
#######################################################
#                                                     #
#                        LGA                          #
#                  ---------------                    #
#                                                     #
#               Local-Global Alignment                #
#        A Method for Finding 3-D Similarities        #
#               in Protein Structures                 #
#                                                     #
#                  ------------ 10/2009               #
#                                                     #
#      Adam Zemla (adamz@llnl.gov)                    #
#      Lawrence Livermore National Laboratory, CA     #
#                                                     #
#######################################################

!!!   License for LGA program has expired  !!!
#   For updated version of the LGA program   #
# please contact Adam Zemla:  adamz@llnl.gov #

# Molecule1: number of CA atoms  132 ( 1007),  selected  118 , name one
# Molecule2: number of CA atoms  118 (  880),  selected  118 , name two
# PARAMETERS: input.pdb  -ie  -3  -d:4  -sda  -swap  -ch1:B  -ch2:A  
# FIXED Atom-Atom correspondence
# GDT and LCS analysis 

LCS - RMSD CUTOFF   5.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:   118      15_A - 132_A       0.55     0.55
  LCS_AVERAGE:    100.00

LCS - RMSD CUTOFF   2.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:   118      15_A - 132_A       0.55     0.55
  LCS_AVERAGE:    100.00

LCS - RMSD CUTOFF   1.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:   118      15_A - 132_A       0.55     0.55
  LCS_AVERAGE:    100.00

LCS_GDT    MOLECULE-1    MOLECULE-2     LCS_DETAILS     GDT_DETAILS                                                    TOTAL NUMBER OF RESIDUE PAIRS:  118
LCS_GDT     RESIDUE       RESIDUE       SEGMENT_SIZE    GLOBAL DISTANCE TEST COLUMNS: number of residues under the threshold assigned to each residue pair
LCS_GDT   NAME NUMBER   NAME NUMBER    1.0  2.0  5.0    0.5  1.0  1.5  2.0  2.5  3.0  3.5  4.0  4.5  5.0  5.5  6.0  6.5  7.0  7.5  8.0  8.5  9.0  9.5 10.0
LCS_GDT     E    15_B     E    15_A    118  118  118     63  113  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     V    16_B     V    16_A    118  118  118    100  113  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     Q    17_B     Q    17_A    118  118  118    100  113  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     L    18_B     L    18_A    118  118  118    100  113  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     V    19_B     V    19_A    118  118  118    100  113  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     E    20_B     E    20_A    118  118  118    100  113  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     S    21_B     S    21_A    118  118  118    100  113  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     G    22_B     G    22_A    118  118  118    100  113  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     G    23_B     G    23_A    118  118  118    100  113  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     G    24_B     G    24_A    118  118  118    100  113  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     L    25_B     L    25_A    118  118  118    100  113  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     V    26_B     V    26_A    118  118  118    100  113  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     L    27_B     L    27_A    118  118  118    100  113  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     P    28_B     P    28_A    118  118  118    100  113  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     G    29_B     G    29_A    118  118  118    100  113  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     G    30_B     G    30_A    118  118  118    100  113  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     S    31_B     S    31_A    118  118  118    100  113  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     L    32_B     L    32_A    118  118  118    100  113  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     K    33_B     K    33_A    118  118  118    100  113  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     L    34_B     L    34_A    118  118  118    100  113  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     S    35_B     S    35_A    118  118  118    100  113  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     C    36_B     C    36_A    118  118  118    100  113  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     A    37_B     A    37_A    118  118  118    100  113  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     A    38_B     A    38_A    118  118  118    100  113  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     S    39_B     S    39_A    118  118  118    100  113  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     G    40_B     G    40_A    118  118  118    100  113  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     F    41_B     F    41_A    118  118  118    100  113  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     N    42_B     N    42_A    118  118  118    100  113  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     F    43_B     F    43_A    118  118  118    100  113  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     G    44_B     G    44_A    118  118  118    100  113  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     S    45_B     S    45_A    118  118  118    100  113  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     S    46_B     S    46_A    118  118  118    100  113  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     D    47_B     D    47_A    118  118  118    100  113  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     M    48_B     M    48_A    118  118  118    100  113  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     N    49_B     N    49_A    118  118  118    100  113  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     W    50_B     W    50_A    118  118  118    100  113  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     V    51_B     V    51_A    118  118  118    100  113  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     R    52_B     R    52_A    118  118  118    100  113  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     Q    53_B     Q    53_A    118  118  118    100  113  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     A    54_B     A    54_A    118  118  118     96  113  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     A    55_B     A    55_A    118  118  118     69  111  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     G    56_B     G    56_A    118  118  118     69  110  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     K    57_B     K    57_A    118  118  118     96  113  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     G    58_B     G    58_A    118  118  118    100  113  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     P    59_B     P    59_A    118  118  118    100  113  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     E    60_B     E    60_A    118  118  118    100  113  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     W    61_B     W    61_A    118  118  118    100  113  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     V    62_B     V    62_A    118  118  118    100  113  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     A    63_B     A    63_A    118  118  118    100  113  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     S    64_B     S    64_A    118  118  118    100  113  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     I    65_B     I    65_A    118  118  118    100  113  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     E    66_B     E    66_A    118  118  118    100  113  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     R    67_B     R    67_A    118  118  118    100  113  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     G    68_B     G    68_A    118  118  118     44  113  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     A    69_B     A    69_A    118  118  118     26  113  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     G    70_B     G    70_A    118  118  118     99  113  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     G    71_B     G    71_A    118  118  118    100  113  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     T    72_B     T    72_A    118  118  118    100  113  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     D    73_B     D    73_A    118  118  118    100  113  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     Y    74_B     Y    74_A    118  118  118    100  113  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     A    75_B     A    75_A    118  118  118    100  113  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     D    76_B     D    76_A    118  118  118    100  113  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     S    77_B     S    77_A    118  118  118     37  113  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     V    78_B     V    78_A    118  118  118    100  113  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     Q    79_B     Q    79_A    118  118  118    100  113  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     G    80_B     G    80_A    118  118  118    100  113  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     R    81_B     R    81_A    118  118  118    100  113  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     F    82_B     F    82_A    118  118  118    100  113  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     T    83_B     T    83_A    118  118  118    100  113  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     V    84_B     V    84_A    118  118  118    100  113  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     S    85_B     S    85_A    118  118  118    100  113  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     R    86_B     R    86_A    118  118  118    100  113  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     D    87_B     D    87_A    118  118  118    100  113  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     N    88_B     N    88_A    118  118  118    100  113  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     A    89_B     A    89_A    118  118  118    100  113  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     K    90_B     K    90_A    118  118  118    100  113  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     S    91_B     S    91_A    118  118  118    100  113  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     T    92_B     T    92_A    118  118  118    100  113  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     L    93_B     L    93_A    118  118  118    100  113  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     W    94_B     W    94_A    118  118  118    100  113  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     L    95_B     L    95_A    118  118  118    100  113  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     Q    96_B     Q    96_A    118  118  118    100  113  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     M    97_B     M    97_A    118  118  118    100  113  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     N    98_B     N    98_A    118  118  118    100  113  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     S    99_B     S    99_A    118  118  118    100  113  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     L   100_B     L   100_A    118  118  118    100  113  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     K   101_B     K   101_A    118  118  118    100  113  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     A   102_B     A   102_A    118  118  118    100  113  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     E   103_B     E   103_A    118  118  118    100  113  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     D   104_B     D   104_A    118  118  118    100  113  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     T   105_B     T   105_A    118  118  118    100  113  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     A   106_B     A   106_A    118  118  118    100  113  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     V   107_B     V   107_A    118  118  118    100  113  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     Y   108_B     Y   108_A    118  118  118    100  113  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     Y   109_B     Y   109_A    118  118  118    100  113  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     C   110_B     C   110_A    118  118  118    100  113  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     V   111_B     V   111_A    118  118  118    100  113  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     V   112_B     V   112_A    118  118  118    100  113  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     S   113_B     S   113_A    118  118  118    100  113  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     D   114_B     D   114_A    118  118  118     70  113  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     N   115_B     N   115_A    118  118  118      6   73  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     S   116_B     S   116_A    118  118  118      6   72  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     G   117_B     G   117_A    118  118  118     63  113  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     Y   118_B     Y   118_A    118  118  118     76  113  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     Y   119_B     Y   119_A    118  118  118    100  113  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     K   120_B     K   120_A    118  118  118    100  113  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     Y   121_B     Y   121_A    118  118  118    100  113  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     W   122_B     W   122_A    118  118  118    100  113  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     G   123_B     G   123_A    118  118  118    100  113  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     Q   124_B     Q   124_A    118  118  118    100  113  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     G   125_B     G   125_A    118  118  118    100  113  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     T   126_B     T   126_A    118  118  118    100  113  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     Q   127_B     Q   127_A    118  118  118    100  113  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     V   128_B     V   128_A    118  118  118    100  113  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     T   129_B     T   129_A    118  118  118    100  113  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     V   130_B     V   130_A    118  118  118    100  113  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     S   131_B     S   131_A    118  118  118    100  113  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     S   132_B     S   132_A    118  118  118      2    3   71  113  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_AVERAGE  LCS_A: 100.00  ( 100.00  100.00  100.00 )

GLOBAL_DISTANCE_TEST (summary information about detected largest sets of residues (represented by selected AToms) that can fit under specified thresholds)
GDT DIST_CUTOFF  0.50   1.00   1.50   2.00   2.50   3.00   3.50   4.00   4.50   5.00   5.50   6.00   6.50   7.00   7.50   8.00   8.50   9.00   9.50  10.00
GDT NUMBER_AT    100    113    117    117    118    118    118    118    118    118    118    118    118    118    118    118    118    118    118    118 
GDT PERCENT_AT  84.75  95.76  99.15  99.15 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00
GDT RMS_LOCAL    0.26   0.36   0.46   0.46   0.55   0.55   0.55   0.55   0.55   0.55   0.55   0.55   0.55   0.55   0.55   0.55   0.55   0.55   0.55   0.55
GDT RMS_ALL_AT   0.56   0.56   0.56   0.56   0.55   0.55   0.55   0.55   0.55   0.55   0.55   0.55   0.55   0.55   0.55   0.55   0.55   0.55   0.55   0.55

# Checking swapping
#   possible swapping detected:  E    15_B      E    15_A
#   possible swapping detected:  E    20_B      E    20_A
#   possible swapping detected:  F    41_B      F    41_A
#   possible swapping detected:  D    47_B      D    47_A
#   possible swapping detected:  E    60_B      E    60_A
#   possible swapping detected:  E    66_B      E    66_A
#   possible swapping detected:  D    73_B      D    73_A
#   possible swapping detected:  Y    74_B      Y    74_A
#   possible swapping detected:  D    76_B      D    76_A
#   possible swapping detected:  F    82_B      F    82_A
#   possible swapping detected:  D    87_B      D    87_A
#   possible swapping detected:  D   104_B      D   104_A
#   possible swapping detected:  Y   109_B      Y   109_A
#   possible swapping detected:  Y   118_B      Y   118_A
#   possible swapping detected:  Y   119_B      Y   119_A
#   possible swapping detected:  Y   121_B      Y   121_A

#      Molecule1      Molecule2  DISTANCE    Mis    MC     All    Dist_max   GDC_mc  GDC_all
LGA    E    15_B      E    15_A     0.769     0    0.661   1.130     8.733   82.143   47.513
LGA    V    16_B      V    16_A     0.358     0    0.015   0.049     0.539   97.619   97.279
LGA    Q    17_B      Q    17_A     0.145     0    0.015   0.243     1.760  100.000   91.905
LGA    L    18_B      L    18_A     0.196     0    0.071   0.095     0.514  100.000   98.810
LGA    V    19_B      V    19_A     0.059     0    0.020   0.035     0.085  100.000  100.000
LGA    E    20_B      E    20_A     0.106     0    0.012   0.109     0.521  100.000   98.942
LGA    S    21_B      S    21_A     0.178     0    0.021   0.031     0.405  100.000  100.000
LGA    G    22_B      G    22_A     0.322     0    0.099   0.099     0.699   97.619   97.619
LGA    G    23_B      G    23_A     0.199     0    0.167   0.167     1.018   95.357   95.357
LGA    G    24_B      G    24_A     0.402     0    0.041   0.041     0.402  100.000  100.000
LGA    L    25_B      L    25_A     0.455     0    0.010   0.056     1.033   95.238   91.726
LGA    V    26_B      V    26_A     0.621     0    0.076   1.147     2.382   95.238   85.850
LGA    L    27_B      L    27_A     0.436     0    0.038   0.167     1.082  100.000   94.107
LGA    P    28_B      P    28_A     0.498     0    0.027   0.075     0.673   95.238   93.197
LGA    G    29_B      G    29_A     0.426     0    0.029   0.029     0.521   97.619   97.619
LGA    G    30_B      G    30_A     0.434     0    0.039   0.039     0.625   97.619   97.619
LGA    S    31_B      S    31_A     0.374     0    0.015   0.028     0.446  100.000  100.000
LGA    L    32_B      L    32_A     0.154     0    0.045   0.106     0.709   97.619   95.238
LGA    K    33_B      K    33_A     0.086     0    0.033   0.672     2.177  100.000   92.011
LGA    L    34_B      L    34_A     0.084     0    0.007   0.074     0.169  100.000  100.000
LGA    S    35_B      S    35_A     0.157     0    0.027   0.670     1.824  100.000   95.476
LGA    C    36_B      C    36_A     0.068     0    0.041   0.051     0.431  100.000  100.000
LGA    A    37_B      A    37_A     0.195     0    0.047   0.059     0.292  100.000  100.000
LGA    A    38_B      A    38_A     0.222     0    0.045   0.074     0.413  100.000  100.000
LGA    S    39_B      S    39_A     0.224     0    0.026   0.031     0.650  100.000   98.413
LGA    G    40_B      G    40_A     0.520     0    0.019   0.019     0.691   92.857   92.857
LGA    F    41_B      F    41_A     0.555     0    0.058   0.058     0.810   95.238   92.208
LGA    N    42_B      N    42_A     0.553     0    0.039   0.106     0.874   92.857   91.667
LGA    F    43_B      F    43_A     0.509     0    0.018   0.095     0.642   95.238   96.537
LGA    G    44_B      G    44_A     0.521     0    0.047   0.047     0.521   97.619   97.619
LGA    S    45_B      S    45_A     0.169     0    0.033   0.042     0.454  100.000  100.000
LGA    S    46_B      S    46_A     0.405     0    0.084   0.112     0.660  100.000   96.825
LGA    D    47_B      D    47_A     0.279     0    0.020   0.093     0.429  100.000  100.000
LGA    M    48_B      M    48_A     0.111     0    0.037   0.165     0.732  100.000   98.810
LGA    N    49_B      N    49_A     0.126     0    0.027   0.148     0.682  100.000   97.619
LGA    W    50_B      W    50_A     0.120     0    0.030   0.103     0.619  100.000   97.959
LGA    V    51_B      V    51_A     0.231     0    0.064   0.116     0.678   97.619   95.918
LGA    R    52_B      R    52_A     0.299     0    0.016   0.092     1.053  100.000   94.848
LGA    Q    53_B      Q    53_A     0.207     0    0.082   0.177     0.734  100.000   98.942
LGA    A    54_B      A    54_A     0.602     0    0.024   0.027     0.700   92.857   92.381
LGA    A    55_B      A    55_A     1.192     0    0.040   0.048     1.494   83.690   83.238
LGA    G    56_B      G    56_A     1.399     0    0.032   0.032     1.399   81.429   81.429
LGA    K    57_B      K    57_A     0.766     0    0.026   0.543     3.686   90.476   81.270
LGA    G    58_B      G    58_A     0.253     0    0.040   0.040     0.265  100.000  100.000
LGA    P    59_B      P    59_A     0.365     0    0.039   0.313     0.758   95.238   95.918
LGA    E    60_B      E    60_A     0.320     0    0.040   0.197     0.923  100.000   96.825
LGA    W    61_B      W    61_A     0.083     0    0.010   0.162     1.013  100.000   96.633
LGA    V    62_B      V    62_A     0.109     0    0.073   0.059     0.268  100.000  100.000
LGA    A    63_B      A    63_A     0.291     0    0.038   0.047     0.362  100.000  100.000
LGA    S    64_B      S    64_A     0.470     0    0.048   0.075     0.643  100.000   96.825
LGA    I    65_B      I    65_A     0.205     0    0.016   0.060     0.526  100.000   98.810
LGA    E    66_B      E    66_A     0.304     0    0.037   0.126     1.459  100.000   91.693
LGA    R    67_B      R    67_A     0.430     0    0.014   0.864     4.233   95.238   84.416
LGA    G    68_B      G    68_A     0.937     0    0.041   0.041     1.363   85.952   85.952
LGA    A    69_B      A    69_A     1.031     1    0.041   0.041     1.031   88.214   70.571
LGA    G    70_B      G    70_A     0.562     0    0.039   0.039     0.562   95.238   95.238
LGA    G    71_B      G    71_A     0.563     0    0.032   0.032     0.563   97.619   97.619
LGA    T    72_B      T    72_A     0.203     0    0.022   0.040     0.397  100.000  100.000
LGA    D    73_B      D    73_A     0.220     0    0.040   0.105     0.347  100.000  100.000
LGA    Y    74_B      Y    74_A     0.292     0    0.016   0.085     0.583  100.000   99.206
LGA    A    75_B      A    75_A     0.217     0    0.043   0.066     0.288  100.000  100.000
LGA    D    76_B      D    76_A     0.511     0    0.029   0.066     0.821   92.857   91.667
LGA    S    77_B      S    77_A     0.879     0    0.074   0.152     1.297   92.857   89.048
LGA    V    78_B      V    78_A     0.318     0    0.043   0.101     0.521  100.000   98.639
LGA    Q    79_B      Q    79_A     0.426     0    0.034   1.011     3.699  100.000   81.270
LGA    G    80_B      G    80_A     0.222     0    0.050   0.050     0.301  100.000  100.000
LGA    R    81_B      R    81_A     0.142     0    0.022   0.445     1.456  100.000   95.714
LGA    F    82_B      F    82_A     0.106     0    0.021   0.145     0.481  100.000  100.000
LGA    T    83_B      T    83_A     0.140     0    0.027   0.039     0.225  100.000  100.000
LGA    V    84_B      V    84_A     0.177     0    0.019   0.078     0.427  100.000  100.000
LGA    S    85_B      S    85_A     0.164     0    0.027   0.033     0.236  100.000  100.000
LGA    R    86_B      R    86_A     0.184     0    0.018   0.344     1.769  100.000   92.424
LGA    D    87_B      D    87_A     0.458     0    0.083   0.155     1.248  100.000   95.298
LGA    N    88_B      N    88_A     0.218     0    0.017   0.040     0.705  100.000   98.810
LGA    A    89_B      A    89_A     0.250     0    0.023   0.026     0.398  100.000  100.000
LGA    K    90_B      K    90_A     0.505     0    0.023   0.070     1.745   97.619   89.683
LGA    S    91_B      S    91_A     0.146     0    0.019   0.073     0.380  100.000  100.000
LGA    T    92_B      T    92_A     0.140     0    0.012   0.038     0.271  100.000  100.000
LGA    L    93_B      L    93_A     0.138     0    0.032   0.049     0.475  100.000  100.000
LGA    W    94_B      W    94_A     0.222     0    0.020   0.599     3.145  100.000   85.408
LGA    L    95_B      L    95_A     0.120     0    0.048   0.085     0.316  100.000  100.000
LGA    Q    96_B      Q    96_A     0.149     0    0.043   0.156     0.617  100.000   98.942
LGA    M    97_B      M    97_A     0.210     0    0.050   0.787     2.194  100.000   93.274
LGA    N    98_B      N    98_A     0.265     0    0.035   1.066     2.239  100.000   91.190
LGA    S    99_B      S    99_A     0.543     0    0.041   0.042     0.660   97.619   95.238
LGA    L   100_B      L   100_A     0.325     0    0.009   0.084     0.643  100.000   97.619
LGA    K   101_B      K   101_A     0.217     0    0.031   0.538     1.828  100.000   87.831
LGA    A   102_B      A   102_A     0.213     0    0.043   0.042     0.224  100.000  100.000
LGA    E   103_B      E   103_A     0.296     0    0.026   0.159     0.978  100.000   96.825
LGA    D   104_B      D   104_A     0.389     0    0.030   0.054     0.529   97.619   98.810
LGA    T   105_B      T   105_A     0.268     0    0.049   0.058     0.391  100.000  100.000
LGA    A   106_B      A   106_A     0.209     0    0.078   0.115     0.292  100.000  100.000
LGA    V   107_B      V   107_A     0.218     0    0.025   0.070     0.344  100.000  100.000
LGA    Y   108_B      Y   108_A     0.192     0    0.025   0.081     0.481  100.000  100.000
LGA    Y   109_B      Y   109_A     0.156     0    0.020   0.159     1.230  100.000   94.484
LGA    C   110_B      C   110_A     0.245     0    0.042   0.078     0.917  100.000   96.825
LGA    V   111_B      V   111_A     0.106     0    0.050   0.099     0.502  100.000   98.639
LGA    V   112_B      V   112_A     0.045     0    0.017   0.073     0.456  100.000  100.000
LGA    S   113_B      S   113_A     0.219     0    0.032   0.599     1.829  100.000   95.476
LGA    D   114_B      D   114_A     0.705     0    0.130   0.782     2.712   92.857   80.952
LGA    N   115_B      N   115_A     1.668     0    0.069   0.140     2.401   72.976   70.893
LGA    S   116_B      S   116_A     1.778     0    0.087   0.617     2.613   72.857   70.238
LGA    G   117_B      G   117_A     0.815     0    0.083   0.083     0.895   90.476   90.476
LGA    Y   118_B      Y   118_A     0.662     0    0.061   1.331     8.011   92.857   61.825
LGA    Y   119_B      Y   119_A     0.068     0    0.021   0.124     0.665  100.000   98.413
LGA    K   120_B      K   120_A     0.139     0    0.085   0.632     3.502  100.000   88.519
LGA    Y   121_B      Y   121_A     0.193     0    0.038   0.088     0.544  100.000   99.206
LGA    W   122_B      W   122_A     0.203     0    0.021   0.205     0.621  100.000   99.320
LGA    G   123_B      G   123_A     0.358     0    0.025   0.025     0.358  100.000  100.000
LGA    Q   124_B      Q   124_A     0.227     0    0.025   1.038     3.290  100.000   86.243
LGA    G   125_B      G   125_A     0.118     0    0.031   0.031     0.250  100.000  100.000
LGA    T   126_B      T   126_A     0.102     0    0.024   0.083     0.323  100.000  100.000
LGA    Q   127_B      Q   127_A     0.170     0    0.026   0.252     0.862  100.000   98.942
LGA    V   128_B      V   128_A     0.109     0    0.044   0.050     0.306  100.000  100.000
LGA    T   129_B      T   129_A     0.029     0    0.032   0.076     0.519  100.000   98.639
LGA    V   130_B      V   130_A     0.239     0    0.034   0.049     0.679   97.619   98.639
LGA    S   131_B      S   131_A     0.744     0    0.096   0.558     4.181   78.095   67.778
LGA    S   132_B      S   132_A     3.337     0    0.079   0.580     4.196   57.500   50.714

# RMSD_GDC results:       CA      MC common percent     ALL common percent   GDC_mc  GDC_all
NUMBER_OF_ATOMS_AA:      118     472    472  100.00     880    880  100.00               118
SUMMARY(RMSD_GDC):     0.552          0.567                  1.032           97.140   94.004

#CA            N1   N2   DIST      N    RMSD    GDT_TS    LGA_S3     LGA_Q 
SUMMARY(GDT)  132  118    4.0    118    0.55    98.729    99.543    18.108

LGA_LOCAL      RMSD:   0.552  Number of atoms:  118  under DIST:   4.00
LGA_ASGN_ATOMS RMSD:   0.552  Number of assigned atoms:  118 
Std_ASGN_ATOMS RMSD:   0.552  Standard rmsd on all 118 assigned CA atoms 

Unitary ROTATION matrix and the SHIFT vector superimpose molecules  (1=>2)
  X_new =  -0.375267 * X  +  -0.813697 * Y  +   0.443927 * Z  + -11.271049
  Y_new =  -0.837322 * X  +   0.092164 * Y  +  -0.538886 * Z  +   4.190264
  Z_new =   0.397576 * X  +  -0.573936 * Y  +  -0.715912 * Z  +   6.584787 

Euler angles from the ROTATION matrix. Conventions XYZ and ZXZ:
           Phi     Theta       Psi   [DEG:       Phi     Theta       Psi ]
XYZ: -1.992132 -0.408874 -2.465825   [DEG: -114.1408  -23.4267 -141.2814 ]
ZXZ:  0.689078  2.368726  2.535770   [DEG:   39.4812  135.7180  145.2890 ]
 
# END of job
