
#######################################################
#                                                     #
#                        LGA                          #
#                  ---------------                    #
#                                                     #
#               Local-Global Alignment                #
#        A Method for Finding 3-D Similarities        #
#               in Protein Structures                 #
#                                                     #
#                  ------------ 10/2009               #
#                                                     #
#      Adam Zemla (adamz@llnl.gov)                    #
#      Lawrence Livermore National Laboratory, CA     #
#                                                     #
#######################################################

!!!   License for LGA program has expired  !!!
#   For updated version of the LGA program   #
# please contact Adam Zemla:  adamz@llnl.gov #

# Molecule1: number of CA atoms  159 ( 1222),  selected  131 , name one
# Molecule2: number of CA atoms  131 (  992),  selected  131 , name two
# PARAMETERS: input.pdb  -ie  -3  -d:4  -sda  -swap  -ch1:A  -ch2:A  
# FIXED Atom-Atom correspondence
# GDT and LCS analysis 

LCS - RMSD CUTOFF   5.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:   131       4_A - 151_A       1.50     1.50
  LCS_AVERAGE:    100.00

LCS - RMSD CUTOFF   2.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:   131       4_A - 151_A       1.50     1.50
  LCS_AVERAGE:    100.00

LCS - RMSD CUTOFF   1.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:    67      68_A - 151_A       1.00     1.58
  LCS_AVERAGE:     39.45

LCS_GDT    MOLECULE-1    MOLECULE-2     LCS_DETAILS     GDT_DETAILS                                                    TOTAL NUMBER OF RESIDUE PAIRS:  131
LCS_GDT     RESIDUE       RESIDUE       SEGMENT_SIZE    GLOBAL DISTANCE TEST COLUMNS: number of residues under the threshold assigned to each residue pair
LCS_GDT   NAME NUMBER   NAME NUMBER    1.0  2.0  5.0    0.5  1.0  1.5  2.0  2.5  3.0  3.5  4.0  4.5  5.0  5.5  6.0  6.5  7.0  7.5  8.0  8.5  9.0  9.5 10.0
LCS_GDT     E     4_A     E     4_A     13  131  131      3    3   13   61   90  106  122  127  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     K     5_A     K     5_A     34  131  131     51   90  104  117  120  123  125  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     T     6_A     T     6_A     39  131  131     65   93  108  117  120  123  125  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     V     7_A     V     7_A     39  131  131     65   93  108  117  120  123  125  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     Y     8_A     Y     8_A     39  131  131     65   93  108  117  120  123  125  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     G     9_A     G     9_A     39  131  131     65   93  108  117  120  123  125  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     L    10_A     L    10_A     39  131  131     65   93  108  117  120  123  125  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     N    11_A     N    11_A     39  131  131     65   93  108  117  120  123  125  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     E    12_A     E    12_A     39  131  131     65   93  108  117  120  123  125  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     Y    13_A     Y    13_A     39  131  131     65   93  108  117  120  123  125  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A    14_A     A    14_A     39  131  131     65   93  108  117  120  123  125  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A    15_A     A    15_A     39  131  131     65   93  108  117  120  123  125  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     L    16_A     L    16_A     39  131  131     54   93  108  117  120  123  125  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     D    17_A     D    17_A     39  131  131     30   93  108  117  120  123  125  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     G    18_A     G    18_A     39  131  131      4   17   85  114  120  123  125  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     I    19_A     I    19_A     39  131  131      5   13   34  113  120  123  125  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     N    20_A     N    20_A     39  131  131      5   19   65  113  120  123  125  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     L    21_A     L    21_A     39  131  131      5   66  102  117  120  123  125  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     E    22_A     E    22_A     39  131  131      7   48  101  117  120  123  125  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     V    23_A     V    23_A     39  131  131     65   93  108  117  120  123  125  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A    24_A     A    24_A     39  131  131     65   93  108  117  120  123  125  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A    25_A     A    25_A     39  131  131     65   93  108  117  120  123  125  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     K    26_A     K    26_A     39  131  131     65   93  108  117  120  123  125  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     L    27_A     L    27_A     39  131  131     65   93  108  117  120  123  125  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     D    28_A     D    28_A     39  131  131     65   93  108  117  120  123  125  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     T    29_A     T    29_A     39  131  131     65   93  108  117  120  123  125  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     G    30_A     G    30_A     39  131  131     65   93  108  117  120  123  125  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A    31_A     A    31_A     39  131  131     65   93  108  117  120  123  125  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     K    32_A     K    32_A     39  131  131     65   93  108  117  120  123  125  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     T    33_A     T    33_A     39  131  131     65   93  108  117  120  123  125  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A    34_A     A    34_A     39  131  131     65   93  108  117  120  123  125  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     S    35_A     S    35_A     39  131  131     65   93  108  117  120  123  125  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     L    36_A     L    36_A     39  131  131     65   93  108  117  120  123  125  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     S    37_A     S    37_A     39  131  131     63   93  108  117  120  123  125  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A    38_A     A    38_A     39  131  131     38   93  108  117  120  123  125  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     R    39_A     R    39_A     39  131  131     30   73  108  117  120  123  125  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     D    40_A     D    40_A     39  131  131     30   67  108  117  120  123  125  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     I    41_A     I    41_A     39  131  131     25   78  108  117  120  123  125  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     K    42_A     K    42_A     39  131  131     19   59  108  117  120  123  125  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     R    43_A     R    43_A     39  131  131     28   91  108  117  120  123  125  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     F    44_A     F    44_A     39  131  131     38   93  108  117  120  123  125  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     K    45_A     K    45_A     37  131  131     38   93  108  117  120  123  125  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     R    46_A     R    46_A     37  131  131     29   88  108  117  120  123  125  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     N    47_A     N    47_A     37  131  131     25   82  108  117  120  123  125  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     G    48_A     G    48_A     37  131  131     24   92  108  117  120  123  125  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     E    49_A     E    49_A     37  131  131     19   88  108  117  120  123  125  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     S    50_A     S    50_A     37  131  131     65   93  108  117  120  123  125  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     W    51_A     W    51_A     37  131  131     41   93  108  117  120  123  125  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     V    52_A     V    52_A     37  131  131     36   93  108  117  120  123  125  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     R    53_A     R    53_A     37  131  131     30   73  108  117  120  123  125  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     F    54_A     F    54_A     37  131  131     30   73  108  117  120  123  125  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     Y    55_A     Y    55_A     37  131  131     26   64  101  117  120  123  125  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     L    56_A     L    56_A     37  131  131     29   67  108  117  120  123  125  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A    57_A     A    57_A     37  131  131     35   85  108  117  120  123  125  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     I    58_A     I    58_A     37  131  131      7   75  108  117  120  123  125  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     D    59_A     D    59_A     26  131  131      3    4    4    4   22   94  125  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A    60_A     A    60_A      4  131  131      3    4   91  114  120  123  125  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A    61_A     A    61_A      6  131  131      4    6    7  100  112  121  125  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     H    62_A     H    62_A      6  131  131      4    6   38   65  112  121  125  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     S    63_A     S    63_A     21  131  131      4   36   56   90  115  122  125  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     H    64_A     H    64_A     21  131  131      4   24   51   65   97  114  125  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     P    65_A     P    65_A     37  131  131     13   36   70   99  118  123  125  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     I    66_A     I    66_A     37  131  131     24   67  107  117  120  123  125  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     E    67_A     E    67_A     37  131  131     31   78  108  117  120  123  125  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     R    68_A     R    68_A     67  131  131     36   93  108  117  120  123  125  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     P    69_A     P    69_A     67  131  131     62   93  108  117  120  123  125  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     L    70_A     L    70_A     67  131  131     65   93  108  117  120  123  125  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A    71_A     A    71_A     67  131  131     65   93  108  117  120  123  125  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     R    72_A     R    72_A     67  131  131     65   93  108  117  120  123  125  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     V    73_A     V    73_A     67  131  131     65   93  108  117  120  123  125  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     S    74_A     S    74_A     67  131  131     58   93  108  117  120  123  125  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     K    75_A     K    75_A     67  131  131     41   93  108  117  120  123  125  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A    93_A     A    93_A     67  131  131     58   93  108  117  120  123  125  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     R    94_A     R    94_A     67  131  131     58   93  108  117  120  123  125  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     P    95_A     P    95_A     67  131  131     65   93  108  117  120  123  125  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     V    96_A     V    96_A     67  131  131     65   93  108  117  120  123  125  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     I    97_A     I    97_A     67  131  131     62   93  108  117  120  123  125  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     E    98_A     E    98_A     67  131  131     62   93  108  117  120  123  125  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     L    99_A     L    99_A     67  131  131     65   93  108  117  120  123  125  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     D   100_A     D   100_A     67  131  131     65   93  108  117  120  123  125  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     I   101_A     I   101_A     67  131  131     65   93  108  117  120  123  125  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     C   102_A     C   102_A     67  131  131     65   93  108  117  120  123  125  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     M   103_A     M   103_A     67  131  131     65   93  108  117  120  123  125  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     G   104_A     G   104_A     67  131  131     65   93  108  117  120  123  125  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     S   105_A     S   105_A     67  131  131     65   93  108  117  120  123  125  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A   106_A     A   106_A     67  131  131     65   93  108  117  120  123  125  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     M   107_A     M   107_A     67  131  131     65   93  108  117  120  123  125  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     R   108_A     R   108_A     67  131  131     65   93  108  117  120  123  125  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     S   109_A     S   109_A     67  131  131     65   93  108  117  120  123  125  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     I   110_A     I   110_A     67  131  131     32   93  108  117  120  123  125  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     E   111_A     E   111_A     67  131  131     65   93  108  117  120  123  125  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     V   112_A     V   112_A     67  131  131     65   93  108  117  120  123  125  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     N   113_A     N   113_A     67  131  131     65   93  108  117  120  123  125  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     L   114_A     L   114_A     67  131  131     61   93  108  117  120  123  125  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     T   115_A     T   115_A     67  131  131     45   93  108  117  120  123  125  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     D   116_A     D   116_A     67  131  131     10   93  108  117  120  123  125  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     R   117_A     R   117_A     67  131  131      3   84  105  117  120  123  125  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     S   118_A     S   118_A     67  131  131      3   90  101  117  120  123  125  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A   119_A     A   119_A     67  131  131      3    3    4    4   74  105  125  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     F   120_A     F   120_A     67  131  131      3    5   38   96  117  122  125  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     Q   121_A     Q   121_A     67  131  131      3    6   52   91  117  123  125  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     Y   122_A     Y   122_A     67  131  131     16   90  106  117  120  123  125  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     P   123_A     P   123_A     67  131  131     65   93  108  117  120  123  125  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     L   124_A     L   124_A     67  131  131     65   93  108  117  120  123  125  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     L   125_A     L   125_A     67  131  131     65   93  108  117  120  123  125  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     I   126_A     I   126_A     67  131  131     65   93  108  117  120  123  125  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     G   127_A     G   127_A     67  131  131     65   93  108  117  120  123  125  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     S   128_A     S   128_A     67  131  131     65   93  108  117  120  123  125  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     E   129_A     E   129_A     67  131  131     65   93  108  117  120  123  125  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A   130_A     A   130_A     67  131  131     65   93  108  117  120  123  125  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     L   131_A     L   131_A     67  131  131     65   93  108  117  120  123  125  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     K   132_A     K   132_A     67  131  131     65   93  108  117  120  123  125  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     R   133_A     R   133_A     67  131  131     63   93  108  117  120  123  125  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     F   134_A     F   134_A     67  131  131     65   93  108  117  120  123  125  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     D   135_A     D   135_A     67  131  131     65   93  108  117  120  123  125  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A   136_A     A   136_A     67  131  131     65   93  108  117  120  123  125  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     L   137_A     L   137_A     67  131  131     65   93  108  117  120  123  125  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     V   138_A     V   138_A     67  131  131     65   93  108  117  120  123  125  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     D   139_A     D   139_A     67  131  131     65   93  108  117  120  123  125  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     P   140_A     P   140_A     67  131  131     65   93  108  117  120  123  125  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     S   141_A     S   141_A     67  131  131     65   93  108  117  120  123  125  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     L   142_A     L   142_A     67  131  131     65   93  108  117  120  123  125  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     K   143_A     K   143_A     67  131  131     65   93  108  117  120  123  125  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     Y   144_A     Y   144_A     67  131  131     65   93  108  117  120  123  125  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A   145_A     A   145_A     67  131  131     65   93  108  117  120  123  125  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A   146_A     A   146_A     67  131  131     65   93  108  117  120  123  125  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     G   147_A     G   147_A     67  131  131     65   93  108  117  120  123  125  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     K   148_A     K   148_A     67  131  131     65   93  108  117  120  123  125  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     P   149_A     P   149_A     67  131  131     65   93  108  117  120  123  125  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A   150_A     A   150_A     67  131  131     63   90  105  117  120  123  125  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     C   151_A     C   151_A     67  131  131     65   93  108  117  120  123  125  130  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_AVERAGE  LCS_A:  79.82  (  39.45  100.00  100.00 )

GLOBAL_DISTANCE_TEST (summary information about detected largest sets of residues (represented by selected AToms) that can fit under specified thresholds)
GDT DIST_CUTOFF  0.50   1.00   1.50   2.00   2.50   3.00   3.50   4.00   4.50   5.00   5.50   6.00   6.50   7.00   7.50   8.00   8.50   9.00   9.50  10.00
GDT NUMBER_AT     65     93    108    117    120    123    125    130    130    131    131    131    131    131    131    131    131    131    131    131 
GDT PERCENT_AT  49.62  70.99  82.44  89.31  91.60  93.89  95.42  99.24  99.24 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00
GDT RMS_LOCAL    0.29   0.54   0.80   0.93   1.02   1.11   1.20   1.44   1.44   1.50   1.50   1.50   1.50   1.50   1.50   1.50   1.50   1.50   1.50   1.50
GDT RMS_ALL_AT   1.86   1.59   1.51   1.52   1.52   1.52   1.51   1.50   1.50   1.50   1.50   1.50   1.50   1.50   1.50   1.50   1.50   1.50   1.50   1.50

# Checking swapping
#   possible swapping detected:  E    12_A      E    12_A
#   possible swapping detected:  D    59_A      D    59_A
#   possible swapping detected:  E    67_A      E    67_A
#   possible swapping detected:  E    98_A      E    98_A
#   possible swapping detected:  F   120_A      F   120_A
#   possible swapping detected:  Y   122_A      Y   122_A

#      Molecule1      Molecule2  DISTANCE    Mis    MC     All    Dist_max   GDC_mc  GDC_all
LGA    E     4_A      E     4_A     4.796     4    0.494   0.477     6.119   43.690   21.323
LGA    K     5_A      K     5_A     1.769     0    0.143   0.659     3.743   71.071   62.804
LGA    T     6_A      T     6_A     0.911     0    0.055   0.074     1.074   88.214   89.184
LGA    V     7_A      V     7_A     0.828     0    0.008   0.073     0.925   90.476   90.476
LGA    Y     8_A      Y     8_A     0.544     0    0.073   0.118     0.925   90.476   90.476
LGA    G     9_A      G     9_A     0.664     0    0.037   0.037     0.664   95.238   95.238
LGA    L    10_A      L    10_A     0.417     0    0.055   0.059     0.612  100.000   96.429
LGA    N    11_A      N    11_A     0.378     0    0.019   1.086     2.547  100.000   90.060
LGA    E    12_A      E    12_A     0.378     0    0.046   0.092     0.726   95.238   97.884
LGA    Y    13_A      Y    13_A     0.886     0    0.007   0.122     2.706   90.476   76.111
LGA    A    14_A      A    14_A     0.638     0    0.112   0.147     0.819   90.476   92.381
LGA    A    15_A      A    15_A     1.120     0    0.016   0.029     1.274   85.952   85.048
LGA    L    16_A      L    16_A     0.558     0    0.092   0.970     3.471   95.238   85.595
LGA    D    17_A      D    17_A     0.571     0    0.073   0.268     1.724   86.190   89.583
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LGA    Y   122_A      Y   122_A     1.529     0    0.075   0.253     2.075   75.119   79.325
LGA    P   123_A      P   123_A     0.527     0    0.014   0.334     1.356   92.857   89.252
LGA    L   124_A      L   124_A     0.653     0    0.044   0.130     0.817   90.476   90.476
LGA    L   125_A      L   125_A     0.718     0    0.026   0.090     0.936   90.476   90.476
LGA    I   126_A      I   126_A     0.488     0    0.013   0.592     1.876   97.619   94.226
LGA    G   127_A      G   127_A     0.453     0    0.058   0.058     0.551   97.619   97.619
LGA    S   128_A      S   128_A     0.314     0    0.037   0.064     0.841  100.000   98.413
LGA    E   129_A      E   129_A     0.444     0    0.020   0.134     0.524  100.000   98.942
LGA    A   130_A      A   130_A     0.125     0    0.058   0.073     0.471  100.000  100.000
LGA    L   131_A      L   131_A     0.270     0    0.035   0.046     0.366  100.000  100.000
LGA    K   132_A      K   132_A     0.346     0    0.036   0.568     2.082   97.619   92.011
LGA    R   133_A      R   133_A     0.721     0    0.032   1.046     3.476   90.476   82.164
LGA    F   134_A      F   134_A     0.861     0    0.041   0.158     1.193   88.214   89.654
LGA    D   135_A      D   135_A     1.056     0    0.054   0.308     2.147   81.548   77.262
LGA    A   136_A      A   136_A     0.796     0    0.060   0.068     0.943   90.476   90.476
LGA    L   137_A      L   137_A     0.820     0    0.022   1.295     5.059   90.476   72.321
LGA    V   138_A      V   138_A     0.650     0    0.010   0.037     0.880   90.476   90.476
LGA    D   139_A      D   139_A     0.742     0    0.023   0.048     1.008   90.476   89.345
LGA    P   140_A      P   140_A     0.804     0    0.018   0.034     1.028   90.476   89.184
LGA    S   141_A      S   141_A     0.819     0    0.049   0.056     0.875   90.476   90.476
LGA    L   142_A      L   142_A     0.586     0    0.022   0.066     0.837   90.476   90.476
LGA    K   143_A      K   143_A     0.288     0    0.047   0.680     2.730  100.000   93.122
LGA    Y   144_A      Y   144_A     0.486     0    0.044   0.074     1.448   95.238   89.048
LGA    A   145_A      A   145_A     0.605     0    0.034   0.046     0.964   92.857   92.381
LGA    A   146_A      A   146_A     0.927     0    0.019   0.043     1.120   85.952   86.857
LGA    G   147_A      G   147_A     0.950     0    0.017   0.017     0.950   90.476   90.476
LGA    K   148_A      K   148_A     1.007     4    0.017   0.016     1.081   83.690   46.243
LGA    P   149_A      P   149_A     1.081     0    0.025   0.035     1.421   81.429   81.429
LGA    A   150_A      A   150_A     1.657     0    0.194   0.187     2.010   79.286   76.381
LGA    C   151_A      C   151_A     1.130     0    0.546   0.600     1.659   79.286   81.508

# RMSD_GDC results:       CA      MC common percent     ALL common percent   GDC_mc  GDC_all
NUMBER_OF_ATOMS_AA:      131     524    524  100.00     992    992  100.00               131
SUMMARY(RMSD_GDC):     1.497          1.485                  2.161           84.244   79.111

#CA            N1   N2   DIST      N    RMSD    GDT_TS    LGA_S3     LGA_Q 
SUMMARY(GDT)  159  131    4.0    130    1.44    89.885    94.385     8.417

LGA_LOCAL      RMSD:   1.445  Number of atoms:  130  under DIST:   4.00
LGA_ASGN_ATOMS RMSD:   1.499  Number of assigned atoms:  131 
Std_ASGN_ATOMS RMSD:   1.497  Standard rmsd on all 131 assigned CA atoms 

Unitary ROTATION matrix and the SHIFT vector superimpose molecules  (1=>2)
  X_new =  -0.002294 * X  +  -0.013989 * Y  +  -0.999900 * Z  + -28.878733
  Y_new =  -0.640825 * X  +   0.767631 * Y  +  -0.009269 * Z  +  27.932806
  Z_new =   0.767683 * X  +   0.640740 * Y  +  -0.010725 * Z  +   3.063301 

Euler angles from the ROTATION matrix. Conventions XYZ and ZXZ:
           Phi     Theta       Psi   [DEG:       Phi     Theta       Psi ]
XYZ: -1.574375 -0.875218  1.587533   [DEG:  -90.2051  -50.1463   90.9589 ]
ZXZ: -1.561526  1.581522  0.875287   [DEG:  -89.4689   90.6145   50.1503 ]
 
# END of job
