
#######################################################
#                                                     #
#                        LGA                          #
#                  ---------------                    #
#                                                     #
#               Local-Global Alignment                #
#        A Method for Finding 3-D Similarities        #
#               in Protein Structures                 #
#                                                     #
#                  ------------ 10/2009               #
#                                                     #
#      Adam Zemla (adamz@llnl.gov)                    #
#      Lawrence Livermore National Laboratory, CA     #
#                                                     #
#######################################################

!!!   License for LGA program has expired  !!!
#   For updated version of the LGA program   #
# please contact Adam Zemla:  adamz@llnl.gov #

# Molecule1: number of CA atoms  132 ( 1007),  selected  118 , name one
# Molecule2: number of CA atoms  118 (  880),  selected  118 , name two
# PARAMETERS: input.pdb  -ie  -3  -d:4  -sda  -swap  -ch1:B  -ch2:A  
# FIXED Atom-Atom correspondence
# GDT and LCS analysis 

LCS - RMSD CUTOFF   5.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:   118      15_A - 132_A       0.95     0.95
  LCS_AVERAGE:    100.00

LCS - RMSD CUTOFF   2.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:   118      15_A - 132_A       0.95     0.95
  LCS_AVERAGE:    100.00

LCS - RMSD CUTOFF   1.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:   118      15_A - 132_A       0.95     0.95
  LCS_AVERAGE:    100.00

LCS_GDT    MOLECULE-1    MOLECULE-2     LCS_DETAILS     GDT_DETAILS                                                    TOTAL NUMBER OF RESIDUE PAIRS:  118
LCS_GDT     RESIDUE       RESIDUE       SEGMENT_SIZE    GLOBAL DISTANCE TEST COLUMNS: number of residues under the threshold assigned to each residue pair
LCS_GDT   NAME NUMBER   NAME NUMBER    1.0  2.0  5.0    0.5  1.0  1.5  2.0  2.5  3.0  3.5  4.0  4.5  5.0  5.5  6.0  6.5  7.0  7.5  8.0  8.5  9.0  9.5 10.0
LCS_GDT     E    15_B     E    15_A    118  118  118     54  105  109  112  114  115  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     V    16_B     V    16_A    118  118  118     54  105  109  112  114  115  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     Q    17_B     Q    17_A    118  118  118     80  105  109  112  114  115  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     L    18_B     L    18_A    118  118  118     87  105  109  112  114  115  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     V    19_B     V    19_A    118  118  118     87  105  109  112  114  115  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     E    20_B     E    20_A    118  118  118     87  105  109  112  114  115  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     S    21_B     S    21_A    118  118  118     87  105  109  112  114  115  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     G    22_B     G    22_A    118  118  118     87  105  109  112  114  115  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     G    23_B     G    23_A    118  118  118     87  105  109  112  114  115  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     G    24_B     G    24_A    118  118  118     87  105  109  112  114  115  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     L    25_B     L    25_A    118  118  118     87  105  109  112  114  115  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     V    26_B     V    26_A    118  118  118     87  105  109  112  114  115  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     L    27_B     L    27_A    118  118  118     76  105  109  112  114  115  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     P    28_B     P    28_A    118  118  118     41  105  109  112  114  115  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     G    29_B     G    29_A    118  118  118     85  105  109  112  114  115  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     G    30_B     G    30_A    118  118  118     87  105  109  112  114  115  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     S    31_B     S    31_A    118  118  118     87  105  109  112  114  115  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     L    32_B     L    32_A    118  118  118     87  105  109  112  114  115  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     K    33_B     K    33_A    118  118  118     87  105  109  112  114  115  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     L    34_B     L    34_A    118  118  118     87  105  109  112  114  115  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     S    35_B     S    35_A    118  118  118     87  105  109  112  114  115  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     C    36_B     C    36_A    118  118  118     87  105  109  112  114  115  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     A    37_B     A    37_A    118  118  118     87  105  109  112  114  115  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     A    38_B     A    38_A    118  118  118     87  105  109  112  114  115  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     S    39_B     S    39_A    118  118  118     87  105  109  112  114  115  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     G    40_B     G    40_A    118  118  118     87  105  109  112  114  115  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     F    41_B     F    41_A    118  118  118     79  105  109  112  114  115  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     N    42_B     N    42_A    118  118  118     83  105  109  112  114  115  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     F    43_B     F    43_A    118  118  118     87  105  109  112  114  115  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     G    44_B     G    44_A    118  118  118     87  105  109  112  114  115  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     S    45_B     S    45_A    118  118  118     72  105  109  112  114  115  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     S    46_B     S    46_A    118  118  118     82  105  109  112  114  115  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     D    47_B     D    47_A    118  118  118     87  105  109  112  114  115  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     M    48_B     M    48_A    118  118  118     87  105  109  112  114  115  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     N    49_B     N    49_A    118  118  118     87  105  109  112  114  115  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     W    50_B     W    50_A    118  118  118     87  105  109  112  114  115  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     V    51_B     V    51_A    118  118  118     87  105  109  112  114  115  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     R    52_B     R    52_A    118  118  118     87  105  109  112  114  115  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     Q    53_B     Q    53_A    118  118  118     87  105  109  112  114  115  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     A    54_B     A    54_A    118  118  118     70  105  109  112  114  115  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     A    55_B     A    55_A    118  118  118     11   89  109  112  114  115  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     G    56_B     G    56_A    118  118  118     11   45  107  112  114  115  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     K    57_B     K    57_A    118  118  118      3  105  109  112  114  115  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     G    58_B     G    58_A    118  118  118      3   73  109  112  114  115  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     P    59_B     P    59_A    118  118  118     17  103  109  112  114  115  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     E    60_B     E    60_A    118  118  118     87  105  109  112  114  115  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     W    61_B     W    61_A    118  118  118     87  105  109  112  114  115  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     V    62_B     V    62_A    118  118  118     87  105  109  112  114  115  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     A    63_B     A    63_A    118  118  118     87  105  109  112  114  115  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     S    64_B     S    64_A    118  118  118     87  105  109  112  114  115  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     I    65_B     I    65_A    118  118  118     87  105  109  112  114  115  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     E    66_B     E    66_A    118  118  118     87  105  109  112  114  115  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     R    67_B     R    67_A    118  118  118     83  105  109  112  114  115  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     G    68_B     G    68_A    118  118  118      3   13  102  112  114  115  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     A    69_B     A    69_A    118  118  118      3    3    4    4   60   72  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     G    70_B     G    70_A    118  118  118      3    3    4  107  111  113  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     G    71_B     G    71_A    118  118  118     87  105  109  112  114  115  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     T    72_B     T    72_A    118  118  118     87  105  109  112  114  115  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     D    73_B     D    73_A    118  118  118     87  105  109  112  114  115  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     Y    74_B     Y    74_A    118  118  118     87  105  109  112  114  115  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     A    75_B     A    75_A    118  118  118     87  105  109  112  114  115  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     D    76_B     D    76_A    118  118  118     87  105  109  112  114  115  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     S    77_B     S    77_A    118  118  118     85  105  109  112  114  115  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     V    78_B     V    78_A    118  118  118     87  105  109  112  114  115  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     Q    79_B     Q    79_A    118  118  118     87  105  109  112  114  115  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     G    80_B     G    80_A    118  118  118     87  105  109  112  114  115  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     R    81_B     R    81_A    118  118  118     87  105  109  112  114  115  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     F    82_B     F    82_A    118  118  118     87  105  109  112  114  115  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     T    83_B     T    83_A    118  118  118     87  105  109  112  114  115  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     V    84_B     V    84_A    118  118  118     87  105  109  112  114  115  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     S    85_B     S    85_A    118  118  118     87  105  109  112  114  115  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     R    86_B     R    86_A    118  118  118     87  105  109  112  114  115  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     D    87_B     D    87_A    118  118  118     87  105  109  112  114  115  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     N    88_B     N    88_A    118  118  118     87  105  109  112  114  115  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     A    89_B     A    89_A    118  118  118     87  105  109  112  114  115  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     K    90_B     K    90_A    118  118  118     87  105  109  112  114  115  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     S    91_B     S    91_A    118  118  118     87  105  109  112  114  115  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     T    92_B     T    92_A    118  118  118     87  105  109  112  114  115  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     L    93_B     L    93_A    118  118  118     87  105  109  112  114  115  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     W    94_B     W    94_A    118  118  118     87  105  109  112  114  115  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     L    95_B     L    95_A    118  118  118     87  105  109  112  114  115  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     Q    96_B     Q    96_A    118  118  118     87  105  109  112  114  115  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     M    97_B     M    97_A    118  118  118     87  105  109  112  114  115  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     N    98_B     N    98_A    118  118  118     87  105  109  112  114  115  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     S    99_B     S    99_A    118  118  118     87  105  109  112  114  115  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     L   100_B     L   100_A    118  118  118     87  105  109  112  114  115  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     K   101_B     K   101_A    118  118  118     87  105  109  112  114  115  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     A   102_B     A   102_A    118  118  118     87  105  109  112  114  115  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     E   103_B     E   103_A    118  118  118     87  105  109  112  114  115  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     D   104_B     D   104_A    118  118  118     87  105  109  112  114  115  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     T   105_B     T   105_A    118  118  118     87  105  109  112  114  115  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     A   106_B     A   106_A    118  118  118     87  105  109  112  114  115  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     V   107_B     V   107_A    118  118  118     87  105  109  112  114  115  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     Y   108_B     Y   108_A    118  118  118     87  105  109  112  114  115  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     Y   109_B     Y   109_A    118  118  118     87  105  109  112  114  115  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     C   110_B     C   110_A    118  118  118     87  105  109  112  114  115  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     V   111_B     V   111_A    118  118  118     87  105  109  112  114  115  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     V   112_B     V   112_A    118  118  118     87  105  109  112  114  115  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     S   113_B     S   113_A    118  118  118     87  105  109  112  114  115  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     D   114_B     D   114_A    118  118  118     79  105  109  112  114  115  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     N   115_B     N   115_A    118  118  118      7   78  107  112  114  115  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     S   116_B     S   116_A    118  118  118      4    7   87  109  114  115  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     G   117_B     G   117_A    118  118  118      3   20   87  112  114  115  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     Y   118_B     Y   118_A    118  118  118      4   94  109  112  114  115  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     Y   119_B     Y   119_A    118  118  118     68  105  109  112  114  115  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     K   120_B     K   120_A    118  118  118     22  105  109  112  114  115  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     Y   121_B     Y   121_A    118  118  118     85  105  109  112  114  115  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     W   122_B     W   122_A    118  118  118     87  105  109  112  114  115  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     G   123_B     G   123_A    118  118  118     87  105  109  112  114  115  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     Q   124_B     Q   124_A    118  118  118     87  105  109  112  114  115  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     G   125_B     G   125_A    118  118  118     87  105  109  112  114  115  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     T   126_B     T   126_A    118  118  118     87  105  109  112  114  115  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     Q   127_B     Q   127_A    118  118  118     87  105  109  112  114  115  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     V   128_B     V   128_A    118  118  118     87  105  109  112  114  115  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     T   129_B     T   129_A    118  118  118     87  105  109  112  114  115  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     V   130_B     V   130_A    118  118  118     87  105  109  112  114  115  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     S   131_B     S   131_A    118  118  118     82  105  109  112  114  115  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     S   132_B     S   132_A    118  118  118      0    6   47   90  109  113  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_AVERAGE  LCS_A: 100.00  ( 100.00  100.00  100.00 )

GLOBAL_DISTANCE_TEST (summary information about detected largest sets of residues (represented by selected AToms) that can fit under specified thresholds)
GDT DIST_CUTOFF  0.50   1.00   1.50   2.00   2.50   3.00   3.50   4.00   4.50   5.00   5.50   6.00   6.50   7.00   7.50   8.00   8.50   9.00   9.50  10.00
GDT NUMBER_AT     87    105    109    112    114    115    117    118    118    118    118    118    118    118    118    118    118    118    118    118 
GDT PERCENT_AT  73.73  88.98  92.37  94.92  96.61  97.46  99.15 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00
GDT RMS_LOCAL    0.29   0.40   0.48   0.58   0.66   0.73   0.89   0.95   0.95   0.95   0.95   0.95   0.95   0.95   0.95   0.95   0.95   0.95   0.95   0.95
GDT RMS_ALL_AT   0.97   0.96   0.96   0.96   0.96   0.96   0.95   0.95   0.95   0.95   0.95   0.95   0.95   0.95   0.95   0.95   0.95   0.95   0.95   0.95

# Checking swapping
#   possible swapping detected:  E    15_B      E    15_A
#   possible swapping detected:  D   114_B      D   114_A

#      Molecule1      Molecule2  DISTANCE    Mis    MC     All    Dist_max   GDC_mc  GDC_all
LGA    E    15_B      E    15_A     0.951     0    0.727   0.842     7.460   78.690   53.386
LGA    V    16_B      V    16_A     1.022     0    0.034   1.090     2.506   83.690   76.871
LGA    Q    17_B      Q    17_A     0.759     0    0.075   1.171     3.326   95.238   81.270
LGA    L    18_B      L    18_A     0.355     0    0.064   0.192     1.158   97.619   94.107
LGA    V    19_B      V    19_A     0.373     0    0.076   0.074     0.622   97.619   98.639
LGA    E    20_B      E    20_A     0.333     0    0.049   0.118     0.396  100.000  100.000
LGA    S    21_B      S    21_A     0.344     0    0.037   0.625     1.950  100.000   95.476
LGA    G    22_B      G    22_A     0.263     0    0.037   0.037     0.375  100.000  100.000
LGA    G    23_B      G    23_A     0.399     0    0.028   0.028     0.399  100.000  100.000
LGA    G    24_B      G    24_A     0.345     0    0.015   0.015     0.446  100.000  100.000
LGA    L    25_B      L    25_A     0.522     0    0.040   1.107     3.026   92.857   83.274
LGA    V    26_B      V    26_A     0.636     0    0.094   0.908     2.698   92.857   84.558
LGA    L    27_B      L    27_A     0.875     0    0.113   1.139     4.212   90.476   78.274
LGA    P    28_B      P    28_A     1.149     0    0.043   0.119     2.299   85.952   79.184
LGA    G    29_B      G    29_A     0.665     0    0.086   0.086     0.754   90.476   90.476
LGA    G    30_B      G    30_A     0.537     0    0.055   0.055     0.604   92.857   92.857
LGA    S    31_B      S    31_A     0.241     0    0.017   0.033     0.450  100.000  100.000
LGA    L    32_B      L    32_A     0.285     0    0.070   0.923     3.397   97.619   89.048
LGA    K    33_B      K    33_A     0.182     0    0.033   0.825     3.012  100.000   85.767
LGA    L    34_B      L    34_A     0.150     0    0.042   0.152     0.527  100.000   98.810
LGA    S    35_B      S    35_A     0.377     0    0.032   0.669     1.614  100.000   93.889
LGA    C    36_B      C    36_A     0.133     0    0.072   0.118     0.455  100.000  100.000
LGA    A    37_B      A    37_A     0.372     0    0.084   0.096     0.579   97.619   96.190
LGA    A    38_B      A    38_A     0.330     0    0.049   0.061     0.487  100.000  100.000
LGA    S    39_B      S    39_A     0.200     0    0.023   0.070     0.390  100.000  100.000
LGA    G    40_B      G    40_A     0.381     0    0.050   0.050     0.811   95.238   95.238
LGA    F    41_B      F    41_A     0.787     0    0.060   0.095     0.950   90.476   90.476
LGA    N    42_B      N    42_A     0.704     0    0.082   1.238     3.968   92.857   78.393
LGA    F    43_B      F    43_A     0.602     0    0.030   0.140     0.833   95.238   93.939
LGA    G    44_B      G    44_A     0.476     0    0.026   0.026     0.577   97.619   97.619
LGA    S    45_B      S    45_A     0.663     0    0.156   0.678     1.294   97.619   92.222
LGA    S    46_B      S    46_A     0.649     0    0.120   0.681     3.142   97.619   86.984
LGA    D    47_B      D    47_A     0.461     0    0.127   0.181     1.577   97.619   90.714
LGA    M    48_B      M    48_A     0.046     0    0.044   0.164     0.637  100.000   98.810
LGA    N    49_B      N    49_A     0.258     0    0.051   0.315     1.083  100.000   97.679
LGA    W    50_B      W    50_A     0.355     0    0.028   0.088     0.447  100.000  100.000
LGA    V    51_B      V    51_A     0.218     0    0.055   0.927     1.990  100.000   90.884
LGA    R    52_B      R    52_A     0.168     0    0.036   0.182     0.816  100.000   96.537
LGA    Q    53_B      Q    53_A     0.489     0    0.037   0.954     3.009   95.238   85.132
LGA    A    54_B      A    54_A     0.877     0    0.051   0.060     0.964   90.476   90.476
LGA    A    55_B      A    55_A     1.457     0    0.068   0.066     1.723   77.143   76.286
LGA    G    56_B      G    56_A     2.083     0    0.131   0.131     2.083   77.381   77.381
LGA    K    57_B      K    57_A     0.963     0    0.048   0.611     8.256   78.095   46.878
LGA    G    58_B      G    58_A     1.941     0    0.208   0.208     1.941   83.810   83.810
LGA    P    59_B      P    59_A     1.142     0    0.065   0.103     1.812   81.548   79.048
LGA    E    60_B      E    60_A     0.594     0    0.076   0.391     1.857   95.238   91.693
LGA    W    61_B      W    61_A     0.333     0    0.050   0.126     0.679   95.238   97.959
LGA    V    62_B      V    62_A     0.091     0    0.046   0.082     0.418  100.000  100.000
LGA    A    63_B      A    63_A     0.285     0    0.068   0.077     0.401  100.000  100.000
LGA    S    64_B      S    64_A     0.141     0    0.051   0.077     0.708  100.000   96.825
LGA    I    65_B      I    65_A     0.178     0    0.097   0.148     0.716   97.619   97.619
LGA    E    66_B      E    66_A     0.516     0    0.072   0.610     2.141   95.238   85.873
LGA    R    67_B      R    67_A     0.668     0    0.584   0.635     5.576   78.095   58.312
LGA    G    68_B      G    68_A     1.954     0    0.442   0.442     1.954   72.857   72.857
LGA    A    69_B      A    69_A     3.534     1    0.758   0.758     3.534   57.619   46.095
LGA    G    70_B      G    70_A     3.733     0    0.522   0.522     3.733   50.357   50.357
LGA    G    71_B      G    71_A     0.319     0    0.152   0.152     1.674   90.833   90.833
LGA    T    72_B      T    72_A     0.243     0    0.044   1.115     2.699  100.000   88.844
LGA    D    73_B      D    73_A     0.199     0    0.022   0.690     2.925  100.000   84.881
LGA    Y    74_B      Y    74_A     0.290     0    0.056   0.071     0.437  100.000  100.000
LGA    A    75_B      A    75_A     0.513     0    0.102   0.115     0.632   97.619   96.190
LGA    D    76_B      D    76_A     0.377     0    0.026   0.409     1.725   97.619   91.845
LGA    S    77_B      S    77_A     0.445     0    0.174   0.207     1.035  100.000   95.317
LGA    V    78_B      V    78_A     0.151     0    0.050   0.154     0.455  100.000  100.000
LGA    Q    79_B      Q    79_A     0.342     0    0.064   1.204     3.587  100.000   86.455
LGA    G    80_B      G    80_A     0.191     0    0.152   0.152     1.159   95.357   95.357
LGA    R    81_B      R    81_A     0.193     0    0.046   0.211     1.164  100.000   94.848
LGA    F    82_B      F    82_A     0.189     0    0.015   0.334     1.172  100.000   94.848
LGA    T    83_B      T    83_A     0.067     0    0.022   0.048     0.223  100.000  100.000
LGA    V    84_B      V    84_A     0.165     0    0.033   0.114     0.533  100.000   98.639
LGA    S    85_B      S    85_A     0.158     0    0.028   0.670     2.328  100.000   94.127
LGA    R    86_B      R    86_A     0.121     0    0.024   1.016     2.605  100.000   91.082
LGA    D    87_B      D    87_A     0.420     0    0.027   0.310     0.961  100.000   96.429
LGA    N    88_B      N    88_A     0.452     0    0.013   0.099     0.654  100.000   96.429
LGA    A    89_B      A    89_A     0.483     0    0.065   0.063     0.693   97.619   96.190
LGA    K    90_B      K    90_A     0.261     0    0.108   0.941     3.805   97.619   84.974
LGA    S    91_B      S    91_A     0.268     0    0.043   0.696     1.826  100.000   93.889
LGA    T    92_B      T    92_A     0.228     0    0.066   0.091     0.786  100.000   98.639
LGA    L    93_B      L    93_A     0.201     0    0.049   0.088     0.491  100.000  100.000
LGA    W    94_B      W    94_A     0.304     0    0.025   1.124     5.771  100.000   75.476
LGA    L    95_B      L    95_A     0.268     0    0.022   0.088     0.334  100.000  100.000
LGA    Q    96_B      Q    96_A     0.256     0    0.049   0.652     1.760  100.000   92.910
LGA    M    97_B      M    97_A     0.148     0    0.034   0.091     0.625  100.000   98.810
LGA    N    98_B      N    98_A     0.121     0    0.045   0.788     1.804  100.000   93.214
LGA    S    99_B      S    99_A     0.436     0    0.041   0.722     2.301  100.000   94.127
LGA    L   100_B      L   100_A     0.242     0    0.015   0.299     1.034  100.000   96.488
LGA    K   101_B      K   101_A     0.176     0    0.039   0.709     3.177  100.000   81.852
LGA    A   102_B      A   102_A     0.185     0    0.031   0.042     0.288  100.000  100.000
LGA    E   103_B      E   103_A     0.254     0    0.083   0.795     2.975  100.000   80.952
LGA    D   104_B      D   104_A     0.310     0    0.079   0.132     0.675  100.000   96.429
LGA    T   105_B      T   105_A     0.267     0    0.018   0.100     0.571  100.000   98.639
LGA    A   106_B      A   106_A     0.231     0    0.047   0.054     0.327  100.000  100.000
LGA    V   107_B      V   107_A     0.216     0    0.051   0.086     0.436  100.000  100.000
LGA    Y   108_B      Y   108_A     0.137     0    0.026   0.152     0.661  100.000   98.413
LGA    Y   109_B      Y   109_A     0.249     0    0.063   0.139     0.727  100.000   97.619
LGA    C   110_B      C   110_A     0.458     0    0.080   0.653     1.839  100.000   93.889
LGA    V   111_B      V   111_A     0.269     0    0.112   1.120     2.226  100.000   88.571
LGA    V   112_B      V   112_A     0.209     0    0.060   0.095     0.770   97.619   97.279
LGA    S   113_B      S   113_A     0.725     0    0.054   0.633     1.365   92.857   89.048
LGA    D   114_B      D   114_A     0.550     0    0.647   0.987     3.980   80.357   68.095
LGA    N   115_B      N   115_A     2.151     0    0.101   0.612     3.818   59.524   59.524
LGA    S   116_B      S   116_A     3.459     0    0.080   0.084     4.242   48.571   47.937
LGA    G   117_B      G   117_A     2.674     0    0.033   0.033     2.674   62.857   62.857
LGA    Y   118_B      Y   118_A     1.543     0    0.032   1.334     9.420   79.405   47.183
LGA    Y   119_B      Y   119_A     0.743     0    0.048   0.499     1.384   88.214   88.214
LGA    K   120_B      K   120_A     1.007     0    0.054   0.531     2.502   88.214   77.989
LGA    Y   121_B      Y   121_A     0.508     0    0.034   0.134     1.040   95.238   92.897
LGA    W   122_B      W   122_A     0.390     0    0.090   0.184     0.916   97.619   95.238
LGA    G   123_B      G   123_A     0.146     0    0.078   0.078     0.160  100.000  100.000
LGA    Q   124_B      Q   124_A     0.057     0    0.088   1.198     5.373  100.000   78.201
LGA    G   125_B      G   125_A     0.205     0    0.058   0.058     0.208  100.000  100.000
LGA    T   126_B      T   126_A     0.225     0    0.064   0.102     0.433  100.000  100.000
LGA    Q   127_B      Q   127_A     0.258     0    0.039   1.076     3.183  100.000   85.608
LGA    V   128_B      V   128_A     0.216     0    0.022   0.083     0.807  100.000   98.639
LGA    T   129_B      T   129_A     0.167     0    0.064   1.002     2.274  100.000   89.728
LGA    V   130_B      V   130_A     0.239     0    0.081   0.098     0.390  100.000  100.000
LGA    S   131_B      S   131_A     0.506     0    0.058   0.576     4.271   74.643   66.746
LGA    S   132_B      S   132_A     4.250     0    0.219   0.828     5.082   39.881   40.000

# RMSD_GDC results:       CA      MC common percent     ALL common percent   GDC_mc  GDC_all
NUMBER_OF_ATOMS_AA:      118     472    472  100.00     880    880  100.00               118
SUMMARY(RMSD_GDC):     0.951          0.971                  1.504           93.775   88.649

#CA            N1   N2   DIST      N    RMSD    GDT_TS    LGA_S3     LGA_Q 
SUMMARY(GDT)  132  118    4.0    118    0.95    95.975    97.777    11.230

LGA_LOCAL      RMSD:   0.951  Number of atoms:  118  under DIST:   4.00
LGA_ASGN_ATOMS RMSD:   0.951  Number of assigned atoms:  118 
Std_ASGN_ATOMS RMSD:   0.951  Standard rmsd on all 118 assigned CA atoms 

Unitary ROTATION matrix and the SHIFT vector superimpose molecules  (1=>2)
  X_new =  -0.396665 * X  +  -0.761611 * Y  +  -0.512450 * Z  + -17.406342
  Y_new =  -0.827599 * X  +   0.538234 * Y  +  -0.159323 * Z  +  -5.977387
  Z_new =   0.397160 * X  +   0.360905 * Y  +  -0.843808 * Z  +  24.155964 

Euler angles from the ROTATION matrix. Conventions XYZ and ZXZ:
           Phi     Theta       Psi   [DEG:       Phi     Theta       Psi ]
XYZ: -2.017744 -0.408420  2.737429   [DEG: -115.6082  -23.4008  156.8431 ]
ZXZ: -1.269365  2.575136  0.833187   [DEG:  -72.7293  147.5444   47.7381 ]
 
# END of job
