
#######################################################
#                                                     #
#                        LGA                          #
#                  ---------------                    #
#                                                     #
#               Local-Global Alignment                #
#        A Method for Finding 3-D Similarities        #
#               in Protein Structures                 #
#                                                     #
#                  ------------ 10/2009               #
#                                                     #
#      Adam Zemla (adamz@llnl.gov)                    #
#      Lawrence Livermore National Laboratory, CA     #
#                                                     #
#######################################################

!!!   License for LGA program has expired  !!!
#   For updated version of the LGA program   #
# please contact Adam Zemla:  adamz@llnl.gov #

# Molecule1: number of CA atoms  132 ( 1007),  selected  118 , name one
# Molecule2: number of CA atoms  118 (  880),  selected  118 , name two
# PARAMETERS: input.pdb  -ie  -3  -d:4  -sda  -swap  -ch1:B  -ch2:A  
# FIXED Atom-Atom correspondence
# GDT and LCS analysis 

LCS - RMSD CUTOFF   5.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:   118      15_A - 132_A       0.48     0.48
  LCS_AVERAGE:    100.00

LCS - RMSD CUTOFF   2.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:   118      15_A - 132_A       0.48     0.48
  LCS_AVERAGE:    100.00

LCS - RMSD CUTOFF   1.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:   118      15_A - 132_A       0.48     0.48
  LCS_AVERAGE:    100.00

LCS_GDT    MOLECULE-1    MOLECULE-2     LCS_DETAILS     GDT_DETAILS                                                    TOTAL NUMBER OF RESIDUE PAIRS:  118
LCS_GDT     RESIDUE       RESIDUE       SEGMENT_SIZE    GLOBAL DISTANCE TEST COLUMNS: number of residues under the threshold assigned to each residue pair
LCS_GDT   NAME NUMBER   NAME NUMBER    1.0  2.0  5.0    0.5  1.0  1.5  2.0  2.5  3.0  3.5  4.0  4.5  5.0  5.5  6.0  6.5  7.0  7.5  8.0  8.5  9.0  9.5 10.0
LCS_GDT     E    15_B     E    15_A    118  118  118     36  110  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     V    16_B     V    16_A    118  118  118     80  113  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     Q    17_B     Q    17_A    118  118  118     94  113  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     L    18_B     L    18_A    118  118  118     94  113  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     V    19_B     V    19_A    118  118  118     94  113  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     E    20_B     E    20_A    118  118  118     94  113  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     S    21_B     S    21_A    118  118  118     94  113  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     G    22_B     G    22_A    118  118  118     87  113  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     G    23_B     G    23_A    118  118  118     88  113  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     G    24_B     G    24_A    118  118  118     94  113  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     L    25_B     L    25_A    118  118  118     94  113  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     V    26_B     V    26_A    118  118  118     39  113  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     L    27_B     L    27_A    118  118  118     94  113  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     P    28_B     P    28_A    118  118  118     94  113  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     G    29_B     G    29_A    118  118  118     94  113  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     G    30_B     G    30_A    118  118  118     94  113  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     S    31_B     S    31_A    118  118  118     94  113  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     L    32_B     L    32_A    118  118  118     94  113  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     K    33_B     K    33_A    118  118  118     94  113  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     L    34_B     L    34_A    118  118  118     94  113  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     S    35_B     S    35_A    118  118  118     94  113  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     C    36_B     C    36_A    118  118  118     94  113  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     A    37_B     A    37_A    118  118  118     94  113  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     A    38_B     A    38_A    118  118  118     94  113  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     S    39_B     S    39_A    118  118  118     94  113  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     G    40_B     G    40_A    118  118  118     94  113  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     F    41_B     F    41_A    118  118  118     94  113  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     N    42_B     N    42_A    118  118  118     94  113  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     F    43_B     F    43_A    118  118  118     94  113  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     G    44_B     G    44_A    118  118  118     94  113  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     S    45_B     S    45_A    118  118  118     94  113  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     S    46_B     S    46_A    118  118  118     94  113  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     D    47_B     D    47_A    118  118  118     94  113  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     M    48_B     M    48_A    118  118  118     94  113  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     N    49_B     N    49_A    118  118  118     94  113  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     W    50_B     W    50_A    118  118  118     94  113  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     V    51_B     V    51_A    118  118  118     94  113  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     R    52_B     R    52_A    118  118  118     94  113  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     Q    53_B     Q    53_A    118  118  118     94  113  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     A    54_B     A    54_A    118  118  118     93  113  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     A    55_B     A    55_A    118  118  118     73  112  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     G    56_B     G    56_A    118  118  118     73  112  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     K    57_B     K    57_A    118  118  118     93  113  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     G    58_B     G    58_A    118  118  118     94  113  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     P    59_B     P    59_A    118  118  118     94  113  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     E    60_B     E    60_A    118  118  118     94  113  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     W    61_B     W    61_A    118  118  118     94  113  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     V    62_B     V    62_A    118  118  118     94  113  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     A    63_B     A    63_A    118  118  118     94  113  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     S    64_B     S    64_A    118  118  118     94  113  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     I    65_B     I    65_A    118  118  118     94  113  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     E    66_B     E    66_A    118  118  118     94  113  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     R    67_B     R    67_A    118  118  118     94  113  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     G    68_B     G    68_A    118  118  118     94  113  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     A    69_B     A    69_A    118  118  118     42  113  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     G    70_B     G    70_A    118  118  118     91  113  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     G    71_B     G    71_A    118  118  118     85  113  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     T    72_B     T    72_A    118  118  118     94  113  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     D    73_B     D    73_A    118  118  118     94  113  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     Y    74_B     Y    74_A    118  118  118     94  113  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     A    75_B     A    75_A    118  118  118     94  113  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     D    76_B     D    76_A    118  118  118     94  113  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     S    77_B     S    77_A    118  118  118      7  113  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     V    78_B     V    78_A    118  118  118     94  113  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     Q    79_B     Q    79_A    118  118  118     36  113  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     G    80_B     G    80_A    118  118  118     94  113  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     R    81_B     R    81_A    118  118  118     94  113  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     F    82_B     F    82_A    118  118  118     94  113  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     T    83_B     T    83_A    118  118  118     94  113  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     V    84_B     V    84_A    118  118  118     94  113  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     S    85_B     S    85_A    118  118  118     94  113  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     R    86_B     R    86_A    118  118  118     94  113  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     D    87_B     D    87_A    118  118  118     74  113  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     N    88_B     N    88_A    118  118  118     94  113  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     A    89_B     A    89_A    118  118  118     79  113  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     K    90_B     K    90_A    118  118  118     93  113  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     S    91_B     S    91_A    118  118  118     94  113  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     T    92_B     T    92_A    118  118  118     94  113  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     L    93_B     L    93_A    118  118  118     94  113  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     W    94_B     W    94_A    118  118  118     94  113  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     L    95_B     L    95_A    118  118  118     94  113  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     Q    96_B     Q    96_A    118  118  118     94  113  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     M    97_B     M    97_A    118  118  118     94  113  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     N    98_B     N    98_A    118  118  118     94  113  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     S    99_B     S    99_A    118  118  118     94  113  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     L   100_B     L   100_A    118  118  118     94  113  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     K   101_B     K   101_A    118  118  118     94  113  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     A   102_B     A   102_A    118  118  118     94  113  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     E   103_B     E   103_A    118  118  118     94  113  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     D   104_B     D   104_A    118  118  118     94  113  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     T   105_B     T   105_A    118  118  118     94  113  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     A   106_B     A   106_A    118  118  118     94  113  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     V   107_B     V   107_A    118  118  118     94  113  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     Y   108_B     Y   108_A    118  118  118     94  113  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     Y   109_B     Y   109_A    118  118  118     94  113  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     C   110_B     C   110_A    118  118  118     94  113  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     V   111_B     V   111_A    118  118  118     94  113  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     V   112_B     V   112_A    118  118  118     94  113  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     S   113_B     S   113_A    118  118  118     94  113  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     D   114_B     D   114_A    118  118  118     44  113  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     N   115_B     N   115_A    118  118  118      4   26  116  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     S   116_B     S   116_A    118  118  118     15   85  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     G   117_B     G   117_A    118  118  118     42  113  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     Y   118_B     Y   118_A    118  118  118     36  113  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     Y   119_B     Y   119_A    118  118  118     94  113  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     K   120_B     K   120_A    118  118  118     94  113  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     Y   121_B     Y   121_A    118  118  118     94  113  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     W   122_B     W   122_A    118  118  118     94  113  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     G   123_B     G   123_A    118  118  118     94  113  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     Q   124_B     Q   124_A    118  118  118     94  113  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     G   125_B     G   125_A    118  118  118     94  113  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     T   126_B     T   126_A    118  118  118     94  113  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     Q   127_B     Q   127_A    118  118  118     94  113  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     V   128_B     V   128_A    118  118  118     94  113  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     T   129_B     T   129_A    118  118  118     94  113  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     V   130_B     V   130_A    118  118  118     94  113  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     S   131_B     S   131_A    118  118  118     91  113  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     S   132_B     S   132_A    118  118  118     39  113  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_AVERAGE  LCS_A: 100.00  ( 100.00  100.00  100.00 )

GLOBAL_DISTANCE_TEST (summary information about detected largest sets of residues (represented by selected AToms) that can fit under specified thresholds)
GDT DIST_CUTOFF  0.50   1.00   1.50   2.00   2.50   3.00   3.50   4.00   4.50   5.00   5.50   6.00   6.50   7.00   7.50   8.00   8.50   9.00   9.50  10.00
GDT NUMBER_AT     94    113    117    118    118    118    118    118    118    118    118    118    118    118    118    118    118    118    118    118 
GDT PERCENT_AT  79.66  95.76  99.15 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00
GDT RMS_LOCAL    0.24   0.38   0.45   0.48   0.48   0.48   0.48   0.48   0.48   0.48   0.48   0.48   0.48   0.48   0.48   0.48   0.48   0.48   0.48   0.48
GDT RMS_ALL_AT   0.49   0.49   0.48   0.48   0.48   0.48   0.48   0.48   0.48   0.48   0.48   0.48   0.48   0.48   0.48   0.48   0.48   0.48   0.48   0.48

# Checking swapping
#   possible swapping detected:  E    15_B      E    15_A
#   possible swapping detected:  E    20_B      E    20_A
#   possible swapping detected:  F    43_B      F    43_A
#   possible swapping detected:  E    60_B      E    60_A
#   possible swapping detected:  E    66_B      E    66_A
#   possible swapping detected:  Y   108_B      Y   108_A
#   possible swapping detected:  D   114_B      D   114_A

#      Molecule1      Molecule2  DISTANCE    Mis    MC     All    Dist_max   GDC_mc  GDC_all
LGA    E    15_B      E    15_A     1.164     0    0.657   1.110     9.279   78.095   43.651
LGA    V    16_B      V    16_A     0.604     0    0.023   0.046     0.838   95.238   93.197
LGA    Q    17_B      Q    17_A     0.240     0    0.020   0.926     4.521  100.000   81.799
LGA    L    18_B      L    18_A     0.209     0    0.028   0.078     0.349  100.000  100.000
LGA    V    19_B      V    19_A     0.139     0    0.017   0.050     0.188  100.000  100.000
LGA    E    20_B      E    20_A     0.177     0    0.042   0.130     0.306  100.000  100.000
LGA    S    21_B      S    21_A     0.307     0    0.020   0.072     0.375  100.000  100.000
LGA    G    22_B      G    22_A     0.600     0    0.056   0.056     0.909   90.476   90.476
LGA    G    23_B      G    23_A     0.568     0    0.084   0.084     0.800   92.857   92.857
LGA    G    24_B      G    24_A     0.211     0    0.027   0.027     0.255  100.000  100.000
LGA    L    25_B      L    25_A     0.421     0    0.016   0.070     1.344   95.238   91.726
LGA    V    26_B      V    26_A     0.819     0    0.098   0.943     2.622   92.857   83.265
LGA    L    27_B      L    27_A     0.493     0    0.042   0.196     0.865   97.619   94.048
LGA    P    28_B      P    28_A     0.278     0    0.027   0.039     0.327  100.000  100.000
LGA    G    29_B      G    29_A     0.306     0    0.034   0.034     0.461  100.000  100.000
LGA    G    30_B      G    30_A     0.480     0    0.035   0.035     0.480  100.000  100.000
LGA    S    31_B      S    31_A     0.280     0    0.039   0.050     0.363  100.000  100.000
LGA    L    32_B      L    32_A     0.184     0    0.087   1.324     2.817   97.619   86.726
LGA    K    33_B      K    33_A     0.168     0    0.057   0.694     2.098  100.000   92.011
LGA    L    34_B      L    34_A     0.103     0    0.036   0.039     0.205  100.000  100.000
LGA    S    35_B      S    35_A     0.065     0    0.013   0.398     1.465  100.000   96.905
LGA    C    36_B      C    36_A     0.210     0    0.038   0.077     0.331  100.000  100.000
LGA    A    37_B      A    37_A     0.154     0    0.037   0.054     0.247  100.000  100.000
LGA    A    38_B      A    38_A     0.138     0    0.028   0.040     0.298  100.000  100.000
LGA    S    39_B      S    39_A     0.337     0    0.042   0.054     0.492  100.000  100.000
LGA    G    40_B      G    40_A     0.580     0    0.035   0.035     0.612   92.857   92.857
LGA    F    41_B      F    41_A     0.403     0    0.066   0.073     0.469  100.000  100.000
LGA    N    42_B      N    42_A     0.292     0    0.020   0.036     0.356  100.000  100.000
LGA    F    43_B      F    43_A     0.237     0    0.049   0.071     0.250  100.000  100.000
LGA    G    44_B      G    44_A     0.275     0    0.026   0.026     0.325  100.000  100.000
LGA    S    45_B      S    45_A     0.178     0    0.017   0.639     2.311  100.000   94.127
LGA    S    46_B      S    46_A     0.246     0    0.063   0.089     0.381  100.000  100.000
LGA    D    47_B      D    47_A     0.108     0    0.011   0.200     0.794  100.000   98.810
LGA    M    48_B      M    48_A     0.165     0    0.073   0.102     0.459  100.000  100.000
LGA    N    49_B      N    49_A     0.176     0    0.029   0.142     0.812  100.000   96.429
LGA    W    50_B      W    50_A     0.134     0    0.027   0.079     0.417  100.000  100.000
LGA    V    51_B      V    51_A     0.057     0    0.048   0.097     0.612   97.619   98.639
LGA    R    52_B      R    52_A     0.288     0    0.044   0.103     0.908  100.000   95.671
LGA    Q    53_B      Q    53_A     0.179     0    0.039   0.138     0.647  100.000   98.942
LGA    A    54_B      A    54_A     0.660     0    0.025   0.024     0.774   90.476   90.476
LGA    A    55_B      A    55_A     1.143     0    0.039   0.047     1.421   83.690   83.238
LGA    G    56_B      G    56_A     1.188     0    0.016   0.016     1.188   81.429   81.429
LGA    K    57_B      K    57_A     0.697     0    0.044   0.861     5.026   95.238   77.037
LGA    G    58_B      G    58_A     0.098     0    0.025   0.025     0.205  100.000  100.000
LGA    P    59_B      P    59_A     0.172     0    0.065   0.072     0.628   97.619   98.639
LGA    E    60_B      E    60_A     0.204     0    0.025   0.290     0.832  100.000   97.884
LGA    W    61_B      W    61_A     0.171     0    0.016   0.154     0.618  100.000   97.959
LGA    V    62_B      V    62_A     0.064     0    0.009   0.047     0.168  100.000  100.000
LGA    A    63_B      A    63_A     0.112     0    0.018   0.019     0.170  100.000  100.000
LGA    S    64_B      S    64_A     0.240     0    0.039   0.064     0.474  100.000  100.000
LGA    I    65_B      I    65_A     0.149     0    0.018   0.028     0.438  100.000  100.000
LGA    E    66_B      E    66_A     0.159     0    0.037   0.241     1.107  100.000   95.820
LGA    R    67_B      R    67_A     0.352     0    0.040   1.150     3.830  100.000   83.939
LGA    G    68_B      G    68_A     0.587     0    0.019   0.019     0.758   92.857   92.857
LGA    A    69_B      A    69_A     0.725     1    0.069   0.069     0.899   90.476   72.381
LGA    G    70_B      G    70_A     0.562     0    0.015   0.015     0.671   90.476   90.476
LGA    G    71_B      G    71_A     0.634     0    0.018   0.018     0.634   95.238   95.238
LGA    T    72_B      T    72_A     0.130     0    0.115   0.196     0.837   97.619   98.639
LGA    D    73_B      D    73_A     0.058     0    0.037   0.776     3.064  100.000   83.988
LGA    Y    74_B      Y    74_A     0.213     0    0.013   0.055     0.489  100.000  100.000
LGA    A    75_B      A    75_A     0.171     0    0.017   0.033     0.333  100.000  100.000
LGA    D    76_B      D    76_A     0.454     0    0.047   0.078     0.982   95.238   92.857
LGA    S    77_B      S    77_A     1.017     0    0.082   0.174     1.483   88.214   85.952
LGA    V    78_B      V    78_A     0.324     0    0.037   0.075     0.453  100.000  100.000
LGA    Q    79_B      Q    79_A     0.760     0    0.040   1.239     3.366   90.476   78.201
LGA    G    80_B      G    80_A     0.250     0    0.029   0.029     0.462  100.000  100.000
LGA    R    81_B      R    81_A     0.151     0    0.018   0.130     0.415  100.000  100.000
LGA    F    82_B      F    82_A     0.066     0    0.034   0.117     0.387  100.000  100.000
LGA    T    83_B      T    83_A     0.150     0    0.028   0.031     0.378  100.000  100.000
LGA    V    84_B      V    84_A     0.207     0    0.019   0.064     0.356  100.000  100.000
LGA    S    85_B      S    85_A     0.127     0    0.033   0.049     0.286  100.000  100.000
LGA    R    86_B      R    86_A     0.063     0    0.057   0.168     0.939  100.000   97.403
LGA    D    87_B      D    87_A     0.637     0    0.039   0.131     1.757   97.619   90.714
LGA    N    88_B      N    88_A     0.463     0    0.038   0.077     0.644   97.619   95.238
LGA    A    89_B      A    89_A     0.644     0    0.029   0.046     0.847   92.857   92.381
LGA    K    90_B      K    90_A     0.610     0    0.022   0.369     1.317   92.857   89.577
LGA    S    91_B      S    91_A     0.145     0    0.024   0.079     0.297  100.000  100.000
LGA    T    92_B      T    92_A     0.162     0    0.044   0.071     0.448  100.000  100.000
LGA    L    93_B      L    93_A     0.073     0    0.027   0.074     0.369  100.000  100.000
LGA    W    94_B      W    94_A     0.168     0    0.048   1.136     6.228  100.000   73.776
LGA    L    95_B      L    95_A     0.149     0    0.028   0.055     0.198  100.000  100.000
LGA    Q    96_B      Q    96_A     0.266     0    0.013   0.214     0.774  100.000   98.942
LGA    M    97_B      M    97_A     0.225     0    0.052   0.697     1.682  100.000   94.286
LGA    N    98_B      N    98_A     0.266     0    0.040   1.089     2.318  100.000   91.190
LGA    S    99_B      S    99_A     0.550     0    0.052   0.065     0.840   97.619   95.238
LGA    L   100_B      L   100_A     0.265     0    0.032   0.060     0.408  100.000  100.000
LGA    K   101_B      K   101_A     0.368     0    0.034   0.524     1.578  100.000   89.735
LGA    A   102_B      A   102_A     0.233     0    0.016   0.028     0.363  100.000  100.000
LGA    E   103_B      E   103_A     0.181     0    0.031   0.204     1.045  100.000   94.815
LGA    D   104_B      D   104_A     0.190     0    0.026   0.065     0.425  100.000  100.000
LGA    T   105_B      T   105_A     0.168     0    0.094   0.095     0.430  100.000  100.000
LGA    A   106_B      A   106_A     0.173     0    0.034   0.046     0.232  100.000  100.000
LGA    V   107_B      V   107_A     0.128     0    0.020   0.111     0.433  100.000  100.000
LGA    Y   108_B      Y   108_A     0.100     0    0.018   0.074     0.286  100.000  100.000
LGA    Y   109_B      Y   109_A     0.092     0    0.007   0.145     1.362  100.000   93.730
LGA    C   110_B      C   110_A     0.280     0    0.033   0.072     0.406  100.000  100.000
LGA    V   111_B      V   111_A     0.287     0    0.012   0.069     0.437  100.000  100.000
LGA    V   112_B      V   112_A     0.151     0    0.019   0.045     0.247  100.000  100.000
LGA    S   113_B      S   113_A     0.381     0    0.028   0.039     0.504  100.000   98.413
LGA    D   114_B      D   114_A     0.738     0    0.105   0.736     2.305   88.214   81.667
LGA    N   115_B      N   115_A     1.876     0    0.105   0.113     2.774   69.048   65.952
LGA    S   116_B      S   116_A     1.696     0    0.108   0.215     2.110   70.833   70.159
LGA    G   117_B      G   117_A     0.965     0    0.120   0.120     0.993   90.476   90.476
LGA    Y   118_B      Y   118_A     1.010     0    0.094   1.331     7.863   88.214   60.437
LGA    Y   119_B      Y   119_A     0.371     0    0.016   0.132     0.948   97.619   95.238
LGA    K   120_B      K   120_A     0.349     0    0.033   0.606     3.202  100.000   91.270
LGA    Y   121_B      Y   121_A     0.262     0    0.014   0.103     0.701  100.000   97.619
LGA    W   122_B      W   122_A     0.249     0    0.019   0.166     0.436  100.000  100.000
LGA    G   123_B      G   123_A     0.131     0    0.021   0.021     0.259  100.000  100.000
LGA    Q   124_B      Q   124_A     0.237     0    0.023   1.062     3.002  100.000   90.265
LGA    G   125_B      G   125_A     0.412     0    0.037   0.037     0.412  100.000  100.000
LGA    T   126_B      T   126_A     0.243     0    0.019   0.049     0.348  100.000  100.000
LGA    Q   127_B      Q   127_A     0.273     0    0.014   0.159     0.548  100.000   98.942
LGA    V   128_B      V   128_A     0.128     0    0.012   0.037     0.342  100.000  100.000
LGA    T   129_B      T   129_A     0.143     0    0.035   0.079     0.460  100.000  100.000
LGA    V   130_B      V   130_A     0.358     0    0.070   0.063     0.426  100.000  100.000
LGA    S   131_B      S   131_A     0.653     0    0.036   0.576     2.295   90.476   86.190
LGA    S   132_B      S   132_A     1.035     0    0.127   0.645     3.143   81.429   76.190

# RMSD_GDC results:       CA      MC common percent     ALL common percent   GDC_mc  GDC_all
NUMBER_OF_ATOMS_AA:      118     472    472  100.00     880    880  100.00               118
SUMMARY(RMSD_GDC):     0.482          0.508                  1.071           97.241   94.229

#CA            N1   N2   DIST      N    RMSD    GDT_TS    LGA_S3     LGA_Q 
SUMMARY(GDT)  132  118    4.0    118    0.48    98.941    99.602    20.279

LGA_LOCAL      RMSD:   0.482  Number of atoms:  118  under DIST:   4.00
LGA_ASGN_ATOMS RMSD:   0.482  Number of assigned atoms:  118 
Std_ASGN_ATOMS RMSD:   0.482  Standard rmsd on all 118 assigned CA atoms 

Unitary ROTATION matrix and the SHIFT vector superimpose molecules  (1=>2)
  X_new =   0.143322 * X  +  -0.738053 * Y  +  -0.659346 * Z  + -12.845510
  Y_new =   0.529458 * X  +  -0.505689 * Y  +   0.681141 * Z  +   5.933756
  Z_new =  -0.836142 * X  +  -0.446718 * Y  +   0.318292 * Z  +   5.994348 

Euler angles from the ROTATION matrix. Conventions XYZ and ZXZ:
           Phi     Theta       Psi   [DEG:       Phi     Theta       Psi ]
XYZ:  1.306437  0.990211 -0.951723   [DEG:   74.8533   56.7349  -54.5297 ]
ZXZ: -2.372452  1.246869 -2.061476   [DEG: -135.9315   71.4404 -118.1139 ]
 
# END of job
