
#######################################################
#                                                     #
#                        LGA                          #
#                  ---------------                    #
#                                                     #
#               Local-Global Alignment                #
#        A Method for Finding 3-D Similarities        #
#               in Protein Structures                 #
#                                                     #
#                  ------------ 10/2009               #
#                                                     #
#      Adam Zemla (adamz@llnl.gov)                    #
#      Lawrence Livermore National Laboratory, CA     #
#                                                     #
#######################################################

!!!   License for LGA program has expired  !!!
#   For updated version of the LGA program   #
# please contact Adam Zemla:  adamz@llnl.gov #

# Molecule1: number of CA atoms  132 ( 1007),  selected  118 , name one
# Molecule2: number of CA atoms  118 (  880),  selected  118 , name two
# PARAMETERS: input.pdb  -ie  -3  -d:4  -sda  -swap  -ch1:B  -ch2:A  
# FIXED Atom-Atom correspondence
# GDT and LCS analysis 

LCS - RMSD CUTOFF   5.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:   118      15_A - 132_A       0.91     0.91
  LCS_AVERAGE:    100.00

LCS - RMSD CUTOFF   2.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:   118      15_A - 132_A       0.91     0.91
  LCS_AVERAGE:    100.00

LCS - RMSD CUTOFF   1.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:   118      15_A - 132_A       0.91     0.91
  LCS_AVERAGE:    100.00

LCS_GDT    MOLECULE-1    MOLECULE-2     LCS_DETAILS     GDT_DETAILS                                                    TOTAL NUMBER OF RESIDUE PAIRS:  118
LCS_GDT     RESIDUE       RESIDUE       SEGMENT_SIZE    GLOBAL DISTANCE TEST COLUMNS: number of residues under the threshold assigned to each residue pair
LCS_GDT   NAME NUMBER   NAME NUMBER    1.0  2.0  5.0    0.5  1.0  1.5  2.0  2.5  3.0  3.5  4.0  4.5  5.0  5.5  6.0  6.5  7.0  7.5  8.0  8.5  9.0  9.5 10.0
LCS_GDT     E    15_B     E    15_A    118  118  118     51  104  109  113  114  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     V    16_B     V    16_A    118  118  118     32  104  110  113  114  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     Q    17_B     Q    17_A    118  118  118     85  104  110  113  114  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     L    18_B     L    18_A    118  118  118     87  104  110  113  114  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     V    19_B     V    19_A    118  118  118     87  104  110  113  114  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     E    20_B     E    20_A    118  118  118     87  104  110  113  114  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     S    21_B     S    21_A    118  118  118     87  104  110  113  114  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     G    22_B     G    22_A    118  118  118     87  104  110  113  114  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     G    23_B     G    23_A    118  118  118     87  104  110  113  114  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     G    24_B     G    24_A    118  118  118     87  104  110  113  114  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     L    25_B     L    25_A    118  118  118     87  104  110  113  114  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     V    26_B     V    26_A    118  118  118     87  104  110  113  114  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     L    27_B     L    27_A    118  118  118     87  104  110  113  114  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     P    28_B     P    28_A    118  118  118     87  104  110  113  114  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     G    29_B     G    29_A    118  118  118     87  104  110  113  114  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     G    30_B     G    30_A    118  118  118     87  104  110  113  114  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     S    31_B     S    31_A    118  118  118     87  104  110  113  114  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     L    32_B     L    32_A    118  118  118     87  104  110  113  114  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     K    33_B     K    33_A    118  118  118     87  104  110  113  114  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     L    34_B     L    34_A    118  118  118     87  104  110  113  114  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     S    35_B     S    35_A    118  118  118     87  104  110  113  114  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     C    36_B     C    36_A    118  118  118     87  104  110  113  114  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     A    37_B     A    37_A    118  118  118     87  104  110  113  114  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     A    38_B     A    38_A    118  118  118     87  104  110  113  114  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     S    39_B     S    39_A    118  118  118     87  104  110  113  114  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     G    40_B     G    40_A    118  118  118     87  104  110  113  114  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     F    41_B     F    41_A    118  118  118     71  104  110  113  114  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     N    42_B     N    42_A    118  118  118     71  104  110  113  114  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     F    43_B     F    43_A    118  118  118     87  104  110  113  114  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     G    44_B     G    44_A    118  118  118     87  104  110  113  114  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     S    45_B     S    45_A    118  118  118     81  104  110  113  114  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     S    46_B     S    46_A    118  118  118     77  104  110  113  114  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     D    47_B     D    47_A    118  118  118     87  104  110  113  114  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     M    48_B     M    48_A    118  118  118     87  104  110  113  114  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     N    49_B     N    49_A    118  118  118     87  104  110  113  114  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     W    50_B     W    50_A    118  118  118     87  104  110  113  114  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     V    51_B     V    51_A    118  118  118     87  104  110  113  114  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     R    52_B     R    52_A    118  118  118     87  104  110  113  114  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     Q    53_B     Q    53_A    118  118  118     87  104  110  113  114  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     A    54_B     A    54_A    118  118  118     77  104  110  113  114  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     A    55_B     A    55_A    118  118  118     10   85  110  113  114  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     G    56_B     G    56_A    118  118  118      3   22   90  113  114  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     K    57_B     K    57_A    118  118  118     32   84  110  113  114  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     G    58_B     G    58_A    118  118  118     39  104  110  113  114  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     P    59_B     P    59_A    118  118  118     77  104  110  113  114  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     E    60_B     E    60_A    118  118  118     87  104  110  113  114  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     W    61_B     W    61_A    118  118  118     87  104  110  113  114  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     V    62_B     V    62_A    118  118  118     87  104  110  113  114  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     A    63_B     A    63_A    118  118  118     87  104  110  113  114  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     S    64_B     S    64_A    118  118  118     87  104  110  113  114  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     I    65_B     I    65_A    118  118  118     87  104  110  113  114  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     E    66_B     E    66_A    118  118  118     86  104  110  113  114  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     R    67_B     R    67_A    118  118  118     59  104  110  113  114  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     G    68_B     G    68_A    118  118  118      3   14   96  112  114  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     A    69_B     A    69_A    118  118  118      3    3    5    5   40   95  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     G    70_B     G    70_A    118  118  118      3   51   87  104  114  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     G    71_B     G    71_A    118  118  118     87  104  110  113  114  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     T    72_B     T    72_A    118  118  118     87  104  110  113  114  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     D    73_B     D    73_A    118  118  118     87  104  110  113  114  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     Y    74_B     Y    74_A    118  118  118     87  104  110  113  114  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     A    75_B     A    75_A    118  118  118     87  104  110  113  114  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     D    76_B     D    76_A    118  118  118     87  104  110  113  114  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     S    77_B     S    77_A    118  118  118     80  104  110  113  114  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     V    78_B     V    78_A    118  118  118     87  104  110  113  114  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     Q    79_B     Q    79_A    118  118  118     87  104  110  113  114  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     G    80_B     G    80_A    118  118  118     87  104  110  113  114  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     R    81_B     R    81_A    118  118  118     87  104  110  113  114  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     F    82_B     F    82_A    118  118  118     87  104  110  113  114  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     T    83_B     T    83_A    118  118  118     87  104  110  113  114  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     V    84_B     V    84_A    118  118  118     87  104  110  113  114  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     S    85_B     S    85_A    118  118  118     87  104  110  113  114  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     R    86_B     R    86_A    118  118  118     87  104  110  113  114  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     D    87_B     D    87_A    118  118  118     87  104  110  113  114  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     N    88_B     N    88_A    118  118  118     87  104  110  113  114  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     A    89_B     A    89_A    118  118  118     87  104  110  113  114  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     K    90_B     K    90_A    118  118  118     87  104  110  113  114  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     S    91_B     S    91_A    118  118  118     87  104  110  113  114  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     T    92_B     T    92_A    118  118  118     87  104  110  113  114  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     L    93_B     L    93_A    118  118  118     87  104  110  113  114  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     W    94_B     W    94_A    118  118  118     87  104  110  113  114  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     L    95_B     L    95_A    118  118  118     87  104  110  113  114  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     Q    96_B     Q    96_A    118  118  118     87  104  110  113  114  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     M    97_B     M    97_A    118  118  118     87  104  110  113  114  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     N    98_B     N    98_A    118  118  118     87  104  110  113  114  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     S    99_B     S    99_A    118  118  118     87  104  110  113  114  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     L   100_B     L   100_A    118  118  118     87  104  110  113  114  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     K   101_B     K   101_A    118  118  118     80  104  110  113  114  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     A   102_B     A   102_A    118  118  118     87  104  110  113  114  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     E   103_B     E   103_A    118  118  118     87  104  110  113  114  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     D   104_B     D   104_A    118  118  118     87  104  110  113  114  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     T   105_B     T   105_A    118  118  118     87  104  110  113  114  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     A   106_B     A   106_A    118  118  118     87  104  110  113  114  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     V   107_B     V   107_A    118  118  118     87  104  110  113  114  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     Y   108_B     Y   108_A    118  118  118     87  104  110  113  114  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     Y   109_B     Y   109_A    118  118  118     87  104  110  113  114  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     C   110_B     C   110_A    118  118  118     87  104  110  113  114  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     V   111_B     V   111_A    118  118  118     87  104  110  113  114  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     V   112_B     V   112_A    118  118  118     87  104  110  113  114  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     S   113_B     S   113_A    118  118  118     85  104  110  113  114  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     D   114_B     D   114_A    118  118  118     87  104  110  113  114  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     N   115_B     N   115_A    118  118  118      4   25  103  113  114  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     S   116_B     S   116_A    118  118  118      4    8   19   79  110  115  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     G   117_B     G   117_A    118  118  118      4    8   43   94  114  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     Y   118_B     Y   118_A    118  118  118     18   89  110  113  114  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     Y   119_B     Y   119_A    118  118  118     64  104  110  113  114  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     K   120_B     K   120_A    118  118  118      3    8  110  113  114  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     Y   121_B     Y   121_A    118  118  118     16  102  110  113  114  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     W   122_B     W   122_A    118  118  118     87  104  110  113  114  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     G   123_B     G   123_A    118  118  118     87  104  110  113  114  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     Q   124_B     Q   124_A    118  118  118     87  104  110  113  114  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     G   125_B     G   125_A    118  118  118     87  104  110  113  114  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     T   126_B     T   126_A    118  118  118     87  104  110  113  114  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     Q   127_B     Q   127_A    118  118  118     87  104  110  113  114  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     V   128_B     V   128_A    118  118  118     87  104  110  113  114  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     T   129_B     T   129_A    118  118  118     87  104  110  113  114  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     V   130_B     V   130_A    118  118  118     87  104  110  113  114  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     S   131_B     S   131_A    118  118  118     74  104  110  113  114  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     S   132_B     S   132_A    118  118  118     85  104  110  113  114  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_AVERAGE  LCS_A: 100.00  ( 100.00  100.00  100.00 )

GLOBAL_DISTANCE_TEST (summary information about detected largest sets of residues (represented by selected AToms) that can fit under specified thresholds)
GDT DIST_CUTOFF  0.50   1.00   1.50   2.00   2.50   3.00   3.50   4.00   4.50   5.00   5.50   6.00   6.50   7.00   7.50   8.00   8.50   9.00   9.50  10.00
GDT NUMBER_AT     87    104    110    113    114    116    117    118    118    118    118    118    118    118    118    118    118    118    118    118 
GDT PERCENT_AT  73.73  88.14  93.22  95.76  96.61  98.31  99.15 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00
GDT RMS_LOCAL    0.29   0.38   0.51   0.61   0.64   0.75   0.82   0.91   0.91   0.91   0.91   0.91   0.91   0.91   0.91   0.91   0.91   0.91   0.91   0.91
GDT RMS_ALL_AT   0.92   0.93   0.91   0.92   0.92   0.91   0.91   0.91   0.91   0.91   0.91   0.91   0.91   0.91   0.91   0.91   0.91   0.91   0.91   0.91

# Checking swapping
#   possible swapping detected:  E    15_B      E    15_A
#   possible swapping detected:  D    47_B      D    47_A

#      Molecule1      Molecule2  DISTANCE    Mis    MC     All    Dist_max   GDC_mc  GDC_all
LGA    E    15_B      E    15_A     1.618     0    0.657   1.404     5.525   75.119   53.228
LGA    V    16_B      V    16_A     0.900     0    0.105   1.215     3.485   88.214   79.592
LGA    Q    17_B      Q    17_A     0.746     0    0.054   0.626     3.423   92.857   84.074
LGA    L    18_B      L    18_A     0.336     0    0.074   1.001     3.071   95.238   86.786
LGA    V    19_B      V    19_A     0.632     0    0.088   0.087     1.117   92.857   90.544
LGA    E    20_B      E    20_A     0.461     0    0.042   0.169     0.493  100.000  100.000
LGA    S    21_B      S    21_A     0.438     0    0.033   0.621     2.017  100.000   94.127
LGA    G    22_B      G    22_A     0.323     0    0.036   0.036     0.468  100.000  100.000
LGA    G    23_B      G    23_A     0.351     0    0.042   0.042     0.431  100.000  100.000
LGA    G    24_B      G    24_A     0.352     0    0.025   0.025     0.352  100.000  100.000
LGA    L    25_B      L    25_A     0.346     0    0.012   0.923     4.345  100.000   84.345
LGA    V    26_B      V    26_A     0.439     0    0.092   1.020     2.555   97.619   87.279
LGA    L    27_B      L    27_A     0.374     0    0.101   0.873     3.586   97.619   87.143
LGA    P    28_B      P    28_A     0.473     0    0.040   0.069     0.483  100.000  100.000
LGA    G    29_B      G    29_A     0.377     0    0.040   0.040     0.485  100.000  100.000
LGA    G    30_B      G    30_A     0.349     0    0.056   0.056     0.354  100.000  100.000
LGA    S    31_B      S    31_A     0.141     0    0.028   0.699     2.153  100.000   94.127
LGA    L    32_B      L    32_A     0.148     0    0.055   0.101     0.567  100.000   97.619
LGA    K    33_B      K    33_A     0.094     0    0.021   0.695     2.366  100.000   92.169
LGA    L    34_B      L    34_A     0.166     0    0.038   0.149     0.357  100.000  100.000
LGA    S    35_B      S    35_A     0.336     0    0.029   0.665     1.836  100.000   95.476
LGA    C    36_B      C    36_A     0.229     0    0.066   0.109     0.474  100.000  100.000
LGA    A    37_B      A    37_A     0.404     0    0.073   0.082     0.617   97.619   98.095
LGA    A    38_B      A    38_A     0.251     0    0.050   0.064     0.417  100.000  100.000
LGA    S    39_B      S    39_A     0.118     0    0.022   0.601     1.826  100.000   95.476
LGA    G    40_B      G    40_A     0.316     0    0.028   0.028     0.613   95.238   95.238
LGA    F    41_B      F    41_A     0.736     0    0.048   0.055     0.806   90.476   90.476
LGA    N    42_B      N    42_A     0.784     0    0.093   1.055     2.657   92.857   83.155
LGA    F    43_B      F    43_A     0.450     0    0.030   0.146     0.771   97.619   96.537
LGA    G    44_B      G    44_A     0.301     0    0.040   0.040     0.468  100.000  100.000
LGA    S    45_B      S    45_A     0.586     0    0.165   0.683     1.340   97.619   92.222
LGA    S    46_B      S    46_A     0.775     0    0.118   0.686     3.420   97.619   85.556
LGA    D    47_B      D    47_A     0.572     0    0.072   0.945     4.134   92.857   75.774
LGA    M    48_B      M    48_A     0.135     0    0.032   0.125     0.340  100.000  100.000
LGA    N    49_B      N    49_A     0.269     0    0.036   0.185     0.708  100.000   98.810
LGA    W    50_B      W    50_A     0.366     0    0.038   0.068     0.439  100.000  100.000
LGA    V    51_B      V    51_A     0.187     0    0.062   0.096     0.554  100.000   98.639
LGA    R    52_B      R    52_A     0.238     0    0.027   1.010     3.075  100.000   88.745
LGA    Q    53_B      Q    53_A     0.271     0    0.017   0.341     2.053   95.238   89.788
LGA    A    54_B      A    54_A     0.807     0    0.045   0.051     0.807   90.476   90.476
LGA    A    55_B      A    55_A     1.411     0    0.598   0.582     1.885   79.286   78.000
LGA    G    56_B      G    56_A     2.531     0    0.260   0.260     2.796   67.143   67.143
LGA    K    57_B      K    57_A     1.293     0    0.039   0.255     9.561   75.833   43.492
LGA    G    58_B      G    58_A     1.284     0    0.167   0.167     1.284   88.214   88.214
LGA    P    59_B      P    59_A     0.846     0    0.036   0.121     1.236   88.214   85.306
LGA    E    60_B      E    60_A     0.386     0    0.061   0.276     1.638  100.000   95.926
LGA    W    61_B      W    61_A     0.231     0    0.048   0.175     0.655   97.619   99.320
LGA    V    62_B      V    62_A     0.102     0    0.039   0.095     0.373  100.000  100.000
LGA    A    63_B      A    63_A     0.275     0    0.061   0.071     0.363  100.000  100.000
LGA    S    64_B      S    64_A     0.096     0    0.039   0.651     2.777  100.000   92.857
LGA    I    65_B      I    65_A     0.182     0    0.061   0.102     0.518  100.000   98.810
LGA    E    66_B      E    66_A     0.722     0    0.064   0.266     2.753   90.476   78.201
LGA    R    67_B      R    67_A     0.800     0    0.584   1.252     3.691   78.095   68.571
LGA    G    68_B      G    68_A     2.054     0    0.445   0.445     2.054   68.810   68.810
LGA    A    69_B      A    69_A     3.636     1    0.077   0.077     3.868   48.452   38.762
LGA    G    70_B      G    70_A     2.994     0    0.507   0.507     2.994   60.952   60.952
LGA    G    71_B      G    71_A     0.606     0    0.084   0.084     1.410   88.214   88.214
LGA    T    72_B      T    72_A     0.308     0    0.054   1.001     2.291  100.000   91.088
LGA    D    73_B      D    73_A     0.374     0    0.055   0.257     1.429  100.000   91.845
LGA    Y    74_B      Y    74_A     0.366     0    0.050   0.054     0.464  100.000  100.000
LGA    A    75_B      A    75_A     0.441     0    0.090   0.102     0.493  100.000  100.000
LGA    D    76_B      D    76_A     0.142     0    0.030   0.542     1.183  100.000   95.357
LGA    S    77_B      S    77_A     0.616     0    0.175   0.218     1.255   97.619   92.222
LGA    V    78_B      V    78_A     0.271     0    0.059   0.153     0.517  100.000   98.639
LGA    Q    79_B      Q    79_A     0.339     0    0.054   1.366     4.164  100.000   82.487
LGA    G    80_B      G    80_A     0.286     0    0.173   0.173     1.098   95.357   95.357
LGA    R    81_B      R    81_A     0.080     0    0.027   0.281     0.806  100.000   96.537
LGA    F    82_B      F    82_A     0.164     0    0.027   0.329     0.945  100.000   96.537
LGA    T    83_B      T    83_A     0.030     0    0.025   0.051     0.181  100.000  100.000
LGA    V    84_B      V    84_A     0.098     0    0.035   1.105     2.558  100.000   88.844
LGA    S    85_B      S    85_A     0.048     0    0.034   0.068     0.158  100.000  100.000
LGA    R    86_B      R    86_A     0.212     0    0.018   1.013     2.475  100.000   89.351
LGA    D    87_B      D    87_A     0.520     0    0.027   0.472     1.464   97.619   91.786
LGA    N    88_B      N    88_A     0.473     0    0.022   0.158     0.588  100.000   97.619
LGA    A    89_B      A    89_A     0.507     0    0.081   0.079     0.784   95.238   94.286
LGA    K    90_B      K    90_A     0.368     0    0.114   0.153     1.402   97.619   92.698
LGA    S    91_B      S    91_A     0.302     0    0.029   0.052     0.544  100.000   98.413
LGA    T    92_B      T    92_A     0.263     0    0.067   1.055     2.292  100.000   89.728
LGA    L    93_B      L    93_A     0.095     0    0.050   0.082     0.494  100.000  100.000
LGA    W    94_B      W    94_A     0.148     0    0.029   0.075     0.358  100.000  100.000
LGA    L    95_B      L    95_A     0.165     0    0.043   0.058     0.210  100.000  100.000
LGA    Q    96_B      Q    96_A     0.233     0    0.022   0.238     0.776  100.000   97.884
LGA    M    97_B      M    97_A     0.156     0    0.036   0.093     0.530  100.000   98.810
LGA    N    98_B      N    98_A     0.112     0    0.050   0.930     2.186  100.000   92.202
LGA    S    99_B      S    99_A     0.293     0    0.048   0.723     2.270  100.000   94.127
LGA    L   100_B      L   100_A     0.169     0    0.016   0.217     0.711  100.000   97.619
LGA    K   101_B      K   101_A     0.607     0    0.036   0.754     2.187   97.619   83.968
LGA    A   102_B      A   102_A     0.383     0    0.037   0.048     0.512   97.619   98.095
LGA    E   103_B      E   103_A     0.347     0    0.072   0.941     3.116  100.000   79.101
LGA    D   104_B      D   104_A     0.321     0    0.075   0.143     0.421  100.000  100.000
LGA    T   105_B      T   105_A     0.366     0    0.012   0.093     0.699  100.000   98.639
LGA    A   106_B      A   106_A     0.251     0    0.045   0.050     0.351  100.000  100.000
LGA    V   107_B      V   107_A     0.223     0    0.043   0.076     0.429  100.000  100.000
LGA    Y   108_B      Y   108_A     0.138     0    0.021   0.068     0.385  100.000  100.000
LGA    Y   109_B      Y   109_A     0.254     0    0.066   0.114     0.549  100.000   99.206
LGA    C   110_B      C   110_A     0.518     0    0.056   0.669     1.858   97.619   92.302
LGA    V   111_B      V   111_A     0.348     0    0.106   1.123     2.284  100.000   88.571
LGA    V   112_B      V   112_A     0.363     0    0.046   1.039     2.828   95.238   85.918
LGA    S   113_B      S   113_A     0.796     0    0.046   0.650     1.821   90.476   86.032
LGA    D   114_B      D   114_A     0.366     0    0.074   0.946     5.723   92.976   69.405
LGA    N   115_B      N   115_A     2.305     0    0.077   1.034     5.193   58.333   47.500
LGA    S   116_B      S   116_A     4.401     0    0.049   0.057     5.131   37.619   36.508
LGA    G   117_B      G   117_A     3.019     0    0.121   0.121     3.019   57.262   57.262
LGA    Y   118_B      Y   118_A     1.491     0    0.048   1.399     6.096   83.810   61.548
LGA    Y   119_B      Y   119_A     0.654     0    0.134   0.505     1.841   92.857   86.071
LGA    K   120_B      K   120_A     1.594     0    0.613   1.065     3.988   67.619   69.683
LGA    Y   121_B      Y   121_A     1.150     0    0.458   0.563     2.715   75.357   76.667
LGA    W   122_B      W   122_A     0.155     0    0.067   0.113     0.707  100.000   97.279
LGA    G   123_B      G   123_A     0.236     0    0.077   0.077     0.260  100.000  100.000
LGA    Q   124_B      Q   124_A     0.362     0    0.066   1.377     6.592   97.619   68.519
LGA    G   125_B      G   125_A     0.162     0    0.062   0.062     0.212  100.000  100.000
LGA    T   126_B      T   126_A     0.166     0    0.070   0.135     0.435  100.000  100.000
LGA    Q   127_B      Q   127_A     0.390     0    0.034   1.101     2.646  100.000   88.042
LGA    V   128_B      V   128_A     0.139     0    0.029   1.042     2.312  100.000   89.728
LGA    T   129_B      T   129_A     0.118     0    0.064   0.999     2.220  100.000   91.088
LGA    V   130_B      V   130_A     0.257     0    0.018   0.069     0.678   97.619   97.279
LGA    S   131_B      S   131_A     0.736     0    0.039   0.050     1.221   92.857   89.048
LGA    S   132_B      S   132_A     0.643     0    0.064   0.593     1.755   90.476   87.540

# RMSD_GDC results:       CA      MC common percent     ALL common percent   GDC_mc  GDC_all
NUMBER_OF_ATOMS_AA:      118     472    472  100.00     880    880  100.00               118
SUMMARY(RMSD_GDC):     0.911          0.930                  1.419           94.279   89.377

#CA            N1   N2   DIST      N    RMSD    GDT_TS    LGA_S3     LGA_Q 
SUMMARY(GDT)  132  118    4.0    118    0.91    95.975    97.885    11.668

LGA_LOCAL      RMSD:   0.911  Number of atoms:  118  under DIST:   4.00
LGA_ASGN_ATOMS RMSD:   0.911  Number of assigned atoms:  118 
Std_ASGN_ATOMS RMSD:   0.911  Standard rmsd on all 118 assigned CA atoms 

Unitary ROTATION matrix and the SHIFT vector superimpose molecules  (1=>2)
  X_new =   0.076543 * X  +  -0.914663 * Y  +   0.396904 * Z  +  74.360527
  Y_new =   0.149152 * X  +  -0.383089 * Y  +  -0.911590 * Z  +  92.155128
  Z_new =   0.985847 * X  +   0.128974 * Y  +   0.107101 * Z  + -63.753120 

Euler angles from the ROTATION matrix. Conventions XYZ and ZXZ:
           Phi     Theta       Psi   [DEG:       Phi     Theta       Psi ]
XYZ:  1.096655 -1.402356  0.877789   [DEG:   62.8337  -80.3491   50.2936 ]
ZXZ:  0.410645  1.463490  1.440709   [DEG:   23.5282   83.8518   82.5466 ]
 
# END of job
