
#######################################################
#                                                     #
#                        LGA                          #
#                  ---------------                    #
#                                                     #
#               Local-Global Alignment                #
#        A Method for Finding 3-D Similarities        #
#               in Protein Structures                 #
#                                                     #
#                  ------------ 10/2009               #
#                                                     #
#      Adam Zemla (adamz@llnl.gov)                    #
#      Lawrence Livermore National Laboratory, CA     #
#                                                     #
#######################################################

!!!   License for LGA program has expired  !!!
#   For updated version of the LGA program   #
# please contact Adam Zemla:  adamz@llnl.gov #

# Molecule1: number of CA atoms  132 ( 1007),  selected  118 , name one
# Molecule2: number of CA atoms  118 (  880),  selected  118 , name two
# PARAMETERS: input.pdb  -ie  -3  -d:4  -sda  -swap  -ch1:B  -ch2:A  
# FIXED Atom-Atom correspondence
# GDT and LCS analysis 

LCS - RMSD CUTOFF   5.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:   118      15_A - 132_A       0.83     0.83
  LCS_AVERAGE:    100.00

LCS - RMSD CUTOFF   2.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:   118      15_A - 132_A       0.83     0.83
  LCS_AVERAGE:    100.00

LCS - RMSD CUTOFF   1.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:   118      15_A - 132_A       0.83     0.83
  LCS_AVERAGE:    100.00

LCS_GDT    MOLECULE-1    MOLECULE-2     LCS_DETAILS     GDT_DETAILS                                                    TOTAL NUMBER OF RESIDUE PAIRS:  118
LCS_GDT     RESIDUE       RESIDUE       SEGMENT_SIZE    GLOBAL DISTANCE TEST COLUMNS: number of residues under the threshold assigned to each residue pair
LCS_GDT   NAME NUMBER   NAME NUMBER    1.0  2.0  5.0    0.5  1.0  1.5  2.0  2.5  3.0  3.5  4.0  4.5  5.0  5.5  6.0  6.5  7.0  7.5  8.0  8.5  9.0  9.5 10.0
LCS_GDT     E    15_B     E    15_A    118  118  118     34   95  111  114  116  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     V    16_B     V    16_A    118  118  118     23  106  111  114  116  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     Q    17_B     Q    17_A    118  118  118     81  106  111  114  116  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     L    18_B     L    18_A    118  118  118     84  106  111  114  116  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     V    19_B     V    19_A    118  118  118     84  106  111  114  116  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     E    20_B     E    20_A    118  118  118     84  106  111  114  116  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     S    21_B     S    21_A    118  118  118     84  106  111  114  116  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     G    22_B     G    22_A    118  118  118     84  106  111  114  116  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     G    23_B     G    23_A    118  118  118     84  106  111  114  116  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     G    24_B     G    24_A    118  118  118     84  106  111  114  116  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     L    25_B     L    25_A    118  118  118     84  106  111  114  116  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     V    26_B     V    26_A    118  118  118     80  106  111  114  116  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     L    27_B     L    27_A    118  118  118     84  106  111  114  116  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     P    28_B     P    28_A    118  118  118     84  106  111  114  116  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     G    29_B     G    29_A    118  118  118     84  106  111  114  116  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     G    30_B     G    30_A    118  118  118     84  106  111  114  116  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     S    31_B     S    31_A    118  118  118     84  106  111  114  116  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     L    32_B     L    32_A    118  118  118     84  106  111  114  116  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     K    33_B     K    33_A    118  118  118     84  106  111  114  116  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     L    34_B     L    34_A    118  118  118     84  106  111  114  116  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     S    35_B     S    35_A    118  118  118     84  106  111  114  116  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     C    36_B     C    36_A    118  118  118     84  106  111  114  116  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     A    37_B     A    37_A    118  118  118     84  106  111  114  116  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     A    38_B     A    38_A    118  118  118     84  106  111  114  116  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     S    39_B     S    39_A    118  118  118     84  106  111  114  116  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     G    40_B     G    40_A    118  118  118     72  106  111  114  116  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     F    41_B     F    41_A    118  118  118     15  106  111  114  116  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     N    42_B     N    42_A    118  118  118     43  106  111  114  116  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     F    43_B     F    43_A    118  118  118     84  106  111  114  116  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     G    44_B     G    44_A    118  118  118     84  106  111  114  116  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     S    45_B     S    45_A    118  118  118     13  106  111  114  116  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     S    46_B     S    46_A    118  118  118     79  106  111  114  116  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     D    47_B     D    47_A    118  118  118     84  106  111  114  116  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     M    48_B     M    48_A    118  118  118     84  106  111  114  116  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     N    49_B     N    49_A    118  118  118     84  106  111  114  116  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     W    50_B     W    50_A    118  118  118     84  106  111  114  116  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     V    51_B     V    51_A    118  118  118     84  106  111  114  116  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     R    52_B     R    52_A    118  118  118     84  106  111  114  116  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     Q    53_B     Q    53_A    118  118  118     84  106  111  114  116  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     A    54_B     A    54_A    118  118  118     17  106  111  114  116  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     A    55_B     A    55_A    118  118  118     17   83  111  114  116  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     G    56_B     G    56_A    118  118  118     17   89  111  114  116  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     K    57_B     K    57_A    118  118  118     17  104  111  114  116  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     G    58_B     G    58_A    118  118  118     42  106  111  114  116  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     P    59_B     P    59_A    118  118  118     79  106  111  114  116  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     E    60_B     E    60_A    118  118  118     84  106  111  114  116  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     W    61_B     W    61_A    118  118  118     84  106  111  114  116  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     V    62_B     V    62_A    118  118  118     84  106  111  114  116  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     A    63_B     A    63_A    118  118  118     84  106  111  114  116  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     S    64_B     S    64_A    118  118  118     84  106  111  114  116  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     I    65_B     I    65_A    118  118  118     84  106  111  114  116  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     E    66_B     E    66_A    118  118  118     84  106  111  114  116  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     R    67_B     R    67_A    118  118  118     64  106  111  114  116  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     G    68_B     G    68_A    118  118  118      3   36  107  114  116  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     A    69_B     A    69_A    118  118  118      3    4    5    5   55   66  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     G    70_B     G    70_A    118  118  118      3   26   47  108  115  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     G    71_B     G    71_A    118  118  118     79  106  111  114  116  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     T    72_B     T    72_A    118  118  118     84  106  111  114  116  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     D    73_B     D    73_A    118  118  118     84  106  111  114  116  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     Y    74_B     Y    74_A    118  118  118     84  106  111  114  116  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     A    75_B     A    75_A    118  118  118     84  106  111  114  116  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     D    76_B     D    76_A    118  118  118     84  106  111  114  116  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     S    77_B     S    77_A    118  118  118     72  106  111  114  116  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     V    78_B     V    78_A    118  118  118     84  106  111  114  116  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     Q    79_B     Q    79_A    118  118  118     80  106  111  114  116  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     G    80_B     G    80_A    118  118  118     84  106  111  114  116  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     R    81_B     R    81_A    118  118  118     84  106  111  114  116  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     F    82_B     F    82_A    118  118  118     84  106  111  114  116  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     T    83_B     T    83_A    118  118  118     84  106  111  114  116  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     V    84_B     V    84_A    118  118  118     84  106  111  114  116  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     S    85_B     S    85_A    118  118  118     84  106  111  114  116  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     R    86_B     R    86_A    118  118  118     84  106  111  114  116  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     D    87_B     D    87_A    118  118  118     84  106  111  114  116  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     N    88_B     N    88_A    118  118  118     84  106  111  114  116  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     A    89_B     A    89_A    118  118  118     84  106  111  114  116  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     K    90_B     K    90_A    118  118  118     84  106  111  114  116  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     S    91_B     S    91_A    118  118  118     84  106  111  114  116  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     T    92_B     T    92_A    118  118  118     84  106  111  114  116  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     L    93_B     L    93_A    118  118  118     84  106  111  114  116  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     W    94_B     W    94_A    118  118  118     84  106  111  114  116  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     L    95_B     L    95_A    118  118  118     84  106  111  114  116  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     Q    96_B     Q    96_A    118  118  118     84  106  111  114  116  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     M    97_B     M    97_A    118  118  118     84  106  111  114  116  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     N    98_B     N    98_A    118  118  118     84  106  111  114  116  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     S    99_B     S    99_A    118  118  118     84  106  111  114  116  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     L   100_B     L   100_A    118  118  118     84  106  111  114  116  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     K   101_B     K   101_A    118  118  118     84  106  111  114  116  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     A   102_B     A   102_A    118  118  118     84  106  111  114  116  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     E   103_B     E   103_A    118  118  118     84  106  111  114  116  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     D   104_B     D   104_A    118  118  118     84  106  111  114  116  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     T   105_B     T   105_A    118  118  118     80  106  111  114  116  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     A   106_B     A   106_A    118  118  118     84  106  111  114  116  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     V   107_B     V   107_A    118  118  118     84  106  111  114  116  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     Y   108_B     Y   108_A    118  118  118     84  106  111  114  116  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     Y   109_B     Y   109_A    118  118  118     84  106  111  114  116  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     C   110_B     C   110_A    118  118  118     84  106  111  114  116  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     V   111_B     V   111_A    118  118  118     84  106  111  114  116  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     V   112_B     V   112_A    118  118  118     84  106  111  114  116  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     S   113_B     S   113_A    118  118  118     84  106  111  114  116  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     D   114_B     D   114_A    118  118  118     78  106  111  114  116  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     N   115_B     N   115_A    118  118  118     20   76  109  114  116  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     S   116_B     S   116_A    118  118  118      4   31   59   96  116  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     G   117_B     G   117_A    118  118  118      3   26   89  114  116  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     Y   118_B     Y   118_A    118  118  118     10  102  111  114  116  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     Y   119_B     Y   119_A    118  118  118     49  106  111  114  116  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     K   120_B     K   120_A    118  118  118     49  106  111  114  116  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     Y   121_B     Y   121_A    118  118  118     73  106  111  114  116  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     W   122_B     W   122_A    118  118  118     84  106  111  114  116  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     G   123_B     G   123_A    118  118  118     84  106  111  114  116  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     Q   124_B     Q   124_A    118  118  118     84  106  111  114  116  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     G   125_B     G   125_A    118  118  118     84  106  111  114  116  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     T   126_B     T   126_A    118  118  118     84  106  111  114  116  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     Q   127_B     Q   127_A    118  118  118     84  106  111  114  116  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     V   128_B     V   128_A    118  118  118     84  106  111  114  116  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     T   129_B     T   129_A    118  118  118     84  106  111  114  116  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     V   130_B     V   130_A    118  118  118     72  106  111  114  116  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     S   131_B     S   131_A    118  118  118     34  106  111  114  116  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     S   132_B     S   132_A    118  118  118     30  106  111  114  116  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_AVERAGE  LCS_A: 100.00  ( 100.00  100.00  100.00 )

GLOBAL_DISTANCE_TEST (summary information about detected largest sets of residues (represented by selected AToms) that can fit under specified thresholds)
GDT DIST_CUTOFF  0.50   1.00   1.50   2.00   2.50   3.00   3.50   4.00   4.50   5.00   5.50   6.00   6.50   7.00   7.50   8.00   8.50   9.00   9.50  10.00
GDT NUMBER_AT     84    106    111    114    116    116    118    118    118    118    118    118    118    118    118    118    118    118    118    118 
GDT PERCENT_AT  71.19  89.83  94.07  96.61  98.31  98.31 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00
GDT RMS_LOCAL    0.30   0.43   0.52   0.59   0.70   0.69   0.83   0.83   0.83   0.83   0.83   0.83   0.83   0.83   0.83   0.83   0.83   0.83   0.83   0.83
GDT RMS_ALL_AT   0.84   0.84   0.83   0.83   0.83   0.83   0.83   0.83   0.83   0.83   0.83   0.83   0.83   0.83   0.83   0.83   0.83   0.83   0.83   0.83

# Checking swapping
#   possible swapping detected:  E    15_B      E    15_A
#   possible swapping detected:  D    47_B      D    47_A
#   possible swapping detected:  E    60_B      E    60_A
#   possible swapping detected:  E    66_B      E    66_A
#   possible swapping detected:  D   114_B      D   114_A
#   possible swapping detected:  Y   118_B      Y   118_A
#   possible swapping detected:  Y   119_B      Y   119_A

#      Molecule1      Molecule2  DISTANCE    Mis    MC     All    Dist_max   GDC_mc  GDC_all
LGA    E    15_B      E    15_A     1.713     0    0.328   1.068     2.870   72.976   71.217
LGA    V    16_B      V    16_A     0.946     0    0.113   1.051     3.089   88.214   79.592
LGA    Q    17_B      Q    17_A     0.618     0    0.067   1.201     3.780   97.619   82.540
LGA    L    18_B      L    18_A     0.299     0    0.061   0.925     3.375   97.619   87.976
LGA    V    19_B      V    19_A     0.543     0    0.099   0.092     0.984   95.238   93.197
LGA    E    20_B      E    20_A     0.279     0    0.045   0.145     0.606  100.000   98.942
LGA    S    21_B      S    21_A     0.273     0    0.034   0.648     2.100  100.000   94.127
LGA    G    22_B      G    22_A     0.218     0    0.052   0.052     0.477  100.000  100.000
LGA    G    23_B      G    23_A     0.258     0    0.048   0.048     0.267  100.000  100.000
LGA    G    24_B      G    24_A     0.230     0    0.021   0.021     0.290  100.000  100.000
LGA    L    25_B      L    25_A     0.278     0    0.034   0.929     4.611  100.000   81.667
LGA    V    26_B      V    26_A     0.515     0    0.116   1.031     2.443   95.238   87.007
LGA    L    27_B      L    27_A     0.338     0    0.111   0.852     3.195   97.619   85.774
LGA    P    28_B      P    28_A     0.401     0    0.040   0.084     0.444  100.000  100.000
LGA    G    29_B      G    29_A     0.370     0    0.046   0.046     0.472  100.000  100.000
LGA    G    30_B      G    30_A     0.369     0    0.063   0.063     0.369  100.000  100.000
LGA    S    31_B      S    31_A     0.072     0    0.023   0.027     0.248  100.000  100.000
LGA    L    32_B      L    32_A     0.137     0    0.052   0.098     0.645  100.000   98.810
LGA    K    33_B      K    33_A     0.070     0    0.018   0.935     3.719  100.000   87.725
LGA    L    34_B      L    34_A     0.159     0    0.041   1.077     2.450  100.000   91.190
LGA    S    35_B      S    35_A     0.431     0    0.024   0.707     1.480  100.000   95.317
LGA    C    36_B      C    36_A     0.186     0    0.129   0.205     1.034  100.000   95.317
LGA    A    37_B      A    37_A     0.301     0    0.086   0.099     0.493  100.000  100.000
LGA    A    38_B      A    38_A     0.334     0    0.050   0.064     0.554  100.000   98.095
LGA    S    39_B      S    39_A     0.456     0    0.039   0.600     1.968   95.238   90.714
LGA    G    40_B      G    40_A     0.690     0    0.059   0.059     0.796   90.476   90.476
LGA    F    41_B      F    41_A     1.073     0    0.096   0.153     1.588   83.690   80.693
LGA    N    42_B      N    42_A     0.935     0    0.101   0.265     2.060   90.476   85.000
LGA    F    43_B      F    43_A     0.516     0    0.033   0.140     0.670   95.238   95.671
LGA    G    44_B      G    44_A     0.111     0    0.034   0.034     0.506   97.619   97.619
LGA    S    45_B      S    45_A     0.872     0    0.129   0.600     1.636   97.619   90.794
LGA    S    46_B      S    46_A     0.631     0    0.136   0.681     3.254   97.619   86.984
LGA    D    47_B      D    47_A     0.275     0    0.079   0.904     4.073  100.000   81.488
LGA    M    48_B      M    48_A     0.060     0    0.046   0.572     1.806  100.000   94.226
LGA    N    49_B      N    49_A     0.375     0    0.043   0.379     0.900  100.000   97.619
LGA    W    50_B      W    50_A     0.375     0    0.024   0.079     0.508   97.619   99.320
LGA    V    51_B      V    51_A     0.200     0    0.061   0.094     0.593  100.000   97.279
LGA    R    52_B      R    52_A     0.194     0    0.034   0.969     3.044  100.000   89.524
LGA    Q    53_B      Q    53_A     0.388     0    0.028   0.291     2.054   95.238   88.730
LGA    A    54_B      A    54_A     1.017     0    0.040   0.052     1.114   83.690   85.048
LGA    A    55_B      A    55_A     1.509     0    0.043   0.053     1.668   75.000   74.571
LGA    G    56_B      G    56_A     1.582     0    0.086   0.086     1.874   72.857   72.857
LGA    K    57_B      K    57_A     1.184     0    0.043   0.728     2.606   83.690   77.884
LGA    G    58_B      G    58_A     0.989     0    0.077   0.077     1.133   88.214   88.214
LGA    P    59_B      P    59_A     0.728     0    0.028   0.142     1.010   90.476   89.184
LGA    E    60_B      E    60_A     0.377     0    0.081   0.585     1.621  100.000   90.741
LGA    W    61_B      W    61_A     0.241     0    0.042   0.148     0.666   97.619   95.918
LGA    V    62_B      V    62_A     0.155     0    0.059   0.092     0.469  100.000  100.000
LGA    A    63_B      A    63_A     0.320     0    0.063   0.073     0.391  100.000  100.000
LGA    S    64_B      S    64_A     0.116     0    0.047   0.629     2.783  100.000   92.857
LGA    I    65_B      I    65_A     0.183     0    0.072   0.093     0.581  100.000   98.810
LGA    E    66_B      E    66_A     0.552     0    0.068   0.598     2.596   95.238   80.317
LGA    R    67_B      R    67_A     0.759     0    0.582   1.285     6.032   78.095   64.242
LGA    G    68_B      G    68_A     2.000     0    0.428   0.428     2.027   70.833   70.833
LGA    A    69_B      A    69_A     3.711     1    0.052   0.052     3.892   46.667   37.333
LGA    G    70_B      G    70_A     3.038     0    0.479   0.479     3.038   59.167   59.167
LGA    G    71_B      G    71_A     0.651     0    0.092   0.092     1.398   88.214   88.214
LGA    T    72_B      T    72_A     0.339     0    0.051   1.006     2.215  100.000   89.932
LGA    D    73_B      D    73_A     0.391     0    0.003   0.755     3.378  100.000   81.905
LGA    Y    74_B      Y    74_A     0.261     0    0.065   0.079     0.368  100.000  100.000
LGA    A    75_B      A    75_A     0.221     0    0.083   0.094     0.254  100.000  100.000
LGA    D    76_B      D    76_A     0.272     0    0.014   0.160     0.616   97.619   97.619
LGA    S    77_B      S    77_A     0.724     0    0.154   0.195     1.211   95.238   90.635
LGA    V    78_B      V    78_A     0.255     0    0.063   0.148     0.550   97.619   95.918
LGA    Q    79_B      Q    79_A     0.490     0    0.078   1.309     4.809  100.000   80.582
LGA    G    80_B      G    80_A     0.329     0    0.166   0.166     1.176   95.357   95.357
LGA    R    81_B      R    81_A     0.107     0    0.027   0.171     0.595  100.000   97.403
LGA    F    82_B      F    82_A     0.155     0    0.025   0.356     0.887  100.000   96.537
LGA    T    83_B      T    83_A     0.065     0    0.025   0.054     0.169  100.000  100.000
LGA    V    84_B      V    84_A     0.116     0    0.044   1.073     2.465  100.000   89.932
LGA    S    85_B      S    85_A     0.144     0    0.042   0.617     2.387  100.000   94.127
LGA    R    86_B      R    86_A     0.269     0    0.024   1.028     2.318  100.000   90.173
LGA    D    87_B      D    87_A     0.469     0    0.026   0.701     1.623  100.000   92.024
LGA    N    88_B      N    88_A     0.386     0    0.017   0.061     0.439  100.000  100.000
LGA    A    89_B      A    89_A     0.369     0    0.059   0.058     0.589  100.000   98.095
LGA    K    90_B      K    90_A     0.210     0    0.122   0.650     2.580   97.619   81.587
LGA    S    91_B      S    91_A     0.165     0    0.033   0.057     0.437  100.000  100.000
LGA    T    92_B      T    92_A     0.335     0    0.085   1.102     2.462  100.000   89.728
LGA    L    93_B      L    93_A     0.113     0    0.049   0.101     0.668  100.000   97.619
LGA    W    94_B      W    94_A     0.254     0    0.021   1.111     6.086  100.000   72.959
LGA    L    95_B      L    95_A     0.214     0    0.041   1.038     2.216  100.000   91.190
LGA    Q    96_B      Q    96_A     0.281     0    0.027   0.159     0.612  100.000   97.884
LGA    M    97_B      M    97_A     0.072     0    0.023   0.064     0.309  100.000  100.000
LGA    N    98_B      N    98_A     0.158     0    0.042   1.073     2.275  100.000   91.190
LGA    S    99_B      S    99_A     0.414     0    0.063   0.062     0.577  100.000   98.413
LGA    L   100_B      L   100_A     0.233     0    0.000   0.276     0.873  100.000   97.619
LGA    K   101_B      K   101_A     0.512     0    0.040   0.776     3.345   97.619   85.185
LGA    A   102_B      A   102_A     0.571     0    0.038   0.044     0.752   92.857   92.381
LGA    E   103_B      E   103_A     0.606     0    0.080   0.930     3.676   92.857   72.804
LGA    D   104_B      D   104_A     0.480     0    0.089   0.138     0.511  100.000   98.810
LGA    T   105_B      T   105_A     0.536     0    0.016   0.085     0.801   95.238   93.197
LGA    A   106_B      A   106_A     0.293     0    0.050   0.060     0.473  100.000  100.000
LGA    V   107_B      V   107_A     0.195     0    0.053   0.099     0.467  100.000  100.000
LGA    Y   108_B      Y   108_A     0.127     0    0.025   0.101     0.453  100.000  100.000
LGA    Y   109_B      Y   109_A     0.343     0    0.070   0.131     0.788  100.000   97.619
LGA    C   110_B      C   110_A     0.495     0    0.053   0.108     1.261  100.000   95.317
LGA    V   111_B      V   111_A     0.296     0    0.099   1.155     2.252  100.000   88.571
LGA    V   112_B      V   112_A     0.264     0    0.021   1.072     2.728   97.619   88.639
LGA    S   113_B      S   113_A     0.599     0    0.044   0.592     1.572   92.857   89.127
LGA    D   114_B      D   114_A     0.758     0    0.386   1.169     6.348   78.095   58.571
LGA    N   115_B      N   115_A     1.927     0    0.023   1.228     5.690   63.690   55.298
LGA    S   116_B      S   116_A     3.354     0    0.074   0.072     4.088   50.476   49.206
LGA    G   117_B      G   117_A     2.402     0    0.099   0.099     2.408   66.786   66.786
LGA    Y   118_B      Y   118_A     1.343     0    0.031   1.213     9.174   85.952   51.548
LGA    Y   119_B      Y   119_A     0.821     0    0.034   0.665     2.308   90.476   83.889
LGA    K   120_B      K   120_A     0.754     0    0.026   0.878     3.778   90.476   76.138
LGA    Y   121_B      Y   121_A     0.634     0    0.012   1.306     9.592   92.857   54.524
LGA    W   122_B      W   122_A     0.485     0    0.075   0.138     0.649   95.238   92.517
LGA    G   123_B      G   123_A     0.119     0    0.068   0.068     0.285  100.000  100.000
LGA    Q   124_B      Q   124_A     0.255     0    0.071   1.264     5.267   97.619   76.085
LGA    G   125_B      G   125_A     0.328     0    0.073   0.073     0.328  100.000  100.000
LGA    T   126_B      T   126_A     0.186     0    0.091   0.132     0.456  100.000  100.000
LGA    Q   127_B      Q   127_A     0.474     0    0.048   0.775     3.925  100.000   80.106
LGA    V   128_B      V   128_A     0.173     0    0.038   0.091     0.668  100.000   98.639
LGA    T   129_B      T   129_A     0.087     0    0.066   0.087     0.574  100.000   98.639
LGA    V   130_B      V   130_A     0.609     0    0.044   1.032     2.707   92.857   84.558
LGA    S   131_B      S   131_A     0.721     0    0.079   0.083     1.017   92.857   90.556
LGA    S   132_B      S   132_A     0.869     0    0.727   0.817     3.102   80.357   79.286

# RMSD_GDC results:       CA      MC common percent     ALL common percent   GDC_mc  GDC_all
NUMBER_OF_ATOMS_AA:      118     472    472  100.00     880    880  100.00               118
SUMMARY(RMSD_GDC):     0.827          0.849                  1.496           94.452   88.705

#CA            N1   N2   DIST      N    RMSD    GDT_TS    LGA_S3     LGA_Q 
SUMMARY(GDT)  132  118    4.0    118    0.83    96.610    98.301    12.728

LGA_LOCAL      RMSD:   0.827  Number of atoms:  118  under DIST:   4.00
LGA_ASGN_ATOMS RMSD:   0.827  Number of assigned atoms:  118 
Std_ASGN_ATOMS RMSD:   0.827  Standard rmsd on all 118 assigned CA atoms 

Unitary ROTATION matrix and the SHIFT vector superimpose molecules  (1=>2)
  X_new =  -0.253930 * X  +  -0.943224 * Y  +   0.214121 * Z  + 105.317047
  Y_new =  -0.055080 * X  +  -0.206916 * Y  +  -0.976807 * Z  +  84.499992
  Z_new =   0.965653 * X  +  -0.259834 * Y  +   0.000590 * Z  +  -8.299582 

Euler angles from the ROTATION matrix. Conventions XYZ and ZXZ:
           Phi     Theta       Psi   [DEG:       Phi     Theta       Psi ]
XYZ: -2.927992 -1.307945 -1.568527   [DEG: -167.7616  -74.9398  -89.8700 ]
ZXZ:  0.215792  1.570207  1.833647   [DEG:   12.3639   89.9662  105.0602 ]
 
# END of job
