
#######################################################
#                                                     #
#                        LGA                          #
#                  ---------------                    #
#                                                     #
#               Local-Global Alignment                #
#        A Method for Finding 3-D Similarities        #
#               in Protein Structures                 #
#                                                     #
#                  ------------ 10/2009               #
#                                                     #
#      Adam Zemla (adamz@llnl.gov)                    #
#      Lawrence Livermore National Laboratory, CA     #
#                                                     #
#######################################################

!!!   License for LGA program has expired  !!!
#   For updated version of the LGA program   #
# please contact Adam Zemla:  adamz@llnl.gov #

# Molecule1: number of CA atoms  132 ( 1007),  selected  118 , name one
# Molecule2: number of CA atoms  118 (  880),  selected  118 , name two
# PARAMETERS: input.pdb  -ie  -3  -d:4  -sda  -swap  -ch1:B  -ch2:A  
# FIXED Atom-Atom correspondence
# GDT and LCS analysis 

LCS - RMSD CUTOFF   5.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:   118      15_A - 132_A       0.50     0.50
  LCS_AVERAGE:    100.00

LCS - RMSD CUTOFF   2.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:   118      15_A - 132_A       0.50     0.50
  LCS_AVERAGE:    100.00

LCS - RMSD CUTOFF   1.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:   118      15_A - 132_A       0.50     0.50
  LCS_AVERAGE:    100.00

LCS_GDT    MOLECULE-1    MOLECULE-2     LCS_DETAILS     GDT_DETAILS                                                    TOTAL NUMBER OF RESIDUE PAIRS:  118
LCS_GDT     RESIDUE       RESIDUE       SEGMENT_SIZE    GLOBAL DISTANCE TEST COLUMNS: number of residues under the threshold assigned to each residue pair
LCS_GDT   NAME NUMBER   NAME NUMBER    1.0  2.0  5.0    0.5  1.0  1.5  2.0  2.5  3.0  3.5  4.0  4.5  5.0  5.5  6.0  6.5  7.0  7.5  8.0  8.5  9.0  9.5 10.0
LCS_GDT     E    15_B     E    15_A    118  118  118     94  112  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     V    16_B     V    16_A    118  118  118     98  112  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     Q    17_B     Q    17_A    118  118  118     98  112  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     L    18_B     L    18_A    118  118  118     98  112  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     V    19_B     V    19_A    118  118  118     98  112  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     E    20_B     E    20_A    118  118  118     98  112  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     S    21_B     S    21_A    118  118  118     98  112  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     G    22_B     G    22_A    118  118  118     98  112  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     G    23_B     G    23_A    118  118  118     98  112  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     G    24_B     G    24_A    118  118  118     98  112  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     L    25_B     L    25_A    118  118  118     98  112  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     V    26_B     V    26_A    118  118  118     98  112  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     L    27_B     L    27_A    118  118  118     98  112  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     P    28_B     P    28_A    118  118  118     98  112  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     G    29_B     G    29_A    118  118  118     98  112  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     G    30_B     G    30_A    118  118  118     98  112  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     S    31_B     S    31_A    118  118  118     98  112  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     L    32_B     L    32_A    118  118  118     98  112  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     K    33_B     K    33_A    118  118  118     98  112  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     L    34_B     L    34_A    118  118  118     98  112  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     S    35_B     S    35_A    118  118  118     98  112  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     C    36_B     C    36_A    118  118  118     98  112  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     A    37_B     A    37_A    118  118  118     98  112  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     A    38_B     A    38_A    118  118  118     98  112  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     S    39_B     S    39_A    118  118  118     98  112  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     G    40_B     G    40_A    118  118  118     98  112  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     F    41_B     F    41_A    118  118  118     98  112  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     N    42_B     N    42_A    118  118  118     98  112  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     F    43_B     F    43_A    118  118  118     98  112  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     G    44_B     G    44_A    118  118  118     98  112  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     S    45_B     S    45_A    118  118  118     98  112  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     S    46_B     S    46_A    118  118  118     98  112  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     D    47_B     D    47_A    118  118  118     98  112  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     M    48_B     M    48_A    118  118  118     98  112  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     N    49_B     N    49_A    118  118  118     98  112  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     W    50_B     W    50_A    118  118  118     98  112  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     V    51_B     V    51_A    118  118  118     98  112  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     R    52_B     R    52_A    118  118  118     98  112  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     Q    53_B     Q    53_A    118  118  118     98  112  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     A    54_B     A    54_A    118  118  118     98  112  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     A    55_B     A    55_A    118  118  118     13  112  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     G    56_B     G    56_A    118  118  118     11  112  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     K    57_B     K    57_A    118  118  118     95  112  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     G    58_B     G    58_A    118  118  118     98  112  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     P    59_B     P    59_A    118  118  118     98  112  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     E    60_B     E    60_A    118  118  118     98  112  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     W    61_B     W    61_A    118  118  118     98  112  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     V    62_B     V    62_A    118  118  118     98  112  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     A    63_B     A    63_A    118  118  118     98  112  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     S    64_B     S    64_A    118  118  118     98  112  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     I    65_B     I    65_A    118  118  118     98  112  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     E    66_B     E    66_A    118  118  118     98  112  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     R    67_B     R    67_A    118  118  118     98  112  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     G    68_B     G    68_A    118  118  118     95  112  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     A    69_B     A    69_A    118  118  118      3    4   42  101  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     G    70_B     G    70_A    118  118  118     98  112  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     G    71_B     G    71_A    118  118  118     98  112  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     T    72_B     T    72_A    118  118  118     98  112  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     D    73_B     D    73_A    118  118  118     98  112  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     Y    74_B     Y    74_A    118  118  118     98  112  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     A    75_B     A    75_A    118  118  118     98  112  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     D    76_B     D    76_A    118  118  118     98  112  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     S    77_B     S    77_A    118  118  118     12  112  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     V    78_B     V    78_A    118  118  118     98  112  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     Q    79_B     Q    79_A    118  118  118     98  112  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     G    80_B     G    80_A    118  118  118     98  112  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     R    81_B     R    81_A    118  118  118     98  112  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     F    82_B     F    82_A    118  118  118     98  112  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     T    83_B     T    83_A    118  118  118     98  112  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     V    84_B     V    84_A    118  118  118     98  112  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     S    85_B     S    85_A    118  118  118     98  112  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     R    86_B     R    86_A    118  118  118     98  112  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     D    87_B     D    87_A    118  118  118     79  112  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     N    88_B     N    88_A    118  118  118     98  112  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     A    89_B     A    89_A    118  118  118     92  112  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     K    90_B     K    90_A    118  118  118     95  112  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     S    91_B     S    91_A    118  118  118     98  112  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     T    92_B     T    92_A    118  118  118     98  112  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     L    93_B     L    93_A    118  118  118     98  112  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     W    94_B     W    94_A    118  118  118     98  112  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     L    95_B     L    95_A    118  118  118     98  112  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     Q    96_B     Q    96_A    118  118  118     98  112  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     M    97_B     M    97_A    118  118  118     98  112  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     N    98_B     N    98_A    118  118  118     98  112  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     S    99_B     S    99_A    118  118  118     98  112  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     L   100_B     L   100_A    118  118  118     98  112  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     K   101_B     K   101_A    118  118  118     98  112  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     A   102_B     A   102_A    118  118  118     98  112  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     E   103_B     E   103_A    118  118  118     98  112  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     D   104_B     D   104_A    118  118  118     98  112  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     T   105_B     T   105_A    118  118  118     98  112  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     A   106_B     A   106_A    118  118  118     98  112  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     V   107_B     V   107_A    118  118  118     98  112  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     Y   108_B     Y   108_A    118  118  118     98  112  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     Y   109_B     Y   109_A    118  118  118     98  112  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     C   110_B     C   110_A    118  118  118     98  112  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     V   111_B     V   111_A    118  118  118     98  112  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     V   112_B     V   112_A    118  118  118     98  112  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     S   113_B     S   113_A    118  118  118     98  112  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     D   114_B     D   114_A    118  118  118     76  112  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     N   115_B     N   115_A    118  118  118      5   10  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     S   116_B     S   116_A    118  118  118      5   71  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     G   117_B     G   117_A    118  118  118     28  112  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     Y   118_B     Y   118_A    118  118  118     55  112  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     Y   119_B     Y   119_A    118  118  118     98  112  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     K   120_B     K   120_A    118  118  118     98  112  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     Y   121_B     Y   121_A    118  118  118     98  112  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     W   122_B     W   122_A    118  118  118     98  112  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     G   123_B     G   123_A    118  118  118     98  112  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     Q   124_B     Q   124_A    118  118  118     98  112  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     G   125_B     G   125_A    118  118  118     98  112  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     T   126_B     T   126_A    118  118  118     98  112  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     Q   127_B     Q   127_A    118  118  118     98  112  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     V   128_B     V   128_A    118  118  118     98  112  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     T   129_B     T   129_A    118  118  118     98  112  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     V   130_B     V   130_A    118  118  118     98  112  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     S   131_B     S   131_A    118  118  118     98  112  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     S   132_B     S   132_A    118  118  118     98  112  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_AVERAGE  LCS_A: 100.00  ( 100.00  100.00  100.00 )

GLOBAL_DISTANCE_TEST (summary information about detected largest sets of residues (represented by selected AToms) that can fit under specified thresholds)
GDT DIST_CUTOFF  0.50   1.00   1.50   2.00   2.50   3.00   3.50   4.00   4.50   5.00   5.50   6.00   6.50   7.00   7.50   8.00   8.50   9.00   9.50  10.00
GDT NUMBER_AT     98    112    117    117    118    118    118    118    118    118    118    118    118    118    118    118    118    118    118    118 
GDT PERCENT_AT  83.05  94.92  99.15  99.15 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00
GDT RMS_LOCAL    0.23   0.34   0.46   0.46   0.50   0.50   0.50   0.50   0.50   0.50   0.50   0.50   0.50   0.50   0.50   0.50   0.50   0.50   0.50   0.50
GDT RMS_ALL_AT   0.51   0.51   0.50   0.50   0.50   0.50   0.50   0.50   0.50   0.50   0.50   0.50   0.50   0.50   0.50   0.50   0.50   0.50   0.50   0.50

# Checking swapping
#   possible swapping detected:  E    15_B      E    15_A
#   possible swapping detected:  E    20_B      E    20_A
#   possible swapping detected:  F    43_B      F    43_A
#   possible swapping detected:  E    60_B      E    60_A
#   possible swapping detected:  E    66_B      E    66_A
#   possible swapping detected:  Y   108_B      Y   108_A
#   possible swapping detected:  D   114_B      D   114_A

#      Molecule1      Molecule2  DISTANCE    Mis    MC     All    Dist_max   GDC_mc  GDC_all
LGA    E    15_B      E    15_A     0.570     0    0.663   1.158     8.315   85.119   49.418
LGA    V    16_B      V    16_A     0.301     0    0.039   0.058     0.533  100.000   98.639
LGA    Q    17_B      Q    17_A     0.247     0    0.033   0.215     1.711  100.000   92.857
LGA    L    18_B      L    18_A     0.160     0    0.026   0.087     0.279  100.000  100.000
LGA    V    19_B      V    19_A     0.094     0    0.019   0.052     0.160  100.000  100.000
LGA    E    20_B      E    20_A     0.138     0    0.051   0.095     0.262  100.000  100.000
LGA    S    21_B      S    21_A     0.171     0    0.024   0.072     0.253  100.000  100.000
LGA    G    22_B      G    22_A     0.477     0    0.058   0.058     0.782   95.238   95.238
LGA    G    23_B      G    23_A     0.384     0    0.066   0.066     0.655   97.619   97.619
LGA    G    24_B      G    24_A     0.257     0    0.032   0.032     0.293  100.000  100.000
LGA    L    25_B      L    25_A     0.423     0    0.010   0.074     1.165   95.238   91.726
LGA    V    26_B      V    26_A     0.648     0    0.075   1.113     2.692   97.619   85.986
LGA    L    27_B      L    27_A     0.266     0    0.033   0.180     0.780  100.000   98.810
LGA    P    28_B      P    28_A     0.248     0    0.026   0.042     0.261  100.000  100.000
LGA    G    29_B      G    29_A     0.227     0    0.035   0.035     0.353  100.000  100.000
LGA    G    30_B      G    30_A     0.330     0    0.018   0.018     0.348  100.000  100.000
LGA    S    31_B      S    31_A     0.168     0    0.032   0.049     0.467  100.000  100.000
LGA    L    32_B      L    32_A     0.126     0    0.067   1.279     2.708   97.619   84.702
LGA    K    33_B      K    33_A     0.149     0    0.063   0.690     2.215  100.000   91.111
LGA    L    34_B      L    34_A     0.188     0    0.006   0.059     0.238  100.000  100.000
LGA    S    35_B      S    35_A     0.194     0    0.014   0.700     2.079  100.000   94.127
LGA    C    36_B      C    36_A     0.160     0    0.028   0.071     0.349  100.000  100.000
LGA    A    37_B      A    37_A     0.153     0    0.031   0.047     0.280  100.000  100.000
LGA    A    38_B      A    38_A     0.188     0    0.025   0.038     0.266  100.000  100.000
LGA    S    39_B      S    39_A     0.324     0    0.033   0.052     0.724   97.619   95.238
LGA    G    40_B      G    40_A     0.574     0    0.058   0.058     0.664   92.857   92.857
LGA    F    41_B      F    41_A     0.488     0    0.064   0.066     0.580  100.000   96.537
LGA    N    42_B      N    42_A     0.449     0    0.024   0.126     0.773  100.000   95.238
LGA    F    43_B      F    43_A     0.332     0    0.055   0.075     0.348  100.000  100.000
LGA    G    44_B      G    44_A     0.401     0    0.039   0.039     0.439  100.000  100.000
LGA    S    45_B      S    45_A     0.366     0    0.044   0.075     0.496  100.000  100.000
LGA    S    46_B      S    46_A     0.309     0    0.061   0.092     0.586  100.000   98.413
LGA    D    47_B      D    47_A     0.068     0    0.020   0.128     0.342  100.000  100.000
LGA    M    48_B      M    48_A     0.133     0    0.066   0.083     0.347  100.000  100.000
LGA    N    49_B      N    49_A     0.226     0    0.016   0.159     0.615  100.000   98.810
LGA    W    50_B      W    50_A     0.195     0    0.022   0.071     0.338  100.000  100.000
LGA    V    51_B      V    51_A     0.133     0    0.035   0.075     0.493  100.000  100.000
LGA    R    52_B      R    52_A     0.219     0    0.045   0.086     0.586  100.000   98.268
LGA    Q    53_B      Q    53_A     0.133     0    0.030   0.160     0.568  100.000   98.942
LGA    A    54_B      A    54_A     0.560     0    0.029   0.026     0.675   92.857   92.381
LGA    A    55_B      A    55_A     1.142     0    0.058   0.066     1.389   83.690   83.238
LGA    G    56_B      G    56_A     1.364     0    0.016   0.016     1.383   81.429   81.429
LGA    K    57_B      K    57_A     0.893     0    0.046   0.870     5.169   88.214   73.122
LGA    G    58_B      G    58_A     0.291     0    0.026   0.026     0.423  100.000  100.000
LGA    P    59_B      P    59_A     0.110     0    0.068   0.079     0.446  100.000  100.000
LGA    E    60_B      E    60_A     0.116     0    0.024   0.283     0.989  100.000   98.942
LGA    W    61_B      W    61_A     0.111     0    0.014   0.107     0.396  100.000  100.000
LGA    V    62_B      V    62_A     0.056     0    0.008   0.041     0.209  100.000  100.000
LGA    A    63_B      A    63_A     0.102     0    0.018   0.019     0.138  100.000  100.000
LGA    S    64_B      S    64_A     0.204     0    0.039   0.070     0.373  100.000  100.000
LGA    I    65_B      I    65_A     0.122     0    0.021   0.036     0.242  100.000  100.000
LGA    E    66_B      E    66_A     0.136     0    0.039   0.192     1.189  100.000   95.820
LGA    R    67_B      R    67_A     0.514     0    0.034   0.900     4.029   95.238   83.290
LGA    G    68_B      G    68_A     0.728     0    0.624   0.624     2.247   84.048   84.048
LGA    A    69_B      A    69_A     2.290     1    0.095   0.095     2.290   70.833   56.667
LGA    G    70_B      G    70_A     0.444     0    0.106   0.106     0.713   95.238   95.238
LGA    G    71_B      G    71_A     0.578     0    0.043   0.043     0.578   97.619   97.619
LGA    T    72_B      T    72_A     0.127     0    0.081   0.143     0.639   97.619   98.639
LGA    D    73_B      D    73_A     0.069     0    0.037   0.159     0.398  100.000  100.000
LGA    Y    74_B      Y    74_A     0.170     0    0.027   0.062     0.358  100.000  100.000
LGA    A    75_B      A    75_A     0.075     0    0.022   0.036     0.402  100.000  100.000
LGA    D    76_B      D    76_A     0.621     0    0.053   0.131     1.131   90.595   89.405
LGA    S    77_B      S    77_A     1.090     0    0.078   0.161     1.513   88.214   84.524
LGA    V    78_B      V    78_A     0.273     0    0.028   0.073     0.462  100.000  100.000
LGA    Q    79_B      Q    79_A     0.571     0    0.031   0.993     3.715   97.619   78.466
LGA    G    80_B      G    80_A     0.349     0    0.025   0.025     0.478  100.000  100.000
LGA    R    81_B      R    81_A     0.105     0    0.026   0.075     0.246  100.000  100.000
LGA    F    82_B      F    82_A     0.123     0    0.037   0.122     0.332  100.000  100.000
LGA    T    83_B      T    83_A     0.132     0    0.033   0.038     0.407  100.000  100.000
LGA    V    84_B      V    84_A     0.159     0    0.020   0.063     0.235  100.000  100.000
LGA    S    85_B      S    85_A     0.083     0    0.027   0.050     0.260  100.000  100.000
LGA    R    86_B      R    86_A     0.071     0    0.062   0.215     0.984  100.000   97.403
LGA    D    87_B      D    87_A     0.698     0    0.038   0.127     1.847   97.619   90.714
LGA    N    88_B      N    88_A     0.478     0    0.043   0.082     0.767   95.238   92.857
LGA    A    89_B      A    89_A     0.580     0    0.028   0.045     0.795   95.238   94.286
LGA    K    90_B      K    90_A     0.570     0    0.038   0.222     1.424   97.619   89.630
LGA    S    91_B      S    91_A     0.129     0    0.020   0.076     0.301  100.000  100.000
LGA    T    92_B      T    92_A     0.167     0    0.046   0.098     0.492  100.000  100.000
LGA    L    93_B      L    93_A     0.084     0    0.023   0.066     0.207  100.000  100.000
LGA    W    94_B      W    94_A     0.182     0    0.050   1.150     5.785  100.000   74.864
LGA    L    95_B      L    95_A     0.162     0    0.028   0.046     0.218  100.000  100.000
LGA    Q    96_B      Q    96_A     0.265     0    0.008   0.194     0.776  100.000   98.942
LGA    M    97_B      M    97_A     0.119     0    0.070   0.158     0.633  100.000   97.619
LGA    N    98_B      N    98_A     0.262     0    0.027   1.095     2.356  100.000   91.190
LGA    S    99_B      S    99_A     0.347     0    0.038   0.052     0.526  100.000   98.413
LGA    L   100_B      L   100_A     0.218     0    0.034   0.055     0.302  100.000  100.000
LGA    K   101_B      K   101_A     0.349     0    0.034   0.511     1.592  100.000   89.735
LGA    A   102_B      A   102_A     0.249     0    0.020   0.027     0.369  100.000  100.000
LGA    E   103_B      E   103_A     0.093     0    0.036   0.206     1.118  100.000   94.815
LGA    D   104_B      D   104_A     0.130     0    0.013   0.037     0.212  100.000  100.000
LGA    T   105_B      T   105_A     0.129     0    0.100   0.100     0.510   97.619   98.639
LGA    A   106_B      A   106_A     0.095     0    0.034   0.048     0.154  100.000  100.000
LGA    V   107_B      V   107_A     0.021     0    0.015   0.105     0.340  100.000  100.000
LGA    Y   108_B      Y   108_A     0.082     0    0.019   0.062     0.269  100.000  100.000
LGA    Y   109_B      Y   109_A     0.095     0    0.018   0.152     1.070  100.000   96.071
LGA    C   110_B      C   110_A     0.372     0    0.059   0.650     1.665  100.000   93.889
LGA    V   111_B      V   111_A     0.220     0    0.012   0.101     0.467  100.000  100.000
LGA    V   112_B      V   112_A     0.134     0    0.030   0.054     0.252  100.000  100.000
LGA    S   113_B      S   113_A     0.336     0    0.014   0.631     1.500   97.619   92.302
LGA    D   114_B      D   114_A     0.724     0    0.080   0.747     2.673   92.857   81.964
LGA    N   115_B      N   115_A     1.813     0    0.103   0.135     2.756   69.048   66.964
LGA    S   116_B      S   116_A     1.939     0    0.106   0.236     2.406   70.833   68.810
LGA    G   117_B      G   117_A     1.040     0    0.125   0.125     1.094   83.690   83.690
LGA    Y   118_B      Y   118_A     0.908     0    0.087   1.378     7.670   90.476   61.746
LGA    Y   119_B      Y   119_A     0.215     0    0.029   0.157     0.772  100.000   98.413
LGA    K   120_B      K   120_A     0.275     0    0.016   0.614     2.865  100.000   93.122
LGA    Y   121_B      Y   121_A     0.185     0    0.020   0.091     0.727  100.000   97.619
LGA    W   122_B      W   122_A     0.140     0    0.031   0.132     0.345  100.000  100.000
LGA    G   123_B      G   123_A     0.186     0    0.011   0.011     0.186  100.000  100.000
LGA    Q   124_B      Q   124_A     0.245     0    0.022   1.040     3.279  100.000   86.243
LGA    G   125_B      G   125_A     0.213     0    0.018   0.018     0.237  100.000  100.000
LGA    T   126_B      T   126_A     0.155     0    0.025   0.066     0.224  100.000  100.000
LGA    Q   127_B      Q   127_A     0.224     0    0.011   0.182     0.601  100.000   98.942
LGA    V   128_B      V   128_A     0.094     0    0.016   0.026     0.187  100.000  100.000
LGA    T   129_B      T   129_A     0.090     0    0.014   0.061     0.467  100.000  100.000
LGA    V   130_B      V   130_A     0.192     0    0.058   0.053     0.278  100.000  100.000
LGA    S   131_B      S   131_A     0.552     0    0.019   0.027     0.847   97.619   95.238
LGA    S   132_B      S   132_A     0.495     0    0.108   0.639     2.963   90.595   85.000

# RMSD_GDC results:       CA      MC common percent     ALL common percent   GDC_mc  GDC_all
NUMBER_OF_ATOMS_AA:      118     472    472  100.00     880    880  100.00               118
SUMMARY(RMSD_GDC):     0.503          0.524                  1.013           97.443   94.546

#CA            N1   N2   DIST      N    RMSD    GDT_TS    LGA_S3     LGA_Q 
SUMMARY(GDT)  132  118    4.0    118    0.50    98.517    99.476    19.580

LGA_LOCAL      RMSD:   0.503  Number of atoms:  118  under DIST:   4.00
LGA_ASGN_ATOMS RMSD:   0.503  Number of assigned atoms:  118 
Std_ASGN_ATOMS RMSD:   0.503  Standard rmsd on all 118 assigned CA atoms 

Unitary ROTATION matrix and the SHIFT vector superimpose molecules  (1=>2)
  X_new =   0.685845 * X  +  -0.546998 * Y  +  -0.480011 * Z  + -11.518863
  Y_new =   0.627492 * X  +   0.110404 * Y  +   0.770756 * Z  +   3.794106
  Z_new =  -0.368607 * X  +  -0.829822 * Y  +   0.418956 * Z  +   5.626541 

Euler angles from the ROTATION matrix. Conventions XYZ and ZXZ:
           Phi     Theta       Psi   [DEG:       Phi     Theta       Psi ]
XYZ:  0.740996  0.377510 -1.103256   [DEG:   42.4559   21.6297  -63.2119 ]
ZXZ: -2.584592  1.138501 -2.723572   [DEG: -148.0862   65.2313 -156.0492 ]
 
# END of job
