
#######################################################
#                                                     #
#                        LGA                          #
#                  ---------------                    #
#                                                     #
#               Local-Global Alignment                #
#        A Method for Finding 3-D Similarities        #
#               in Protein Structures                 #
#                                                     #
#                  ------------ 10/2009               #
#                                                     #
#      Adam Zemla (adamz@llnl.gov)                    #
#      Lawrence Livermore National Laboratory, CA     #
#                                                     #
#######################################################

!!!   License for LGA program has expired  !!!
#   For updated version of the LGA program   #
# please contact Adam Zemla:  adamz@llnl.gov #

# Molecule1: number of CA atoms  159 ( 1307),  selected  159 , name one
# Molecule2: number of CA atoms  160 ( 1315),  selected  159 , name two
# PARAMETERS: input.pdb  -ie  -3  -d:4  -sda  -swap  -ch1:A  -ch2:A  
# FIXED Atom-Atom correspondence
# GDT and LCS analysis 

LCS - RMSD CUTOFF   5.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:   159       2_A - 160_A       1.44     1.44
  LCS_AVERAGE:     99.38

LCS - RMSD CUTOFF   2.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:   159       2_A - 160_A       1.44     1.44
  LCS_AVERAGE:     99.38

LCS - RMSD CUTOFF   1.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:   112      16_A - 127_A       1.00     1.51
  LCS_AVERAGE:     56.56

LCS_GDT    MOLECULE-1    MOLECULE-2     LCS_DETAILS     GDT_DETAILS                                                    TOTAL NUMBER OF RESIDUE PAIRS:  159
LCS_GDT     RESIDUE       RESIDUE       SEGMENT_SIZE    GLOBAL DISTANCE TEST COLUMNS: number of residues under the threshold assigned to each residue pair
LCS_GDT   NAME NUMBER   NAME NUMBER    1.0  2.0  5.0    0.5  1.0  1.5  2.0  2.5  3.0  3.5  4.0  4.5  5.0  5.5  6.0  6.5  7.0  7.5  8.0  8.5  9.0  9.5 10.0
LCS_GDT     K     2_A     K     2_A     45  159  159     17   85  126  147  153  156  157  158  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159 
LCS_GDT     N     3_A     N     3_A     45  159  159     34  104  126  147  153  156  157  158  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159 
LCS_GDT     F     4_A     F     4_A     45  159  159     13  104  126  147  153  156  157  158  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159 
LCS_GDT     E     5_A     E     5_A     45  159  159     33  104  126  147  153  156  157  158  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159 
LCS_GDT     I     6_A     I     6_A     45  159  159     35  104  126  147  153  156  157  158  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159 
LCS_GDT     V     7_A     V     7_A     45  159  159     35  104  126  147  153  156  157  158  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159 
LCS_GDT     T     8_A     T     8_A     45  159  159     25   91  126  147  153  156  157  158  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159 
LCS_GDT     V     9_A     V     9_A     45  159  159     14   66  125  147  153  156  157  158  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159 
LCS_GDT     T    10_A     T    10_A     45  159  159     20   61  124  147  153  156  157  158  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159 
LCS_GDT     P    11_A     P    11_A     45  159  159      8   46   97  139  153  156  157  158  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159 
LCS_GDT     D    12_A     D    12_A     45  159  159     10   53   97  139  153  156  157  158  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159 
LCS_GDT     H    13_A     H    13_A     45  159  159     20   84  126  147  153  156  157  158  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159 
LCS_GDT     A    14_A     A    14_A     45  159  159     20   87  126  147  153  156  157  158  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159 
LCS_GDT     E    15_A     E    15_A     45  159  159     16   93  126  147  153  156  157  158  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159 
LCS_GDT     Q    16_A     Q    16_A    112  159  159     35  104  126  147  153  156  157  158  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159 
LCS_GDT     L    17_A     L    17_A    112  159  159     35  104  126  147  153  156  157  158  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159 
LCS_GDT     I    18_A     I    18_A    112  159  159     35  104  126  147  153  156  157  158  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159 
LCS_GDT     S    19_A     S    19_A    112  159  159     36  104  126  147  153  156  157  158  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159 
LCS_GDT     M    20_A     M    20_A    112  159  159     21  104  126  147  153  156  157  158  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159 
LCS_GDT     I    21_A     I    21_A    112  159  159     22  104  126  147  153  156  157  158  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159 
LCS_GDT     H    22_A     H    22_A    112  159  159     36  104  126  147  153  156  157  158  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159 
LCS_GDT     E    23_A     E    23_A    112  159  159     34  104  126  147  153  156  157  158  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159 
LCS_GDT     L    24_A     L    24_A    112  159  159     17  104  126  147  153  156  157  158  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159 
LCS_GDT     A    25_A     A    25_A    112  159  159     36  104  126  147  153  156  157  158  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159 
LCS_GDT     E    26_A     E    26_A    112  159  159     36  104  126  147  153  156  157  158  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159 
LCS_GDT     F    27_A     F    27_A    112  159  159     26  104  126  147  153  156  157  158  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159 
LCS_GDT     E    28_A     E    28_A    112  159  159     36  104  126  147  153  156  157  158  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159 
LCS_GDT     K    29_A     K    29_A    112  159  159     36  104  126  147  153  156  157  158  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159 
LCS_GDT     M    30_A     M    30_A    112  159  159     36  104  126  147  153  156  157  158  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159 
LCS_GDT     K    31_A     K    31_A    112  159  159     36  104  126  147  153  156  157  158  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159 
LCS_GDT     S    32_A     S    32_A    112  159  159     28  104  126  147  153  156  157  158  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159 
LCS_GDT     S    33_A     S    33_A    112  159  159     35  104  126  147  153  156  157  158  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159 
LCS_GDT     V    34_A     V    34_A    112  159  159     20  104  126  147  153  156  157  158  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159 
LCS_GDT     V    35_A     V    35_A    112  159  159     32  104  126  147  153  156  157  158  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159 
LCS_GDT     N    36_A     N    36_A    112  159  159     14   95  126  147  153  156  157  158  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159 
LCS_GDT     T    37_A     T    37_A    112  159  159     13   88  126  147  153  156  157  158  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159 
LCS_GDT     A    38_A     A    38_A    112  159  159      7   25  124  147  153  156  157  158  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159 
LCS_GDT     E    39_A     E    39_A    112  159  159      7   46  118  147  153  156  157  158  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159 
LCS_GDT     K    40_A     K    40_A    112  159  159     12   97  126  147  153  156  157  158  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159 
LCS_GDT     L    41_A     L    41_A    112  159  159     32  104  126  147  153  156  157  158  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159 
LCS_GDT     R    42_A     R    42_A    112  159  159     15   88  126  147  153  156  157  158  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159 
LCS_GDT     K    43_A     K    43_A    112  159  159      3   72  124  147  153  156  157  158  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159 
LCS_GDT     D    44_A     D    44_A    112  159  159      3   76  126  147  153  156  157  158  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159 
LCS_GDT     I    45_A     I    45_A    112  159  159     14   46  125  147  153  156  157  158  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159 
LCS_GDT     E    46_A     E    46_A    112  159  159      3   88  126  147  153  156  157  158  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159 
LCS_GDT     N    47_A     N    47_A    112  159  159      3    3  121  147  153  156  157  158  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159 
LCS_GDT     K    48_A     K    48_A    112  159  159      6   88  123  147  153  156  157  158  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159 
LCS_GDT     A    49_A     A    49_A    112  159  159      3    9   21   64  105  151  157  158  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159 
LCS_GDT     V    50_A     V    50_A    112  159  159     21   97  126  147  153  156  157  158  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159 
LCS_GDT     H    51_A     H    51_A    112  159  159     36  104  126  147  153  156  157  158  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159 
LCS_GDT     G    52_A     G    52_A    112  159  159     13   79  126  147  153  156  157  158  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159 
LCS_GDT     F    53_A     F    53_A    112  159  159     32  104  126  147  153  156  157  158  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159 
LCS_GDT     I    54_A     I    54_A    112  159  159     36  104  126  147  153  156  157  158  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159 
LCS_GDT     A    55_A     A    55_A    112  159  159     35  104  126  147  153  156  157  158  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159 
LCS_GDT     F    56_A     F    56_A    112  159  159     13  104  126  147  153  156  157  158  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159 
LCS_GDT     I    57_A     I    57_A    112  159  159     18  104  126  147  153  156  157  158  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159 
LCS_GDT     G    58_A     G    58_A    112  159  159     13   74  125  147  153  156  157  158  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159 
LCS_GDT     E    59_A     E    59_A    112  159  159     13   97  126  147  153  156  157  158  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159 
LCS_GDT     E    60_A     E    60_A    112  159  159     13  104  126  147  153  156  157  158  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159 
LCS_GDT     P    61_A     P    61_A    112  159  159     34  104  126  147  153  156  157  158  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159 
LCS_GDT     A    62_A     A    62_A    112  159  159     36  104  126  147  153  156  157  158  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159 
LCS_GDT     G    63_A     G    63_A    112  159  159     34  104  126  147  153  156  157  158  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159 
LCS_GDT     M    64_A     M    64_A    112  159  159     36  104  126  147  153  156  157  158  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159 
LCS_GDT     N    65_A     N    65_A    112  159  159     34  104  126  147  153  156  157  158  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159 
LCS_GDT     L    66_A     L    66_A    112  159  159     35  104  126  147  153  156  157  158  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159 
LCS_GDT     F    67_A     F    67_A    112  159  159     36  104  126  147  153  156  157  158  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159 
LCS_GDT     Y    68_A     Y    68_A    112  159  159     36  104  126  147  153  156  157  158  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159 
LCS_GDT     Y    69_A     Y    69_A    112  159  159     36  104  126  147  153  156  157  158  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159 
LCS_GDT     A    70_A     A    70_A    112  159  159     36  104  126  147  153  156  157  158  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159 
LCS_GDT     Y    71_A     Y    71_A    112  159  159     16   92  126  147  153  156  157  158  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159 
LCS_GDT     S    72_A     S    72_A    112  159  159      5   24  117  147  153  156  157  158  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159 
LCS_GDT     T    73_A     T    73_A    112  159  159      5   46  119  147  153  156  157  158  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159 
LCS_GDT     W    74_A     W    74_A    112  159  159     10   78  125  147  153  156  157  158  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159 
LCS_GDT     V    75_A     V    75_A    112  159  159     33  100  126  147  153  156  157  158  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159 
LCS_GDT     G    76_A     G    76_A    112  159  159      3   51  125  147  153  156  157  158  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159 
LCS_GDT     Q    77_A     Q    77_A    112  159  159     33   98  126  147  153  156  157  158  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159 
LCS_GDT     Y    78_A     Y    78_A    112  159  159     36  104  126  147  153  156  157  158  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159 
LCS_GDT     L    79_A     L    79_A    112  159  159     36  104  126  147  153  156  157  158  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159 
LCS_GDT     H    80_A     H    80_A    112  159  159     36  104  126  147  153  156  157  158  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159 
LCS_GDT     M    81_A     M    81_A    112  159  159     35  104  126  147  153  156  157  158  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159 
LCS_GDT     E    82_A     E    82_A    112  159  159     35  104  126  147  153  156  157  158  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159 
LCS_GDT     D    83_A     D    83_A    112  159  159     36  104  126  147  153  156  157  158  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159 
LCS_GDT     L    84_A     L    84_A    112  159  159     36  104  126  147  153  156  157  158  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159 
LCS_GDT     Y    85_A     Y    85_A    112  159  159     34  104  126  147  153  156  157  158  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159 
LCS_GDT     I    86_A     I    86_A    112  159  159     36  104  126  147  153  156  157  158  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159 
LCS_GDT     R    87_A     R    87_A    112  159  159     36  104  126  147  153  156  157  158  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159 
LCS_GDT     P    88_A     P    88_A    112  159  159     36  104  126  147  153  156  157  158  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159 
LCS_GDT     Q    89_A     Q    89_A    112  159  159     36  104  126  147  153  156  157  158  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159 
LCS_GDT     F    90_A     F    90_A    112  159  159     36  104  126  147  153  156  157  158  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159 
LCS_GDT     R    91_A     R    91_A    112  159  159     36  104  126  147  153  156  157  158  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159 
LCS_GDT     R    92_A     R    92_A    112  159  159     18  104  126  147  153  156  157  158  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159 
LCS_GDT     M    93_A     M    93_A    112  159  159     11  104  126  147  153  156  157  158  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159 
LCS_GDT     G    94_A     G    94_A    112  159  159     36  104  126  147  153  156  157  158  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159 
LCS_GDT     L    95_A     L    95_A    112  159  159     22  104  126  147  153  156  157  158  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159 
LCS_GDT     A    96_A     A    96_A    112  159  159     21  104  126  147  153  156  157  158  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159 
LCS_GDT     R    97_A     R    97_A    112  159  159     10  100  126  147  153  156  157  158  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159 
LCS_GDT     T    98_A     T    98_A    112  159  159     28  104  126  147  153  156  157  158  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159 
LCS_GDT     L    99_A     L    99_A    112  159  159     36  104  126  147  153  156  157  158  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159 
LCS_GDT     W   100_A     W   100_A    112  159  159     36  104  126  147  153  156  157  158  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159 
LCS_GDT     K   101_A     K   101_A    112  159  159     33  104  126  147  153  156  157  158  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159 
LCS_GDT     K   102_A     K   102_A    112  159  159     36  104  126  147  153  156  157  158  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159 
LCS_GDT     L   103_A     L   103_A    112  159  159     36  104  126  147  153  156  157  158  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159 
LCS_GDT     A   104_A     A   104_A    112  159  159     36  104  126  147  153  156  157  158  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159 
LCS_GDT     E   105_A     E   105_A    112  159  159     36  104  126  147  153  156  157  158  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159 
LCS_GDT     L   106_A     L   106_A    112  159  159     36  104  126  147  153  156  157  158  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159 
LCS_GDT     A   107_A     A   107_A    112  159  159     36  104  126  147  153  156  157  158  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159 
LCS_GDT     R   108_A     R   108_A    112  159  159     36  104  126  147  153  156  157  158  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159 
LCS_GDT     D   109_A     D   109_A    112  159  159     36  104  126  147  153  156  157  158  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159 
LCS_GDT     K   110_A     K   110_A    112  159  159     36  104  126  147  153  156  157  158  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159 
LCS_GDT     G   111_A     G   111_A    112  159  159     35  104  126  147  153  156  157  158  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159 
LCS_GDT     I   112_A     I   112_A    112  159  159     31  104  126  147  153  156  157  158  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159 
LCS_GDT     V   113_A     V   113_A    112  159  159     34  104  126  147  153  156  157  158  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159 
LCS_GDT     R   114_A     R   114_A    112  159  159     31  104  126  147  153  156  157  158  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159 
LCS_GDT     L   115_A     L   115_A    112  159  159     34  104  126  147  153  156  157  158  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159 
LCS_GDT     E   116_A     E   116_A    112  159  159     36  104  126  147  153  156  157  158  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159 
LCS_GDT     W   117_A     W   117_A    112  159  159     35  104  126  147  153  156  157  158  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159 
LCS_GDT     A   118_A     A   118_A    112  159  159     33  104  126  147  153  156  157  158  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159 
LCS_GDT     V   119_A     V   119_A    112  159  159     35  104  126  147  153  156  157  158  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159 
LCS_GDT     L   120_A     L   120_A    112  159  159     36  104  126  147  153  156  157  158  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159 
LCS_GDT     D   121_A     D   121_A    112  159  159     36  104  126  147  153  156  157  158  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159 
LCS_GDT     W   122_A     W   122_A    112  159  159     35  104  126  147  153  156  157  158  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159 
LCS_GDT     N   123_A     N   123_A    112  159  159     34  104  126  147  153  156  157  158  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159 
LCS_GDT     K   124_A     K   124_A    112  159  159     16  104  126  147  153  156  157  158  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159 
LCS_GDT     N   125_A     N   125_A    112  159  159     16  104  126  147  153  156  157  158  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159 
LCS_GDT     A   126_A     A   126_A    112  159  159     36  104  126  147  153  156  157  158  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159 
LCS_GDT     I   127_A     I   127_A    112  159  159      9  104  126  147  153  156  157  158  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159 
LCS_GDT     A   128_A     A   128_A     89  159  159      6   74  125  144  153  156  157  158  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159 
LCS_GDT     L   129_A     L   129_A     89  159  159     33  104  126  147  153  156  157  158  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159 
LCS_GDT     Y   130_A     Y   130_A     89  159  159      3  104  126  147  153  156  157  158  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159 
LCS_GDT     D   131_A     D   131_A     89  159  159     18   89  126  147  153  156  157  158  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159 
LCS_GDT     T   132_A     T   132_A     89  159  159     11   95  126  147  153  156  157  158  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159 
LCS_GDT     V   133_A     V   133_A     88  159  159     10   22   84  146  153  156  157  158  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159 
LCS_GDT     D   134_A     D   134_A     87  159  159     10   39  119  147  153  156  157  158  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159 
LCS_GDT     Y   135_A     Y   135_A     87  159  159     10   39  119  147  153  156  157  158  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159 
LCS_GDT     V   136_A     V   136_A     87  159  159     11   46  119  147  153  156  157  158  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159 
LCS_GDT     N   137_A     N   137_A     63  159  159     10   46   90  147  153  156  157  158  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159 
LCS_GDT     L   138_A     L   138_A      8  159  159      4   11   59  124  151  156  157  158  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159 
LCS_GDT     T   139_A     T   139_A      8  159  159      4   11   55   99  150  156  157  158  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159 
LCS_GDT     K   140_A     K   140_A      8  159  159      4   11   35   89  143  156  157  158  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159 
LCS_GDT     S   141_A     S   141_A      5  159  159      3    8   32   53   95  144  156  158  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159 
LCS_GDT     E   142_A     E   142_A      5  159  159      3    4    6   23   29   44  114  130  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159 
LCS_GDT     G   143_A     G   143_A     18  159  159      5   67  125  147  153  156  157  158  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159 
LCS_GDT     W   144_A     W   144_A     18  159  159     12   67  125  147  153  156  157  158  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159 
LCS_GDT     F   145_A     F   145_A     18  159  159     12   67  124  147  153  156  157  158  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159 
LCS_GDT     T   146_A     T   146_A     18  159  159      9   46  122  147  153  156  157  158  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159 
LCS_GDT     F   147_A     F   147_A     18  159  159     12   91  126  147  153  156  157  158  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159 
LCS_GDT     R   148_A     R   148_A     18  159  159     36  104  126  147  153  156  157  158  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159 
LCS_GDT     M   149_A     M   149_A     18  159  159     33  104  126  147  153  156  157  158  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159 
LCS_GDT     D   150_A     D   150_A     18  159  159     35  104  126  147  153  156  157  158  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159 
LCS_GDT     G   151_A     G   151_A     18  159  159     22  104  126  147  153  156  157  158  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159 
LCS_GDT     A   152_A     A   152_A     18  159  159     14  104  126  147  153  156  157  158  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159 
LCS_GDT     A   153_A     A   153_A     18  159  159     14  104  126  147  153  156  157  158  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159 
LCS_GDT     I   154_A     I   154_A     18  159  159     31  104  126  147  153  156  157  158  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159 
LCS_GDT     N   155_A     N   155_A     18  159  159     18  104  126  147  153  156  157  158  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159 
LCS_GDT     K   156_A     K   156_A     18  159  159     20  104  126  147  153  156  157  158  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159 
LCS_GDT     F   157_A     F   157_A     18  159  159     14  104  126  147  153  156  157  158  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159 
LCS_GDT     A   158_A     A   158_A     18  159  159     10   79  125  147  153  156  157  158  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159 
LCS_GDT     D   159_A     D   159_A     18  159  159     35  104  126  147  153  156  157  158  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159 
LCS_GDT     E   160_A     E   160_A     18  159  159      6   29  125  147  153  156  157  158  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159  159 
LCS_AVERAGE  LCS_A:  85.10  (  56.56   99.38   99.38 )

GLOBAL_DISTANCE_TEST (summary information about detected largest sets of residues (represented by selected AToms) that can fit under specified thresholds)
GDT DIST_CUTOFF  0.50   1.00   1.50   2.00   2.50   3.00   3.50   4.00   4.50   5.00   5.50   6.00   6.50   7.00   7.50   8.00   8.50   9.00   9.50  10.00
GDT NUMBER_AT     36    104    126    147    153    156    157    158    159    159    159    159    159    159    159    159    159    159    159    159 
GDT PERCENT_AT  22.50  65.00  78.75  91.87  95.62  97.50  98.12  98.75  99.37  99.37  99.37  99.37  99.37  99.37  99.37  99.37  99.37  99.37  99.37  99.37
GDT RMS_LOCAL    0.36   0.66   0.82   1.07   1.15   1.24   1.28   1.34   1.44   1.44   1.44   1.44   1.44   1.44   1.44   1.44   1.44   1.44   1.44   1.44
GDT RMS_ALL_AT   1.58   1.55   1.53   1.47   1.47   1.45   1.45   1.45   1.44   1.44   1.44   1.44   1.44   1.44   1.44   1.44   1.44   1.44   1.44   1.44

# Checking swapping
#   possible swapping detected:  E     5_A      E     5_A
#   possible swapping detected:  F    27_A      F    27_A
#   possible swapping detected:  F    67_A      F    67_A
#   possible swapping detected:  Y    68_A      Y    68_A
#   possible swapping detected:  Y    69_A      Y    69_A
#   possible swapping detected:  Y    85_A      Y    85_A
#   possible swapping detected:  Y   135_A      Y   135_A
#   possible swapping detected:  F   145_A      F   145_A
#   possible swapping detected:  F   147_A      F   147_A
#   possible swapping detected:  F   157_A      F   157_A
#   possible swapping detected:  E   160_A      E   160_A

#      Molecule1      Molecule2  DISTANCE    Mis    MC     All    Dist_max   GDC_mc  GDC_all
LGA    K     2_A      K     2_A     1.264     0    0.043   1.246     6.275   83.810   64.021
LGA    N     3_A      N     3_A     0.399     0    0.149   0.206     0.824   92.857   94.048
LGA    F     4_A      F     4_A     1.050     0    0.095   0.155     2.199   85.952   76.926
LGA    E     5_A      E     5_A     1.208     0    0.065   0.752     3.655   81.429   66.720
LGA    I     6_A      I     6_A     1.042     0    0.016   0.046     1.442   83.690   82.560
LGA    V     7_A      V     7_A     0.647     0    0.045   1.196     2.766   90.476   82.313
LGA    T     8_A      T     8_A     1.331     0    0.038   1.090     4.159   83.690   72.789
LGA    V     9_A      V     9_A     1.706     0    0.070   0.870     3.578   70.833   70.000
LGA    T    10_A      T    10_A     1.973     0    0.064   0.144     2.071   70.833   70.544
LGA    P    11_A      P    11_A     2.564     0    0.061   0.070     2.867   62.857   60.408
LGA    D    12_A      D    12_A     2.560     0    0.029   0.834     3.167   60.952   62.083
LGA    H    13_A      H    13_A     1.467     0    0.083   0.094     2.112   81.548   75.571
LGA    A    14_A      A    14_A     1.298     0    0.065   0.071     1.683   83.690   81.524
LGA    E    15_A      E    15_A     1.351     0    0.152   1.069     4.940   81.429   59.524
LGA    Q    16_A      Q    16_A     0.601     0    0.046   1.288     5.019   90.476   74.656
LGA    L    17_A      L    17_A     0.689     0    0.029   1.363     4.381   92.857   76.667
LGA    I    18_A      I    18_A     0.460     0    0.052   0.649     3.349  100.000   91.369
LGA    S    19_A      S    19_A     0.539     0    0.056   0.591     1.952   92.857   89.127
LGA    M    20_A      M    20_A     1.031     0    0.056   0.798     2.125   83.690   80.476
LGA    I    21_A      I    21_A     1.000     0    0.067   0.185     1.531   83.690   81.488
LGA    H    22_A      H    22_A     0.832     0    0.028   1.272     5.332   90.476   68.476
LGA    E    23_A      E    23_A     0.954     0    0.020   0.188     1.129   85.952   88.466
LGA    L    24_A      L    24_A     1.181     0    0.036   0.691     3.291   85.952   77.679
LGA    A    25_A      A    25_A     0.475     0    0.031   0.038     0.583   92.857   94.286
LGA    E    26_A      E    26_A     0.653     0    0.024   0.177     1.144   90.476   89.471
LGA    F    27_A      F    27_A     1.059     0    0.025   0.325     1.428   88.214   85.541
LGA    E    28_A      E    28_A     0.694     0    0.127   0.287     2.176   92.857   84.709
LGA    K    29_A      K    29_A     0.326     0    0.058   0.888     4.065   97.619   77.672
LGA    M    30_A      M    30_A     0.372     0    0.088   0.207     0.838   95.238   96.429
LGA    K    31_A      K    31_A     0.561     0    0.039   0.966     5.752   92.857   71.376
LGA    S    32_A      S    32_A     0.877     0    0.108   0.114     1.747   83.810   86.032
LGA    S    33_A      S    33_A     0.507     0    0.125   0.681     1.537   95.238   90.714
LGA    V    34_A      V    34_A     0.811     0    0.131   0.186     1.313   90.476   87.891
LGA    V    35_A      V    35_A     0.851     0    0.105   0.102     1.077   90.476   89.184
LGA    N    36_A      N    36_A     1.182     0    0.069   0.730     3.047   81.429   71.310
LGA    T    37_A      T    37_A     1.262     0    0.026   0.072     1.535   81.429   80.204
LGA    A    38_A      A    38_A     1.799     0    0.083   0.089     2.011   72.857   71.238
LGA    E    39_A      E    39_A     2.176     0    0.095   0.723     4.904   72.976   59.788
LGA    K    40_A      K    40_A     1.102     0    0.017   0.077     1.722   85.952   81.534
LGA    L    41_A      L    41_A     0.833     0    0.038   1.404     4.168   90.476   77.381
LGA    R    42_A      R    42_A     1.341     0    0.015   1.333     6.878   77.143   56.147
LGA    K    43_A      K    43_A     2.021     0    0.039   1.141     8.058   68.810   51.376
LGA    D    44_A      D    44_A     1.736     0    0.036   0.160     2.402   72.857   68.810
LGA    I    45_A      I    45_A     1.828     0    0.121   1.215     4.822   72.857   65.655
LGA    E    46_A      E    46_A     1.152     0    0.192   0.254     1.951   83.690   83.492
LGA    N    47_A      N    47_A     1.735     0    0.538   0.778     6.087   69.286   52.083
LGA    K    48_A      K    48_A     1.767     0    0.197   0.966     6.099   66.905   57.460
LGA    A    49_A      A    49_A     3.837     0    0.146   0.157     4.905   46.667   43.619
LGA    V    50_A      V    50_A     1.226     0    0.157   1.037     4.069   83.810   75.238
LGA    H    51_A      H    51_A     0.409     0    0.068   1.175     6.299   95.238   68.286
LGA    G    52_A      G    52_A     1.537     0    0.218   0.218     2.058   75.119   75.119
LGA    F    53_A      F    53_A     0.909     0    0.064   0.615     2.254   88.214   86.710
LGA    I    54_A      I    54_A     0.237     0    0.035   0.567     1.412  100.000   96.488
LGA    A    55_A      A    55_A     0.814     0    0.017   0.029     0.873   90.476   90.476
LGA    F    56_A      F    56_A     1.163     0    0.025   0.171     1.453   81.429   82.251
LGA    I    57_A      I    57_A     1.259     0    0.039   1.120     3.671   81.429   71.786
LGA    G    58_A      G    58_A     1.813     0    0.041   0.041     1.813   72.857   72.857
LGA    E    59_A      E    59_A     1.439     0    0.020   0.101     1.583   79.286   78.571
LGA    E    60_A      E    60_A     1.311     0    0.046   0.178     1.498   81.429   81.429
LGA    P    61_A      P    61_A     0.788     0    0.121   0.135     1.253   88.214   85.306
LGA    A    62_A      A    62_A     0.236     0    0.312   0.324     1.259   95.357   96.286
LGA    G    63_A      G    63_A     0.574     0    0.028   0.028     0.669   95.238   95.238
LGA    M    64_A      M    64_A     0.407     0    0.036   0.568     2.297  100.000   90.893
LGA    N    65_A      N    65_A     0.687     0    0.136   0.840     3.348   90.595   79.940
LGA    L    66_A      L    66_A     0.703     0    0.123   0.954     3.997   88.214   74.345
LGA    F    67_A      F    67_A     0.412     0    0.027   0.132     0.653   97.619   97.403
LGA    Y    68_A      Y    68_A     0.900     0    0.084   0.181     1.782   90.476   82.302
LGA    Y    69_A      Y    69_A     0.844     0    0.063   0.319     2.265   90.595   82.540
LGA    A    70_A      A    70_A     0.756     0    0.113   0.165     1.003   88.214   88.667
LGA    Y    71_A      Y    71_A     1.046     0    0.049   0.138     1.903   83.690   81.548
LGA    S    72_A      S    72_A     1.856     0    0.052   0.098     2.336   75.000   72.937
LGA    T    73_A      T    73_A     1.877     0    0.127   0.111     2.157   70.833   70.544
LGA    W    74_A      W    74_A     1.467     0    0.169   1.190     5.298   77.143   63.367
LGA    V    75_A      V    75_A     0.883     0    0.636   0.647     3.246   78.095   82.109
LGA    G    76_A      G    76_A     1.544     0    0.065   0.065     1.852   77.143   77.143
LGA    Q    77_A      Q    77_A     0.830     0    0.063   1.006     4.192   90.476   72.857
LGA    Y    78_A      Y    78_A     0.280     0    0.033   0.141     1.008   97.619   93.690
LGA    L    79_A      L    79_A     0.280     0    0.023   0.171     1.117  100.000   94.107
LGA    H    80_A      H    80_A     0.515     0    0.010   1.103     2.693   95.238   84.619
LGA    M    81_A      M    81_A     0.600     0    0.051   0.174     0.893   90.476   90.476
LGA    E    82_A      E    82_A     0.693     0    0.074   0.147     1.706   88.214   86.508
LGA    D    83_A      D    83_A     0.435     0    0.033   0.189     1.799   92.976   86.190
LGA    L    84_A      L    84_A     0.730     0    0.082   0.825     2.151   90.476   85.060
LGA    Y    85_A      Y    85_A     0.835     0    0.038   0.174     1.551   90.476   85.278
LGA    I    86_A      I    86_A     0.685     0    0.046   0.107     0.951   90.476   90.476
LGA    R    87_A      R    87_A     0.728     0    0.048   1.225     4.773   92.857   78.874
LGA    P    88_A      P    88_A     0.901     0    0.079   0.164     1.372   88.214   85.306
LGA    Q    89_A      Q    89_A     1.044     0    0.152   0.993     4.150   81.548   71.058
LGA    F    90_A      F    90_A     0.710     0    0.040   0.220     1.328   90.476   87.186
LGA    R    91_A      R    91_A     0.743     0    0.119   0.986     2.864   83.810   80.087
LGA    R    92_A      R    92_A     1.549     0    0.099   1.414     8.186   72.976   49.437
LGA    M    93_A      M    93_A     1.331     0    0.023   0.238     2.311   79.286   78.274
LGA    G    94_A      G    94_A     0.851     0    0.052   0.052     1.019   88.214   88.214
LGA    L    95_A      L    95_A     0.698     0    0.038   0.187     2.529   90.476   79.762
LGA    A    96_A      A    96_A     1.001     0    0.197   0.214     1.343   85.952   85.048
LGA    R    97_A      R    97_A     0.887     0    0.068   1.134     6.336   90.476   60.736
LGA    T    98_A      T    98_A     0.486     0    0.046   0.094     0.660   97.619   97.279
LGA    L    99_A      L    99_A     0.520     0    0.052   0.071     1.102   92.857   90.536
LGA    W   100_A      W   100_A     0.721     0    0.022   0.805     4.379   90.476   72.109
LGA    K   101_A      K   101_A     0.729     0    0.021   0.911     3.646   90.476   80.317
LGA    K   102_A      K   102_A     0.613     0    0.099   0.697     2.949   90.476   79.101
LGA    L   103_A      L   103_A     0.389     0    0.106   0.899     2.179   95.357   88.690
LGA    A   104_A      A   104_A     0.201     0    0.054   0.065     0.295  100.000  100.000
LGA    E   105_A      E   105_A     0.499     0    0.038   1.222     5.374  100.000   71.640
LGA    L   106_A      L   106_A     0.579     0    0.041   0.150     1.366   92.857   88.274
LGA    A   107_A      A   107_A     0.525     0    0.069   0.081     0.766   90.476   90.476
LGA    R   108_A      R   108_A     0.359     0    0.030   1.018     4.864   95.238   79.221
LGA    D   109_A      D   109_A     0.690     0    0.032   0.143     1.247   90.476   89.345
LGA    K   110_A      K   110_A     0.485     0    0.038   0.985     3.608   92.857   82.328
LGA    G   111_A      G   111_A     0.848     0    0.143   0.143     0.848   92.857   92.857
LGA    I   112_A      I   112_A     0.764     0    0.041   0.106     1.229   90.476   87.083
LGA    V   113_A      V   113_A     1.072     0    0.105   1.185     4.230   88.214   79.048
LGA    R   114_A      R   114_A     0.602     0    0.044   0.172     1.895   92.857   86.580
LGA    L   115_A      L   115_A     0.425     0    0.190   0.220     1.175   95.238   90.595
LGA    E   116_A      E   116_A     0.341     0    0.025   0.062     0.951   95.238   94.709
LGA    W   117_A      W   117_A     0.980     0    0.031   0.244     1.586   85.952   84.082
LGA    A   118_A      A   118_A     1.129     0    0.007   0.011     1.180   81.429   81.429
LGA    V   119_A      V   119_A     1.002     0    0.077   0.133     1.780   85.952   81.565
LGA    L   120_A      L   120_A     0.724     0    0.067   0.134     1.230   90.476   87.083
LGA    D   121_A      D   121_A     0.884     0    0.079   0.115     1.021   90.476   89.345
LGA    W   122_A      W   122_A     0.933     0    0.023   0.051     1.047   85.952   90.544
LGA    N   123_A      N   123_A     1.088     0    0.081   0.124     1.228   83.690   82.560
LGA    K   124_A      K   124_A     1.282     0    0.043   0.809     3.877   81.429   74.392
LGA    N   125_A      N   125_A     1.285     0    0.028   1.342     3.688   81.429   69.821
LGA    A   126_A      A   126_A     0.841     0    0.024   0.024     1.001   88.214   88.667
LGA    I   127_A      I   127_A     1.451     0    0.077   0.163     1.983   77.143   78.214
LGA    A   128_A      A   128_A     2.188     0    0.058   0.062     2.604   70.833   68.095
LGA    L   129_A      L   129_A     1.101     0    0.107   0.176     1.490   81.429   82.560
LGA    Y   130_A      Y   130_A     1.083     0    0.130   0.129     1.249   81.429   86.706
LGA    D   131_A      D   131_A     1.849     0    0.167   0.179     2.820   70.833   65.893
LGA    T   132_A      T   132_A     1.123     0    0.203   0.319     2.187   85.952   79.184
LGA    V   133_A      V   133_A     2.401     0    0.645   0.630     4.289   57.976   56.599
LGA    D   134_A      D   134_A     2.130     0    0.462   0.536     4.663   73.214   62.024
LGA    Y   135_A      Y   135_A     2.044     0    0.052   1.361     8.730   64.762   44.286
LGA    V   136_A      V   136_A     1.997     0    0.129   0.193     2.256   77.262   71.905
LGA    N   137_A      N   137_A     2.211     0    0.082   0.486     3.378   59.167   57.262
LGA    L   138_A      L   138_A     3.030     0    0.137   0.162     3.916   52.024   51.071
LGA    T   139_A      T   139_A     3.483     0    0.229   1.128     5.193   40.833   41.156
LGA    K   140_A      K   140_A     3.735     0    0.035   1.015     7.917   39.167   35.873
LGA    S   141_A      S   141_A     5.079     0    0.383   0.380     5.542   29.286   28.254
LGA    E   142_A      E   142_A     7.104     0    0.162   0.187    16.155   21.190    9.577
LGA    G   143_A      G   143_A     1.477     0    0.332   0.332     2.654   69.048   69.048
LGA    W   144_A      W   144_A     1.545     0    0.069   0.112     2.271   75.000   72.959
LGA    F   145_A      F   145_A     1.638     0    0.028   1.140     6.424   72.857   52.208
LGA    T   146_A      T   146_A     1.866     0    0.049   0.127     2.935   79.405   70.952
LGA    F   147_A      F   147_A     0.964     0    0.096   0.887     3.053   83.810   74.113
LGA    R   148_A      R   148_A     0.510     0    0.041   0.197     1.381   90.476   93.117
LGA    M   149_A      M   149_A     1.052     0    0.057   1.049     2.461   88.214   78.571
LGA    D   150_A      D   150_A     0.457     0    0.077   1.215     4.531   92.857   78.095
LGA    G   151_A      G   151_A     0.902     0    0.017   0.017     0.980   90.476   90.476
LGA    A   152_A      A   152_A     0.721     0    0.052   0.055     0.758   90.476   90.476
LGA    A   153_A      A   153_A     0.915     0    0.008   0.010     1.096   90.476   88.667
LGA    I   154_A      I   154_A     0.862     0    0.030   0.055     1.111   90.476   89.345
LGA    N   155_A      N   155_A     1.050     0    0.018   0.057     1.410   83.690   82.560
LGA    K   156_A      K   156_A     0.697     0    0.049   0.963     5.091   90.476   69.365
LGA    F   157_A      F   157_A     1.231     0    0.044   0.401     2.319   81.548   76.104
LGA    A   158_A      A   158_A     1.908     0    0.059   0.062     2.337   70.833   69.619
LGA    D   159_A      D   159_A     0.744     0    0.028   0.108     2.520   90.595   78.810
LGA    E   160_A      E   160_A     1.619     0    0.667   0.603     4.260   66.310   76.878

# RMSD_GDC results:       CA      MC common percent     ALL common percent   GDC_mc  GDC_all
NUMBER_OF_ATOMS_AA:      159     636    636  100.00    1307   1307  100.00               160
SUMMARY(RMSD_GDC):     1.443          1.450                  2.170           82.928   77.022

#CA            N1   N2   DIST      N    RMSD    GDT_TS    LGA_S3     LGA_Q 
SUMMARY(GDT)  159  160    4.0    158    1.34    88.750    94.131    11.004

LGA_LOCAL      RMSD:   1.336  Number of atoms:  158  under DIST:   4.00
LGA_ASGN_ATOMS RMSD:   1.446  Number of assigned atoms:  159 
Std_ASGN_ATOMS RMSD:   1.443  Standard rmsd on all 159 assigned CA atoms 

Unitary ROTATION matrix and the SHIFT vector superimpose molecules  (1=>2)
  X_new =  -0.861236 * X  +  -0.081068 * Y  +  -0.501697 * Z  +  -4.336260
  Y_new =   0.447129 * X  +   0.348346 * Y  +  -0.823851 * Z  + -16.789474
  Z_new =   0.241552 * X  +  -0.933854 * Y  +  -0.263761 * Z  +   0.182715 

Euler angles from the ROTATION matrix. Conventions XYZ and ZXZ:
           Phi     Theta       Psi   [DEG:       Phi     Theta       Psi ]
XYZ:  2.662726 -0.243965 -1.846069   [DEG:  152.5629  -13.9781 -105.7720 ]
ZXZ: -0.546986  1.837715  2.888479   [DEG:  -31.3400  105.2933  165.4977 ]
 
# END of job
