
#######################################################
#                                                     #
#                        LGA                          #
#                  ---------------                    #
#                                                     #
#               Local-Global Alignment                #
#        A Method for Finding 3-D Similarities        #
#               in Protein Structures                 #
#                                                     #
#                  ------------ 10/2009               #
#                                                     #
#      Adam Zemla (adamz@llnl.gov)                    #
#      Lawrence Livermore National Laboratory, CA     #
#                                                     #
#######################################################

!!!   License for LGA program has expired  !!!
#   For updated version of the LGA program   #
# please contact Adam Zemla:  adamz@llnl.gov #

# Molecule1: number of CA atoms  132 ( 1007),  selected  118 , name one
# Molecule2: number of CA atoms  118 (  880),  selected  118 , name two
# PARAMETERS: input.pdb  -ie  -3  -d:4  -sda  -swap  -ch1:B  -ch2:A  
# FIXED Atom-Atom correspondence
# GDT and LCS analysis 

LCS - RMSD CUTOFF   5.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:   118      15_A - 132_A       0.44     0.44
  LCS_AVERAGE:    100.00

LCS - RMSD CUTOFF   2.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:   118      15_A - 132_A       0.44     0.44
  LCS_AVERAGE:    100.00

LCS - RMSD CUTOFF   1.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:   118      15_A - 132_A       0.44     0.44
  LCS_AVERAGE:    100.00

LCS_GDT    MOLECULE-1    MOLECULE-2     LCS_DETAILS     GDT_DETAILS                                                    TOTAL NUMBER OF RESIDUE PAIRS:  118
LCS_GDT     RESIDUE       RESIDUE       SEGMENT_SIZE    GLOBAL DISTANCE TEST COLUMNS: number of residues under the threshold assigned to each residue pair
LCS_GDT   NAME NUMBER   NAME NUMBER    1.0  2.0  5.0    0.5  1.0  1.5  2.0  2.5  3.0  3.5  4.0  4.5  5.0  5.5  6.0  6.5  7.0  7.5  8.0  8.5  9.0  9.5 10.0
LCS_GDT     E    15_B     E    15_A    118  118  118     54  113  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     V    16_B     V    16_A    118  118  118    100  113  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     Q    17_B     Q    17_A    118  118  118    100  113  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     L    18_B     L    18_A    118  118  118    100  113  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     V    19_B     V    19_A    118  118  118    100  113  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     E    20_B     E    20_A    118  118  118    100  113  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     S    21_B     S    21_A    118  118  118    100  113  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     G    22_B     G    22_A    118  118  118    100  113  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     G    23_B     G    23_A    118  118  118    100  113  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     G    24_B     G    24_A    118  118  118    100  113  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     L    25_B     L    25_A    118  118  118    100  113  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     V    26_B     V    26_A    118  118  118     23  113  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     L    27_B     L    27_A    118  118  118    100  113  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     P    28_B     P    28_A    118  118  118    100  113  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     G    29_B     G    29_A    118  118  118    100  113  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     G    30_B     G    30_A    118  118  118    100  113  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     S    31_B     S    31_A    118  118  118    100  113  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     L    32_B     L    32_A    118  118  118    100  113  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     K    33_B     K    33_A    118  118  118    100  113  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     L    34_B     L    34_A    118  118  118    100  113  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     S    35_B     S    35_A    118  118  118    100  113  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     C    36_B     C    36_A    118  118  118    100  113  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     A    37_B     A    37_A    118  118  118    100  113  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     A    38_B     A    38_A    118  118  118    100  113  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     S    39_B     S    39_A    118  118  118    100  113  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     G    40_B     G    40_A    118  118  118    100  113  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     F    41_B     F    41_A    118  118  118    100  113  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     N    42_B     N    42_A    118  118  118    100  113  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     F    43_B     F    43_A    118  118  118    100  113  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     G    44_B     G    44_A    118  118  118    100  113  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     S    45_B     S    45_A    118  118  118    100  113  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     S    46_B     S    46_A    118  118  118    100  113  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     D    47_B     D    47_A    118  118  118    100  113  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     M    48_B     M    48_A    118  118  118    100  113  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     N    49_B     N    49_A    118  118  118    100  113  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     W    50_B     W    50_A    118  118  118    100  113  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     V    51_B     V    51_A    118  118  118    100  113  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     R    52_B     R    52_A    118  118  118    100  113  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     Q    53_B     Q    53_A    118  118  118    100  113  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     A    54_B     A    54_A    118  118  118     99  113  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     A    55_B     A    55_A    118  118  118     85  113  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     G    56_B     G    56_A    118  118  118     85  113  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     K    57_B     K    57_A    118  118  118     99  113  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     G    58_B     G    58_A    118  118  118    100  113  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     P    59_B     P    59_A    118  118  118    100  113  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     E    60_B     E    60_A    118  118  118    100  113  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     W    61_B     W    61_A    118  118  118    100  113  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     V    62_B     V    62_A    118  118  118    100  113  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     A    63_B     A    63_A    118  118  118    100  113  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     S    64_B     S    64_A    118  118  118    100  113  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     I    65_B     I    65_A    118  118  118    100  113  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     E    66_B     E    66_A    118  118  118    100  113  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     R    67_B     R    67_A    118  118  118    100  113  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     G    68_B     G    68_A    118  118  118     98  113  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     A    69_B     A    69_A    118  118  118     89  113  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     G    70_B     G    70_A    118  118  118    100  113  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     G    71_B     G    71_A    118  118  118     98  113  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     T    72_B     T    72_A    118  118  118    100  113  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     D    73_B     D    73_A    118  118  118    100  113  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     Y    74_B     Y    74_A    118  118  118    100  113  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     A    75_B     A    75_A    118  118  118    100  113  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     D    76_B     D    76_A    118  118  118    100  113  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     S    77_B     S    77_A    118  118  118     20  113  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     V    78_B     V    78_A    118  118  118    100  113  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     Q    79_B     Q    79_A    118  118  118     98  113  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     G    80_B     G    80_A    118  118  118    100  113  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     R    81_B     R    81_A    118  118  118    100  113  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     F    82_B     F    82_A    118  118  118    100  113  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     T    83_B     T    83_A    118  118  118    100  113  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     V    84_B     V    84_A    118  118  118    100  113  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     S    85_B     S    85_A    118  118  118    100  113  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     R    86_B     R    86_A    118  118  118    100  113  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     D    87_B     D    87_A    118  118  118    100  113  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     N    88_B     N    88_A    118  118  118    100  113  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     A    89_B     A    89_A    118  118  118    100  113  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     K    90_B     K    90_A    118  118  118    100  113  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     S    91_B     S    91_A    118  118  118    100  113  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     T    92_B     T    92_A    118  118  118    100  113  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     L    93_B     L    93_A    118  118  118    100  113  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     W    94_B     W    94_A    118  118  118    100  113  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     L    95_B     L    95_A    118  118  118    100  113  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     Q    96_B     Q    96_A    118  118  118    100  113  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     M    97_B     M    97_A    118  118  118    100  113  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     N    98_B     N    98_A    118  118  118    100  113  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     S    99_B     S    99_A    118  118  118    100  113  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     L   100_B     L   100_A    118  118  118    100  113  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     K   101_B     K   101_A    118  118  118    100  113  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     A   102_B     A   102_A    118  118  118    100  113  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     E   103_B     E   103_A    118  118  118    100  113  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     D   104_B     D   104_A    118  118  118    100  113  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     T   105_B     T   105_A    118  118  118    100  113  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     A   106_B     A   106_A    118  118  118    100  113  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     V   107_B     V   107_A    118  118  118    100  113  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     Y   108_B     Y   108_A    118  118  118    100  113  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     Y   109_B     Y   109_A    118  118  118    100  113  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     C   110_B     C   110_A    118  118  118    100  113  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     V   111_B     V   111_A    118  118  118    100  113  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     V   112_B     V   112_A    118  118  118    100  113  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     S   113_B     S   113_A    118  118  118    100  113  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     D   114_B     D   114_A    118  118  118     36  113  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     N   115_B     N   115_A    118  118  118      4   53  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     S   116_B     S   116_A    118  118  118     22  100  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     G   117_B     G   117_A    118  118  118     36  113  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     Y   118_B     Y   118_A    118  118  118     10  106  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     Y   119_B     Y   119_A    118  118  118     92  113  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     K   120_B     K   120_A    118  118  118    100  113  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     Y   121_B     Y   121_A    118  118  118    100  113  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     W   122_B     W   122_A    118  118  118    100  113  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     G   123_B     G   123_A    118  118  118    100  113  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     Q   124_B     Q   124_A    118  118  118    100  113  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     G   125_B     G   125_A    118  118  118    100  113  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     T   126_B     T   126_A    118  118  118    100  113  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     Q   127_B     Q   127_A    118  118  118    100  113  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     V   128_B     V   128_A    118  118  118    100  113  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     T   129_B     T   129_A    118  118  118    100  113  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     V   130_B     V   130_A    118  118  118    100  113  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     S   131_B     S   131_A    118  118  118    100  113  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     S   132_B     S   132_A    118  118  118     47  113  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_AVERAGE  LCS_A: 100.00  ( 100.00  100.00  100.00 )

GLOBAL_DISTANCE_TEST (summary information about detected largest sets of residues (represented by selected AToms) that can fit under specified thresholds)
GDT DIST_CUTOFF  0.50   1.00   1.50   2.00   2.50   3.00   3.50   4.00   4.50   5.00   5.50   6.00   6.50   7.00   7.50   8.00   8.50   9.00   9.50  10.00
GDT NUMBER_AT    100    113    118    118    118    118    118    118    118    118    118    118    118    118    118    118    118    118    118    118 
GDT PERCENT_AT  84.75  95.76 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00
GDT RMS_LOCAL    0.24   0.34   0.44   0.44   0.44   0.44   0.44   0.44   0.44   0.44   0.44   0.44   0.44   0.44   0.44   0.44   0.44   0.44   0.44   0.44
GDT RMS_ALL_AT   0.45   0.45   0.44   0.44   0.44   0.44   0.44   0.44   0.44   0.44   0.44   0.44   0.44   0.44   0.44   0.44   0.44   0.44   0.44   0.44

# Checking swapping
#   possible swapping detected:  E    15_B      E    15_A
#   possible swapping detected:  E    20_B      E    20_A
#   possible swapping detected:  F    43_B      F    43_A
#   possible swapping detected:  E    60_B      E    60_A
#   possible swapping detected:  E    66_B      E    66_A
#   possible swapping detected:  Y   108_B      Y   108_A
#   possible swapping detected:  D   114_B      D   114_A

#      Molecule1      Molecule2  DISTANCE    Mis    MC     All    Dist_max   GDC_mc  GDC_all
LGA    E    15_B      E    15_A     1.055     0    0.662   1.161     8.844   75.833   43.122
LGA    V    16_B      V    16_A     0.462     0    0.035   0.056     0.703   97.619   95.918
LGA    Q    17_B      Q    17_A     0.284     0    0.023   0.218     2.091  100.000   87.937
LGA    L    18_B      L    18_A     0.259     0    0.027   0.092     0.363  100.000  100.000
LGA    V    19_B      V    19_A     0.144     0    0.033   0.054     0.211  100.000  100.000
LGA    E    20_B      E    20_A     0.198     0    0.047   0.098     0.281  100.000  100.000
LGA    S    21_B      S    21_A     0.246     0    0.022   0.032     0.275  100.000  100.000
LGA    G    22_B      G    22_A     0.511     0    0.063   0.063     0.783   92.857   92.857
LGA    G    23_B      G    23_A     0.358     0    0.073   0.073     0.736   97.619   97.619
LGA    G    24_B      G    24_A     0.273     0    0.031   0.031     0.370  100.000  100.000
LGA    L    25_B      L    25_A     0.504     0    0.013   0.059     1.476   92.857   90.536
LGA    V    26_B      V    26_A     0.834     0    0.095   0.937     2.795   90.476   83.129
LGA    L    27_B      L    27_A     0.422     0    0.038   0.169     0.781  100.000   96.429
LGA    P    28_B      P    28_A     0.273     0    0.026   0.043     0.345  100.000  100.000
LGA    G    29_B      G    29_A     0.280     0    0.032   0.032     0.468  100.000  100.000
LGA    G    30_B      G    30_A     0.402     0    0.026   0.026     0.402  100.000  100.000
LGA    S    31_B      S    31_A     0.227     0    0.030   0.036     0.318  100.000  100.000
LGA    L    32_B      L    32_A     0.204     0    0.061   1.302     2.705   97.619   86.726
LGA    K    33_B      K    33_A     0.221     0    0.087   0.703     2.103   97.619   90.952
LGA    L    34_B      L    34_A     0.137     0    0.009   0.055     0.284  100.000  100.000
LGA    S    35_B      S    35_A     0.192     0    0.006   0.676     1.734  100.000   93.889
LGA    C    36_B      C    36_A     0.164     0    0.028   0.058     0.291  100.000  100.000
LGA    A    37_B      A    37_A     0.163     0    0.037   0.055     0.328  100.000  100.000
LGA    A    38_B      A    38_A     0.136     0    0.026   0.037     0.253  100.000  100.000
LGA    S    39_B      S    39_A     0.227     0    0.035   0.043     0.455  100.000  100.000
LGA    G    40_B      G    40_A     0.388     0    0.047   0.047     0.388  100.000  100.000
LGA    F    41_B      F    41_A     0.153     0    0.064   0.065     0.280  100.000  100.000
LGA    N    42_B      N    42_A     0.141     0    0.019   0.122     0.359  100.000  100.000
LGA    F    43_B      F    43_A     0.139     0    0.041   0.058     0.200  100.000  100.000
LGA    G    44_B      G    44_A     0.205     0    0.024   0.024     0.254  100.000  100.000
LGA    S    45_B      S    45_A     0.179     0    0.010   0.037     0.200  100.000  100.000
LGA    S    46_B      S    46_A     0.220     0    0.051   0.072     0.419  100.000  100.000
LGA    D    47_B      D    47_A     0.102     0    0.011   0.207     0.906  100.000   98.810
LGA    M    48_B      M    48_A     0.117     0    0.081   0.107     0.412  100.000  100.000
LGA    N    49_B      N    49_A     0.193     0    0.022   0.165     0.837  100.000   96.429
LGA    W    50_B      W    50_A     0.148     0    0.034   0.082     0.430  100.000  100.000
LGA    V    51_B      V    51_A     0.032     0    0.045   0.083     0.458  100.000  100.000
LGA    R    52_B      R    52_A     0.168     0    0.033   0.081     0.458  100.000  100.000
LGA    Q    53_B      Q    53_A     0.181     0    0.025   0.075     0.621  100.000   98.942
LGA    A    54_B      A    54_A     0.589     0    0.023   0.025     0.688   92.857   92.381
LGA    A    55_B      A    55_A     1.077     0    0.039   0.047     1.349   83.690   83.238
LGA    G    56_B      G    56_A     1.087     0    0.021   0.021     1.087   83.690   83.690
LGA    K    57_B      K    57_A     0.625     0    0.044   0.858     4.914   95.238   78.624
LGA    G    58_B      G    58_A     0.136     0    0.023   0.023     0.216  100.000  100.000
LGA    P    59_B      P    59_A     0.087     0    0.058   0.067     0.446  100.000  100.000
LGA    E    60_B      E    60_A     0.116     0    0.030   0.203     0.579  100.000   98.942
LGA    W    61_B      W    61_A     0.105     0    0.016   0.131     0.576  100.000   99.320
LGA    V    62_B      V    62_A     0.089     0    0.014   0.043     0.210  100.000  100.000
LGA    A    63_B      A    63_A     0.148     0    0.023   0.025     0.211  100.000  100.000
LGA    S    64_B      S    64_A     0.311     0    0.042   0.067     0.467  100.000  100.000
LGA    I    65_B      I    65_A     0.159     0    0.016   0.032     0.375  100.000  100.000
LGA    E    66_B      E    66_A     0.132     0    0.046   0.241     1.222  100.000   95.820
LGA    R    67_B      R    67_A     0.311     0    0.034   1.033     2.815  100.000   88.615
LGA    G    68_B      G    68_A     0.597     0    0.031   0.031     0.633   92.857   92.857
LGA    A    69_B      A    69_A     0.667     1    0.076   0.076     0.667   90.476   72.381
LGA    G    70_B      G    70_A     0.265     0    0.015   0.015     0.503   97.619   97.619
LGA    G    71_B      G    71_A     0.550     0    0.015   0.015     0.550   97.619   97.619
LGA    T    72_B      T    72_A     0.102     0    0.113   0.196     0.951   97.619   98.639
LGA    D    73_B      D    73_A     0.098     0    0.036   0.766     2.879  100.000   85.893
LGA    Y    74_B      Y    74_A     0.209     0    0.015   0.071     0.426  100.000  100.000
LGA    A    75_B      A    75_A     0.184     0    0.015   0.032     0.385  100.000  100.000
LGA    D    76_B      D    76_A     0.513     0    0.044   0.094     0.955   92.857   91.667
LGA    S    77_B      S    77_A     0.914     0    0.084   0.175     1.301   90.476   87.460
LGA    V    78_B      V    78_A     0.292     0    0.029   0.070     0.462  100.000  100.000
LGA    Q    79_B      Q    79_A     0.626     0    0.044   1.218     3.530   97.619   81.534
LGA    G    80_B      G    80_A     0.151     0    0.029   0.029     0.356  100.000  100.000
LGA    R    81_B      R    81_A     0.111     0    0.028   0.108     0.406  100.000  100.000
LGA    F    82_B      F    82_A     0.111     0    0.041   0.124     0.434  100.000  100.000
LGA    T    83_B      T    83_A     0.163     0    0.031   0.038     0.380  100.000  100.000
LGA    V    84_B      V    84_A     0.170     0    0.019   0.055     0.305  100.000  100.000
LGA    S    85_B      S    85_A     0.111     0    0.037   0.069     0.303  100.000  100.000
LGA    R    86_B      R    86_A     0.038     0    0.035   0.148     0.653  100.000   99.134
LGA    D    87_B      D    87_A     0.244     0    0.016   0.171     1.201  100.000   96.488
LGA    N    88_B      N    88_A     0.234     0    0.037   0.039     0.507  100.000   98.810
LGA    A    89_B      A    89_A     0.337     0    0.025   0.041     0.446  100.000  100.000
LGA    K    90_B      K    90_A     0.351     0    0.019   0.238     0.881  100.000   95.767
LGA    S    91_B      S    91_A     0.119     0    0.020   0.076     0.251  100.000  100.000
LGA    T    92_B      T    92_A     0.089     0    0.019   0.059     0.358  100.000  100.000
LGA    L    93_B      L    93_A     0.055     0    0.018   0.050     0.319  100.000  100.000
LGA    W    94_B      W    94_A     0.083     0    0.033   0.046     0.580  100.000   98.639
LGA    L    95_B      L    95_A     0.133     0    0.021   0.054     0.199  100.000  100.000
LGA    Q    96_B      Q    96_A     0.236     0    0.012   0.222     0.793  100.000   98.942
LGA    M    97_B      M    97_A     0.184     0    0.028   0.209     0.561  100.000   98.810
LGA    N    98_B      N    98_A     0.231     0    0.027   1.063     2.281  100.000   91.190
LGA    S    99_B      S    99_A     0.437     0    0.043   0.058     0.675  100.000   96.825
LGA    L   100_B      L   100_A     0.210     0    0.021   0.052     0.436  100.000  100.000
LGA    K   101_B      K   101_A     0.342     0    0.038   0.522     1.587  100.000   89.735
LGA    A   102_B      A   102_A     0.230     0    0.011   0.030     0.352  100.000  100.000
LGA    E   103_B      E   103_A     0.199     0    0.043   0.154     0.855  100.000   95.767
LGA    D   104_B      D   104_A     0.183     0    0.011   0.038     0.279  100.000  100.000
LGA    T   105_B      T   105_A     0.151     0    0.092   0.094     0.360  100.000  100.000
LGA    A   106_B      A   106_A     0.199     0    0.034   0.045     0.251  100.000  100.000
LGA    V   107_B      V   107_A     0.146     0    0.016   0.098     0.388  100.000  100.000
LGA    Y   108_B      Y   108_A     0.121     0    0.017   0.067     0.230  100.000  100.000
LGA    Y   109_B      Y   109_A     0.024     0    0.021   0.165     1.277  100.000   95.278
LGA    C   110_B      C   110_A     0.431     0    0.062   0.662     1.644  100.000   92.381
LGA    V   111_B      V   111_A     0.277     0    0.007   0.072     0.532  100.000   98.639
LGA    V   112_B      V   112_A     0.170     0    0.028   0.055     0.271  100.000  100.000
LGA    S   113_B      S   113_A     0.343     0    0.022   0.043     0.405  100.000  100.000
LGA    D   114_B      D   114_A     0.811     0    0.102   0.749     1.952   90.476   82.738
LGA    N   115_B      N   115_A     1.532     0    0.074   0.159     2.343   75.238   73.036
LGA    S   116_B      S   116_A     1.726     0    0.099   0.229     2.236   72.976   71.587
LGA    G   117_B      G   117_A     0.995     0    0.121   0.121     1.272   85.952   85.952
LGA    Y   118_B      Y   118_A     1.349     0    0.109   1.325     7.430   81.429   60.317
LGA    Y   119_B      Y   119_A     0.579     0    0.020   0.221     1.546   90.476   89.841
LGA    K   120_B      K   120_A     0.493     0    0.038   0.635     3.326  100.000   91.270
LGA    Y   121_B      Y   121_A     0.259     0    0.019   0.052     0.685  100.000   97.619
LGA    W   122_B      W   122_A     0.198     0    0.028   0.162     0.574  100.000   98.639
LGA    G   123_B      G   123_A     0.132     0    0.020   0.020     0.296  100.000  100.000
LGA    Q   124_B      Q   124_A     0.271     0    0.028   1.058     2.920  100.000   91.164
LGA    G   125_B      G   125_A     0.365     0    0.040   0.040     0.365  100.000  100.000
LGA    T   126_B      T   126_A     0.199     0    0.028   0.065     0.288  100.000  100.000
LGA    Q   127_B      Q   127_A     0.234     0    0.008   0.137     0.538  100.000   98.942
LGA    V   128_B      V   128_A     0.136     0    0.017   0.033     0.270  100.000  100.000
LGA    T   129_B      T   129_A     0.159     0    0.021   0.073     0.603  100.000   98.639
LGA    V   130_B      V   130_A     0.198     0    0.067   0.060     0.263  100.000  100.000
LGA    S   131_B      S   131_A     0.506     0    0.018   0.588     2.269   92.857   87.778
LGA    S   132_B      S   132_A     0.849     0    0.130   0.656     2.589   90.476   84.921

# RMSD_GDC results:       CA      MC common percent     ALL common percent   GDC_mc  GDC_all
NUMBER_OF_ATOMS_AA:      118     472    472  100.00     880    880  100.00               118
SUMMARY(RMSD_GDC):     0.442          0.468                  0.938           97.754   95.241

#CA            N1   N2   DIST      N    RMSD    GDT_TS    LGA_S3     LGA_Q 
SUMMARY(GDT)  132  118    4.0    118    0.44    98.941    99.665    21.773

LGA_LOCAL      RMSD:   0.442  Number of atoms:  118  under DIST:   4.00
LGA_ASGN_ATOMS RMSD:   0.442  Number of assigned atoms:  118 
Std_ASGN_ATOMS RMSD:   0.442  Standard rmsd on all 118 assigned CA atoms 

Unitary ROTATION matrix and the SHIFT vector superimpose molecules  (1=>2)
  X_new =   0.089655 * X  +  -0.455771 * Y  +  -0.885570 * Z  + -11.663537
  Y_new =  -0.018799 * X  +  -0.889767 * Y  +   0.456028 * Z  +   5.392302
  Z_new =  -0.995795 * X  +  -0.024238 * Y  +  -0.088340 * Z  +   6.739122 

Euler angles from the ROTATION matrix. Conventions XYZ and ZXZ:
           Phi     Theta       Psi   [DEG:       Phi     Theta       Psi ]
XYZ: -0.206684  1.479063 -2.873814   [DEG:  -11.8421   84.7441 -164.6574 ]
ZXZ: -2.046335  1.659252 -1.595132   [DEG: -117.2464   95.0681  -91.3943 ]
 
# END of job
