
#######################################################
#                                                     #
#                        LGA                          #
#                  ---------------                    #
#                                                     #
#               Local-Global Alignment                #
#        A Method for Finding 3-D Similarities        #
#               in Protein Structures                 #
#                                                     #
#                  ------------ 10/2009               #
#                                                     #
#      Adam Zemla (adamz@llnl.gov)                    #
#      Lawrence Livermore National Laboratory, CA     #
#                                                     #
#######################################################

!!!   License for LGA program has expired  !!!
#   For updated version of the LGA program   #
# please contact Adam Zemla:  adamz@llnl.gov #

# Molecule1: number of CA atoms  159 ( 1222),  selected  131 , name one
# Molecule2: number of CA atoms  131 (  992),  selected  131 , name two
# PARAMETERS: input.pdb  -ie  -3  -d:4  -sda  -swap  -ch1:A  -ch2:A  
# FIXED Atom-Atom correspondence
# GDT and LCS analysis 

LCS - RMSD CUTOFF   5.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:   131       4_A - 151_A       1.50     1.50
  LCS_AVERAGE:    100.00

LCS - RMSD CUTOFF   2.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:   131       4_A - 151_A       1.50     1.50
  LCS_AVERAGE:    100.00

LCS - RMSD CUTOFF   1.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:    37      22_A - 58_A        0.98     1.68
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:    37      65_A - 118_A       0.96     1.55
  LCS_AVERAGE:     24.56

LCS_GDT    MOLECULE-1    MOLECULE-2     LCS_DETAILS     GDT_DETAILS                                                    TOTAL NUMBER OF RESIDUE PAIRS:  131
LCS_GDT     RESIDUE       RESIDUE       SEGMENT_SIZE    GLOBAL DISTANCE TEST COLUMNS: number of residues under the threshold assigned to each residue pair
LCS_GDT   NAME NUMBER   NAME NUMBER    1.0  2.0  5.0    0.5  1.0  1.5  2.0  2.5  3.0  3.5  4.0  4.5  5.0  5.5  6.0  6.5  7.0  7.5  8.0  8.5  9.0  9.5 10.0
LCS_GDT     E     4_A     E     4_A     14  131  131      3    4   31   76  100  117  124  128  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     K     5_A     K     5_A     15  131  131     22   85  102  116  120  124  127  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     T     6_A     T     6_A     15  131  131     62   92  107  116  120  124  127  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     V     7_A     V     7_A     15  131  131     62   92  107  116  120  124  127  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     Y     8_A     Y     8_A     15  131  131     62   92  107  116  120  124  127  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     G     9_A     G     9_A     15  131  131     62   92  107  116  120  124  127  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     L    10_A     L    10_A     15  131  131     62   92  107  116  120  124  127  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     N    11_A     N    11_A     15  131  131     62   92  107  116  120  124  127  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     E    12_A     E    12_A     15  131  131     62   92  107  116  120  124  127  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     Y    13_A     Y    13_A     15  131  131     62   92  107  116  120  124  127  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A    14_A     A    14_A     15  131  131     62   92  107  116  120  124  127  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A    15_A     A    15_A     15  131  131     62   92  107  116  120  124  127  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     L    16_A     L    16_A     15  131  131     51   92  107  116  120  124  127  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     D    17_A     D    17_A     28  131  131     26   92  107  116  120  124  127  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     G    18_A     G    18_A     28  131  131      5   23   73  114  120  124  127  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     I    19_A     I    19_A     28  131  131      4   17   64  113  120  124  127  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     N    20_A     N    20_A     28  131  131      4   17   67  114  120  124  127  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     L    21_A     L    21_A     28  131  131      4   61  102  116  120  124  127  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     E    22_A     E    22_A     37  131  131      7   45   99  116  120  124  127  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     V    23_A     V    23_A     37  131  131     62   92  107  116  120  124  127  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A    24_A     A    24_A     37  131  131     62   92  107  116  120  124  127  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A    25_A     A    25_A     37  131  131     62   92  107  116  120  124  127  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     K    26_A     K    26_A     37  131  131     62   92  107  116  120  124  127  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     L    27_A     L    27_A     37  131  131     62   92  107  116  120  124  127  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     D    28_A     D    28_A     37  131  131     62   92  107  116  120  124  127  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     T    29_A     T    29_A     37  131  131     62   92  107  116  120  124  127  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     G    30_A     G    30_A     37  131  131     62   92  107  116  120  124  127  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A    31_A     A    31_A     37  131  131     62   92  107  116  120  124  127  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     K    32_A     K    32_A     37  131  131     62   92  107  116  120  124  127  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     T    33_A     T    33_A     37  131  131     62   92  107  116  120  124  127  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A    34_A     A    34_A     37  131  131     62   92  107  116  120  124  127  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     S    35_A     S    35_A     37  131  131     62   92  107  116  120  124  127  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     L    36_A     L    36_A     37  131  131     61   92  107  116  120  124  127  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     S    37_A     S    37_A     37  131  131     61   92  107  116  120  124  127  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A    38_A     A    38_A     37  131  131     30   92  107  116  120  124  127  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     R    39_A     R    39_A     37  131  131     28   72  107  116  120  124  127  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     D    40_A     D    40_A     37  131  131     26   66  107  116  120  124  127  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     I    41_A     I    41_A     37  131  131     25   72  107  116  120  124  127  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     K    42_A     K    42_A     37  131  131     17   57  107  116  120  124  127  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     R    43_A     R    43_A     37  131  131     27   81  107  116  120  124  127  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     F    44_A     F    44_A     37  131  131     29   92  107  116  120  124  127  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     K    45_A     K    45_A     37  131  131     29   92  107  116  120  124  127  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     R    46_A     R    46_A     37  131  131     26   78  107  116  120  124  127  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     N    47_A     N    47_A     37  131  131     22   76  107  116  120  124  127  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     G    48_A     G    48_A     37  131  131     14   90  107  116  120  124  127  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     E    49_A     E    49_A     37  131  131     22   88  107  116  120  124  127  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     S    50_A     S    50_A     37  131  131     25   92  107  116  120  124  127  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     W    51_A     W    51_A     37  131  131     31   92  107  116  120  124  127  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     V    52_A     V    52_A     37  131  131     29   92  107  116  120  124  127  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     R    53_A     R    53_A     37  131  131     26   76  107  116  120  124  127  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     F    54_A     F    54_A     37  131  131     26   75  107  116  120  124  127  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     Y    55_A     Y    55_A     37  131  131     26   65  102  116  120  124  127  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     L    56_A     L    56_A     37  131  131     27   68  107  116  120  124  127  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A    57_A     A    57_A     37  131  131     30   85  107  116  120  124  127  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     I    58_A     I    58_A     37  131  131     14   79  107  116  120  124  127  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     D    59_A     D    59_A     27  131  131      4    4    4    5   46  109  127  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A    60_A     A    60_A      4  131  131      4    4   96  115  119  124  127  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A    61_A     A    61_A      7  131  131      4   41   94  110  119  124  127  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     H    62_A     H    62_A      7  131  131      4   19   42  101  118  122  127  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     S    63_A     S    63_A     20  131  131      4   35   52   79  111  121  127  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     H    64_A     H    64_A     20  131  131      4   21   53   63   94  117  126  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     P    65_A     P    65_A     37  131  131      9   39   66   95  119  124  127  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     I    66_A     I    66_A     37  131  131     26   66  107  116  120  124  127  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     E    67_A     E    67_A     37  131  131     28   76  107  116  120  124  127  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     R    68_A     R    68_A     37  131  131     30   92  107  116  120  124  127  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     P    69_A     P    69_A     37  131  131     52   92  107  116  120  124  127  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     L    70_A     L    70_A     37  131  131     58   92  107  116  120  124  127  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A    71_A     A    71_A     37  131  131     62   92  107  116  120  124  127  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     R    72_A     R    72_A     37  131  131     62   92  107  116  120  124  127  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     V    73_A     V    73_A     37  131  131     61   92  107  116  120  124  127  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     S    74_A     S    74_A     37  131  131     51   92  107  116  120  124  127  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     K    75_A     K    75_A     37  131  131     53   92  107  116  120  124  127  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A    93_A     A    93_A     37  131  131     33   92  107  116  120  124  127  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     R    94_A     R    94_A     37  131  131     36   92  107  116  120  124  127  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     P    95_A     P    95_A     37  131  131     61   92  107  116  120  124  127  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     V    96_A     V    96_A     37  131  131     62   92  107  116  120  124  127  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     I    97_A     I    97_A     37  131  131     50   92  107  116  120  124  127  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     E    98_A     E    98_A     37  131  131     50   92  107  116  120  124  127  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     L    99_A     L    99_A     37  131  131     62   92  107  116  120  124  127  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     D   100_A     D   100_A     37  131  131     62   92  107  116  120  124  127  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     I   101_A     I   101_A     37  131  131     62   92  107  116  120  124  127  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     C   102_A     C   102_A     37  131  131     62   92  107  116  120  124  127  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     M   103_A     M   103_A     37  131  131     62   92  107  116  120  124  127  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     G   104_A     G   104_A     37  131  131     62   92  107  116  120  124  127  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     S   105_A     S   105_A     37  131  131     62   92  107  116  120  124  127  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A   106_A     A   106_A     37  131  131     62   92  107  116  120  124  127  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     M   107_A     M   107_A     37  131  131     62   92  107  116  120  124  127  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     R   108_A     R   108_A     37  131  131     62   92  107  116  120  124  127  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     S   109_A     S   109_A     37  131  131     62   92  107  116  120  124  127  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     I   110_A     I   110_A     37  131  131     45   92  107  116  120  124  127  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     E   111_A     E   111_A     37  131  131     62   92  107  116  120  124  127  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     V   112_A     V   112_A     37  131  131     62   92  107  116  120  124  127  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     N   113_A     N   113_A     37  131  131     62   92  107  116  120  124  127  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     L   114_A     L   114_A     37  131  131     57   92  107  116  120  124  127  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     T   115_A     T   115_A     37  131  131     40   92  107  116  120  124  127  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     D   116_A     D   116_A     37  131  131     30   92  107  116  120  124  127  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     R   117_A     R   117_A     37  131  131      4   25  101  116  120  124  127  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     S   118_A     S   118_A     37  131  131     32   88  101  116  120  124  127  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A   119_A     A   119_A     34  131  131      3    3    4    7   13  102  127  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     F   120_A     F   120_A     32  131  131      3    5   26   60  115  122  127  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     Q   121_A     Q   121_A     32  131  131      3   15   48  101  119  124  127  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     Y   122_A     Y   122_A     32  131  131     47   88  107  116  120  124  127  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     P   123_A     P   123_A     32  131  131     61   92  107  116  120  124  127  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     L   124_A     L   124_A     32  131  131     62   92  107  116  120  124  127  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     L   125_A     L   125_A     32  131  131     62   92  107  116  120  124  127  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     I   126_A     I   126_A     32  131  131     62   92  107  116  120  124  127  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     G   127_A     G   127_A     32  131  131     62   92  107  116  120  124  127  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     S   128_A     S   128_A     32  131  131     62   92  107  116  120  124  127  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     E   129_A     E   129_A     32  131  131     62   92  107  116  120  124  127  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A   130_A     A   130_A     32  131  131     62   92  107  116  120  124  127  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     L   131_A     L   131_A     32  131  131     62   92  107  116  120  124  127  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     K   132_A     K   132_A     32  131  131     62   92  107  116  120  124  127  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     R   133_A     R   133_A     32  131  131     53   92  107  116  120  124  127  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     F   134_A     F   134_A     32  131  131     62   92  107  116  120  124  127  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     D   135_A     D   135_A     32  131  131     62   92  107  116  120  124  127  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A   136_A     A   136_A     32  131  131     62   92  107  116  120  124  127  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     L   137_A     L   137_A     32  131  131     62   92  107  116  120  124  127  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     V   138_A     V   138_A     32  131  131     62   92  107  116  120  124  127  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     D   139_A     D   139_A     32  131  131     62   92  107  116  120  124  127  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     P   140_A     P   140_A     32  131  131     62   92  107  116  120  124  127  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     S   141_A     S   141_A     32  131  131     62   92  107  116  120  124  127  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     L   142_A     L   142_A     32  131  131     62   92  107  116  120  124  127  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     K   143_A     K   143_A     32  131  131     62   92  107  116  120  124  127  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     Y   144_A     Y   144_A     32  131  131     62   92  107  116  120  124  127  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A   145_A     A   145_A     32  131  131     58   92  107  116  120  124  127  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A   146_A     A   146_A     32  131  131     50   92  107  116  120  124  127  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     G   147_A     G   147_A     32  131  131     50   92  107  116  120  124  127  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     K   148_A     K   148_A     32  131  131     62   92  107  116  120  124  127  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     P   149_A     P   149_A     32  131  131     62   92  107  116  120  124  127  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A   150_A     A   150_A     32  131  131     47   88  102  116  120  124  127  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     C   151_A     C   151_A     32  131  131     62   92  107  116  120  124  127  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_AVERAGE  LCS_A:  74.85  (  24.56  100.00  100.00 )

GLOBAL_DISTANCE_TEST (summary information about detected largest sets of residues (represented by selected AToms) that can fit under specified thresholds)
GDT DIST_CUTOFF  0.50   1.00   1.50   2.00   2.50   3.00   3.50   4.00   4.50   5.00   5.50   6.00   6.50   7.00   7.50   8.00   8.50   9.00   9.50  10.00
GDT NUMBER_AT     62     92    107    116    120    124    127    130    131    131    131    131    131    131    131    131    131    131    131    131 
GDT PERCENT_AT  47.33  70.23  81.68  88.55  91.60  94.66  96.95  99.24 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00
GDT RMS_LOCAL    0.30   0.58   0.80   0.93   1.05   1.16   1.29   1.45   1.50   1.50   1.50   1.50   1.50   1.50   1.50   1.50   1.50   1.50   1.50   1.50
GDT RMS_ALL_AT   1.89   1.61   1.52   1.53   1.53   1.52   1.50   1.50   1.50   1.50   1.50   1.50   1.50   1.50   1.50   1.50   1.50   1.50   1.50   1.50

# Checking swapping
#   possible swapping detected:  E    12_A      E    12_A
#   possible swapping detected:  E    22_A      E    22_A
#   possible swapping detected:  D    59_A      D    59_A
#   possible swapping detected:  E    67_A      E    67_A
#   possible swapping detected:  E    98_A      E    98_A
#   possible swapping detected:  F   120_A      F   120_A
#   possible swapping detected:  Y   122_A      Y   122_A

#      Molecule1      Molecule2  DISTANCE    Mis    MC     All    Dist_max   GDC_mc  GDC_all
LGA    E     4_A      E     4_A     4.628     4    0.499   0.482     6.219   45.357   22.063
LGA    K     5_A      K     5_A     1.922     0    0.127   0.648     2.982   68.929   70.265
LGA    T     6_A      T     6_A     1.004     0    0.054   0.068     1.185   81.429   82.721
LGA    V     7_A      V     7_A     0.934     0    0.019   0.080     1.050   90.476   89.184
LGA    Y     8_A      Y     8_A     0.612     0    0.081   0.122     1.041   90.476   88.968
LGA    G     9_A      G     9_A     0.677     0    0.030   0.030     0.677   95.238   95.238
LGA    L    10_A      L    10_A     0.417     0    0.067   0.077     0.569   97.619   94.048
LGA    N    11_A      N    11_A     0.368     0    0.018   1.083     2.646  100.000   90.060
LGA    E    12_A      E    12_A     0.427     0    0.049   0.099     0.790   95.238   97.884
LGA    Y    13_A      Y    13_A     0.972     0    0.008   0.121     3.093   90.476   73.532
LGA    A    14_A      A    14_A     0.644     0    0.130   0.171     0.842   90.476   92.381
LGA    A    15_A      A    15_A     1.202     0    0.019   0.025     1.373   85.952   85.048
LGA    L    16_A      L    16_A     0.661     0    0.076   0.926     3.700   95.238   83.631
LGA    D    17_A      D    17_A     0.638     0    0.078   0.330     1.811   84.048   88.512
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LGA    Y   122_A      Y   122_A     1.483     0    0.066   0.260     1.985   79.286   82.222
LGA    P   123_A      P   123_A     0.596     0    0.025   0.347     1.335   90.476   87.891
LGA    L   124_A      L   124_A     0.684     0    0.048   0.124     0.856   90.476   90.476
LGA    L   125_A      L   125_A     0.717     0    0.024   0.093     0.960   90.476   90.476
LGA    I   126_A      I   126_A     0.441     0    0.023   0.597     2.002   97.619   93.214
LGA    G   127_A      G   127_A     0.457     0    0.054   0.054     0.566   97.619   97.619
LGA    S   128_A      S   128_A     0.329     0    0.032   0.057     0.728  100.000   98.413
LGA    E   129_A      E   129_A     0.309     0    0.024   0.974     3.803  100.000   85.026
LGA    A   130_A      A   130_A     0.145     0    0.047   0.063     0.447  100.000  100.000
LGA    L   131_A      L   131_A     0.295     0    0.028   0.058     0.433  100.000  100.000
LGA    K   132_A      K   132_A     0.345     0    0.021   0.777     2.405   95.238   90.053
LGA    R   133_A      R   133_A     0.769     0    0.014   0.974     3.153   90.476   83.636
LGA    F   134_A      F   134_A     0.851     0    0.039   0.159     1.206   88.214   92.251
LGA    D   135_A      D   135_A     1.053     0    0.064   0.417     2.591   83.690   77.381
LGA    A   136_A      A   136_A     0.886     0    0.077   0.093     0.998   90.476   90.476
LGA    L   137_A      L   137_A     0.868     0    0.020   1.351     4.490   90.476   72.857
LGA    V   138_A      V   138_A     0.699     0    0.018   0.029     0.945   90.476   90.476
LGA    D   139_A      D   139_A     0.802     0    0.025   0.055     1.053   90.476   89.345
LGA    P   140_A      P   140_A     0.887     0    0.017   0.034     1.161   90.476   86.599
LGA    S   141_A      S   141_A     0.872     0    0.062   0.066     0.932   90.476   90.476
LGA    L   142_A      L   142_A     0.570     0    0.021   0.075     0.782   90.476   90.476
LGA    K   143_A      K   143_A     0.315     0    0.041   0.676     2.894  100.000   90.000
LGA    Y   144_A      Y   144_A     0.512     0    0.033   0.089     1.602   92.857   86.786
LGA    A   145_A      A   145_A     0.705     0    0.041   0.054     1.076   90.595   90.571
LGA    A   146_A      A   146_A     1.096     0    0.015   0.041     1.339   83.690   83.238
LGA    G   147_A      G   147_A     1.208     0    0.014   0.014     1.208   81.429   81.429
LGA    K   148_A      K   148_A     1.227     4    0.016   0.016     1.293   81.429   45.238
LGA    P   149_A      P   149_A     1.211     0    0.020   0.036     1.653   79.286   80.204
LGA    A   150_A      A   150_A     1.861     0    0.225   0.216     2.298   75.000   72.952
LGA    C   151_A      C   151_A     1.170     0    0.549   0.624     1.819   77.143   78.571

# RMSD_GDC results:       CA      MC common percent     ALL common percent   GDC_mc  GDC_all
NUMBER_OF_ATOMS_AA:      131     524    524  100.00     992    992  100.00               131
SUMMARY(RMSD_GDC):     1.496          1.487                  2.171           83.678   78.417

#CA            N1   N2   DIST      N    RMSD    GDT_TS    LGA_S3     LGA_Q 
SUMMARY(GDT)  159  131    4.0    130    1.45    89.504    94.385     8.404

LGA_LOCAL      RMSD:   1.447  Number of atoms:  130  under DIST:   4.00
LGA_ASGN_ATOMS RMSD:   1.497  Number of assigned atoms:  131 
Std_ASGN_ATOMS RMSD:   1.496  Standard rmsd on all 131 assigned CA atoms 

Unitary ROTATION matrix and the SHIFT vector superimpose molecules  (1=>2)
  X_new =   0.292274 * X  +   0.059382 * Y  +   0.954489 * Z  + -27.889256
  Y_new =   0.360628 * X  +   0.917544 * Y  +  -0.167511 * Z  +  28.101290
  Z_new =  -0.885733 * X  +   0.393174 * Y  +   0.246759 * Z  +   3.103382 

Euler angles from the ROTATION matrix. Conventions XYZ and ZXZ:
           Phi     Theta       Psi   [DEG:       Phi     Theta       Psi ]
XYZ:  0.889710  1.088072  1.010324   [DEG:   50.9766   62.3419   57.8873 ]
ZXZ:  1.397067  1.321461 -1.153029   [DEG:   80.0461   75.7142  -66.0637 ]
 
# END of job
