
#######################################################
#                                                     #
#                        LGA                          #
#                  ---------------                    #
#                                                     #
#               Local-Global Alignment                #
#        A Method for Finding 3-D Similarities        #
#               in Protein Structures                 #
#                                                     #
#                  ------------ 10/2009               #
#                                                     #
#      Adam Zemla (adamz@llnl.gov)                    #
#      Lawrence Livermore National Laboratory, CA     #
#                                                     #
#######################################################

!!!   License for LGA program has expired  !!!
#   For updated version of the LGA program   #
# please contact Adam Zemla:  adamz@llnl.gov #

# Molecule1: number of CA atoms  159 ( 1222),  selected  131 , name one
# Molecule2: number of CA atoms  131 (  992),  selected  131 , name two
# PARAMETERS: input.pdb  -ie  -3  -d:4  -sda  -swap  -ch1:A  -ch2:A  
# FIXED Atom-Atom correspondence
# GDT and LCS analysis 

LCS - RMSD CUTOFF   5.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:   131       4_A - 151_A       1.52     1.52
  LCS_AVERAGE:    100.00

LCS - RMSD CUTOFF   2.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:   131       4_A - 151_A       1.52     1.52
  LCS_AVERAGE:    100.00

LCS - RMSD CUTOFF   1.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:    37      65_A - 118_A       0.92     1.57
  LCS_AVERAGE:     24.29

LCS_GDT    MOLECULE-1    MOLECULE-2     LCS_DETAILS     GDT_DETAILS                                                    TOTAL NUMBER OF RESIDUE PAIRS:  131
LCS_GDT     RESIDUE       RESIDUE       SEGMENT_SIZE    GLOBAL DISTANCE TEST COLUMNS: number of residues under the threshold assigned to each residue pair
LCS_GDT   NAME NUMBER   NAME NUMBER    1.0  2.0  5.0    0.5  1.0  1.5  2.0  2.5  3.0  3.5  4.0  4.5  5.0  5.5  6.0  6.5  7.0  7.5  8.0  8.5  9.0  9.5 10.0
LCS_GDT     E     4_A     E     4_A     13  131  131      3    3   14   72   92  116  123  126  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     K     5_A     K     5_A     15  131  131     50   90  104  117  120  123  126  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     T     6_A     T     6_A     15  131  131     67   91  108  117  120  123  126  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     V     7_A     V     7_A     15  131  131     67   91  108  117  120  123  126  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     Y     8_A     Y     8_A     15  131  131     67   91  108  117  120  123  126  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     G     9_A     G     9_A     15  131  131     67   91  108  117  120  123  126  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     L    10_A     L    10_A     15  131  131     67   91  108  117  120  123  126  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     N    11_A     N    11_A     15  131  131     67   91  108  117  120  123  126  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     E    12_A     E    12_A     15  131  131     67   91  108  117  120  123  126  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     Y    13_A     Y    13_A     15  131  131     67   91  108  117  120  123  126  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A    14_A     A    14_A     15  131  131     67   91  108  117  120  123  126  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A    15_A     A    15_A     15  131  131     67   91  108  117  120  123  126  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     L    16_A     L    16_A     15  131  131     56   91  108  117  120  123  126  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     D    17_A     D    17_A     22  131  131     26   91  108  117  120  123  126  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     G    18_A     G    18_A     26  131  131      4   23   70  112  120  123  126  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     I    19_A     I    19_A     26  131  131      4   11   51  111  120  123  126  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     N    20_A     N    20_A     26  131  131      4   23   65  111  120  123  126  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     L    21_A     L    21_A     26  131  131      4   62  102  117  120  123  126  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     E    22_A     E    22_A     36  131  131     10   51   99  117  120  123  126  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     V    23_A     V    23_A     36  131  131     67   91  108  117  120  123  126  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A    24_A     A    24_A     36  131  131     58   91  108  117  120  123  126  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A    25_A     A    25_A     36  131  131     67   91  108  117  120  123  126  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     K    26_A     K    26_A     36  131  131     67   91  108  117  120  123  126  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     L    27_A     L    27_A     36  131  131     67   91  108  117  120  123  126  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     D    28_A     D    28_A     36  131  131     67   91  108  117  120  123  126  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     T    29_A     T    29_A     36  131  131     67   91  108  117  120  123  126  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     G    30_A     G    30_A     36  131  131     67   91  108  117  120  123  126  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A    31_A     A    31_A     36  131  131     67   91  108  117  120  123  126  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     K    32_A     K    32_A     36  131  131     67   91  108  117  120  123  126  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     T    33_A     T    33_A     36  131  131     67   91  108  117  120  123  126  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A    34_A     A    34_A     36  131  131     67   91  108  117  120  123  126  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     S    35_A     S    35_A     36  131  131     67   91  108  117  120  123  126  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     L    36_A     L    36_A     36  131  131     58   91  108  117  120  123  126  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     S    37_A     S    37_A     36  131  131     53   91  108  117  120  123  126  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A    38_A     A    38_A     36  131  131     34   91  108  117  120  123  126  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     R    39_A     R    39_A     36  131  131     28   69  108  117  120  123  126  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     D    40_A     D    40_A     36  131  131     28   69  107  117  120  123  126  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     I    41_A     I    41_A     36  131  131     28   71  108  117  120  123  126  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     K    42_A     K    42_A     36  131  131     19   58  108  117  120  123  126  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     R    43_A     R    43_A     36  131  131     20   81  108  117  120  123  126  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     F    44_A     F    44_A     36  131  131     34   91  108  117  120  123  126  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     K    45_A     K    45_A     36  131  131     34   91  108  117  120  123  126  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     R    46_A     R    46_A     36  131  131     30   89  108  117  120  123  126  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     N    47_A     N    47_A     36  131  131     28   85  108  117  120  123  126  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     G    48_A     G    48_A     36  131  131     19   91  108  117  120  123  126  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     E    49_A     E    49_A     36  131  131     43   91  108  117  120  123  126  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     S    50_A     S    50_A     36  131  131     67   91  108  117  120  123  126  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     W    51_A     W    51_A     36  131  131     41   91  108  117  120  123  126  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     V    52_A     V    52_A     36  131  131     34   91  108  117  120  123  126  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     R    53_A     R    53_A     36  131  131     22   75  108  117  120  123  126  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     F    54_A     F    54_A     36  131  131     28   75  108  117  120  123  126  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     Y    55_A     Y    55_A     36  131  131     20   61   97  117  120  123  126  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     L    56_A     L    56_A     36  131  131     27   69  108  117  120  123  126  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A    57_A     A    57_A     36  131  131     30   76  108  117  120  123  126  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     I    58_A     I    58_A     36  131  131     12   76  108  117  120  123  126  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     D    59_A     D    59_A     35  131  131      4    4    4    4   48  117  126  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A    60_A     A    60_A      4  131  131      4    4   94  116  120  123  126  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A    61_A     A    61_A      5  131  131      4    6   34  104  117  122  126  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     H    62_A     H    62_A      5  131  131      4    6   35   63  115  121  126  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     S    63_A     S    63_A     20  131  131      4   28   48   67  104  119  126  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     H    64_A     H    64_A     20  131  131      4   28   53   65   94  117  126  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     P    65_A     P    65_A     37  131  131     11   42   69  102  119  123  126  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     I    66_A     I    66_A     37  131  131     20   65  107  117  120  123  126  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     E    67_A     E    67_A     37  131  131     27   75  108  117  120  123  126  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     R    68_A     R    68_A     37  131  131     31   91  108  117  120  123  126  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     P    69_A     P    69_A     37  131  131     57   91  108  117  120  123  126  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     L    70_A     L    70_A     37  131  131     66   91  108  117  120  123  126  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A    71_A     A    71_A     37  131  131     67   91  108  117  120  123  126  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     R    72_A     R    72_A     37  131  131     67   91  108  117  120  123  126  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     V    73_A     V    73_A     37  131  131     67   91  108  117  120  123  126  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     S    74_A     S    74_A     37  131  131     58   91  108  117  120  123  126  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     K    75_A     K    75_A     37  131  131     54   91  108  117  120  123  126  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A    93_A     A    93_A     37  131  131     56   91  108  117  120  123  126  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     R    94_A     R    94_A     37  131  131     55   91  108  117  120  123  126  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     P    95_A     P    95_A     37  131  131     67   91  108  117  120  123  126  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     V    96_A     V    96_A     37  131  131     67   91  108  117  120  123  126  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     I    97_A     I    97_A     37  131  131     53   91  108  117  120  123  126  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     E    98_A     E    98_A     37  131  131     58   91  108  117  120  123  126  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     L    99_A     L    99_A     37  131  131     67   91  108  117  120  123  126  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     D   100_A     D   100_A     37  131  131     67   91  108  117  120  123  126  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     I   101_A     I   101_A     37  131  131     67   91  108  117  120  123  126  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     C   102_A     C   102_A     37  131  131     67   91  108  117  120  123  126  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     M   103_A     M   103_A     37  131  131     67   91  108  117  120  123  126  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     G   104_A     G   104_A     37  131  131     67   91  108  117  120  123  126  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     S   105_A     S   105_A     37  131  131     67   91  108  117  120  123  126  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A   106_A     A   106_A     37  131  131     67   91  108  117  120  123  126  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     M   107_A     M   107_A     37  131  131     67   91  108  117  120  123  126  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     R   108_A     R   108_A     37  131  131     67   91  108  117  120  123  126  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     S   109_A     S   109_A     37  131  131     67   91  108  117  120  123  126  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     I   110_A     I   110_A     37  131  131     38   91  108  117  120  123  126  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     E   111_A     E   111_A     37  131  131     67   91  108  117  120  123  126  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     V   112_A     V   112_A     37  131  131     67   91  108  117  120  123  126  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     N   113_A     N   113_A     37  131  131     67   91  108  117  120  123  126  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     L   114_A     L   114_A     37  131  131     53   91  108  117  120  123  126  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     T   115_A     T   115_A     37  131  131     40   91  108  117  120  123  126  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     D   116_A     D   116_A     37  131  131     33   91  108  117  120  123  126  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     R   117_A     R   117_A     37  131  131      3   87  103  117  120  123  126  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     S   118_A     S   118_A     37  131  131     67   91  104  117  120  123  126  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A   119_A     A   119_A     35  131  131      3    3    4    6   12  104  125  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     F   120_A     F   120_A     32  131  131      3    5   14   71  115  121  126  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     Q   121_A     Q   121_A     32  131  131      3   19   79  104  119  123  126  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     Y   122_A     Y   122_A     32  131  131     43   91  108  117  120  123  126  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     P   123_A     P   123_A     32  131  131     58   91  108  117  120  123  126  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     L   124_A     L   124_A     32  131  131     67   91  108  117  120  123  126  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     L   125_A     L   125_A     32  131  131     67   91  108  117  120  123  126  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     I   126_A     I   126_A     32  131  131     67   91  108  117  120  123  126  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     G   127_A     G   127_A     32  131  131     67   91  108  117  120  123  126  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     S   128_A     S   128_A     32  131  131     67   91  108  117  120  123  126  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     E   129_A     E   129_A     32  131  131     67   91  108  117  120  123  126  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A   130_A     A   130_A     32  131  131     67   91  108  117  120  123  126  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     L   131_A     L   131_A     32  131  131     67   91  108  117  120  123  126  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     K   132_A     K   132_A     32  131  131     67   91  108  117  120  123  126  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     R   133_A     R   133_A     32  131  131     67   91  108  117  120  123  126  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     F   134_A     F   134_A     32  131  131     67   91  108  117  120  123  126  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     D   135_A     D   135_A     32  131  131     67   91  108  117  120  123  126  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A   136_A     A   136_A     32  131  131     67   91  108  117  120  123  126  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     L   137_A     L   137_A     32  131  131     67   91  108  117  120  123  126  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     V   138_A     V   138_A     32  131  131     67   91  108  117  120  123  126  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     D   139_A     D   139_A     32  131  131     67   91  108  117  120  123  126  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     P   140_A     P   140_A     32  131  131     67   91  108  117  120  123  126  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     S   141_A     S   141_A     32  131  131     67   91  108  117  120  123  126  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     L   142_A     L   142_A     32  131  131     67   91  108  117  120  123  126  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     K   143_A     K   143_A     32  131  131     67   91  108  117  120  123  126  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     Y   144_A     Y   144_A     32  131  131     67   91  108  117  120  123  126  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A   145_A     A   145_A     32  131  131     67   91  108  117  120  123  126  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A   146_A     A   146_A     32  131  131     65   91  108  117  120  123  126  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     G   147_A     G   147_A     32  131  131     67   91  108  117  120  123  126  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     K   148_A     K   148_A     32  131  131     67   91  108  117  120  123  126  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     P   149_A     P   149_A     32  131  131     67   91  108  117  120  123  126  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A   150_A     A   150_A     32  131  131     65   91  105  117  120  123  126  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     C   151_A     C   151_A     32  131  131     67   91  108  117  120  123  126  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_AVERAGE  LCS_A:  74.76  (  24.29  100.00  100.00 )

GLOBAL_DISTANCE_TEST (summary information about detected largest sets of residues (represented by selected AToms) that can fit under specified thresholds)
GDT DIST_CUTOFF  0.50   1.00   1.50   2.00   2.50   3.00   3.50   4.00   4.50   5.00   5.50   6.00   6.50   7.00   7.50   8.00   8.50   9.00   9.50  10.00
GDT NUMBER_AT     67     91    108    117    120    123    126    130    131    131    131    131    131    131    131    131    131    131    131    131 
GDT PERCENT_AT  51.15  69.47  82.44  89.31  91.60  93.89  96.18  99.24 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00
GDT RMS_LOCAL    0.32   0.47   0.82   0.94   1.03   1.12   1.28   1.47   1.52   1.52   1.52   1.52   1.52   1.52   1.52   1.52   1.52   1.52   1.52   1.52
GDT RMS_ALL_AT   1.90   1.76   1.55   1.55   1.54   1.54   1.53   1.52   1.52   1.52   1.52   1.52   1.52   1.52   1.52   1.52   1.52   1.52   1.52   1.52

# Checking swapping
#   possible swapping detected:  E    12_A      E    12_A
#   possible swapping detected:  D    59_A      D    59_A
#   possible swapping detected:  E    67_A      E    67_A
#   possible swapping detected:  F   120_A      F   120_A
#   possible swapping detected:  Y   122_A      Y   122_A

#      Molecule1      Molecule2  DISTANCE    Mis    MC     All    Dist_max   GDC_mc  GDC_all
LGA    E     4_A      E     4_A     4.784     4    0.490   0.473     6.066   43.690   21.323
LGA    K     5_A      K     5_A     1.814     0    0.137   0.665     3.775   68.929   60.952
LGA    T     6_A      T     6_A     0.990     0    0.058   0.070     1.143   88.214   86.599
LGA    V     7_A      V     7_A     0.882     0    0.021   0.055     1.021   90.476   89.184
LGA    Y     8_A      Y     8_A     0.466     0    0.075   0.137     0.677   95.238   92.063
LGA    G     9_A      G     9_A     0.631     0    0.035   0.035     0.631   92.857   92.857
LGA    L    10_A      L    10_A     0.473     0    0.049   0.089     0.601   97.619   94.048
LGA    N    11_A      N    11_A     0.486     0    0.019   1.044     2.636  100.000   88.869
LGA    E    12_A      E    12_A     0.533     0    0.054   0.101     0.928   92.857   96.825
LGA    Y    13_A      Y    13_A     1.062     0    0.007   0.125     3.157   88.214   72.143
LGA    A    14_A      A    14_A     0.702     0    0.129   0.168     0.907   90.476   92.381
LGA    A    15_A      A    15_A     1.223     0    0.019   0.030     1.374   85.952   85.048
LGA    L    16_A      L    16_A     0.646     0    0.084   0.954     3.593   95.238   84.762
LGA    D    17_A      D    17_A     0.690     0    0.073   0.266     1.836   84.048   92.024
LGA    G    18_A      G    18_A     2.897     0    0.099   0.099     4.328   52.262   52.262
LGA    I    19_A      I    19_A     2.924     0    0.648   0.635     3.930   53.690   55.417
LGA    N    20_A      N    20_A     3.348     0    0.140   0.890     7.993   51.786   34.345
LGA    L    21_A      L    21_A     2.305     0    0.051   1.369     3.562   62.857   61.190
LGA    E    22_A      E    22_A     2.379     0    0.025   0.592     4.675   64.881   53.069
LGA    V    23_A      V    23_A     1.153     0    0.061   1.062     2.958   81.429   78.027
LGA    A    24_A      A    24_A     1.372     0    0.017   0.029     1.682   81.429   79.714
LGA    A    25_A      A    25_A     0.799     0    0.017   0.027     0.936   90.476   90.476
LGA    K    26_A      K    26_A     0.747     0    0.018   0.265     1.358   90.476   89.471
LGA    L    27_A      L    27_A     0.503     0    0.021   0.071     0.725   90.476   94.048
LGA    D    28_A      D    28_A     0.586     0    0.027   0.251     1.620   90.476   88.274
LGA    T    29_A      T    29_A     0.561     0    0.070   0.101     0.867   90.476   91.837
LGA    G    30_A      G    30_A     0.877     0    0.023   0.023     1.181   85.952   85.952
LGA    A    31_A      A    31_A     1.124     0    0.032   0.039     1.197   85.952   85.048
LGA    K    32_A      K    32_A     0.930     0    0.017   0.943     3.647   90.595   76.614
LGA    T    33_A      T    33_A     0.718     0    0.045   0.087     1.090   90.476   89.184
LGA    A    34_A      A    34_A     0.741     0    0.014   0.033     0.767   92.857   92.381
LGA    S    35_A      S    35_A     0.652     0    0.024   0.732     2.284   90.476   86.190
LGA    L    36_A      L    36_A     0.623     0    0.041   0.110     0.901   92.857   91.667
LGA    S    37_A      S    37_A     0.694     0    0.046   0.051     0.983   90.476   90.476
LGA    A    38_A      A    38_A     0.680     0    0.076   0.099     1.293   88.333   90.667
LGA    R    39_A      R    39_A     1.614     0    0.071   1.113     3.798   75.000   66.580
LGA    D    40_A      D    40_A     1.765     0    0.077   0.131     2.490   72.857   69.821
LGA    I    41_A      I    41_A     1.285     0    0.082   0.147     1.927   77.143   82.679
LGA    K    42_A      K    42_A     1.612     4    0.039   0.052     1.865   79.286   43.333
LGA    R    43_A      R    43_A     1.162     0    0.022   1.071     3.410   81.429   75.584
LGA    F    44_A      F    44_A     0.769     0    0.042   0.114     0.874   90.476   90.476
LGA    K    45_A      K    45_A     0.588     0    0.009   0.849     4.281   90.476   79.735
LGA    R    46_A      R    46_A     0.962     0    0.028   0.253     1.822   85.952   79.957
LGA    N    47_A      N    47_A     1.340     0    0.026   0.294     2.411   79.286   75.060
LGA    G    48_A      G    48_A     1.353     0    0.036   0.036     1.520   79.286   79.286
LGA    E    49_A      E    49_A     1.480     0    0.037   0.981     2.481   83.690   77.778
LGA    S    50_A      S    50_A     1.022     0    0.014   0.035     1.509   85.952   83.016
LGA    W    51_A      W    51_A     0.352     0    0.039   0.133     1.125  100.000   92.585
LGA    V    52_A      V    52_A     0.531     0    0.050   0.102     0.717   92.857   94.558
LGA    R    53_A      R    53_A     1.280     0    0.010   0.954     3.870   83.690   69.870
LGA    F    54_A      F    54_A     1.350     0    0.016   0.100     1.796   77.143   85.628
LGA    Y    55_A      Y    55_A     2.044     0    0.042   0.194     3.228   70.833   61.786
LGA    L    56_A      L    56_A     1.624     0    0.065   0.154     2.296   77.143   75.060
LGA    A    57_A      A    57_A     1.225     0    0.459   0.418     2.651   75.357   73.238
LGA    I    58_A      I    58_A     1.309     0    0.164   1.187     4.653   67.738   62.500
LGA    D    59_A      D    59_A     4.268     0    0.419   1.186     6.138   50.357   34.821
LGA    A    60_A      A    60_A     2.087     0    0.076   0.074     2.677   60.952   61.714
LGA    A    61_A      A    61_A     3.305     0    0.177   0.196     3.927   50.357   48.952
LGA    H    62_A      H    62_A     3.722     0    0.087   0.712    11.584   40.714   19.190
LGA    S    63_A      S    63_A     4.353     0    0.117   0.670     6.425   37.619   36.667
LGA    H    64_A      H    64_A     4.270     0    0.232   0.279     7.795   43.452   28.714
LGA    P    65_A      P    65_A     3.072     0    0.031   0.348     4.148   50.119   46.327
LGA    I    66_A      I    66_A     1.765     0    0.044   0.150     1.973   77.143   76.071
LGA    E    67_A      E    67_A     1.245     0    0.041   0.213     1.762   79.286   77.619
LGA    R    68_A      R    68_A     0.826     0    0.032   0.258     1.238   90.476   88.831
LGA    P    69_A      P    69_A     0.404     0    0.014   0.342     1.398   95.238   91.905
LGA    L    70_A      L    70_A     0.371     0    0.104   0.246     0.944  100.000   95.238
LGA    A    71_A      A    71_A     0.694     0    0.015   0.018     0.831   90.476   90.476
LGA    R    72_A      R    72_A     0.658     0    0.066   0.976     3.352   90.476   85.152
LGA    V    73_A      V    73_A     0.486     0    0.030   0.045     0.594   92.857   95.918
LGA    S    74_A      S    74_A     0.496     0    0.182   0.547     2.386   90.595   86.270
LGA    K    75_A      K    75_A     0.774     4    0.219   0.274     2.432   81.786   44.444
LGA    A    93_A      A    93_A     0.482     0    0.539   0.586     3.062   86.905   79.524
LGA    R    94_A      R    94_A     0.569     4    0.087   0.109     0.751   90.476   60.173
LGA    P    95_A      P    95_A     0.526     0    0.020   0.098     0.755   95.238   94.558
LGA    V    96_A      V    96_A     0.649     0    0.025   0.048     0.953   90.476   90.476
LGA    I    97_A      I    97_A     0.790     0    0.041   0.079     0.825   90.476   90.476
LGA    E    98_A      E    98_A     0.539     0    0.058   0.699     2.850   92.857   78.413
LGA    L    99_A      L    99_A     0.486     0    0.032   0.060     0.630  100.000   95.238
LGA    D   100_A      D   100_A     0.582     0    0.077   0.518     1.926   90.476   88.274
LGA    I   101_A      I   101_A     0.893     0    0.063   0.106     0.997   90.476   90.476
LGA    C   102_A      C   102_A     0.934     0    0.036   0.076     1.293   90.476   87.460
LGA    M   103_A      M   103_A     0.807     0    0.043   1.065     3.077   90.476   82.083
LGA    G   104_A      G   104_A     0.909     0    0.035   0.035     1.090   85.952   85.952
LGA    S   105_A      S   105_A     1.287     0    0.078   0.140     1.499   83.690   82.937
LGA    A   106_A      A   106_A     0.919     0    0.031   0.034     1.084   88.214   88.667
LGA    M   107_A      M   107_A     0.848     0    0.014   0.135     0.972   90.476   90.476
LGA    R   108_A      R   108_A     0.562     0    0.058   0.476     2.702   90.476   84.242
LGA    S   109_A      S   109_A     0.438     0    0.035   0.065     0.510   97.619   96.825
LGA    I   110_A      I   110_A     0.557     0    0.053   1.504     3.399   97.619   82.619
LGA    E   111_A      E   111_A     0.303     0    0.050   0.739     2.164  100.000   88.942
LGA    V   112_A      V   112_A     0.657     0    0.065   1.038     2.229   90.476   83.129
LGA    N   113_A      N   113_A     0.529     0    0.028   1.327     4.075   95.238   78.810
LGA    L   114_A      L   114_A     0.293     0    0.054   0.077     0.487  100.000  100.000
LGA    T   115_A      T   115_A     0.558     0    0.026   0.091     1.076   95.238   90.612
LGA    D   116_A      D   116_A     0.852     0    0.428   1.132     5.932   82.262   61.905
LGA    R   117_A      R   117_A     1.682     0    0.606   0.972     3.831   69.286   67.403
LGA    S   118_A      S   118_A     1.810     0    0.654   0.623     4.677   73.333   61.349
LGA    A   119_A      A   119_A     4.787     0    0.062   0.058     7.310   36.786   31.429
LGA    F   120_A      F   120_A     3.590     0    0.552   1.022    11.473   57.738   24.978
LGA    Q   121_A      Q   121_A     3.014     0    0.654   0.947    10.241   55.476   30.794
LGA    Y   122_A      Y   122_A     1.468     0    0.051   0.277     1.912   79.286   82.976
LGA    P   123_A      P   123_A     0.627     0    0.016   0.335     1.342   92.857   89.252
LGA    L   124_A      L   124_A     0.736     0    0.044   0.124     0.899   90.476   90.476
LGA    L   125_A      L   125_A     0.807     0    0.024   0.103     0.997   90.476   90.476
LGA    I   126_A      I   126_A     0.570     0    0.007   0.596     1.879   90.476   90.655
LGA    G   127_A      G   127_A     0.548     0    0.056   0.056     0.562   92.857   92.857
LGA    S   128_A      S   128_A     0.417     0    0.032   0.086     1.000  100.000   96.825
LGA    E   129_A      E   129_A     0.431     0    0.026   0.907     3.262  100.000   85.608
LGA    A   130_A      A   130_A     0.091     0    0.049   0.063     0.414  100.000  100.000
LGA    L   131_A      L   131_A     0.310     0    0.033   0.046     0.426  100.000  100.000
LGA    K   132_A      K   132_A     0.391     0    0.023   0.770     2.651   97.619   89.418
LGA    R   133_A      R   133_A     0.621     0    0.022   1.064     3.472   92.857   83.030
LGA    F   134_A      F   134_A     0.834     0    0.037   0.161     1.205   88.214   89.654
LGA    D   135_A      D   135_A     1.083     0    0.059   0.348     2.180   81.548   77.262
LGA    A   136_A      A   136_A     0.839     0    0.058   0.063     1.018   88.214   88.667
LGA    L   137_A      L   137_A     0.934     0    0.017   0.275     2.595   90.476   80.774
LGA    V   138_A      V   138_A     0.753     0    0.012   0.040     1.051   88.214   89.184
LGA    D   139_A      D   139_A     0.800     0    0.024   0.053     0.976   90.476   90.476
LGA    P   140_A      P   140_A     0.947     0    0.025   0.034     1.177   90.476   86.599
LGA    S   141_A      S   141_A     0.800     0    0.050   0.057     0.895   90.476   90.476
LGA    L   142_A      L   142_A     0.506     0    0.021   0.064     0.780   95.238   94.048
LGA    K   143_A      K   143_A     0.343     0    0.043   0.683     2.856  100.000   90.000
LGA    Y   144_A      Y   144_A     0.641     0    0.044   0.087     1.595   92.857   86.786
LGA    A   145_A      A   145_A     0.681     0    0.041   0.053     1.009   88.214   88.667
LGA    A   146_A      A   146_A     1.018     0    0.024   0.046     1.244   83.690   83.238
LGA    G   147_A      G   147_A     1.057     0    0.017   0.017     1.068   81.429   81.429
LGA    K   148_A      K   148_A     1.158     4    0.022   0.022     1.228   81.429   45.238
LGA    P   149_A      P   149_A     1.249     0    0.021   0.037     1.488   81.429   81.429
LGA    A   150_A      A   150_A     1.690     0    0.227   0.218     2.104   79.286   76.381
LGA    C   151_A      C   151_A     0.884     0    0.549   0.619     2.125   81.786   83.175

# RMSD_GDC results:       CA      MC common percent     ALL common percent   GDC_mc  GDC_all
NUMBER_OF_ATOMS_AA:      131     524    524  100.00     992    992  100.00               131
SUMMARY(RMSD_GDC):     1.520          1.505                  2.151           83.730   78.592

#CA            N1   N2   DIST      N    RMSD    GDT_TS    LGA_S3     LGA_Q 
SUMMARY(GDT)  159  131    4.0    130    1.47    89.504    94.345     8.286

LGA_LOCAL      RMSD:   1.469  Number of atoms:  130  under DIST:   4.00
LGA_ASGN_ATOMS RMSD:   1.522  Number of assigned atoms:  131 
Std_ASGN_ATOMS RMSD:   1.520  Standard rmsd on all 131 assigned CA atoms 

Unitary ROTATION matrix and the SHIFT vector superimpose molecules  (1=>2)
  X_new =   0.426986 * X  +  -0.891664 * Y  +   0.150397 * Z  + -29.687395
  Y_new =  -0.890131 * X  +  -0.443746 * Y  +  -0.103718 * Z  +  27.657021
  Z_new =   0.159219 * X  +  -0.089587 * Y  +  -0.983170 * Z  +   3.501832 

Euler angles from the ROTATION matrix. Conventions XYZ and ZXZ:
           Phi     Theta       Psi   [DEG:       Phi     Theta       Psi ]
XYZ: -1.123529 -0.159900 -3.050723   [DEG:  -64.3735   -9.1616 -174.7936 ]
ZXZ:  0.967066  2.957868  2.083310   [DEG:   55.4088  169.4734  119.3649 ]
 
# END of job
