
#######################################################
#                                                     #
#                        LGA                          #
#                  ---------------                    #
#                                                     #
#               Local-Global Alignment                #
#        A Method for Finding 3-D Similarities        #
#               in Protein Structures                 #
#                                                     #
#                  ------------ 10/2009               #
#                                                     #
#      Adam Zemla (adamz@llnl.gov)                    #
#      Lawrence Livermore National Laboratory, CA     #
#                                                     #
#######################################################

!!!   License for LGA program has expired  !!!
#   For updated version of the LGA program   #
# please contact Adam Zemla:  adamz@llnl.gov #

# Molecule1: number of CA atoms  159 ( 1222),  selected  131 , name one
# Molecule2: number of CA atoms  131 (  992),  selected  131 , name two
# PARAMETERS: input.pdb  -ie  -3  -d:4  -sda  -swap  -ch1:A  -ch2:A  
# FIXED Atom-Atom correspondence
# GDT and LCS analysis 

LCS - RMSD CUTOFF   5.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:   131       4_A - 151_A       1.47     1.47
  LCS_AVERAGE:    100.00

LCS - RMSD CUTOFF   2.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:   131       4_A - 151_A       1.47     1.47
  LCS_AVERAGE:    100.00

LCS - RMSD CUTOFF   1.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:    42       5_A - 46_A        1.00     1.54
  LCS_AVERAGE:     27.85

LCS_GDT    MOLECULE-1    MOLECULE-2     LCS_DETAILS     GDT_DETAILS                                                    TOTAL NUMBER OF RESIDUE PAIRS:  131
LCS_GDT     RESIDUE       RESIDUE       SEGMENT_SIZE    GLOBAL DISTANCE TEST COLUMNS: number of residues under the threshold assigned to each residue pair
LCS_GDT   NAME NUMBER   NAME NUMBER    1.0  2.0  5.0    0.5  1.0  1.5  2.0  2.5  3.0  3.5  4.0  4.5  5.0  5.5  6.0  6.5  7.0  7.5  8.0  8.5  9.0  9.5 10.0
LCS_GDT     E     4_A     E     4_A     14  131  131      3    3    8   82  111  120  125  129  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     K     5_A     K     5_A     42  131  131     38   96  111  119  120  123  126  129  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     T     6_A     T     6_A     42  131  131     46   96  111  119  120  123  126  129  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     V     7_A     V     7_A     42  131  131     46   96  111  119  120  123  126  129  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     Y     8_A     Y     8_A     42  131  131     46   96  111  119  120  123  126  129  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     G     9_A     G     9_A     42  131  131     46   96  111  119  120  123  126  129  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     L    10_A     L    10_A     42  131  131     46   96  111  119  120  123  126  129  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     N    11_A     N    11_A     42  131  131     46   96  111  119  120  123  126  129  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     E    12_A     E    12_A     42  131  131     46   96  111  119  120  123  126  129  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     Y    13_A     Y    13_A     42  131  131     46   96  111  119  120  123  126  129  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A    14_A     A    14_A     42  131  131     46   96  111  119  120  123  126  129  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A    15_A     A    15_A     42  131  131     46   96  111  119  120  123  126  129  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     L    16_A     L    16_A     42  131  131     40   96  111  119  120  123  126  129  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     D    17_A     D    17_A     42  131  131     46   96  111  119  120  123  126  129  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     G    18_A     G    18_A     42  131  131      3   10   15   95  118  123  126  129  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     I    19_A     I    19_A     42  131  131      7   71  111  119  120  123  126  129  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     N    20_A     N    20_A     42  131  131      6   12   99  119  120  123  126  129  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     L    21_A     L    21_A     42  131  131      6   78  111  119  120  123  126  129  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     E    22_A     E    22_A     42  131  131      7   62  111  119  120  123  126  129  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     V    23_A     V    23_A     42  131  131     46   96  111  119  120  123  126  129  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A    24_A     A    24_A     42  131  131     41   96  111  119  120  123  126  129  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A    25_A     A    25_A     42  131  131     42   96  111  119  120  123  126  129  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     K    26_A     K    26_A     42  131  131     46   96  111  119  120  123  126  129  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     L    27_A     L    27_A     42  131  131     46   96  111  119  120  123  126  129  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     D    28_A     D    28_A     42  131  131     46   96  111  119  120  123  126  129  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     T    29_A     T    29_A     42  131  131     46   96  111  119  120  123  126  129  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     G    30_A     G    30_A     42  131  131     46   96  111  119  120  123  126  129  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A    31_A     A    31_A     42  131  131     46   96  111  119  120  123  126  129  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     K    32_A     K    32_A     42  131  131     46   96  111  119  120  123  126  129  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     T    33_A     T    33_A     42  131  131     28   95  111  119  120  123  126  129  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A    34_A     A    34_A     42  131  131     39   96  111  119  120  123  126  129  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     S    35_A     S    35_A     42  131  131     46   96  111  119  120  123  126  129  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     L    36_A     L    36_A     42  131  131     46   96  111  119  120  123  126  129  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     S    37_A     S    37_A     42  131  131     46   96  111  119  120  123  126  129  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A    38_A     A    38_A     42  131  131     39   96  111  119  120  123  126  129  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     R    39_A     R    39_A     42  131  131     23   90  111  119  120  123  126  129  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     D    40_A     D    40_A     42  131  131     23   87  111  119  120  123  126  129  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     I    41_A     I    41_A     42  131  131     29   96  111  119  120  123  126  129  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     K    42_A     K    42_A     42  131  131     19   84  111  119  120  123  126  129  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     R    43_A     R    43_A     42  131  131     13   93  111  119  120  123  126  129  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     F    44_A     F    44_A     42  131  131     20   93  111  119  120  123  126  129  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     K    45_A     K    45_A     42  131  131     28   96  111  119  120  123  126  129  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     R    46_A     R    46_A     42  131  131     10   96  111  119  120  123  126  129  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     N    47_A     N    47_A     40  131  131     43   96  111  119  120  123  126  129  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     G    48_A     G    48_A     40  131  131     10   95  111  119  120  123  126  129  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     E    49_A     E    49_A     40  131  131     34   94  111  119  120  123  126  129  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     S    50_A     S    50_A     40  131  131     28   96  111  119  120  123  126  129  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     W    51_A     W    51_A     40  131  131     44   96  111  119  120  123  126  129  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     V    52_A     V    52_A     40  131  131     38   96  111  119  120  123  126  129  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     R    53_A     R    53_A     40  131  131     35   96  111  119  120  123  126  129  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     F    54_A     F    54_A     40  131  131     35   96  111  119  120  123  126  129  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     Y    55_A     Y    55_A     40  131  131     19   83  111  119  120  123  126  129  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     L    56_A     L    56_A     40  131  131     25   85  111  119  120  123  126  129  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A    57_A     A    57_A     40  131  131     27   96  111  119  120  123  126  129  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     I    58_A     I    58_A     40  131  131     35   96  111  119  120  123  126  129  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     D    59_A     D    59_A     37  131  131      4   14   27   53  101  119  126  129  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A    60_A     A    60_A      4  131  131      4    4   34   58  109  121  124  128  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A    61_A     A    61_A      4  131  131      4    4    4    5    9    9   18   35   88  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     H    62_A     H    62_A      8  131  131      4    7    8   61  119  123  126  129  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     S    63_A     S    63_A     23  131  131      3   31   82  112  118  123  126  129  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     H    64_A     H    64_A     38  131  131     10   19   51   79  111  122  126  129  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     P    65_A     P    65_A     38  131  131     13   58  101  118  120  123  126  129  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     I    66_A     I    66_A     38  131  131     29   96  111  119  120  123  126  129  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     E    67_A     E    67_A     38  131  131     40   96  111  119  120  123  126  129  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     R    68_A     R    68_A     38  131  131     46   96  111  119  120  123  126  129  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     P    69_A     P    69_A     38  131  131     45   96  111  119  120  123  126  129  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     L    70_A     L    70_A     38  131  131     44   96  111  119  120  123  126  129  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A    71_A     A    71_A     38  131  131     44   96  111  119  120  123  126  129  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     R    72_A     R    72_A     38  131  131     32   96  111  119  120  123  126  129  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     V    73_A     V    73_A     38  131  131     42   96  111  119  120  123  126  129  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     S    74_A     S    74_A     38  131  131     43   96  111  119  120  123  126  129  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     K    75_A     K    75_A     38  131  131     46   96  111  119  120  123  126  129  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A    93_A     A    93_A     38  131  131     43   96  111  119  120  123  126  129  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     R    94_A     R    94_A     38  131  131     46   96  111  119  120  123  126  129  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     P    95_A     P    95_A     38  131  131     44   96  111  119  120  123  126  129  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     V    96_A     V    96_A     38  131  131     46   96  111  119  120  123  126  129  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     I    97_A     I    97_A     38  131  131     46   96  111  119  120  123  126  129  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     E    98_A     E    98_A     38  131  131     46   96  111  119  120  123  126  129  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     L    99_A     L    99_A     38  131  131     46   96  111  119  120  123  126  129  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     D   100_A     D   100_A     38  131  131     46   96  111  119  120  123  126  129  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     I   101_A     I   101_A     38  131  131     46   96  111  119  120  123  126  129  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     C   102_A     C   102_A     38  131  131     46   96  111  119  120  123  126  129  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     M   103_A     M   103_A     38  131  131     46   96  111  119  120  123  126  129  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     G   104_A     G   104_A     38  131  131     46   96  111  119  120  123  126  129  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     S   105_A     S   105_A     38  131  131     12   87  111  119  120  123  126  129  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A   106_A     A   106_A     38  131  131     39   96  111  119  120  123  126  129  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     M   107_A     M   107_A     38  131  131     46   96  111  119  120  123  126  129  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     R   108_A     R   108_A     38  131  131     46   96  111  119  120  123  126  129  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     S   109_A     S   109_A     38  131  131     46   96  111  119  120  123  126  129  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     I   110_A     I   110_A     38  131  131     43   96  111  119  120  123  126  129  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     E   111_A     E   111_A     38  131  131     41   96  111  119  120  123  126  129  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     V   112_A     V   112_A     38  131  131     46   96  111  119  120  123  126  129  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     N   113_A     N   113_A     38  131  131     46   96  111  119  120  123  126  129  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     L   114_A     L   114_A     38  131  131     46   96  111  119  120  123  126  129  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     T   115_A     T   115_A     38  131  131     46   96  111  119  120  123  126  129  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     D   116_A     D   116_A     38  131  131     46   96  111  119  120  123  126  129  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     R   117_A     R   117_A     38  131  131     46   96  111  119  120  123  126  129  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     S   118_A     S   118_A     38  131  131     20   54  104  119  120  122  126  129  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A   119_A     A   119_A     38  131  131      3    3    4    8  116  123  126  129  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     F   120_A     F   120_A      3  131  131      3    3   31  115  120  123  126  129  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     Q   121_A     Q   121_A     31  131  131      3    9   25   97  112  121  126  129  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     Y   122_A     Y   122_A     31  131  131     17   70  104  119  120  123  126  129  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     P   123_A     P   123_A     31  131  131     46   96  111  119  120  123  126  129  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     L   124_A     L   124_A     31  131  131     46   96  111  119  120  123  126  129  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     L   125_A     L   125_A     31  131  131     40   96  111  119  120  123  126  129  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     I   126_A     I   126_A     31  131  131     41   96  111  119  120  123  126  129  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     G   127_A     G   127_A     31  131  131     46   96  111  119  120  123  126  129  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     S   128_A     S   128_A     31  131  131     46   96  111  119  120  123  126  129  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     E   129_A     E   129_A     31  131  131     46   96  111  119  120  123  126  129  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A   130_A     A   130_A     31  131  131     46   96  111  119  120  123  126  129  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     L   131_A     L   131_A     31  131  131     46   96  111  119  120  123  126  129  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     K   132_A     K   132_A     31  131  131     46   96  111  119  120  123  126  129  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     R   133_A     R   133_A     31  131  131     46   96  111  119  120  123  126  129  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     F   134_A     F   134_A     31  131  131     46   96  111  119  120  123  126  129  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     D   135_A     D   135_A     31  131  131     46   96  111  119  120  123  126  129  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A   136_A     A   136_A     31  131  131     46   96  111  119  120  123  126  129  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     L   137_A     L   137_A     31  131  131     10   96  111  119  120  123  126  129  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     V   138_A     V   138_A     31  131  131     46   96  111  119  120  123  126  129  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     D   139_A     D   139_A     31  131  131     39   96  111  119  120  123  126  129  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     P   140_A     P   140_A     31  131  131     44   96  111  119  120  123  126  129  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     S   141_A     S   141_A     31  131  131     46   96  111  119  120  123  126  129  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     L   142_A     L   142_A     31  131  131     46   96  111  119  120  123  126  129  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     K   143_A     K   143_A     31  131  131      9   94  111  119  120  123  126  129  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     Y   144_A     Y   144_A     31  131  131      4   77  111  119  120  123  126  129  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A   145_A     A   145_A     31  131  131     46   96  111  119  120  123  126  129  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A   146_A     A   146_A     31  131  131     37   96  111  119  120  123  126  129  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     G   147_A     G   147_A     31  131  131     38   93  111  119  120  123  126  129  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     K   148_A     K   148_A     31  131  131     41   96  111  119  120  123  126  129  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     P   149_A     P   149_A     31  131  131     12   92  111  119  120  123  126  129  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A   150_A     A   150_A     31  131  131      5   61  111  119  120  123  126  129  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     C   151_A     C   151_A     31  131  131      3    3  108  119  120  123  126  129  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_AVERAGE  LCS_A:  75.95  (  27.85  100.00  100.00 )

GLOBAL_DISTANCE_TEST (summary information about detected largest sets of residues (represented by selected AToms) that can fit under specified thresholds)
GDT DIST_CUTOFF  0.50   1.00   1.50   2.00   2.50   3.00   3.50   4.00   4.50   5.00   5.50   6.00   6.50   7.00   7.50   8.00   8.50   9.00   9.50  10.00
GDT NUMBER_AT     46     96    111    119    120    123    126    129    130    130    131    131    131    131    131    131    131    131    131    131 
GDT PERCENT_AT  35.11  73.28  84.73  90.84  91.60  93.89  96.18  98.47  99.24  99.24 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00
GDT RMS_LOCAL    0.36   0.61   0.76   0.89   0.91   1.08   1.17   1.33   1.38   1.38   1.47   1.47   1.47   1.47   1.47   1.47   1.47   1.47   1.47   1.47
GDT RMS_ALL_AT   1.54   1.49   1.49   1.49   1.48   1.48   1.49   1.48   1.47   1.47   1.47   1.47   1.47   1.47   1.47   1.47   1.47   1.47   1.47   1.47

# Checking swapping
#   possible swapping detected:  Y     8_A      Y     8_A
#   possible swapping detected:  Y    13_A      Y    13_A
#   possible swapping detected:  E    22_A      E    22_A
#   possible swapping detected:  F    44_A      F    44_A
#   possible swapping detected:  E    49_A      E    49_A
#   possible swapping detected:  F    54_A      F    54_A
#   possible swapping detected:  Y    55_A      Y    55_A
#   possible swapping detected:  E    67_A      E    67_A
#   possible swapping detected:  E   111_A      E   111_A
#   possible swapping detected:  F   120_A      F   120_A
#   possible swapping detected:  E   129_A      E   129_A
#   possible swapping detected:  F   134_A      F   134_A
#   possible swapping detected:  Y   144_A      Y   144_A

#      Molecule1      Molecule2  DISTANCE    Mis    MC     All    Dist_max   GDC_mc  GDC_all
LGA    E     4_A      E     4_A     4.236     4    0.576   0.558     6.188   50.357   24.286
LGA    K     5_A      K     5_A     0.935     0    0.222   0.579     2.196   84.048   84.603
LGA    T     6_A      T     6_A     0.771     0    0.059   0.129     0.818   90.476   90.476
LGA    V     7_A      V     7_A     0.750     0    0.031   0.035     1.314   90.476   86.599
LGA    Y     8_A      Y     8_A     0.382     0    0.020   0.154     0.555  100.000   98.413
LGA    G     9_A      G     9_A     0.433     0    0.040   0.040     0.470  100.000  100.000
LGA    L    10_A      L    10_A     0.337     0    0.032   1.393     3.241  100.000   83.095
LGA    N    11_A      N    11_A     0.546     0    0.332   1.167     2.470   86.429   82.024
LGA    E    12_A      E    12_A     0.504     0    0.019   0.110     0.770   95.238   92.593
LGA    Y    13_A      Y    13_A     0.439     0    0.066   0.228     0.761   95.238   96.825
LGA    A    14_A      A    14_A     0.647     0    0.024   0.041     0.754   92.857   92.381
LGA    A    15_A      A    15_A     0.778     0    0.027   0.035     0.829   90.476   90.476
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LGA    F   120_A      F   120_A     2.971     0    0.537   0.748    10.487   62.976   27.922
LGA    Q   121_A      Q   121_A     4.140     0    0.686   0.572    10.110   43.690   22.593
LGA    Y   122_A      Y   122_A     2.037     0    0.238   0.288     2.771   66.905   73.730
LGA    P   123_A      P   123_A     0.595     0    0.037   0.050     1.027   90.476   90.544
LGA    L   124_A      L   124_A     0.724     0    0.031   0.069     1.283   90.476   87.083
LGA    L   125_A      L   125_A     0.949     0    0.053   0.115     1.361   85.952   84.821
LGA    I   126_A      I   126_A     0.816     0    0.042   0.600     1.928   90.476   88.274
LGA    G   127_A      G   127_A     0.668     0    0.032   0.032     0.740   92.857   92.857
LGA    S   128_A      S   128_A     0.424     0    0.033   0.602     1.948   97.619   92.302
LGA    E   129_A      E   129_A     0.118     0    0.024   0.885     4.003  100.000   83.545
LGA    A   130_A      A   130_A     0.118     0    0.030   0.039     0.215  100.000  100.000
LGA    L   131_A      L   131_A     0.206     0    0.043   0.088     0.559  100.000   97.619
LGA    K   132_A      K   132_A     0.116     0    0.010   0.558     1.747  100.000   93.862
LGA    R   133_A      R   133_A     0.250     0    0.016   0.963     2.429  100.000   87.792
LGA    F   134_A      F   134_A     0.528     0    0.021   0.298     0.632   95.238   95.671
LGA    D   135_A      D   135_A     0.322     0    0.027   0.245     2.152  100.000   88.690
LGA    A   136_A      A   136_A     0.322     0    0.020   0.038     1.223   92.976   92.476
LGA    L   137_A      L   137_A     1.028     0    0.113   0.145     1.529   85.952   81.548
LGA    V   138_A      V   138_A     0.533     0    0.045   0.052     0.952   90.476   90.476
LGA    D   139_A      D   139_A     0.733     0    0.085   0.198     1.409   92.857   89.405
LGA    P   140_A      P   140_A     0.668     0    0.013   0.314     1.991   95.238   89.388
LGA    S   141_A      S   141_A     0.507     0    0.057   0.060     0.657   92.857   92.063
LGA    L   142_A      L   142_A     0.517     0    0.062   0.148     0.696   92.857   92.857
LGA    K   143_A      K   143_A     1.047     0    0.635   0.786     3.519   75.833   69.418
LGA    Y   144_A      Y   144_A     1.428     0    0.099   0.089     2.444   79.286   72.302
LGA    A   145_A      A   145_A     0.847     0    0.039   0.043     0.866   90.476   90.476
LGA    A   146_A      A   146_A     0.706     0    0.664   0.605     3.097   78.095   80.571
LGA    G   147_A      G   147_A     1.284     0    0.069   0.069     1.695   79.286   79.286
LGA    K   148_A      K   148_A     1.002     4    0.075   0.101     1.157   81.429   46.243
LGA    P   149_A      P   149_A     1.379     0    0.049   0.099     1.678   79.286   77.755
LGA    A   150_A      A   150_A     1.866     0    0.087   0.084     3.053   71.071   66.857
LGA    C   151_A      C   151_A     1.737     0    0.224   0.313     3.808   75.476   67.063

# RMSD_GDC results:       CA      MC common percent     ALL common percent   GDC_mc  GDC_all
NUMBER_OF_ATOMS_AA:      131     524    524  100.00     992    992  100.00               131
SUMMARY(RMSD_GDC):     1.474          1.436                  2.119           85.532   78.916

#CA            N1   N2   DIST      N    RMSD    GDT_TS    LGA_S3     LGA_Q 
SUMMARY(GDT)  159  131    4.0    129    1.33    90.649    94.814     9.046

LGA_LOCAL      RMSD:   1.326  Number of atoms:  129  under DIST:   4.00
LGA_ASGN_ATOMS RMSD:   1.478  Number of assigned atoms:  131 
Std_ASGN_ATOMS RMSD:   1.474  Standard rmsd on all 131 assigned CA atoms 

Unitary ROTATION matrix and the SHIFT vector superimpose molecules  (1=>2)
  X_new =   0.918553 * X  +  -0.369369 * Y  +  -0.140810 * Z  + -17.481861
  Y_new =   0.225414 * X  +   0.196814 * Y  +   0.954177 * Z  +  34.754593
  Z_new =  -0.324730 * X  +  -0.908202 * Y  +   0.264045 * Z  +  29.602127 

Euler angles from the ROTATION matrix. Conventions XYZ and ZXZ:
           Phi     Theta       Psi   [DEG:       Phi     Theta       Psi ]
XYZ:  0.240646  0.330726 -1.287863   [DEG:   13.7880   18.9492  -73.7891 ]
ZXZ: -2.995078  1.303583 -2.798205   [DEG: -171.6053   74.6898 -160.3254 ]
 
# END of job
