
#######################################################
#                                                     #
#                        LGA                          #
#                  ---------------                    #
#                                                     #
#               Local-Global Alignment                #
#        A Method for Finding 3-D Similarities        #
#               in Protein Structures                 #
#                                                     #
#                  ------------ 10/2009               #
#                                                     #
#      Adam Zemla (adamz@llnl.gov)                    #
#      Lawrence Livermore National Laboratory, CA     #
#                                                     #
#######################################################

!!!   License for LGA program has expired  !!!
#   For updated version of the LGA program   #
# please contact Adam Zemla:  adamz@llnl.gov #

# Molecule1: number of CA atoms  132 ( 1007),  selected  118 , name one
# Molecule2: number of CA atoms  118 (  880),  selected  118 , name two
# PARAMETERS: input.pdb  -ie  -3  -d:4  -sda  -swap  -ch1:B  -ch2:A  
# FIXED Atom-Atom correspondence
# GDT and LCS analysis 

LCS - RMSD CUTOFF   5.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:   118      15_A - 132_A       0.73     0.73
  LCS_AVERAGE:    100.00

LCS - RMSD CUTOFF   2.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:   118      15_A - 132_A       0.73     0.73
  LCS_AVERAGE:    100.00

LCS - RMSD CUTOFF   1.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:   118      15_A - 132_A       0.73     0.73
  LCS_AVERAGE:    100.00

LCS_GDT    MOLECULE-1    MOLECULE-2     LCS_DETAILS     GDT_DETAILS                                                    TOTAL NUMBER OF RESIDUE PAIRS:  118
LCS_GDT     RESIDUE       RESIDUE       SEGMENT_SIZE    GLOBAL DISTANCE TEST COLUMNS: number of residues under the threshold assigned to each residue pair
LCS_GDT   NAME NUMBER   NAME NUMBER    1.0  2.0  5.0    0.5  1.0  1.5  2.0  2.5  3.0  3.5  4.0  4.5  5.0  5.5  6.0  6.5  7.0  7.5  8.0  8.5  9.0  9.5 10.0
LCS_GDT     E    15_B     E    15_A    118  118  118     84  111  114  115  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     V    16_B     V    16_A    118  118  118     87  111  114  115  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     Q    17_B     Q    17_A    118  118  118     81  111  114  115  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     L    18_B     L    18_A    118  118  118     94  111  114  115  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     V    19_B     V    19_A    118  118  118     94  111  114  115  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     E    20_B     E    20_A    118  118  118     94  111  114  115  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     S    21_B     S    21_A    118  118  118     94  111  114  115  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     G    22_B     G    22_A    118  118  118     94  111  114  115  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     G    23_B     G    23_A    118  118  118     94  111  114  115  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     G    24_B     G    24_A    118  118  118     94  111  114  115  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     L    25_B     L    25_A    118  118  118     92  111  114  115  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     V    26_B     V    26_A    118  118  118     81  111  114  115  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     L    27_B     L    27_A    118  118  118     94  111  114  115  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     P    28_B     P    28_A    118  118  118     94  111  114  115  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     G    29_B     G    29_A    118  118  118     94  111  114  115  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     G    30_B     G    30_A    118  118  118     94  111  114  115  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     S    31_B     S    31_A    118  118  118     91  111  114  115  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     L    32_B     L    32_A    118  118  118     94  111  114  115  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     K    33_B     K    33_A    118  118  118     94  111  114  115  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     L    34_B     L    34_A    118  118  118     94  111  114  115  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     S    35_B     S    35_A    118  118  118     94  111  114  115  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     C    36_B     C    36_A    118  118  118     94  111  114  115  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     A    37_B     A    37_A    118  118  118     94  111  114  115  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     A    38_B     A    38_A    118  118  118     94  111  114  115  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     S    39_B     S    39_A    118  118  118     94  111  114  115  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     G    40_B     G    40_A    118  118  118     94  111  114  115  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     F    41_B     F    41_A    118  118  118     94  111  114  115  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     N    42_B     N    42_A    118  118  118     70  111  114  115  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     F    43_B     F    43_A    118  118  118     94  111  114  115  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     G    44_B     G    44_A    118  118  118     94  111  114  115  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     S    45_B     S    45_A    118  118  118     94  111  114  115  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     S    46_B     S    46_A    118  118  118     94  111  114  115  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     D    47_B     D    47_A    118  118  118     94  111  114  115  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     M    48_B     M    48_A    118  118  118     94  111  114  115  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     N    49_B     N    49_A    118  118  118     94  111  114  115  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     W    50_B     W    50_A    118  118  118     94  111  114  115  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     V    51_B     V    51_A    118  118  118     94  111  114  115  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     R    52_B     R    52_A    118  118  118     94  111  114  115  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     Q    53_B     Q    53_A    118  118  118     94  111  114  115  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     A    54_B     A    54_A    118  118  118     78  111  114  115  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     A    55_B     A    55_A    118  118  118      8   89  114  115  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     G    56_B     G    56_A    118  118  118     21  104  114  115  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     K    57_B     K    57_A    118  118  118     76  111  114  115  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     G    58_B     G    58_A    118  118  118     76  111  114  115  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     P    59_B     P    59_A    118  118  118     94  111  114  115  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     E    60_B     E    60_A    118  118  118     94  111  114  115  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     W    61_B     W    61_A    118  118  118     94  111  114  115  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     V    62_B     V    62_A    118  118  118     94  111  114  115  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     A    63_B     A    63_A    118  118  118     94  111  114  115  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     S    64_B     S    64_A    118  118  118     94  111  114  115  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     I    65_B     I    65_A    118  118  118     94  111  114  115  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     E    66_B     E    66_A    118  118  118     94  111  114  115  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     R    67_B     R    67_A    118  118  118     92  111  114  115  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     G    68_B     G    68_A    118  118  118      6   23  113  115  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     A    69_B     A    69_A    118  118  118      3    3    5   18   77  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     G    70_B     G    70_A    118  118  118      3    3   41  114  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     G    71_B     G    71_A    118  118  118     94  111  114  115  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     T    72_B     T    72_A    118  118  118     94  111  114  115  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     D    73_B     D    73_A    118  118  118     94  111  114  115  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     Y    74_B     Y    74_A    118  118  118     94  111  114  115  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     A    75_B     A    75_A    118  118  118     94  111  114  115  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     D    76_B     D    76_A    118  118  118     94  111  114  115  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     S    77_B     S    77_A    118  118  118     94  111  114  115  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     V    78_B     V    78_A    118  118  118     94  111  114  115  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     Q    79_B     Q    79_A    118  118  118     94  111  114  115  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     G    80_B     G    80_A    118  118  118     94  111  114  115  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     R    81_B     R    81_A    118  118  118     94  111  114  115  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     F    82_B     F    82_A    118  118  118     94  111  114  115  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     T    83_B     T    83_A    118  118  118     94  111  114  115  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     V    84_B     V    84_A    118  118  118     94  111  114  115  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     S    85_B     S    85_A    118  118  118     94  111  114  115  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     R    86_B     R    86_A    118  118  118     94  111  114  115  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     D    87_B     D    87_A    118  118  118     86  111  114  115  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     N    88_B     N    88_A    118  118  118     94  111  114  115  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     A    89_B     A    89_A    118  118  118     91  111  114  115  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     K    90_B     K    90_A    118  118  118     94  111  114  115  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     S    91_B     S    91_A    118  118  118     94  111  114  115  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     T    92_B     T    92_A    118  118  118     94  111  114  115  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     L    93_B     L    93_A    118  118  118     94  111  114  115  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     W    94_B     W    94_A    118  118  118     94  111  114  115  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     L    95_B     L    95_A    118  118  118     94  111  114  115  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     Q    96_B     Q    96_A    118  118  118     94  111  114  115  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     M    97_B     M    97_A    118  118  118     94  111  114  115  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     N    98_B     N    98_A    118  118  118     94  111  114  115  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     S    99_B     S    99_A    118  118  118     94  111  114  115  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     L   100_B     L   100_A    118  118  118     94  111  114  115  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     K   101_B     K   101_A    118  118  118     94  111  114  115  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     A   102_B     A   102_A    118  118  118     94  111  114  115  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     E   103_B     E   103_A    118  118  118     94  111  114  115  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     D   104_B     D   104_A    118  118  118     94  111  114  115  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     T   105_B     T   105_A    118  118  118     94  111  114  115  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     A   106_B     A   106_A    118  118  118     94  111  114  115  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     V   107_B     V   107_A    118  118  118     94  111  114  115  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     Y   108_B     Y   108_A    118  118  118     94  111  114  115  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     Y   109_B     Y   109_A    118  118  118     94  111  114  115  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     C   110_B     C   110_A    118  118  118     94  111  114  115  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     V   111_B     V   111_A    118  118  118     94  111  114  115  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     V   112_B     V   112_A    118  118  118     94  111  114  115  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     S   113_B     S   113_A    118  118  118     94  111  114  115  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     D   114_B     D   114_A    118  118  118     92  111  114  115  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     N   115_B     N   115_A    118  118  118     93  111  114  115  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     S   116_B     S   116_A    118  118  118      3    3    4    8    9   70  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     G   117_B     G   117_A    118  118  118      3   94  114  115  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     Y   118_B     Y   118_A    118  118  118     52  111  114  115  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     Y   119_B     Y   119_A    118  118  118     94  111  114  115  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     K   120_B     K   120_A    118  118  118     94  111  114  115  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     Y   121_B     Y   121_A    118  118  118     94  111  114  115  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     W   122_B     W   122_A    118  118  118     94  111  114  115  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     G   123_B     G   123_A    118  118  118     94  111  114  115  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     Q   124_B     Q   124_A    118  118  118     94  111  114  115  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     G   125_B     G   125_A    118  118  118     94  111  114  115  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     T   126_B     T   126_A    118  118  118     94  111  114  115  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     Q   127_B     Q   127_A    118  118  118     94  111  114  115  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     V   128_B     V   128_A    118  118  118     94  111  114  115  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     T   129_B     T   129_A    118  118  118     94  111  114  115  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     V   130_B     V   130_A    118  118  118     94  111  114  115  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     S   131_B     S   131_A    118  118  118     94  111  114  115  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     S   132_B     S   132_A    118  118  118     94  111  114  115  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_AVERAGE  LCS_A: 100.00  ( 100.00  100.00  100.00 )

GLOBAL_DISTANCE_TEST (summary information about detected largest sets of residues (represented by selected AToms) that can fit under specified thresholds)
GDT DIST_CUTOFF  0.50   1.00   1.50   2.00   2.50   3.00   3.50   4.00   4.50   5.00   5.50   6.00   6.50   7.00   7.50   8.00   8.50   9.00   9.50  10.00
GDT NUMBER_AT     94    111    114    115    116    117    118    118    118    118    118    118    118    118    118    118    118    118    118    118 
GDT PERCENT_AT  79.66  94.07  96.61  97.46  98.31  99.15 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00
GDT RMS_LOCAL    0.29   0.39   0.45   0.48   0.56   0.65   0.73   0.73   0.73   0.73   0.73   0.73   0.73   0.73   0.73   0.73   0.73   0.73   0.73   0.73
GDT RMS_ALL_AT   0.75   0.74   0.74   0.74   0.73   0.73   0.73   0.73   0.73   0.73   0.73   0.73   0.73   0.73   0.73   0.73   0.73   0.73   0.73   0.73

# Checking swapping
#   possible swapping detected:  E    15_B      E    15_A
#   possible swapping detected:  F    41_B      F    41_A
#   possible swapping detected:  E    60_B      E    60_A
#   possible swapping detected:  E    66_B      E    66_A
#   possible swapping detected:  D    87_B      D    87_A
#   possible swapping detected:  D   104_B      D   104_A
#   possible swapping detected:  Y   108_B      Y   108_A
#   possible swapping detected:  D   114_B      D   114_A
#   possible swapping detected:  Y   121_B      Y   121_A

#      Molecule1      Molecule2  DISTANCE    Mis    MC     All    Dist_max   GDC_mc  GDC_all
LGA    E    15_B      E    15_A     0.645     0    0.673   0.968     7.092   82.738   56.296
LGA    V    16_B      V    16_A     0.670     0    0.039   0.075     0.775   90.476   90.476
LGA    Q    17_B      Q    17_A     0.772     0    0.052   0.763     4.152   90.476   75.132
LGA    L    18_B      L    18_A     0.347     0    0.053   0.082     0.518   97.619   98.810
LGA    V    19_B      V    19_A     0.472     0    0.043   0.065     0.630   97.619   94.558
LGA    E    20_B      E    20_A     0.456     0    0.039   0.108     0.508  100.000   98.942
LGA    S    21_B      S    21_A     0.443     0    0.030   0.092     0.542   97.619   98.413
LGA    G    22_B      G    22_A     0.303     0    0.041   0.041     0.521   97.619   97.619
LGA    G    23_B      G    23_A     0.216     0    0.039   0.039     0.341  100.000  100.000
LGA    G    24_B      G    24_A     0.209     0    0.013   0.013     0.429  100.000  100.000
LGA    L    25_B      L    25_A     0.555     0    0.008   0.068     1.666   92.857   87.202
LGA    V    26_B      V    26_A     0.676     0    0.092   1.122     2.727   97.619   85.986
LGA    L    27_B      L    27_A     0.214     0    0.032   0.212     0.855  100.000   97.619
LGA    P    28_B      P    28_A     0.389     0    0.046   0.059     0.411  100.000  100.000
LGA    G    29_B      G    29_A     0.398     0    0.024   0.024     0.435  100.000  100.000
LGA    G    30_B      G    30_A     0.527     0    0.033   0.033     0.527   97.619   97.619
LGA    S    31_B      S    31_A     0.585     0    0.029   0.067     0.782   90.476   90.476
LGA    L    32_B      L    32_A     0.313     0    0.033   0.106     0.493  100.000  100.000
LGA    K    33_B      K    33_A     0.273     0    0.025   0.725     2.609  100.000   84.392
LGA    L    34_B      L    34_A     0.265     0    0.021   0.034     0.288  100.000  100.000
LGA    S    35_B      S    35_A     0.281     0    0.030   0.054     0.339  100.000  100.000
LGA    C    36_B      C    36_A     0.309     0    0.025   0.041     0.385  100.000  100.000
LGA    A    37_B      A    37_A     0.336     0    0.044   0.053     0.378  100.000  100.000
LGA    A    38_B      A    38_A     0.243     0    0.037   0.054     0.323  100.000  100.000
LGA    S    39_B      S    39_A     0.270     0    0.020   0.031     0.621  100.000   96.825
LGA    G    40_B      G    40_A     0.211     0    0.022   0.022     0.319  100.000  100.000
LGA    F    41_B      F    41_A     0.454     0    0.042   0.073     0.616   97.619   96.537
LGA    N    42_B      N    42_A     0.664     0    0.036   0.133     1.009   90.476   89.345
LGA    F    43_B      F    43_A     0.402     0    0.000   0.122     0.501  100.000   99.134
LGA    G    44_B      G    44_A     0.368     0    0.113   0.113     0.897   95.238   95.238
LGA    S    45_B      S    45_A     0.317     0    0.052   0.099     0.383  100.000  100.000
LGA    S    46_B      S    46_A     0.439     0    0.044   0.639     2.488  100.000   92.540
LGA    D    47_B      D    47_A     0.321     0    0.034   0.161     1.324  100.000   94.107
LGA    M    48_B      M    48_A     0.089     0    0.038   0.057     0.253  100.000  100.000
LGA    N    49_B      N    49_A     0.237     0    0.028   0.137     0.606  100.000   97.619
LGA    W    50_B      W    50_A     0.353     0    0.023   0.049     0.407  100.000  100.000
LGA    V    51_B      V    51_A     0.255     0    0.057   0.080     0.519  100.000   98.639
LGA    R    52_B      R    52_A     0.205     0    0.018   0.051     0.259  100.000  100.000
LGA    Q    53_B      Q    53_A     0.362     0    0.017   0.111     0.793   97.619   94.709
LGA    A    54_B      A    54_A     0.692     0    0.031   0.034     0.874   90.476   90.476
LGA    A    55_B      A    55_A     1.541     0    0.123   0.141     2.005   79.286   76.381
LGA    G    56_B      G    56_A     1.440     0    0.064   0.064     1.472   81.429   81.429
LGA    K    57_B      K    57_A     1.074     0    0.053   0.511     1.804   83.690   82.487
LGA    G    58_B      G    58_A     0.918     0    0.053   0.053     1.019   88.214   88.214
LGA    P    59_B      P    59_A     0.452     0    0.031   0.347     1.444   97.619   93.265
LGA    E    60_B      E    60_A     0.337     0    0.028   0.156     0.747  100.000   98.942
LGA    W    61_B      W    61_A     0.401     0    0.019   0.115     1.071  100.000   92.585
LGA    V    62_B      V    62_A     0.342     0    0.031   0.046     0.553   97.619   98.639
LGA    A    63_B      A    63_A     0.571     0    0.039   0.044     0.574   97.619   96.190
LGA    S    64_B      S    64_A     0.302     0    0.039   0.070     0.689  100.000   96.825
LGA    I    65_B      I    65_A     0.073     0    0.028   0.053     0.180  100.000  100.000
LGA    E    66_B      E    66_A     0.286     0    0.036   0.147     0.721  100.000   98.942
LGA    R    67_B      R    67_A     0.531     0    0.598   1.169     3.392   78.095   75.758
LGA    G    68_B      G    68_A     1.765     0    0.599   0.599     2.110   70.833   70.833
LGA    A    69_B      A    69_A     3.559     1    0.119   0.119     3.884   48.452   38.762
LGA    G    70_B      G    70_A     2.908     0    0.604   0.604     2.963   60.952   60.952
LGA    G    71_B      G    71_A     0.341     0    0.074   0.074     1.421   92.976   92.976
LGA    T    72_B      T    72_A     0.218     0    0.057   0.123     0.254  100.000  100.000
LGA    D    73_B      D    73_A     0.319     0    0.014   0.764     3.447  100.000   83.988
LGA    Y    74_B      Y    74_A     0.331     0    0.053   0.092     0.602   97.619   99.206
LGA    A    75_B      A    75_A     0.330     0    0.024   0.033     0.392  100.000  100.000
LGA    D    76_B      D    76_A     0.455     0    0.044   0.095     0.777  100.000   95.238
LGA    S    77_B      S    77_A     0.331     0    0.042   0.118     0.597  100.000   96.825
LGA    V    78_B      V    78_A     0.252     0    0.020   0.043     0.458  100.000  100.000
LGA    Q    79_B      Q    79_A     0.542     0    0.036   0.950     3.963   92.857   79.153
LGA    G    80_B      G    80_A     0.629     0    0.077   0.077     0.797   90.476   90.476
LGA    R    81_B      R    81_A     0.413     0    0.010   0.098     0.445  100.000  100.000
LGA    F    82_B      F    82_A     0.318     0    0.023   0.043     0.392  100.000  100.000
LGA    T    83_B      T    83_A     0.278     0    0.015   0.091     0.754  100.000   98.639
LGA    V    84_B      V    84_A     0.376     0    0.011   0.068     0.491  100.000  100.000
LGA    S    85_B      S    85_A     0.334     0    0.025   0.066     0.372  100.000  100.000
LGA    R    86_B      R    86_A     0.283     0    0.014   0.075     0.523  100.000   98.268
LGA    D    87_B      D    87_A     0.625     0    0.019   0.233     1.846   97.619   90.714
LGA    N    88_B      N    88_A     0.387     0    0.140   0.217     0.963   97.619   98.810
LGA    A    89_B      A    89_A     0.553     0    0.086   0.085     0.748   92.857   92.381
LGA    K    90_B      K    90_A     0.488     0    0.021   0.157     2.722  100.000   87.090
LGA    S    91_B      S    91_A     0.246     0    0.057   0.062     0.543  100.000   98.413
LGA    T    92_B      T    92_A     0.183     0    0.014   0.040     0.383  100.000  100.000
LGA    L    93_B      L    93_A     0.240     0    0.048   0.052     0.263  100.000  100.000
LGA    W    94_B      W    94_A     0.258     0    0.023   1.104     5.957  100.000   74.184
LGA    L    95_B      L    95_A     0.236     0    0.017   0.029     0.275  100.000  100.000
LGA    Q    96_B      Q    96_A     0.321     0    0.016   0.060     0.435  100.000  100.000
LGA    M    97_B      M    97_A     0.254     0    0.021   0.083     0.340  100.000  100.000
LGA    N    98_B      N    98_A     0.302     0    0.044   0.274     0.918  100.000   97.619
LGA    S    99_B      S    99_A     0.288     0    0.033   0.046     0.288  100.000  100.000
LGA    L   100_B      L   100_A     0.234     0    0.033   0.029     0.361  100.000  100.000
LGA    K   101_B      K   101_A     0.367     0    0.030   0.587     1.693  100.000   87.831
LGA    A   102_B      A   102_A     0.229     0    0.014   0.020     0.306  100.000  100.000
LGA    E   103_B      E   103_A     0.132     0    0.012   1.004     2.871  100.000   81.799
LGA    D   104_B      D   104_A     0.184     0    0.033   0.067     0.387  100.000  100.000
LGA    T   105_B      T   105_A     0.161     0    0.071   0.114     0.325  100.000  100.000
LGA    A   106_B      A   106_A     0.224     0    0.039   0.037     0.224  100.000  100.000
LGA    V   107_B      V   107_A     0.121     0    0.023   0.039     0.235  100.000  100.000
LGA    Y   108_B      Y   108_A     0.147     0    0.017   0.052     0.183  100.000  100.000
LGA    Y   109_B      Y   109_A     0.346     0    0.024   0.079     0.711  100.000   97.619
LGA    C   110_B      C   110_A     0.442     0    0.042   0.063     0.471  100.000  100.000
LGA    V   111_B      V   111_A     0.214     0    0.024   1.037     2.665  100.000   88.639
LGA    V   112_B      V   112_A     0.141     0    0.013   0.054     0.246  100.000  100.000
LGA    S   113_B      S   113_A     0.419     0    0.049   0.112     0.895   97.619   95.238
LGA    D   114_B      D   114_A     0.562     0    0.141   0.839     2.785   86.071   79.643
LGA    N   115_B      N   115_A     0.639     0    0.355   0.325     3.889   95.238   75.536
LGA    S   116_B      S   116_A     3.712     0    0.205   0.619     7.472   59.524   44.921
LGA    G   117_B      G   117_A     1.605     0    0.482   0.482     1.605   86.190   86.190
LGA    Y   118_B      Y   118_A     0.909     0    0.056   1.363     7.859   88.214   59.722
LGA    Y   119_B      Y   119_A     0.499     0    0.030   0.141     1.375   97.619   91.349
LGA    K   120_B      K   120_A     0.409     0    0.080   0.810     4.188  100.000   80.370
LGA    Y   121_B      Y   121_A     0.377     0    0.022   0.261     2.412   97.619   84.802
LGA    W   122_B      W   122_A     0.314     0    0.070   0.092     0.692  100.000   96.599
LGA    G   123_B      G   123_A     0.153     0    0.008   0.008     0.311  100.000  100.000
LGA    Q   124_B      Q   124_A     0.292     0    0.020   1.660     6.822  100.000   69.259
LGA    G   125_B      G   125_A     0.104     0    0.021   0.021     0.154  100.000  100.000
LGA    T   126_B      T   126_A     0.229     0    0.031   0.043     0.400  100.000  100.000
LGA    Q   127_B      Q   127_A     0.256     0    0.008   0.739     3.290  100.000   85.767
LGA    V   128_B      V   128_A     0.110     0    0.020   0.042     0.332  100.000  100.000
LGA    T   129_B      T   129_A     0.239     0    0.046   0.101     0.887  100.000   95.918
LGA    V   130_B      V   130_A     0.093     0    0.018   0.036     0.184  100.000  100.000
LGA    S   131_B      S   131_A     0.185     0    0.074   0.100     0.322  100.000  100.000
LGA    S   132_B      S   132_A     0.460     0    0.096   0.399     0.922   95.238   93.651

# RMSD_GDC results:       CA      MC common percent     ALL common percent   GDC_mc  GDC_all
NUMBER_OF_ATOMS_AA:      118     472    472  100.00     880    880  100.00               118
SUMMARY(RMSD_GDC):     0.732          0.708                  1.187           96.215   92.523

#CA            N1   N2   DIST      N    RMSD    GDT_TS    LGA_S3     LGA_Q 
SUMMARY(GDT)  132  118    4.0    118    0.73    97.881    98.937    14.189

LGA_LOCAL      RMSD:   0.732  Number of atoms:  118  under DIST:   4.00
LGA_ASGN_ATOMS RMSD:   0.732  Number of assigned atoms:  118 
Std_ASGN_ATOMS RMSD:   0.732  Standard rmsd on all 118 assigned CA atoms 

Unitary ROTATION matrix and the SHIFT vector superimpose molecules  (1=>2)
  X_new =  -0.192616 * X  +   0.037425 * Y  +   0.980560 * Z  +  -4.005302
  Y_new =  -0.918407 * X  +  -0.358796 * Y  +  -0.166713 * Z  +  73.768044
  Z_new =   0.345582 * X  +  -0.932665 * Y  +   0.103481 * Z  +  94.233055 

Euler angles from the ROTATION matrix. Conventions XYZ and ZXZ:
           Phi     Theta       Psi   [DEG:       Phi     Theta       Psi ]
XYZ: -1.777528 -0.352859 -1.460297   [DEG: -101.8449  -20.2173  -83.6688 ]
ZXZ:  1.402389  1.467130  2.786745   [DEG:   80.3510   84.0604  159.6687 ]
 
# END of job
