
#######################################################
#                                                     #
#                        LGA                          #
#                  ---------------                    #
#                                                     #
#               Local-Global Alignment                #
#        A Method for Finding 3-D Similarities        #
#               in Protein Structures                 #
#                                                     #
#                  ------------ 10/2009               #
#                                                     #
#      Adam Zemla (adamz@llnl.gov)                    #
#      Lawrence Livermore National Laboratory, CA     #
#                                                     #
#######################################################

!!!   License for LGA program has expired  !!!
#   For updated version of the LGA program   #
# please contact Adam Zemla:  adamz@llnl.gov #

# Molecule1: number of CA atoms  137 ( 1043),  selected  137 , name one
# Molecule2: number of CA atoms  192 ( 1472),  selected  137 , name two
# PARAMETERS: input.pdb  -ie  -3  -d:4  -sda  -swap  -ch1:A  -ch2:A  
# FIXED Atom-Atom correspondence
# GDT and LCS analysis 

LCS - RMSD CUTOFF   5.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:   137       1_A - 137_A       1.30     1.30
  LCS_AVERAGE:     71.35

LCS - RMSD CUTOFF   2.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:   137       1_A - 137_A       1.30     1.30
  LCS_AVERAGE:     71.35

LCS - RMSD CUTOFF   1.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:    44       3_A - 46_A        1.00     1.36
  LCS_AVERAGE:     18.53

LCS_GDT    MOLECULE-1    MOLECULE-2     LCS_DETAILS     GDT_DETAILS                                                    TOTAL NUMBER OF RESIDUE PAIRS:  137
LCS_GDT     RESIDUE       RESIDUE       SEGMENT_SIZE    GLOBAL DISTANCE TEST COLUMNS: number of residues under the threshold assigned to each residue pair
LCS_GDT   NAME NUMBER   NAME NUMBER    1.0  2.0  5.0    0.5  1.0  1.5  2.0  2.5  3.0  3.5  4.0  4.5  5.0  5.5  6.0  6.5  7.0  7.5  8.0  8.5  9.0  9.5 10.0
LCS_GDT     A     1_A     A     1_A     42  137  137      8   34   87  121  130  134  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137 
LCS_GDT     L     2_A     L     2_A     42  137  137     13   81  110  126  130  134  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137 
LCS_GDT     V     3_A     V     3_A     44  137  137     34   84  110  126  130  134  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137 
LCS_GDT     I     4_A     I     4_A     44  137  137     34   84  110  126  130  134  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137 
LCS_GDT     A     5_A     A     5_A     44  137  137     34   84  110  126  130  134  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137 
LCS_GDT     F     6_A     F     6_A     44  137  137     27   84  110  126  130  134  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137 
LCS_GDT     I     7_A     I     7_A     44  137  137     21   84  110  126  130  134  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137 
LCS_GDT     G     8_A     G     8_A     44  137  137     21   84  110  126  130  134  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137 
LCS_GDT     K     9_A     K     9_A     44  137  137     25   84  110  126  130  134  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137 
LCS_GDT     N    10_A     N    10_A     44  137  137     21   84  110  126  130  134  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137 
LCS_GDT     G    11_A     G    11_A     44  137  137     23   84  110  126  130  134  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137 
LCS_GDT     A    12_A     A    12_A     44  137  137     24   84  110  126  130  134  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137 
LCS_GDT     V    13_A     V    13_A     44  137  137     27   84  110  126  130  134  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137 
LCS_GDT     M    14_A     M    14_A     44  137  137     34   84  110  126  130  134  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137 
LCS_GDT     A    15_A     A    15_A     44  137  137     34   84  110  126  130  134  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137 
LCS_GDT     G    16_A     G    16_A     44  137  137     34   84  110  126  130  134  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137 
LCS_GDT     D    17_A     D    17_A     44  137  137     32   84  110  126  130  134  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137 
LCS_GDT     M    18_A     M    18_A     44  137  137     34   84  110  126  130  134  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137 
LCS_GDT     R    19_A     R    19_A     44  137  137     34   84  110  126  130  134  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137 
LCS_GDT     E    20_A     E    20_A     44  137  137     25   84  110  126  130  134  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137 
LCS_GDT     I    21_A     I    21_A     44  137  137     25   84  110  126  130  134  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137 
LCS_GDT     T    22_A     T    22_A     44  137  137     13   84  110  126  130  134  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137 
LCS_GDT     F    23_A     F    23_A     44  137  137     34   84  110  126  130  134  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137 
LCS_GDT     E    24_A     E    24_A     44  137  137     34   84  110  126  130  134  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137 
LCS_GDT     G    25_A     G    25_A     44  137  137     33   84  110  126  130  134  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137 
LCS_GDT     E    26_A     E    26_A     44  137  137     34   84  110  126  130  134  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137 
LCS_GDT     K    27_A     K    27_A     44  137  137      4   77  110  126  130  134  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137 
LCS_GDT     P    28_A     P    28_A     44  137  137      8   75  110  126  130  134  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137 
LCS_GDT     D    29_A     D    29_A     44  137  137     19   81  110  126  130  134  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137 
LCS_GDT     R    30_A     R    30_A     44  137  137     34   84  110  126  130  134  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137 
LCS_GDT     E    31_A     E    31_A     44  137  137     22   84  110  126  130  134  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137 
LCS_GDT     K    32_A     K    32_A     44  137  137     24   82  110  126  130  134  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137 
LCS_GDT     L    33_A     L    33_A     44  137  137     33   84  110  126  130  134  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137 
LCS_GDT     E    34_A     E    34_A     44  137  137     34   84  110  126  130  134  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137 
LCS_GDT     K    35_A     K    35_A     44  137  137     34   84  110  126  130  134  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137 
LCS_GDT     E    36_A     E    36_A     44  137  137     25   84  110  126  130  134  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137 
LCS_GDT     L    37_A     L    37_A     44  137  137     34   84  110  126  130  134  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137 
LCS_GDT     Y    38_A     Y    38_A     44  137  137      5   61  110  126  130  134  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137 
LCS_GDT     S    39_A     S    39_A     44  137  137      5   38  107  126  130  134  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137 
LCS_GDT     G    40_A     G    40_A     44  137  137      3   16   91  126  130  134  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137 
LCS_GDT     S    41_A     S    41_A     44  137  137      3   38  109  126  130  134  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137 
LCS_GDT     I    42_A     I    42_A     44  137  137      4   55  110  126  130  134  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137 
LCS_GDT     V    43_A     V    43_A     44  137  137      3    3   51  108  128  134  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137 
LCS_GDT     T    44_A     T    44_A     44  137  137     11   57  109  126  130  134  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137 
LCS_GDT     D    45_A     D    45_A     44  137  137     19   84  110  126  130  134  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137 
LCS_GDT     E    46_A     E    46_A     44  137  137     12   84  110  126  130  134  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137 
LCS_GDT     E    47_A     E    47_A     43  137  137     19   84  110  126  130  134  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137 
LCS_GDT     M    48_A     M    48_A     43  137  137     19   84  110  126  130  134  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137 
LCS_GDT     Q    49_A     Q    49_A     43  137  137     33   84  110  126  130  134  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137 
LCS_GDT     K    50_A     K    50_A     43  137  137     32   84  110  126  130  134  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137 
LCS_GDT     K    51_A     K    51_A     43  137  137     34   84  110  126  130  134  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137 
LCS_GDT     A    52_A     A    52_A     43  137  137     33   84  110  126  130  134  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137 
LCS_GDT     E    53_A     E    53_A     43  137  137      7   71  109  126  130  134  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137 
LCS_GDT     E    54_A     E    54_A     43  137  137     20   77  110  126  130  134  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137 
LCS_GDT     F    55_A     F    55_A     43  137  137     20   77  110  126  130  134  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137 
LCS_GDT     G    56_A     G    56_A     43  137  137      4   61  107  126  130  134  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137 
LCS_GDT     V    57_A     V    57_A     43  137  137      4   84  110  126  130  134  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137 
LCS_GDT     K    58_A     K    58_A     43  137  137     34   84  110  126  130  134  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137 
LCS_GDT     I    59_A     I    59_A     43  137  137     27   84  110  126  130  134  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137 
LCS_GDT     T    60_A     T    60_A     43  137  137      7   84  110  126  130  134  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137 
LCS_GDT     V    61_A     V    61_A     43  137  137     12   84  110  126  130  134  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137 
LCS_GDT     A    62_A     A    62_A     43  137  137      4   81  110  126  130  134  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137 
LCS_GDT     D    63_A     D    63_A     20  137  137     27   81  110  126  130  134  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137 
LCS_GDT     C    64_A     C    64_A      8  137  137      4    7   60  119  130  134  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137 
LCS_GDT     K    65_A     K    65_A     20  137  137      4   39   84  121  130  134  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137 
LCS_GDT     E    66_A     E    66_A     20  137  137     17   84  110  126  130  134  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137 
LCS_GDT     K    67_A     K    67_A     20  137  137     34   84  110  126  130  134  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137 
LCS_GDT     V    68_A     V    68_A     20  137  137     34   84  110  126  130  134  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137 
LCS_GDT     S    69_A     S    69_A     20  137  137     34   84  110  126  130  134  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137 
LCS_GDT     E    70_A     E    70_A     20  137  137     34   84  110  126  130  134  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137 
LCS_GDT     R    71_A     R    71_A     20  137  137      4   29   76  115  130  134  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137 
LCS_GDT     N    72_A     N    72_A     20  137  137      5   40   76  115  130  134  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137 
LCS_GDT     G    73_A     G    73_A     34  137  137      4   36  110  126  130  134  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137 
LCS_GDT     V    74_A     V    74_A     34  137  137      6   84  110  126  130  134  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137 
LCS_GDT     L    75_A     L    75_A     34  137  137     16   84  110  126  130  134  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137 
LCS_GDT     V    76_A     V    76_A     34  137  137     34   84  110  126  130  134  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137 
LCS_GDT     G    77_A     G    77_A     34  137  137     32   84  110  126  130  134  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137 
LCS_GDT     E    78_A     E    78_A     34  137  137     25   84  110  126  130  134  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137 
LCS_GDT     V    79_A     V    79_A     34  137  137     28   84  110  126  130  134  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137 
LCS_GDT     S    80_A     S    80_A     34  137  137     30   84  110  126  130  134  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137 
LCS_GDT     S    81_A     S    81_A     34  137  137     19   74  109  126  130  134  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137 
LCS_GDT     A    82_A     A    82_A     34  137  137     13   78  110  126  130  134  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137 
LCS_GDT     E    83_A     E    83_A     34  137  137      9   54  106  125  130  134  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137 
LCS_GDT     G    84_A     G    84_A     34  137  137     23   84  110  126  130  134  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137 
LCS_GDT     G    85_A     G    85_A     34  137  137     21   84  110  126  130  134  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137 
LCS_GDT     V    86_A     V    86_A     34  137  137      3   10   28  106  130  134  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137 
LCS_GDT     V    87_A     V    87_A     34  137  137     19   83  110  126  130  134  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137 
LCS_GDT     K    88_A     K    88_A     34  137  137     28   84  110  126  130  134  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137 
LCS_GDT     K    89_A     K    89_A     34  137  137     32   84  110  126  130  134  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137 
LCS_GDT     R    90_A     R    90_A     34  137  137     34   84  110  126  130  134  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137 
LCS_GDT     R    91_A     R    91_A     34  137  137     34   84  110  126  130  134  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137 
LCS_GDT     L    92_A     L    92_A     34  137  137     27   84  110  126  130  134  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137 
LCS_GDT     Y    93_A     Y    93_A     34  137  137     34   84  110  126  130  134  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137 
LCS_GDT     A    94_A     A    94_A     34  137  137     34   84  110  126  130  134  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137 
LCS_GDT     S    95_A     S    95_A     34  137  137     15   82  110  126  130  134  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137 
LCS_GDT     A    96_A     A    96_A     34  137  137     11   70  110  126  130  134  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137 
LCS_GDT     G    97_A     G    97_A     34  137  137     23   84  110  126  130  134  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137 
LCS_GDT     N    98_A     N    98_A     34  137  137     34   84  110  126  130  134  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137 
LCS_GDT     F    99_A     F    99_A     34  137  137     34   84  110  126  130  134  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137 
LCS_GDT     A   100_A     A   100_A     34  137  137     28   84  110  126  130  134  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137 
LCS_GDT     I   101_A     I   101_A     34  137  137     34   84  110  126  130  134  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137 
LCS_GDT     A   102_A     A   102_A     34  137  137     34   84  110  126  130  134  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137 
LCS_GDT     E   103_A     E   103_A     34  137  137     31   84  110  126  130  134  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137 
LCS_GDT     L   104_A     L   104_A     34  137  137     28   84  110  126  130  134  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137 
LCS_GDT     I   105_A     I   105_A     34  137  137     19   81  110  126  130  134  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137 
LCS_GDT     N   106_A     N   106_A     34  137  137     18   75  110  126  130  134  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137 
LCS_GDT     T   107_A     T   107_A     32  137  137      3   13   55  101  130  134  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137 
LCS_GDT     E   108_A     E   108_A     32  137  137     13   81  110  126  130  134  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137 
LCS_GDT     M   109_A     M   109_A     32  137  137     15   70  110  126  130  134  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137 
LCS_GDT     T   110_A     T   110_A     26  137  137      5   43   91  126  130  134  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137 
LCS_GDT     L   111_A     L   111_A     25  137  137      6   43  102  126  130  134  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137 
LCS_GDT     T   112_A     T   112_A     26  137  137      3    8   54  109  126  134  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137 
LCS_GDT     S   113_A     S   113_A     26  137  137     22   84  109  126  130  134  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137 
LCS_GDT     Q   114_A     Q   114_A     26  137  137     28   84  110  126  130  134  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137 
LCS_GDT     G   115_A     G   115_A     26  137  137      3   24  106  126  130  134  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137 
LCS_GDT     K   116_A     K   116_A     26  137  137     27   84  110  126  130  134  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137 
LCS_GDT     G   117_A     G   117_A     26  137  137     28   84  110  126  130  134  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137 
LCS_GDT     S   118_A     S   118_A     26  137  137     34   84  110  126  130  134  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137 
LCS_GDT     N   119_A     N   119_A     26  137  137     34   84  110  126  130  134  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137 
LCS_GDT     F   120_A     F   120_A     26  137  137     23   84  110  126  130  134  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137 
LCS_GDT     I   121_A     I   121_A     26  137  137     23   84  110  126  130  134  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137 
LCS_GDT     A   122_A     A   122_A     26  137  137     34   84  110  126  130  134  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137 
LCS_GDT     F   123_A     F   123_A     26  137  137     32   84  110  126  130  134  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137 
LCS_GDT     G   124_A     G   124_A     26  137  137     33   84  110  126  130  134  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137 
LCS_GDT     N   125_A     N   125_A     26  137  137     30   84  110  126  130  134  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137 
LCS_GDT     E   126_A     E   126_A     26  137  137     34   84  110  126  130  134  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137 
LCS_GDT     F   127_A     F   127_A     26  137  137     32   84  110  126  130  134  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137 
LCS_GDT     T   128_A     T   128_A     26  137  137     33   84  110  126  130  134  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137 
LCS_GDT     K   129_A     K   129_A     26  137  137     19   84  110  126  130  134  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137 
LCS_GDT     Q   130_A     Q   130_A     26  137  137     19   84  110  126  130  134  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137 
LCS_GDT     V   131_A     V   131_A     26  137  137     18   84  110  126  130  134  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137 
LCS_GDT     A   132_A     A   132_A     26  137  137     19   84  110  126  130  134  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137 
LCS_GDT     N   133_A     N   133_A     26  137  137     25   84  110  126  130  134  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137 
LCS_GDT     K   134_A     K   134_A     26  137  137     22   84  110  126  130  134  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137 
LCS_GDT     C   135_A     C   135_A     26  137  137     22   84  110  126  130  134  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137 
LCS_GDT     F   136_A     F   136_A     26  137  137     17   73  110  126  130  134  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137 
LCS_GDT     K   137_A     K   137_A     26  137  137      4   33  103  123  130  134  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137  137 
LCS_AVERAGE  LCS_A:  53.75  (  18.53   71.35   71.35 )

GLOBAL_DISTANCE_TEST (summary information about detected largest sets of residues (represented by selected AToms) that can fit under specified thresholds)
GDT DIST_CUTOFF  0.50   1.00   1.50   2.00   2.50   3.00   3.50   4.00   4.50   5.00   5.50   6.00   6.50   7.00   7.50   8.00   8.50   9.00   9.50  10.00
GDT NUMBER_AT     34     84    110    126    130    134    137    137    137    137    137    137    137    137    137    137    137    137    137    137 
GDT PERCENT_AT  17.71  43.75  57.29  65.63  67.71  69.79  71.35  71.35  71.35  71.35  71.35  71.35  71.35  71.35  71.35  71.35  71.35  71.35  71.35  71.35
GDT RMS_LOCAL    0.36   0.67   0.86   1.04   1.10   1.20   1.30   1.30   1.30   1.30   1.30   1.30   1.30   1.30   1.30   1.30   1.30   1.30   1.30   1.30
GDT RMS_ALL_AT   1.33   1.31   1.31   1.31   1.31   1.31   1.30   1.30   1.30   1.30   1.30   1.30   1.30   1.30   1.30   1.30   1.30   1.30   1.30   1.30

# Checking swapping
#   possible swapping detected:  E    31_A      E    31_A
#   possible swapping detected:  E    36_A      E    36_A
#   possible swapping detected:  F    55_A      F    55_A
#   possible swapping detected:  E    66_A      E    66_A
#   possible swapping detected:  F   120_A      F   120_A
#   possible swapping detected:  F   136_A      F   136_A

#      Molecule1      Molecule2  DISTANCE    Mis    MC     All    Dist_max   GDC_mc  GDC_all
LGA    A     1_A      A     1_A     2.456     0    0.313   0.430     2.541   68.810   66.476
LGA    L     2_A      L     2_A     1.217     0    0.071   0.198     2.239   81.548   76.190
LGA    V     3_A      V     3_A     0.404     0    0.106   1.085     3.187   97.619   84.014
LGA    I     4_A      I     4_A     0.668     0    0.069   1.101     2.948   95.238   85.357
LGA    A     5_A      A     5_A     0.426     0    0.064   0.079     0.699  100.000   98.095
LGA    F     6_A      F     6_A     0.626     0    0.067   0.202     1.127   88.214   88.009
LGA    I     7_A      I     7_A     0.830     0    0.096   1.652     4.494   90.476   77.381
LGA    G     8_A      G     8_A     0.983     0    0.016   0.016     0.983   90.476   90.476
LGA    K     9_A      K     9_A     0.614     0    0.054   1.061     6.379   95.238   68.889
LGA    N    10_A      N    10_A     0.806     0    0.047   1.053     5.389   90.476   69.583
LGA    G    11_A      G    11_A     0.636     0    0.036   0.036     0.636   92.857   92.857
LGA    A    12_A      A    12_A     0.819     0    0.060   0.066     0.988   90.476   90.476
LGA    V    13_A      V    13_A     0.767     0    0.049   1.157     3.289   95.238   83.742
LGA    M    14_A      M    14_A     0.185     0    0.111   0.550     1.848  100.000   92.024
LGA    A    15_A      A    15_A     0.387     0    0.080   0.082     0.525   97.619   98.095
LGA    G    16_A      G    16_A     0.430     0    0.059   0.059     0.575   95.238   95.238
LGA    D    17_A      D    17_A     0.795     0    0.046   0.231     1.019   90.476   89.345
LGA    M    18_A      M    18_A     0.650     0    0.193   0.776     2.352   95.238   83.095
LGA    R    19_A      R    19_A     0.381     0    0.046   0.612     2.309   95.238   89.048
LGA    E    20_A      E    20_A     0.644     0    0.042   0.576     2.463   92.857   82.857
LGA    I    21_A      I    21_A     0.671     0    0.026   0.155     1.221   88.214   88.214
LGA    T    22_A      T    22_A     0.969     0    0.092   1.264     3.673   90.476   78.776
LGA    F    23_A      F    23_A     0.408     0    0.140   0.341     0.865   95.238   93.939
LGA    E    24_A      E    24_A     0.240     0    0.082   0.688     2.625  100.000   86.190
LGA    G    25_A      G    25_A     0.617     0    0.063   0.063     0.617   92.857   92.857
LGA    E    26_A      E    26_A     0.489     0    0.246   0.813     3.263   95.238   86.138
LGA    K    27_A      K    27_A     1.570     0    0.027   1.139     4.507   79.286   64.974
LGA    P    28_A      P    28_A     1.716     0    0.039   0.186     2.019   75.000   72.925
LGA    D    29_A      D    29_A     1.165     0    0.028   0.069     1.815   83.690   81.488
LGA    R    30_A      R    30_A     0.208     0    0.046   1.290     3.219   97.619   83.247
LGA    E    31_A      E    31_A     0.903     0    0.123   1.244     4.477   90.476   66.190
LGA    K    32_A      K    32_A     1.039     0    0.119   1.550     9.650   83.690   54.127
LGA    L    33_A      L    33_A     0.662     0    0.070   0.242     1.508   90.476   88.274
LGA    E    34_A      E    34_A     0.055     0    0.046   0.934     2.705  100.000   86.138
LGA    K    35_A      K    35_A     0.378     0    0.078   0.740     4.423   95.238   83.810
LGA    E    36_A      E    36_A     0.715     0    0.093   0.852     2.999   90.595   75.714
LGA    L    37_A      L    37_A     0.445     0    0.045   0.248     1.322   92.976   92.976
LGA    Y    38_A      Y    38_A     1.507     0    0.095   0.436     2.157   75.000   72.222
LGA    S    39_A      S    39_A     2.010     0    0.048   0.054     2.211   68.810   67.460
LGA    G    40_A      G    40_A     2.164     0    0.096   0.096     2.445   66.786   66.786
LGA    S    41_A      S    41_A     1.847     0    0.114   0.115     2.018   75.119   75.794
LGA    I    42_A      I    42_A     1.593     0    0.183   0.321     3.133   72.857   70.060
LGA    V    43_A      V    43_A     3.075     0    0.033   1.118     6.431   57.381   45.170
LGA    T    44_A      T    44_A     1.690     0    0.135   1.012     2.923   77.143   70.816
LGA    D    45_A      D    45_A     0.961     0    0.030   1.038     3.079   88.214   77.917
LGA    E    46_A      E    46_A     0.988     0    0.036   0.951     4.783   88.214   69.101
LGA    E    47_A      E    47_A     1.276     0    0.093   0.195     3.415   79.286   69.683
LGA    M    48_A      M    48_A     1.194     0    0.120   0.768     3.959   83.690   74.643
LGA    Q    49_A      Q    49_A     0.570     0    0.033   1.067     5.318   90.476   74.339
LGA    K    50_A      K    50_A     0.867     0    0.095   0.920     6.710   92.857   67.513
LGA    K    51_A      K    51_A     0.490     0    0.091   1.152     6.272   95.238   76.931
LGA    A    52_A      A    52_A     0.549     0    0.067   0.078     0.972   90.476   90.476
LGA    E    53_A      E    53_A     1.640     0    0.176   0.840     3.626   75.000   67.884
LGA    E    54_A      E    54_A     1.513     0    0.032   1.072     5.839   72.976   57.460
LGA    F    55_A      F    55_A     1.385     0    0.081   0.846     2.717   77.143   73.030
LGA    G    56_A      G    56_A     1.884     0    0.132   0.132     2.008   70.833   70.833
LGA    V    57_A      V    57_A     0.939     0    0.058   1.127     3.631   95.238   82.653
LGA    K    58_A      K    58_A     0.431     0    0.063   0.520     2.514   95.238   85.926
LGA    I    59_A      I    59_A     0.605     0    0.355   0.641     1.777   88.214   87.143
LGA    T    60_A      T    60_A     1.059     0    0.058   1.093     2.735   85.952   77.075
LGA    V    61_A      V    61_A     1.085     0    0.097   1.058     2.789   83.690   78.163
LGA    A    62_A      A    62_A     1.363     0    0.036   0.049     2.004   83.690   79.905
LGA    D    63_A      D    63_A     1.161     0    0.289   0.256     1.763   77.143   77.143
LGA    C    64_A      C    64_A     2.568     0    0.347   0.808     3.199   66.905   62.460
LGA    K    65_A      K    65_A     2.387     0    0.050   1.316     7.811   72.976   50.899
LGA    E    66_A      E    66_A     1.428     0    0.265   0.907     6.009   77.143   54.497
LGA    K    67_A      K    67_A     0.647     0    0.049   0.677     2.283   88.214   89.788
LGA    V    68_A      V    68_A     0.655     0    0.051   0.209     0.820   90.476   91.837
LGA    S    69_A      S    69_A     0.541     0    0.018   0.585     1.995   90.476   87.540
LGA    E    70_A      E    70_A     0.659     0    0.259   0.902     3.765   88.214   76.032
LGA    R    71_A      R    71_A     3.022     0    0.372   1.348     8.334   49.048   36.104
LGA    N    72_A      N    72_A     3.051     0    0.310   1.136     8.165   61.190   41.726
LGA    G    73_A      G    73_A     1.484     0    0.176   0.176     1.963   83.810   83.810
LGA    V    74_A      V    74_A     1.073     0    0.015   0.079     1.957   83.690   79.048
LGA    L    75_A      L    75_A     0.979     0    0.027   0.239     1.368   90.476   88.214
LGA    V    76_A      V    76_A     0.647     0    0.136   1.047     2.756   88.214   82.109
LGA    G    77_A      G    77_A     0.897     0    0.122   0.122     0.981   90.476   90.476
LGA    E    78_A      E    78_A     1.187     0    0.201   0.338     1.400   81.429   86.508
LGA    V    79_A      V    79_A     1.061     0    0.090   1.020     2.936   79.286   75.510
LGA    S    80_A      S    80_A     0.855     0    0.391   0.743     1.584   86.071   84.524
LGA    S    81_A      S    81_A     1.671     0    0.237   0.593     2.697   69.048   70.317
LGA    A    82_A      A    82_A     1.484     0    0.605   0.558     2.477   75.119   74.667
LGA    E    83_A      E    83_A     1.923     0    0.568   0.869     5.543   61.429   51.587
LGA    G    84_A      G    84_A     1.486     0    0.421   0.421     2.783   79.881   79.881
LGA    G    85_A      G    85_A     0.625     0    0.623   0.623     3.123   73.690   73.690
LGA    V    86_A      V    86_A     3.391     0    0.331   0.423     5.691   57.262   44.014
LGA    V    87_A      V    87_A     1.020     0    0.108   0.228     1.826   81.548   81.565
LGA    K    88_A      K    88_A     0.852     0    0.348   1.106     6.893   88.333   66.138
LGA    K    89_A      K    89_A     0.499     0    0.134   0.677     2.694   95.238   88.942
LGA    R    90_A      R    90_A     0.448     0    0.163   1.169     2.325   95.238   81.169
LGA    R    91_A      R    91_A     0.434     0    0.040   0.629     1.891   97.619   89.913
LGA    L    92_A      L    92_A     0.876     0    0.074   1.116     3.381   88.214   82.024
LGA    Y    93_A      Y    93_A     0.497     0    0.080   0.254     1.877   95.238   87.659
LGA    A    94_A      A    94_A     0.418     0    0.031   0.033     0.959   95.238   94.286
LGA    S    95_A      S    95_A     1.073     0    0.036   0.104     1.309   83.690   82.937
LGA    A    96_A      A    96_A     1.509     0    0.080   0.085     1.941   77.143   76.286
LGA    G    97_A      G    97_A     0.822     0    0.094   0.094     1.009   92.976   92.976
LGA    N    98_A      N    98_A     0.234     0    0.101   0.266     2.094  100.000   88.690
LGA    F    99_A      F    99_A     0.680     0    0.083   0.183     2.137   90.476   79.351
LGA    A   100_A      A   100_A     0.905     0    0.076   0.098     1.769   90.476   86.952
LGA    I   101_A      I   101_A     0.439     0    0.063   1.076     2.711   95.238   83.452
LGA    A   102_A      A   102_A     0.647     0    0.038   0.062     0.647   95.238   94.286
LGA    E   103_A      E   103_A     0.631     0    0.017   0.941     4.625   90.476   74.180
LGA    L   104_A      L   104_A     0.786     0    0.016   1.349     4.384   90.476   75.714
LGA    I   105_A      I   105_A     1.213     0    0.262   1.245     3.621   83.690   71.786
LGA    N   106_A      N   106_A     1.696     0    0.255   0.496     2.578   66.905   72.083
LGA    T   107_A      T   107_A     3.681     0    0.028   0.094     5.524   50.119   41.497
LGA    E   108_A      E   108_A     1.339     0    0.169   0.309     4.389   75.119   60.000
LGA    M   109_A      M   109_A     1.733     0    0.046   0.942     4.059   72.857   69.524
LGA    T   110_A      T   110_A     2.406     0    0.571   0.917     4.551   56.548   54.898
LGA    L   111_A      L   111_A     2.160     0    0.045   1.259     7.052   69.286   47.083
LGA    T   112_A      T   112_A     3.659     0    0.686   1.472     7.722   48.810   33.265
LGA    S   113_A      S   113_A     1.544     0    0.090   0.663     3.114   79.405   74.841
LGA    Q   114_A      Q   114_A     1.095     0    0.317   1.179     6.873   83.929   58.624
LGA    G   115_A      G   115_A     1.962     0    0.160   0.160     1.962   77.143   77.143
LGA    K   116_A      K   116_A     0.652     0    0.108   0.929     6.024   90.476   66.984
LGA    G   117_A      G   117_A     0.565     0    0.045   0.045     0.613   95.238   95.238
LGA    S   118_A      S   118_A     0.522     0    0.059   0.724     2.275   90.476   84.683
LGA    N   119_A      N   119_A     0.439     0    0.131   1.031     3.678  100.000   84.940
LGA    F   120_A      F   120_A     0.827     0    0.131   1.334     7.259   92.857   58.355
LGA    I   121_A      I   121_A     0.894     0    0.080   0.591     1.837   90.476   87.143
LGA    A   122_A      A   122_A     0.321     0    0.058   0.083     0.684  100.000   98.095
LGA    F   123_A      F   123_A     0.770     0    0.021   0.212     1.512   90.476   86.407
LGA    G   124_A      G   124_A     0.721     0    0.074   0.074     0.922   90.476   90.476
LGA    N   125_A      N   125_A     0.693     0    0.066   0.273     1.154   90.476   90.536
LGA    E   126_A      E   126_A     0.137     0    0.074   0.963     4.704   95.238   73.069
LGA    F   127_A      F   127_A     0.564     0    0.062   0.114     1.591   95.238   88.961
LGA    T   128_A      T   128_A     0.462     0    0.016   0.089     0.933   95.238   93.197
LGA    K   129_A      K   129_A     0.792     0    0.043   0.289     1.653   88.214   86.508
LGA    Q   130_A      Q   130_A     0.970     0    0.051   0.858     2.547   85.952   81.746
LGA    V   131_A      V   131_A     1.094     0    0.074   1.006     2.143   81.429   79.116
LGA    A   132_A      A   132_A     1.015     0    0.015   0.036     1.098   85.952   86.857
LGA    N   133_A      N   133_A     0.650     0    0.063   1.218     4.380   92.857   75.774
LGA    K   134_A      K   134_A     1.063     0    0.148   0.666     3.025   83.690   76.296
LGA    C   135_A      C   135_A     1.109     0    0.082   0.790     2.845   79.286   75.952
LGA    F   136_A      F   136_A     1.553     0    0.577   0.664     5.414   62.619   54.156
LGA    K   137_A      K   137_A     2.765     0    0.434   1.043     5.644   45.714   50.106

# RMSD_GDC results:       CA      MC common percent     ALL common percent   GDC_mc  GDC_all
NUMBER_OF_ATOMS_AA:      137     548    548  100.00    1043   1043  100.00               192
SUMMARY(RMSD_GDC):     1.303          1.339                  2.169           60.441   55.054

#CA            N1   N2   DIST      N    RMSD    GDT_TS    LGA_S3     LGA_Q 
SUMMARY(GDT)  137  192    4.0    137    1.30    63.021    67.389     9.765

LGA_LOCAL      RMSD:   1.303  Number of atoms:  137  under DIST:   4.00
LGA_ASGN_ATOMS RMSD:   1.303  Number of assigned atoms:  137 
Std_ASGN_ATOMS RMSD:   1.303  Standard rmsd on all 137 assigned CA atoms 

Unitary ROTATION matrix and the SHIFT vector superimpose molecules  (1=>2)
  X_new =   0.859193 * X  +  -0.479335 * Y  +  -0.178956 * Z  +  -2.927380
  Y_new =   0.483732 * X  +   0.647045 * Y  +   0.589352 * Z  + -41.004444
  Z_new =  -0.166705 * X  +  -0.592934 * Y  +   0.787807 * Z  + -54.197014 

Euler angles from the ROTATION matrix. Conventions XYZ and ZXZ:
           Phi     Theta       Psi   [DEG:       Phi     Theta       Psi ]
XYZ:  0.512775  0.167487 -0.645188   [DEG:   29.3798    9.5963  -36.9665 ]
ZXZ: -2.846792  0.663557 -2.867516   [DEG: -163.1092   38.0190 -164.2966 ]
 
# END of job
