
#######################################################
#                                                     #
#                        LGA                          #
#                  ---------------                    #
#                                                     #
#               Local-Global Alignment                #
#        A Method for Finding 3-D Similarities        #
#               in Protein Structures                 #
#                                                     #
#                  ------------ 10/2009               #
#                                                     #
#      Adam Zemla (adamz@llnl.gov)                    #
#      Lawrence Livermore National Laboratory, CA     #
#                                                     #
#######################################################

!!!   License for LGA program has expired  !!!
#   For updated version of the LGA program   #
# please contact Adam Zemla:  adamz@llnl.gov #

# Molecule1: number of CA atoms  132 ( 1007),  selected  118 , name one
# Molecule2: number of CA atoms  118 (  880),  selected  118 , name two
# PARAMETERS: input.pdb  -ie  -3  -d:4  -sda  -swap  -ch1:B  -ch2:A  
# FIXED Atom-Atom correspondence
# GDT and LCS analysis 

LCS - RMSD CUTOFF   5.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:   118      15_A - 132_A       0.47     0.47
  LCS_AVERAGE:    100.00

LCS - RMSD CUTOFF   2.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:   118      15_A - 132_A       0.47     0.47
  LCS_AVERAGE:    100.00

LCS - RMSD CUTOFF   1.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:   118      15_A - 132_A       0.47     0.47
  LCS_AVERAGE:    100.00

LCS_GDT    MOLECULE-1    MOLECULE-2     LCS_DETAILS     GDT_DETAILS                                                    TOTAL NUMBER OF RESIDUE PAIRS:  118
LCS_GDT     RESIDUE       RESIDUE       SEGMENT_SIZE    GLOBAL DISTANCE TEST COLUMNS: number of residues under the threshold assigned to each residue pair
LCS_GDT   NAME NUMBER   NAME NUMBER    1.0  2.0  5.0    0.5  1.0  1.5  2.0  2.5  3.0  3.5  4.0  4.5  5.0  5.5  6.0  6.5  7.0  7.5  8.0  8.5  9.0  9.5 10.0
LCS_GDT     E    15_B     E    15_A    118  118  118     69  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     V    16_B     V    16_A    118  118  118    101  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     Q    17_B     Q    17_A    118  118  118    101  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     L    18_B     L    18_A    118  118  118    101  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     V    19_B     V    19_A    118  118  118    101  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     E    20_B     E    20_A    118  118  118    101  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     S    21_B     S    21_A    118  118  118    101  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     G    22_B     G    22_A    118  118  118    101  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     G    23_B     G    23_A    118  118  118    101  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     G    24_B     G    24_A    118  118  118    101  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     L    25_B     L    25_A    118  118  118    101  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     V    26_B     V    26_A    118  118  118     50  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     L    27_B     L    27_A    118  118  118    101  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     P    28_B     P    28_A    118  118  118    101  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     G    29_B     G    29_A    118  118  118    101  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     G    30_B     G    30_A    118  118  118    101  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     S    31_B     S    31_A    118  118  118    101  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     L    32_B     L    32_A    118  118  118    101  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     K    33_B     K    33_A    118  118  118    101  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     L    34_B     L    34_A    118  118  118    101  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     S    35_B     S    35_A    118  118  118    101  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     C    36_B     C    36_A    118  118  118    101  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     A    37_B     A    37_A    118  118  118    101  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     A    38_B     A    38_A    118  118  118    101  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     S    39_B     S    39_A    118  118  118    101  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     G    40_B     G    40_A    118  118  118    101  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     F    41_B     F    41_A    118  118  118    101  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     N    42_B     N    42_A    118  118  118    101  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     F    43_B     F    43_A    118  118  118    101  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     G    44_B     G    44_A    118  118  118    101  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     S    45_B     S    45_A    118  118  118    101  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     S    46_B     S    46_A    118  118  118    101  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     D    47_B     D    47_A    118  118  118    101  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     M    48_B     M    48_A    118  118  118    101  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     N    49_B     N    49_A    118  118  118    101  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     W    50_B     W    50_A    118  118  118    101  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     V    51_B     V    51_A    118  118  118    101  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     R    52_B     R    52_A    118  118  118    101  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     Q    53_B     Q    53_A    118  118  118    101  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     A    54_B     A    54_A    118  118  118     97  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     A    55_B     A    55_A    118  118  118     77  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     G    56_B     G    56_A    118  118  118     77  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     K    57_B     K    57_A    118  118  118    101  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     G    58_B     G    58_A    118  118  118    101  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     P    59_B     P    59_A    118  118  118    101  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     E    60_B     E    60_A    118  118  118    101  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     W    61_B     W    61_A    118  118  118    101  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     V    62_B     V    62_A    118  118  118    101  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     A    63_B     A    63_A    118  118  118    101  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     S    64_B     S    64_A    118  118  118    101  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     I    65_B     I    65_A    118  118  118    101  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     E    66_B     E    66_A    118  118  118    101  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     R    67_B     R    67_A    118  118  118    101  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     G    68_B     G    68_A    118  118  118    101  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     A    69_B     A    69_A    118  118  118     24  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     G    70_B     G    70_A    118  118  118    101  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     G    71_B     G    71_A    118  118  118    101  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     T    72_B     T    72_A    118  118  118    101  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     D    73_B     D    73_A    118  118  118    101  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     Y    74_B     Y    74_A    118  118  118    101  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     A    75_B     A    75_A    118  118  118    101  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     D    76_B     D    76_A    118  118  118    100  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     S    77_B     S    77_A    118  118  118     29  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     V    78_B     V    78_A    118  118  118    101  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     Q    79_B     Q    79_A    118  118  118     97  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     G    80_B     G    80_A    118  118  118    101  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     R    81_B     R    81_A    118  118  118    101  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     F    82_B     F    82_A    118  118  118    101  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     T    83_B     T    83_A    118  118  118    101  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     V    84_B     V    84_A    118  118  118    101  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     S    85_B     S    85_A    118  118  118    101  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     R    86_B     R    86_A    118  118  118    101  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     D    87_B     D    87_A    118  118  118    101  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     N    88_B     N    88_A    118  118  118    101  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     A    89_B     A    89_A    118  118  118    100  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     K    90_B     K    90_A    118  118  118    101  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     S    91_B     S    91_A    118  118  118    101  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     T    92_B     T    92_A    118  118  118    101  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     L    93_B     L    93_A    118  118  118    101  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     W    94_B     W    94_A    118  118  118    101  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     L    95_B     L    95_A    118  118  118    101  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     Q    96_B     Q    96_A    118  118  118    101  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     M    97_B     M    97_A    118  118  118    101  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     N    98_B     N    98_A    118  118  118    101  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     S    99_B     S    99_A    118  118  118    101  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     L   100_B     L   100_A    118  118  118    101  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     K   101_B     K   101_A    118  118  118     93  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     A   102_B     A   102_A    118  118  118    101  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     E   103_B     E   103_A    118  118  118    101  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     D   104_B     D   104_A    118  118  118    101  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     T   105_B     T   105_A    118  118  118    101  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     A   106_B     A   106_A    118  118  118    101  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     V   107_B     V   107_A    118  118  118    101  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     Y   108_B     Y   108_A    118  118  118    101  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     Y   109_B     Y   109_A    118  118  118    101  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     C   110_B     C   110_A    118  118  118    101  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     V   111_B     V   111_A    118  118  118    101  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     V   112_B     V   112_A    118  118  118    101  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     S   113_B     S   113_A    118  118  118    101  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     D   114_B     D   114_A    118  118  118    101  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     N   115_B     N   115_A    118  118  118      4   32  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     S   116_B     S   116_A    118  118  118      4   91  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     G   117_B     G   117_A    118  118  118     68  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     Y   118_B     Y   118_A    118  118  118     78  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     Y   119_B     Y   119_A    118  118  118    101  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     K   120_B     K   120_A    118  118  118    101  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     Y   121_B     Y   121_A    118  118  118    101  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     W   122_B     W   122_A    118  118  118    101  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     G   123_B     G   123_A    118  118  118    101  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     Q   124_B     Q   124_A    118  118  118    101  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     G   125_B     G   125_A    118  118  118    101  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     T   126_B     T   126_A    118  118  118    101  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     Q   127_B     Q   127_A    118  118  118    101  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     V   128_B     V   128_A    118  118  118    101  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     T   129_B     T   129_A    118  118  118    101  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     V   130_B     V   130_A    118  118  118    101  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     S   131_B     S   131_A    118  118  118    101  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     S   132_B     S   132_A    118  118  118     28  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_AVERAGE  LCS_A: 100.00  ( 100.00  100.00  100.00 )

GLOBAL_DISTANCE_TEST (summary information about detected largest sets of residues (represented by selected AToms) that can fit under specified thresholds)
GDT DIST_CUTOFF  0.50   1.00   1.50   2.00   2.50   3.00   3.50   4.00   4.50   5.00   5.50   6.00   6.50   7.00   7.50   8.00   8.50   9.00   9.50  10.00
GDT NUMBER_AT    101    116    117    118    118    118    118    118    118    118    118    118    118    118    118    118    118    118    118    118 
GDT PERCENT_AT  85.59  98.31  99.15 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00
GDT RMS_LOCAL    0.28   0.39   0.46   0.47   0.47   0.47   0.47   0.47   0.47   0.47   0.47   0.47   0.47   0.47   0.47   0.47   0.47   0.47   0.47   0.47
GDT RMS_ALL_AT   0.47   0.47   0.47   0.47   0.47   0.47   0.47   0.47   0.47   0.47   0.47   0.47   0.47   0.47   0.47   0.47   0.47   0.47   0.47   0.47

# Checking swapping
#   possible swapping detected:  E    15_B      E    15_A
#   possible swapping detected:  E    20_B      E    20_A
#   possible swapping detected:  F    43_B      F    43_A
#   possible swapping detected:  E    60_B      E    60_A
#   possible swapping detected:  E    66_B      E    66_A
#   possible swapping detected:  Y   108_B      Y   108_A
#   possible swapping detected:  D   114_B      D   114_A

#      Molecule1      Molecule2  DISTANCE    Mis    MC     All    Dist_max   GDC_mc  GDC_all
LGA    E    15_B      E    15_A     0.884     0    0.655   1.135     8.741   80.357   46.402
LGA    V    16_B      V    16_A     0.463     0    0.013   0.038     0.733   97.619   94.558
LGA    Q    17_B      Q    17_A     0.343     0    0.016   0.228     1.944  100.000   88.836
LGA    L    18_B      L    18_A     0.289     0    0.085   0.133     0.670  100.000   98.810
LGA    V    19_B      V    19_A     0.135     0    0.010   0.032     0.166  100.000  100.000
LGA    E    20_B      E    20_A     0.149     0    0.011   0.112     0.682  100.000   98.942
LGA    S    21_B      S    21_A     0.231     0    0.020   0.030     0.313  100.000  100.000
LGA    G    22_B      G    22_A     0.446     0    0.062   0.062     0.725   97.619   97.619
LGA    G    23_B      G    23_A     0.429     0    0.078   0.078     0.852   97.619   97.619
LGA    G    24_B      G    24_A     0.196     0    0.033   0.033     0.314  100.000  100.000
LGA    L    25_B      L    25_A     0.389     0    0.014   0.032     1.586   95.238   89.524
LGA    V    26_B      V    26_A     0.796     0    0.116   0.992     2.750   95.238   84.626
LGA    L    27_B      L    27_A     0.436     0    0.057   0.181     1.064  100.000   94.107
LGA    P    28_B      P    28_A     0.237     0    0.029   0.071     0.306  100.000  100.000
LGA    G    29_B      G    29_A     0.308     0    0.027   0.027     0.485  100.000  100.000
LGA    G    30_B      G    30_A     0.352     0    0.021   0.021     0.352  100.000  100.000
LGA    S    31_B      S    31_A     0.326     0    0.015   0.029     0.413  100.000  100.000
LGA    L    32_B      L    32_A     0.203     0    0.065   1.320     2.813   97.619   85.774
LGA    K    33_B      K    33_A     0.142     0    0.047   0.674     2.007  100.000   92.011
LGA    L    34_B      L    34_A     0.136     0    0.013   0.049     0.246  100.000  100.000
LGA    S    35_B      S    35_A     0.186     0    0.025   0.661     1.876  100.000   95.476
LGA    C    36_B      C    36_A     0.125     0    0.067   0.066     0.294  100.000  100.000
LGA    A    37_B      A    37_A     0.144     0    0.031   0.030     0.175  100.000  100.000
LGA    A    38_B      A    38_A     0.157     0    0.016   0.034     0.300  100.000  100.000
LGA    S    39_B      S    39_A     0.267     0    0.024   0.032     0.543  100.000   98.413
LGA    G    40_B      G    40_A     0.366     0    0.031   0.031     0.481  100.000  100.000
LGA    F    41_B      F    41_A     0.324     0    0.056   0.083     0.459  100.000  100.000
LGA    N    42_B      N    42_A     0.439     0    0.042   0.059     0.680  100.000   95.238
LGA    F    43_B      F    43_A     0.314     0    0.018   0.048     0.359  100.000  100.000
LGA    G    44_B      G    44_A     0.297     0    0.017   0.017     0.297  100.000  100.000
LGA    S    45_B      S    45_A     0.097     0    0.044   0.045     0.277  100.000  100.000
LGA    S    46_B      S    46_A     0.093     0    0.052   0.068     0.240  100.000  100.000
LGA    D    47_B      D    47_A     0.187     0    0.043   0.211     0.496  100.000  100.000
LGA    M    48_B      M    48_A     0.107     0    0.043   0.097     0.534  100.000   98.810
LGA    N    49_B      N    49_A     0.215     0    0.025   0.174     0.860  100.000   96.429
LGA    W    50_B      W    50_A     0.163     0    0.033   0.103     0.452  100.000  100.000
LGA    V    51_B      V    51_A     0.124     0    0.059   0.113     0.472  100.000  100.000
LGA    R    52_B      R    52_A     0.215     0    0.024   0.124     0.762  100.000   96.537
LGA    Q    53_B      Q    53_A     0.147     0    0.074   0.113     0.293  100.000  100.000
LGA    A    54_B      A    54_A     0.639     0    0.022   0.022     0.736   90.476   90.476
LGA    A    55_B      A    55_A     0.993     0    0.035   0.041     1.293   88.214   86.857
LGA    G    56_B      G    56_A     1.039     0    0.032   0.032     1.053   85.952   85.952
LGA    K    57_B      K    57_A     0.615     0    0.019   0.521     3.129   95.238   86.085
LGA    G    58_B      G    58_A     0.388     0    0.038   0.038     0.464  100.000  100.000
LGA    P    59_B      P    59_A     0.516     0    0.051   0.095     0.823   92.857   94.558
LGA    E    60_B      E    60_A     0.472     0    0.042   0.279     1.132  100.000   93.704
LGA    W    61_B      W    61_A     0.221     0    0.011   0.120     0.794  100.000   97.959
LGA    V    62_B      V    62_A     0.112     0    0.034   0.044     0.212  100.000  100.000
LGA    A    63_B      A    63_A     0.174     0    0.044   0.055     0.286  100.000  100.000
LGA    S    64_B      S    64_A     0.528     0    0.052   0.075     0.745   97.619   95.238
LGA    I    65_B      I    65_A     0.171     0    0.023   0.049     0.546  100.000   98.810
LGA    E    66_B      E    66_A     0.164     0    0.028   0.137     0.884  100.000   95.767
LGA    R    67_B      R    67_A     0.099     0    0.015   1.227     4.524  100.000   80.173
LGA    G    68_B      G    68_A     0.514     0    0.020   0.020     0.792   92.857   92.857
LGA    A    69_B      A    69_A     0.967     1    0.051   0.051     0.967   90.476   72.381
LGA    G    70_B      G    70_A     0.203     0    0.030   0.030     0.359  100.000  100.000
LGA    G    71_B      G    71_A     0.330     0    0.020   0.020     0.330  100.000  100.000
LGA    T    72_B      T    72_A     0.177     0    0.024   0.046     0.415  100.000  100.000
LGA    D    73_B      D    73_A     0.138     0    0.044   0.726     2.958  100.000   85.893
LGA    Y    74_B      Y    74_A     0.279     0    0.014   0.069     0.587  100.000   99.206
LGA    A    75_B      A    75_A     0.243     0    0.043   0.065     0.315  100.000  100.000
LGA    D    76_B      D    76_A     0.557     0    0.028   0.070     0.897   92.857   91.667
LGA    S    77_B      S    77_A     0.896     0    0.077   0.154     1.340   92.857   89.048
LGA    V    78_B      V    78_A     0.321     0    0.051   0.078     0.477  100.000  100.000
LGA    Q    79_B      Q    79_A     0.610     0    0.043   1.233     3.750   92.857   80.370
LGA    G    80_B      G    80_A     0.350     0    0.027   0.027     0.410  100.000  100.000
LGA    R    81_B      R    81_A     0.086     0    0.005   0.300     0.863  100.000   99.134
LGA    F    82_B      F    82_A     0.028     0    0.020   0.131     0.640  100.000   97.403
LGA    T    83_B      T    83_A     0.069     0    0.029   0.035     0.166  100.000  100.000
LGA    V    84_B      V    84_A     0.168     0    0.019   0.068     0.425  100.000  100.000
LGA    S    85_B      S    85_A     0.106     0    0.027   0.036     0.205  100.000  100.000
LGA    R    86_B      R    86_A     0.106     0    0.023   0.286     1.776  100.000   93.290
LGA    D    87_B      D    87_A     0.460     0    0.068   0.158     1.306  100.000   94.107
LGA    N    88_B      N    88_A     0.535     0    0.022   0.060     0.822   90.476   90.476
LGA    A    89_B      A    89_A     0.715     0    0.041   0.046     0.912   92.857   92.381
LGA    K    90_B      K    90_A     0.483     0    0.029   0.097     1.053  100.000   93.704
LGA    S    91_B      S    91_A     0.244     0    0.023   0.071     0.500  100.000  100.000
LGA    T    92_B      T    92_A     0.164     0    0.016   0.042     0.388  100.000  100.000
LGA    L    93_B      L    93_A     0.108     0    0.033   0.108     0.644  100.000   96.429
LGA    W    94_B      W    94_A     0.326     0    0.025   1.125     6.060  100.000   73.299
LGA    L    95_B      L    95_A     0.247     0    0.041   0.058     0.314  100.000  100.000
LGA    Q    96_B      Q    96_A     0.243     0    0.037   0.129     0.593  100.000   98.942
LGA    M    97_B      M    97_A     0.283     0    0.076   0.787     2.245  100.000   94.405
LGA    N    98_B      N    98_A     0.278     0    0.020   1.095     2.312  100.000   91.190
LGA    S    99_B      S    99_A     0.445     0    0.026   0.040     0.612  100.000   96.825
LGA    L   100_B      L   100_A     0.192     0    0.016   0.090     0.725  100.000   98.810
LGA    K   101_B      K   101_A     0.592     0    0.040   0.535     1.681   97.619   86.772
LGA    A   102_B      A   102_A     0.471     0    0.031   0.031     0.528   97.619   96.190
LGA    E   103_B      E   103_A     0.427     0    0.031   0.183     1.341  100.000   91.693
LGA    D   104_B      D   104_A     0.311     0    0.026   0.082     0.496  100.000  100.000
LGA    T   105_B      T   105_A     0.187     0    0.048   0.054     0.247  100.000  100.000
LGA    A   106_B      A   106_A     0.171     0    0.050   0.074     0.245  100.000  100.000
LGA    V   107_B      V   107_A     0.201     0    0.025   0.060     0.280  100.000  100.000
LGA    Y   108_B      Y   108_A     0.171     0    0.030   0.049     0.437  100.000  100.000
LGA    Y   109_B      Y   109_A     0.099     0    0.009   0.133     1.172  100.000   96.071
LGA    C   110_B      C   110_A     0.297     0    0.042   0.093     0.938  100.000   96.825
LGA    V   111_B      V   111_A     0.219     0    0.042   0.082     0.553  100.000   97.279
LGA    V   112_B      V   112_A     0.227     0    0.018   0.063     0.275  100.000  100.000
LGA    S   113_B      S   113_A     0.323     0    0.050   0.106     0.598  100.000   98.413
LGA    D   114_B      D   114_A     0.302     0    0.132   0.779     2.985   95.238   83.274
LGA    N   115_B      N   115_A     1.923     0    0.071   0.173     2.754   72.976   67.917
LGA    S   116_B      S   116_A     1.963     0    0.081   0.072     2.242   70.833   70.159
LGA    G   117_B      G   117_A     0.856     0    0.116   0.116     1.089   88.214   88.214
LGA    Y   118_B      Y   118_A     0.758     0    0.068   1.150     8.018   90.476   58.452
LGA    Y   119_B      Y   119_A     0.350     0    0.020   0.108     0.840  100.000   94.444
LGA    K   120_B      K   120_A     0.255     0    0.065   0.625     3.244  100.000   91.323
LGA    Y   121_B      Y   121_A     0.228     0    0.029   0.065     0.260  100.000  100.000
LGA    W   122_B      W   122_A     0.339     0    0.037   0.200     0.587   97.619   97.279
LGA    G   123_B      G   123_A     0.304     0    0.022   0.022     0.306  100.000  100.000
LGA    Q   124_B      Q   124_A     0.279     0    0.029   1.056     3.173  100.000   88.254
LGA    G   125_B      G   125_A     0.283     0    0.045   0.045     0.446  100.000  100.000
LGA    T   126_B      T   126_A     0.169     0    0.040   0.065     0.295  100.000  100.000
LGA    Q   127_B      Q   127_A     0.333     0    0.023   0.194     0.795  100.000   98.942
LGA    V   128_B      V   128_A     0.204     0    0.045   0.058     0.360  100.000  100.000
LGA    T   129_B      T   129_A     0.254     0    0.037   0.075     0.698  100.000   98.639
LGA    V   130_B      V   130_A     0.244     0    0.033   0.034     0.490  100.000  100.000
LGA    S   131_B      S   131_A     0.508     0    0.049   0.060     0.712   92.857   92.063
LGA    S   132_B      S   132_A     1.030     0    0.089   0.600     2.763   83.690   78.889

# RMSD_GDC results:       CA      MC common percent     ALL common percent   GDC_mc  GDC_all
NUMBER_OF_ATOMS_AA:      118     472    472  100.00     880    880  100.00               118
SUMMARY(RMSD_GDC):     0.468          0.484                  1.042           97.831   94.476

#CA            N1   N2   DIST      N    RMSD    GDT_TS    LGA_S3     LGA_Q 
SUMMARY(GDT)  132  118    4.0    118    0.47    99.576    99.803    20.784

LGA_LOCAL      RMSD:   0.468  Number of atoms:  118  under DIST:   4.00
LGA_ASGN_ATOMS RMSD:   0.468  Number of assigned atoms:  118 
Std_ASGN_ATOMS RMSD:   0.468  Standard rmsd on all 118 assigned CA atoms 

Unitary ROTATION matrix and the SHIFT vector superimpose molecules  (1=>2)
  X_new =   0.798281 * X  +   0.256989 * Y  +  -0.544705 * Z  + -11.357214
  Y_new =  -0.585602 * X  +   0.542574 * Y  +  -0.602233 * Z  +   5.017135
  Z_new =   0.140775 * X  +   0.799731 * Y  +   0.583620 * Z  +   8.733956 

Euler angles from the ROTATION matrix. Conventions XYZ and ZXZ:
           Phi     Theta       Psi   [DEG:       Phi     Theta       Psi ]
XYZ: -0.632908 -0.141244  0.940368   [DEG:  -36.2629   -8.0927   53.8791 ]
ZXZ: -0.735282  0.947617  0.174243   [DEG:  -42.1286   54.2944    9.9834 ]
 
# END of job
