
#######################################################
#                                                     #
#                        LGA                          #
#                  ---------------                    #
#                                                     #
#               Local-Global Alignment                #
#        A Method for Finding 3-D Similarities        #
#               in Protein Structures                 #
#                                                     #
#                  ------------ 10/2009               #
#                                                     #
#      Adam Zemla (adamz@llnl.gov)                    #
#      Lawrence Livermore National Laboratory, CA     #
#                                                     #
#######################################################

!!!   License for LGA program has expired  !!!
#   For updated version of the LGA program   #
# please contact Adam Zemla:  adamz@llnl.gov #

# Molecule1: number of CA atoms  159 ( 1222),  selected  131 , name one
# Molecule2: number of CA atoms  131 (  992),  selected  131 , name two
# PARAMETERS: input.pdb  -ie  -3  -d:4  -sda  -swap  -ch1:A  -ch2:A  
# FIXED Atom-Atom correspondence
# GDT and LCS analysis 

LCS - RMSD CUTOFF   5.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:   131       4_A - 151_A       1.57     1.57
  LCS_AVERAGE:    100.00

LCS - RMSD CUTOFF   2.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:   131       4_A - 151_A       1.57     1.57
  LCS_AVERAGE:    100.00

LCS - RMSD CUTOFF   1.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:    39       6_A - 44_A        0.99     1.80
  LCS_AVERAGE:     26.74

LCS_GDT    MOLECULE-1    MOLECULE-2     LCS_DETAILS     GDT_DETAILS                                                    TOTAL NUMBER OF RESIDUE PAIRS:  131
LCS_GDT     RESIDUE       RESIDUE       SEGMENT_SIZE    GLOBAL DISTANCE TEST COLUMNS: number of residues under the threshold assigned to each residue pair
LCS_GDT   NAME NUMBER   NAME NUMBER    1.0  2.0  5.0    0.5  1.0  1.5  2.0  2.5  3.0  3.5  4.0  4.5  5.0  5.5  6.0  6.5  7.0  7.5  8.0  8.5  9.0  9.5 10.0
LCS_GDT     E     4_A     E     4_A     12  131  131      3    3   12   50   86  104  121  124  128  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     K     5_A     K     5_A     34  131  131     40   86  105  117  120  122  125  128  129  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     T     6_A     T     6_A     39  131  131     60   91  108  117  120  122  125  128  129  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     V     7_A     V     7_A     39  131  131     60   91  108  117  120  122  125  128  129  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     Y     8_A     Y     8_A     39  131  131     60   91  108  117  120  122  125  128  129  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     G     9_A     G     9_A     39  131  131     58   91  108  117  120  122  125  128  129  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     L    10_A     L    10_A     39  131  131     60   91  108  117  120  122  125  128  129  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     N    11_A     N    11_A     39  131  131     60   91  108  117  120  122  125  128  129  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     E    12_A     E    12_A     39  131  131     60   91  108  117  120  122  125  128  129  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     Y    13_A     Y    13_A     39  131  131     60   91  108  117  120  122  125  128  129  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A    14_A     A    14_A     39  131  131     60   91  108  117  120  122  125  128  129  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A    15_A     A    15_A     39  131  131     60   91  108  117  120  122  125  128  129  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     L    16_A     L    16_A     39  131  131     45   91  108  117  120  122  125  128  129  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     D    17_A     D    17_A     39  131  131     24   91  108  117  120  122  125  128  129  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     G    18_A     G    18_A     39  131  131      4    7   78  115  120  122  125  128  129  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     I    19_A     I    19_A     39  131  131      4    7   30  115  120  122  125  128  129  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     N    20_A     N    20_A     39  131  131      3    7   65  115  120  122  125  128  129  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     L    21_A     L    21_A     39  131  131      5   68  106  117  120  122  125  128  129  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     E    22_A     E    22_A     39  131  131      9   58  106  117  120  122  125  128  129  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     V    23_A     V    23_A     39  131  131     60   91  108  117  120  122  125  128  129  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A    24_A     A    24_A     39  131  131     60   91  108  117  120  122  125  128  129  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A    25_A     A    25_A     39  131  131     60   91  108  117  120  122  125  128  129  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     K    26_A     K    26_A     39  131  131     60   91  108  117  120  122  125  128  129  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     L    27_A     L    27_A     39  131  131     60   91  108  117  120  122  125  128  129  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     D    28_A     D    28_A     39  131  131     60   91  108  117  120  122  125  128  129  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     T    29_A     T    29_A     39  131  131     60   91  108  117  120  122  125  128  129  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     G    30_A     G    30_A     39  131  131     60   91  108  117  120  122  125  128  129  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A    31_A     A    31_A     39  131  131     60   91  108  117  120  122  125  128  129  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     K    32_A     K    32_A     39  131  131     60   91  108  117  120  122  125  128  129  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     T    33_A     T    33_A     39  131  131     60   91  108  117  120  122  125  128  129  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A    34_A     A    34_A     39  131  131     60   91  108  117  120  122  125  128  129  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     S    35_A     S    35_A     39  131  131     60   91  108  117  120  122  125  128  129  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     L    36_A     L    36_A     39  131  131     59   91  108  117  120  122  125  128  129  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     S    37_A     S    37_A     39  131  131     53   91  108  117  120  122  125  128  129  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A    38_A     A    38_A     39  131  131     33   91  108  117  120  122  125  128  129  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     R    39_A     R    39_A     39  131  131     31   75  108  117  120  122  125  128  129  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     D    40_A     D    40_A     39  131  131     31   75  108  117  120  122  125  128  129  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     I    41_A     I    41_A     39  131  131     28   77  108  117  120  122  125  128  129  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     K    42_A     K    42_A     39  131  131     20   61  108  117  120  122  125  128  129  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     R    43_A     R    43_A     39  131  131     28   91  108  117  120  122  125  128  129  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     F    44_A     F    44_A     39  131  131     31   91  108  117  120  122  125  128  129  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     K    45_A     K    45_A     38  131  131     31   91  108  117  120  122  125  128  129  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     R    46_A     R    46_A     38  131  131     28   81  108  117  120  122  125  128  129  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     N    47_A     N    47_A     38  131  131     22   78  108  117  120  122  125  128  129  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     G    48_A     G    48_A     38  131  131     27   90  108  117  120  122  125  128  129  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     E    49_A     E    49_A     38  131  131     21   87  108  117  120  122  125  128  129  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     S    50_A     S    50_A     38  131  131     30   91  108  117  120  122  125  128  129  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     W    51_A     W    51_A     38  131  131     39   91  108  117  120  122  125  128  129  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     V    52_A     V    52_A     38  131  131     33   91  108  117  120  122  125  128  129  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     R    53_A     R    53_A     38  131  131     28   75  108  117  120  122  125  128  129  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     F    54_A     F    54_A     38  131  131     31   75  108  117  120  122  125  128  129  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     Y    55_A     Y    55_A     38  131  131     28   69  104  117  120  122  125  128  129  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     L    56_A     L    56_A     38  131  131     31   75  108  117  120  122  125  128  129  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A    57_A     A    57_A     38  131  131     33   85  108  117  120  122  125  128  129  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     I    58_A     I    58_A     38  131  131     27   87  108  117  120  122  125  128  129  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     D    59_A     D    59_A      4  131  131      3    3    4    5    8   59   83  127  129  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A    60_A     A    60_A      4  131  131      3   26   53   89  114  121  125  128  129  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A    61_A     A    61_A      5  131  131      3    5    7   20   26   93  122  125  129  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     H    62_A     H    62_A      5  131  131      3    5   12   57  113  120  125  128  129  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     S    63_A     S    63_A     21  131  131      3   42   65   99  115  122  125  128  129  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     H    64_A     H    64_A     21  131  131      4   22   54   72   99  119  124  128  129  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     P    65_A     P    65_A     37  131  131     13   43   73  104  119  122  125  128  129  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     I    66_A     I    66_A     37  131  131     28   72  108  117  120  122  125  128  129  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     E    67_A     E    67_A     37  131  131     33   77  108  117  120  122  125  128  129  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     R    68_A     R    68_A     37  131  131     33   90  108  117  120  122  125  128  129  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     P    69_A     P    69_A     37  131  131     52   91  108  117  120  122  125  128  129  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     L    70_A     L    70_A     37  131  131     50   91  108  117  120  122  125  128  129  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A    71_A     A    71_A     37  131  131     60   91  108  117  120  122  125  128  129  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     R    72_A     R    72_A     37  131  131     60   91  108  117  120  122  125  128  129  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     V    73_A     V    73_A     37  131  131     59   91  108  117  120  122  125  128  129  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     S    74_A     S    74_A     37  131  131     57   91  108  117  120  122  125  128  129  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     K    75_A     K    75_A     37  131  131     57   91  108  117  120  122  125  128  129  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A    93_A     A    93_A     37  131  131     39   91  108  117  120  122  125  128  129  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     R    94_A     R    94_A     37  131  131     53   91  108  117  120  122  125  128  129  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     P    95_A     P    95_A     37  131  131     59   91  108  117  120  122  125  128  129  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     V    96_A     V    96_A     37  131  131     60   91  108  117  120  122  125  128  129  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     I    97_A     I    97_A     37  131  131     48   91  108  117  120  122  125  128  129  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     E    98_A     E    98_A     37  131  131     40   91  108  117  120  122  125  128  129  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     L    99_A     L    99_A     37  131  131     60   91  108  117  120  122  125  128  129  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     D   100_A     D   100_A     37  131  131     59   91  108  117  120  122  125  128  129  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     I   101_A     I   101_A     37  131  131     60   91  108  117  120  122  125  128  129  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     C   102_A     C   102_A     37  131  131     60   91  108  117  120  122  125  128  129  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     M   103_A     M   103_A     37  131  131     60   91  108  117  120  122  125  128  129  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     G   104_A     G   104_A     37  131  131     60   91  108  117  120  122  125  128  129  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     S   105_A     S   105_A     37  131  131     60   91  108  117  120  122  125  128  129  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A   106_A     A   106_A     37  131  131     60   91  108  117  120  122  125  128  129  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     M   107_A     M   107_A     37  131  131     60   91  108  117  120  122  125  128  129  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     R   108_A     R   108_A     37  131  131     60   91  108  117  120  122  125  128  129  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     S   109_A     S   109_A     37  131  131     60   91  108  117  120  122  125  128  129  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     I   110_A     I   110_A     37  131  131     37   91  108  117  120  122  125  128  129  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     E   111_A     E   111_A     37  131  131     58   91  108  117  120  122  125  128  129  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     V   112_A     V   112_A     37  131  131     60   91  108  117  120  122  125  128  129  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     N   113_A     N   113_A     37  131  131     60   91  108  117  120  122  125  128  129  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     L   114_A     L   114_A     37  131  131     53   91  108  117  120  122  125  128  129  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     T   115_A     T   115_A     37  131  131     31   91  108  117  120  122  125  128  129  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     D   116_A     D   116_A     37  131  131     35   91  108  117  120  122  125  128  129  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     R   117_A     R   117_A     37  131  131      3   78  107  117  120  122  125  128  129  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     S   118_A     S   118_A     37  131  131     60   89  106  117  120  122  125  128  129  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A   119_A     A   119_A     36  131  131      3    4    4    7   13   87  124  128  129  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     F   120_A     F   120_A     32  131  131      3   24   43   69  115  122  125  128  129  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     Q   121_A     Q   121_A     32  131  131      3   16   43  104  118  122  125  128  129  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     Y   122_A     Y   122_A     32  131  131     23   89  107  117  120  122  125  128  129  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     P   123_A     P   123_A     32  131  131     58   91  108  117  120  122  125  128  129  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     L   124_A     L   124_A     32  131  131     60   91  108  117  120  122  125  128  129  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     L   125_A     L   125_A     32  131  131     60   91  108  117  120  122  125  128  129  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     I   126_A     I   126_A     32  131  131     60   91  108  117  120  122  125  128  129  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     G   127_A     G   127_A     32  131  131     60   91  108  117  120  122  125  128  129  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     S   128_A     S   128_A     32  131  131     60   91  108  117  120  122  125  128  129  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     E   129_A     E   129_A     32  131  131     60   91  108  117  120  122  125  128  129  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A   130_A     A   130_A     32  131  131     60   91  108  117  120  122  125  128  129  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     L   131_A     L   131_A     32  131  131     60   91  108  117  120  122  125  128  129  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     K   132_A     K   132_A     32  131  131     60   91  108  117  120  122  125  128  129  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     R   133_A     R   133_A     32  131  131     57   91  108  117  120  122  125  128  129  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     F   134_A     F   134_A     32  131  131     60   91  108  117  120  122  125  128  129  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     D   135_A     D   135_A     32  131  131     60   91  108  117  120  122  125  128  129  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A   136_A     A   136_A     32  131  131     60   91  108  117  120  122  125  128  129  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     L   137_A     L   137_A     32  131  131     60   91  108  117  120  122  125  128  129  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     V   138_A     V   138_A     32  131  131     60   91  108  117  120  122  125  128  129  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     D   139_A     D   139_A     32  131  131     60   91  108  117  120  122  125  128  129  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     P   140_A     P   140_A     32  131  131     47   91  108  117  120  122  125  128  129  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     S   141_A     S   141_A     32  131  131     50   91  108  117  120  122  125  128  129  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     L   142_A     L   142_A     32  131  131     60   91  108  117  120  122  125  128  129  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     K   143_A     K   143_A     32  131  131     60   91  108  117  120  122  125  128  129  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     Y   144_A     Y   144_A     32  131  131     60   91  108  117  120  122  125  128  129  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A   145_A     A   145_A     32  131  131     60   91  108  117  120  122  125  128  129  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A   146_A     A   146_A     32  131  131     60   91  108  117  120  122  125  128  129  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     G   147_A     G   147_A     32  131  131     60   91  108  117  120  122  125  128  129  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     K   148_A     K   148_A     32  131  131     60   91  108  117  120  122  125  128  129  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     P   149_A     P   149_A     32  131  131     60   91  108  117  120  122  125  128  129  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A   150_A     A   150_A     32  131  131     60   91  107  117  120  122  125  128  129  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     C   151_A     C   151_A     32  131  131     60   91  107  117  120  122  125  128  129  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_AVERAGE  LCS_A:  75.58  (  26.74  100.00  100.00 )

GLOBAL_DISTANCE_TEST (summary information about detected largest sets of residues (represented by selected AToms) that can fit under specified thresholds)
GDT DIST_CUTOFF  0.50   1.00   1.50   2.00   2.50   3.00   3.50   4.00   4.50   5.00   5.50   6.00   6.50   7.00   7.50   8.00   8.50   9.00   9.50  10.00
GDT NUMBER_AT     60     91    108    117    120    122    125    128    129    131    131    131    131    131    131    131    131    131    131    131 
GDT PERCENT_AT  45.80  69.47  82.44  89.31  91.60  93.13  95.42  97.71  98.47 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00
GDT RMS_LOCAL    0.31   0.56   0.82   0.92   1.01   1.08   1.21   1.37   1.44   1.57   1.57   1.57   1.57   1.57   1.57   1.57   1.57   1.57   1.57   1.57
GDT RMS_ALL_AT   1.94   1.66   1.58   1.58   1.59   1.59   1.58   1.57   1.57   1.57   1.57   1.57   1.57   1.57   1.57   1.57   1.57   1.57   1.57   1.57

# Checking swapping
#   possible swapping detected:  E    12_A      E    12_A
#   possible swapping detected:  D    59_A      D    59_A
#   possible swapping detected:  E    67_A      E    67_A
#   possible swapping detected:  E    98_A      E    98_A
#   possible swapping detected:  F   120_A      F   120_A
#   possible swapping detected:  Y   122_A      Y   122_A

#      Molecule1      Molecule2  DISTANCE    Mis    MC     All    Dist_max   GDC_mc  GDC_all
LGA    E     4_A      E     4_A     5.146     4    0.432   0.421     6.772   37.500   18.148
LGA    K     5_A      K     5_A     1.924     0    0.144   0.665     3.436   67.143   62.593
LGA    T     6_A      T     6_A     1.092     0    0.065   0.128     1.288   81.429   81.429
LGA    V     7_A      V     7_A     1.009     0    0.023   0.074     1.095   85.952   84.014
LGA    Y     8_A      Y     8_A     0.508     0    0.060   0.129     1.069   92.857   89.762
LGA    G     9_A      G     9_A     0.628     0    0.036   0.036     0.628   95.238   95.238
LGA    L    10_A      L    10_A     0.231     0    0.023   1.377     3.215  100.000   83.095
LGA    N    11_A      N    11_A     0.141     0    0.031   0.959     2.701  100.000   92.321
LGA    E    12_A      E    12_A     0.283     0    0.043   0.117     0.588   97.619   98.942
LGA    Y    13_A      Y    13_A     0.858     0    0.008   0.102     2.929   90.476   75.476
LGA    A    14_A      A    14_A     0.607     0    0.104   0.144     0.746   90.476   92.381
LGA    A    15_A      A    15_A     1.047     0    0.019   0.019     1.162   85.952   85.048
LGA    L    16_A      L    16_A     0.657     0    0.088   0.991     3.648   95.238   83.631
LGA    D    17_A      D    17_A     0.662     0    0.064   0.271     1.743   86.190   90.714
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LGA    Y   122_A      Y   122_A     1.511     0    0.038   0.331     1.976   77.143   83.770
LGA    P   123_A      P   123_A     0.550     0    0.067   0.343     1.282   90.476   87.891
LGA    L   124_A      L   124_A     0.601     0    0.055   0.122     0.788   90.476   90.476
LGA    L   125_A      L   125_A     0.683     0    0.052   0.080     0.951   90.476   90.476
LGA    I   126_A      I   126_A     0.455     0    0.006   0.598     1.894   97.619   94.226
LGA    G   127_A      G   127_A     0.470     0    0.036   0.036     0.556   97.619   97.619
LGA    S   128_A      S   128_A     0.361     0    0.028   0.062     0.399  100.000  100.000
LGA    E   129_A      E   129_A     0.327     0    0.026   0.985     3.990  100.000   85.026
LGA    A   130_A      A   130_A     0.241     0    0.041   0.050     0.440  100.000  100.000
LGA    L   131_A      L   131_A     0.314     0    0.026   0.059     0.467  100.000  100.000
LGA    K   132_A      K   132_A     0.333     0    0.021   0.782     2.253   95.238   88.995
LGA    R   133_A      R   133_A     0.849     0    0.053   1.092     3.920   90.476   80.173
LGA    F   134_A      F   134_A     0.902     0    0.038   0.167     1.205   85.952   88.831
LGA    D   135_A      D   135_A     1.036     0    0.037   0.307     2.024   83.690   79.405
LGA    A   136_A      A   136_A     0.894     0    0.063   0.068     1.062   88.214   88.667
LGA    L   137_A      L   137_A     0.969     0    0.039   0.236     2.464   90.476   81.726
LGA    V   138_A      V   138_A     0.730     0    0.015   0.080     1.158   88.214   90.544
LGA    D   139_A      D   139_A     0.934     0    0.029   0.083     1.322   90.476   87.083
LGA    P   140_A      P   140_A     1.200     0    0.034   0.086     1.633   81.429   78.980
LGA    S   141_A      S   141_A     1.060     0    0.088   0.145     1.311   81.429   81.429
LGA    L   142_A      L   142_A     0.695     0    0.023   0.052     0.969   90.476   90.476
LGA    K   143_A      K   143_A     0.369     0    0.054   0.666     2.797  100.000   91.005
LGA    Y   144_A      Y   144_A     0.529     0    0.051   0.107     1.328   92.857   88.254
LGA    A   145_A      A   145_A     0.573     0    0.020   0.024     1.083   90.595   90.571
LGA    A   146_A      A   146_A     0.998     0    0.026   0.037     1.181   85.952   86.857
LGA    G   147_A      G   147_A     1.066     0    0.023   0.023     1.066   83.690   83.690
LGA    K   148_A      K   148_A     1.116     4    0.026   0.024     1.193   81.429   45.238
LGA    P   149_A      P   149_A     1.044     0    0.040   0.043     1.359   81.429   82.721
LGA    A   150_A      A   150_A     1.519     0    0.144   0.143     1.750   79.286   78.000
LGA    C   151_A      C   151_A     1.527     0    0.542   0.588     1.765   77.262   80.159

# RMSD_GDC results:       CA      MC common percent     ALL common percent   GDC_mc  GDC_all
NUMBER_OF_ATOMS_AA:      131     524    524  100.00     992    992  100.00               131
SUMMARY(RMSD_GDC):     1.568          1.563                  2.239           83.760   78.544

#CA            N1   N2   DIST      N    RMSD    GDT_TS    LGA_S3     LGA_Q 
SUMMARY(GDT)  159  131    4.0    128    1.37    89.122    94.101     8.712

LGA_LOCAL      RMSD:   1.369  Number of atoms:  128  under DIST:   4.00
LGA_ASGN_ATOMS RMSD:   1.573  Number of assigned atoms:  131 
Std_ASGN_ATOMS RMSD:   1.568  Standard rmsd on all 131 assigned CA atoms 

Unitary ROTATION matrix and the SHIFT vector superimpose molecules  (1=>2)
  X_new =   0.936487 * X  +   0.346411 * Y  +  -0.054689 * Z  + -27.439390
  Y_new =   0.210877 * X  +  -0.431621 * Y  +   0.877060 * Z  +  27.729944
  Z_new =   0.280218 * X  +  -0.832888 * Y  +  -0.477258 * Z  +   3.701569 

Euler angles from the ROTATION matrix. Conventions XYZ and ZXZ:
           Phi     Theta       Psi   [DEG:       Phi     Theta       Psi ]
XYZ:  0.221485 -0.284021 -2.091138   [DEG:   12.6901  -16.2732 -119.8134 ]
ZXZ: -3.079318  2.068328  2.817047   [DEG: -176.4319  118.5065  161.4049 ]
 
# END of job
