
#######################################################
#                                                     #
#                        LGA                          #
#                  ---------------                    #
#                                                     #
#               Local-Global Alignment                #
#        A Method for Finding 3-D Similarities        #
#               in Protein Structures                 #
#                                                     #
#                  ------------ 10/2009               #
#                                                     #
#      Adam Zemla (adamz@llnl.gov)                    #
#      Lawrence Livermore National Laboratory, CA     #
#                                                     #
#######################################################

!!!   License for LGA program has expired  !!!
#   For updated version of the LGA program   #
# please contact Adam Zemla:  adamz@llnl.gov #

# Molecule1: number of CA atoms  159 ( 1222),  selected  131 , name one
# Molecule2: number of CA atoms  131 (  992),  selected  131 , name two
# PARAMETERS: input.pdb  -ie  -3  -d:4  -sda  -swap  -ch1:A  -ch2:A  
# FIXED Atom-Atom correspondence
# GDT and LCS analysis 

LCS - RMSD CUTOFF   5.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:   131       4_A - 151_A       1.31     1.31
  LCS_AVERAGE:    100.00

LCS - RMSD CUTOFF   2.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:   131       4_A - 151_A       1.31     1.31
  LCS_AVERAGE:    100.00

LCS - RMSD CUTOFF   1.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:    69      66_A - 151_A       0.99     1.34
  LCS_AVERAGE:     44.50

LCS_GDT    MOLECULE-1    MOLECULE-2     LCS_DETAILS     GDT_DETAILS                                                    TOTAL NUMBER OF RESIDUE PAIRS:  131
LCS_GDT     RESIDUE       RESIDUE       SEGMENT_SIZE    GLOBAL DISTANCE TEST COLUMNS: number of residues under the threshold assigned to each residue pair
LCS_GDT   NAME NUMBER   NAME NUMBER    1.0  2.0  5.0    0.5  1.0  1.5  2.0  2.5  3.0  3.5  4.0  4.5  5.0  5.5  6.0  6.5  7.0  7.5  8.0  8.5  9.0  9.5 10.0
LCS_GDT     E     4_A     E     4_A     14  131  131      0    3    9   51  109  122  127  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     K     5_A     K     5_A     50  131  131     54  101  114  120  122  124  128  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     T     6_A     T     6_A     50  131  131     54  101  114  120  122  124  128  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     V     7_A     V     7_A     50  131  131     54  101  114  120  122  124  128  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     Y     8_A     Y     8_A     50  131  131     54  101  114  120  122  124  128  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     G     9_A     G     9_A     50  131  131     54  101  114  120  122  124  128  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     L    10_A     L    10_A     50  131  131     46  101  114  120  122  124  128  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     N    11_A     N    11_A     50  131  131     38  101  114  120  122  124  128  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     E    12_A     E    12_A     50  131  131     54  101  114  120  122  124  128  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     Y    13_A     Y    13_A     50  131  131     54  101  114  120  122  124  128  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A    14_A     A    14_A     50  131  131     54  101  114  120  122  124  128  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A    15_A     A    15_A     50  131  131     54  101  114  120  122  124  128  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     L    16_A     L    16_A     50  131  131     49  101  114  120  122  124  128  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     D    17_A     D    17_A     50  131  131     44  101  114  120  122  124  128  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     G    18_A     G    18_A     50  131  131      3    4   14   66  116  124  128  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     I    19_A     I    19_A     50  131  131      3   24  111  120  122  124  128  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     N    20_A     N    20_A     50  131  131      4   12   97  119  121  124  128  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     L    21_A     L    21_A     50  131  131      5   68  114  120  122  124  128  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     E    22_A     E    22_A     50  131  131      6   62  114  120  122  124  128  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     V    23_A     V    23_A     50  131  131     54  101  114  120  122  124  128  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A    24_A     A    24_A     50  131  131     53  101  114  120  122  124  128  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A    25_A     A    25_A     50  131  131     54  101  114  120  122  124  128  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     K    26_A     K    26_A     50  131  131     54  101  114  120  122  124  128  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     L    27_A     L    27_A     50  131  131     54  101  114  120  122  124  128  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     D    28_A     D    28_A     50  131  131     54  101  114  120  122  124  128  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     T    29_A     T    29_A     50  131  131     54  101  114  120  122  124  128  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     G    30_A     G    30_A     50  131  131     53  101  114  120  122  124  128  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A    31_A     A    31_A     50  131  131     54  101  114  120  122  124  128  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     K    32_A     K    32_A     50  131  131     53  101  114  120  122  124  128  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     T    33_A     T    33_A     50  131  131     28  101  114  120  122  124  128  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A    34_A     A    34_A     50  131  131     53  101  114  120  122  124  128  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     S    35_A     S    35_A     50  131  131     54  101  114  120  122  124  128  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     L    36_A     L    36_A     50  131  131     54  101  114  120  122  124  128  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     S    37_A     S    37_A     50  131  131     54  101  114  120  122  124  128  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A    38_A     A    38_A     50  131  131     44  101  114  120  122  124  128  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     R    39_A     R    39_A     50  131  131     11   97  114  120  122  124  128  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     D    40_A     D    40_A     50  131  131     30   97  114  120  122  124  128  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     I    41_A     I    41_A     50  131  131     31  101  114  120  122  124  128  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     K    42_A     K    42_A     50  131  131     18   93  114  120  122  124  128  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     R    43_A     R    43_A     50  131  131     27   98  114  120  122  124  128  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     F    44_A     F    44_A     50  131  131     39  101  114  120  122  124  128  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     K    45_A     K    45_A     50  131  131     42  101  114  120  122  124  128  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     R    46_A     R    46_A     50  131  131     52  101  114  120  122  124  128  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     N    47_A     N    47_A     50  131  131     46  101  114  120  122  124  128  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     G    48_A     G    48_A     50  131  131     22  101  114  120  122  124  128  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     E    49_A     E    49_A     50  131  131     37  101  114  120  122  124  128  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     S    50_A     S    50_A     50  131  131     31  101  114  120  122  124  128  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     W    51_A     W    51_A     50  131  131     54  101  114  120  122  124  128  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     V    52_A     V    52_A     50  131  131     44  101  114  120  122  124  128  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     R    53_A     R    53_A     50  131  131     26  101  114  120  122  124  128  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     F    54_A     F    54_A     50  131  131     37  101  114  120  122  124  128  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     Y    55_A     Y    55_A     40  131  131     24   91  114  120  122  124  128  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     L    56_A     L    56_A     40  131  131     24   97  114  120  122  124  128  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A    57_A     A    57_A     40  131  131     46  101  114  120  122  124  128  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     I    58_A     I    58_A     40  131  131     18  101  114  120  122  124  128  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     D    59_A     D    59_A     35  131  131      3   13   32   92  112  122  128  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A    60_A     A    60_A      3  131  131      3    3   14  104  120  123  127  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A    61_A     A    61_A      3  131  131      3    3    4    4    6   11   15   64  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     H    62_A     H    62_A     40  131  131      7   35   62  120  122  124  128  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     S    63_A     S    63_A     40  131  131     18   53   94  118  122  124  128  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     H    64_A     H    64_A     40  131  131     11   69  109  120  122  124  128  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     P    65_A     P    65_A     40  131  131     18   85  114  120  122  124  128  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     I    66_A     I    66_A     69  131  131     38  101  114  120  122  124  128  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     E    67_A     E    67_A     69  131  131     43  101  114  120  122  124  128  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     R    68_A     R    68_A     69  131  131     54  101  114  120  122  124  128  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     P    69_A     P    69_A     69  131  131     54  101  114  120  122  124  128  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     L    70_A     L    70_A     69  131  131     48  101  114  120  122  124  128  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A    71_A     A    71_A     69  131  131     38  101  114  120  122  124  128  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     R    72_A     R    72_A     69  131  131     27  101  114  120  122  124  128  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     V    73_A     V    73_A     69  131  131     38  101  114  120  122  124  128  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     S    74_A     S    74_A     69  131  131     47  101  114  120  122  124  128  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     K    75_A     K    75_A     69  131  131     54  101  114  120  122  124  128  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A    93_A     A    93_A     69  131  131     51  101  114  120  122  124  128  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     R    94_A     R    94_A     69  131  131     54  101  114  120  122  124  128  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     P    95_A     P    95_A     69  131  131     46  101  114  120  122  124  128  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     V    96_A     V    96_A     69  131  131     53  101  114  120  122  124  128  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     I    97_A     I    97_A     69  131  131     53  101  114  120  122  124  128  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     E    98_A     E    98_A     69  131  131     54  101  114  120  122  124  128  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     L    99_A     L    99_A     69  131  131     54  101  114  120  122  124  128  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     D   100_A     D   100_A     69  131  131     49  101  114  120  122  124  128  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     I   101_A     I   101_A     69  131  131     54  101  114  120  122  124  128  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     C   102_A     C   102_A     69  131  131     54  101  114  120  122  124  128  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     M   103_A     M   103_A     69  131  131     54  101  114  120  122  124  128  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     G   104_A     G   104_A     69  131  131     54  101  114  120  122  124  128  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     S   105_A     S   105_A     69  131  131     54  101  114  120  122  124  128  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A   106_A     A   106_A     69  131  131     54  101  114  120  122  124  128  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     M   107_A     M   107_A     69  131  131     54  101  114  120  122  124  128  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     R   108_A     R   108_A     69  131  131     54  101  114  120  122  124  128  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     S   109_A     S   109_A     69  131  131     54  101  114  120  122  124  128  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     I   110_A     I   110_A     69  131  131     54  101  114  120  122  124  128  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     E   111_A     E   111_A     69  131  131     54  101  114  120  122  124  128  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     V   112_A     V   112_A     69  131  131     54  101  114  120  122  124  128  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     N   113_A     N   113_A     69  131  131     54  101  114  120  122  124  128  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     L   114_A     L   114_A     69  131  131     54  101  114  120  122  124  128  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     T   115_A     T   115_A     69  131  131     54  101  114  120  122  124  128  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     D   116_A     D   116_A     69  131  131     54  101  114  120  122  124  128  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     R   117_A     R   117_A     69  131  131     54  100  114  120  122  124  128  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     S   118_A     S   118_A     69  131  131      3   62  102  118  121  124  128  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A   119_A     A   119_A     69  131  131      3   20   35   89  117  124  128  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     F   120_A     F   120_A     69  131  131      3    3    4   32  122  124  128  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     Q   121_A     Q   121_A     69  131  131      3    5   68   84  115  124  128  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     Y   122_A     Y   122_A     69  131  131     13   83  110  120  122  124  128  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     P   123_A     P   123_A     69  131  131     54  101  114  120  122  124  128  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     L   124_A     L   124_A     69  131  131     54  101  114  120  122  124  128  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     L   125_A     L   125_A     69  131  131     49  101  114  120  122  124  128  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     I   126_A     I   126_A     69  131  131     53  101  114  120  122  124  128  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     G   127_A     G   127_A     69  131  131     54  101  114  120  122  124  128  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     S   128_A     S   128_A     69  131  131     54  101  114  120  122  124  128  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     E   129_A     E   129_A     69  131  131     54  101  114  120  122  124  128  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A   130_A     A   130_A     69  131  131     54  101  114  120  122  124  128  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     L   131_A     L   131_A     69  131  131     54  101  114  120  122  124  128  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     K   132_A     K   132_A     69  131  131     54  101  114  120  122  124  128  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     R   133_A     R   133_A     69  131  131     54  101  114  120  122  124  128  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     F   134_A     F   134_A     69  131  131     54  101  114  120  122  124  128  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     D   135_A     D   135_A     69  131  131     48  101  114  120  122  124  128  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A   136_A     A   136_A     69  131  131     54  101  114  120  122  124  128  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     L   137_A     L   137_A     69  131  131     52  101  114  120  122  124  128  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     V   138_A     V   138_A     69  131  131     54  101  114  120  122  124  128  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     D   139_A     D   139_A     69  131  131     54  101  114  120  122  124  128  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     P   140_A     P   140_A     69  131  131     54  101  114  120  122  124  128  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     S   141_A     S   141_A     69  131  131     54  101  114  120  122  124  128  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     L   142_A     L   142_A     69  131  131     54  101  114  120  122  124  128  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     K   143_A     K   143_A     69  131  131      9  101  114  120  122  124  128  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     Y   144_A     Y   144_A     69  131  131      5   69  114  120  122  124  128  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A   145_A     A   145_A     69  131  131     27  101  114  120  122  124  128  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A   146_A     A   146_A     69  131  131     54  101  114  120  122  124  128  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     G   147_A     G   147_A     69  131  131     30  101  114  120  122  124  128  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     K   148_A     K   148_A     69  131  131     21  101  114  120  122  124  128  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     P   149_A     P   149_A     69  131  131     54  101  114  120  122  124  128  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A   150_A     A   150_A     69  131  131     52  101  114  120  122  124  128  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     C   151_A     C   151_A     69  131  131     43  101  114  120  122  124  128  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_AVERAGE  LCS_A:  81.50  (  44.50  100.00  100.00 )

GLOBAL_DISTANCE_TEST (summary information about detected largest sets of residues (represented by selected AToms) that can fit under specified thresholds)
GDT DIST_CUTOFF  0.50   1.00   1.50   2.00   2.50   3.00   3.50   4.00   4.50   5.00   5.50   6.00   6.50   7.00   7.50   8.00   8.50   9.00   9.50  10.00
GDT NUMBER_AT     54    101    114    120    122    124    128    130    130    131    131    131    131    131    131    131    131    131    131    131 
GDT PERCENT_AT  41.22  77.10  87.02  91.60  93.13  94.66  97.71  99.24  99.24 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00
GDT RMS_LOCAL    0.34   0.60   0.71   0.83   0.92   0.99   1.15   1.23   1.23   1.31   1.31   1.31   1.31   1.31   1.31   1.31   1.31   1.31   1.31   1.31
GDT RMS_ALL_AT   1.41   1.32   1.32   1.32   1.33   1.33   1.32   1.31   1.31   1.31   1.31   1.31   1.31   1.31   1.31   1.31   1.31   1.31   1.31   1.31

# Checking swapping
#   possible swapping detected:  Y     8_A      Y     8_A
#   possible swapping detected:  Y    13_A      Y    13_A
#   possible swapping detected:  E    22_A      E    22_A
#   possible swapping detected:  F    44_A      F    44_A
#   possible swapping detected:  E    49_A      E    49_A
#   possible swapping detected:  F    54_A      F    54_A
#   possible swapping detected:  Y    55_A      Y    55_A
#   possible swapping detected:  E   111_A      E   111_A
#   possible swapping detected:  F   120_A      F   120_A
#   possible swapping detected:  E   129_A      E   129_A
#   possible swapping detected:  F   134_A      F   134_A
#   possible swapping detected:  Y   144_A      Y   144_A

#      Molecule1      Molecule2  DISTANCE    Mis    MC     All    Dist_max   GDC_mc  GDC_all
LGA    E     4_A      E     4_A     3.639     4    0.534   0.517     5.031   53.690   26.772
LGA    K     5_A      K     5_A     0.437     0    0.227   0.857     1.829   93.214   88.783
LGA    T     6_A      T     6_A     0.435     0    0.037   0.106     0.811  100.000   97.279
LGA    V     7_A      V     7_A     0.552     0    0.024   0.036     0.885   95.238   93.197
LGA    Y     8_A      Y     8_A     0.333     0    0.020   0.155     0.814  100.000   96.825
LGA    G     9_A      G     9_A     0.254     0    0.074   0.074     0.325  100.000  100.000
LGA    L    10_A      L    10_A     0.674     0    0.040   0.103     0.841   90.476   91.667
LGA    N    11_A      N    11_A     0.890     0    0.211   1.452     4.472   86.071   70.774
LGA    E    12_A      E    12_A     0.391     0    0.046   0.315     1.254   97.619   94.762
LGA    Y    13_A      Y    13_A     0.392     0    0.050   0.169     0.836   97.619   95.238
LGA    A    14_A      A    14_A     0.526     0    0.028   0.029     0.697   92.857   94.286
LGA    A    15_A      A    15_A     0.556     0    0.016   0.022     0.697   95.238   94.286
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LGA    F   120_A      F   120_A     3.423     0    0.557   1.236    11.913   63.095   26.277
LGA    Q   121_A      Q   121_A     3.662     0    0.665   0.864    10.203   46.905   26.667
LGA    Y   122_A      Y   122_A     1.786     0    0.208   0.419     2.448   72.976   80.952
LGA    P   123_A      P   123_A     0.646     0    0.029   0.031     0.892   90.476   90.476
LGA    L   124_A      L   124_A     0.735     0    0.048   0.085     1.091   90.476   88.214
LGA    L   125_A      L   125_A     0.844     0    0.034   0.749     2.378   88.214   83.869
LGA    I   126_A      I   126_A     0.681     0    0.009   0.592     1.904   90.476   88.274
LGA    G   127_A      G   127_A     0.586     0    0.036   0.036     0.586   95.238   95.238
LGA    S   128_A      S   128_A     0.484     0    0.042   0.601     1.792   97.619   92.302
LGA    E   129_A      E   129_A     0.351     0    0.027   0.246     0.667  100.000   97.884
LGA    A   130_A      A   130_A     0.295     0    0.024   0.027     0.295  100.000  100.000
LGA    L   131_A      L   131_A     0.210     0    0.040   0.065     0.442  100.000  100.000
LGA    K   132_A      K   132_A     0.362     0    0.012   0.759     2.733  100.000   90.476
LGA    R   133_A      R   133_A     0.467     0    0.027   0.938     1.851   97.619   87.489
LGA    F   134_A      F   134_A     0.439     0    0.023   0.266     0.726   97.619   96.537
LGA    D   135_A      D   135_A     0.880     0    0.018   0.860     4.219   90.476   73.452
LGA    A   136_A      A   136_A     0.440     0    0.029   0.053     1.126   90.595   92.476
LGA    L   137_A      L   137_A     0.820     0    0.107   0.148     1.128   88.214   85.952
LGA    V   138_A      V   138_A     0.270     0    0.052   0.062     0.624  100.000   98.639
LGA    D   139_A      D   139_A     0.432     0    0.081   0.181     0.816   97.619   95.238
LGA    P   140_A      P   140_A     0.256     0    0.012   0.315     1.286  100.000   97.347
LGA    S   141_A      S   141_A     0.415     0    0.026   0.034     0.466  100.000  100.000
LGA    L   142_A      L   142_A     0.451     0    0.049   0.124     0.581   97.619   98.810
LGA    K   143_A      K   143_A     1.035     0    0.552   0.739     5.387   75.833   65.873
LGA    Y   144_A      Y   144_A     1.345     0    0.259   0.217     2.517   77.143   73.730
LGA    A   145_A      A   145_A     1.055     0    0.106   0.115     1.261   88.214   86.857
LGA    A   146_A      A   146_A     0.549     0    0.025   0.023     0.733   90.476   90.476
LGA    G   147_A      G   147_A     1.167     0    0.150   0.150     1.255   83.690   83.690
LGA    K   148_A      K   148_A     1.040     4    0.021   0.039     1.270   85.952   47.249
LGA    P   149_A      P   149_A     0.507     0    0.038   0.083     1.147   88.214   90.544
LGA    A   150_A      A   150_A     0.887     0    0.035   0.034     1.488   90.476   88.667
LGA    C   151_A      C   151_A     0.651     0    0.398   0.464     3.394   88.452   78.095

# RMSD_GDC results:       CA      MC common percent     ALL common percent   GDC_mc  GDC_all
NUMBER_OF_ATOMS_AA:      131     524    524  100.00     992    992  100.00               131
SUMMARY(RMSD_GDC):     1.313          1.307                  2.042           87.420   81.276

#CA            N1   N2   DIST      N    RMSD    GDT_TS    LGA_S3     LGA_Q 
SUMMARY(GDT)  159  131    4.0    130    1.23    91.985    95.648     9.747

LGA_LOCAL      RMSD:   1.234  Number of atoms:  130  under DIST:   4.00
LGA_ASGN_ATOMS RMSD:   1.314  Number of assigned atoms:  131 
Std_ASGN_ATOMS RMSD:   1.313  Standard rmsd on all 131 assigned CA atoms 

Unitary ROTATION matrix and the SHIFT vector superimpose molecules  (1=>2)
  X_new =   0.094891 * X  +   0.709059 * Y  +  -0.698735 * Z  + -17.047760
  Y_new =   0.263612 * X  +  -0.694743 * Y  +  -0.669209 * Z  +  37.506561
  Z_new =  -0.959950 * X  +  -0.120693 * Y  +  -0.252841 * Z  +  27.438000 

Euler angles from the ROTATION matrix. Conventions XYZ and ZXZ:
           Phi     Theta       Psi   [DEG:       Phi     Theta       Psi ]
XYZ:  1.225272  1.286825 -2.696231   [DEG:   70.2029   73.7296 -154.4827 ]
ZXZ: -0.806979  1.826412 -1.695868   [DEG:  -46.2365  104.6457  -97.1661 ]
 
# END of job
