
#######################################################
#                                                     #
#                        LGA                          #
#                  ---------------                    #
#                                                     #
#               Local-Global Alignment                #
#        A Method for Finding 3-D Similarities        #
#               in Protein Structures                 #
#                                                     #
#                  ------------ 10/2009               #
#                                                     #
#      Adam Zemla (adamz@llnl.gov)                    #
#      Lawrence Livermore National Laboratory, CA     #
#                                                     #
#######################################################

!!!   License for LGA program has expired  !!!
#   For updated version of the LGA program   #
# please contact Adam Zemla:  adamz@llnl.gov #

# Molecule1: number of CA atoms  132 ( 1007),  selected  118 , name one
# Molecule2: number of CA atoms  118 (  880),  selected  118 , name two
# PARAMETERS: input.pdb  -ie  -3  -d:4  -sda  -swap  -ch1:B  -ch2:A  
# FIXED Atom-Atom correspondence
# GDT and LCS analysis 

LCS - RMSD CUTOFF   5.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:   118      15_A - 132_A       0.46     0.46
  LCS_AVERAGE:    100.00

LCS - RMSD CUTOFF   2.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:   118      15_A - 132_A       0.46     0.46
  LCS_AVERAGE:    100.00

LCS - RMSD CUTOFF   1.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:   118      15_A - 132_A       0.46     0.46
  LCS_AVERAGE:    100.00

LCS_GDT    MOLECULE-1    MOLECULE-2     LCS_DETAILS     GDT_DETAILS                                                    TOTAL NUMBER OF RESIDUE PAIRS:  118
LCS_GDT     RESIDUE       RESIDUE       SEGMENT_SIZE    GLOBAL DISTANCE TEST COLUMNS: number of residues under the threshold assigned to each residue pair
LCS_GDT   NAME NUMBER   NAME NUMBER    1.0  2.0  5.0    0.5  1.0  1.5  2.0  2.5  3.0  3.5  4.0  4.5  5.0  5.5  6.0  6.5  7.0  7.5  8.0  8.5  9.0  9.5 10.0
LCS_GDT     E    15_B     E    15_A    118  118  118    100  114  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     V    16_B     V    16_A    118  118  118    100  114  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     Q    17_B     Q    17_A    118  118  118    100  114  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     L    18_B     L    18_A    118  118  118    100  114  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     V    19_B     V    19_A    118  118  118    100  114  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     E    20_B     E    20_A    118  118  118    100  114  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     S    21_B     S    21_A    118  118  118    100  114  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     G    22_B     G    22_A    118  118  118    100  114  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     G    23_B     G    23_A    118  118  118    100  114  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     G    24_B     G    24_A    118  118  118    100  114  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     L    25_B     L    25_A    118  118  118    100  114  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     V    26_B     V    26_A    118  118  118    100  114  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     L    27_B     L    27_A    118  118  118    100  114  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     P    28_B     P    28_A    118  118  118    100  114  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     G    29_B     G    29_A    118  118  118    100  114  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     G    30_B     G    30_A    118  118  118    100  114  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     S    31_B     S    31_A    118  118  118    100  114  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     L    32_B     L    32_A    118  118  118    100  114  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     K    33_B     K    33_A    118  118  118    100  114  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     L    34_B     L    34_A    118  118  118    100  114  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     S    35_B     S    35_A    118  118  118    100  114  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     C    36_B     C    36_A    118  118  118    100  114  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     A    37_B     A    37_A    118  118  118    100  114  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     A    38_B     A    38_A    118  118  118    100  114  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     S    39_B     S    39_A    118  118  118    100  114  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     G    40_B     G    40_A    118  118  118    100  114  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     F    41_B     F    41_A    118  118  118    100  114  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     N    42_B     N    42_A    118  118  118    100  114  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     F    43_B     F    43_A    118  118  118    100  114  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     G    44_B     G    44_A    118  118  118    100  114  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     S    45_B     S    45_A    118  118  118    100  114  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     S    46_B     S    46_A    118  118  118    100  114  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     D    47_B     D    47_A    118  118  118    100  114  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     M    48_B     M    48_A    118  118  118    100  114  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     N    49_B     N    49_A    118  118  118    100  114  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     W    50_B     W    50_A    118  118  118    100  114  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     V    51_B     V    51_A    118  118  118    100  114  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     R    52_B     R    52_A    118  118  118    100  114  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     Q    53_B     Q    53_A    118  118  118    100  114  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     A    54_B     A    54_A    118  118  118    100  114  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     A    55_B     A    55_A    118  118  118     39  114  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     G    56_B     G    56_A    118  118  118     13  114  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     K    57_B     K    57_A    118  118  118     99  114  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     G    58_B     G    58_A    118  118  118    100  114  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     P    59_B     P    59_A    118  118  118    100  114  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     E    60_B     E    60_A    118  118  118    100  114  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     W    61_B     W    61_A    118  118  118    100  114  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     V    62_B     V    62_A    118  118  118    100  114  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     A    63_B     A    63_A    118  118  118    100  114  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     S    64_B     S    64_A    118  118  118    100  114  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     I    65_B     I    65_A    118  118  118    100  114  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     E    66_B     E    66_A    118  118  118    100  114  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     R    67_B     R    67_A    118  118  118    100  114  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     G    68_B     G    68_A    118  118  118     87  114  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     A    69_B     A    69_A    118  118  118      3    4   38  114  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     G    70_B     G    70_A    118  118  118    100  114  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     G    71_B     G    71_A    118  118  118    100  114  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     T    72_B     T    72_A    118  118  118    100  114  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     D    73_B     D    73_A    118  118  118    100  114  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     Y    74_B     Y    74_A    118  118  118    100  114  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     A    75_B     A    75_A    118  118  118    100  114  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     D    76_B     D    76_A    118  118  118    100  114  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     S    77_B     S    77_A    118  118  118     67  114  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     V    78_B     V    78_A    118  118  118    100  114  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     Q    79_B     Q    79_A    118  118  118    100  114  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     G    80_B     G    80_A    118  118  118    100  114  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     R    81_B     R    81_A    118  118  118    100  114  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     F    82_B     F    82_A    118  118  118    100  114  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     T    83_B     T    83_A    118  118  118    100  114  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     V    84_B     V    84_A    118  118  118    100  114  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     S    85_B     S    85_A    118  118  118    100  114  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     R    86_B     R    86_A    118  118  118    100  114  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     D    87_B     D    87_A    118  118  118     75  114  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     N    88_B     N    88_A    118  118  118     99  114  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     A    89_B     A    89_A    118  118  118     87  114  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     K    90_B     K    90_A    118  118  118     75  114  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     S    91_B     S    91_A    118  118  118    100  114  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     T    92_B     T    92_A    118  118  118    100  114  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     L    93_B     L    93_A    118  118  118    100  114  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     W    94_B     W    94_A    118  118  118    100  114  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     L    95_B     L    95_A    118  118  118    100  114  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     Q    96_B     Q    96_A    118  118  118    100  114  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     M    97_B     M    97_A    118  118  118    100  114  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     N    98_B     N    98_A    118  118  118    100  114  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     S    99_B     S    99_A    118  118  118    100  114  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     L   100_B     L   100_A    118  118  118    100  114  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     K   101_B     K   101_A    118  118  118    100  114  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     A   102_B     A   102_A    118  118  118    100  114  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     E   103_B     E   103_A    118  118  118    100  114  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     D   104_B     D   104_A    118  118  118    100  114  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     T   105_B     T   105_A    118  118  118    100  114  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     A   106_B     A   106_A    118  118  118    100  114  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     V   107_B     V   107_A    118  118  118    100  114  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     Y   108_B     Y   108_A    118  118  118    100  114  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     Y   109_B     Y   109_A    118  118  118    100  114  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     C   110_B     C   110_A    118  118  118    100  114  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     V   111_B     V   111_A    118  118  118    100  114  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     V   112_B     V   112_A    118  118  118    100  114  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     S   113_B     S   113_A    118  118  118    100  114  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     D   114_B     D   114_A    118  118  118     86  114  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     N   115_B     N   115_A    118  118  118      4    8  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     S   116_B     S   116_A    118  118  118      4  109  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     G   117_B     G   117_A    118  118  118     66  114  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     Y   118_B     Y   118_A    118  118  118     85  114  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     Y   119_B     Y   119_A    118  118  118    100  114  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     K   120_B     K   120_A    118  118  118    100  114  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     Y   121_B     Y   121_A    118  118  118    100  114  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     W   122_B     W   122_A    118  118  118    100  114  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     G   123_B     G   123_A    118  118  118    100  114  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     Q   124_B     Q   124_A    118  118  118    100  114  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     G   125_B     G   125_A    118  118  118    100  114  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     T   126_B     T   126_A    118  118  118    100  114  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     Q   127_B     Q   127_A    118  118  118    100  114  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     V   128_B     V   128_A    118  118  118    100  114  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     T   129_B     T   129_A    118  118  118    100  114  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     V   130_B     V   130_A    118  118  118    100  114  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     S   131_B     S   131_A    118  118  118    100  114  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     S   132_B     S   132_A    118  118  118    100  114  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_AVERAGE  LCS_A: 100.00  ( 100.00  100.00  100.00 )

GLOBAL_DISTANCE_TEST (summary information about detected largest sets of residues (represented by selected AToms) that can fit under specified thresholds)
GDT DIST_CUTOFF  0.50   1.00   1.50   2.00   2.50   3.00   3.50   4.00   4.50   5.00   5.50   6.00   6.50   7.00   7.50   8.00   8.50   9.00   9.50  10.00
GDT NUMBER_AT    100    114    117    117    118    118    118    118    118    118    118    118    118    118    118    118    118    118    118    118 
GDT PERCENT_AT  84.75  96.61  99.15  99.15 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00
GDT RMS_LOCAL    0.23   0.34   0.41   0.41   0.46   0.46   0.46   0.46   0.46   0.46   0.46   0.46   0.46   0.46   0.46   0.46   0.46   0.46   0.46   0.46
GDT RMS_ALL_AT   0.46   0.46   0.46   0.46   0.46   0.46   0.46   0.46   0.46   0.46   0.46   0.46   0.46   0.46   0.46   0.46   0.46   0.46   0.46   0.46

# Checking swapping
#   possible swapping detected:  E    15_B      E    15_A
#   possible swapping detected:  E    20_B      E    20_A
#   possible swapping detected:  F    43_B      F    43_A
#   possible swapping detected:  E    60_B      E    60_A
#   possible swapping detected:  E    66_B      E    66_A
#   possible swapping detected:  Y   108_B      Y   108_A
#   possible swapping detected:  D   114_B      D   114_A

#      Molecule1      Molecule2  DISTANCE    Mis    MC     All    Dist_max   GDC_mc  GDC_all
LGA    E    15_B      E    15_A     0.388     0    0.669   1.150     7.949   87.500   52.487
LGA    V    16_B      V    16_A     0.290     0    0.032   0.052     0.507  100.000   98.639
LGA    Q    17_B      Q    17_A     0.270     0    0.032   0.199     1.489  100.000   93.810
LGA    L    18_B      L    18_A     0.128     0    0.032   0.108     0.492  100.000  100.000
LGA    V    19_B      V    19_A     0.100     0    0.011   0.053     0.186  100.000  100.000
LGA    E    20_B      E    20_A     0.153     0    0.047   0.118     0.295  100.000  100.000
LGA    S    21_B      S    21_A     0.183     0    0.021   0.029     0.256  100.000  100.000
LGA    G    22_B      G    22_A     0.480     0    0.021   0.021     0.556   97.619   97.619
LGA    G    23_B      G    23_A     0.356     0    0.054   0.054     0.547   97.619   97.619
LGA    G    24_B      G    24_A     0.298     0    0.035   0.035     0.316  100.000  100.000
LGA    L    25_B      L    25_A     0.402     0    0.010   0.072     1.117   97.619   92.917
LGA    V    26_B      V    26_A     0.576     0    0.072   1.125     2.598   97.619   87.279
LGA    L    27_B      L    27_A     0.230     0    0.031   0.179     0.776  100.000   98.810
LGA    P    28_B      P    28_A     0.249     0    0.026   0.042     0.278  100.000  100.000
LGA    G    29_B      G    29_A     0.162     0    0.031   0.031     0.246  100.000  100.000
LGA    G    30_B      G    30_A     0.214     0    0.033   0.033     0.241  100.000  100.000
LGA    S    31_B      S    31_A     0.224     0    0.026   0.045     0.410  100.000  100.000
LGA    L    32_B      L    32_A     0.099     0    0.052   0.471     1.313  100.000   95.357
LGA    K    33_B      K    33_A     0.058     0    0.049   0.699     2.289  100.000   92.169
LGA    L    34_B      L    34_A     0.221     0    0.010   0.088     0.278  100.000  100.000
LGA    S    35_B      S    35_A     0.094     0    0.034   0.173     0.718  100.000   98.413
LGA    C    36_B      C    36_A     0.143     0    0.030   0.076     0.317  100.000  100.000
LGA    A    37_B      A    37_A     0.116     0    0.032   0.048     0.255  100.000  100.000
LGA    A    38_B      A    38_A     0.144     0    0.024   0.038     0.236  100.000  100.000
LGA    S    39_B      S    39_A     0.301     0    0.032   0.044     0.689   97.619   96.825
LGA    G    40_B      G    40_A     0.569     0    0.051   0.051     0.701   92.857   92.857
LGA    F    41_B      F    41_A     0.537     0    0.066   0.068     0.651   95.238   93.939
LGA    N    42_B      N    42_A     0.469     0    0.029   0.137     0.694   97.619   94.048
LGA    F    43_B      F    43_A     0.335     0    0.069   0.076     0.352  100.000  100.000
LGA    G    44_B      G    44_A     0.466     0    0.025   0.025     0.468  100.000  100.000
LGA    S    45_B      S    45_A     0.325     0    0.061   0.076     0.491  100.000  100.000
LGA    S    46_B      S    46_A     0.303     0    0.062   0.086     0.585  100.000   98.413
LGA    D    47_B      D    47_A     0.066     0    0.011   0.164     0.475  100.000  100.000
LGA    M    48_B      M    48_A     0.086     0    0.067   0.088     0.322  100.000  100.000
LGA    N    49_B      N    49_A     0.211     0    0.019   0.130     0.528  100.000   98.810
LGA    W    50_B      W    50_A     0.172     0    0.025   0.075     0.377  100.000  100.000
LGA    V    51_B      V    51_A     0.109     0    0.034   0.066     0.434  100.000  100.000
LGA    R    52_B      R    52_A     0.212     0    0.042   0.079     0.561  100.000   99.134
LGA    Q    53_B      Q    53_A     0.134     0    0.029   0.151     0.574  100.000   98.942
LGA    A    54_B      A    54_A     0.498     0    0.025   0.025     0.586   95.238   94.286
LGA    A    55_B      A    55_A     1.042     0    0.050   0.057     1.313   83.690   83.238
LGA    G    56_B      G    56_A     1.109     0    0.022   0.022     1.109   81.429   81.429
LGA    K    57_B      K    57_A     0.684     0    0.047   0.866     4.903   95.238   78.624
LGA    G    58_B      G    58_A     0.169     0    0.022   0.022     0.265  100.000  100.000
LGA    P    59_B      P    59_A     0.111     0    0.063   0.071     0.481  100.000  100.000
LGA    E    60_B      E    60_A     0.111     0    0.024   0.275     0.923  100.000   98.942
LGA    W    61_B      W    61_A     0.106     0    0.013   0.084     0.274  100.000  100.000
LGA    V    62_B      V    62_A     0.052     0    0.008   0.039     0.188  100.000  100.000
LGA    A    63_B      A    63_A     0.052     0    0.018   0.019     0.097  100.000  100.000
LGA    S    64_B      S    64_A     0.100     0    0.033   0.056     0.252  100.000  100.000
LGA    I    65_B      I    65_A     0.076     0    0.021   0.032     0.196  100.000  100.000
LGA    E    66_B      E    66_A     0.122     0    0.035   0.229     1.208  100.000   96.878
LGA    R    67_B      R    67_A     0.464     0    0.034   0.832     3.636  100.000   87.273
LGA    G    68_B      G    68_A     0.691     0    0.627   0.627     2.290   84.048   84.048
LGA    A    69_B      A    69_A     2.215     1    0.086   0.086     2.215   70.833   56.667
LGA    G    70_B      G    70_A     0.482     0    0.088   0.088     0.744   95.238   95.238
LGA    G    71_B      G    71_A     0.547     0    0.041   0.041     0.547   97.619   97.619
LGA    T    72_B      T    72_A     0.082     0    0.117   0.203     0.878   97.619   98.639
LGA    D    73_B      D    73_A     0.074     0    0.043   0.786     2.983  100.000   85.893
LGA    Y    74_B      Y    74_A     0.155     0    0.017   0.064     0.392  100.000  100.000
LGA    A    75_B      A    75_A     0.057     0    0.017   0.037     0.277  100.000  100.000
LGA    D    76_B      D    76_A     0.450     0    0.050   0.131     0.958   95.238   92.857
LGA    S    77_B      S    77_A     0.941     0    0.077   0.160     1.376   90.476   87.460
LGA    V    78_B      V    78_A     0.217     0    0.033   0.064     0.363  100.000  100.000
LGA    Q    79_B      Q    79_A     0.504     0    0.028   1.087     3.839   97.619   80.212
LGA    G    80_B      G    80_A     0.257     0    0.025   0.025     0.404  100.000  100.000
LGA    R    81_B      R    81_A     0.088     0    0.031   0.065     0.169  100.000  100.000
LGA    F    82_B      F    82_A     0.152     0    0.029   0.111     0.267  100.000  100.000
LGA    T    83_B      T    83_A     0.098     0    0.036   0.042     0.347  100.000  100.000
LGA    V    84_B      V    84_A     0.114     0    0.020   0.061     0.238  100.000  100.000
LGA    S    85_B      S    85_A     0.079     0    0.025   0.048     0.278  100.000  100.000
LGA    R    86_B      R    86_A     0.123     0    0.053   0.172     0.812  100.000   98.268
LGA    D    87_B      D    87_A     0.735     0    0.032   0.133     1.914   92.857   87.202
LGA    N    88_B      N    88_A     0.508     0    0.045   0.093     0.731   95.238   92.857
LGA    A    89_B      A    89_A     0.661     0    0.036   0.052     0.888   92.857   92.381
LGA    K    90_B      K    90_A     0.663     0    0.029   0.206     1.476   92.857   87.513
LGA    S    91_B      S    91_A     0.148     0    0.026   0.075     0.317  100.000  100.000
LGA    T    92_B      T    92_A     0.208     0    0.041   0.086     0.583  100.000   98.639
LGA    L    93_B      L    93_A     0.127     0    0.025   0.068     0.210  100.000  100.000
LGA    W    94_B      W    94_A     0.108     0    0.044   1.156     5.589  100.000   74.830
LGA    L    95_B      L    95_A     0.144     0    0.025   0.048     0.258  100.000  100.000
LGA    Q    96_B      Q    96_A     0.242     0    0.011   0.195     0.709  100.000   98.942
LGA    M    97_B      M    97_A     0.133     0    0.033   0.109     0.443  100.000  100.000
LGA    N    98_B      N    98_A     0.178     0    0.028   1.091     2.268  100.000   91.190
LGA    S    99_B      S    99_A     0.245     0    0.038   0.056     0.418  100.000  100.000
LGA    L   100_B      L   100_A     0.162     0    0.024   0.057     0.256  100.000  100.000
LGA    K   101_B      K   101_A     0.319     0    0.037   0.511     1.550  100.000   89.735
LGA    A   102_B      A   102_A     0.178     0    0.017   0.027     0.303  100.000  100.000
LGA    E   103_B      E   103_A     0.034     0    0.044   0.179     0.931  100.000   96.825
LGA    D   104_B      D   104_A     0.067     0    0.013   0.039     0.178  100.000  100.000
LGA    T   105_B      T   105_A     0.113     0    0.099   0.099     0.506   97.619   98.639
LGA    A   106_B      A   106_A     0.102     0    0.034   0.049     0.154  100.000  100.000
LGA    V   107_B      V   107_A     0.039     0    0.014   0.097     0.313  100.000  100.000
LGA    Y   108_B      Y   108_A     0.085     0    0.020   0.061     0.265  100.000  100.000
LGA    Y   109_B      Y   109_A     0.060     0    0.018   0.150     0.989  100.000   96.825
LGA    C   110_B      C   110_A     0.363     0    0.066   0.643     1.641  100.000   93.889
LGA    V   111_B      V   111_A     0.176     0    0.020   0.086     0.476  100.000  100.000
LGA    V   112_B      V   112_A     0.173     0    0.031   0.100     0.340  100.000  100.000
LGA    S   113_B      S   113_A     0.347     0    0.013   0.649     1.618  100.000   93.889
LGA    D   114_B      D   114_A     0.645     0    0.081   0.752     2.662   92.857   81.964
LGA    N   115_B      N   115_A     1.640     0    0.102   0.223     2.509   72.976   68.929
LGA    S   116_B      S   116_A     1.629     0    0.107   0.223     2.043   77.143   74.365
LGA    G   117_B      G   117_A     0.798     0    0.089   0.089     0.837   90.476   90.476
LGA    Y   118_B      Y   118_A     0.769     0    0.086   1.365     7.915   90.476   61.944
LGA    Y   119_B      Y   119_A     0.179     0    0.017   0.155     0.599  100.000   97.619
LGA    K   120_B      K   120_A     0.252     0    0.019   0.579     2.472  100.000   93.968
LGA    Y   121_B      Y   121_A     0.173     0    0.021   0.084     0.880  100.000   96.825
LGA    W   122_B      W   122_A     0.121     0    0.035   0.141     0.409  100.000  100.000
LGA    G   123_B      G   123_A     0.219     0    0.012   0.012     0.219  100.000  100.000
LGA    Q   124_B      Q   124_A     0.275     0    0.028   1.034     3.397  100.000   87.196
LGA    G   125_B      G   125_A     0.225     0    0.022   0.022     0.275  100.000  100.000
LGA    T   126_B      T   126_A     0.156     0    0.023   0.049     0.223  100.000  100.000
LGA    Q   127_B      Q   127_A     0.227     0    0.010   0.159     0.565  100.000   98.942
LGA    V   128_B      V   128_A     0.138     0    0.012   0.045     0.248  100.000  100.000
LGA    T   129_B      T   129_A     0.161     0    0.018   0.064     0.527  100.000   98.639
LGA    V   130_B      V   130_A     0.170     0    0.054   0.051     0.274  100.000  100.000
LGA    S   131_B      S   131_A     0.488     0    0.018   0.026     0.819  100.000   96.825
LGA    S   132_B      S   132_A     0.731     0    0.095   0.623     2.792   85.952   81.905

# RMSD_GDC results:       CA      MC common percent     ALL common percent   GDC_mc  GDC_all
NUMBER_OF_ATOMS_AA:      118     472    472  100.00     880    880  100.00               118
SUMMARY(RMSD_GDC):     0.459          0.480                  0.977           97.686   94.903

#CA            N1   N2   DIST      N    RMSD    GDT_TS    LGA_S3     LGA_Q 
SUMMARY(GDT)  132  118    4.0    118    0.46    98.941    99.610    21.119

LGA_LOCAL      RMSD:   0.459  Number of atoms:  118  under DIST:   4.00
LGA_ASGN_ATOMS RMSD:   0.459  Number of assigned atoms:  118 
Std_ASGN_ATOMS RMSD:   0.459  Standard rmsd on all 118 assigned CA atoms 

Unitary ROTATION matrix and the SHIFT vector superimpose molecules  (1=>2)
  X_new =   0.015822 * X  +  -0.403049 * Y  +  -0.915042 * Z  + -11.113546
  Y_new =   0.327549 * X  +  -0.862569 * Y  +   0.385600 * Z  +   4.059717
  Z_new =  -0.944702 * X  +  -0.305822 * Y  +   0.118371 * Z  +   6.676727 

Euler angles from the ROTATION matrix. Conventions XYZ and ZXZ:
           Phi     Theta       Psi   [DEG:       Phi     Theta       Psi ]
XYZ:  1.522531  1.236684 -1.201496   [DEG:   87.2346   70.8568  -68.8406 ]
ZXZ: -1.969615  1.452147 -1.883873   [DEG: -112.8506   83.2019 -107.9380 ]
 
# END of job
