
#######################################################
#                                                     #
#                        LGA                          #
#                  ---------------                    #
#                                                     #
#               Local-Global Alignment                #
#        A Method for Finding 3-D Similarities        #
#               in Protein Structures                 #
#                                                     #
#                  ------------ 10/2009               #
#                                                     #
#      Adam Zemla (adamz@llnl.gov)                    #
#      Lawrence Livermore National Laboratory, CA     #
#                                                     #
#######################################################

!!!   License for LGA program has expired  !!!
#   For updated version of the LGA program   #
# please contact Adam Zemla:  adamz@llnl.gov #

# Molecule1: number of CA atoms  132 ( 1007),  selected  118 , name one
# Molecule2: number of CA atoms  118 (  880),  selected  118 , name two
# PARAMETERS: input.pdb  -ie  -3  -d:4  -sda  -swap  -ch1:B  -ch2:A  
# FIXED Atom-Atom correspondence
# GDT and LCS analysis 

LCS - RMSD CUTOFF   5.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:   118      15_A - 132_A       0.52     0.52
  LCS_AVERAGE:    100.00

LCS - RMSD CUTOFF   2.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:   118      15_A - 132_A       0.52     0.52
  LCS_AVERAGE:    100.00

LCS - RMSD CUTOFF   1.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:   118      15_A - 132_A       0.52     0.52
  LCS_AVERAGE:    100.00

LCS_GDT    MOLECULE-1    MOLECULE-2     LCS_DETAILS     GDT_DETAILS                                                    TOTAL NUMBER OF RESIDUE PAIRS:  118
LCS_GDT     RESIDUE       RESIDUE       SEGMENT_SIZE    GLOBAL DISTANCE TEST COLUMNS: number of residues under the threshold assigned to each residue pair
LCS_GDT   NAME NUMBER   NAME NUMBER    1.0  2.0  5.0    0.5  1.0  1.5  2.0  2.5  3.0  3.5  4.0  4.5  5.0  5.5  6.0  6.5  7.0  7.5  8.0  8.5  9.0  9.5 10.0
LCS_GDT     E    15_B     E    15_A    118  118  118     47  113  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     V    16_B     V    16_A    118  118  118     92  113  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     Q    17_B     Q    17_A    118  118  118     98  113  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     L    18_B     L    18_A    118  118  118     98  113  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     V    19_B     V    19_A    118  118  118     98  113  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     E    20_B     E    20_A    118  118  118     98  113  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     S    21_B     S    21_A    118  118  118     98  113  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     G    22_B     G    22_A    118  118  118     97  113  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     G    23_B     G    23_A    118  118  118     98  113  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     G    24_B     G    24_A    118  118  118     98  113  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     L    25_B     L    25_A    118  118  118     98  113  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     V    26_B     V    26_A    118  118  118     61  113  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     L    27_B     L    27_A    118  118  118     98  113  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     P    28_B     P    28_A    118  118  118     98  113  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     G    29_B     G    29_A    118  118  118     98  113  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     G    30_B     G    30_A    118  118  118     98  113  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     S    31_B     S    31_A    118  118  118     98  113  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     L    32_B     L    32_A    118  118  118     98  113  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     K    33_B     K    33_A    118  118  118     98  113  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     L    34_B     L    34_A    118  118  118     98  113  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     S    35_B     S    35_A    118  118  118     98  113  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     C    36_B     C    36_A    118  118  118     98  113  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     A    37_B     A    37_A    118  118  118     98  113  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     A    38_B     A    38_A    118  118  118     98  113  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     S    39_B     S    39_A    118  118  118     98  113  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     G    40_B     G    40_A    118  118  118     98  113  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     F    41_B     F    41_A    118  118  118     98  113  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     N    42_B     N    42_A    118  118  118     98  113  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     F    43_B     F    43_A    118  118  118     98  113  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     G    44_B     G    44_A    118  118  118     98  113  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     S    45_B     S    45_A    118  118  118     98  113  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     S    46_B     S    46_A    118  118  118     98  113  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     D    47_B     D    47_A    118  118  118     98  113  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     M    48_B     M    48_A    118  118  118     98  113  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     N    49_B     N    49_A    118  118  118     98  113  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     W    50_B     W    50_A    118  118  118     98  113  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     V    51_B     V    51_A    118  118  118     98  113  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     R    52_B     R    52_A    118  118  118     98  113  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     Q    53_B     Q    53_A    118  118  118     98  113  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     A    54_B     A    54_A    118  118  118     98  113  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     A    55_B     A    55_A    118  118  118     13  112  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     G    56_B     G    56_A    118  118  118     44  112  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     K    57_B     K    57_A    118  118  118     98  113  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     G    58_B     G    58_A    118  118  118     98  113  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     P    59_B     P    59_A    118  118  118     98  113  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     E    60_B     E    60_A    118  118  118     98  113  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     W    61_B     W    61_A    118  118  118     98  113  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     V    62_B     V    62_A    118  118  118     98  113  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     A    63_B     A    63_A    118  118  118     98  113  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     S    64_B     S    64_A    118  118  118     98  113  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     I    65_B     I    65_A    118  118  118     98  113  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     E    66_B     E    66_A    118  118  118     98  113  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     R    67_B     R    67_A    118  118  118     98  113  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     G    68_B     G    68_A    118  118  118     98  113  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     A    69_B     A    69_A    118  118  118      3    4   14   90  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     G    70_B     G    70_A    118  118  118     98  113  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     G    71_B     G    71_A    118  118  118     82  113  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     T    72_B     T    72_A    118  118  118     98  113  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     D    73_B     D    73_A    118  118  118     98  113  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     Y    74_B     Y    74_A    118  118  118     98  113  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     A    75_B     A    75_A    118  118  118     98  113  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     D    76_B     D    76_A    118  118  118     98  113  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     S    77_B     S    77_A    118  118  118     18  113  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     V    78_B     V    78_A    118  118  118     98  113  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     Q    79_B     Q    79_A    118  118  118     98  113  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     G    80_B     G    80_A    118  118  118     98  113  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     R    81_B     R    81_A    118  118  118     98  113  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     F    82_B     F    82_A    118  118  118     98  113  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     T    83_B     T    83_A    118  118  118     98  113  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     V    84_B     V    84_A    118  118  118     98  113  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     S    85_B     S    85_A    118  118  118     98  113  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     R    86_B     R    86_A    118  118  118     98  113  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     D    87_B     D    87_A    118  118  118     91  113  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     N    88_B     N    88_A    118  118  118     98  113  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     A    89_B     A    89_A    118  118  118     91  113  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     K    90_B     K    90_A    118  118  118     91  113  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     S    91_B     S    91_A    118  118  118     98  113  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     T    92_B     T    92_A    118  118  118     98  113  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     L    93_B     L    93_A    118  118  118     98  113  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     W    94_B     W    94_A    118  118  118     98  113  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     L    95_B     L    95_A    118  118  118     98  113  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     Q    96_B     Q    96_A    118  118  118     98  113  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     M    97_B     M    97_A    118  118  118     98  113  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     N    98_B     N    98_A    118  118  118     98  113  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     S    99_B     S    99_A    118  118  118     98  113  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     L   100_B     L   100_A    118  118  118     98  113  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     K   101_B     K   101_A    118  118  118     98  113  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     A   102_B     A   102_A    118  118  118     98  113  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     E   103_B     E   103_A    118  118  118     98  113  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     D   104_B     D   104_A    118  118  118     98  113  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     T   105_B     T   105_A    118  118  118     98  113  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     A   106_B     A   106_A    118  118  118     98  113  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     V   107_B     V   107_A    118  118  118     98  113  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     Y   108_B     Y   108_A    118  118  118     98  113  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     Y   109_B     Y   109_A    118  118  118     98  113  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     C   110_B     C   110_A    118  118  118     98  113  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     V   111_B     V   111_A    118  118  118     98  113  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     V   112_B     V   112_A    118  118  118     98  113  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     S   113_B     S   113_A    118  118  118     98  113  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     D   114_B     D   114_A    118  118  118     88  113  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     N   115_B     N   115_A    118  118  118      5   19  113  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     S   116_B     S   116_A    118  118  118      5   80  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     G   117_B     G   117_A    118  118  118     47  113  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     Y   118_B     Y   118_A    118  118  118     47  113  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     Y   119_B     Y   119_A    118  118  118     98  113  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     K   120_B     K   120_A    118  118  118     98  113  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     Y   121_B     Y   121_A    118  118  118     98  113  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     W   122_B     W   122_A    118  118  118     98  113  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     G   123_B     G   123_A    118  118  118     98  113  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     Q   124_B     Q   124_A    118  118  118     98  113  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     G   125_B     G   125_A    118  118  118     98  113  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     T   126_B     T   126_A    118  118  118     98  113  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     Q   127_B     Q   127_A    118  118  118     98  113  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     V   128_B     V   128_A    118  118  118     98  113  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     T   129_B     T   129_A    118  118  118     98  113  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     V   130_B     V   130_A    118  118  118     98  113  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     S   131_B     S   131_A    118  118  118     98  113  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     S   132_B     S   132_A    118  118  118     61  113  116  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_AVERAGE  LCS_A: 100.00  ( 100.00  100.00  100.00 )

GLOBAL_DISTANCE_TEST (summary information about detected largest sets of residues (represented by selected AToms) that can fit under specified thresholds)
GDT DIST_CUTOFF  0.50   1.00   1.50   2.00   2.50   3.00   3.50   4.00   4.50   5.00   5.50   6.00   6.50   7.00   7.50   8.00   8.50   9.00   9.50  10.00
GDT NUMBER_AT     98    113    116    117    118    118    118    118    118    118    118    118    118    118    118    118    118    118    118    118 
GDT PERCENT_AT  83.05  95.76  98.31  99.15 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00
GDT RMS_LOCAL    0.25   0.37   0.43   0.47   0.52   0.52   0.52   0.52   0.52   0.52   0.52   0.52   0.52   0.52   0.52   0.52   0.52   0.52   0.52   0.52
GDT RMS_ALL_AT   0.53   0.52   0.52   0.52   0.52   0.52   0.52   0.52   0.52   0.52   0.52   0.52   0.52   0.52   0.52   0.52   0.52   0.52   0.52   0.52

# Checking swapping
#   possible swapping detected:  E    15_B      E    15_A
#   possible swapping detected:  E    20_B      E    20_A
#   possible swapping detected:  F    43_B      F    43_A
#   possible swapping detected:  E    60_B      E    60_A
#   possible swapping detected:  E    66_B      E    66_A
#   possible swapping detected:  Y   108_B      Y   108_A
#   possible swapping detected:  D   114_B      D   114_A

#      Molecule1      Molecule2  DISTANCE    Mis    MC     All    Dist_max   GDC_mc  GDC_all
LGA    E    15_B      E    15_A     1.250     0    0.640   1.150     9.346   76.429   43.651
LGA    V    16_B      V    16_A     0.589     0    0.032   0.058     0.891   95.238   93.197
LGA    Q    17_B      Q    17_A     0.260     0    0.035   0.212     1.869  100.000   89.788
LGA    L    18_B      L    18_A     0.247     0    0.025   0.087     0.446  100.000  100.000
LGA    V    19_B      V    19_A     0.188     0    0.023   0.051     0.256  100.000  100.000
LGA    E    20_B      E    20_A     0.229     0    0.048   0.135     0.670  100.000   98.942
LGA    S    21_B      S    21_A     0.279     0    0.025   0.035     0.306  100.000  100.000
LGA    G    22_B      G    22_A     0.511     0    0.053   0.053     0.745   92.857   92.857
LGA    G    23_B      G    23_A     0.361     0    0.060   0.060     0.636   95.238   95.238
LGA    G    24_B      G    24_A     0.218     0    0.026   0.026     0.283  100.000  100.000
LGA    L    25_B      L    25_A     0.432     0    0.012   0.078     1.334   95.238   91.726
LGA    V    26_B      V    26_A     0.767     0    0.085   1.112     2.889   97.619   85.986
LGA    L    27_B      L    27_A     0.374     0    0.034   0.176     0.767  100.000   97.619
LGA    P    28_B      P    28_A     0.230     0    0.029   0.038     0.261  100.000  100.000
LGA    G    29_B      G    29_A     0.233     0    0.037   0.037     0.397  100.000  100.000
LGA    G    30_B      G    30_A     0.394     0    0.013   0.013     0.394  100.000  100.000
LGA    S    31_B      S    31_A     0.212     0    0.028   0.039     0.329  100.000  100.000
LGA    L    32_B      L    32_A     0.128     0    0.083   1.329     2.829   97.619   84.702
LGA    K    33_B      K    33_A     0.165     0    0.068   0.691     2.117  100.000   92.011
LGA    L    34_B      L    34_A     0.159     0    0.007   0.052     0.205  100.000  100.000
LGA    S    35_B      S    35_A     0.228     0    0.014   0.718     2.142  100.000   94.127
LGA    C    36_B      C    36_A     0.139     0    0.034   0.059     0.573  100.000   98.413
LGA    A    37_B      A    37_A     0.135     0    0.038   0.055     0.360  100.000  100.000
LGA    A    38_B      A    38_A     0.195     0    0.031   0.039     0.329  100.000  100.000
LGA    S    39_B      S    39_A     0.352     0    0.033   0.031     0.609   97.619   95.238
LGA    G    40_B      G    40_A     0.558     0    0.052   0.052     0.647   92.857   92.857
LGA    F    41_B      F    41_A     0.497     0    0.061   0.080     0.582  100.000   97.403
LGA    N    42_B      N    42_A     0.476     0    0.025   0.128     0.760   97.619   94.048
LGA    F    43_B      F    43_A     0.316     0    0.050   0.067     0.329  100.000  100.000
LGA    G    44_B      G    44_A     0.407     0    0.029   0.029     0.407  100.000  100.000
LGA    S    45_B      S    45_A     0.242     0    0.043   0.109     0.365  100.000  100.000
LGA    S    46_B      S    46_A     0.240     0    0.058   0.097     0.513  100.000   98.413
LGA    D    47_B      D    47_A     0.132     0    0.017   0.186     0.719  100.000   98.810
LGA    M    48_B      M    48_A     0.069     0    0.071   0.111     0.404  100.000  100.000
LGA    N    49_B      N    49_A     0.188     0    0.024   0.170     0.797  100.000   96.429
LGA    W    50_B      W    50_A     0.160     0    0.026   0.086     0.488  100.000  100.000
LGA    V    51_B      V    51_A     0.034     0    0.045   0.091     0.509   97.619   98.639
LGA    R    52_B      R    52_A     0.185     0    0.038   0.081     0.498  100.000  100.000
LGA    Q    53_B      Q    53_A     0.160     0    0.034   0.139     0.728  100.000   98.942
LGA    A    54_B      A    54_A     0.676     0    0.023   0.024     0.794   90.476   90.476
LGA    A    55_B      A    55_A     1.268     0    0.047   0.054     1.591   81.429   79.714
LGA    G    56_B      G    56_A     1.294     0    0.017   0.017     1.294   81.429   81.429
LGA    K    57_B      K    57_A     0.711     0    0.046   0.883     5.368   95.238   77.037
LGA    G    58_B      G    58_A     0.088     0    0.028   0.028     0.195  100.000  100.000
LGA    P    59_B      P    59_A     0.260     0    0.069   0.077     0.743   97.619   98.639
LGA    E    60_B      E    60_A     0.292     0    0.036   0.791     3.824  100.000   82.116
LGA    W    61_B      W    61_A     0.148     0    0.024   0.121     0.542  100.000   99.320
LGA    V    62_B      V    62_A     0.018     0    0.012   0.041     0.204  100.000  100.000
LGA    A    63_B      A    63_A     0.142     0    0.027   0.028     0.193  100.000  100.000
LGA    S    64_B      S    64_A     0.349     0    0.045   0.069     0.486  100.000  100.000
LGA    I    65_B      I    65_A     0.184     0    0.018   0.037     0.526  100.000   98.810
LGA    E    66_B      E    66_A     0.115     0    0.033   0.212     1.083  100.000   95.820
LGA    R    67_B      R    67_A     0.428     0    0.037   1.009     2.641  100.000   89.351
LGA    G    68_B      G    68_A     0.589     0    0.606   0.606     2.033   86.429   86.429
LGA    A    69_B      A    69_A     2.407     1    0.115   0.115     2.407   73.095   58.476
LGA    G    70_B      G    70_A     0.333     0    0.225   0.225     1.378   90.595   90.595
LGA    G    71_B      G    71_A     0.681     0    0.047   0.047     0.681   97.619   97.619
LGA    T    72_B      T    72_A     0.154     0    0.076   0.145     0.507   97.619   98.639
LGA    D    73_B      D    73_A     0.096     0    0.041   0.138     0.332  100.000  100.000
LGA    Y    74_B      Y    74_A     0.197     0    0.029   0.061     0.485  100.000  100.000
LGA    A    75_B      A    75_A     0.162     0    0.024   0.030     0.457  100.000  100.000
LGA    D    76_B      D    76_A     0.534     0    0.044   0.078     0.949   92.857   91.667
LGA    S    77_B      S    77_A     0.968     0    0.075   0.136     1.363   90.476   87.460
LGA    V    78_B      V    78_A     0.327     0    0.017   0.078     0.507  100.000   98.639
LGA    Q    79_B      Q    79_A     0.514     0    0.033   1.187     3.489   97.619   82.487
LGA    G    80_B      G    80_A     0.261     0    0.030   0.030     0.393  100.000  100.000
LGA    R    81_B      R    81_A     0.058     0    0.026   0.137     0.530  100.000   99.134
LGA    F    82_B      F    82_A     0.054     0    0.038   0.121     0.421  100.000  100.000
LGA    T    83_B      T    83_A     0.132     0    0.030   0.039     0.396  100.000  100.000
LGA    V    84_B      V    84_A     0.198     0    0.018   0.061     0.299  100.000  100.000
LGA    S    85_B      S    85_A     0.119     0    0.024   0.041     0.273  100.000  100.000
LGA    R    86_B      R    86_A     0.108     0    0.055   0.199     1.074  100.000   96.580
LGA    D    87_B      D    87_A     0.675     0    0.036   0.126     1.859   97.619   90.714
LGA    N    88_B      N    88_A     0.467     0    0.042   0.092     0.701   97.619   95.238
LGA    A    89_B      A    89_A     0.579     0    0.018   0.034     0.777   95.238   94.286
LGA    K    90_B      K    90_A     0.650     0    0.045   0.369     1.433   92.857   88.519
LGA    S    91_B      S    91_A     0.189     0    0.018   0.073     0.427  100.000  100.000
LGA    T    92_B      T    92_A     0.128     0    0.047   0.074     0.365  100.000  100.000
LGA    L    93_B      L    93_A     0.096     0    0.026   0.099     0.462  100.000  100.000
LGA    W    94_B      W    94_A     0.213     0    0.047   1.143     5.940  100.000   73.605
LGA    L    95_B      L    95_A     0.182     0    0.027   0.045     0.220  100.000  100.000
LGA    Q    96_B      Q    96_A     0.274     0    0.019   0.254     0.916  100.000   98.942
LGA    M    97_B      M    97_A     0.191     0    0.072   0.802     1.943  100.000   93.095
LGA    N    98_B      N    98_A     0.263     0    0.030   1.088     2.434  100.000   91.190
LGA    S    99_B      S    99_A     0.452     0    0.046   0.056     0.709  100.000   96.825
LGA    L   100_B      L   100_A     0.241     0    0.026   0.068     0.439  100.000  100.000
LGA    K   101_B      K   101_A     0.331     0    0.036   0.510     1.626  100.000   89.735
LGA    A   102_B      A   102_A     0.211     0    0.015   0.028     0.315  100.000  100.000
LGA    E   103_B      E   103_A     0.169     0    0.028   0.210     1.108  100.000   94.815
LGA    D   104_B      D   104_A     0.203     0    0.010   0.040     0.333  100.000  100.000
LGA    T   105_B      T   105_A     0.105     0    0.086   0.089     0.361  100.000  100.000
LGA    A   106_B      A   106_A     0.137     0    0.031   0.044     0.184  100.000  100.000
LGA    V   107_B      V   107_A     0.065     0    0.018   0.110     0.383  100.000  100.000
LGA    Y   108_B      Y   108_A     0.073     0    0.015   0.073     0.299  100.000  100.000
LGA    Y   109_B      Y   109_A     0.050     0    0.015   0.158     1.201  100.000   95.278
LGA    C   110_B      C   110_A     0.401     0    0.045   0.098     1.203  100.000   95.317
LGA    V   111_B      V   111_A     0.332     0    0.008   0.073     0.493  100.000  100.000
LGA    V   112_B      V   112_A     0.246     0    0.023   0.046     0.288  100.000  100.000
LGA    S   113_B      S   113_A     0.375     0    0.021   0.649     1.816  100.000   93.889
LGA    D   114_B      D   114_A     0.640     0    0.091   0.716     2.686   88.333   79.702
LGA    N   115_B      N   115_A     1.967     0    0.092   0.102     3.069   71.071   65.119
LGA    S   116_B      S   116_A     1.592     0    0.112   0.577     2.617   75.000   71.667
LGA    G   117_B      G   117_A     0.865     0    0.078   0.078     0.892   90.476   90.476
LGA    Y   118_B      Y   118_A     0.787     0    0.093   1.379     8.039   90.476   60.159
LGA    Y   119_B      Y   119_A     0.287     0    0.023   0.147     0.958   97.619   97.619
LGA    K   120_B      K   120_A     0.249     0    0.035   0.640     3.330  100.000   92.328
LGA    Y   121_B      Y   121_A     0.251     0    0.011   0.064     0.531  100.000   99.206
LGA    W   122_B      W   122_A     0.234     0    0.028   0.151     0.473  100.000  100.000
LGA    G   123_B      G   123_A     0.131     0    0.014   0.014     0.230  100.000  100.000
LGA    Q   124_B      Q   124_A     0.155     0    0.025   1.058     3.179  100.000   90.265
LGA    G   125_B      G   125_A     0.360     0    0.041   0.041     0.360  100.000  100.000
LGA    T   126_B      T   126_A     0.195     0    0.027   0.072     0.309  100.000  100.000
LGA    Q   127_B      Q   127_A     0.245     0    0.013   0.125     0.483  100.000  100.000
LGA    V   128_B      V   128_A     0.130     0    0.013   0.037     0.355  100.000  100.000
LGA    T   129_B      T   129_A     0.125     0    0.025   0.068     0.463  100.000  100.000
LGA    V   130_B      V   130_A     0.194     0    0.065   0.059     0.257  100.000  100.000
LGA    S   131_B      S   131_A     0.440     0    0.045   0.568     2.205   97.619   92.540
LGA    S   132_B      S   132_A     0.941     0    0.114   0.641     3.073   85.952   79.206

# RMSD_GDC results:       CA      MC common percent     ALL common percent   GDC_mc  GDC_all
NUMBER_OF_ATOMS_AA:      118     472    472  100.00     880    880  100.00               118
SUMMARY(RMSD_GDC):     0.516          0.531                  1.073           97.359   94.231

#CA            N1   N2   DIST      N    RMSD    GDT_TS    LGA_S3     LGA_Q 
SUMMARY(GDT)  132  118    4.0    118    0.52    98.729    99.480    19.143

LGA_LOCAL      RMSD:   0.516  Number of atoms:  118  under DIST:   4.00
LGA_ASGN_ATOMS RMSD:   0.516  Number of assigned atoms:  118 
Std_ASGN_ATOMS RMSD:   0.516  Standard rmsd on all 118 assigned CA atoms 

Unitary ROTATION matrix and the SHIFT vector superimpose molecules  (1=>2)
  X_new =   0.700225 * X  +   0.677592 * Y  +  -0.224840 * Z  + -11.392971
  Y_new =  -0.710975 * X  +   0.633264 * Y  +  -0.305762 * Z  +  -0.329499
  Z_new =  -0.064799 * X  +   0.373958 * Y  +   0.925179 * Z  +   6.841878 

Euler angles from the ROTATION matrix. Conventions XYZ and ZXZ:
           Phi     Theta       Psi   [DEG:       Phi     Theta       Psi ]
XYZ: -0.793015  0.064844  0.384123   [DEG:  -45.4364    3.7153   22.0086 ]
ZXZ: -0.634055  0.389289 -0.171574   [DEG:  -36.3287   22.3046   -9.8305 ]
 
# END of job
