
#######################################################
#                                                     #
#                        LGA                          #
#                  ---------------                    #
#                                                     #
#               Local-Global Alignment                #
#        A Method for Finding 3-D Similarities        #
#               in Protein Structures                 #
#                                                     #
#                  ------------ 10/2009               #
#                                                     #
#      Adam Zemla (adamz@llnl.gov)                    #
#      Lawrence Livermore National Laboratory, CA     #
#                                                     #
#######################################################

!!!   License for LGA program has expired  !!!
#   For updated version of the LGA program   #
# please contact Adam Zemla:  adamz@llnl.gov #

# Molecule1: number of CA atoms  132 ( 1007),  selected  118 , name one
# Molecule2: number of CA atoms  118 (  880),  selected  118 , name two
# PARAMETERS: input.pdb  -ie  -3  -d:4  -sda  -swap  -ch1:B  -ch2:A  
# FIXED Atom-Atom correspondence
# GDT and LCS analysis 

LCS - RMSD CUTOFF   5.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:   118      15_A - 132_A       0.85     0.85
  LCS_AVERAGE:    100.00

LCS - RMSD CUTOFF   2.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:   118      15_A - 132_A       0.85     0.85
  LCS_AVERAGE:    100.00

LCS - RMSD CUTOFF   1.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:   118      15_A - 132_A       0.85     0.85
  LCS_AVERAGE:    100.00

LCS_GDT    MOLECULE-1    MOLECULE-2     LCS_DETAILS     GDT_DETAILS                                                    TOTAL NUMBER OF RESIDUE PAIRS:  118
LCS_GDT     RESIDUE       RESIDUE       SEGMENT_SIZE    GLOBAL DISTANCE TEST COLUMNS: number of residues under the threshold assigned to each residue pair
LCS_GDT   NAME NUMBER   NAME NUMBER    1.0  2.0  5.0    0.5  1.0  1.5  2.0  2.5  3.0  3.5  4.0  4.5  5.0  5.5  6.0  6.5  7.0  7.5  8.0  8.5  9.0  9.5 10.0
LCS_GDT     E    15_B     E    15_A    118  118  118     27   94  110  112  115  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     V    16_B     V    16_A    118  118  118     38  106  110  112  115  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     Q    17_B     Q    17_A    118  118  118     92  106  110  112  115  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     L    18_B     L    18_A    118  118  118     92  106  110  112  115  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     V    19_B     V    19_A    118  118  118     92  106  110  112  115  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     E    20_B     E    20_A    118  118  118     92  106  110  112  115  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     S    21_B     S    21_A    118  118  118     92  106  110  112  115  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     G    22_B     G    22_A    118  118  118     92  106  110  112  115  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     G    23_B     G    23_A    118  118  118     92  106  110  112  115  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     G    24_B     G    24_A    118  118  118     92  106  110  112  115  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     L    25_B     L    25_A    118  118  118     92  106  110  112  115  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     V    26_B     V    26_A    118  118  118     92  106  110  112  115  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     L    27_B     L    27_A    118  118  118     92  106  110  112  115  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     P    28_B     P    28_A    118  118  118     92  106  110  112  115  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     G    29_B     G    29_A    118  118  118     92  106  110  112  115  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     G    30_B     G    30_A    118  118  118     92  106  110  112  115  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     S    31_B     S    31_A    118  118  118     92  106  110  112  115  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     L    32_B     L    32_A    118  118  118     92  106  110  112  115  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     K    33_B     K    33_A    118  118  118     92  106  110  112  115  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     L    34_B     L    34_A    118  118  118     92  106  110  112  115  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     S    35_B     S    35_A    118  118  118     92  106  110  112  115  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     C    36_B     C    36_A    118  118  118     92  106  110  112  115  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     A    37_B     A    37_A    118  118  118     92  106  110  112  115  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     A    38_B     A    38_A    118  118  118     92  106  110  112  115  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     S    39_B     S    39_A    118  118  118     92  106  110  112  115  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     G    40_B     G    40_A    118  118  118     91  106  110  112  115  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     F    41_B     F    41_A    118  118  118     38  106  110  112  115  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     N    42_B     N    42_A    118  118  118     25  105  110  112  115  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     F    43_B     F    43_A    118  118  118     91  106  110  112  115  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     G    44_B     G    44_A    118  118  118     92  106  110  112  115  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     S    45_B     S    45_A    118  118  118     65  106  110  112  115  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     S    46_B     S    46_A    118  118  118     92  106  110  112  115  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     D    47_B     D    47_A    118  118  118     92  106  110  112  115  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     M    48_B     M    48_A    118  118  118     92  106  110  112  115  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     N    49_B     N    49_A    118  118  118     92  106  110  112  115  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     W    50_B     W    50_A    118  118  118     92  106  110  112  115  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     V    51_B     V    51_A    118  118  118     92  106  110  112  115  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     R    52_B     R    52_A    118  118  118     92  106  110  112  115  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     Q    53_B     Q    53_A    118  118  118     92  106  110  112  115  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     A    54_B     A    54_A    118  118  118     22  106  110  112  115  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     A    55_B     A    55_A    118  118  118      9   71  110  112  115  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     G    56_B     G    56_A    118  118  118      9   16   36  111  115  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     K    57_B     K    57_A    118  118  118      9  100  110  112  115  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     G    58_B     G    58_A    118  118  118     67  106  110  112  115  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     P    59_B     P    59_A    118  118  118     92  106  110  112  115  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     E    60_B     E    60_A    118  118  118     92  106  110  112  115  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     W    61_B     W    61_A    118  118  118     92  106  110  112  115  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     V    62_B     V    62_A    118  118  118     92  106  110  112  115  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     A    63_B     A    63_A    118  118  118     92  106  110  112  115  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     S    64_B     S    64_A    118  118  118     92  106  110  112  115  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     I    65_B     I    65_A    118  118  118     92  106  110  112  115  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     E    66_B     E    66_A    118  118  118     92  106  110  112  115  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     R    67_B     R    67_A    118  118  118     77  106  110  112  115  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     G    68_B     G    68_A    118  118  118      3   29  105  112  115  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     A    69_B     A    69_A    118  118  118      3    3    5    5   48   84  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     G    70_B     G    70_A    118  118  118     14   36   79  108  115  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     G    71_B     G    71_A    118  118  118     92  106  110  112  115  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     T    72_B     T    72_A    118  118  118     92  106  110  112  115  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     D    73_B     D    73_A    118  118  118     92  106  110  112  115  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     Y    74_B     Y    74_A    118  118  118     92  106  110  112  115  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     A    75_B     A    75_A    118  118  118     92  106  110  112  115  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     D    76_B     D    76_A    118  118  118     92  106  110  112  115  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     S    77_B     S    77_A    118  118  118     76  106  110  112  115  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     V    78_B     V    78_A    118  118  118     92  106  110  112  115  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     Q    79_B     Q    79_A    118  118  118     91  106  110  112  115  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     G    80_B     G    80_A    118  118  118     92  106  110  112  115  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     R    81_B     R    81_A    118  118  118     92  106  110  112  115  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     F    82_B     F    82_A    118  118  118     92  106  110  112  115  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     T    83_B     T    83_A    118  118  118     92  106  110  112  115  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     V    84_B     V    84_A    118  118  118     92  106  110  112  115  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     S    85_B     S    85_A    118  118  118     92  106  110  112  115  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     R    86_B     R    86_A    118  118  118     92  106  110  112  115  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     D    87_B     D    87_A    118  118  118     92  106  110  112  115  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     N    88_B     N    88_A    118  118  118     92  106  110  112  115  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     A    89_B     A    89_A    118  118  118     92  106  110  112  115  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     K    90_B     K    90_A    118  118  118     92  106  110  112  115  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     S    91_B     S    91_A    118  118  118     92  106  110  112  115  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     T    92_B     T    92_A    118  118  118     92  106  110  112  115  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     L    93_B     L    93_A    118  118  118     92  106  110  112  115  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     W    94_B     W    94_A    118  118  118     92  106  110  112  115  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     L    95_B     L    95_A    118  118  118     92  106  110  112  115  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     Q    96_B     Q    96_A    118  118  118     92  106  110  112  115  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     M    97_B     M    97_A    118  118  118     92  106  110  112  115  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     N    98_B     N    98_A    118  118  118     92  106  110  112  115  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     S    99_B     S    99_A    118  118  118     92  106  110  112  115  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     L   100_B     L   100_A    118  118  118     92  106  110  112  115  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     K   101_B     K   101_A    118  118  118     92  106  110  112  115  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     A   102_B     A   102_A    118  118  118     92  106  110  112  115  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     E   103_B     E   103_A    118  118  118     92  106  110  112  115  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     D   104_B     D   104_A    118  118  118     92  106  110  112  115  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     T   105_B     T   105_A    118  118  118     92  106  110  112  115  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     A   106_B     A   106_A    118  118  118     92  106  110  112  115  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     V   107_B     V   107_A    118  118  118     92  106  110  112  115  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     Y   108_B     Y   108_A    118  118  118     92  106  110  112  115  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     Y   109_B     Y   109_A    118  118  118     92  106  110  112  115  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     C   110_B     C   110_A    118  118  118     92  106  110  112  115  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     V   111_B     V   111_A    118  118  118     92  106  110  112  115  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     V   112_B     V   112_A    118  118  118     92  106  110  112  115  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     S   113_B     S   113_A    118  118  118     92  106  110  112  115  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     D   114_B     D   114_A    118  118  118     92  106  110  112  115  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     N   115_B     N   115_A    118  118  118      5   14   96  112  115  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     S   116_B     S   116_A    118  118  118      5   21   45   73  111  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     G   117_B     G   117_A    118  118  118      5   13   49  112  115  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     Y   118_B     Y   118_A    118  118  118     19   84  109  112  115  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     Y   119_B     Y   119_A    118  118  118     29  106  110  112  115  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     K   120_B     K   120_A    118  118  118     56  106  110  112  115  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     Y   121_B     Y   121_A    118  118  118     85  106  110  112  115  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     W   122_B     W   122_A    118  118  118     92  106  110  112  115  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     G   123_B     G   123_A    118  118  118     92  106  110  112  115  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     Q   124_B     Q   124_A    118  118  118     92  106  110  112  115  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     G   125_B     G   125_A    118  118  118     92  106  110  112  115  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     T   126_B     T   126_A    118  118  118     92  106  110  112  115  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     Q   127_B     Q   127_A    118  118  118     92  106  110  112  115  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     V   128_B     V   128_A    118  118  118     92  106  110  112  115  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     T   129_B     T   129_A    118  118  118     92  106  110  112  115  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     V   130_B     V   130_A    118  118  118     92  106  110  112  115  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     S   131_B     S   131_A    118  118  118     21  106  110  112  115  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     S   132_B     S   132_A    118  118  118     92  106  110  112  115  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_AVERAGE  LCS_A: 100.00  ( 100.00  100.00  100.00 )

GLOBAL_DISTANCE_TEST (summary information about detected largest sets of residues (represented by selected AToms) that can fit under specified thresholds)
GDT DIST_CUTOFF  0.50   1.00   1.50   2.00   2.50   3.00   3.50   4.00   4.50   5.00   5.50   6.00   6.50   7.00   7.50   8.00   8.50   9.00   9.50  10.00
GDT NUMBER_AT     92    106    110    112    115    116    118    118    118    118    118    118    118    118    118    118    118    118    118    118 
GDT PERCENT_AT  77.97  89.83  93.22  94.92  97.46  98.31 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00
GDT RMS_LOCAL    0.28   0.39   0.49   0.54   0.67   0.71   0.85   0.85   0.85   0.85   0.85   0.85   0.85   0.85   0.85   0.85   0.85   0.85   0.85   0.85
GDT RMS_ALL_AT   0.86   0.85   0.85   0.85   0.85   0.85   0.85   0.85   0.85   0.85   0.85   0.85   0.85   0.85   0.85   0.85   0.85   0.85   0.85   0.85

# Checking swapping
#   possible swapping detected:  E    15_B      E    15_A
#   possible swapping detected:  D    47_B      D    47_A
#   possible swapping detected:  Y    74_B      Y    74_A
#   possible swapping detected:  Y   118_B      Y   118_A

#      Molecule1      Molecule2  DISTANCE    Mis    MC     All    Dist_max   GDC_mc  GDC_all
LGA    E    15_B      E    15_A     1.769     0    0.370   0.626     2.655   69.048   69.471
LGA    V    16_B      V    16_A     0.910     0    0.174   1.281     3.248   90.476   79.660
LGA    Q    17_B      Q    17_A     0.482     0    0.061   0.536     2.652  100.000   87.090
LGA    L    18_B      L    18_A     0.258     0    0.056   0.157     1.339  100.000   94.167
LGA    V    19_B      V    19_A     0.470     0    0.079   0.091     1.070  100.000   93.333
LGA    E    20_B      E    20_A     0.271     0    0.059   0.520     1.224  100.000   95.820
LGA    S    21_B      S    21_A     0.285     0    0.038   0.669     2.270  100.000   94.127
LGA    G    22_B      G    22_A     0.172     0    0.035   0.035     0.296  100.000  100.000
LGA    G    23_B      G    23_A     0.180     0    0.046   0.046     0.238  100.000  100.000
LGA    G    24_B      G    24_A     0.295     0    0.033   0.033     0.295  100.000  100.000
LGA    L    25_B      L    25_A     0.309     0    0.028   0.946     4.263  100.000   84.345
LGA    V    26_B      V    26_A     0.419     0    0.095   1.016     2.449   97.619   88.367
LGA    L    27_B      L    27_A     0.358     0    0.112   0.855     3.633   97.619   84.821
LGA    P    28_B      P    28_A     0.423     0    0.047   0.075     0.437  100.000  100.000
LGA    G    29_B      G    29_A     0.339     0    0.041   0.041     0.444  100.000  100.000
LGA    G    30_B      G    30_A     0.337     0    0.048   0.048     0.337  100.000  100.000
LGA    S    31_B      S    31_A     0.187     0    0.026   0.027     0.285  100.000  100.000
LGA    L    32_B      L    32_A     0.135     0    0.041   0.925     2.973  100.000   89.048
LGA    K    33_B      K    33_A     0.173     0    0.036   0.584     2.447  100.000   89.947
LGA    L    34_B      L    34_A     0.135     0    0.042   0.930     2.384  100.000   91.190
LGA    S    35_B      S    35_A     0.163     0    0.025   0.049     0.281  100.000  100.000
LGA    C    36_B      C    36_A     0.049     0    0.060   0.083     0.216  100.000  100.000
LGA    A    37_B      A    37_A     0.238     0    0.062   0.067     0.431  100.000  100.000
LGA    A    38_B      A    38_A     0.189     0    0.050   0.059     0.335  100.000  100.000
LGA    S    39_B      S    39_A     0.284     0    0.017   0.036     0.416  100.000  100.000
LGA    G    40_B      G    40_A     0.527     0    0.031   0.031     0.610   90.476   90.476
LGA    F    41_B      F    41_A     0.824     0    0.030   0.104     1.116   90.476   88.831
LGA    N    42_B      N    42_A     1.143     0    0.100   1.347     4.338   85.952   68.512
LGA    F    43_B      F    43_A     0.470     0    0.026   0.083     0.659   97.619   97.403
LGA    G    44_B      G    44_A     0.164     0    0.027   0.027     0.473  100.000  100.000
LGA    S    45_B      S    45_A     0.779     0    0.184   0.685     1.615   97.619   90.794
LGA    S    46_B      S    46_A     0.575     0    0.124   0.198     2.103   97.619   89.444
LGA    D    47_B      D    47_A     0.363     0    0.074   0.942     4.053  100.000   80.298
LGA    M    48_B      M    48_A     0.078     0    0.032   0.171     0.611  100.000   98.810
LGA    N    49_B      N    49_A     0.390     0    0.041   0.196     0.552  100.000   98.810
LGA    W    50_B      W    50_A     0.374     0    0.031   0.088     0.497  100.000  100.000
LGA    V    51_B      V    51_A     0.182     0    0.073   0.941     2.005  100.000   91.088
LGA    R    52_B      R    52_A     0.197     0    0.034   0.127     0.411  100.000  100.000
LGA    Q    53_B      Q    53_A     0.306     0    0.025   0.501     2.318   95.238   88.730
LGA    A    54_B      A    54_A     1.078     0    0.038   0.047     1.299   83.690   83.238
LGA    A    55_B      A    55_A     1.901     0    0.048   0.046     2.368   68.810   68.000
LGA    G    56_B      G    56_A     2.753     0    0.122   0.122     3.223   57.262   57.262
LGA    K    57_B      K    57_A     1.503     0    0.024   0.817     5.675   77.143   63.439
LGA    G    58_B      G    58_A     0.778     0    0.090   0.090     1.033   90.595   90.595
LGA    P    59_B      P    59_A     0.520     0    0.018   0.175     0.807   95.238   94.558
LGA    E    60_B      E    60_A     0.279     0    0.101   0.662     2.403  100.000   91.905
LGA    W    61_B      W    61_A     0.312     0    0.049   0.245     1.025   97.619   95.272
LGA    V    62_B      V    62_A     0.168     0    0.049   0.096     0.478  100.000  100.000
LGA    A    63_B      A    63_A     0.451     0    0.076   0.088     0.592  100.000   98.095
LGA    S    64_B      S    64_A     0.136     0    0.082   0.108     0.795  100.000   96.825
LGA    I    65_B      I    65_A     0.296     0    0.078   0.104     0.677   97.619   97.619
LGA    E    66_B      E    66_A     0.552     0    0.078   0.734     3.444   97.619   80.635
LGA    R    67_B      R    67_A     0.773     0    0.584   1.258     8.746   78.095   51.299
LGA    G    68_B      G    68_A     2.115     0    0.448   0.448     2.120   66.786   66.786
LGA    A    69_B      A    69_A     3.610     1    0.062   0.062     3.646   50.238   40.190
LGA    G    70_B      G    70_A     2.766     0    0.502   0.502     2.920   60.952   60.952
LGA    G    71_B      G    71_A     0.419     0    0.073   0.073     1.157   92.976   92.976
LGA    T    72_B      T    72_A     0.321     0    0.056   1.012     2.144   97.619   89.728
LGA    D    73_B      D    73_A     0.121     0    0.025   0.647     2.565  100.000   86.845
LGA    Y    74_B      Y    74_A     0.250     0    0.050   0.089     0.907  100.000   96.032
LGA    A    75_B      A    75_A     0.184     0    0.086   0.096     0.310  100.000  100.000
LGA    D    76_B      D    76_A     0.378     0    0.020   0.198     0.683   97.619   96.429
LGA    S    77_B      S    77_A     0.689     0    0.181   0.234     1.163   97.619   92.222
LGA    V    78_B      V    78_A     0.376     0    0.051   0.136     0.598   95.238   95.918
LGA    Q    79_B      Q    79_A     0.516     0    0.051   1.098     3.117   97.619   85.291
LGA    G    80_B      G    80_A     0.363     0    0.172   0.172     1.011   95.357   95.357
LGA    R    81_B      R    81_A     0.121     0    0.033   0.284     0.701  100.000   97.403
LGA    F    82_B      F    82_A     0.117     0    0.018   0.261     0.838  100.000   97.403
LGA    T    83_B      T    83_A     0.085     0    0.024   0.059     0.317  100.000  100.000
LGA    V    84_B      V    84_A     0.172     0    0.043   1.085     2.685  100.000   88.844
LGA    S    85_B      S    85_A     0.078     0    0.027   0.606     2.069  100.000   94.127
LGA    R    86_B      R    86_A     0.177     0    0.021   0.096     0.468  100.000  100.000
LGA    D    87_B      D    87_A     0.397     0    0.027   0.547     1.316  100.000   94.167
LGA    N    88_B      N    88_A     0.328     0    0.016   0.104     0.500  100.000   98.810
LGA    A    89_B      A    89_A     0.251     0    0.085   0.085     0.413  100.000  100.000
LGA    K    90_B      K    90_A     0.242     0    0.097   0.740     3.462   97.619   90.212
LGA    S    91_B      S    91_A     0.243     0    0.022   0.694     1.901  100.000   95.476
LGA    T    92_B      T    92_A     0.261     0    0.080   1.073     2.363  100.000   88.571
LGA    L    93_B      L    93_A     0.123     0    0.059   0.125     0.817  100.000   96.429
LGA    W    94_B      W    94_A     0.199     0    0.031   0.546     2.617  100.000   87.857
LGA    L    95_B      L    95_A     0.201     0    0.060   0.075     0.274  100.000  100.000
LGA    Q    96_B      Q    96_A     0.201     0    0.030   1.127     3.114  100.000   89.259
LGA    M    97_B      M    97_A     0.184     0    0.024   0.097     0.671  100.000   98.810
LGA    N    98_B      N    98_A     0.052     0    0.043   0.938     2.135  100.000   92.202
LGA    S    99_B      S    99_A     0.272     0    0.059   0.082     0.321  100.000  100.000
LGA    L   100_B      L   100_A     0.277     0    0.000   0.215     0.810  100.000   96.429
LGA    K   101_B      K   101_A     0.425     0    0.013   0.799     3.150  100.000   87.196
LGA    A   102_B      A   102_A     0.412     0    0.038   0.049     0.642   97.619   96.190
LGA    E   103_B      E   103_A     0.465     0    0.066   1.027     3.211   97.619   77.249
LGA    D   104_B      D   104_A     0.304     0    0.075   0.166     0.710  100.000   97.619
LGA    T   105_B      T   105_A     0.251     0    0.025   0.108     0.464  100.000  100.000
LGA    A   106_B      A   106_A     0.206     0    0.042   0.049     0.327  100.000  100.000
LGA    V   107_B      V   107_A     0.196     0    0.043   0.064     0.398  100.000  100.000
LGA    Y   108_B      Y   108_A     0.155     0    0.031   0.089     0.325  100.000  100.000
LGA    Y   109_B      Y   109_A     0.234     0    0.049   0.063     0.354  100.000  100.000
LGA    C   110_B      C   110_A     0.253     0    0.044   0.058     0.361  100.000  100.000
LGA    V   111_B      V   111_A     0.233     0    0.071   1.125     2.294  100.000   88.571
LGA    V   112_B      V   112_A     0.120     0    0.025   0.078     0.540  100.000   98.639
LGA    S   113_B      S   113_A     0.505     0    0.026   0.190     1.233   97.619   93.730
LGA    D   114_B      D   114_A     0.283     0    0.079   0.968     5.462   95.238   73.571
LGA    N   115_B      N   115_A     2.267     0    0.063   1.025     6.006   63.333   47.560
LGA    S   116_B      S   116_A     3.515     0    0.041   0.047     3.830   48.452   47.857
LGA    G   117_B      G   117_A     2.377     0    0.098   0.098     2.377   66.786   66.786
LGA    Y   118_B      Y   118_A     1.488     0    0.046   1.224     8.463   79.286   50.675
LGA    Y   119_B      Y   119_A     0.893     0    0.037   0.474     2.527   90.476   79.603
LGA    K   120_B      K   120_A     0.823     0    0.046   0.665     1.610   90.476   82.593
LGA    Y   121_B      Y   121_A     0.656     0    0.029   0.138     1.865   92.857   85.317
LGA    W   122_B      W   122_A     0.444     0    0.089   0.167     1.103   95.238   93.231
LGA    G   123_B      G   123_A     0.174     0    0.071   0.071     0.214  100.000  100.000
LGA    Q   124_B      Q   124_A     0.279     0    0.087   0.849     6.107   97.619   66.190
LGA    G   125_B      G   125_A     0.284     0    0.076   0.076     0.284  100.000  100.000
LGA    T   126_B      T   126_A     0.216     0    0.082   0.126     0.427  100.000  100.000
LGA    Q   127_B      Q   127_A     0.443     0    0.041   0.963     2.639  100.000   88.995
LGA    V   128_B      V   128_A     0.143     0    0.023   0.084     0.724  100.000   98.639
LGA    T   129_B      T   129_A     0.199     0    0.037   0.052     0.308  100.000  100.000
LGA    V   130_B      V   130_A     0.500     0    0.037   0.061     0.963   95.238   93.197
LGA    S   131_B      S   131_A     0.886     0    0.048   0.064     1.354   92.857   89.048
LGA    S   132_B      S   132_A     0.558     0    0.717   0.823     2.801   82.143   83.413

# RMSD_GDC results:       CA      MC common percent     ALL common percent   GDC_mc  GDC_all
NUMBER_OF_ATOMS_AA:      118     472    472  100.00     880    880  100.00               118
SUMMARY(RMSD_GDC):     0.849          0.852                  1.391           94.796   89.694

#CA            N1   N2   DIST      N    RMSD    GDT_TS    LGA_S3     LGA_Q 
SUMMARY(GDT)  132  118    4.0    118    0.85    96.186    98.063    12.430

LGA_LOCAL      RMSD:   0.849  Number of atoms:  118  under DIST:   4.00
LGA_ASGN_ATOMS RMSD:   0.849  Number of assigned atoms:  118 
Std_ASGN_ATOMS RMSD:   0.849  Standard rmsd on all 118 assigned CA atoms 

Unitary ROTATION matrix and the SHIFT vector superimpose molecules  (1=>2)
  X_new =  -0.204375 * X  +  -0.956280 * Y  +   0.209187 * Z  + 104.915955
  Y_new =   0.005744 * X  +  -0.214865 * Y  +  -0.976627 * Z  +  82.423141
  Z_new =   0.978876 * X  +  -0.198397 * Y  +   0.049406 * Z  + -19.773691 

Euler angles from the ROTATION matrix. Conventions XYZ and ZXZ:
           Phi     Theta       Psi   [DEG:       Phi     Theta       Psi ]
XYZ:  3.113496 -1.364888 -1.326736   [DEG:  178.3902  -78.2023  -76.0164 ]
ZXZ:  0.211005  1.521370  1.770766   [DEG:   12.0897   87.1681  101.4574 ]
 
# END of job
