
#######################################################
#                                                     #
#                        LGA                          #
#                  ---------------                    #
#                                                     #
#               Local-Global Alignment                #
#        A Method for Finding 3-D Similarities        #
#               in Protein Structures                 #
#                                                     #
#                  ------------ 10/2009               #
#                                                     #
#      Adam Zemla (adamz@llnl.gov)                    #
#      Lawrence Livermore National Laboratory, CA     #
#                                                     #
#######################################################

!!!   License for LGA program has expired  !!!
#   For updated version of the LGA program   #
# please contact Adam Zemla:  adamz@llnl.gov #

# Molecule1: number of CA atoms  159 ( 1222),  selected  131 , name one
# Molecule2: number of CA atoms  131 (  992),  selected  131 , name two
# PARAMETERS: input.pdb  -ie  -3  -d:4  -sda  -swap  -ch1:A  -ch2:A  
# FIXED Atom-Atom correspondence
# GDT and LCS analysis 

LCS - RMSD CUTOFF   5.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:   131       4_A - 151_A       1.52     1.52
  LCS_AVERAGE:    100.00

LCS - RMSD CUTOFF   2.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:   131       4_A - 151_A       1.52     1.52
  LCS_AVERAGE:    100.00

LCS - RMSD CUTOFF   1.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:    47       8_A - 54_A        1.00     1.60
  LCS_AVERAGE:     28.92

LCS_GDT    MOLECULE-1    MOLECULE-2     LCS_DETAILS     GDT_DETAILS                                                    TOTAL NUMBER OF RESIDUE PAIRS:  131
LCS_GDT     RESIDUE       RESIDUE       SEGMENT_SIZE    GLOBAL DISTANCE TEST COLUMNS: number of residues under the threshold assigned to each residue pair
LCS_GDT   NAME NUMBER   NAME NUMBER    1.0  2.0  5.0    0.5  1.0  1.5  2.0  2.5  3.0  3.5  4.0  4.5  5.0  5.5  6.0  6.5  7.0  7.5  8.0  8.5  9.0  9.5 10.0
LCS_GDT     E     4_A     E     4_A      5  131  131      3    4    8   37  102  118  125  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     K     5_A     K     5_A     34  131  131     33   92  111  115  120  124  127  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     T     6_A     T     6_A     40  131  131     35   92  111  115  120  124  127  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     V     7_A     V     7_A     40  131  131     35   92  111  115  120  124  127  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     Y     8_A     Y     8_A     47  131  131     47   92  111  115  120  124  127  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     G     9_A     G     9_A     47  131  131      4   92  111  115  120  124  127  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     L    10_A     L    10_A     47  131  131     47   92  111  115  120  124  127  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     N    11_A     N    11_A     47  131  131     47   92  111  115  120  124  127  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     E    12_A     E    12_A     47  131  131     47   92  111  115  120  124  127  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     Y    13_A     Y    13_A     47  131  131     47   92  111  115  120  124  127  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A    14_A     A    14_A     47  131  131     47   92  111  115  120  124  127  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A    15_A     A    15_A     47  131  131     47   92  111  115  120  124  127  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     L    16_A     L    16_A     47  131  131     38   92  111  115  120  124  127  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     D    17_A     D    17_A     47  131  131      6   81  111  115  120  124  127  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     G    18_A     G    18_A     47  131  131      4   24   66  115  120  124  127  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     I    19_A     I    19_A     47  131  131      3   24   66  115  120  124  127  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     N    20_A     N    20_A     47  131  131      3    9   82  115  120  124  127  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     L    21_A     L    21_A     47  131  131      3   70  111  115  120  124  127  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     E    22_A     E    22_A     47  131  131      9   76  111  115  120  124  127  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     V    23_A     V    23_A     47  131  131     47   92  111  115  120  124  127  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A    24_A     A    24_A     47  131  131     34   92  111  115  120  124  127  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A    25_A     A    25_A     47  131  131     47   92  111  115  120  124  127  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     K    26_A     K    26_A     47  131  131     47   92  111  115  120  124  127  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     L    27_A     L    27_A     47  131  131     47   92  111  115  120  124  127  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     D    28_A     D    28_A     47  131  131     47   92  111  115  120  124  127  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     T    29_A     T    29_A     47  131  131     47   92  111  115  120  124  127  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     G    30_A     G    30_A     47  131  131     47   92  111  115  120  124  127  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A    31_A     A    31_A     47  131  131     47   92  111  115  120  124  127  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     K    32_A     K    32_A     47  131  131     36   92  111  115  120  124  127  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     T    33_A     T    33_A     47  131  131     31   92  111  115  120  124  127  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A    34_A     A    34_A     47  131  131     37   92  111  115  120  124  127  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     S    35_A     S    35_A     47  131  131     47   92  111  115  120  124  127  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     L    36_A     L    36_A     47  131  131     47   92  111  115  120  124  127  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     S    37_A     S    37_A     47  131  131     47   92  111  115  120  124  127  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A    38_A     A    38_A     47  131  131     35   92  111  115  120  124  127  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     R    39_A     R    39_A     47  131  131     20   78  111  115  120  124  127  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     D    40_A     D    40_A     47  131  131     27   81  111  115  120  124  127  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     I    41_A     I    41_A     47  131  131     29   92  111  115  120  124  127  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     K    42_A     K    42_A     47  131  131     20   82  111  115  120  124  127  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     R    43_A     R    43_A     47  131  131     20   89  111  115  120  124  127  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     F    44_A     F    44_A     47  131  131     27   92  111  115  120  124  127  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     K    45_A     K    45_A     47  131  131     23   92  111  115  120  124  127  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     R    46_A     R    46_A     47  131  131     38   92  111  115  120  124  127  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     N    47_A     N    47_A     47  131  131     34   92  111  115  120  124  127  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     G    48_A     G    48_A     47  131  131     21   90  111  115  120  124  127  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     E    49_A     E    49_A     47  131  131     20   90  111  115  120  124  127  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     S    50_A     S    50_A     47  131  131     22   92  111  115  120  124  127  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     W    51_A     W    51_A     47  131  131     40   92  111  115  120  124  127  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     V    52_A     V    52_A     47  131  131     36   92  111  115  120  124  127  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     R    53_A     R    53_A     47  131  131     31   92  111  115  120  124  127  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     F    54_A     F    54_A     47  131  131     31   92  111  115  120  124  127  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     Y    55_A     Y    55_A     38  131  131     27   75  110  115  120  124  127  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     L    56_A     L    56_A     38  131  131     27   78  111  115  120  124  127  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A    57_A     A    57_A     38  131  131      3    4   34  108  120  124  127  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     I    58_A     I    58_A     38  131  131     29   92  111  115  120  124  127  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     D    59_A     D    59_A      4  131  131      4    8   15   63  100  120  127  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A    60_A     A    60_A      4  131  131      4    4   21   57   73  113  124  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A    61_A     A    61_A      4  131  131      4    4    4    4   12   41   56  121  127  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     H    62_A     H    62_A      4  131  131      4    5   80  114  120  124  127  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     S    63_A     S    63_A     22  131  131      3    6   11   53   69  116  125  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     H    64_A     H    64_A     37  131  131      5   22   55   99  117  123  127  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     P    65_A     P    65_A     38  131  131     13   63  105  115  120  124  127  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     I    66_A     I    66_A     38  131  131     35   92  111  115  120  124  127  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     E    67_A     E    67_A     38  131  131     41   92  111  115  120  124  127  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     R    68_A     R    68_A     38  131  131     47   92  111  115  120  124  127  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     P    69_A     P    69_A     38  131  131     29   92  111  115  120  124  127  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     L    70_A     L    70_A     38  131  131     37   92  111  115  120  124  127  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A    71_A     A    71_A     38  131  131     29   92  111  115  120  124  127  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     R    72_A     R    72_A     38  131  131     28   92  111  115  120  124  127  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     V    73_A     V    73_A     38  131  131     39   92  111  115  120  124  127  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     S    74_A     S    74_A     38  131  131     41   92  111  115  120  124  127  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     K    75_A     K    75_A     38  131  131     43   92  111  115  120  124  127  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A    93_A     A    93_A     38  131  131     39   92  111  115  120  124  127  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     R    94_A     R    94_A     38  131  131     47   92  111  115  120  124  127  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     P    95_A     P    95_A     38  131  131     39   92  111  115  120  124  127  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     V    96_A     V    96_A     38  131  131     47   92  111  115  120  124  127  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     I    97_A     I    97_A     38  131  131     47   92  111  115  120  124  127  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     E    98_A     E    98_A     38  131  131     47   92  111  115  120  124  127  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     L    99_A     L    99_A     38  131  131     47   92  111  115  120  124  127  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     D   100_A     D   100_A     38  131  131     47   92  111  115  120  124  127  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     I   101_A     I   101_A     38  131  131     47   92  111  115  120  124  127  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     C   102_A     C   102_A     38  131  131     47   92  111  115  120  124  127  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     M   103_A     M   103_A     38  131  131     41   92  111  115  120  124  127  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     G   104_A     G   104_A     38  131  131      4   39   96  115  120  124  127  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     S   105_A     S   105_A     38  131  131     40   92  111  115  120  124  127  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A   106_A     A   106_A     38  131  131     10   71  108  115  120  124  127  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     M   107_A     M   107_A     38  131  131     37   92  111  115  120  124  127  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     R   108_A     R   108_A     38  131  131     47   92  111  115  120  124  127  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     S   109_A     S   109_A     38  131  131     47   92  111  115  120  124  127  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     I   110_A     I   110_A     38  131  131     47   92  111  115  120  124  127  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     E   111_A     E   111_A     38  131  131     47   92  111  115  120  124  127  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     V   112_A     V   112_A     38  131  131     47   92  111  115  120  124  127  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     N   113_A     N   113_A     38  131  131     47   92  111  115  120  124  127  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     L   114_A     L   114_A     38  131  131     47   92  111  115  120  124  127  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     T   115_A     T   115_A     38  131  131     44   92  111  115  120  124  127  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     D   116_A     D   116_A     38  131  131     47   92  111  115  120  124  127  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     R   117_A     R   117_A     38  131  131     41   92  111  115  120  124  127  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     S   118_A     S   118_A     38  131  131      3   27   80  102  118  124  127  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A   119_A     A   119_A     38  131  131      3    4   10  114  120  124  127  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     F   120_A     F   120_A      3  131  131      3    3    4    4   35  124  127  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     Q   121_A     Q   121_A     31  131  131      4   11   54   93  114  123  127  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     Y   122_A     Y   122_A     31  131  131     11   60   98  115  120  124  127  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     P   123_A     P   123_A     31  131  131     47   92  111  115  120  124  127  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     L   124_A     L   124_A     31  131  131     47   92  111  115  120  124  127  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     L   125_A     L   125_A     31  131  131     41   92  111  115  120  124  127  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     I   126_A     I   126_A     31  131  131     47   92  111  115  120  124  127  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     G   127_A     G   127_A     31  131  131     47   92  111  115  120  124  127  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     S   128_A     S   128_A     31  131  131     47   92  111  115  120  124  127  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     E   129_A     E   129_A     31  131  131     47   92  111  115  120  124  127  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A   130_A     A   130_A     31  131  131     47   92  111  115  120  124  127  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     L   131_A     L   131_A     31  131  131     47   92  111  115  120  124  127  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     K   132_A     K   132_A     31  131  131     47   92  111  115  120  124  127  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     R   133_A     R   133_A     31  131  131     47   92  111  115  120  124  127  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     F   134_A     F   134_A     31  131  131     47   92  111  115  120  124  127  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     D   135_A     D   135_A     31  131  131     43   92  111  115  120  124  127  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A   136_A     A   136_A     31  131  131     47   92  111  115  120  124  127  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     L   137_A     L   137_A     31  131  131     11   92  111  115  120  124  127  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     V   138_A     V   138_A     31  131  131     34   92  111  115  120  124  127  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     D   139_A     D   139_A     31  131  131     20   92  111  115  120  124  127  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     P   140_A     P   140_A     31  131  131     20   92  111  115  120  124  127  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     S   141_A     S   141_A     31  131  131     20   92  111  115  120  124  127  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     L   142_A     L   142_A     31  131  131     26   92  111  115  120  124  127  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     K   143_A     K   143_A     31  131  131     35   92  111  115  120  124  127  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     Y   144_A     Y   144_A     31  131  131     36   92  111  115  120  124  127  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A   145_A     A   145_A     31  131  131     35   92  111  115  120  124  127  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A   146_A     A   146_A     31  131  131     36   92  111  115  120  124  127  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     G   147_A     G   147_A     31  131  131     17   90  111  115  120  124  127  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     K   148_A     K   148_A     31  131  131     16   91  111  115  120  124  127  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     P   149_A     P   149_A     31  131  131      8   90  111  115  120  124  127  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A   150_A     A   150_A     31  131  131     43   92  111  115  120  124  127  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     C   151_A     C   151_A     31  131  131      2   92  111  115  120  124  127  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_AVERAGE  LCS_A:  76.31  (  28.92  100.00  100.00 )

GLOBAL_DISTANCE_TEST (summary information about detected largest sets of residues (represented by selected AToms) that can fit under specified thresholds)
GDT DIST_CUTOFF  0.50   1.00   1.50   2.00   2.50   3.00   3.50   4.00   4.50   5.00   5.50   6.00   6.50   7.00   7.50   8.00   8.50   9.00   9.50  10.00
GDT NUMBER_AT     47     92    111    115    120    124    127    128    129    130    131    131    131    131    131    131    131    131    131    131 
GDT PERCENT_AT  35.88  70.23  84.73  87.79  91.60  94.66  96.95  97.71  98.47  99.24 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00
GDT RMS_LOCAL    0.37   0.64   0.80   0.86   0.98   1.11   1.24   1.30   1.36   1.46   1.52   1.52   1.52   1.52   1.52   1.52   1.52   1.52   1.52   1.52
GDT RMS_ALL_AT   1.60   1.53   1.53   1.53   1.53   1.53   1.52   1.52   1.53   1.52   1.52   1.52   1.52   1.52   1.52   1.52   1.52   1.52   1.52   1.52

# Checking swapping
#   possible swapping detected:  Y     8_A      Y     8_A
#   possible swapping detected:  E    12_A      E    12_A
#   possible swapping detected:  Y    13_A      Y    13_A
#   possible swapping detected:  E    22_A      E    22_A
#   possible swapping detected:  F    44_A      F    44_A
#   possible swapping detected:  E    49_A      E    49_A
#   possible swapping detected:  F    54_A      F    54_A
#   possible swapping detected:  Y    55_A      Y    55_A
#   possible swapping detected:  D    59_A      D    59_A
#   possible swapping detected:  E    67_A      E    67_A
#   possible swapping detected:  E   111_A      E   111_A
#   possible swapping detected:  F   120_A      F   120_A
#   possible swapping detected:  E   129_A      E   129_A
#   possible swapping detected:  F   134_A      F   134_A
#   possible swapping detected:  Y   144_A      Y   144_A

#      Molecule1      Molecule2  DISTANCE    Mis    MC     All    Dist_max   GDC_mc  GDC_all
LGA    E     4_A      E     4_A     4.359     4    0.576   0.558     6.050   46.786   22.698
LGA    K     5_A      K     5_A     0.957     0    0.221   0.670     2.933   81.786   77.937
LGA    T     6_A      T     6_A     0.860     0    0.066   0.172     1.093   92.857   90.544
LGA    V     7_A      V     7_A     0.755     0    0.019   0.040     1.429   95.238   89.320
LGA    Y     8_A      Y     8_A     0.521     0    0.700   0.634     3.265   80.476   87.937
LGA    G     9_A      G     9_A     1.049     0    0.093   0.093     1.639   79.286   79.286
LGA    L    10_A      L    10_A     0.869     0    0.075   1.379     3.149   88.214   77.917
LGA    N    11_A      N    11_A     0.728     0    0.028   0.862     3.153   90.476   82.024
LGA    E    12_A      E    12_A     0.587     0    0.027   1.161     5.538   90.476   69.841
LGA    Y    13_A      Y    13_A     0.428     0    0.059   0.164     0.907   97.619   94.444
LGA    A    14_A      A    14_A     0.485     0    0.026   0.042     0.534   97.619   98.095
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LGA    A   119_A      A   119_A     2.623     0    0.053   0.054     5.097   65.595   57.714
LGA    F   120_A      F   120_A     3.510     0    0.551   1.257    12.233   59.405   24.286
LGA    Q   121_A      Q   121_A     3.868     0    0.647   0.548     8.930   45.238   25.820
LGA    Y   122_A      Y   122_A     2.109     0    0.217   0.358     2.677   66.905   76.667
LGA    P   123_A      P   123_A     0.776     0    0.021   0.064     1.119   88.214   87.891
LGA    L   124_A      L   124_A     0.685     0    0.026   0.048     0.897   90.476   90.476
LGA    L   125_A      L   125_A     0.910     0    0.059   0.124     1.214   88.214   85.952
LGA    I   126_A      I   126_A     0.645     0    0.028   0.585     1.725   92.857   89.464
LGA    G   127_A      G   127_A     0.528     0    0.041   0.041     0.560   95.238   95.238
LGA    S   128_A      S   128_A     0.436     0    0.039   0.599     1.604  100.000   93.889
LGA    E   129_A      E   129_A     0.361     0    0.024   0.208     0.932  100.000   97.884
LGA    A   130_A      A   130_A     0.282     0    0.033   0.036     0.405  100.000  100.000
LGA    L   131_A      L   131_A     0.299     0    0.041   0.064     0.474  100.000  100.000
LGA    K   132_A      K   132_A     0.370     0    0.018   0.766     2.567  100.000   91.323
LGA    R   133_A      R   133_A     0.498     0    0.040   0.985     2.204   95.238   84.329
LGA    F   134_A      F   134_A     0.554     0    0.030   0.373     1.589   97.619   89.004
LGA    D   135_A      D   135_A     0.460     0    0.019   0.286     2.144  100.000   88.690
LGA    A   136_A      A   136_A     0.541     0    0.028   0.050     1.214   88.214   88.667
LGA    L   137_A      L   137_A     1.025     0    0.086   0.128     1.364   83.690   82.560
LGA    V   138_A      V   138_A     0.777     0    0.075   0.090     0.859   90.476   90.476
LGA    D   139_A      D   139_A     1.119     0    0.101   0.183     1.495   85.952   83.690
LGA    P   140_A      P   140_A     1.090     0    0.020   0.321     2.360   85.952   80.408
LGA    S   141_A      S   141_A     1.075     0    0.018   0.024     1.331   83.690   82.937
LGA    L   142_A      L   142_A     0.839     0    0.116   1.386     3.548   92.857   81.310
LGA    K   143_A      K   143_A     0.627     0    0.040   0.666     2.310   90.476   86.720
LGA    Y   144_A      Y   144_A     0.717     0    0.073   0.219     0.904   90.476   92.063
LGA    A   145_A      A   145_A     0.958     0    0.064   0.069     1.007   90.476   88.667
LGA    A   146_A      A   146_A     0.699     0    0.027   0.025     0.826   90.476   90.476
LGA    G   147_A      G   147_A     1.131     0    0.131   0.131     1.278   83.690   83.690
LGA    K   148_A      K   148_A     1.115     4    0.012   0.028     1.186   83.690   46.243
LGA    P   149_A      P   149_A     1.245     0    0.578   0.649     4.105   68.214   77.755
LGA    A   150_A      A   150_A     0.389     0    0.187   0.182     0.759   95.238   96.190
LGA    C   151_A      C   151_A     1.070     0    0.207   0.219     3.778   73.690   68.492

# RMSD_GDC results:       CA      MC common percent     ALL common percent   GDC_mc  GDC_all
NUMBER_OF_ATOMS_AA:      131     524    524  100.00     992    992  100.00               131
SUMMARY(RMSD_GDC):     1.520          1.508                  2.184           84.743   78.379

#CA            N1   N2   DIST      N    RMSD    GDT_TS    LGA_S3     LGA_Q 
SUMMARY(GDT)  159  131    4.0    128    1.30    88.931    94.372     9.170

LGA_LOCAL      RMSD:   1.296  Number of atoms:  128  under DIST:   4.00
LGA_ASGN_ATOMS RMSD:   1.522  Number of assigned atoms:  131 
Std_ASGN_ATOMS RMSD:   1.520  Standard rmsd on all 131 assigned CA atoms 

Unitary ROTATION matrix and the SHIFT vector superimpose molecules  (1=>2)
  X_new =  -0.047704 * X  +  -0.070251 * Y  +  -0.996388 * Z  + -17.170929
  Y_new =   0.587094 * X  +  -0.809001 * Y  +   0.028931 * Z  +  35.376183
  Z_new =  -0.808112 * X  +  -0.583594 * Y  +   0.079836 * Z  +  28.647749 

Euler angles from the ROTATION matrix. Conventions XYZ and ZXZ:
           Phi     Theta       Psi   [DEG:       Phi     Theta       Psi ]
XYZ:  1.651872  0.940939 -1.434840   [DEG:   94.6453   53.9118  -82.2103 ]
ZXZ: -1.599824  1.490875 -2.196247   [DEG:  -91.6632   85.4209 -125.8357 ]
 
# END of job
