
#######################################################
#                                                     #
#                        LGA                          #
#                  ---------------                    #
#                                                     #
#               Local-Global Alignment                #
#        A Method for Finding 3-D Similarities        #
#               in Protein Structures                 #
#                                                     #
#                  ------------ 10/2009               #
#                                                     #
#      Adam Zemla (adamz@llnl.gov)                    #
#      Lawrence Livermore National Laboratory, CA     #
#                                                     #
#######################################################

!!!   License for LGA program has expired  !!!
#   For updated version of the LGA program   #
# please contact Adam Zemla:  adamz@llnl.gov #

# Molecule1: number of CA atoms  132 ( 1007),  selected  118 , name one
# Molecule2: number of CA atoms  118 (  880),  selected  118 , name two
# PARAMETERS: input.pdb  -ie  -3  -d:4  -sda  -swap  -ch1:B  -ch2:A  
# FIXED Atom-Atom correspondence
# GDT and LCS analysis 

LCS - RMSD CUTOFF   5.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:   118      15_A - 132_A       0.47     0.47
  LCS_AVERAGE:    100.00

LCS - RMSD CUTOFF   2.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:   118      15_A - 132_A       0.47     0.47
  LCS_AVERAGE:    100.00

LCS - RMSD CUTOFF   1.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:   118      15_A - 132_A       0.47     0.47
  LCS_AVERAGE:    100.00

LCS_GDT    MOLECULE-1    MOLECULE-2     LCS_DETAILS     GDT_DETAILS                                                    TOTAL NUMBER OF RESIDUE PAIRS:  118
LCS_GDT     RESIDUE       RESIDUE       SEGMENT_SIZE    GLOBAL DISTANCE TEST COLUMNS: number of residues under the threshold assigned to each residue pair
LCS_GDT   NAME NUMBER   NAME NUMBER    1.0  2.0  5.0    0.5  1.0  1.5  2.0  2.5  3.0  3.5  4.0  4.5  5.0  5.5  6.0  6.5  7.0  7.5  8.0  8.5  9.0  9.5 10.0
LCS_GDT     E    15_B     E    15_A    118  118  118     41  115  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     V    16_B     V    16_A    118  118  118     99  115  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     Q    17_B     Q    17_A    118  118  118     99  115  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     L    18_B     L    18_A    118  118  118     99  115  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     V    19_B     V    19_A    118  118  118     99  115  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     E    20_B     E    20_A    118  118  118     99  115  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     S    21_B     S    21_A    118  118  118     99  115  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     G    22_B     G    22_A    118  118  118     97  115  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     G    23_B     G    23_A    118  118  118     99  115  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     G    24_B     G    24_A    118  118  118     99  115  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     L    25_B     L    25_A    118  118  118     99  115  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     V    26_B     V    26_A    118  118  118     17  115  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     L    27_B     L    27_A    118  118  118     99  115  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     P    28_B     P    28_A    118  118  118     99  115  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     G    29_B     G    29_A    118  118  118     99  115  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     G    30_B     G    30_A    118  118  118     99  115  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     S    31_B     S    31_A    118  118  118     99  115  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     L    32_B     L    32_A    118  118  118     99  115  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     K    33_B     K    33_A    118  118  118     99  115  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     L    34_B     L    34_A    118  118  118     99  115  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     S    35_B     S    35_A    118  118  118     99  115  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     C    36_B     C    36_A    118  118  118     99  115  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     A    37_B     A    37_A    118  118  118     99  115  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     A    38_B     A    38_A    118  118  118     99  115  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     S    39_B     S    39_A    118  118  118     99  115  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     G    40_B     G    40_A    118  118  118     99  115  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     F    41_B     F    41_A    118  118  118     99  115  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     N    42_B     N    42_A    118  118  118     99  115  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     F    43_B     F    43_A    118  118  118     99  115  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     G    44_B     G    44_A    118  118  118     99  115  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     S    45_B     S    45_A    118  118  118     99  115  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     S    46_B     S    46_A    118  118  118     99  115  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     D    47_B     D    47_A    118  118  118     99  115  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     M    48_B     M    48_A    118  118  118     99  115  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     N    49_B     N    49_A    118  118  118     99  115  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     W    50_B     W    50_A    118  118  118     99  115  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     V    51_B     V    51_A    118  118  118     99  115  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     R    52_B     R    52_A    118  118  118     99  115  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     Q    53_B     Q    53_A    118  118  118     99  115  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     A    54_B     A    54_A    118  118  118     99  115  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     A    55_B     A    55_A    118  118  118     51  115  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     G    56_B     G    56_A    118  118  118     51  115  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     K    57_B     K    57_A    118  118  118     99  115  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     G    58_B     G    58_A    118  118  118     99  115  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     P    59_B     P    59_A    118  118  118     99  115  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     E    60_B     E    60_A    118  118  118     99  115  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     W    61_B     W    61_A    118  118  118     99  115  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     V    62_B     V    62_A    118  118  118     99  115  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     A    63_B     A    63_A    118  118  118     99  115  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     S    64_B     S    64_A    118  118  118     99  115  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     I    65_B     I    65_A    118  118  118     99  115  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     E    66_B     E    66_A    118  118  118     99  115  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     R    67_B     R    67_A    118  118  118     99  115  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     G    68_B     G    68_A    118  118  118     99  115  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     A    69_B     A    69_A    118  118  118      7  115  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     G    70_B     G    70_A    118  118  118     99  115  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     G    71_B     G    71_A    118  118  118     95  115  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     T    72_B     T    72_A    118  118  118     99  115  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     D    73_B     D    73_A    118  118  118     99  115  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     Y    74_B     Y    74_A    118  118  118     99  115  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     A    75_B     A    75_A    118  118  118     99  115  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     D    76_B     D    76_A    118  118  118     97  115  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     S    77_B     S    77_A    118  118  118     19  114  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     V    78_B     V    78_A    118  118  118     99  115  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     Q    79_B     Q    79_A    118  118  118     97  115  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     G    80_B     G    80_A    118  118  118     99  115  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     R    81_B     R    81_A    118  118  118     99  115  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     F    82_B     F    82_A    118  118  118     99  115  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     T    83_B     T    83_A    118  118  118     99  115  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     V    84_B     V    84_A    118  118  118     99  115  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     S    85_B     S    85_A    118  118  118     99  115  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     R    86_B     R    86_A    118  118  118     99  115  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     D    87_B     D    87_A    118  118  118     99  115  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     N    88_B     N    88_A    118  118  118     99  115  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     A    89_B     A    89_A    118  118  118     74  115  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     K    90_B     K    90_A    118  118  118     99  115  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     S    91_B     S    91_A    118  118  118     99  115  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     T    92_B     T    92_A    118  118  118     99  115  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     L    93_B     L    93_A    118  118  118     99  115  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     W    94_B     W    94_A    118  118  118     99  115  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     L    95_B     L    95_A    118  118  118     99  115  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     Q    96_B     Q    96_A    118  118  118     99  115  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     M    97_B     M    97_A    118  118  118     99  115  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     N    98_B     N    98_A    118  118  118     99  115  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     S    99_B     S    99_A    118  118  118     99  115  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     L   100_B     L   100_A    118  118  118     99  115  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     K   101_B     K   101_A    118  118  118     99  115  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     A   102_B     A   102_A    118  118  118     99  115  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     E   103_B     E   103_A    118  118  118     99  115  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     D   104_B     D   104_A    118  118  118     99  115  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     T   105_B     T   105_A    118  118  118     99  115  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     A   106_B     A   106_A    118  118  118     99  115  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     V   107_B     V   107_A    118  118  118     99  115  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     Y   108_B     Y   108_A    118  118  118     99  115  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     Y   109_B     Y   109_A    118  118  118     99  115  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     C   110_B     C   110_A    118  118  118     99  115  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     V   111_B     V   111_A    118  118  118     99  115  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     V   112_B     V   112_A    118  118  118     99  115  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     S   113_B     S   113_A    118  118  118     99  115  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     D   114_B     D   114_A    118  118  118     99  115  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     N   115_B     N   115_A    118  118  118      4    9  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     S   116_B     S   116_A    118  118  118     25   92  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     G   117_B     G   117_A    118  118  118     66  115  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     Y   118_B     Y   118_A    118  118  118     64  115  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     Y   119_B     Y   119_A    118  118  118     99  115  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     K   120_B     K   120_A    118  118  118     99  115  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     Y   121_B     Y   121_A    118  118  118     99  115  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     W   122_B     W   122_A    118  118  118     99  115  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     G   123_B     G   123_A    118  118  118     99  115  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     Q   124_B     Q   124_A    118  118  118     99  115  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     G   125_B     G   125_A    118  118  118     99  115  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     T   126_B     T   126_A    118  118  118     99  115  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     Q   127_B     Q   127_A    118  118  118     99  115  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     V   128_B     V   128_A    118  118  118     99  115  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     T   129_B     T   129_A    118  118  118     99  115  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     V   130_B     V   130_A    118  118  118     99  115  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     S   131_B     S   131_A    118  118  118     99  115  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     S   132_B     S   132_A    118  118  118     41  115  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_AVERAGE  LCS_A: 100.00  ( 100.00  100.00  100.00 )

GLOBAL_DISTANCE_TEST (summary information about detected largest sets of residues (represented by selected AToms) that can fit under specified thresholds)
GDT DIST_CUTOFF  0.50   1.00   1.50   2.00   2.50   3.00   3.50   4.00   4.50   5.00   5.50   6.00   6.50   7.00   7.50   8.00   8.50   9.00   9.50  10.00
GDT NUMBER_AT     99    115    118    118    118    118    118    118    118    118    118    118    118    118    118    118    118    118    118    118 
GDT PERCENT_AT  83.90  97.46 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00
GDT RMS_LOCAL    0.26   0.38   0.47   0.47   0.47   0.47   0.47   0.47   0.47   0.47   0.47   0.47   0.47   0.47   0.47   0.47   0.47   0.47   0.47   0.47
GDT RMS_ALL_AT   0.48   0.47   0.47   0.47   0.47   0.47   0.47   0.47   0.47   0.47   0.47   0.47   0.47   0.47   0.47   0.47   0.47   0.47   0.47   0.47

# Checking swapping
#   possible swapping detected:  E    15_B      E    15_A
#   possible swapping detected:  E    20_B      E    20_A
#   possible swapping detected:  F    43_B      F    43_A
#   possible swapping detected:  E    60_B      E    60_A
#   possible swapping detected:  E    66_B      E    66_A
#   possible swapping detected:  Y   108_B      Y   108_A
#   possible swapping detected:  D   114_B      D   114_A

#      Molecule1      Molecule2  DISTANCE    Mis    MC     All    Dist_max   GDC_mc  GDC_all
LGA    E    15_B      E    15_A     0.958     0    0.666   1.165     8.671   80.357   46.402
LGA    V    16_B      V    16_A     0.351     0    0.035   0.054     0.697   97.619   97.279
LGA    Q    17_B      Q    17_A     0.347     0    0.021   0.200     1.914  100.000   88.836
LGA    L    18_B      L    18_A     0.335     0    0.022   0.111     0.647  100.000   98.810
LGA    V    19_B      V    19_A     0.106     0    0.009   0.052     0.185  100.000  100.000
LGA    E    20_B      E    20_A     0.157     0    0.046   0.095     0.363  100.000  100.000
LGA    S    21_B      S    21_A     0.249     0    0.025   0.040     0.271  100.000  100.000
LGA    G    22_B      G    22_A     0.529     0    0.052   0.052     0.829   92.857   92.857
LGA    G    23_B      G    23_A     0.431     0    0.069   0.069     0.784   95.238   95.238
LGA    G    24_B      G    24_A     0.141     0    0.031   0.031     0.332  100.000  100.000
LGA    L    25_B      L    25_A     0.475     0    0.018   0.058     1.666   95.238   89.524
LGA    V    26_B      V    26_A     0.870     0    0.099   0.957     2.760   92.857   83.265
LGA    L    27_B      L    27_A     0.474     0    0.039   0.211     0.956   97.619   94.048
LGA    P    28_B      P    28_A     0.194     0    0.031   0.040     0.264  100.000  100.000
LGA    G    29_B      G    29_A     0.212     0    0.037   0.037     0.401  100.000  100.000
LGA    G    30_B      G    30_A     0.413     0    0.020   0.020     0.413  100.000  100.000
LGA    S    31_B      S    31_A     0.316     0    0.028   0.046     0.448  100.000  100.000
LGA    L    32_B      L    32_A     0.212     0    0.080   1.315     2.780   97.619   86.726
LGA    K    33_B      K    33_A     0.188     0    0.076   0.694     2.037   97.619   90.952
LGA    L    34_B      L    34_A     0.142     0    0.007   0.059     0.210  100.000  100.000
LGA    S    35_B      S    35_A     0.183     0    0.012   0.714     2.111  100.000   94.127
LGA    C    36_B      C    36_A     0.138     0    0.036   0.082     0.245  100.000  100.000
LGA    A    37_B      A    37_A     0.112     0    0.024   0.038     0.236  100.000  100.000
LGA    A    38_B      A    38_A     0.156     0    0.036   0.040     0.285  100.000  100.000
LGA    S    39_B      S    39_A     0.245     0    0.037   0.038     0.544  100.000   98.413
LGA    G    40_B      G    40_A     0.433     0    0.050   0.050     0.467  100.000  100.000
LGA    F    41_B      F    41_A     0.344     0    0.062   0.075     0.477  100.000  100.000
LGA    N    42_B      N    42_A     0.454     0    0.032   0.112     0.701   97.619   94.048
LGA    F    43_B      F    43_A     0.255     0    0.027   0.044     0.301  100.000  100.000
LGA    G    44_B      G    44_A     0.271     0    0.022   0.022     0.272  100.000  100.000
LGA    S    45_B      S    45_A     0.078     0    0.027   0.049     0.281  100.000  100.000
LGA    S    46_B      S    46_A     0.116     0    0.050   0.081     0.310  100.000  100.000
LGA    D    47_B      D    47_A     0.102     0    0.020   0.253     1.133  100.000   97.679
LGA    M    48_B      M    48_A     0.160     0    0.079   0.119     0.491  100.000  100.000
LGA    N    49_B      N    49_A     0.186     0    0.029   0.156     0.799  100.000   96.429
LGA    W    50_B      W    50_A     0.138     0    0.027   0.084     0.453  100.000  100.000
LGA    V    51_B      V    51_A     0.081     0    0.036   0.080     0.410  100.000  100.000
LGA    R    52_B      R    52_A     0.201     0    0.042   0.085     0.805  100.000   96.537
LGA    Q    53_B      Q    53_A     0.086     0    0.051   0.169     0.358  100.000  100.000
LGA    A    54_B      A    54_A     0.646     0    0.025   0.025     0.793   90.476   90.476
LGA    A    55_B      A    55_A     1.025     0    0.049   0.055     1.317   83.690   83.238
LGA    G    56_B      G    56_A     0.953     0    0.045   0.045     1.017   88.214   88.214
LGA    K    57_B      K    57_A     0.623     0    0.034   0.515     2.993   95.238   85.873
LGA    G    58_B      G    58_A     0.330     0    0.033   0.033     0.398  100.000  100.000
LGA    P    59_B      P    59_A     0.465     0    0.072   0.080     0.885   95.238   97.279
LGA    E    60_B      E    60_A     0.329     0    0.034   0.271     0.666  100.000   97.884
LGA    W    61_B      W    61_A     0.220     0    0.015   0.104     0.578  100.000   98.639
LGA    V    62_B      V    62_A     0.098     0    0.011   0.040     0.251  100.000  100.000
LGA    A    63_B      A    63_A     0.171     0    0.022   0.023     0.237  100.000  100.000
LGA    S    64_B      S    64_A     0.383     0    0.043   0.066     0.531  100.000   98.413
LGA    I    65_B      I    65_A     0.199     0    0.011   0.040     0.547  100.000   98.810
LGA    E    66_B      E    66_A     0.136     0    0.031   0.240     1.085  100.000   96.878
LGA    R    67_B      R    67_A     0.175     0    0.047   1.208     4.347  100.000   81.342
LGA    G    68_B      G    68_A     0.461     0    0.060   0.060     0.617   95.238   95.238
LGA    A    69_B      A    69_A     0.968     1    0.108   0.108     0.968   92.857   74.286
LGA    G    70_B      G    70_A     0.124     0    0.030   0.030     0.414  100.000  100.000
LGA    G    71_B      G    71_A     0.549     0    0.026   0.026     0.549   97.619   97.619
LGA    T    72_B      T    72_A     0.122     0    0.111   0.193     0.898   97.619   98.639
LGA    D    73_B      D    73_A     0.082     0    0.037   0.768     3.003  100.000   85.000
LGA    Y    74_B      Y    74_A     0.270     0    0.013   0.074     0.509  100.000   99.206
LGA    A    75_B      A    75_A     0.229     0    0.017   0.032     0.414  100.000  100.000
LGA    D    76_B      D    76_A     0.556     0    0.047   0.086     1.020   90.595   90.536
LGA    S    77_B      S    77_A     1.020     0    0.092   0.189     1.450   88.214   85.952
LGA    V    78_B      V    78_A     0.337     0    0.024   0.053     0.504  100.000   98.639
LGA    Q    79_B      Q    79_A     0.588     0    0.043   1.211     3.553   97.619   82.487
LGA    G    80_B      G    80_A     0.201     0    0.028   0.028     0.375  100.000  100.000
LGA    R    81_B      R    81_A     0.100     0    0.032   0.153     0.517  100.000   99.134
LGA    F    82_B      F    82_A     0.067     0    0.044   0.125     0.468  100.000  100.000
LGA    T    83_B      T    83_A     0.090     0    0.027   0.029     0.307  100.000  100.000
LGA    V    84_B      V    84_A     0.156     0    0.018   0.053     0.291  100.000  100.000
LGA    S    85_B      S    85_A     0.129     0    0.032   0.052     0.304  100.000  100.000
LGA    R    86_B      R    86_A     0.128     0    0.054   0.163     0.936  100.000   96.537
LGA    D    87_B      D    87_A     0.566     0    0.040   0.137     1.626   97.619   90.714
LGA    N    88_B      N    88_A     0.535     0    0.048   0.070     0.695   90.476   91.667
LGA    A    89_B      A    89_A     0.745     0    0.012   0.026     0.890   90.476   90.476
LGA    K    90_B      K    90_A     0.557     0    0.032   0.333     1.156   95.238   92.646
LGA    S    91_B      S    91_A     0.120     0    0.023   0.075     0.370  100.000  100.000
LGA    T    92_B      T    92_A     0.141     0    0.047   0.071     0.418  100.000  100.000
LGA    L    93_B      L    93_A     0.050     0    0.023   0.084     0.449  100.000  100.000
LGA    W    94_B      W    94_A     0.229     0    0.047   1.145     6.005  100.000   73.299
LGA    L    95_B      L    95_A     0.169     0    0.025   0.043     0.203  100.000  100.000
LGA    Q    96_B      Q    96_A     0.275     0    0.013   0.210     0.758  100.000   98.942
LGA    M    97_B      M    97_A     0.245     0    0.073   0.806     2.083  100.000   93.274
LGA    N    98_B      N    98_A     0.333     0    0.024   1.092     2.286  100.000   91.190
LGA    S    99_B      S    99_A     0.443     0    0.042   0.053     0.672  100.000   96.825
LGA    L   100_B      L   100_A     0.246     0    0.034   0.064     0.539  100.000   98.810
LGA    K   101_B      K   101_A     0.527     0    0.032   0.522     1.664   97.619   88.677
LGA    A   102_B      A   102_A     0.406     0    0.013   0.029     0.520  100.000   98.095
LGA    E   103_B      E   103_A     0.425     0    0.026   0.201     1.265  100.000   91.693
LGA    D   104_B      D   104_A     0.322     0    0.009   0.050     0.462  100.000  100.000
LGA    T   105_B      T   105_A     0.144     0    0.096   0.099     0.271  100.000  100.000
LGA    A   106_B      A   106_A     0.173     0    0.032   0.044     0.260  100.000  100.000
LGA    V   107_B      V   107_A     0.138     0    0.020   0.104     0.411  100.000  100.000
LGA    Y   108_B      Y   108_A     0.157     0    0.016   0.055     0.426  100.000  100.000
LGA    Y   109_B      Y   109_A     0.090     0    0.009   0.138     1.097  100.000   96.071
LGA    C   110_B      C   110_A     0.245     0    0.034   0.072     0.463  100.000  100.000
LGA    V   111_B      V   111_A     0.223     0    0.010   0.056     0.429  100.000  100.000
LGA    V   112_B      V   112_A     0.251     0    0.034   0.049     0.338  100.000  100.000
LGA    S   113_B      S   113_A     0.313     0    0.034   0.053     0.467  100.000  100.000
LGA    D   114_B      D   114_A     0.281     0    0.104   0.736     2.878   95.238   83.274
LGA    N   115_B      N   115_A     1.929     0    0.105   0.110     2.833   69.048   65.952
LGA    S   116_B      S   116_A     1.950     0    0.096   0.106     2.254   70.833   70.159
LGA    G   117_B      G   117_A     0.816     0    0.122   0.122     1.066   88.214   88.214
LGA    Y   118_B      Y   118_A     0.780     0    0.093   1.162     8.004   90.476   59.127
LGA    Y   119_B      Y   119_A     0.352     0    0.055   0.162     0.875  100.000   95.238
LGA    K   120_B      K   120_A     0.279     0    0.025   0.643     3.190  100.000   92.328
LGA    Y   121_B      Y   121_A     0.278     0    0.021   0.059     0.407  100.000  100.000
LGA    W   122_B      W   122_A     0.293     0    0.033   0.150     0.602   97.619   98.639
LGA    G   123_B      G   123_A     0.193     0    0.015   0.015     0.226  100.000  100.000
LGA    Q   124_B      Q   124_A     0.211     0    0.019   1.057     3.192  100.000   88.201
LGA    G   125_B      G   125_A     0.385     0    0.031   0.031     0.385  100.000  100.000
LGA    T   126_B      T   126_A     0.241     0    0.030   0.063     0.310  100.000  100.000
LGA    Q   127_B      Q   127_A     0.303     0    0.016   0.148     0.655  100.000   98.942
LGA    V   128_B      V   128_A     0.274     0    0.018   0.035     0.423  100.000  100.000
LGA    T   129_B      T   129_A     0.278     0    0.024   0.074     0.691  100.000   98.639
LGA    V   130_B      V   130_A     0.218     0    0.056   0.054     0.337  100.000  100.000
LGA    S   131_B      S   131_A     0.512     0    0.018   0.051     0.559   95.238   93.651
LGA    S   132_B      S   132_A     0.934     0    0.085   0.607     2.814   90.476   83.413

# RMSD_GDC results:       CA      MC common percent     ALL common percent   GDC_mc  GDC_all
NUMBER_OF_ATOMS_AA:      118     472    472  100.00     880    880  100.00               118
SUMMARY(RMSD_GDC):     0.467          0.488                  1.033           97.677   94.658

#CA            N1   N2   DIST      N    RMSD    GDT_TS    LGA_S3     LGA_Q 
SUMMARY(GDT)  132  118    4.0    118    0.47    99.364    99.799    20.825

LGA_LOCAL      RMSD:   0.467  Number of atoms:  118  under DIST:   4.00
LGA_ASGN_ATOMS RMSD:   0.467  Number of assigned atoms:  118 
Std_ASGN_ATOMS RMSD:   0.467  Standard rmsd on all 118 assigned CA atoms 

Unitary ROTATION matrix and the SHIFT vector superimpose molecules  (1=>2)
  X_new =   0.798147 * X  +   0.257658 * Y  +  -0.544586 * Z  + -11.353159
  Y_new =  -0.585798 * X  +   0.543044 * Y  +  -0.601618 * Z  +   5.021238
  Z_new =   0.140723 * X  +   0.799197 * Y  +   0.584364 * Z  +   8.730227 

Euler angles from the ROTATION matrix. Conventions XYZ and ZXZ:
           Phi     Theta       Psi   [DEG:       Phi     Theta       Psi ]
XYZ: -0.633148 -0.141192  0.939443   [DEG:  -36.2767   -8.0897   53.8261 ]
ZXZ: -0.735682  0.946700  0.174294   [DEG:  -42.1515   54.2419    9.9863 ]
 
# END of job
