
#######################################################
#                                                     #
#                        LGA                          #
#                  ---------------                    #
#                                                     #
#               Local-Global Alignment                #
#        A Method for Finding 3-D Similarities        #
#               in Protein Structures                 #
#                                                     #
#                  ------------ 10/2009               #
#                                                     #
#      Adam Zemla (adamz@llnl.gov)                    #
#      Lawrence Livermore National Laboratory, CA     #
#                                                     #
#######################################################

!!!   License for LGA program has expired  !!!
#   For updated version of the LGA program   #
# please contact Adam Zemla:  adamz@llnl.gov #

# Molecule1: number of CA atoms  132 ( 1007),  selected  118 , name one
# Molecule2: number of CA atoms  118 (  880),  selected  118 , name two
# PARAMETERS: input.pdb  -ie  -3  -d:4  -sda  -swap  -ch1:B  -ch2:A  
# FIXED Atom-Atom correspondence
# GDT and LCS analysis 

LCS - RMSD CUTOFF   5.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:   118      15_A - 132_A       1.22     1.22
  LCS_AVERAGE:    100.00

LCS - RMSD CUTOFF   2.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:   118      15_A - 132_A       1.22     1.22
  LCS_AVERAGE:    100.00

LCS - RMSD CUTOFF   1.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:   101      15_A - 115_A       0.90     1.24
  LCS_AVERAGE:     74.95

LCS_GDT    MOLECULE-1    MOLECULE-2     LCS_DETAILS     GDT_DETAILS                                                    TOTAL NUMBER OF RESIDUE PAIRS:  118
LCS_GDT     RESIDUE       RESIDUE       SEGMENT_SIZE    GLOBAL DISTANCE TEST COLUMNS: number of residues under the threshold assigned to each residue pair
LCS_GDT   NAME NUMBER   NAME NUMBER    1.0  2.0  5.0    0.5  1.0  1.5  2.0  2.5  3.0  3.5  4.0  4.5  5.0  5.5  6.0  6.5  7.0  7.5  8.0  8.5  9.0  9.5 10.0
LCS_GDT     E    15_B     E    15_A    101  118  118     72  103  109  111  114  114  115  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     V    16_B     V    16_A    101  118  118     73  103  109  111  114  114  115  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     Q    17_B     Q    17_A    101  118  118     68  103  109  111  114  114  115  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     L    18_B     L    18_A    101  118  118     81  103  109  111  114  114  115  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     V    19_B     V    19_A    101  118  118     81  103  109  111  114  114  115  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     E    20_B     E    20_A    101  118  118     81  103  109  111  114  114  115  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     S    21_B     S    21_A    101  118  118     81  103  109  111  114  114  115  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     G    22_B     G    22_A    101  118  118     81  103  109  111  114  114  115  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     G    23_B     G    23_A    101  118  118     81  103  109  111  114  114  115  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     G    24_B     G    24_A    101  118  118     81  103  109  111  114  114  115  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     L    25_B     L    25_A    101  118  118     81  103  109  111  114  114  115  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     V    26_B     V    26_A    101  118  118     71  103  109  111  114  114  115  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     L    27_B     L    27_A    101  118  118     81  103  109  111  114  114  115  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     P    28_B     P    28_A    101  118  118     81  103  109  111  114  114  115  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     G    29_B     G    29_A    101  118  118     48  103  109  111  114  114  115  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     G    30_B     G    30_A    101  118  118     71  103  109  111  114  114  115  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     S    31_B     S    31_A    101  118  118     81  103  109  111  114  114  115  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     L    32_B     L    32_A    101  118  118     81  103  109  111  114  114  115  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     K    33_B     K    33_A    101  118  118     81  103  109  111  114  114  115  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     L    34_B     L    34_A    101  118  118     81  103  109  111  114  114  115  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     S    35_B     S    35_A    101  118  118     81  103  109  111  114  114  115  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     C    36_B     C    36_A    101  118  118     81  103  109  111  114  114  115  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     A    37_B     A    37_A    101  118  118     81  103  109  111  114  114  115  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     A    38_B     A    38_A    101  118  118     81  103  109  111  114  114  115  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     S    39_B     S    39_A    101  118  118     81  103  109  111  114  114  115  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     G    40_B     G    40_A    101  118  118     81  103  109  111  114  114  115  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     F    41_B     F    41_A    101  118  118     81  103  109  111  114  114  115  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     N    42_B     N    42_A    101  118  118     62  103  109  111  114  114  115  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     F    43_B     F    43_A    101  118  118     73  103  109  111  114  114  115  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     G    44_B     G    44_A    101  118  118     81  103  109  111  114  114  115  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     S    45_B     S    45_A    101  118  118     78  103  109  111  114  114  115  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     S    46_B     S    46_A    101  118  118     81  103  109  111  114  114  115  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     D    47_B     D    47_A    101  118  118     76  103  109  111  114  114  115  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     M    48_B     M    48_A    101  118  118     81  103  109  111  114  114  115  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     N    49_B     N    49_A    101  118  118     81  103  109  111  114  114  115  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     W    50_B     W    50_A    101  118  118     81  103  109  111  114  114  115  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     V    51_B     V    51_A    101  118  118     81  103  109  111  114  114  115  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     R    52_B     R    52_A    101  118  118     81  103  109  111  114  114  115  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     Q    53_B     Q    53_A    101  118  118     78  103  109  111  114  114  115  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     A    54_B     A    54_A    101  118  118     25  103  109  111  114  114  115  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     A    55_B     A    55_A    101  118  118     21   70  109  111  114  114  115  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     G    56_B     G    56_A    101  118  118     11   70  104  111  114  114  115  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     K    57_B     K    57_A    101  118  118     25  100  109  111  114  114  115  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     G    58_B     G    58_A    101  118  118     41  103  109  111  114  114  115  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     P    59_B     P    59_A    101  118  118     72  103  109  111  114  114  115  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     E    60_B     E    60_A    101  118  118     81  103  109  111  114  114  115  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     W    61_B     W    61_A    101  118  118     81  103  109  111  114  114  115  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     V    62_B     V    62_A    101  118  118     81  103  109  111  114  114  115  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     A    63_B     A    63_A    101  118  118     81  103  109  111  114  114  115  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     S    64_B     S    64_A    101  118  118     81  103  109  111  114  114  115  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     I    65_B     I    65_A    101  118  118     81  103  109  111  114  114  115  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     E    66_B     E    66_A    101  118  118     79  103  109  111  114  114  115  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     R    67_B     R    67_A    101  118  118     36  103  109  111  114  114  115  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     G    68_B     G    68_A    101  118  118      3   28   64  110  114  114  115  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     A    69_B     A    69_A    101  118  118      3    3    4    5   27  105  115  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     G    70_B     G    70_A    101  118  118      3    3   64  111  114  114  115  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     G    71_B     G    71_A    101  118  118     81  103  109  111  114  114  115  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     T    72_B     T    72_A    101  118  118     81  103  109  111  114  114  115  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     D    73_B     D    73_A    101  118  118     81  103  109  111  114  114  115  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     Y    74_B     Y    74_A    101  118  118     81  103  109  111  114  114  115  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     A    75_B     A    75_A    101  118  118     81  103  109  111  114  114  115  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     D    76_B     D    76_A    101  118  118     81  103  109  111  114  114  115  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     S    77_B     S    77_A    101  118  118     81  103  109  111  114  114  115  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     V    78_B     V    78_A    101  118  118     81  103  109  111  114  114  115  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     Q    79_B     Q    79_A    101  118  118     81  103  109  111  114  114  115  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     G    80_B     G    80_A    101  118  118     74  103  109  111  114  114  115  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     R    81_B     R    81_A    101  118  118     81  103  109  111  114  114  115  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     F    82_B     F    82_A    101  118  118     81  103  109  111  114  114  115  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     T    83_B     T    83_A    101  118  118     81  103  109  111  114  114  115  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     V    84_B     V    84_A    101  118  118     81  103  109  111  114  114  115  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     S    85_B     S    85_A    101  118  118     81  103  109  111  114  114  115  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     R    86_B     R    86_A    101  118  118     81  103  109  111  114  114  115  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     D    87_B     D    87_A    101  118  118     81  103  109  111  114  114  115  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     N    88_B     N    88_A    101  118  118     81  103  109  111  114  114  115  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     A    89_B     A    89_A    101  118  118     68  103  109  111  114  114  115  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     K    90_B     K    90_A    101  118  118     77  103  109  111  114  114  115  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     S    91_B     S    91_A    101  118  118     81  103  109  111  114  114  115  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     T    92_B     T    92_A    101  118  118     81  103  109  111  114  114  115  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     L    93_B     L    93_A    101  118  118     81  103  109  111  114  114  115  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     W    94_B     W    94_A    101  118  118     81  103  109  111  114  114  115  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     L    95_B     L    95_A    101  118  118     81  103  109  111  114  114  115  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     Q    96_B     Q    96_A    101  118  118     81  103  109  111  114  114  115  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     M    97_B     M    97_A    101  118  118     81  103  109  111  114  114  115  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     N    98_B     N    98_A    101  118  118     81  103  109  111  114  114  115  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     S    99_B     S    99_A    101  118  118     71  103  109  111  114  114  115  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     L   100_B     L   100_A    101  118  118     81  103  109  111  114  114  115  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     K   101_B     K   101_A    101  118  118     77  103  109  111  114  114  115  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     A   102_B     A   102_A    101  118  118     81  103  109  111  114  114  115  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     E   103_B     E   103_A    101  118  118     81  103  109  111  114  114  115  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     D   104_B     D   104_A    101  118  118     81  103  109  111  114  114  115  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     T   105_B     T   105_A    101  118  118     81  103  109  111  114  114  115  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     A   106_B     A   106_A    101  118  118     81  103  109  111  114  114  115  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     V   107_B     V   107_A    101  118  118     81  103  109  111  114  114  115  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     Y   108_B     Y   108_A    101  118  118     81  103  109  111  114  114  115  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     Y   109_B     Y   109_A    101  118  118     81  103  109  111  114  114  115  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     C   110_B     C   110_A    101  118  118     81  103  109  111  114  114  115  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     V   111_B     V   111_A    101  118  118     81  103  109  111  114  114  115  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     V   112_B     V   112_A    101  118  118     68  103  109  111  114  114  115  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     S   113_B     S   113_A    101  118  118     16   67  109  111  114  114  115  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     D   114_B     D   114_A    101  118  118     17   93  108  111  114  114  115  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     N   115_B     N   115_A    101  118  118      4    5   33   72  107  113  115  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     S   116_B     S   116_A      5  118  118      4    5   11   16   32   75  112  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     G   117_B     G   117_A      5  118  118      4    4   11   22   56  103  113  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     Y   118_B     Y   118_A     15  118  118     25  101  109  111  114  114  115  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     Y   119_B     Y   119_A     15  118  118     19   98  109  111  114  114  115  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     K   120_B     K   120_A     15  118  118     81  103  109  111  114  114  115  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     Y   121_B     Y   121_A     15  118  118     81  103  109  111  114  114  115  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     W   122_B     W   122_A     15  118  118     81  103  109  111  114  114  115  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     G   123_B     G   123_A     15  118  118     81  103  109  111  114  114  115  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     Q   124_B     Q   124_A     15  118  118     81  103  109  111  114  114  115  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     G   125_B     G   125_A     15  118  118     81  103  109  111  114  114  115  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     T   126_B     T   126_A     15  118  118     81  103  109  111  114  114  115  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     Q   127_B     Q   127_A     15  118  118     81  103  109  111  114  114  115  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     V   128_B     V   128_A     15  118  118     81  103  109  111  114  114  115  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     T   129_B     T   129_A     15  118  118     81  103  109  111  114  114  115  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     V   130_B     V   130_A     15  118  118     81  103  109  111  114  114  115  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     S   131_B     S   131_A     15  118  118     81  103  109  111  114  114  115  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     S   132_B     S   132_A     15  118  118      7   65  103  111  114  114  115  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_AVERAGE  LCS_A:  91.65  (  74.95  100.00  100.00 )

GLOBAL_DISTANCE_TEST (summary information about detected largest sets of residues (represented by selected AToms) that can fit under specified thresholds)
GDT DIST_CUTOFF  0.50   1.00   1.50   2.00   2.50   3.00   3.50   4.00   4.50   5.00   5.50   6.00   6.50   7.00   7.50   8.00   8.50   9.00   9.50  10.00
GDT NUMBER_AT     81    103    109    111    114    114    115    116    118    118    118    118    118    118    118    118    118    118    118    118 
GDT PERCENT_AT  68.64  87.29  92.37  94.07  96.61  96.61  97.46  98.31 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00
GDT RMS_LOCAL    0.29   0.43   0.54   0.60   0.70   0.70   0.77   0.89   1.22   1.22   1.22   1.22   1.22   1.22   1.22   1.22   1.22   1.22   1.22   1.22
GDT RMS_ALL_AT   1.24   1.24   1.25   1.25   1.26   1.26   1.26   1.24   1.22   1.22   1.22   1.22   1.22   1.22   1.22   1.22   1.22   1.22   1.22   1.22

# Checking swapping
#   possible swapping detected:  E    66_B      E    66_A
#   possible swapping detected:  E   103_B      E   103_A

#      Molecule1      Molecule2  DISTANCE    Mis    MC     All    Dist_max   GDC_mc  GDC_all
LGA    E    15_B      E    15_A     0.810     0    0.696   0.963     7.136   84.524   56.402
LGA    V    16_B      V    16_A     0.679     0    0.042   1.197     3.329   88.214   80.816
LGA    Q    17_B      Q    17_A     0.785     0    0.076   1.207     4.887   97.619   70.582
LGA    L    18_B      L    18_A     0.099     0    0.075   1.030     3.493  100.000   89.167
LGA    V    19_B      V    19_A     0.238     0    0.092   1.104     2.319  100.000   89.932
LGA    E    20_B      E    20_A     0.239     0    0.055   0.146     0.509  100.000   98.942
LGA    S    21_B      S    21_A     0.254     0    0.043   0.627     1.835  100.000   93.889
LGA    G    22_B      G    22_A     0.441     0    0.056   0.056     0.659   97.619   97.619
LGA    G    23_B      G    23_A     0.283     0    0.112   0.112     0.733   97.619   97.619
LGA    G    24_B      G    24_A     0.388     0    0.045   0.045     0.615   97.619   97.619
LGA    L    25_B      L    25_A     0.489     0    0.074   1.413     4.265   95.238   82.857
LGA    V    26_B      V    26_A     0.714     0    0.141   0.973     2.696   95.238   84.626
LGA    L    27_B      L    27_A     0.185     0    0.084   1.317     3.218   97.619   83.810
LGA    P    28_B      P    28_A     0.415     0    0.633   0.616     2.687   86.905   87.279
LGA    G    29_B      G    29_A     1.267     0    0.055   0.055     1.526   83.810   83.810
LGA    G    30_B      G    30_A     0.761     0    0.024   0.024     0.812   92.857   92.857
LGA    S    31_B      S    31_A     0.439     0    0.029   0.673     2.645   92.857   88.095
LGA    L    32_B      L    32_A     0.445     0    0.064   0.842     3.127   97.619   87.857
LGA    K    33_B      K    33_A     0.393     0    0.032   1.008     4.640   97.619   81.693
LGA    L    34_B      L    34_A     0.231     0    0.031   0.928     2.491  100.000   91.190
LGA    S    35_B      S    35_A     0.159     0    0.022   0.041     0.254  100.000  100.000
LGA    C    36_B      C    36_A     0.147     0    0.013   0.049     0.192  100.000  100.000
LGA    A    37_B      A    37_A     0.319     0    0.073   0.079     0.463  100.000  100.000
LGA    A    38_B      A    38_A     0.271     0    0.054   0.068     0.409  100.000  100.000
LGA    S    39_B      S    39_A     0.262     0    0.018   0.092     0.776  100.000   96.825
LGA    G    40_B      G    40_A     0.288     0    0.092   0.092     0.753   97.619   97.619
LGA    F    41_B      F    41_A     0.431     0    0.032   0.158     0.718  100.000   95.671
LGA    N    42_B      N    42_A     0.783     0    0.162   0.988     3.807   90.476   77.024
LGA    F    43_B      F    43_A     0.604     0    0.034   0.140     0.840   95.238   95.671
LGA    G    44_B      G    44_A     0.581     0    0.022   0.022     0.668   95.238   95.238
LGA    S    45_B      S    45_A     0.650     0    0.118   0.657     1.263   97.619   92.222
LGA    S    46_B      S    46_A     0.423     0    0.115   0.151     1.355  100.000   95.317
LGA    D    47_B      D    47_A     0.503     0    0.095   0.192     1.319   92.857   90.536
LGA    M    48_B      M    48_A     0.372     0    0.043   0.104     0.562   97.619   98.810
LGA    N    49_B      N    49_A     0.136     0    0.051   0.832     2.109  100.000   92.202
LGA    W    50_B      W    50_A     0.297     0    0.040   0.058     0.548  100.000   98.639
LGA    V    51_B      V    51_A     0.230     0    0.101   1.162     2.999   97.619   87.483
LGA    R    52_B      R    52_A     0.316     0    0.038   0.596     2.078   97.619   95.065
LGA    Q    53_B      Q    53_A     0.472     0    0.025   0.484     2.195   95.238   88.730
LGA    A    54_B      A    54_A     0.997     0    0.048   0.056     1.136   85.952   85.048
LGA    A    55_B      A    55_A     1.584     0    0.029   0.034     1.819   75.000   74.571
LGA    G    56_B      G    56_A     2.060     0    0.059   0.059     2.060   70.833   70.833
LGA    K    57_B      K    57_A     1.464     0    0.027   0.860     4.498   79.286   67.354
LGA    G    58_B      G    58_A     0.974     0    0.043   0.043     1.108   88.214   88.214
LGA    P    59_B      P    59_A     0.643     0    0.051   0.074     1.159   95.238   90.612
LGA    E    60_B      E    60_A     0.263     0    0.102   0.547     1.722   97.619   94.868
LGA    W    61_B      W    61_A     0.309     0    0.024   0.142     0.534  100.000   97.279
LGA    V    62_B      V    62_A     0.306     0    0.066   0.093     0.615   97.619   97.279
LGA    A    63_B      A    63_A     0.450     0    0.069   0.078     0.546  100.000   98.095
LGA    S    64_B      S    64_A     0.321     0    0.012   0.068     1.268   97.619   93.730
LGA    I    65_B      I    65_A     0.097     0    0.056   0.545     1.752  100.000   96.607
LGA    E    66_B      E    66_A     0.478     0    0.068   0.666     3.307   95.238   75.661
LGA    R    67_B      R    67_A     0.945     0    0.587   1.358     4.031   78.095   69.394
LGA    G    68_B      G    68_A     2.423     0    0.459   0.459     2.553   62.857   62.857
LGA    A    69_B      A    69_A     3.512     1    0.110   0.110     3.578   50.238   40.190
LGA    G    70_B      G    70_A     2.366     0    0.497   0.497     2.885   66.905   66.905
LGA    G    71_B      G    71_A     0.486     0    0.068   0.068     0.740   97.619   97.619
LGA    T    72_B      T    72_A     0.535     0    0.059   0.114     1.045   90.476   87.891
LGA    D    73_B      D    73_A     0.680     0    0.076   0.280     1.863   97.619   87.381
LGA    Y    74_B      Y    74_A     0.153     0    0.048   0.071     0.332  100.000  100.000
LGA    A    75_B      A    75_A     0.155     0    0.087   0.095     0.266  100.000  100.000
LGA    D    76_B      D    76_A     0.548     0    0.025   0.291     1.356   92.857   90.536
LGA    S    77_B      S    77_A     0.546     0    0.178   0.210     0.903   92.857   92.063
LGA    V    78_B      V    78_A     0.510     0    0.050   0.137     0.804   95.238   93.197
LGA    Q    79_B      Q    79_A     0.630     0    0.060   1.049     5.998   92.857   68.307
LGA    G    80_B      G    80_A     0.742     0    0.184   0.184     1.571   86.071   86.071
LGA    R    81_B      R    81_A     0.201     0    0.026   0.125     0.380  100.000  100.000
LGA    F    82_B      F    82_A     0.220     0    0.021   0.241     0.772  100.000   98.268
LGA    T    83_B      T    83_A     0.161     0    0.016   0.050     0.213  100.000  100.000
LGA    V    84_B      V    84_A     0.228     0    0.030   1.098     2.708  100.000   88.844
LGA    S    85_B      S    85_A     0.200     0    0.037   0.644     2.398  100.000   94.127
LGA    R    86_B      R    86_A     0.296     0    0.024   0.998     2.527  100.000   90.216
LGA    D    87_B      D    87_A     0.375     0    0.017   0.359     1.163  100.000   96.488
LGA    N    88_B      N    88_A     0.322     0    0.022   0.079     0.547   95.238   97.619
LGA    A    89_B      A    89_A     0.829     0    0.085   0.083     1.105   90.476   88.667
LGA    K    90_B      K    90_A     0.543     0    0.122   0.781     3.323   95.238   84.127
LGA    S    91_B      S    91_A     0.338     0    0.068   0.696     1.676  100.000   93.889
LGA    T    92_B      T    92_A     0.235     0    0.090   0.100     0.788  100.000   98.639
LGA    L    93_B      L    93_A     0.201     0    0.039   0.088     0.457  100.000  100.000
LGA    W    94_B      W    94_A     0.352     0    0.035   1.127     4.695  100.000   76.293
LGA    L    95_B      L    95_A     0.332     0    0.025   1.017     2.397  100.000   91.012
LGA    Q    96_B      Q    96_A     0.402     0    0.030   0.114     1.159  100.000   95.820
LGA    M    97_B      M    97_A     0.367     0    0.015   0.156     0.588  100.000   98.810
LGA    N    98_B      N    98_A     0.489     0    0.048   1.112     2.527  100.000   87.857
LGA    S    99_B      S    99_A     0.705     0    0.042   0.725     2.033   90.476   86.190
LGA    L   100_B      L   100_A     0.527     0    0.017   0.687     2.262   92.857   87.440
LGA    K   101_B      K   101_A     0.545     0    0.034   0.746     1.358   97.619   90.635
LGA    A   102_B      A   102_A     0.348     0    0.044   0.054     0.430  100.000  100.000
LGA    E   103_B      E   103_A     0.152     0    0.121   0.787     3.931   97.619   79.471
LGA    D   104_B      D   104_A     0.118     0    0.059   0.197     0.869  100.000   98.810
LGA    T   105_B      T   105_A     0.078     0    0.024   0.105     0.423  100.000  100.000
LGA    A   106_B      A   106_A     0.198     0    0.054   0.064     0.414  100.000  100.000
LGA    V   107_B      V   107_A     0.191     0    0.046   1.133     2.636  100.000   88.844
LGA    Y   108_B      Y   108_A     0.188     0    0.023   0.078     0.251  100.000  100.000
LGA    Y   109_B      Y   109_A     0.470     0    0.036   0.127     1.178   97.619   92.897
LGA    C   110_B      C   110_A     0.445     0    0.041   0.078     0.542   97.619   98.413
LGA    V   111_B      V   111_A     0.139     0    0.073   1.101     2.598   97.619   88.639
LGA    V   112_B      V   112_A     0.641     0    0.085   1.018     2.099   92.857   85.646
LGA    S   113_B      S   113_A     1.559     0    0.053   0.227     3.840   75.119   66.825
LGA    D   114_B      D   114_A     1.951     0    0.038   0.520     6.227   67.143   52.024
LGA    N   115_B      N   115_A     4.814     0    0.034   1.129     6.913   27.381   29.702
LGA    S   116_B      S   116_A     7.185     0    0.337   0.371     7.713   13.452   12.381
LGA    G   117_B      G   117_A     6.117     0    0.703   0.703     6.347   27.262   27.262
LGA    Y   118_B      Y   118_A     1.316     0    0.578   1.222    11.559   79.286   36.627
LGA    Y   119_B      Y   119_A     1.273     0    0.149   0.409     1.614   83.690   82.262
LGA    K   120_B      K   120_A     0.407     0    0.694   0.612     4.127   80.476   69.947
LGA    Y   121_B      Y   121_A     0.416     0    0.081   0.153     1.476   97.619   92.183
LGA    W   122_B      W   122_A     0.084     0    0.096   1.164     6.564  100.000   72.551
LGA    G   123_B      G   123_A     0.060     0    0.063   0.063     0.186  100.000  100.000
LGA    Q   124_B      Q   124_A     0.037     0    0.098   1.031     5.329   97.619   73.545
LGA    G   125_B      G   125_A     0.081     0    0.049   0.049     0.282  100.000  100.000
LGA    T   126_B      T   126_A     0.243     0    0.088   0.116     0.668   97.619   97.279
LGA    Q   127_B      Q   127_A     0.199     0    0.046   1.085     2.368  100.000   88.995
LGA    V   128_B      V   128_A     0.249     0    0.022   0.079     0.424  100.000  100.000
LGA    T   129_B      T   129_A     0.143     0    0.021   0.079     0.590  100.000   98.639
LGA    V   130_B      V   130_A     0.214     0    0.054   0.081     0.493  100.000  100.000
LGA    S   131_B      S   131_A     0.397     0    0.097   0.687     2.978   84.643   76.746
LGA    S   132_B      S   132_A     2.366     0    0.133   0.786     3.450   61.548   60.159

# RMSD_GDC results:       CA      MC common percent     ALL common percent   GDC_mc  GDC_all
NUMBER_OF_ATOMS_AA:      118     472    472  100.00     880    880  100.00               118
SUMMARY(RMSD_GDC):     1.222          1.229                  1.748           92.242   86.619

#CA            N1   N2   DIST      N    RMSD    GDT_TS    LGA_S3     LGA_Q 
SUMMARY(GDT)  132  118    4.0    116    0.89    94.915    97.346    11.664

LGA_LOCAL      RMSD:   0.895  Number of atoms:  116  under DIST:   4.00
LGA_ASGN_ATOMS RMSD:   1.241  Number of assigned atoms:  118 
Std_ASGN_ATOMS RMSD:   1.222  Standard rmsd on all 118 assigned CA atoms 

Unitary ROTATION matrix and the SHIFT vector superimpose molecules  (1=>2)
  X_new =  -0.416789 * X  +  -0.562730 * Y  +   0.713878 * Z  +  -8.009281
  Y_new =  -0.908984 * X  +   0.252912 * Y  +  -0.331336 * Z  + -31.559540
  Z_new =   0.005904 * X  +  -0.787001 * Y  +  -0.616923 * Z  +  73.544724 

Euler angles from the ROTATION matrix. Conventions XYZ and ZXZ:
           Phi     Theta       Psi   [DEG:       Phi     Theta       Psi ]
XYZ: -2.000714 -0.005904 -2.235637   [DEG: -114.6325   -0.3383 -128.0926 ]
ZXZ:  1.136250  2.235624  3.134090   [DEG:   65.1023  128.0918  179.5702 ]
 
# END of job
