
#######################################################
#                                                     #
#                        LGA                          #
#                  ---------------                    #
#                                                     #
#               Local-Global Alignment                #
#        A Method for Finding 3-D Similarities        #
#               in Protein Structures                 #
#                                                     #
#                  ------------ 10/2009               #
#                                                     #
#      Adam Zemla (adamz@llnl.gov)                    #
#      Lawrence Livermore National Laboratory, CA     #
#                                                     #
#######################################################

!!!   License for LGA program has expired  !!!
#   For updated version of the LGA program   #
# please contact Adam Zemla:  adamz@llnl.gov #

# Molecule1: number of CA atoms  147 ( 1231),  selected  147 , name one
# Molecule2: number of CA atoms  177 ( 1470),  selected  147 , name two
# PARAMETERS: input.pdb  -ie  -3  -d:4  -sda  -swap  -ch1:A  -ch2:A  
# FIXED Atom-Atom correspondence
# GDT and LCS analysis 

LCS - RMSD CUTOFF   5.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:   147       5_A - 151_A       1.23     1.23
  LCS_AVERAGE:     83.05

LCS - RMSD CUTOFF   2.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:   147       5_A - 151_A       1.23     1.23
  LCS_AVERAGE:     83.05

LCS - RMSD CUTOFF   1.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:    99      53_A - 151_A       0.94     1.26
  LCS_AVERAGE:     45.87

LCS_GDT    MOLECULE-1    MOLECULE-2     LCS_DETAILS     GDT_DETAILS                                                    TOTAL NUMBER OF RESIDUE PAIRS:  147
LCS_GDT     RESIDUE       RESIDUE       SEGMENT_SIZE    GLOBAL DISTANCE TEST COLUMNS: number of residues under the threshold assigned to each residue pair
LCS_GDT   NAME NUMBER   NAME NUMBER    1.0  2.0  5.0    0.5  1.0  1.5  2.0  2.5  3.0  3.5  4.0  4.5  5.0  5.5  6.0  6.5  7.0  7.5  8.0  8.5  9.0  9.5 10.0
LCS_GDT     V     5_A     V     5_A      3  147  147      3    4    4    4    8   10   17   27   40  122  145  146  147  147  147  147  147  147  147  147 
LCS_GDT     Q     6_A     Q     6_A     46  147  147     48  129  135  138  142  144  146  146  146  146  146  146  147  147  147  147  147  147  147  147 
LCS_GDT     P     7_A     P     7_A     46  147  147     81  129  135  138  142  144  146  146  146  146  146  146  147  147  147  147  147  147  147  147 
LCS_GDT     E     8_A     E     8_A     46  147  147     49  129  135  138  142  144  146  146  146  146  146  146  147  147  147  147  147  147  147  147 
LCS_GDT     Y     9_A     Y     9_A     46  147  147     66  129  135  138  142  144  146  146  146  146  146  146  147  147  147  147  147  147  147  147 
LCS_GDT     R    10_A     R    10_A     46  147  147     89  129  135  138  142  144  146  146  146  146  146  146  147  147  147  147  147  147  147  147 
LCS_GDT     I    11_A     I    11_A     46  147  147     93  129  135  138  142  144  146  146  146  146  146  146  147  147  147  147  147  147  147  147 
LCS_GDT     Y    12_A     Y    12_A     46  147  147    100  129  135  138  142  144  146  146  146  146  146  146  147  147  147  147  147  147  147  147 
LCS_GDT     E    13_A     E    13_A     46  147  147    100  129  135  138  142  144  146  146  146  146  146  146  147  147  147  147  147  147  147  147 
LCS_GDT     M    14_A     M    14_A     46  147  147    100  129  135  138  142  144  146  146  146  146  146  146  147  147  147  147  147  147  147  147 
LCS_GDT     N    15_A     N    15_A     46  147  147    100  129  135  138  142  144  146  146  146  146  146  146  147  147  147  147  147  147  147  147 
LCS_GDT     K    16_A     K    16_A     46  147  147    100  129  135  138  142  144  146  146  146  146  146  146  147  147  147  147  147  147  147  147 
LCS_GDT     R    17_A     R    17_A     46  147  147    100  129  135  138  142  144  146  146  146  146  146  146  147  147  147  147  147  147  147  147 
LCS_GDT     L    18_A     L    18_A     46  147  147    100  129  135  138  142  144  146  146  146  146  146  146  147  147  147  147  147  147  147  147 
LCS_GDT     Q    19_A     Q    19_A     46  147  147    100  129  135  138  142  144  146  146  146  146  146  146  147  147  147  147  147  147  147  147 
LCS_GDT     S    20_A     S    20_A     46  147  147    100  129  135  138  142  144  146  146  146  146  146  146  147  147  147  147  147  147  147  147 
LCS_GDT     R    21_A     R    21_A     46  147  147     83  129  135  138  142  144  146  146  146  146  146  146  147  147  147  147  147  147  147  147 
LCS_GDT     T    22_A     T    22_A     46  147  147    100  129  135  138  142  144  146  146  146  146  146  146  147  147  147  147  147  147  147  147 
LCS_GDT     E    23_A     E    23_A     46  147  147    100  129  135  138  142  144  146  146  146  146  146  146  147  147  147  147  147  147  147  147 
LCS_GDT     D    24_A     D    24_A     46  147  147    100  129  135  138  142  144  146  146  146  146  146  146  147  147  147  147  147  147  147  147 
LCS_GDT     S    25_A     S    25_A     46  147  147    100  129  135  138  142  144  146  146  146  146  146  146  147  147  147  147  147  147  147  147 
LCS_GDT     D    26_A     D    26_A     46  147  147     37  129  135  138  142  144  146  146  146  146  146  146  147  147  147  147  147  147  147  147 
LCS_GDT     N    27_A     N    27_A     46  147  147    100  129  135  138  142  144  146  146  146  146  146  146  147  147  147  147  147  147  147  147 
LCS_GDT     L    28_A     L    28_A     46  147  147    100  129  135  138  142  144  146  146  146  146  146  146  147  147  147  147  147  147  147  147 
LCS_GDT     W    29_A     W    29_A     46  147  147    100  129  135  138  142  144  146  146  146  146  146  146  147  147  147  147  147  147  147  147 
LCS_GDT     W    30_A     W    30_A     46  147  147    100  129  135  138  142  144  146  146  146  146  146  146  147  147  147  147  147  147  147  147 
LCS_GDT     D    31_A     D    31_A     46  147  147    100  129  135  138  142  144  146  146  146  146  146  146  147  147  147  147  147  147  147  147 
LCS_GDT     A    32_A     A    32_A     46  147  147    100  129  135  138  142  144  146  146  146  146  146  146  147  147  147  147  147  147  147  147 
LCS_GDT     F    33_A     F    33_A     46  147  147    100  129  135  138  142  144  146  146  146  146  146  146  147  147  147  147  147  147  147  147 
LCS_GDT     A    34_A     A    34_A     46  147  147    100  129  135  138  142  144  146  146  146  146  146  146  147  147  147  147  147  147  147  147 
LCS_GDT     T    35_A     T    35_A     46  147  147    100  129  135  138  142  144  146  146  146  146  146  146  147  147  147  147  147  147  147  147 
LCS_GDT     E    36_A     E    36_A     46  147  147    100  129  135  138  142  144  146  146  146  146  146  146  147  147  147  147  147  147  147  147 
LCS_GDT     F    37_A     F    37_A     46  147  147    100  129  135  138  142  144  146  146  146  146  146  146  147  147  147  147  147  147  147  147 
LCS_GDT     F    38_A     F    38_A     46  147  147    100  129  135  138  142  144  146  146  146  146  146  146  147  147  147  147  147  147  147  147 
LCS_GDT     E    39_A     E    39_A     46  147  147    100  129  135  138  142  144  146  146  146  146  146  146  147  147  147  147  147  147  147  147 
LCS_GDT     D    40_A     D    40_A     46  147  147    100  129  135  138  142  144  146  146  146  146  146  146  147  147  147  147  147  147  147  147 
LCS_GDT     D    41_A     D    41_A     46  147  147    100  129  135  138  142  144  146  146  146  146  146  146  147  147  147  147  147  147  147  147 
LCS_GDT     A    42_A     A    42_A     46  147  147    100  129  135  138  142  144  146  146  146  146  146  146  147  147  147  147  147  147  147  147 
LCS_GDT     T    43_A     T    43_A     46  147  147     57  129  135  138  142  144  146  146  146  146  146  146  147  147  147  147  147  147  147  147 
LCS_GDT     L    44_A     L    44_A     46  147  147    100  129  135  138  142  144  146  146  146  146  146  146  147  147  147  147  147  147  147  147 
LCS_GDT     T    45_A     T    45_A     46  147  147    100  129  135  138  142  144  146  146  146  146  146  146  147  147  147  147  147  147  147  147 
LCS_GDT     L    46_A     L    46_A     46  147  147    100  129  135  138  142  144  146  146  146  146  146  146  147  147  147  147  147  147  147  147 
LCS_GDT     S    47_A     S    47_A     46  147  147     92  129  135  138  142  144  146  146  146  146  146  146  147  147  147  147  147  147  147  147 
LCS_GDT     F    48_A     F    48_A     46  147  147      7   67  134  138  142  144  146  146  146  146  146  146  147  147  147  147  147  147  147  147 
LCS_GDT     C    49_A     C    49_A     46  147  147      5   47  104  138  142  144  146  146  146  146  146  146  147  147  147  147  147  147  147  147 
LCS_GDT     L    50_A     L    50_A     46  147  147     17   57  122  138  142  144  146  146  146  146  146  146  147  147  147  147  147  147  147  147 
LCS_GDT     E    51_A     E    51_A     46  147  147      5   19   74  129  142  144  146  146  146  146  146  146  147  147  147  147  147  147  147  147 
LCS_GDT     D    52_A     D    52_A     16  147  147      4    4   26   71  133  144  146  146  146  146  146  146  147  147  147  147  147  147  147  147 
LCS_GDT     G    53_A     G    53_A     99  147  147      4   11   74  129  142  144  146  146  146  146  146  146  147  147  147  147  147  147  147  147 
LCS_GDT     P    54_A     P    54_A     99  147  147      3   18   96  138  142  144  146  146  146  146  146  146  147  147  147  147  147  147  147  147 
LCS_GDT     K    55_A     K    55_A     99  147  147     38  128  135  138  142  144  146  146  146  146  146  146  147  147  147  147  147  147  147  147 
LCS_GDT     R    56_A     R    56_A     99  147  147     68  129  135  138  142  144  146  146  146  146  146  146  147  147  147  147  147  147  147  147 
LCS_GDT     Y    57_A     Y    57_A     99  147  147    100  129  135  138  142  144  146  146  146  146  146  146  147  147  147  147  147  147  147  147 
LCS_GDT     T    58_A     T    58_A     99  147  147    100  129  135  138  142  144  146  146  146  146  146  146  147  147  147  147  147  147  147  147 
LCS_GDT     I    59_A     I    59_A     99  147  147     21  129  135  138  142  144  146  146  146  146  146  146  147  147  147  147  147  147  147  147 
LCS_GDT     G    60_A     G    60_A     99  147  147     92  129  135  138  142  144  146  146  146  146  146  146  147  147  147  147  147  147  147  147 
LCS_GDT     R    61_A     R    61_A     99  147  147    100  129  135  138  142  144  146  146  146  146  146  146  147  147  147  147  147  147  147  147 
LCS_GDT     T    62_A     T    62_A     99  147  147    100  129  135  138  142  144  146  146  146  146  146  146  147  147  147  147  147  147  147  147 
LCS_GDT     L    63_A     L    63_A     99  147  147    100  129  135  138  142  144  146  146  146  146  146  146  147  147  147  147  147  147  147  147 
LCS_GDT     I    64_A     I    64_A     99  147  147    100  129  135  138  142  144  146  146  146  146  146  146  147  147  147  147  147  147  147  147 
LCS_GDT     P    65_A     P    65_A     99  147  147    100  129  135  138  142  144  146  146  146  146  146  146  147  147  147  147  147  147  147  147 
LCS_GDT     R    66_A     R    66_A     99  147  147    100  129  135  138  142  144  146  146  146  146  146  146  147  147  147  147  147  147  147  147 
LCS_GDT     Y    67_A     Y    67_A     99  147  147    100  129  135  138  142  144  146  146  146  146  146  146  147  147  147  147  147  147  147  147 
LCS_GDT     F    68_A     F    68_A     99  147  147    100  129  135  138  142  144  146  146  146  146  146  146  147  147  147  147  147  147  147  147 
LCS_GDT     S    69_A     S    69_A     99  147  147    100  129  135  138  142  144  146  146  146  146  146  146  147  147  147  147  147  147  147  147 
LCS_GDT     T    70_A     T    70_A     99  147  147    100  129  135  138  142  144  146  146  146  146  146  146  147  147  147  147  147  147  147  147 
LCS_GDT     V    71_A     V    71_A     99  147  147    100  129  135  138  142  144  146  146  146  146  146  146  147  147  147  147  147  147  147  147 
LCS_GDT     F    72_A     F    72_A     99  147  147     80  129  135  138  142  144  146  146  146  146  146  146  147  147  147  147  147  147  147  147 
LCS_GDT     E    73_A     E    73_A     99  147  147     80  129  135  138  142  144  146  146  146  146  146  146  147  147  147  147  147  147  147  147 
LCS_GDT     G    74_A     G    74_A     99  147  147      3   18   31  132  138  143  146  146  146  146  146  146  147  147  147  147  147  147  147  147 
LCS_GDT     G    75_A     G    75_A     99  147  147      4   18   60  134  139  143  146  146  146  146  146  146  147  147  147  147  147  147  147  147 
LCS_GDT     V    76_A     V    76_A     99  147  147      8  108  135  138  142  144  146  146  146  146  146  146  147  147  147  147  147  147  147  147 
LCS_GDT     T    77_A     T    77_A     99  147  147     57  129  135  138  142  144  146  146  146  146  146  146  147  147  147  147  147  147  147  147 
LCS_GDT     D    78_A     D    78_A     99  147  147    100  129  135  138  142  144  146  146  146  146  146  146  147  147  147  147  147  147  147  147 
LCS_GDT     L    79_A     L    79_A     99  147  147    100  129  135  138  142  144  146  146  146  146  146  146  147  147  147  147  147  147  147  147 
LCS_GDT     Y    80_A     Y    80_A     99  147  147    100  129  135  138  142  144  146  146  146  146  146  146  147  147  147  147  147  147  147  147 
LCS_GDT     Y    81_A     Y    81_A     99  147  147    100  129  135  138  142  144  146  146  146  146  146  146  147  147  147  147  147  147  147  147 
LCS_GDT     I    82_A     I    82_A     99  147  147    100  129  135  138  142  144  146  146  146  146  146  146  147  147  147  147  147  147  147  147 
LCS_GDT     L    83_A     L    83_A     99  147  147    100  129  135  138  142  144  146  146  146  146  146  146  147  147  147  147  147  147  147  147 
LCS_GDT     K    84_A     K    84_A     99  147  147    100  129  135  138  142  144  146  146  146  146  146  146  147  147  147  147  147  147  147  147 
LCS_GDT     H    85_A     H    85_A     99  147  147    100  129  135  138  142  144  146  146  146  146  146  146  147  147  147  147  147  147  147  147 
LCS_GDT     S    86_A     S    86_A     99  147  147    100  129  135  138  142  144  146  146  146  146  146  146  147  147  147  147  147  147  147  147 
LCS_GDT     K    87_A     K    87_A     99  147  147    100  129  135  138  142  144  146  146  146  146  146  146  147  147  147  147  147  147  147  147 
LCS_GDT     E    88_A     E    88_A     99  147  147    100  129  135  138  142  144  146  146  146  146  146  146  147  147  147  147  147  147  147  147 
LCS_GDT     S    89_A     S    89_A     99  147  147     92  129  135  138  142  144  146  146  146  146  146  146  147  147  147  147  147  147  147  147 
LCS_GDT     Y    90_A     Y    90_A     99  147  147    100  129  135  138  142  144  146  146  146  146  146  146  147  147  147  147  147  147  147  147 
LCS_GDT     H    91_A     H    91_A     99  147  147    100  129  135  138  142  144  146  146  146  146  146  146  147  147  147  147  147  147  147  147 
LCS_GDT     N    92_A     N    92_A     99  147  147     37  129  135  138  142  144  146  146  146  146  146  146  147  147  147  147  147  147  147  147 
LCS_GDT     S    93_A     S    93_A     99  147  147     12  105  135  138  142  144  146  146  146  146  146  146  147  147  147  147  147  147  147  147 
LCS_GDT     S    94_A     S    94_A     99  147  147     54  129  135  138  142  144  146  146  146  146  146  146  147  147  147  147  147  147  147  147 
LCS_GDT     I    95_A     I    95_A     99  147  147    100  129  135  138  142  144  146  146  146  146  146  146  147  147  147  147  147  147  147  147 
LCS_GDT     T    96_A     T    96_A     99  147  147    100  129  135  138  142  144  146  146  146  146  146  146  147  147  147  147  147  147  147  147 
LCS_GDT     V    97_A     V    97_A     99  147  147    100  129  135  138  142  144  146  146  146  146  146  146  147  147  147  147  147  147  147  147 
LCS_GDT     D    98_A     D    98_A     99  147  147    100  129  135  138  142  144  146  146  146  146  146  146  147  147  147  147  147  147  147  147 
LCS_GDT     C    99_A     C    99_A     99  147  147    100  129  135  138  142  144  146  146  146  146  146  146  147  147  147  147  147  147  147  147 
LCS_GDT     D   100_A     D   100_A     99  147  147    100  129  135  138  142  144  146  146  146  146  146  146  147  147  147  147  147  147  147  147 
LCS_GDT     Q   101_A     Q   101_A     99  147  147    100  129  135  138  142  144  146  146  146  146  146  146  147  147  147  147  147  147  147  147 
LCS_GDT     C   102_A     C   102_A     99  147  147    100  129  135  138  142  144  146  146  146  146  146  146  147  147  147  147  147  147  147  147 
LCS_GDT     A   103_A     A   103_A     99  147  147    100  129  135  138  142  144  146  146  146  146  146  146  147  147  147  147  147  147  147  147 
LCS_GDT     M   104_A     M   104_A     99  147  147    100  129  135  138  142  144  146  146  146  146  146  146  147  147  147  147  147  147  147  147 
LCS_GDT     V   105_A     V   105_A     99  147  147    100  129  135  138  142  144  146  146  146  146  146  146  147  147  147  147  147  147  147  147 
LCS_GDT     T   106_A     T   106_A     99  147  147    100  129  135  138  142  144  146  146  146  146  146  146  147  147  147  147  147  147  147  147 
LCS_GDT     Q   107_A     Q   107_A     99  147  147    100  129  135  138  142  144  146  146  146  146  146  146  147  147  147  147  147  147  147  147 
LCS_GDT     H   108_A     H   108_A     99  147  147    100  129  135  138  142  144  146  146  146  146  146  146  147  147  147  147  147  147  147  147 
LCS_GDT     G   109_A     G   109_A     99  147  147     25  117  135  138  142  144  146  146  146  146  146  146  147  147  147  147  147  147  147  147 
LCS_GDT     K   110_A     K   110_A     99  147  147      3   59  115  138  142  144  146  146  146  146  146  146  147  147  147  147  147  147  147  147 
LCS_GDT     P   111_A     P   111_A     99  147  147     22  116  135  138  142  144  146  146  146  146  146  146  147  147  147  147  147  147  147  147 
LCS_GDT     M   112_A     M   112_A     99  147  147      4  111  135  138  142  144  146  146  146  146  146  146  147  147  147  147  147  147  147  147 
LCS_GDT     F   113_A     F   113_A     99  147  147     90  129  135  138  142  144  146  146  146  146  146  146  147  147  147  147  147  147  147  147 
LCS_GDT     T   114_A     T   114_A     99  147  147     90  129  135  138  142  144  146  146  146  146  146  146  147  147  147  147  147  147  147  147 
LCS_GDT     K   115_A     K   115_A     99  147  147    100  129  135  138  142  144  146  146  146  146  146  146  147  147  147  147  147  147  147  147 
LCS_GDT     V   116_A     V   116_A     99  147  147    100  129  135  138  142  144  146  146  146  146  146  146  147  147  147  147  147  147  147  147 
LCS_GDT     C   117_A     C   117_A     99  147  147    100  129  135  138  142  144  146  146  146  146  146  146  147  147  147  147  147  147  147  147 
LCS_GDT     T   118_A     T   118_A     99  147  147    100  129  135  138  142  144  146  146  146  146  146  146  147  147  147  147  147  147  147  147 
LCS_GDT     E   119_A     E   119_A     99  147  147     83  129  135  138  142  144  146  146  146  146  146  146  147  147  147  147  147  147  147  147 
LCS_GDT     G   120_A     G   120_A     99  147  147    100  129  135  138  142  144  146  146  146  146  146  146  147  147  147  147  147  147  147  147 
LCS_GDT     R   121_A     R   121_A     99  147  147    100  129  135  138  142  144  146  146  146  146  146  146  147  147  147  147  147  147  147  147 
LCS_GDT     L   122_A     L   122_A     99  147  147    100  129  135  138  142  144  146  146  146  146  146  146  147  147  147  147  147  147  147  147 
LCS_GDT     I   123_A     I   123_A     99  147  147    100  129  135  138  142  144  146  146  146  146  146  146  147  147  147  147  147  147  147  147 
LCS_GDT     L   124_A     L   124_A     99  147  147    100  129  135  138  142  144  146  146  146  146  146  146  147  147  147  147  147  147  147  147 
LCS_GDT     E   125_A     E   125_A     99  147  147    100  129  135  138  142  144  146  146  146  146  146  146  147  147  147  147  147  147  147  147 
LCS_GDT     F   126_A     F   126_A     99  147  147    100  129  135  138  142  144  146  146  146  146  146  146  147  147  147  147  147  147  147  147 
LCS_GDT     T   127_A     T   127_A     99  147  147     80  129  135  138  142  144  146  146  146  146  146  146  147  147  147  147  147  147  147  147 
LCS_GDT     F   128_A     F   128_A     99  147  147     95  129  135  138  142  144  146  146  146  146  146  146  147  147  147  147  147  147  147  147 
LCS_GDT     D   129_A     D   129_A     99  147  147      3  129  135  138  142  144  146  146  146  146  146  146  147  147  147  147  147  147  147  147 
LCS_GDT     D   130_A     D   130_A     99  147  147    100  129  135  138  142  144  146  146  146  146  146  146  147  147  147  147  147  147  147  147 
LCS_GDT     L   131_A     L   131_A     99  147  147    100  129  135  138  142  144  146  146  146  146  146  146  147  147  147  147  147  147  147  147 
LCS_GDT     M   132_A     M   132_A     99  147  147    100  129  135  138  142  144  146  146  146  146  146  146  147  147  147  147  147  147  147  147 
LCS_GDT     R   133_A     R   133_A     99  147  147    100  129  135  138  142  144  146  146  146  146  146  146  147  147  147  147  147  147  147  147 
LCS_GDT     I   134_A     I   134_A     99  147  147    100  129  135  138  142  144  146  146  146  146  146  146  147  147  147  147  147  147  147  147 
LCS_GDT     K   135_A     K   135_A     99  147  147    100  129  135  138  142  144  146  146  146  146  146  146  147  147  147  147  147  147  147  147 
LCS_GDT     T   136_A     T   136_A     99  147  147    100  129  135  138  142  144  146  146  146  146  146  146  147  147  147  147  147  147  147  147 
LCS_GDT     W   137_A     W   137_A     99  147  147    100  129  135  138  142  144  146  146  146  146  146  146  147  147  147  147  147  147  147  147 
LCS_GDT     H   138_A     H   138_A     99  147  147    100  129  135  138  142  144  146  146  146  146  146  146  147  147  147  147  147  147  147  147 
LCS_GDT     F   139_A     F   139_A     99  147  147    100  129  135  138  142  144  146  146  146  146  146  146  147  147  147  147  147  147  147  147 
LCS_GDT     T   140_A     T   140_A     99  147  147    100  129  135  138  142  144  146  146  146  146  146  146  147  147  147  147  147  147  147  147 
LCS_GDT     I   141_A     I   141_A     99  147  147    100  129  135  138  142  144  146  146  146  146  146  146  147  147  147  147  147  147  147  147 
LCS_GDT     R   142_A     R   142_A     99  147  147    100  129  135  138  142  144  146  146  146  146  146  146  147  147  147  147  147  147  147  147 
LCS_GDT     Q   143_A     Q   143_A     99  147  147     89  129  135  138  142  144  146  146  146  146  146  146  147  147  147  147  147  147  147  147 
LCS_GDT     Y   144_A     Y   144_A     99  147  147     93  129  135  138  142  144  146  146  146  146  146  146  147  147  147  147  147  147  147  147 
LCS_GDT     R   145_A     R   145_A     99  147  147    100  129  135  138  142  144  146  146  146  146  146  146  147  147  147  147  147  147  147  147 
LCS_GDT     E   146_A     E   146_A     99  147  147    100  129  135  138  142  144  146  146  146  146  146  146  147  147  147  147  147  147  147  147 
LCS_GDT     L   147_A     L   147_A     99  147  147    100  129  135  138  142  144  146  146  146  146  146  146  147  147  147  147  147  147  147  147 
LCS_GDT     V   148_A     V   148_A     99  147  147    100  129  135  138  142  144  146  146  146  146  146  146  147  147  147  147  147  147  147  147 
LCS_GDT     P   149_A     P   149_A     99  147  147    100  129  135  138  142  144  146  146  146  146  146  146  147  147  147  147  147  147  147  147 
LCS_GDT     R   150_A     R   150_A     99  147  147     77  129  135  138  142  144  146  146  146  146  146  146  147  147  147  147  147  147  147  147 
LCS_GDT     S   151_A     S   151_A     99  147  147      0    3   39  137  142  144  146  146  146  146  146  146  147  147  147  147  147  147  147  147 
LCS_AVERAGE  LCS_A:  70.66  (  45.87   83.05   83.05 )

GLOBAL_DISTANCE_TEST (summary information about detected largest sets of residues (represented by selected AToms) that can fit under specified thresholds)
GDT DIST_CUTOFF  0.50   1.00   1.50   2.00   2.50   3.00   3.50   4.00   4.50   5.00   5.50   6.00   6.50   7.00   7.50   8.00   8.50   9.00   9.50  10.00
GDT NUMBER_AT    100    129    135    138    142    144    146    146    146    146    146    146    147    147    147    147    147    147    147    147 
GDT PERCENT_AT  56.50  72.88  76.27  77.97  80.23  81.36  82.49  82.49  82.49  82.49  82.49  82.49  83.05  83.05  83.05  83.05  83.05  83.05  83.05  83.05
GDT RMS_LOCAL    0.31   0.46   0.56   0.66   0.84   0.98   1.04   1.04   1.04   1.04   1.04   1.04   1.23   1.23   1.23   1.23   1.23   1.23   1.23   1.23
GDT RMS_ALL_AT   1.31   1.29   1.27   1.25   1.24   1.24   1.24   1.24   1.24   1.24   1.24   1.24   1.23   1.23   1.23   1.23   1.23   1.23   1.23   1.23

# Checking swapping
#   possible swapping detected:  D    24_A      D    24_A
#   possible swapping detected:  F    33_A      F    33_A
#   possible swapping detected:  F    48_A      F    48_A
#   possible swapping detected:  E    51_A      E    51_A
#   possible swapping detected:  E    73_A      E    73_A
#   possible swapping detected:  Y    81_A      Y    81_A
#   possible swapping detected:  E    88_A      E    88_A
#   possible swapping detected:  D    98_A      D    98_A
#   possible swapping detected:  E   119_A      E   119_A
#   possible swapping detected:  D   129_A      D   129_A
#   possible swapping detected:  D   130_A      D   130_A
#   possible swapping detected:  Y   144_A      Y   144_A
#   possible swapping detected:  E   146_A      E   146_A

#      Molecule1      Molecule2  DISTANCE    Mis    MC     All    Dist_max   GDC_mc  GDC_all
LGA    V     5_A      V     5_A     8.154     0    0.056   0.977    12.402   11.190    6.463
LGA    Q     6_A      Q     6_A     1.133     0    0.606   1.110     6.436   76.429   56.720
LGA    P     7_A      P     7_A     0.728     0    0.034   0.254     0.877   90.476   93.197
LGA    E     8_A      E     8_A     1.111     0    0.064   0.492     3.673   83.690   64.550
LGA    Y     9_A      Y     9_A     0.975     0    0.065   0.269     1.277   88.214   85.952
LGA    R    10_A      R    10_A     0.645     0    0.018   0.234     1.169   90.476   89.654
LGA    I    11_A      I    11_A     0.635     0    0.017   0.138     0.657   90.476   91.667
LGA    Y    12_A      Y    12_A     0.528     0    0.068   0.169     1.456   90.476   86.706
LGA    E    13_A      E    13_A     0.461     0    0.042   0.210     1.242  100.000   93.757
LGA    M    14_A      M    14_A     0.291     0    0.035   0.591     2.275  100.000   94.405
LGA    N    15_A      N    15_A     0.372     0    0.038   0.108     0.497  100.000  100.000
LGA    K    16_A      K    16_A     0.366     0    0.025   0.236     1.225  100.000   94.762
LGA    R    17_A      R    17_A     0.256     0    0.043   1.209     3.704  100.000   83.333
LGA    L    18_A      L    18_A     0.303     0    0.065   0.072     0.612   97.619   98.810
LGA    Q    19_A      Q    19_A     0.280     0    0.007   0.115     0.399  100.000  100.000
LGA    S    20_A      S    20_A     0.251     0    0.068   0.675     1.379   95.238   92.143
LGA    R    21_A      R    21_A     0.900     0    0.097   0.227     1.228   90.476   85.541
LGA    T    22_A      T    22_A     0.771     0    0.045   0.065     1.081   92.857   90.544
LGA    E    23_A      E    23_A     0.664     0    0.099   0.779     4.950   90.476   69.683
LGA    D    24_A      D    24_A     0.733     0    0.218   0.178     1.927   88.214   83.750
LGA    S    25_A      S    25_A     0.622     0    0.024   0.631     1.968   92.857   89.127
LGA    D    26_A      D    26_A     0.838     0    0.124   0.946     2.914   92.857   83.036
LGA    N    27_A      N    27_A     0.479     0    0.043   0.774     2.091   97.619   92.024
LGA    L    28_A      L    28_A     0.308     0    0.025   0.786     1.866  100.000   92.024
LGA    W    29_A      W    29_A     0.117     0    0.023   0.114     0.621  100.000   97.959
LGA    W    30_A      W    30_A     0.048     0    0.013   0.065     0.263  100.000  100.000
LGA    D    31_A      D    31_A     0.390     0    0.042   0.580     1.706   97.619   90.714
LGA    A    32_A      A    32_A     0.611     0    0.071   0.077     0.696   95.238   94.286
LGA    F    33_A      F    33_A     0.532     0    0.021   0.118     0.620   92.857   93.939
LGA    A    34_A      A    34_A     0.511     0    0.018   0.018     0.570   95.238   94.286
LGA    T    35_A      T    35_A     0.393     0    0.022   0.100     0.431  100.000  100.000
LGA    E    36_A      E    36_A     0.365     0    0.024   0.140     0.496  100.000  100.000
LGA    F    37_A      F    37_A     0.289     0    0.013   0.093     0.459  100.000  100.000
LGA    F    38_A      F    38_A     0.372     0    0.083   0.154     0.634   97.619   97.403
LGA    E    39_A      E    39_A     0.511     0    0.043   0.528     2.213   90.476   87.672
LGA    D    40_A      D    40_A     0.441     0    0.017   0.583     2.007  100.000   92.024
LGA    D    41_A      D    41_A     0.540     0    0.027   0.145     1.327   92.857   88.274
LGA    A    42_A      A    42_A     0.501     0    0.086   0.099     0.633   97.619   96.190
LGA    T    43_A      T    43_A     0.814     0    0.131   1.099     2.262   90.476   82.993
LGA    L    44_A      L    44_A     0.576     0    0.026   0.059     0.722   90.476   91.667
LGA    T    45_A      T    45_A     0.480     0    0.039   0.075     0.544  100.000   98.639
LGA    L    46_A      L    46_A     0.483     0    0.038   0.131     0.646  100.000   97.619
LGA    S    47_A      S    47_A     0.341     0    0.038   0.543     2.099   95.238   90.952
LGA    F    48_A      F    48_A     1.584     0    0.080   0.163     2.378   75.000   72.208
LGA    C    49_A      C    49_A     2.744     0    0.041   0.137     3.775   57.262   53.730
LGA    L    50_A      L    50_A     2.472     0    0.097   0.180     2.861   60.952   69.107
LGA    E    51_A      E    51_A     3.743     0    0.018   1.227     9.082   43.452   25.132
LGA    D    52_A      D    52_A     4.771     0    0.051   1.202     8.111   31.548   21.190
LGA    G    53_A      G    53_A     3.606     0    0.296   0.296     3.698   48.452   48.452
LGA    P    54_A      P    54_A     3.011     0    0.039   0.231     3.705   57.381   53.265
LGA    K    55_A      K    55_A     0.897     0    0.097   1.132     4.484   86.071   74.021
LGA    R    56_A      R    56_A     0.575     0    0.046   1.642     6.995   90.595   64.545
LGA    Y    57_A      Y    57_A     0.799     0    0.090   0.085     2.195   92.857   80.317
LGA    T    58_A      T    58_A     0.600     0    0.025   0.151     1.012   88.214   89.184
LGA    I    59_A      I    59_A     1.022     0    0.060   1.260     2.737   88.214   76.667
LGA    G    60_A      G    60_A     0.867     0    0.022   0.022     0.936   90.476   90.476
LGA    R    61_A      R    61_A     0.474     0    0.047   0.098     0.938   97.619   93.074
LGA    T    62_A      T    62_A     0.296     0    0.115   1.108     2.923   97.619   87.279
LGA    L    63_A      L    63_A     0.434     0    0.035   0.194     0.763  100.000   95.238
LGA    I    64_A      I    64_A     0.234     0    0.026   0.076     0.439  100.000  100.000
LGA    P    65_A      P    65_A     0.207     0    0.016   0.072     0.341  100.000  100.000
LGA    R    66_A      R    66_A     0.211     0    0.022   1.654     7.201  100.000   74.978
LGA    Y    67_A      Y    67_A     0.354     0    0.023   0.089     0.701  100.000   95.238
LGA    F    68_A      F    68_A     0.172     0    0.021   0.123     0.394  100.000  100.000
LGA    S    69_A      S    69_A     0.354     0    0.040   0.486     1.663  100.000   95.476
LGA    T    70_A      T    70_A     0.434     0    0.038   0.172     0.701   97.619   95.918
LGA    V    71_A      V    71_A     0.346     0    0.087   0.168     0.817   95.238   95.918
LGA    F    72_A      F    72_A     0.572     0    0.188   0.399     1.120   90.595   91.429
LGA    E    73_A      E    73_A     0.800     0    0.142   0.790     5.695   77.738   55.397
LGA    G    74_A      G    74_A     3.192     0    0.290   0.290     3.371   53.690   53.690
LGA    G    75_A      G    75_A     2.989     0    0.059   0.059     3.115   59.167   59.167
LGA    V    76_A      V    76_A     1.503     0    0.043   0.065     1.999   75.000   75.306
LGA    T    77_A      T    77_A     1.035     0    0.112   0.134     1.432   83.690   82.721
LGA    D    78_A      D    78_A     0.378     0    0.045   0.203     0.707  100.000   97.619
LGA    L    79_A      L    79_A     0.358     0    0.028   0.105     0.410  100.000  100.000
LGA    Y    80_A      Y    80_A     0.259     0    0.058   0.148     0.496  100.000  100.000
LGA    Y    81_A      Y    81_A     0.411     0    0.019   0.085     0.522  100.000   99.206
LGA    I    82_A      I    82_A     0.352     0    0.035   0.573     2.133  100.000   94.405
LGA    L    83_A      L    83_A     0.299     0    0.021   0.149     0.621  100.000   98.810
LGA    K    84_A      K    84_A     0.308     0    0.086   1.033     4.903   97.619   81.640
LGA    H    85_A      H    85_A     0.498     0    0.104   1.165     3.351   95.238   85.048
LGA    S    86_A      S    86_A     0.266     0    0.077   0.166     0.907   97.619   96.825
LGA    K    87_A      K    87_A     0.336     0    0.066   1.059     5.144   97.619   77.090
LGA    E    88_A      E    88_A     0.585     0    0.053   0.876     2.605   92.857   79.259
LGA    S    89_A      S    89_A     0.959     0    0.075   0.562     2.526   90.476   83.413
LGA    Y    90_A      Y    90_A     0.760     0    0.024   0.131     2.017   90.476   81.667
LGA    H    91_A      H    91_A     0.441     0    0.030   0.397     1.196   92.857   91.524
LGA    N    92_A      N    92_A     0.788     0    0.094   1.081     4.249   83.810   73.095
LGA    S    93_A      S    93_A     1.526     0    0.160   0.582     2.125   81.548   78.730
LGA    S    94_A      S    94_A     0.674     0    0.018   0.090     1.044   90.476   88.968
LGA    I    95_A      I    95_A     0.728     0    0.017   0.241     0.995   92.857   91.667
LGA    T    96_A      T    96_A     0.614     0    0.036   0.208     1.297   90.476   89.184
LGA    V    97_A      V    97_A     0.356     0    0.024   0.099     0.566   97.619   97.279
LGA    D    98_A      D    98_A     0.262     0    0.095   0.299     0.720   97.619   96.429
LGA    C    99_A      C    99_A     0.485     0    0.040   0.072     0.535  100.000   96.825
LGA    D   100_A      D   100_A     0.599     0    0.071   0.613     2.071   90.476   83.929
LGA    Q   101_A      Q   101_A     0.665     0    0.050   0.127     1.033   90.476   89.471
LGA    C   102_A      C   102_A     0.568     0    0.057   0.173     0.900   90.476   92.063
LGA    A   103_A      A   103_A     0.554     0    0.024   0.029     0.646   90.476   92.381
LGA    M   104_A      M   104_A     0.593     0    0.026   0.293     0.981   92.857   91.667
LGA    V   105_A      V   105_A     0.571     0    0.027   0.050     0.739   95.238   93.197
LGA    T   106_A      T   106_A     0.473     0    0.041   0.057     0.512  100.000   98.639
LGA    Q   107_A      Q   107_A     0.265     0    0.083   1.447     5.241   97.619   78.148
LGA    H   108_A      H   108_A     0.644     0    0.073   0.406     1.059   90.595   89.619
LGA    G   109_A      G   109_A     1.685     0    0.225   0.225     1.685   86.190   86.190
LGA    K   110_A      K   110_A     2.343     0    0.649   1.156     6.967   58.690   42.222
LGA    P   111_A      P   111_A     1.423     0    0.142   0.386     4.047   81.786   67.483
LGA    M   112_A      M   112_A     1.407     0    0.068   0.338     2.662   83.690   74.286
LGA    F   113_A      F   113_A     0.330     0    0.039   1.346     6.529   97.619   65.628
LGA    T   114_A      T   114_A     0.283     0    0.090   1.160     2.304  100.000   88.571
LGA    K   115_A      K   115_A     0.630     0    0.042   0.115     0.630   90.476   90.476
LGA    V   116_A      V   116_A     0.548     0    0.057   0.147     0.917   95.238   93.197
LGA    C   117_A      C   117_A     0.335     0    0.047   0.774     2.823   97.619   91.270
LGA    T   118_A      T   118_A     0.414     0    0.035   0.093     0.684   97.619   94.558
LGA    E   119_A      E   119_A     0.653     0    0.025   0.566     2.130   95.238   83.915
LGA    G   120_A      G   120_A     0.346     0    0.066   0.066     0.531   97.619   97.619
LGA    R   121_A      R   121_A     0.179     0    0.029   0.299     1.704  100.000   91.645
LGA    L   122_A      L   122_A     0.234     0    0.028   0.104     0.553  100.000   98.810
LGA    I   123_A      I   123_A     0.179     0    0.047   0.745     2.435  100.000   95.595
LGA    L   124_A      L   124_A     0.439     0    0.062   0.105     0.458  100.000  100.000
LGA    E   125_A      E   125_A     0.413     0    0.069   0.781     2.913  100.000   91.058
LGA    F   126_A      F   126_A     0.397     0    0.015   0.050     0.769   95.238   98.268
LGA    T   127_A      T   127_A     0.944     0    0.050   0.064     1.641   92.857   86.735
LGA    F   128_A      F   128_A     0.361     0    0.012   0.493     2.218   97.619   86.710
LGA    D   129_A      D   129_A     0.971     0    0.137   1.010     2.621   92.857   81.964
LGA    D   130_A      D   130_A     0.654     0    0.025   0.971     4.829   90.476   72.143
LGA    L   131_A      L   131_A     0.601     0    0.065   0.242     0.710   92.857   91.667
LGA    M   132_A      M   132_A     0.479     0    0.031   0.262     1.112   97.619   92.917
LGA    R   133_A      R   133_A     0.360     0    0.024   0.902     2.015  100.000   90.909
LGA    I   134_A      I   134_A     0.366     0    0.025   0.152     0.575  100.000   98.810
LGA    K   135_A      K   135_A     0.361     0    0.042   0.568     2.997  100.000   87.196
LGA    T   136_A      T   136_A     0.543     0    0.039   1.033     2.229   97.619   88.367
LGA    W   137_A      W   137_A     0.384     0    0.017   0.132     0.602   97.619   97.959
LGA    H   138_A      H   138_A     0.268     0    0.009   0.508     1.204  100.000   94.381
LGA    F   139_A      F   139_A     0.241     0    0.025   0.149     0.481  100.000  100.000
LGA    T   140_A      T   140_A     0.387     0    0.061   0.080     0.544   97.619   97.279
LGA    I   141_A      I   141_A     0.380     0    0.020   0.248     0.821   95.238   96.429
LGA    R   142_A      R   142_A     0.474     0    0.168   1.313     4.071   92.976   84.156
LGA    Q   143_A      Q   143_A     0.857     0    0.017   0.916     4.480   90.476   73.386
LGA    Y   144_A      Y   144_A     0.982     0    0.055   0.073     1.189   85.952   85.198
LGA    R   145_A      R   145_A     0.910     0    0.071   1.196     5.789   90.476   66.061
LGA    E   146_A      E   146_A     0.813     0    0.081   0.164     1.221   88.214   88.466
LGA    L   147_A      L   147_A     0.531     0    0.064   0.521     1.424   92.857   91.786
LGA    V   148_A      V   148_A     0.712     0    0.048   1.014     3.054   90.476   81.020
LGA    P   149_A      P   149_A     0.852     0    0.134   0.370     1.815   86.071   85.374
LGA    R   150_A      R   150_A     0.432     0    0.681   1.002     2.741   86.905   80.476
LGA    S   151_A      S   151_A     2.428     0    0.251   0.643     6.722   44.286   40.317

# RMSD_GDC results:       CA      MC common percent     ALL common percent   GDC_mc  GDC_all
NUMBER_OF_ATOMS_AA:      147     588    588  100.00    1231   1231  100.00               177
SUMMARY(RMSD_GDC):     1.233          1.263                  1.763           75.363   70.960

#CA            N1   N2   DIST      N    RMSD    GDT_TS    LGA_S3     LGA_Q 
SUMMARY(GDT)  147  177    4.0    146    1.04    79.096    80.940    12.793

LGA_LOCAL      RMSD:   1.041  Number of atoms:  146  under DIST:   4.00
LGA_ASGN_ATOMS RMSD:   1.237  Number of assigned atoms:  147 
Std_ASGN_ATOMS RMSD:   1.233  Standard rmsd on all 147 assigned CA atoms 

Unitary ROTATION matrix and the SHIFT vector superimpose molecules  (1=>2)
  X_new =   0.685605 * X  +   0.072400 * Y  +   0.724364 * Z  + -14.511646
  Y_new =   0.013213 * X  +  -0.996116 * Y  +   0.087055 * Z  +  11.969393
  Z_new =   0.727853 * X  +  -0.050115 * Y  +  -0.683899 * Z  +   0.940249 

Euler angles from the ROTATION matrix. Conventions XYZ and ZXZ:
           Phi     Theta       Psi   [DEG:       Phi     Theta       Psi ]
XYZ:  0.019269 -0.815186 -3.068445   [DEG:    1.1040  -46.7067 -175.8090 ]
ZXZ:  1.690404  2.323890  1.639541   [DEG:   96.8530  133.1491   93.9388 ]
 
# END of job
