
#######################################################
#                                                     #
#                        LGA                          #
#                  ---------------                    #
#                                                     #
#               Local-Global Alignment                #
#        A Method for Finding 3-D Similarities        #
#               in Protein Structures                 #
#                                                     #
#                  ------------ 10/2009               #
#                                                     #
#      Adam Zemla (adamz@llnl.gov)                    #
#      Lawrence Livermore National Laboratory, CA     #
#                                                     #
#######################################################

!!!   License for LGA program has expired  !!!
#   For updated version of the LGA program   #
# please contact Adam Zemla:  adamz@llnl.gov #

# Molecule1: number of CA atoms  158 ( 1268),  selected  157 , name one
# Molecule2: number of CA atoms  157 ( 1259),  selected  157 , name two
# PARAMETERS: input.pdb  -ie  -3  -d:4  -sda  -swap  -ch1:A  -ch2:A  
# FIXED Atom-Atom correspondence
# GDT and LCS analysis 

LCS - RMSD CUTOFF   5.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:   157       1_A - 157_A       1.63     1.63
  LCS_AVERAGE:    100.00

LCS - RMSD CUTOFF   2.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:   157       1_A - 157_A       1.63     1.63
  LCS_AVERAGE:    100.00

LCS - RMSD CUTOFF   1.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:   149       9_A - 157_A       0.99     1.70
  LCS_AVERAGE:     90.43

LCS_GDT    MOLECULE-1    MOLECULE-2     LCS_DETAILS     GDT_DETAILS                                                    TOTAL NUMBER OF RESIDUE PAIRS:  157
LCS_GDT     RESIDUE       RESIDUE       SEGMENT_SIZE    GLOBAL DISTANCE TEST COLUMNS: number of residues under the threshold assigned to each residue pair
LCS_GDT   NAME NUMBER   NAME NUMBER    1.0  2.0  5.0    0.5  1.0  1.5  2.0  2.5  3.0  3.5  4.0  4.5  5.0  5.5  6.0  6.5  7.0  7.5  8.0  8.5  9.0  9.5 10.0
LCS_GDT     L     1_A     L     1_A     11  157  157      4    9   11   64   98  132  150  153  154  156  156  157  157  157  157  157  157  157  157  157 
LCS_GDT     S     2_A     S     2_A     11  157  157      7   10   11   25   79  109  137  151  154  156  156  157  157  157  157  157  157  157  157  157 
LCS_GDT     D     3_A     D     3_A     11  157  157      8   10   11   15   57   95  130  151  154  156  156  157  157  157  157  157  157  157  157  157 
LCS_GDT     R     4_A     R     4_A     11  157  157      8   10   11   13   20   33   59  111  142  154  156  157  157  157  157  157  157  157  157  157 
LCS_GDT     E     5_A     E     5_A     11  157  157      8   10   11   15   32   88  129  147  154  156  156  157  157  157  157  157  157  157  157  157 
LCS_GDT     L     6_A     L     6_A     11  157  157      8   30   84  125  147  149  150  153  154  156  156  157  157  157  157  157  157  157  157  157 
LCS_GDT     E     7_A     E     7_A     11  157  157      8   18   58  110  142  149  150  153  154  156  156  157  157  157  157  157  157  157  157  157 
LCS_GDT     A     8_A     A     8_A     11  157  157      8   10   29   73  110  142  150  153  154  156  156  157  157  157  157  157  157  157  157  157 
LCS_GDT     S     9_A     S     9_A    149  157  157      8   10   11   13   47  143  150  153  154  156  156  157  157  157  157  157  157  157  157  157 
LCS_GDT     L    10_A     L    10_A    149  157  157      8   61  106  145  148  149  150  153  154  156  156  157  157  157  157  157  157  157  157  157 
LCS_GDT     Q    11_A     Q    11_A    149  157  157      8   61  123  145  148  149  150  153  154  156  156  157  157  157  157  157  157  157  157  157 
LCS_GDT     A    12_A     A    12_A    149  157  157     18   63  120  145  148  149  150  153  154  156  156  157  157  157  157  157  157  157  157  157 
LCS_GDT     F    13_A     F    13_A    149  157  157     15   94  139  145  148  149  150  153  154  156  156  157  157  157  157  157  157  157  157  157 
LCS_GDT     F    14_A     F    14_A    149  157  157     56  109  139  145  148  149  150  153  154  156  156  157  157  157  157  157  157  157  157  157 
LCS_GDT     E    15_A     E    15_A    149  157  157     35   96  139  145  148  149  150  153  154  156  156  157  157  157  157  157  157  157  157  157 
LCS_GDT     V    16_A     V    16_A    149  157  157     56  116  139  145  148  149  150  153  154  156  156  157  157  157  157  157  157  157  157  157 
LCS_GDT     H    17_A     H    17_A    149  157  157     56  116  139  145  148  149  150  153  154  156  156  157  157  157  157  157  157  157  157  157 
LCS_GDT     T    18_A     T    18_A    149  157  157     56  112  139  145  148  149  150  153  154  156  156  157  157  157  157  157  157  157  157  157 
LCS_GDT     R    19_A     R    19_A    149  157  157     56  116  139  145  148  149  150  153  154  156  156  157  157  157  157  157  157  157  157  157 
LCS_GDT     L    20_A     L    20_A    149  157  157     56  116  139  145  148  149  150  153  154  156  156  157  157  157  157  157  157  157  157  157 
LCS_GDT     V    21_A     V    21_A    149  157  157     56  116  139  145  148  149  150  153  154  156  156  157  157  157  157  157  157  157  157  157 
LCS_GDT     H    22_A     H    22_A    149  157  157     56  116  139  145  148  149  150  153  154  156  156  157  157  157  157  157  157  157  157  157 
LCS_GDT     R    23_A     R    23_A    149  157  157     56  116  139  145  148  149  150  153  154  156  156  157  157  157  157  157  157  157  157  157 
LCS_GDT     L    24_A     L    24_A    149  157  157     45  116  139  145  148  149  150  153  154  156  156  157  157  157  157  157  157  157  157  157 
LCS_GDT     A    25_A     A    25_A    149  157  157     41  116  139  145  148  149  150  153  154  156  156  157  157  157  157  157  157  157  157  157 
LCS_GDT     G    26_A     G    26_A    149  157  157     41  116  139  145  148  149  150  153  154  156  156  157  157  157  157  157  157  157  157  157 
LCS_GDT     I    27_A     I    27_A    149  157  157      8  113  139  145  148  149  150  153  154  156  156  157  157  157  157  157  157  157  157  157 
LCS_GDT     E    28_A     E    28_A    149  157  157      8  113  139  145  148  149  150  153  154  156  156  157  157  157  157  157  157  157  157  157 
LCS_GDT     P    29_A     P    29_A    149  157  157     45  116  139  145  148  149  150  153  154  156  156  157  157  157  157  157  157  157  157  157 
LCS_GDT     D    30_A     D    30_A    149  157  157     44  116  139  145  148  149  150  153  154  156  156  157  157  157  157  157  157  157  157  157 
LCS_GDT     P    31_A     P    31_A    149  157  157     43  106  139  145  148  149  150  153  154  156  156  157  157  157  157  157  157  157  157  157 
LCS_GDT     R    32_A     R    32_A    149  157  157     43  106  139  145  148  149  150  153  154  156  156  157  157  157  157  157  157  157  157  157 
LCS_GDT     F    33_A     F    33_A    149  157  157     43  113  139  145  148  149  150  153  154  156  156  157  157  157  157  157  157  157  157  157 
LCS_GDT     E    34_A     E    34_A    149  157  157     29   96  139  145  148  149  150  153  154  156  156  157  157  157  157  157  157  157  157  157 
LCS_GDT     I    35_A     I    35_A    149  157  157     43  111  139  145  148  149  150  153  154  156  156  157  157  157  157  157  157  157  157  157 
LCS_GDT     L    36_A     L    36_A    149  157  157     45  116  139  145  148  149  150  153  154  156  156  157  157  157  157  157  157  157  157  157 
LCS_GDT     D    37_A     D    37_A    149  157  157     45  116  139  145  148  149  150  153  154  156  156  157  157  157  157  157  157  157  157  157 
LCS_GDT     K    38_A     K    38_A    149  157  157     43  113  139  145  148  149  150  153  154  156  156  157  157  157  157  157  157  157  157  157 
LCS_GDT     Y    39_A     Y    39_A    149  157  157     45  116  139  145  148  149  150  153  154  156  156  157  157  157  157  157  157  157  157  157 
LCS_GDT     I    40_A     I    40_A    149  157  157     45  116  139  145  148  149  150  153  154  156  156  157  157  157  157  157  157  157  157  157 
LCS_GDT     F    41_A     F    41_A    149  157  157     30  116  139  145  148  149  150  153  154  156  156  157  157  157  157  157  157  157  157  157 
LCS_GDT     R    42_A     R    42_A    149  157  157     42  116  139  145  148  149  150  153  154  156  156  157  157  157  157  157  157  157  157  157 
LCS_GDT     Q    43_A     Q    43_A    149  157  157     40  116  139  145  148  149  150  153  154  156  156  157  157  157  157  157  157  157  157  157 
LCS_GDT     I    44_A     I    44_A    149  157  157     19  113  139  145  148  149  150  153  154  156  156  157  157  157  157  157  157  157  157  157 
LCS_GDT     V    45_A     V    45_A    149  157  157     42  116  139  145  148  149  150  153  154  156  156  157  157  157  157  157  157  157  157  157 
LCS_GDT     A    46_A     A    46_A    149  157  157     10  116  139  145  148  149  150  153  154  156  156  157  157  157  157  157  157  157  157  157 
LCS_GDT     D    47_A     D    47_A    149  157  157     10  116  139  145  148  149  150  153  154  156  156  157  157  157  157  157  157  157  157  157 
LCS_GDT     N    48_A     N    48_A    149  157  157     16  116  139  145  148  149  150  153  154  156  156  157  157  157  157  157  157  157  157  157 
LCS_GDT     P    49_A     P    49_A    149  157  157     43  116  139  145  148  149  150  153  154  156  156  157  157  157  157  157  157  157  157  157 
LCS_GDT     E    50_A     E    50_A    149  157  157     39  116  139  145  148  149  150  153  154  156  156  157  157  157  157  157  157  157  157  157 
LCS_GDT     E    51_A     E    51_A    149  157  157     48  116  139  145  148  149  150  153  154  156  156  157  157  157  157  157  157  157  157  157 
LCS_GDT     R    52_A     R    52_A    149  157  157     11  105  139  145  148  149  150  153  154  156  156  157  157  157  157  157  157  157  157  157 
LCS_GDT     E    53_A     E    53_A    149  157  157     37  101  139  145  148  149  150  153  154  156  156  157  157  157  157  157  157  157  157  157 
LCS_GDT     K    54_A     K    54_A    149  157  157     54  116  139  145  148  149  150  153  154  156  156  157  157  157  157  157  157  157  157  157 
LCS_GDT     I    55_A     I    55_A    149  157  157     10  116  139  145  148  149  150  153  154  156  156  157  157  157  157  157  157  157  157  157 
LCS_GDT     R    56_A     R    56_A    149  157  157     23   87  138  145  148  149  150  153  154  156  156  157  157  157  157  157  157  157  157  157 
LCS_GDT     L    57_A     L    57_A    149  157  157     37  100  139  145  148  149  150  153  154  156  156  157  157  157  157  157  157  157  157  157 
LCS_GDT     D    58_A     D    58_A    149  157  157     56  116  139  145  148  149  150  153  154  156  156  157  157  157  157  157  157  157  157  157 
LCS_GDT     Y    59_A     Y    59_A    149  157  157     37  114  139  145  148  149  150  153  154  156  156  157  157  157  157  157  157  157  157  157 
LCS_GDT     G    60_A     G    60_A    149  157  157     37  112  139  145  148  149  150  153  154  156  156  157  157  157  157  157  157  157  157  157 
LCS_GDT     R    61_A     R    61_A    149  157  157     46  116  139  145  148  149  150  153  154  156  156  157  157  157  157  157  157  157  157  157 
LCS_GDT     A    62_A     A    62_A    149  157  157     48  116  139  145  148  149  150  153  154  156  156  157  157  157  157  157  157  157  157  157 
LCS_GDT     A    63_A     A    63_A    149  157  157     56  116  139  145  148  149  150  153  154  156  156  157  157  157  157  157  157  157  157  157 
LCS_GDT     E    64_A     E    64_A    149  157  157     56  116  139  145  148  149  150  153  154  156  156  157  157  157  157  157  157  157  157  157 
LCS_GDT     I    65_A     I    65_A    149  157  157     48  116  139  145  148  149  150  153  154  156  156  157  157  157  157  157  157  157  157  157 
LCS_GDT     F    66_A     F    66_A    149  157  157     56  116  139  145  148  149  150  153  154  156  156  157  157  157  157  157  157  157  157  157 
LCS_GDT     R    67_A     R    67_A    149  157  157     56  116  139  145  148  149  150  153  154  156  156  157  157  157  157  157  157  157  157  157 
LCS_GDT     D    68_A     D    68_A    149  157  157     56  116  139  145  148  149  150  153  154  156  156  157  157  157  157  157  157  157  157  157 
LCS_GDT     A    69_A     A    69_A    149  157  157     56  116  139  145  148  149  150  153  154  156  156  157  157  157  157  157  157  157  157  157 
LCS_GDT     L    70_A     L    70_A    149  157  157     56  116  139  145  148  149  150  153  154  156  156  157  157  157  157  157  157  157  157  157 
LCS_GDT     A    71_A     A    71_A    149  157  157     56  116  139  145  148  149  150  153  154  156  156  157  157  157  157  157  157  157  157  157 
LCS_GDT     R    72_A     R    72_A    149  157  157     37  116  139  145  148  149  150  153  154  156  156  157  157  157  157  157  157  157  157  157 
LCS_GDT     D    73_A     D    73_A    149  157  157     31  116  139  145  148  149  150  153  154  156  156  157  157  157  157  157  157  157  157  157 
LCS_GDT     I    74_A     I    74_A    149  157  157     40  116  139  145  148  149  150  153  154  156  156  157  157  157  157  157  157  157  157  157 
LCS_GDT     T    75_A     T    75_A    149  157  157     40  114  139  145  148  149  150  153  154  156  156  157  157  157  157  157  157  157  157  157 
LCS_GDT     T    76_A     T    76_A    149  157  157     56  116  139  145  148  149  150  153  154  156  156  157  157  157  157  157  157  157  157  157 
LCS_GDT     P    77_A     P    77_A    149  157  157     56  116  139  145  148  149  150  153  154  156  156  157  157  157  157  157  157  157  157  157 
LCS_GDT     E    78_A     E    78_A    149  157  157     56  116  139  145  148  149  150  153  154  156  156  157  157  157  157  157  157  157  157  157 
LCS_GDT     A    79_A     A    79_A    149  157  157     56  116  139  145  148  149  150  153  154  156  156  157  157  157  157  157  157  157  157  157 
LCS_GDT     F    80_A     F    80_A    149  157  157     56  116  139  145  148  149  150  153  154  156  156  157  157  157  157  157  157  157  157  157 
LCS_GDT     N    81_A     N    81_A    149  157  157     56  116  139  145  148  149  150  153  154  156  156  157  157  157  157  157  157  157  157  157 
LCS_GDT     A    82_A     A    82_A    149  157  157     56  116  139  145  148  149  150  153  154  156  156  157  157  157  157  157  157  157  157  157 
LCS_GDT     Y    83_A     Y    83_A    149  157  157     56  116  139  145  148  149  150  153  154  156  156  157  157  157  157  157  157  157  157  157 
LCS_GDT     L    84_A     L    84_A    149  157  157     56  116  139  145  148  149  150  153  154  156  156  157  157  157  157  157  157  157  157  157 
LCS_GDT     E    85_A     E    85_A    149  157  157     56  116  139  145  148  149  150  153  154  156  156  157  157  157  157  157  157  157  157  157 
LCS_GDT     A    86_A     A    86_A    149  157  157     56  116  139  145  148  149  150  153  154  156  156  157  157  157  157  157  157  157  157  157 
LCS_GDT     L    87_A     L    87_A    149  157  157     56  116  139  145  148  149  150  153  154  156  156  157  157  157  157  157  157  157  157  157 
LCS_GDT     G    88_A     G    88_A    149  157  157     56  116  139  145  148  149  150  153  154  156  156  157  157  157  157  157  157  157  157  157 
LCS_GDT     P    89_A     P    89_A    149  157  157     56  116  139  145  148  149  150  153  154  156  156  157  157  157  157  157  157  157  157  157 
LCS_GDT     D    90_A     D    90_A    149  157  157     56  116  139  145  148  149  150  153  154  156  156  157  157  157  157  157  157  157  157  157 
LCS_GDT     A    91_A     A    91_A    149  157  157     56  116  139  145  148  149  150  153  154  156  156  157  157  157  157  157  157  157  157  157 
LCS_GDT     V    92_A     V    92_A    149  157  157     56  116  139  145  148  149  150  153  154  156  156  157  157  157  157  157  157  157  157  157 
LCS_GDT     R    93_A     R    93_A    149  157  157     56  116  139  145  148  149  150  153  154  156  156  157  157  157  157  157  157  157  157  157 
LCS_GDT     T    94_A     T    94_A    149  157  157     56  116  139  145  148  149  150  153  154  156  156  157  157  157  157  157  157  157  157  157 
LCS_GDT     V    95_A     V    95_A    149  157  157     56  116  139  145  148  149  150  153  154  156  156  157  157  157  157  157  157  157  157  157 
LCS_GDT     Q    96_A     Q    96_A    149  157  157     56  116  139  145  148  149  150  153  154  156  156  157  157  157  157  157  157  157  157  157 
LCS_GDT     D    97_A     D    97_A    149  157  157     56  116  139  145  148  149  150  153  154  156  156  157  157  157  157  157  157  157  157  157 
LCS_GDT     L    98_A     L    98_A    149  157  157     56  116  139  145  148  149  150  153  154  156  156  157  157  157  157  157  157  157  157  157 
LCS_GDT     T    99_A     T    99_A    149  157  157     56  116  139  145  148  149  150  153  154  156  156  157  157  157  157  157  157  157  157  157 
LCS_GDT     R   100_A     R   100_A    149  157  157     47  116  139  145  148  149  150  153  154  156  156  157  157  157  157  157  157  157  157  157 
LCS_GDT     R   101_A     R   101_A    149  157  157     47  116  139  145  148  149  150  153  154  156  156  157  157  157  157  157  157  157  157  157 
LCS_GDT     F   102_A     F   102_A    149  157  157     54  116  139  145  148  149  150  153  154  156  156  157  157  157  157  157  157  157  157  157 
LCS_GDT     V   103_A     V   103_A    149  157  157     45  116  139  145  148  149  150  153  154  156  156  157  157  157  157  157  157  157  157  157 
LCS_GDT     D   104_A     D   104_A    149  157  157     25  116  139  145  148  149  150  153  154  156  156  157  157  157  157  157  157  157  157  157 
LCS_GDT     V   105_A     V   105_A    149  157  157     23  116  139  145  148  149  150  153  154  156  156  157  157  157  157  157  157  157  157  157 
LCS_GDT     I   106_A     I   106_A    149  157  157     47  116  139  145  148  149  150  153  154  156  156  157  157  157  157  157  157  157  157  157 
LCS_GDT     R   107_A     R   107_A    149  157  157     23   93  139  145  148  149  150  153  154  156  156  157  157  157  157  157  157  157  157  157 
LCS_GDT     A   108_A     A   108_A    149  157  157     14   72  127  145  148  149  150  153  154  156  156  157  157  157  157  157  157  157  157  157 
LCS_GDT     D   109_A     D   109_A    149  157  157     23   93  139  145  148  149  150  153  154  156  156  157  157  157  157  157  157  157  157  157 
LCS_GDT     P   110_A     P   110_A    149  157  157     23  116  139  145  148  149  150  153  154  156  156  157  157  157  157  157  157  157  157  157 
LCS_GDT     E   111_A     E   111_A    149  157  157     22  116  139  145  148  149  150  153  154  156  156  157  157  157  157  157  157  157  157  157 
LCS_GDT     A   112_A     A   112_A    149  157  157     23   93  139  145  148  149  150  153  154  156  156  157  157  157  157  157  157  157  157  157 
LCS_GDT     I   113_A     I   113_A    149  157  157     42  116  139  145  148  149  150  153  154  156  156  157  157  157  157  157  157  157  157  157 
LCS_GDT     A   114_A     A   114_A    149  157  157     45  116  139  145  148  149  150  153  154  156  156  157  157  157  157  157  157  157  157  157 
LCS_GDT     K   115_A     K   115_A    149  157  157     30  116  139  145  148  149  150  153  154  156  156  157  157  157  157  157  157  157  157  157 
LCS_GDT     L   116_A     L   116_A    149  157  157     30  116  139  145  148  149  150  153  154  156  156  157  157  157  157  157  157  157  157  157 
LCS_GDT     L   117_A     L   117_A    149  157  157     30  116  139  145  148  149  150  153  154  156  156  157  157  157  157  157  157  157  157  157 
LCS_GDT     N   118_A     N   118_A    149  157  157     30  110  139  145  148  149  150  153  154  156  156  157  157  157  157  157  157  157  157  157 
LCS_GDT     I   119_A     I   119_A    149  157  157     42  116  139  145  148  149  150  153  154  156  156  157  157  157  157  157  157  157  157  157 
LCS_GDT     S   120_A     S   120_A    149  157  157     45  116  139  145  148  149  150  153  154  156  156  157  157  157  157  157  157  157  157  157 
LCS_GDT     K   121_A     K   121_A    149  157  157     47  116  139  145  148  149  150  153  154  156  156  157  157  157  157  157  157  157  157  157 
LCS_GDT     E   122_A     E   122_A    149  157  157     56  116  139  145  148  149  150  153  154  156  156  157  157  157  157  157  157  157  157  157 
LCS_GDT     D   123_A     D   123_A    149  157  157     47  116  139  145  148  149  150  153  154  156  156  157  157  157  157  157  157  157  157  157 
LCS_GDT     V   124_A     V   124_A    149  157  157     54  116  139  145  148  149  150  153  154  156  156  157  157  157  157  157  157  157  157  157 
LCS_GDT     Q   125_A     Q   125_A    149  157  157     56  116  139  145  148  149  150  153  154  156  156  157  157  157  157  157  157  157  157  157 
LCS_GDT     G   126_A     G   126_A    149  157  157     56  116  139  145  148  149  150  153  154  156  156  157  157  157  157  157  157  157  157  157 
LCS_GDT     L   127_A     L   127_A    149  157  157     56  116  139  145  148  149  150  153  154  156  156  157  157  157  157  157  157  157  157  157 
LCS_GDT     A   128_A     A   128_A    149  157  157     56  116  139  145  148  149  150  153  154  156  156  157  157  157  157  157  157  157  157  157 
LCS_GDT     R   129_A     R   129_A    149  157  157     56  116  139  145  148  149  150  153  154  156  156  157  157  157  157  157  157  157  157  157 
LCS_GDT     A   130_A     A   130_A    149  157  157     56  116  139  145  148  149  150  153  154  156  156  157  157  157  157  157  157  157  157  157 
LCS_GDT     G   131_A     G   131_A    149  157  157     56  116  139  145  148  149  150  153  154  156  156  157  157  157  157  157  157  157  157  157 
LCS_GDT     E   132_A     E   132_A    149  157  157     56  116  139  145  148  149  150  153  154  156  156  157  157  157  157  157  157  157  157  157 
LCS_GDT     A   133_A     A   133_A    149  157  157     49  116  139  145  148  149  150  153  154  156  156  157  157  157  157  157  157  157  157  157 
LCS_GDT     A   134_A     A   134_A    149  157  157     56  116  139  145  148  149  150  153  154  156  156  157  157  157  157  157  157  157  157  157 
LCS_GDT     I   135_A     I   135_A    149  157  157     54  116  139  145  148  149  150  153  154  156  156  157  157  157  157  157  157  157  157  157 
LCS_GDT     E   136_A     E   136_A    149  157  157     45  116  139  145  148  149  150  153  154  156  156  157  157  157  157  157  157  157  157  157 
LCS_GDT     R   137_A     R   137_A    149  157  157     45  116  139  145  148  149  150  153  154  156  156  157  157  157  157  157  157  157  157  157 
LCS_GDT     G   138_A     G   138_A    149  157  157     43  116  139  145  148  149  150  153  154  156  156  157  157  157  157  157  157  157  157  157 
LCS_GDT     E   139_A     E   139_A    149  157  157     56  116  139  145  148  149  150  153  154  156  156  157  157  157  157  157  157  157  157  157 
LCS_GDT     G   140_A     G   140_A    149  157  157     45  116  139  145  148  149  150  153  154  156  156  157  157  157  157  157  157  157  157  157 
LCS_GDT     A   141_A     A   141_A    149  157  157     56  116  139  145  148  149  150  153  154  156  156  157  157  157  157  157  157  157  157  157 
LCS_GDT     S   142_A     S   142_A    149  157  157     45  116  139  145  148  149  150  153  154  156  156  157  157  157  157  157  157  157  157  157 
LCS_GDT     L   143_A     L   143_A    149  157  157     56  116  139  145  148  149  150  153  154  156  156  157  157  157  157  157  157  157  157  157 
LCS_GDT     G   144_A     G   144_A    149  157  157     56  116  139  145  148  149  150  153  154  156  156  157  157  157  157  157  157  157  157  157 
LCS_GDT     V   145_A     V   145_A    149  157  157     51  116  139  145  148  149  150  153  154  156  156  157  157  157  157  157  157  157  157  157 
LCS_GDT     L   146_A     L   146_A    149  157  157     51  116  139  145  148  149  150  153  154  156  156  157  157  157  157  157  157  157  157  157 
LCS_GDT     R   147_A     R   147_A    149  157  157     48  116  139  145  148  149  150  153  154  156  156  157  157  157  157  157  157  157  157  157 
LCS_GDT     E   148_A     E   148_A    149  157  157     47  116  139  145  148  149  150  153  154  156  156  157  157  157  157  157  157  157  157  157 
LCS_GDT     L   149_A     L   149_A    149  157  157     45  116  139  145  148  149  150  153  154  156  156  157  157  157  157  157  157  157  157  157 
LCS_GDT     R   150_A     R   150_A    149  157  157     45  116  139  145  148  149  150  153  154  156  156  157  157  157  157  157  157  157  157  157 
LCS_GDT     K   151_A     K   151_A    149  157  157     45  116  139  145  148  149  150  153  154  156  156  157  157  157  157  157  157  157  157  157 
LCS_GDT     I   152_A     I   152_A    149  157  157     30  116  139  145  148  149  150  153  154  156  156  157  157  157  157  157  157  157  157  157 
LCS_GDT     E   153_A     E   153_A    149  157  157     30  116  139  145  148  149  150  153  154  156  156  157  157  157  157  157  157  157  157  157 
LCS_GDT     K   154_A     K   154_A    149  157  157     21  110  139  145  148  149  150  153  154  156  156  157  157  157  157  157  157  157  157  157 
LCS_GDT     K   155_A     K   155_A    149  157  157      3   58  110  143  148  149  150  153  153  156  156  157  157  157  157  157  157  157  157  157 
LCS_GDT     R   156_A     R   156_A    149  157  157      3   51  106  144  148  149  150  153  153  156  156  157  157  157  157  157  157  157  157  157 
LCS_GDT     N   157_A     N   157_A    149  157  157      3  114  139  145  148  149  150  153  154  156  156  157  157  157  157  157  157  157  157  157 
LCS_AVERAGE  LCS_A:  96.81  (  90.43  100.00  100.00 )

GLOBAL_DISTANCE_TEST (summary information about detected largest sets of residues (represented by selected AToms) that can fit under specified thresholds)
GDT DIST_CUTOFF  0.50   1.00   1.50   2.00   2.50   3.00   3.50   4.00   4.50   5.00   5.50   6.00   6.50   7.00   7.50   8.00   8.50   9.00   9.50  10.00
GDT NUMBER_AT     56    116    139    145    148    149    150    153    154    156    156    157    157    157    157    157    157    157    157    157 
GDT PERCENT_AT  35.67  73.89  88.54  92.36  94.27  94.90  95.54  97.45  98.09  99.36  99.36 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00
GDT RMS_LOCAL    0.34   0.64   0.78   0.85   0.91   0.95   1.00   1.24   1.49   1.51   1.51   1.63   1.63   1.63   1.63   1.63   1.63   1.63   1.63   1.63
GDT RMS_ALL_AT   1.77   1.72   1.72   1.70   1.71   1.70   1.69   1.65   1.63   1.63   1.63   1.63   1.63   1.63   1.63   1.63   1.63   1.63   1.63   1.63

# Checking swapping
#   possible swapping detected:  D     3_A      D     3_A
#   possible swapping detected:  E     5_A      E     5_A
#   possible swapping detected:  E     7_A      E     7_A
#   possible swapping detected:  F    13_A      F    13_A
#   possible swapping detected:  F    14_A      F    14_A
#   possible swapping detected:  F    33_A      F    33_A
#   possible swapping detected:  F    41_A      F    41_A
#   possible swapping detected:  E    50_A      E    50_A
#   possible swapping detected:  E    51_A      E    51_A
#   possible swapping detected:  E    53_A      E    53_A
#   possible swapping detected:  Y    59_A      Y    59_A
#   possible swapping detected:  E    64_A      E    64_A
#   possible swapping detected:  F    80_A      F    80_A
#   possible swapping detected:  Y    83_A      Y    83_A
#   possible swapping detected:  E    85_A      E    85_A
#   possible swapping detected:  E   111_A      E   111_A
#   possible swapping detected:  E   132_A      E   132_A
#   possible swapping detected:  E   136_A      E   136_A
#   possible swapping detected:  E   139_A      E   139_A
#   possible swapping detected:  E   148_A      E   148_A
#   possible swapping detected:  E   153_A      E   153_A

#      Molecule1      Molecule2  DISTANCE    Mis    MC     All    Dist_max   GDC_mc  GDC_all
LGA    L     1_A      L     1_A     6.046     0    0.557   0.702     9.791   20.000   12.560
LGA    S     2_A      S     2_A     6.856     0    0.067   0.121     9.145   17.500   12.698
LGA    D     3_A      D     3_A     5.891     0    0.027   0.962     6.927   20.476   17.381
LGA    R     4_A      R     4_A     8.009     0    0.021   1.349    17.168    8.810    3.290
LGA    E     5_A      E     5_A     7.066     0    0.016   0.113    10.719   16.905    8.677
LGA    L     6_A      L     6_A     3.206     0    0.082   1.324     4.655   50.833   57.976
LGA    E     7_A      E     7_A     3.436     0    0.027   0.874     5.114   53.690   41.376
LGA    A     8_A      A     8_A     4.746     0    0.014   0.020     6.288   37.262   33.238
LGA    S     9_A      S     9_A     4.526     0    0.090   0.740     5.096   37.262   35.397
LGA    L    10_A      L    10_A     2.429     0    0.397   0.389     4.477   64.881   57.738
LGA    Q    11_A      Q    11_A     1.977     0    0.037   1.197     6.160   70.833   54.550
LGA    A    12_A      A    12_A     2.032     0    0.044   0.063     2.419   68.810   68.000
LGA    F    13_A      F    13_A     1.192     0    0.019   0.101     1.510   81.548   83.117
LGA    F    14_A      F    14_A     1.006     0    0.073   1.458     6.761   83.690   60.519
LGA    E    15_A      E    15_A     1.261     0    0.053   0.904     5.032   81.429   58.995
LGA    V    16_A      V    16_A     0.805     0    0.052   0.056     1.089   90.476   89.184
LGA    H    17_A      H    17_A     0.513     0    0.053   0.308     0.724   92.857   93.333
LGA    T    18_A      T    18_A     0.978     0    0.038   0.838     3.153   88.214   79.592
LGA    R    19_A      R    19_A     0.855     0    0.016   1.168     5.182   90.476   71.558
LGA    L    20_A      L    20_A     0.635     0    0.013   0.070     0.781   90.476   90.476
LGA    V    21_A      V    21_A     0.622     0    0.065   0.077     0.725   90.476   90.476
LGA    H    22_A      H    22_A     0.723     0    0.074   0.174     0.827   90.476   90.476
LGA    R    23_A      R    23_A     0.683     0    0.023   1.255     6.383   90.476   67.965
LGA    L    24_A      L    24_A     0.597     0    0.105   0.103     1.152   88.214   88.214
LGA    A    25_A      A    25_A     0.783     0    0.019   0.031     1.083   88.214   88.667
LGA    G    26_A      G    26_A     0.785     0    0.021   0.021     1.316   85.952   85.952
LGA    I    27_A      I    27_A     1.272     0    0.044   0.159     1.695   81.429   80.357
LGA    E    28_A      E    28_A     1.421     0    0.026   0.657     3.528   81.429   69.841
LGA    P    29_A      P    29_A     1.018     0    0.019   0.065     1.278   81.429   81.429
LGA    D    30_A      D    30_A     1.003     0    0.050   0.105     1.435   83.690   83.690
LGA    P    31_A      P    31_A     1.681     0    0.011   0.292     2.625   75.000   71.837
LGA    R    32_A      R    32_A     1.669     0    0.067   0.770     5.428   77.143   60.476
LGA    F    33_A      F    33_A     1.291     0    0.026   0.064     1.461   81.429   82.251
LGA    E    34_A      E    34_A     1.851     0    0.032   0.794     4.807   72.857   56.138
LGA    I    35_A      I    35_A     1.468     0    0.014   0.039     1.624   79.286   78.214
LGA    L    36_A      L    36_A     0.974     0    0.010   0.053     1.128   88.214   90.536
LGA    D    37_A      D    37_A     1.141     0    0.025   0.176     1.498   81.429   81.429
LGA    K    38_A      K    38_A     1.379     0    0.022   0.074     2.511   81.429   73.122
LGA    Y    39_A      Y    39_A     0.928     0    0.049   0.181     1.103   88.214   88.968
LGA    I    40_A      I    40_A     0.836     0    0.043   0.078     0.931   90.476   90.476
LGA    F    41_A      F    41_A     1.202     0    0.050   0.473     3.908   81.429   68.442
LGA    R    42_A      R    42_A     0.878     0    0.015   1.175     4.945   90.476   77.446
LGA    Q    43_A      Q    43_A     0.708     0    0.039   1.127     4.179   88.214   76.825
LGA    I    44_A      I    44_A     1.168     0    0.062   0.087     1.486   83.690   82.560
LGA    V    45_A      V    45_A     1.033     0    0.040   1.136     2.759   85.952   78.163
LGA    A    46_A      A    46_A     0.736     0    0.054   0.064     0.829   90.476   90.476
LGA    D    47_A      D    47_A     0.879     0    0.048   0.145     1.463   88.214   84.821
LGA    N    48_A      N    48_A     0.847     0    0.017   0.095     1.180   90.476   89.345
LGA    P    49_A      P    49_A     0.448     0    0.071   0.080     0.694   95.238   95.918
LGA    E    50_A      E    50_A     0.503     0    0.092   0.213     0.696   92.857   95.767
LGA    E    51_A      E    51_A     0.502     0    0.031   0.765     1.889   92.857   87.566
LGA    R    52_A      R    52_A     1.145     0    0.034   1.073     2.526   83.690   79.394
LGA    E    53_A      E    53_A     1.283     0    0.019   0.148     1.992   81.429   77.619
LGA    K    54_A      K    54_A     0.527     0    0.034   1.068     5.570   90.476   77.513
LGA    I    55_A      I    55_A     0.993     0    0.080   0.225     1.871   85.952   82.619
LGA    R    56_A      R    56_A     1.594     0    0.032   0.341     2.896   77.143   67.922
LGA    L    57_A      L    57_A     1.297     0    0.095   1.061     3.248   85.952   75.655
LGA    D    58_A      D    58_A     0.635     0    0.026   0.122     0.876   90.476   92.857
LGA    Y    59_A      Y    59_A     0.868     0    0.024   0.181     1.359   90.476   85.198
LGA    G    60_A      G    60_A     0.906     0    0.072   0.072     0.906   92.857   92.857
LGA    R    61_A      R    61_A     0.655     0    0.012   1.306     6.195   90.476   72.035
LGA    A    62_A      A    62_A     0.535     0    0.018   0.025     0.643   95.238   94.286
LGA    A    63_A      A    63_A     0.416     0    0.011   0.012     0.597   95.238   96.190
LGA    E    64_A      E    64_A     0.562     0    0.037   0.145     0.981   92.857   91.534
LGA    I    65_A      I    65_A     0.550     0    0.013   0.051     0.630   90.476   94.048
LGA    F    66_A      F    66_A     0.520     0    0.036   0.129     0.705   90.476   93.939
LGA    R    67_A      R    67_A     0.605     0    0.028   1.153     6.161   90.476   72.078
LGA    D    68_A      D    68_A     0.621     0    0.043   0.853     3.191   90.476   80.000
LGA    A    69_A      A    69_A     0.582     0    0.029   0.027     0.582   90.476   90.476
LGA    L    70_A      L    70_A     0.654     0    0.032   0.041     0.937   90.476   90.476
LGA    A    71_A      A    71_A     0.657     0    0.052   0.063     0.763   90.476   90.476
LGA    R    72_A      R    72_A     0.799     0    0.022   1.383     7.255   90.476   68.398
LGA    D    73_A      D    73_A     0.837     0    0.068   0.240     1.496   90.476   87.083
LGA    I    74_A      I    74_A     0.764     0    0.057   0.516     1.754   90.476   88.274
LGA    T    75_A      T    75_A     1.074     0    0.042   0.068     1.275   83.690   82.721
LGA    T    76_A      T    76_A     0.969     0    0.031   0.065     1.113   90.476   87.891
LGA    P    77_A      P    77_A     0.804     0    0.025   0.037     0.904   90.476   90.476
LGA    E    78_A      E    78_A     0.768     0    0.017   1.629     7.065   90.476   63.545
LGA    A    79_A      A    79_A     0.749     0    0.012   0.017     0.773   90.476   90.476
LGA    F    80_A      F    80_A     0.575     0    0.043   0.237     1.133   92.857   91.429
LGA    N    81_A      N    81_A     0.504     0    0.048   0.082     0.766   90.476   91.667
LGA    A    82_A      A    82_A     0.664     0    0.015   0.025     0.874   90.476   90.476
LGA    Y    83_A      Y    83_A     0.471     0    0.040   0.116     0.793   95.238   95.238
LGA    L    84_A      L    84_A     0.183     0    0.023   1.359     2.911  100.000   85.893
LGA    E    85_A      E    85_A     0.444     0    0.034   0.790     3.753  100.000   79.206
LGA    A    86_A      A    86_A     0.552     0    0.015   0.018     0.605   92.857   92.381
LGA    L    87_A      L    87_A     0.197     0    0.088   0.274     0.726  100.000   98.810
LGA    G    88_A      G    88_A     0.552     0    0.030   0.030     0.552   97.619   97.619
LGA    P    89_A      P    89_A     0.624     0    0.014   0.316     0.818   90.476   91.837
LGA    D    90_A      D    90_A     0.494     0    0.024   0.224     0.575   97.619   96.429
LGA    A    91_A      A    91_A     0.386     0    0.037   0.048     0.477  100.000  100.000
LGA    V    92_A      V    92_A     0.485     0    0.012   0.069     0.729  100.000   97.279
LGA    R    93_A      R    93_A     0.406     0    0.059   1.175     5.836   97.619   76.623
LGA    T    94_A      T    94_A     0.277     0    0.027   0.053     0.357  100.000  100.000
LGA    V    95_A      V    95_A     0.231     0    0.011   0.029     0.257  100.000  100.000
LGA    Q    96_A      Q    96_A     0.250     0    0.014   1.041     2.532  100.000   92.222
LGA    D    97_A      D    97_A     0.088     0    0.036   0.061     0.404  100.000  100.000
LGA    L    98_A      L    98_A     0.222     0    0.045   1.178     4.011  100.000   86.429
LGA    T    99_A      T    99_A     0.273     0    0.021   0.114     0.463  100.000  100.000
LGA    R   100_A      R   100_A     0.535     0    0.072   1.836     7.968   92.857   61.905
LGA    R   101_A      R   101_A     0.507     0    0.018   1.253     4.311   95.238   81.818
LGA    F   102_A      F   102_A     0.330     0    0.065   0.111     0.734  100.000   95.671
LGA    V   103_A      V   103_A     0.668     0    0.014   0.246     0.841   90.476   90.476
LGA    D   104_A      D   104_A     1.031     0    0.077   0.106     1.433   85.952   83.690
LGA    V   105_A      V   105_A     0.896     0    0.019   0.035     1.041   90.476   89.184
LGA    I   106_A      I   106_A     0.448     0    0.041   0.103     0.724   92.857   96.429
LGA    R   107_A      R   107_A     1.424     0    0.025   1.077     2.331   77.143   74.459
LGA    A   108_A      A   108_A     1.929     0    0.079   0.098     2.176   72.857   71.238
LGA    D   109_A      D   109_A     1.547     0    0.030   0.106     2.517   77.143   72.024
LGA    P   110_A      P   110_A     0.899     0    0.017   0.028     1.349   88.214   86.599
LGA    E   111_A      E   111_A     1.073     0    0.028   0.284     1.827   81.429   78.571
LGA    A   112_A      A   112_A     1.416     0    0.024   0.022     1.675   81.429   79.714
LGA    I   113_A      I   113_A     0.873     0    0.034   0.089     1.013   88.214   89.345
LGA    A   114_A      A   114_A     0.775     0    0.063   0.074     0.920   90.476   90.476
LGA    K   115_A      K   115_A     1.150     0    0.013   0.697     4.932   81.429   66.402
LGA    L   116_A      L   116_A     1.214     0    0.010   0.084     1.380   81.429   84.821
LGA    L   117_A      L   117_A     1.112     0    0.023   0.083     1.286   81.429   85.952
LGA    N   118_A      N   118_A     1.395     0    0.015   0.078     1.964   81.429   77.143
LGA    I   119_A      I   119_A     0.995     0    0.041   0.092     1.127   88.214   89.345
LGA    S   120_A      S   120_A     0.802     0    0.032   0.038     0.917   90.476   90.476
LGA    K   121_A      K   121_A     0.404     0    0.045   0.825     5.070   97.619   74.444
LGA    E   122_A      E   122_A     0.386     0    0.016   0.697     1.885   95.238   86.667
LGA    D   123_A      D   123_A     0.600     0    0.017   0.140     0.956   92.857   91.667
LGA    V   124_A      V   124_A     0.490     0    0.020   0.056     0.652  100.000   95.918
LGA    Q   125_A      Q   125_A     0.442     0    0.012   0.129     1.156  100.000   94.762
LGA    G   126_A      G   126_A     0.386     0    0.070   0.070     0.492  100.000  100.000
LGA    L   127_A      L   127_A     0.309     0    0.053   0.162     0.933  100.000   97.619
LGA    A   128_A      A   128_A     0.344     0    0.056   0.059     0.388  100.000  100.000
LGA    R   129_A      R   129_A     0.477     0    0.056   1.267     6.761  100.000   65.368
LGA    A   130_A      A   130_A     0.321     0    0.025   0.032     0.464  100.000  100.000
LGA    G   131_A      G   131_A     0.257     0    0.058   0.058     0.257  100.000  100.000
LGA    E   132_A      E   132_A     0.306     0    0.050   0.937     3.685  100.000   87.672
LGA    A   133_A      A   133_A     0.410     0    0.023   0.030     0.495  100.000  100.000
LGA    A   134_A      A   134_A     0.382     0    0.039   0.040     0.636   97.619   98.095
LGA    I   135_A      I   135_A     0.424     0    0.038   0.096     0.583   97.619   97.619
LGA    E   136_A      E   136_A     0.626     0    0.059   1.007     3.259   92.857   79.683
LGA    R   137_A      R   137_A     0.677     0    0.047   0.997     2.781   90.476   83.420
LGA    G   138_A      G   138_A     0.879     0    0.033   0.033     0.879   90.476   90.476
LGA    E   139_A      E   139_A     0.558     0    0.033   0.235     0.746   90.476   94.709
LGA    G   140_A      G   140_A     0.674     0    0.032   0.032     0.687   90.476   90.476
LGA    A   141_A      A   141_A     0.564     0    0.056   0.061     0.629   90.476   90.476
LGA    S   142_A      S   142_A     0.765     0    0.012   0.053     1.034   90.476   88.968
LGA    L   143_A      L   143_A     0.387     0    0.030   0.117     0.605   97.619   97.619
LGA    G   144_A      G   144_A     0.398     0    0.044   0.044     0.421  100.000  100.000
LGA    V   145_A      V   145_A     0.550     0    0.029   0.087     0.853   90.476   90.476
LGA    L   146_A      L   146_A     0.502     0    0.019   0.055     0.534   95.238   97.619
LGA    R   147_A      R   147_A     0.379     0    0.026   0.479     1.702   95.238   89.913
LGA    E   148_A      E   148_A     0.543     0    0.066   0.122     1.123   92.857   91.587
LGA    L   149_A      L   149_A     0.829     0    0.038   0.161     1.088   88.214   85.952
LGA    R   150_A      R   150_A     0.758     0    0.038   0.746     2.972   88.214   80.476
LGA    K   151_A      K   151_A     0.925     0    0.021   0.589     1.852   85.952   84.497
LGA    I   152_A      I   152_A     1.127     0    0.010   0.069     1.245   81.429   81.429
LGA    E   153_A      E   153_A     1.210     0    0.104   0.707     3.237   81.429   77.037
LGA    K   154_A      K   154_A     1.308     0    0.138   0.944     3.839   79.286   72.540
LGA    K   155_A      K   155_A     2.585     0    0.095   0.691     5.856   59.048   48.466
LGA    R   156_A      R   156_A     2.593     0    0.153   1.009     3.730   69.048   59.004
LGA    N   157_A      N   157_A     0.994     0    0.434   0.771     6.394   83.810   57.798

# RMSD_GDC results:       CA      MC common percent     ALL common percent   GDC_mc  GDC_all
NUMBER_OF_ATOMS_AA:      157     628    628  100.00    1259   1259  100.00               157
SUMMARY(RMSD_GDC):     1.627          1.559                  2.319           85.892   81.116

#CA            N1   N2   DIST      N    RMSD    GDT_TS    LGA_S3     LGA_Q 
SUMMARY(GDT)  158  157    4.0    153    1.24    90.924    95.324    11.456

LGA_LOCAL      RMSD:   1.236  Number of atoms:  153  under DIST:   4.00
LGA_ASGN_ATOMS RMSD:   1.654  Number of assigned atoms:  157 
Std_ASGN_ATOMS RMSD:   1.627  Standard rmsd on all 157 assigned CA atoms 

Unitary ROTATION matrix and the SHIFT vector superimpose molecules  (1=>2)
  X_new =   0.850783 * X  +  -0.200326 * Y  +   0.485837 * Z  +  -7.728753
  Y_new =   0.134817 * X  +  -0.810352 * Y  +  -0.570222 * Z  +  15.741217
  Z_new =   0.507930 * X  +   0.550635 * Y  +  -0.662427 * Z  + -14.607239 

Euler angles from the ROTATION matrix. Conventions XYZ and ZXZ:
           Phi     Theta       Psi   [DEG:       Phi     Theta       Psi ]
XYZ:  0.157156 -0.532779  2.448092   [DEG:    9.0044  -30.5260  140.2653 ]
ZXZ:  0.705662  2.294850  0.745077   [DEG:   40.4314  131.4852   42.6898 ]
 
# END of job
