max   GDC_mc  GDC_all
LGA    E     4_A      E     4_A     4.855     4    0.441   0.429     6.373   42.024   20.582
LGA    K     5_A      K     5_A     1.910     0    0.132   0.671     3.611   67.143   61.058
LGA    T     6_A      T     6_A     1.077     0    0.068   0.117     1.284   81.429   81.429
LGA    V     7_A      V     7_A     1.000     0    0.019   0.052     1.120   88.214   85.306
LGA    Y     8_A      Y     8_A     0.463     0    0.060   0.130     1.062   95.238   91.310
LGA    G     9_A      G     9_A     0.646     0    0.033   0.033     0.646   95.238   95.238
LGA    L    10_A      L    10_A     0.311     0    0.014   1.372     3.181  100.000   83.095
LGA    N    11_A      N    11_A     0.220     0    0.032   1.106     2.626  100.000   91.250
LGA    E    12_A      E    12_A     0.285     0    0.035   0.115     0.629   95.238   97.884
LGA    Y    13_A      Y    13_A     0.859     0    0.010   0.125     3.180   90.476   74.206
LGA    A    14_A      A    14_A     0.542     0    0.126   0.176     0.698   90.476   92.381
LGA    A    15_A      A    15_A     1.067     0    0.020   0.020     1.200   88.214   86.857
LGA    L    16_A      L    16_A     0.640     0    0.081   0.992     3.729   95.238   83.631
LGA    D    17_A      D    17_A     0.695     0    0.066   0.236     1.748   86.190   90.774
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LGA    Y   122_A      Y   122_A     1.527     0    0.033   0.284     1.991   77.143   82.262
LGA    P   123_A      P   123_A     0.550     0    0.073   0.347     1.222   90.476   87.891
LGA    L   124_A      L   124_A     0.615     0    0.059   0.123     0.807   90.476   90.476
LGA    L   125_A      L   125_A     0.678     0    0.052   0.076     0.930   90.476   90.476
LGA    I   126_A      I   126_A     0.471     0    0.005   0.593     1.897   97.619   94.226
LGA    G   127_A      G   127_A     0.475     0    0.035   0.035     0.524   97.619   97.619
LGA    S   128_A      S   128_A     0.366     0    0.030   0.065     0.395  100.000  100.000
LGA    E   129_A      E   129_A     0.324     0    0.027   0.992     3.982  100.000   85.026
LGA    A   130_A      A   130_A     0.202     0    0.044   0.049     0.417  100.000  100.000
LGA    L   131_A      L   131_A     0.298     0    0.029   0.054     0.434  100.000  100.000
LGA    K   132_A      K   132_A     0.346     0    0.018   0.782     2.300   95.238   88.995
LGA    R   133_A      R   133_A     0.851     0    0.046   1.084     3.865   90.476   80.823
LGA    F   134_A      F   134_A     0.902     0    0.044   0.138     1.209   85.952   88.831
LGA    D   135_A      D   135_A     1.047     0    0.043   0.331     2.042   81.548   78.333
LGA    A   136_A      A   136_A     0.877     0    0.068   0.076     1.090   88.214   88.667
LGA    L   137_A      L   137_A     0.978     0    0.042   0.262     2.594   90.476   80.774
LGA    V   138_A      V   138_A     0.757     0    0.015   0.049     1.137   88.214   89.184
LGA    D   139_A      D   139_A     0.940     0    0.037   0.092     1.299   90.476   87.083
LGA    P   140_A      P   140_A     1.217     0    0.034   0.076     1.628   81.429   78.980
LGA    S   141_A      S   141_A     1.072     0    0.097   0.148     1.399   81.429   81.429
LGA    L   142_A      L   142_A     0.711     0    0.022   0.056     0.901   90.476   90.476
LGA    K   143_A      K   143_A     0.420     0    0.048   0.685     2.977  100.000   90.000
LGA    Y   144_A      Y   144_A     0.552     0    0.044   0.107     1.523   92.857   86.786
LGA    A   145_A      A   145_A     0.578     0    0.034   0.039     1.046   90.595   90.571
LGA    A   146_A      A   146_A     1.007     0    0.028   0.039     1.214   83.690   85.048
LGA    G   147_A      G   147_A     1.079     0    0.024   0.024     1.079   83.690   83.690
LGA    K   148_A      K   148_A     1.156     4    0.018   0.019     1.261   81.429   45.238
LGA    P   149_A      P   149_A     1.121     0    0.037   0.040     1.441   81.429   81.429
LGA    A   150_A      A   150_A     1.659     0    0.188   0.184     1.964   77.143   76.286
LGA    C   151_A      C   151_A     1.373     0    0.540   0.603     1.679   79.286   80.000

# RMSD_GDC results:       CA      MC common percent     ALL common percent   GDC_mc  GDC_all
NUMBER_OF_ATOMS_AA:      131     524    524  100.00     992    992  100.00               131
SUMMARY(RMSD_GDC):     1.585          1.577                  2.258           83.290   77.924

#CA            N1   N2   DIST      N    RMSD    GDT_TS    LGA_S3     LGA_Q 
SUMMARY(GDT)  159  131    4.0    127    1.36    88.740    93.830     8.684

LGA_LOCAL      RMSD:   1.362  Number of atoms:  127  under DIST:   4.00
LGA_ASGN_ATOMS RMSD:   1.588  Number of assigned atoms:  131 
Std_ASGN_ATOMS RMSD:   1.585  Standard rmsd on all 131 assigned CA atoms 

Unitary ROTATION matrix and the SHIFT vector superimpose molecules  (1=>2)
  X_new =   0.961043 * X  +   0.276216 * Y  +  -0.010031 * Z  + -27.526442
  Y_new =   0.154648 * X  +  -0.507280 * Y  +   0.847792 * Z  +  27.420794
  Z_new =   0.229085 * X  +  -0.816316 * Y  +  -0.530234 * Z  +   3.666003 

Euler angles from the ROTATION matrix. Conventions XYZ and ZXZ:
           Phi     Theta       Psi   [DEG:       Phi     Theta       Psi ]
XYZ:  0.159549 -0.231137 -2.146851   [DEG:    9.1415  -13.2432 -123.0055 ]
ZXZ: -3.129761  2.129673  2.867998   [DEG: -179.3221  122.0213  164.3242 ]
 
# END of job
