
#######################################################
#                                                     #
#                        LGA                          #
#                  ---------------                    #
#                                                     #
#               Local-Global Alignment                #
#        A Method for Finding 3-D Similarities        #
#               in Protein Structures                 #
#                                                     #
#                  ------------ 10/2009               #
#                                                     #
#      Adam Zemla (adamz@llnl.gov)                    #
#      Lawrence Livermore National Laboratory, CA     #
#                                                     #
#######################################################

!!!   License for LGA program has expired  !!!
#   For updated version of the LGA program   #
# please contact Adam Zemla:  adamz@llnl.gov #

# Molecule1: number of CA atoms  159 ( 1222),  selected  131 , name one
# Molecule2: number of CA atoms  131 (  992),  selected  131 , name two
# PARAMETERS: input.pdb  -ie  -3  -d:4  -sda  -swap  -ch1:A  -ch2:A  
# FIXED Atom-Atom correspondence
# GDT and LCS analysis 

LCS - RMSD CUTOFF   5.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:   131       4_A - 151_A       1.52     1.52
  LCS_AVERAGE:    100.00

LCS - RMSD CUTOFF   2.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:   131       4_A - 151_A       1.52     1.52
  LCS_AVERAGE:    100.00

LCS - RMSD CUTOFF   1.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:    37      22_A - 58_A        0.97     1.71
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:    37      65_A - 118_A       0.95     1.57
  LCS_AVERAGE:     24.60

LCS_GDT    MOLECULE-1    MOLECULE-2     LCS_DETAILS     GDT_DETAILS                                                    TOTAL NUMBER OF RESIDUE PAIRS:  131
LCS_GDT     RESIDUE       RESIDUE       SEGMENT_SIZE    GLOBAL DISTANCE TEST COLUMNS: number of residues under the threshold assigned to each residue pair
LCS_GDT   NAME NUMBER   NAME NUMBER    1.0  2.0  5.0    0.5  1.0  1.5  2.0  2.5  3.0  3.5  4.0  4.5  5.0  5.5  6.0  6.5  7.0  7.5  8.0  8.5  9.0  9.5 10.0
LCS_GDT     E     4_A     E     4_A     13  131  131      3    3   15   70   90  115  122  127  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     K     5_A     K     5_A     15  131  131     29   83  103  116  120  123  127  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     T     6_A     T     6_A     15  131  131     58   92  107  116  120  123  127  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     V     7_A     V     7_A     15  131  131     58   92  107  116  120  123  127  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     Y     8_A     Y     8_A     15  131  131     58   92  107  116  120  123  127  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     G     9_A     G     9_A     15  131  131     58   92  107  116  120  123  127  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     L    10_A     L    10_A     15  131  131     58   92  107  116  120  123  127  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     N    11_A     N    11_A     15  131  131     58   92  107  116  120  123  127  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     E    12_A     E    12_A     15  131  131     58   92  107  116  120  123  127  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     Y    13_A     Y    13_A     15  131  131     58   92  107  116  120  123  127  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A    14_A     A    14_A     15  131  131     58   92  107  116  120  123  127  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A    15_A     A    15_A     15  131  131     58   92  107  116  120  123  127  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     L    16_A     L    16_A     15  131  131     45   92  107  116  120  123  127  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     D    17_A     D    17_A     28  131  131     25   92  107  116  120  123  127  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     G    18_A     G    18_A     28  131  131      6   25   73  113  120  123  127  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     I    19_A     I    19_A     28  131  131      4   15   56  113  120  123  127  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     N    20_A     N    20_A     28  131  131      3   16   66  113  120  123  126  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     L    21_A     L    21_A     28  131  131      5   63   99  116  120  123  127  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     E    22_A     E    22_A     37  131  131      5   54   99  116  120  123  127  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     V    23_A     V    23_A     37  131  131     58   92  107  116  120  123  127  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A    24_A     A    24_A     37  131  131     58   92  107  116  120  123  127  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A    25_A     A    25_A     37  131  131     58   92  107  116  120  123  127  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     K    26_A     K    26_A     37  131  131     58   92  107  116  120  123  127  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     L    27_A     L    27_A     37  131  131     58   92  107  116  120  123  127  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     D    28_A     D    28_A     37  131  131     58   92  107  116  120  123  127  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     T    29_A     T    29_A     37  131  131     58   92  107  116  120  123  127  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     G    30_A     G    30_A     37  131  131     58   92  107  116  120  123  127  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A    31_A     A    31_A     37  131  131     58   92  107  116  120  123  127  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     K    32_A     K    32_A     37  131  131     58   92  107  116  120  123  127  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     T    33_A     T    33_A     37  131  131     58   92  107  116  120  123  127  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A    34_A     A    34_A     37  131  131     58   92  107  116  120  123  127  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     S    35_A     S    35_A     37  131  131     58   92  107  116  120  123  127  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     L    36_A     L    36_A     37  131  131     57   92  107  116  120  123  127  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     S    37_A     S    37_A     37  131  131     47   92  107  116  120  123  127  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A    38_A     A    38_A     37  131  131     30   92  107  116  120  123  127  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     R    39_A     R    39_A     37  131  131     26   73  107  116  120  123  127  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     D    40_A     D    40_A     37  131  131     25   73  106  116  120  123  127  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     I    41_A     I    41_A     37  131  131     25   73  107  116  120  123  127  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     K    42_A     K    42_A     37  131  131     16   57  107  116  120  123  127  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     R    43_A     R    43_A     37  131  131     24   89  107  116  120  123  127  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     F    44_A     F    44_A     37  131  131     30   92  107  116  120  123  127  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     K    45_A     K    45_A     37  131  131     30   92  107  116  120  123  127  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     R    46_A     R    46_A     37  131  131     27   77  107  116  120  123  127  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     N    47_A     N    47_A     37  131  131     21   75  107  116  120  123  127  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     G    48_A     G    48_A     37  131  131     16   85  107  116  120  123  127  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     E    49_A     E    49_A     37  131  131     21   83  107  116  120  123  127  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     S    50_A     S    50_A     37  131  131     34   92  107  116  120  123  127  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     W    51_A     W    51_A     37  131  131     31   92  107  116  120  123  127  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     V    52_A     V    52_A     37  131  131     30   92  107  116  120  123  127  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     R    53_A     R    53_A     37  131  131     27   73  107  116  120  123  127  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     F    54_A     F    54_A     37  131  131     27   73  107  116  120  123  127  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     Y    55_A     Y    55_A     37  131  131     25   67  103  116  120  123  127  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     L    56_A     L    56_A     37  131  131     27   73  107  116  120  123  127  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A    57_A     A    57_A     37  131  131     30   86  107  116  120  123  127  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     I    58_A     I    58_A     37  131  131     20   81  107  116  120  123  127  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     D    59_A     D    59_A     35  131  131      4    4    4    9   46   79  127  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A    60_A     A    60_A      4  131  131      4    4   94  115  119  123  127  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A    61_A     A    61_A      6  131  131      4    6   41  102  118  122  127  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     H    62_A     H    62_A      6  131  131      4    6   47   88  117  121  127  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     S    63_A     S    63_A     20  131  131     15   31   52   83  111  120  127  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     H    64_A     H    64_A     20  131  131      4   17   49   66   95  115  125  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     P    65_A     P    65_A     37  131  131      9   40   68   96  119  123  127  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     I    66_A     I    66_A     37  131  131     25   67  105  116  120  123  127  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     E    67_A     E    67_A     37  131  131     27   73  107  116  120  123  127  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     R    68_A     R    68_A     37  131  131     30   88  107  116  120  123  127  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     P    69_A     P    69_A     37  131  131     44   92  107  116  120  123  127  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     L    70_A     L    70_A     37  131  131     49   92  107  116  120  123  127  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A    71_A     A    71_A     37  131  131     58   92  107  116  120  123  127  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     R    72_A     R    72_A     37  131  131     58   92  107  116  120  123  127  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     V    73_A     V    73_A     37  131  131     57   92  107  116  120  123  127  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     S    74_A     S    74_A     37  131  131     52   92  107  116  120  123  127  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     K    75_A     K    75_A     37  131  131     33   92  107  116  120  123  127  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A    93_A     A    93_A     37  131  131     30   92  107  116  120  123  127  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     R    94_A     R    94_A     37  131  131     38   92  107  116  120  123  127  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     P    95_A     P    95_A     37  131  131     57   92  107  116  120  123  127  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     V    96_A     V    96_A     37  131  131     58   92  107  116  120  123  127  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     I    97_A     I    97_A     37  131  131     48   92  107  116  120  123  127  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     E    98_A     E    98_A     37  131  131     48   92  107  116  120  123  127  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     L    99_A     L    99_A     37  131  131     58   92  107  116  120  123  127  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     D   100_A     D   100_A     37  131  131     58   92  107  116  120  123  127  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     I   101_A     I   101_A     37  131  131     58   92  107  116  120  123  127  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     C   102_A     C   102_A     37  131  131     58   92  107  116  120  123  127  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     M   103_A     M   103_A     37  131  131     58   92  107  116  120  123  127  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     G   104_A     G   104_A     37  131  131     58   92  107  116  120  123  127  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     S   105_A     S   105_A     37  131  131     58   92  107  116  120  123  127  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A   106_A     A   106_A     37  131  131     58   92  107  116  120  123  127  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     M   107_A     M   107_A     37  131  131     58   92  107  116  120  123  127  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     R   108_A     R   108_A     37  131  131     58   92  107  116  120  123  127  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     S   109_A     S   109_A     37  131  131     58   92  107  116  120  123  127  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     I   110_A     I   110_A     37  131  131     34   92  107  116  120  123  127  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     E   111_A     E   111_A     37  131  131     57   92  107  116  120  123  127  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     V   112_A     V   112_A     37  131  131     58   92  107  116  120  123  127  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     N   113_A     N   113_A     37  131  131     58   92  107  116  120  123  127  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     L   114_A     L   114_A     37  131  131     47   92  107  116  120  123  127  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     T   115_A     T   115_A     37  131  131     30   92  107  116  120  123  127  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     D   116_A     D   116_A     37  131  131     28   92  107  116  120  123  127  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     R   117_A     R   117_A     37  131  131      3   83  105  116  120  123  127  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     S   118_A     S   118_A     37  131  131     19   87  103  116  120  123  127  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A   119_A     A   119_A     35  131  131      3    3    4    7   13   93  126  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     F   120_A     F   120_A     32  131  131      3    5   16   74  115  122  127  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     Q   121_A     Q   121_A     32  131  131      3   16   50   96  119  123  127  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     Y   122_A     Y   122_A     32  131  131     19   87  105  116  120  123  127  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     P   123_A     P   123_A     32  131  131     57   92  107  116  120  123  127  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     L   124_A     L   124_A     32  131  131     58   92  107  116  120  123  127  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     L   125_A     L   125_A     32  131  131     58   92  107  116  120  123  127  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     I   126_A     I   126_A     32  131  131     58   92  107  116  120  123  127  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     G   127_A     G   127_A     32  131  131     58   92  107  116  120  123  127  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     S   128_A     S   128_A     32  131  131     58   92  107  116  120  123  127  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     E   129_A     E   129_A     32  131  131     58   92  107  116  120  123  127  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A   130_A     A   130_A     32  131  131     58   92  107  116  120  123  127  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     L   131_A     L   131_A     32  131  131     58   92  107  116  120  123  127  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     K   132_A     K   132_A     32  131  131     58   92  107  116  120  123  127  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     R   133_A     R   133_A     32  131  131     52   92  107  116  120  123  127  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     F   134_A     F   134_A     32  131  131     52   92  107  116  120  123  127  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     D   135_A     D   135_A     32  131  131     57   92  107  116  120  123  127  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A   136_A     A   136_A     32  131  131     58   92  107  116  120  123  127  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     L   137_A     L   137_A     32  131  131     58   92  107  116  120  123  127  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     V   138_A     V   138_A     32  131  131     58   92  107  116  120  123  127  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     D   139_A     D   139_A     32  131  131     58   92  107  116  120  123  127  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     P   140_A     P   140_A     32  131  131     50   92  107  116  120  123  127  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     S   141_A     S   141_A     32  131  131     57   92  107  116  120  123  127  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     L   142_A     L   142_A     32  131  131     58   92  107  116  120  123  127  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     K   143_A     K   143_A     32  131  131     58   92  107  116  120  123  127  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     Y   144_A     Y   144_A     32  131  131     58   92  107  116  120  123  127  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A   145_A     A   145_A     32  131  131     53   92  107  116  120  123  127  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A   146_A     A   146_A     32  131  131     43   92  107  116  120  123  127  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     G   147_A     G   147_A     32  131  131     45   92  107  116  120  123  127  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     K   148_A     K   148_A     32  131  131     58   92  107  116  120  123  127  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     P   149_A     P   149_A     32  131  131     58   92  107  116  120  123  127  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A   150_A     A   150_A     32  131  131     51   87  103  116  120  123  127  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     C   151_A     C   151_A     32  131  131     58   92  107  116  120  123  127  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_AVERAGE  LCS_A:  74.87  (  24.60  100.00  100.00 )

GLOBAL_DISTANCE_TEST (summary information about detected largest sets of residues (represented by selected AToms) that can fit under specified thresholds)
GDT DIST_CUTOFF  0.50   1.00   1.50   2.00   2.50   3.00   3.50   4.00   4.50   5.00   5.50   6.00   6.50   7.00   7.50   8.00   8.50   9.00   9.50  10.00
GDT NUMBER_AT     58     92    107    116    120    123    127    130    131    131    131    131    131    131    131    131    131    131    131    131 
GDT PERCENT_AT  44.27  70.23  81.68  88.55  91.60  93.89  96.95  99.24 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00
GDT RMS_LOCAL    0.31   0.60   0.83   0.95   1.07   1.15   1.34   1.47   1.52   1.52   1.52   1.52   1.52   1.52   1.52   1.52   1.52   1.52   1.52   1.52
GDT RMS_ALL_AT   1.91   1.64   1.53   1.54   1.54   1.54   1.52   1.52   1.52   1.52   1.52   1.52   1.52   1.52   1.52   1.52   1.52   1.52   1.52   1.52

# Checking swapping
#   possible swapping detected:  E    12_A      E    12_A
#   possible swapping detected:  D    59_A      D    59_A
#   possible swapping detected:  E    67_A      E    67_A
#   possible swapping detected:  E    98_A      E    98_A
#   possible swapping detected:  F   120_A      F   120_A
#   possible swapping detected:  Y   122_A      Y   122_A

#      Molecule1      Molecule2  DISTANCE    Mis    MC     All    Dist_max   GDC_mc  GDC_all
LGA    E     4_A      E     4_A     4.796     4    0.491   0.475     6.329   42.024   20.582
LGA    K     5_A      K     5_A     1.938     0    0.143   0.658     4.056   67.143   58.730
LGA    T     6_A      T     6_A     0.985     0    0.048   0.072     1.190   85.952   85.306
LGA    V     7_A      V     7_A     0.915     0    0.018   0.059     1.065   90.476   89.184
LGA    Y     8_A      Y     8_A     0.554     0    0.088   0.126     1.081   90.476   88.968
LGA    G     9_A      G     9_A     0.707     0    0.042   0.042     0.707   92.857   92.857
LGA    L    10_A      L    10_A     0.393     0    0.065   0.291     1.333  100.000   95.298
LGA    N    11_A      N    11_A     0.371     0    0.017   1.095     2.639  100.000   90.060
LGA    E    12_A      E    12_A     0.409     0    0.049   0.107     0.749   95.238   97.884
LGA    Y    13_A      Y    13_A     0.972     0    0.006   0.127     3.232   90.476   72.262
LGA    A    14_A      A    14_A     0.619     0    0.125   0.163     0.818   90.476   92.381
LGA    A    15_A      A    15_A     1.150     0    0.016   0.031     1.318   85.952   85.048
LGA    L    16_A      L    16_A     0.561     0    0.086   0.972     3.544   95.238   84.762
LGA    D    17_A      D    17_A     0.653     0    0.091   0.486     1.780   84.048   92.024
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LGA    Y   122_A      Y   122_A     1.534     0    0.060   0.249     2.033   75.119   79.325
LGA    P   123_A      P   123_A     0.585     0    0.021   0.346     1.414   92.857   89.252
LGA    L   124_A      L   124_A     0.653     0    0.042   0.129     0.765   90.476   90.476
LGA    L   125_A      L   125_A     0.689     0    0.019   0.104     0.891   90.476   90.476
LGA    I   126_A      I   126_A     0.422     0    0.021   0.601     1.903   97.619   94.226
LGA    G   127_A      G   127_A     0.459     0    0.051   0.051     0.504   97.619   97.619
LGA    S   128_A      S   128_A     0.316     0    0.034   0.063     0.701  100.000   98.413
LGA    E   129_A      E   129_A     0.221     0    0.024   0.954     3.907  100.000   84.233
LGA    A   130_A      A   130_A     0.226     0    0.055   0.070     0.551   97.619   98.095
LGA    L   131_A      L   131_A     0.383     0    0.031   0.053     0.534   97.619   98.810
LGA    K   132_A      K   132_A     0.472     0    0.018   0.771     2.457   95.238   90.053
LGA    R   133_A      R   133_A     0.883     0    0.023   1.067     3.825   88.214   79.351
LGA    F   134_A      F   134_A     0.977     0    0.042   0.165     1.340   85.952   88.831
LGA    D   135_A      D   135_A     1.199     0    0.051   0.314     2.263   79.286   76.131
LGA    A   136_A      A   136_A     0.949     0    0.068   0.077     1.103   88.214   88.667
LGA    L   137_A      L   137_A     0.960     0    0.034   1.195     5.336   90.476   73.214
LGA    V   138_A      V   138_A     0.750     0    0.014   0.043     1.026   88.214   89.184
LGA    D   139_A      D   139_A     0.930     0    0.028   0.054     1.203   90.476   87.083
LGA    P   140_A      P   140_A     1.164     0    0.011   0.060     1.501   81.429   80.204
LGA    S   141_A      S   141_A     1.079     0    0.066   0.071     1.148   81.429   81.429
LGA    L   142_A      L   142_A     0.714     0    0.025   0.071     0.914   90.476   90.476
LGA    K   143_A      K   143_A     0.471     0    0.037   0.680     3.201   97.619   88.148
LGA    Y   144_A      Y   144_A     0.613     0    0.033   0.095     1.784   92.857   84.563
LGA    A   145_A      A   145_A     0.719     0    0.041   0.052     1.126   90.595   90.571
LGA    A   146_A      A   146_A     1.150     0    0.016   0.042     1.381   81.429   81.429
LGA    G   147_A      G   147_A     1.238     0    0.012   0.012     1.238   81.429   81.429
LGA    K   148_A      K   148_A     1.226     4    0.014   0.015     1.268   81.429   45.238
LGA    P   149_A      P   149_A     1.180     0    0.017   0.033     1.596   79.286   80.204
LGA    A   150_A      A   150_A     1.794     0    0.203   0.196     2.170   77.143   74.667
LGA    C   151_A      C   151_A     1.279     0    0.545   0.611     1.635   77.143   78.571

# RMSD_GDC results:       CA      MC common percent     ALL common percent   GDC_mc  GDC_all
NUMBER_OF_ATOMS_AA:      131     524    524  100.00     992    992  100.00               131
SUMMARY(RMSD_GDC):     1.519          1.506                  2.200           83.337   78.113

#CA            N1   N2   DIST      N    RMSD    GDT_TS    LGA_S3     LGA_Q 
SUMMARY(GDT)  159  131    4.0    130    1.47    89.504    94.338     8.295

LGA_LOCAL      RMSD:   1.467  Number of atoms:  130  under DIST:   4.00
LGA_ASGN_ATOMS RMSD:   1.520  Number of assigned atoms:  131 
Std_ASGN_ATOMS RMSD:   1.519  Standard rmsd on all 131 assigned CA atoms 

Unitary ROTATION matrix and the SHIFT vector superimpose molecules  (1=>2)
  X_new =   0.988404 * X  +   0.146718 * Y  +   0.039142 * Z  + -28.122112
  Y_new =   0.061394 * X  +  -0.621877 * Y  +   0.780705 * Z  +  27.663988
  Z_new =   0.138885 * X  +  -0.769248 * Y  +  -0.623673 * Z  +   4.499725 

Euler angles from the ROTATION matrix. Conventions XYZ and ZXZ:
           Phi     Theta       Psi   [DEG:       Phi     Theta       Psi ]
XYZ:  0.062035 -0.139336 -2.252062   [DEG:    3.5543   -7.9834 -129.0336 ]
ZXZ:  3.091497  2.244229  2.962970   [DEG:  177.1298  128.5848  169.7657 ]
 
# END of job
