
#######################################################
#                                                     #
#                        LGA                          #
#                  ---------------                    #
#                                                     #
#               Local-Global Alignment                #
#        A Method for Finding 3-D Similarities        #
#               in Protein Structures                 #
#                                                     #
#                  ------------ 10/2009               #
#                                                     #
#      Adam Zemla (adamz@llnl.gov)                    #
#      Lawrence Livermore National Laboratory, CA     #
#                                                     #
#######################################################

!!!   License for LGA program has expired  !!!
#   For updated version of the LGA program   #
# please contact Adam Zemla:  adamz@llnl.gov #

# Molecule1: number of CA atoms  132 ( 1007),  selected  118 , name one
# Molecule2: number of CA atoms  118 (  880),  selected  118 , name two
# PARAMETERS: input.pdb  -ie  -3  -d:4  -sda  -swap  -ch1:B  -ch2:A  
# FIXED Atom-Atom correspondence
# GDT and LCS analysis 

LCS - RMSD CUTOFF   5.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:   118      15_A - 132_A       0.51     0.51
  LCS_AVERAGE:    100.00

LCS - RMSD CUTOFF   2.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:   118      15_A - 132_A       0.51     0.51
  LCS_AVERAGE:    100.00

LCS - RMSD CUTOFF   1.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:   118      15_A - 132_A       0.51     0.51
  LCS_AVERAGE:    100.00

LCS_GDT    MOLECULE-1    MOLECULE-2     LCS_DETAILS     GDT_DETAILS                                                    TOTAL NUMBER OF RESIDUE PAIRS:  118
LCS_GDT     RESIDUE       RESIDUE       SEGMENT_SIZE    GLOBAL DISTANCE TEST COLUMNS: number of residues under the threshold assigned to each residue pair
LCS_GDT   NAME NUMBER   NAME NUMBER    1.0  2.0  5.0    0.5  1.0  1.5  2.0  2.5  3.0  3.5  4.0  4.5  5.0  5.5  6.0  6.5  7.0  7.5  8.0  8.5  9.0  9.5 10.0
LCS_GDT     E    15_B     E    15_A    118  118  118     52  111  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     V    16_B     V    16_A    118  118  118    100  112  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     Q    17_B     Q    17_A    118  118  118    100  112  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     L    18_B     L    18_A    118  118  118    100  112  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     V    19_B     V    19_A    118  118  118    100  112  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     E    20_B     E    20_A    118  118  118    100  112  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     S    21_B     S    21_A    118  118  118    100  112  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     G    22_B     G    22_A    118  118  118    100  112  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     G    23_B     G    23_A    118  118  118    100  112  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     G    24_B     G    24_A    118  118  118    100  112  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     L    25_B     L    25_A    118  118  118    100  112  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     V    26_B     V    26_A    118  118  118     55  112  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     L    27_B     L    27_A    118  118  118    100  112  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     P    28_B     P    28_A    118  118  118    100  112  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     G    29_B     G    29_A    118  118  118    100  112  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     G    30_B     G    30_A    118  118  118    100  112  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     S    31_B     S    31_A    118  118  118    100  112  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     L    32_B     L    32_A    118  118  118    100  112  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     K    33_B     K    33_A    118  118  118    100  112  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     L    34_B     L    34_A    118  118  118    100  112  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     S    35_B     S    35_A    118  118  118    100  112  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     C    36_B     C    36_A    118  118  118    100  112  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     A    37_B     A    37_A    118  118  118    100  112  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     A    38_B     A    38_A    118  118  118    100  112  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     S    39_B     S    39_A    118  118  118    100  112  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     G    40_B     G    40_A    118  118  118    100  112  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     F    41_B     F    41_A    118  118  118    100  112  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     N    42_B     N    42_A    118  118  118    100  112  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     F    43_B     F    43_A    118  118  118    100  112  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     G    44_B     G    44_A    118  118  118    100  112  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     S    45_B     S    45_A    118  118  118    100  112  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     S    46_B     S    46_A    118  118  118    100  112  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     D    47_B     D    47_A    118  118  118    100  112  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     M    48_B     M    48_A    118  118  118    100  112  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     N    49_B     N    49_A    118  118  118    100  112  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     W    50_B     W    50_A    118  118  118    100  112  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     V    51_B     V    51_A    118  118  118    100  112  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     R    52_B     R    52_A    118  118  118    100  112  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     Q    53_B     Q    53_A    118  118  118    100  112  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     A    54_B     A    54_A    118  118  118     99  112  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     A    55_B     A    55_A    118  118  118     10  107  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     G    56_B     G    56_A    118  118  118     10  111  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     K    57_B     K    57_A    118  118  118     99  112  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     G    58_B     G    58_A    118  118  118    100  112  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     P    59_B     P    59_A    118  118  118    100  112  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     E    60_B     E    60_A    118  118  118    100  112  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     W    61_B     W    61_A    118  118  118    100  112  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     V    62_B     V    62_A    118  118  118    100  112  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     A    63_B     A    63_A    118  118  118    100  112  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     S    64_B     S    64_A    118  118  118    100  112  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     I    65_B     I    65_A    118  118  118    100  112  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     E    66_B     E    66_A    118  118  118    100  112  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     R    67_B     R    67_A    118  118  118    100  112  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     G    68_B     G    68_A    118  118  118    100  112  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     A    69_B     A    69_A    118  118  118      3    4    4   38  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     G    70_B     G    70_A    118  118  118    100  112  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     G    71_B     G    71_A    118  118  118     90  112  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     T    72_B     T    72_A    118  118  118    100  112  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     D    73_B     D    73_A    118  118  118    100  112  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     Y    74_B     Y    74_A    118  118  118    100  112  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     A    75_B     A    75_A    118  118  118    100  112  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     D    76_B     D    76_A    118  118  118    100  112  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     S    77_B     S    77_A    118  118  118     18  112  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     V    78_B     V    78_A    118  118  118    100  112  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     Q    79_B     Q    79_A    118  118  118    100  112  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     G    80_B     G    80_A    118  118  118    100  112  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     R    81_B     R    81_A    118  118  118    100  112  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     F    82_B     F    82_A    118  118  118    100  112  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     T    83_B     T    83_A    118  118  118    100  112  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     V    84_B     V    84_A    118  118  118    100  112  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     S    85_B     S    85_A    118  118  118    100  112  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     R    86_B     R    86_A    118  118  118    100  112  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     D    87_B     D    87_A    118  118  118     71  112  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     N    88_B     N    88_A    118  118  118    100  112  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     A    89_B     A    89_A    118  118  118    100  112  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     K    90_B     K    90_A    118  118  118     95  112  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     S    91_B     S    91_A    118  118  118    100  112  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     T    92_B     T    92_A    118  118  118    100  112  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     L    93_B     L    93_A    118  118  118    100  112  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     W    94_B     W    94_A    118  118  118    100  112  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     L    95_B     L    95_A    118  118  118    100  112  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     Q    96_B     Q    96_A    118  118  118    100  112  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     M    97_B     M    97_A    118  118  118    100  112  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     N    98_B     N    98_A    118  118  118    100  112  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     S    99_B     S    99_A    118  118  118    100  112  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     L   100_B     L   100_A    118  118  118    100  112  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     K   101_B     K   101_A    118  118  118    100  112  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     A   102_B     A   102_A    118  118  118    100  112  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     E   103_B     E   103_A    118  118  118    100  112  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     D   104_B     D   104_A    118  118  118    100  112  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     T   105_B     T   105_A    118  118  118    100  112  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     A   106_B     A   106_A    118  118  118    100  112  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     V   107_B     V   107_A    118  118  118    100  112  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     Y   108_B     Y   108_A    118  118  118    100  112  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     Y   109_B     Y   109_A    118  118  118    100  112  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     C   110_B     C   110_A    118  118  118    100  112  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     V   111_B     V   111_A    118  118  118    100  112  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     V   112_B     V   112_A    118  118  118    100  112  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     S   113_B     S   113_A    118  118  118    100  112  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     D   114_B     D   114_A    118  118  118     90  112  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     N   115_B     N   115_A    118  118  118      4   31  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     S   116_B     S   116_A    118  118  118      9   69  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     G   117_B     G   117_A    118  118  118     42  112  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     Y   118_B     Y   118_A    118  118  118     73  112  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     Y   119_B     Y   119_A    118  118  118    100  112  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     K   120_B     K   120_A    118  118  118    100  112  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     Y   121_B     Y   121_A    118  118  118    100  112  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     W   122_B     W   122_A    118  118  118    100  112  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     G   123_B     G   123_A    118  118  118    100  112  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     Q   124_B     Q   124_A    118  118  118    100  112  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     G   125_B     G   125_A    118  118  118    100  112  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     T   126_B     T   126_A    118  118  118    100  112  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     Q   127_B     Q   127_A    118  118  118    100  112  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     V   128_B     V   128_A    118  118  118    100  112  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     T   129_B     T   129_A    118  118  118    100  112  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     V   130_B     V   130_A    118  118  118    100  112  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     S   131_B     S   131_A    118  118  118    100  112  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     S   132_B     S   132_A    118  118  118    100  112  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_AVERAGE  LCS_A: 100.00  ( 100.00  100.00  100.00 )

GLOBAL_DISTANCE_TEST (summary information about detected largest sets of residues (represented by selected AToms) that can fit under specified thresholds)
GDT DIST_CUTOFF  0.50   1.00   1.50   2.00   2.50   3.00   3.50   4.00   4.50   5.00   5.50   6.00   6.50   7.00   7.50   8.00   8.50   9.00   9.50  10.00
GDT NUMBER_AT    100    112    116    117    118    118    118    118    118    118    118    118    118    118    118    118    118    118    118    118 
GDT PERCENT_AT  84.75  94.92  98.31  99.15 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00
GDT RMS_LOCAL    0.24   0.34   0.42   0.46   0.51   0.51   0.51   0.51   0.51   0.51   0.51   0.51   0.51   0.51   0.51   0.51   0.51   0.51   0.51   0.51
GDT RMS_ALL_AT   0.53   0.52   0.51   0.51   0.51   0.51   0.51   0.51   0.51   0.51   0.51   0.51   0.51   0.51   0.51   0.51   0.51   0.51   0.51   0.51

# Checking swapping
#   possible swapping detected:  E    15_B      E    15_A
#   possible swapping detected:  E    20_B      E    20_A
#   possible swapping detected:  F    43_B      F    43_A
#   possible swapping detected:  E    60_B      E    60_A
#   possible swapping detected:  E    66_B      E    66_A
#   possible swapping detected:  Y   108_B      Y   108_A
#   possible swapping detected:  D   114_B      D   114_A

#      Molecule1      Molecule2  DISTANCE    Mis    MC     All    Dist_max   GDC_mc  GDC_all
LGA    E    15_B      E    15_A     1.175     0    0.658   1.196     8.987   76.429   44.074
LGA    V    16_B      V    16_A     0.448     0    0.043   0.064     0.793   97.619   94.558
LGA    Q    17_B      Q    17_A     0.299     0    0.020   0.209     1.819  100.000   89.788
LGA    L    18_B      L    18_A     0.252     0    0.029   0.103     0.554  100.000   98.810
LGA    V    19_B      V    19_A     0.177     0    0.007   0.052     0.235  100.000  100.000
LGA    E    20_B      E    20_A     0.201     0    0.049   0.098     0.437  100.000  100.000
LGA    S    21_B      S    21_A     0.247     0    0.021   0.074     0.336  100.000  100.000
LGA    G    22_B      G    22_A     0.489     0    0.059   0.059     0.769   95.238   95.238
LGA    G    23_B      G    23_A     0.346     0    0.061   0.061     0.664   97.619   97.619
LGA    G    24_B      G    24_A     0.196     0    0.026   0.026     0.334  100.000  100.000
LGA    L    25_B      L    25_A     0.386     0    0.010   0.066     1.335   95.238   91.726
LGA    V    26_B      V    26_A     0.749     0    0.088   0.926     2.628   92.857   84.490
LGA    L    27_B      L    27_A     0.399     0    0.036   0.172     0.753  100.000   96.429
LGA    P    28_B      P    28_A     0.257     0    0.027   0.039     0.276  100.000  100.000
LGA    G    29_B      G    29_A     0.222     0    0.033   0.033     0.350  100.000  100.000
LGA    G    30_B      G    30_A     0.333     0    0.031   0.031     0.344  100.000  100.000
LGA    S    31_B      S    31_A     0.155     0    0.040   0.047     0.309  100.000  100.000
LGA    L    32_B      L    32_A     0.121     0    0.084   1.313     2.750   97.619   85.774
LGA    K    33_B      K    33_A     0.134     0    0.050   0.692     2.132  100.000   92.011
LGA    L    34_B      L    34_A     0.121     0    0.026   0.039     0.179  100.000  100.000
LGA    S    35_B      S    35_A     0.149     0    0.014   0.461     1.525  100.000   95.476
LGA    C    36_B      C    36_A     0.217     0    0.023   0.082     0.308  100.000  100.000
LGA    A    37_B      A    37_A     0.185     0    0.029   0.044     0.344  100.000  100.000
LGA    A    38_B      A    38_A     0.221     0    0.027   0.037     0.291  100.000  100.000
LGA    S    39_B      S    39_A     0.358     0    0.035   0.048     0.628   97.619   96.825
LGA    G    40_B      G    40_A     0.575     0    0.047   0.047     0.651   92.857   92.857
LGA    F    41_B      F    41_A     0.491     0    0.066   0.076     0.568  100.000   97.403
LGA    N    42_B      N    42_A     0.429     0    0.038   0.178     0.776   97.619   96.429
LGA    F    43_B      F    43_A     0.336     0    0.044   0.062     0.338  100.000  100.000
LGA    G    44_B      G    44_A     0.381     0    0.028   0.028     0.385  100.000  100.000
LGA    S    45_B      S    45_A     0.241     0    0.055   0.076     0.344  100.000  100.000
LGA    S    46_B      S    46_A     0.266     0    0.053   0.097     0.590  100.000   98.413
LGA    D    47_B      D    47_A     0.138     0    0.019   0.225     0.924  100.000   98.810
LGA    M    48_B      M    48_A     0.136     0    0.070   0.107     0.407  100.000  100.000
LGA    N    49_B      N    49_A     0.111     0    0.025   0.175     0.879  100.000   96.429
LGA    W    50_B      W    50_A     0.099     0    0.024   0.065     0.296  100.000  100.000
LGA    V    51_B      V    51_A     0.056     0    0.036   0.088     0.471  100.000  100.000
LGA    R    52_B      R    52_A     0.224     0    0.038   0.096     0.742  100.000   97.403
LGA    Q    53_B      Q    53_A     0.169     0    0.039   0.105     0.663  100.000   98.942
LGA    A    54_B      A    54_A     0.688     0    0.025   0.030     0.825   90.476   90.476
LGA    A    55_B      A    55_A     1.310     0    0.053   0.059     1.653   81.429   79.714
LGA    G    56_B      G    56_A     1.278     0    0.053   0.053     1.346   81.429   81.429
LGA    K    57_B      K    57_A     0.750     0    0.050   0.533     3.315   95.238   85.079
LGA    G    58_B      G    58_A     0.109     0    0.027   0.027     0.216  100.000  100.000
LGA    P    59_B      P    59_A     0.265     0    0.070   0.079     0.727   97.619   98.639
LGA    E    60_B      E    60_A     0.241     0    0.030   0.271     0.849  100.000   98.942
LGA    W    61_B      W    61_A     0.185     0    0.016   0.118     0.544  100.000   98.639
LGA    V    62_B      V    62_A     0.036     0    0.008   0.041     0.205  100.000  100.000
LGA    A    63_B      A    63_A     0.154     0    0.020   0.021     0.208  100.000  100.000
LGA    S    64_B      S    64_A     0.373     0    0.043   0.065     0.502  100.000   98.413
LGA    I    65_B      I    65_A     0.219     0    0.019   0.035     0.468  100.000  100.000
LGA    E    66_B      E    66_A     0.065     0    0.033   0.223     1.084  100.000   96.878
LGA    R    67_B      R    67_A     0.379     0    0.035   1.137     3.371  100.000   85.671
LGA    G    68_B      G    68_A     0.525     0    0.605   0.605     1.939   88.452   88.452
LGA    A    69_B      A    69_A     2.409     1    0.119   0.119     2.409   68.810   55.048
LGA    G    70_B      G    70_A     0.280     0    0.130   0.130     0.711   95.238   95.238
LGA    G    71_B      G    71_A     0.659     0    0.041   0.041     0.659   97.619   97.619
LGA    T    72_B      T    72_A     0.121     0    0.110   0.196     0.764   97.619   98.639
LGA    D    73_B      D    73_A     0.067     0    0.043   0.747     2.845  100.000   85.893
LGA    Y    74_B      Y    74_A     0.215     0    0.006   0.059     0.538  100.000   99.206
LGA    A    75_B      A    75_A     0.171     0    0.017   0.035     0.371  100.000  100.000
LGA    D    76_B      D    76_A     0.584     0    0.047   0.081     1.076   90.595   90.536
LGA    S    77_B      S    77_A     1.101     0    0.079   0.182     1.548   88.214   84.524
LGA    V    78_B      V    78_A     0.320     0    0.026   0.070     0.486  100.000  100.000
LGA    Q    79_B      Q    79_A     0.570     0    0.034   1.196     3.404   97.619   82.487
LGA    G    80_B      G    80_A     0.238     0    0.032   0.032     0.399  100.000  100.000
LGA    R    81_B      R    81_A     0.051     0    0.025   0.101     0.402  100.000  100.000
LGA    F    82_B      F    82_A     0.052     0    0.041   0.121     0.391  100.000  100.000
LGA    T    83_B      T    83_A     0.106     0    0.030   0.044     0.386  100.000  100.000
LGA    V    84_B      V    84_A     0.178     0    0.016   0.045     0.273  100.000  100.000
LGA    S    85_B      S    85_A     0.143     0    0.024   0.049     0.324  100.000  100.000
LGA    R    86_B      R    86_A     0.115     0    0.056   0.193     1.000  100.000   96.580
LGA    D    87_B      D    87_A     0.607     0    0.029   0.116     1.738   97.619   90.714
LGA    N    88_B      N    88_A     0.416     0    0.035   0.064     0.764  100.000   96.429
LGA    A    89_B      A    89_A     0.497     0    0.035   0.052     0.697   97.619   96.190
LGA    K    90_B      K    90_A     0.558     0    0.027   0.237     1.345   97.619   90.635
LGA    S    91_B      S    91_A     0.165     0    0.029   0.076     0.292  100.000  100.000
LGA    T    92_B      T    92_A     0.108     0    0.043   0.095     0.356  100.000  100.000
LGA    L    93_B      L    93_A     0.097     0    0.024   0.070     0.342  100.000  100.000
LGA    W    94_B      W    94_A     0.224     0    0.054   1.138     6.002  100.000   73.299
LGA    L    95_B      L    95_A     0.143     0    0.027   0.051     0.202  100.000  100.000
LGA    Q    96_B      Q    96_A     0.255     0    0.020   0.227     0.816  100.000   98.942
LGA    M    97_B      M    97_A     0.174     0    0.055   0.703     1.682  100.000   94.286
LGA    N    98_B      N    98_A     0.190     0    0.035   1.082     2.273  100.000   91.190
LGA    S    99_B      S    99_A     0.413     0    0.052   0.062     0.639  100.000   96.825
LGA    L   100_B      L   100_A     0.213     0    0.023   0.056     0.287  100.000  100.000
LGA    K   101_B      K   101_A     0.235     0    0.033   0.509     1.631  100.000   89.735
LGA    A   102_B      A   102_A     0.140     0    0.014   0.026     0.235  100.000  100.000
LGA    E   103_B      E   103_A     0.165     0    0.035   0.200     1.042  100.000   94.815
LGA    D   104_B      D   104_A     0.208     0    0.022   0.046     0.362  100.000  100.000
LGA    T   105_B      T   105_A     0.134     0    0.095   0.095     0.452  100.000  100.000
LGA    A   106_B      A   106_A     0.146     0    0.037   0.048     0.204  100.000  100.000
LGA    V   107_B      V   107_A     0.043     0    0.014   0.097     0.294  100.000  100.000
LGA    Y   108_B      Y   108_A     0.043     0    0.021   0.076     0.272  100.000  100.000
LGA    Y   109_B      Y   109_A     0.043     0    0.009   0.144     1.075  100.000   95.278
LGA    C   110_B      C   110_A     0.274     0    0.034   0.059     0.495  100.000  100.000
LGA    V   111_B      V   111_A     0.250     0    0.013   0.085     0.426  100.000  100.000
LGA    V   112_B      V   112_A     0.188     0    0.024   0.046     0.242  100.000  100.000
LGA    S   113_B      S   113_A     0.334     0    0.021   0.643     1.711  100.000   93.889
LGA    D   114_B      D   114_A     0.625     0    0.092   0.735     2.828   90.595   80.833
LGA    N   115_B      N   115_A     2.016     0    0.106   0.210     3.085   67.024   63.095
LGA    S   116_B      S   116_A     1.761     0    0.115   0.224     2.071   72.857   71.508
LGA    G   117_B      G   117_A     0.915     0    0.107   0.107     0.963   90.476   90.476
LGA    Y   118_B      Y   118_A     0.704     0    0.084   1.361     8.112   90.476   60.675
LGA    Y   119_B      Y   119_A     0.189     0    0.016   0.186     0.870  100.000   96.825
LGA    K   120_B      K   120_A     0.262     0    0.022   0.629     3.315  100.000   92.328
LGA    Y   121_B      Y   121_A     0.241     0    0.015   0.078     0.537  100.000   99.206
LGA    W   122_B      W   122_A     0.207     0    0.029   0.149     0.474  100.000  100.000
LGA    G   123_B      G   123_A     0.167     0    0.015   0.015     0.214  100.000  100.000
LGA    Q   124_B      Q   124_A     0.157     0    0.025   1.066     3.368  100.000   89.259
LGA    G   125_B      G   125_A     0.311     0    0.032   0.032     0.311  100.000  100.000
LGA    T   126_B      T   126_A     0.179     0    0.028   0.072     0.274  100.000  100.000
LGA    Q   127_B      Q   127_A     0.255     0    0.021   0.128     0.521  100.000   98.942
LGA    V   128_B      V   128_A     0.156     0    0.012   0.034     0.337  100.000  100.000
LGA    T   129_B      T   129_A     0.142     0    0.033   0.073     0.345  100.000  100.000
LGA    V   130_B      V   130_A     0.215     0    0.062   0.055     0.276  100.000  100.000
LGA    S   131_B      S   131_A     0.467     0    0.030   0.571     2.239   97.619   90.952
LGA    S   132_B      S   132_A     0.692     0    0.119   0.643     2.821   90.476   84.921

# RMSD_GDC results:       CA      MC common percent     ALL common percent   GDC_mc  GDC_all
NUMBER_OF_ATOMS_AA:      118     472    472  100.00     880    880  100.00               118
SUMMARY(RMSD_GDC):     0.512          0.530                  1.047           97.487   94.482

#CA            N1   N2   DIST      N    RMSD    GDT_TS    LGA_S3     LGA_Q 
SUMMARY(GDT)  132  118    4.0    118    0.51    98.517    99.413    19.290

LGA_LOCAL      RMSD:   0.512  Number of atoms:  118  under DIST:   4.00
LGA_ASGN_ATOMS RMSD:   0.512  Number of assigned atoms:  118 
Std_ASGN_ATOMS RMSD:   0.512  Standard rmsd on all 118 assigned CA atoms 

Unitary ROTATION matrix and the SHIFT vector superimpose molecules  (1=>2)
  X_new =  -0.021630 * X  +  -0.158280 * Y  +  -0.987157 * Z  + -12.353598
  Y_new =  -0.237258 * X  +  -0.958369 * Y  +   0.158863 * Z  +   4.458712
  Z_new =  -0.971206 * X  +   0.237647 * Y  +  -0.016824 * Z  +   6.875365 

Euler angles from the ROTATION matrix. Conventions XYZ and ZXZ:
           Phi     Theta       Psi   [DEG:       Phi     Theta       Psi ]
XYZ: -1.661712  1.330241  1.641471   [DEG:  -95.2091   76.2172   94.0494 ]
ZXZ: -1.730358  1.587621 -1.330819   [DEG:  -99.1422   90.9640  -76.2503 ]
 
# END of job
