
#######################################################
#                                                     #
#                        LGA                          #
#                  ---------------                    #
#                                                     #
#               Local-Global Alignment                #
#        A Method for Finding 3-D Similarities        #
#               in Protein Structures                 #
#                                                     #
#                  ------------ 10/2009               #
#                                                     #
#      Adam Zemla (adamz@llnl.gov)                    #
#      Lawrence Livermore National Laboratory, CA     #
#                                                     #
#######################################################

!!!   License for LGA program has expired  !!!
#   For updated version of the LGA program   #
# please contact Adam Zemla:  adamz@llnl.gov #

# Molecule1: number of CA atoms  159 ( 1222),  selected  131 , name one
# Molecule2: number of CA atoms  131 (  992),  selected  131 , name two
# PARAMETERS: input.pdb  -ie  -3  -d:4  -sda  -swap  -ch1:A  -ch2:A  
# FIXED Atom-Atom correspondence
# GDT and LCS analysis 

LCS - RMSD CUTOFF   5.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:   131       4_A - 151_A       1.67     1.67
  LCS_AVERAGE:    100.00

LCS - RMSD CUTOFF   2.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:   131       4_A - 151_A       1.67     1.67
  LCS_AVERAGE:    100.00

LCS - RMSD CUTOFF   1.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:    37      22_A - 58_A        0.97     1.94
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:    37      65_A - 118_A       0.97     1.71
  LCS_AVERAGE:     23.89

LCS_GDT    MOLECULE-1    MOLECULE-2     LCS_DETAILS     GDT_DETAILS                                                    TOTAL NUMBER OF RESIDUE PAIRS:  131
LCS_GDT     RESIDUE       RESIDUE       SEGMENT_SIZE    GLOBAL DISTANCE TEST COLUMNS: number of residues under the threshold assigned to each residue pair
LCS_GDT   NAME NUMBER   NAME NUMBER    1.0  2.0  5.0    0.5  1.0  1.5  2.0  2.5  3.0  3.5  4.0  4.5  5.0  5.5  6.0  6.5  7.0  7.5  8.0  8.5  9.0  9.5 10.0
LCS_GDT     E     4_A     E     4_A     12  131  131      3    3   11   42   86   95  119  123  126  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     K     5_A     K     5_A     14  131  131     46   88  103  116  120  123  125  125  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     T     6_A     T     6_A     14  131  131     64   91  106  116  120  123  125  125  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     V     7_A     V     7_A     14  131  131     64   91  106  116  120  123  125  125  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     Y     8_A     Y     8_A     14  131  131     64   91  106  116  120  123  125  125  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     G     9_A     G     9_A     14  131  131     64   91  106  116  120  123  125  125  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     L    10_A     L    10_A     14  131  131     64   91  106  116  120  123  125  125  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     N    11_A     N    11_A     14  131  131     64   91  106  116  120  123  125  125  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     E    12_A     E    12_A     14  131  131     64   91  106  116  120  123  125  125  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     Y    13_A     Y    13_A     14  131  131     64   91  106  116  120  123  125  125  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A    14_A     A    14_A     14  131  131     64   91  106  116  120  123  125  125  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A    15_A     A    15_A     14  131  131     64   91  106  116  120  123  125  125  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     L    16_A     L    16_A     14  131  131     40   91  106  116  120  123  125  125  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     D    17_A     D    17_A     14  131  131     22   91  106  116  120  123  125  125  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     G    18_A     G    18_A     15  131  131      4   15   58  112  120  123  125  125  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     I    19_A     I    19_A     20  131  131      4   15   43  109  120  123  125  125  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     N    20_A     N    20_A     26  131  131      4   15   62  112  120  123  125  125  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     L    21_A     L    21_A     26  131  131      4   58  104  116  120  123  125  125  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     E    22_A     E    22_A     37  131  131      4   39  101  116  120  123  125  125  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     V    23_A     V    23_A     37  131  131     64   91  106  116  120  123  125  125  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A    24_A     A    24_A     37  131  131     54   91  106  116  120  123  125  125  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A    25_A     A    25_A     37  131  131     64   91  106  116  120  123  125  125  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     K    26_A     K    26_A     37  131  131     64   91  106  116  120  123  125  125  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     L    27_A     L    27_A     37  131  131     64   91  106  116  120  123  125  125  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     D    28_A     D    28_A     37  131  131     64   91  106  116  120  123  125  125  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     T    29_A     T    29_A     37  131  131     64   91  106  116  120  123  125  125  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     G    30_A     G    30_A     37  131  131     64   91  106  116  120  123  125  125  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A    31_A     A    31_A     37  131  131     64   91  106  116  120  123  125  125  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     K    32_A     K    32_A     37  131  131     64   91  106  116  120  123  125  125  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     T    33_A     T    33_A     37  131  131     64   91  106  116  120  123  125  125  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A    34_A     A    34_A     37  131  131     64   91  106  116  120  123  125  125  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     S    35_A     S    35_A     37  131  131     64   91  106  116  120  123  125  125  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     L    36_A     L    36_A     37  131  131     58   91  106  116  120  123  125  125  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     S    37_A     S    37_A     37  131  131     55   91  106  116  120  123  125  125  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A    38_A     A    38_A     37  131  131     30   90  106  116  120  123  125  125  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     R    39_A     R    39_A     37  131  131     26   69  106  116  120  123  125  125  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     D    40_A     D    40_A     37  131  131     26   64  105  116  120  123  125  125  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     I    41_A     I    41_A     37  131  131     26   69  106  116  120  123  125  125  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     K    42_A     K    42_A     37  131  131     19   59  104  116  120  123  125  125  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     R    43_A     R    43_A     37  131  131     26   79  106  116  120  123  125  125  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     F    44_A     F    44_A     37  131  131     28   90  106  116  120  123  125  125  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     K    45_A     K    45_A     37  131  131     27   91  106  116  120  123  125  125  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     R    46_A     R    46_A     37  131  131     26   79  106  116  120  123  125  125  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     N    47_A     N    47_A     37  131  131     21   87  106  116  120  123  125  125  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     G    48_A     G    48_A     37  131  131     19   90  106  116  120  123  125  125  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     E    49_A     E    49_A     37  131  131     21   90  106  116  120  123  125  125  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     S    50_A     S    50_A     37  131  131     26   90  106  116  120  123  125  125  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     W    51_A     W    51_A     37  131  131     31   91  106  116  120  123  125  125  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     V    52_A     V    52_A     37  131  131     30   91  106  116  120  123  125  125  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     R    53_A     R    53_A     37  131  131     21   69  106  116  120  123  125  125  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     F    54_A     F    54_A     37  131  131     26   69  106  116  120  123  125  125  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     Y    55_A     Y    55_A     37  131  131     19   58   90  116  120  123  125  125  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     L    56_A     L    56_A     37  131  131     26   63  102  116  120  123  125  125  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A    57_A     A    57_A     37  131  131     27   71  106  116  120  123  125  125  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     I    58_A     I    58_A     37  131  131     28   82  106  116  120  123  125  125  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     D    59_A     D    59_A      3  131  131      3    4    4   17   39   96  121  125  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A    60_A     A    60_A      3  131  131      3    4    4    8   12  106  114  124  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A    61_A     A    61_A      3  131  131      3    3    4    6    7   14   22  104  124  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     H    62_A     H    62_A      4  131  131      3   11   19   94  115  120  125  125  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     S    63_A     S    63_A     20  131  131     26   57   78  109  119  123  125  125  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     H    64_A     H    64_A     20  131  131      3    4    9   45   70   92  115  125  127  128  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     P    65_A     P    65_A     37  131  131      3   34   56   87  116  123  125  125  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     I    66_A     I    66_A     37  131  131     26   63   99  116  120  123  125  125  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     E    67_A     E    67_A     37  131  131     25   71  106  116  120  123  125  125  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     R    68_A     R    68_A     37  131  131     30   91  106  116  120  123  125  125  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     P    69_A     P    69_A     37  131  131     55   91  106  116  120  123  125  125  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     L    70_A     L    70_A     37  131  131     56   91  106  116  120  123  125  125  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A    71_A     A    71_A     37  131  131     64   91  106  116  120  123  125  125  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     R    72_A     R    72_A     37  131  131     64   91  106  116  120  123  125  125  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     V    73_A     V    73_A     37  131  131     56   91  106  116  120  123  125  125  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     S    74_A     S    74_A     37  131  131     45   91  106  116  120  123  125  125  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     K    75_A     K    75_A     37  131  131     59   91  106  116  120  123  125  125  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A    93_A     A    93_A     37  131  131     45   91  106  116  120  123  125  125  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     R    94_A     R    94_A     37  131  131     44   91  106  116  120  123  125  125  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     P    95_A     P    95_A     37  131  131     58   91  106  116  120  123  125  125  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     V    96_A     V    96_A     37  131  131     64   91  106  116  120  123  125  125  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     I    97_A     I    97_A     37  131  131     64   91  106  116  120  123  125  125  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     E    98_A     E    98_A     37  131  131     58   91  106  116  120  123  125  125  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     L    99_A     L    99_A     37  131  131     64   91  106  116  120  123  125  125  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     D   100_A     D   100_A     37  131  131     62   91  106  116  120  123  125  125  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     I   101_A     I   101_A     37  131  131     64   91  106  116  120  123  125  125  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     C   102_A     C   102_A     37  131  131     64   91  106  116  120  123  125  125  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     M   103_A     M   103_A     37  131  131     64   91  106  116  120  123  125  125  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     G   104_A     G   104_A     37  131  131     64   91  106  116  120  123  125  125  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     S   105_A     S   105_A     37  131  131     64   91  106  116  120  123  125  125  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A   106_A     A   106_A     37  131  131     64   91  106  116  120  123  125  125  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     M   107_A     M   107_A     37  131  131     64   91  106  116  120  123  125  125  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     R   108_A     R   108_A     37  131  131     64   91  106  116  120  123  125  125  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     S   109_A     S   109_A     37  131  131     64   91  106  116  120  123  125  125  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     I   110_A     I   110_A     37  131  131     36   91  106  116  120  123  125  125  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     E   111_A     E   111_A     37  131  131     64   91  106  116  120  123  125  125  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     V   112_A     V   112_A     37  131  131     64   91  106  116  120  123  125  125  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     N   113_A     N   113_A     37  131  131     64   91  106  116  120  123  125  125  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     L   114_A     L   114_A     37  131  131     55   91  106  116  120  123  125  125  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     T   115_A     T   115_A     37  131  131     45   91  106  116  120  123  125  125  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     D   116_A     D   116_A     37  131  131     25   91  106  116  120  123  125  125  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     R   117_A     R   117_A     37  131  131      4   25  101  116  120  123  125  125  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     S   118_A     S   118_A     37  131  131     23   90  103  116  120  123  125  125  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A   119_A     A   119_A      4  131  131      3    3    4    6   13  102  116  125  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     F   120_A     F   120_A     32  131  131      3    5   30   60  117  122  125  125  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     Q   121_A     Q   121_A     32  131  131      4   20   83  101  119  123  125  125  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     Y   122_A     Y   122_A     32  131  131     29   91  106  116  120  123  125  125  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     P   123_A     P   123_A     32  131  131     56   91  106  116  120  123  125  125  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     L   124_A     L   124_A     32  131  131     64   91  106  116  120  123  125  125  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     L   125_A     L   125_A     32  131  131     64   91  106  116  120  123  125  125  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     I   126_A     I   126_A     32  131  131     64   91  106  116  120  123  125  125  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     G   127_A     G   127_A     32  131  131     64   91  106  116  120  123  125  125  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     S   128_A     S   128_A     32  131  131     64   91  106  116  120  123  125  125  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     E   129_A     E   129_A     32  131  131     64   91  106  116  120  123  125  125  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A   130_A     A   130_A     32  131  131     64   91  106  116  120  123  125  125  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     L   131_A     L   131_A     32  131  131     64   91  106  116  120  123  125  125  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     K   132_A     K   132_A     32  131  131     64   91  106  116  120  123  125  125  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     R   133_A     R   133_A     32  131  131     55   91  106  116  120  123  125  125  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     F   134_A     F   134_A     32  131  131     61   91  106  116  120  123  125  125  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     D   135_A     D   135_A     32  131  131     64   91  106  116  120  123  125  125  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A   136_A     A   136_A     32  131  131     64   91  106  116  120  123  125  125  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     L   137_A     L   137_A     32  131  131     64   91  106  116  120  123  125  125  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     V   138_A     V   138_A     32  131  131     64   91  106  116  120  123  125  125  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     D   139_A     D   139_A     32  131  131     64   91  106  116  120  123  125  125  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     P   140_A     P   140_A     32  131  131     64   91  106  116  120  123  125  125  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     S   141_A     S   141_A     32  131  131     64   91  106  116  120  123  125  125  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     L   142_A     L   142_A     32  131  131     64   91  106  116  120  123  125  125  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     K   143_A     K   143_A     32  131  131     64   91  106  116  120  123  125  125  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     Y   144_A     Y   144_A     32  131  131     64   91  106  116  120  123  125  125  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A   145_A     A   145_A     32  131  131     64   91  106  116  120  123  125  125  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A   146_A     A   146_A     32  131  131     64   91  106  116  120  123  125  125  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     G   147_A     G   147_A     32  131  131     64   91  106  116  120  123  125  125  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     K   148_A     K   148_A     32  131  131     64   91  106  116  120  123  125  125  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     P   149_A     P   149_A     32  131  131     64   91  106  116  120  123  125  125  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     A   150_A     A   150_A     32  131  131     64   90  105  116  120  123  125  125  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_GDT     C   151_A     C   151_A     32  131  131     64   91  106  116  120  123  125  125  128  129  130  131  131  131  131  131  131  131  131  131 
LCS_AVERAGE  LCS_A:  74.63  (  23.89  100.00  100.00 )

GLOBAL_DISTANCE_TEST (summary information about detected largest sets of residues (represented by selected AToms) that can fit under specified thresholds)
GDT DIST_CUTOFF  0.50   1.00   1.50   2.00   2.50   3.00   3.50   4.00   4.50   5.00   5.50   6.00   6.50   7.00   7.50   8.00   8.50   9.00   9.50  10.00
GDT NUMBER_AT     64     91    106    116    120    123    125    125    128    129    130    131    131    131    131    131    131    131    131    131 
GDT PERCENT_AT  48.85  69.47  80.92  88.55  91.60  93.89  95.42  95.42  97.71  98.47  99.24 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00
GDT RMS_LOCAL    0.31   0.56   0.79   0.94   1.07   1.17   1.25   1.25   1.47   1.53   1.59   1.67   1.67   1.67   1.67   1.67   1.67   1.67   1.67   1.67
GDT RMS_ALL_AT   2.01   1.76   1.68   1.68   1.68   1.68   1.67   1.67   1.67   1.67   1.67   1.67   1.67   1.67   1.67   1.67   1.67   1.67   1.67   1.67

# Checking swapping
#   possible swapping detected:  E    12_A      E    12_A
#   possible swapping detected:  E    22_A      E    22_A
#   possible swapping detected:  D    59_A      D    59_A
#   possible swapping detected:  E    67_A      E    67_A
#   possible swapping detected:  E    98_A      E    98_A
#   possible swapping detected:  F   120_A      F   120_A
#   possible swapping detected:  Y   122_A      Y   122_A

#      Molecule1      Molecule2  DISTANCE    Mis    MC     All    Dist_max   GDC_mc  GDC_all
LGA    E     4_A      E     4_A     5.173     4    0.484   0.466     7.047   39.048   18.466
LGA    K     5_A      K     5_A     1.732     0    0.141   0.666     3.203   67.143   64.286
LGA    T     6_A      T     6_A     1.048     0    0.057   0.062     1.137   81.429   82.721
LGA    V     7_A      V     7_A     1.072     0    0.025   0.054     1.215   83.690   82.721
LGA    Y     8_A      Y     8_A     0.662     0    0.071   0.120     0.978   90.476   90.476
LGA    G     9_A      G     9_A     0.563     0    0.047   0.047     0.655   95.238   95.238
LGA    L    10_A      L    10_A     0.151     0    0.068   0.283     1.165  100.000   96.488
LGA    N    11_A      N    11_A     0.202     0    0.023   0.064     0.469  100.000  100.000
LGA    E    12_A      E    12_A     0.416     0    0.064   0.102     0.661   95.238   97.884
LGA    Y    13_A      Y    13_A     0.871     0    0.011   0.100     2.591   90.476   76.111
LGA    A    14_A      A    14_A     0.651     0    0.102   0.136     0.788   90.476   90.476
LGA    A    15_A      A    15_A     1.044     0    0.011   0.022     1.131   85.952   85.048
LGA    L    16_A      L    16_A     0.728     0    0.084   0.915     3.712   92.857   82.440
LGA    D    17_A      D    17_A     0.676     0    0.072   0.300     1.924   84.048   88.512
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LGA    Y   122_A      Y   122_A     1.341     0    0.058   0.301     1.810   81.548   85.238
LGA    P   123_A      P   123_A     0.587     0    0.023   0.337     1.056   90.476   89.184
LGA    L   124_A      L   124_A     0.636     0    0.040   0.116     0.912   90.476   90.476
LGA    L   125_A      L   125_A     0.633     0    0.026   0.095     0.810   90.476   90.476
LGA    I   126_A      I   126_A     0.501     0    0.029   0.587     2.037   95.238   92.024
LGA    G   127_A      G   127_A     0.497     0    0.048   0.048     0.607   97.619   97.619
LGA    S   128_A      S   128_A     0.360     0    0.034   0.070     0.587  100.000   98.413
LGA    E   129_A      E   129_A     0.403     0    0.036   0.996     4.004  100.000   83.280
LGA    A   130_A      A   130_A     0.250     0    0.050   0.067     0.369  100.000  100.000
LGA    L   131_A      L   131_A     0.189     0    0.028   0.047     0.270  100.000  100.000
LGA    K   132_A      K   132_A     0.220     0    0.025   0.759     2.103  100.000   92.011
LGA    R   133_A      R   133_A     0.722     0    0.024   1.059     3.761   90.476   81.558
LGA    F   134_A      F   134_A     0.828     0    0.047   0.171     1.090   88.214   90.519
LGA    D   135_A      D   135_A     0.822     0    0.059   0.283     1.712   88.214   83.750
LGA    A   136_A      A   136_A     0.679     0    0.066   0.074     0.773   90.476   90.476
LGA    L   137_A      L   137_A     0.832     0    0.036   0.279     2.411   90.476   81.726
LGA    V   138_A      V   138_A     0.595     0    0.012   0.032     0.879   90.476   90.476
LGA    D   139_A      D   139_A     0.776     0    0.023   0.053     1.263   90.476   88.214
LGA    P   140_A      P   140_A     0.746     0    0.018   0.057     1.120   90.476   89.184
LGA    S   141_A      S   141_A     0.656     0    0.070   0.074     0.757   90.476   90.476
LGA    L   142_A      L   142_A     0.394     0    0.019   0.070     0.819  100.000   96.429
LGA    K   143_A      K   143_A     0.107     0    0.037   0.653     2.208  100.000   94.021
LGA    Y   144_A      Y   144_A     0.547     0    0.035   0.071     1.220   92.857   89.008
LGA    A   145_A      A   145_A     0.792     0    0.033   0.045     1.136   88.214   88.667
LGA    A   146_A      A   146_A     1.020     0    0.016   0.039     1.233   83.690   85.048
LGA    G   147_A      G   147_A     1.155     0    0.021   0.021     1.155   83.690   83.690
LGA    K   148_A      K   148_A     1.110     4    0.017   0.017     1.137   81.429   45.238
LGA    P   149_A      P   149_A     1.010     0    0.013   0.030     1.352   81.429   82.721
LGA    A   150_A      A   150_A     1.463     0    0.179   0.173     1.720   81.429   79.714
LGA    C   151_A      C   151_A     1.038     0    0.552   0.608     1.881   79.286   83.016

# RMSD_GDC results:       CA      MC common percent     ALL common percent   GDC_mc  GDC_all
NUMBER_OF_ATOMS_AA:      131     524    524  100.00     992    992  100.00               131
SUMMARY(RMSD_GDC):     1.668          1.638                  2.354           83.413   78.045

#CA            N1   N2   DIST      N    RMSD    GDT_TS    LGA_S3     LGA_Q 
SUMMARY(GDT)  159  131    4.0    125    1.25    88.359    93.726     9.266

LGA_LOCAL      RMSD:   1.249  Number of atoms:  125  under DIST:   4.00
LGA_ASGN_ATOMS RMSD:   1.673  Number of assigned atoms:  131 
Std_ASGN_ATOMS RMSD:   1.668  Standard rmsd on all 131 assigned CA atoms 

Unitary ROTATION matrix and the SHIFT vector superimpose molecules  (1=>2)
  X_new =   0.120893 * X  +   0.358121 * Y  +   0.925815 * Z  + -30.258579
  Y_new =  -0.117350 * X  +   0.931272 * Y  +  -0.344908 * Z  +  27.539499
  Z_new =  -0.985705 * X  +  -0.066948 * Y  +   0.154610 * Z  +   3.375371 

Euler angles from the ROTATION matrix. Conventions XYZ and ZXZ:
           Phi     Theta       Psi   [DEG:       Phi     Theta       Psi ]
XYZ: -0.770529  1.401507 -0.408636   [DEG:  -44.1480   80.3004  -23.4131 ]
ZXZ:  1.214179  1.415564 -1.638611   [DEG:   69.5673   81.1058  -93.8855 ]
 
# END of job
