
#######################################################
#                                                     #
#                        LGA                          #
#                  ---------------                    #
#                                                     #
#               Local-Global Alignment                #
#        A Method for Finding 3-D Similarities        #
#               in Protein Structures                 #
#                                                     #
#                  ------------ 10/2009               #
#                                                     #
#      Adam Zemla (adamz@llnl.gov)                    #
#      Lawrence Livermore National Laboratory, CA     #
#                                                     #
#######################################################

!!!   License for LGA program has expired  !!!
#   For updated version of the LGA program   #
# please contact Adam Zemla:  adamz@llnl.gov #

# Molecule1: number of CA atoms  115 (  972),  selected  108 , name one
# Molecule2: number of CA atoms  108 (  908),  selected  108 , name two
# PARAMETERS: input.pdb  -ie  -3  -d:4  -sda  -swap  -ch1:C  -ch2:C  
# FIXED Atom-Atom correspondence
# GDT and LCS analysis 

LCS - RMSD CUTOFF   5.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:   108       2_C - 109_C       0.54     0.54
  LCS_AVERAGE:    100.00

LCS - RMSD CUTOFF   2.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:   108       2_C - 109_C       0.54     0.54
  LCS_AVERAGE:    100.00

LCS - RMSD CUTOFF   1.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:   108       2_C - 109_C       0.54     0.54
  LCS_AVERAGE:    100.00

LCS_GDT    MOLECULE-1    MOLECULE-2     LCS_DETAILS     GDT_DETAILS                                                    TOTAL NUMBER OF RESIDUE PAIRS:  108
LCS_GDT     RESIDUE       RESIDUE       SEGMENT_SIZE    GLOBAL DISTANCE TEST COLUMNS: number of residues under the threshold assigned to each residue pair
LCS_GDT   NAME NUMBER   NAME NUMBER    1.0  2.0  5.0    0.5  1.0  1.5  2.0  2.5  3.0  3.5  4.0  4.5  5.0  5.5  6.0  6.5  7.0  7.5  8.0  8.5  9.0  9.5 10.0
LCS_GDT     L     2_C     L     2_C    108  108  108     76  104  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     P     3_C     P     3_C    108  108  108     76  104  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     D     4_C     D     4_C    108  108  108     76  104  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E     5_C     E     5_C    108  108  108     76  104  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E     6_C     E     6_C    108  108  108     76  104  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K     7_C     K     7_C    108  108  108     76  104  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L     8_C     L     8_C    108  108  108     76  104  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K     9_C     K     9_C    108  108  108     76  104  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    10_C     L    10_C    108  108  108     76  104  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    11_C     L    11_C    108  108  108     76  104  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     D    12_C     D    12_C    108  108  108     76  104  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     T    13_C     T    13_C    108  108  108     76  104  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    14_C     L    14_C    108  108  108     76  104  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    15_C     L    15_C    108  108  108     76  104  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     T    16_C     T    16_C    108  108  108     76  104  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     M    17_C     M    17_C    108  108  108     76  104  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     V    18_C     V    18_C    108  108  108     76  104  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    19_C     E    19_C    108  108  108     76  104  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     W    20_C     W    20_C    108  108  108     73  104  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     V    21_C     V    21_C    108  108  108     76  104  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K    22_C     K    22_C    108  108  108     76  104  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    23_C     E    23_C    108  108  108     76  104  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    24_C     L    24_C    108  108  108     76  104  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    25_C     L    25_C    108  108  108     76  104  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    26_C     E    26_C    108  108  108     66  104  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    27_C     E    27_C    108  108  108     60  104  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     S    28_C     S    28_C    108  108  108     76  104  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     V    29_C     V    29_C    108  108  108     60  104  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    30_C     E    30_C    108  108  108     73  104  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K    31_C     K    31_C    108  108  108     76  104  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     N    32_C     N    32_C    108  108  108     76  104  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     S    33_C     S    33_C    108  108  108     23  103  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     R    34_C     R    34_C    108  108  108     28  103  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     M    35_C     M    35_C    108  108  108     28   96  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     R    36_C     R    36_C    108  108  108     23  104  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     H    37_C     H    37_C    108  108  108     59  104  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     I    38_C     I    38_C    108  108  108     53  104  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     R    39_C     R    39_C    108  108  108     27  104  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A    40_C     A    40_C    108  108  108     76  104  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     V    41_C     V    41_C    108  108  108     76  104  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     M    42_C     M    42_C    108  108  108     76  104  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     W    43_C     W    43_C    108  108  108     76  104  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A    44_C     A    44_C    108  108  108     76  104  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    45_C     E    45_C    108  108  108     76  104  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     Y    46_C     Y    46_C    108  108  108     76  104  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     M    47_C     M    47_C    108  108  108     73  104  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    48_C     L    48_C    108  108  108     51  104  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    49_C     E    49_C    108  108  108     28  104  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     I    50_C     I    50_C    108  108  108     59  104  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A    51_C     A    51_C    108  108  108     59  104  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     R    52_C     R    52_C    108  108  108     76  104  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     S    53_C     S    53_C    108  108  108     76  104  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    54_C     L    54_C    108  108  108     76  104  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    55_C     E    55_C    108  108  108     76  104  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     D    56_C     D    56_C    108  108  108     76  104  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    57_C     E    57_C    108  108  108     76  104  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K    58_C     K    58_C    108  108  108     76  104  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     I    59_C     I    59_C    108  108  108     76  104  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    60_C     L    60_C    108  108  108     76  104  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    61_C     E    61_C    108  108  108     76  104  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     I    62_C     I    62_C    108  108  108     76  104  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A    63_C     A    63_C    108  108  108     76  104  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    64_C     E    64_C    108  108  108     76  104  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K    65_C     K    65_C    108  108  108     76  104  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    66_C     L    66_C    108  108  108     76  104  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    67_C     E    67_C    108  108  108     76  104  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K    68_C     K    68_C    108  108  108     74  104  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A    69_C     A    69_C    108  108  108     45  104  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    70_C     L    70_C    108  108  108     62  104  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     P    71_C     P    71_C    108  108  108     62  104  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    72_C     E    72_C    108  108  108     76  104  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K    73_C     K    73_C    108  108  108     76  104  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     S    74_C     S    74_C    108  108  108      4   92  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K    75_C     K    75_C    108  108  108     60  104  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     M    76_C     M    76_C    108  108  108     74  104  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     F    77_C     F    77_C    108  108  108     53  104  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     T    78_C     T    78_C    108  108  108     70  104  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K    79_C     K    79_C    108  108  108     53  104  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    80_C     E    80_C    108  108  108     28  104  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    81_C     E    81_C    108  108  108     53  104  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     Y    82_C     Y    82_C    108  108  108     76  104  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    83_C     E    83_C    108  108  108     76  104  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K    84_C     K    84_C    108  108  108     76  104  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    85_C     L    85_C    108  108  108     76  104  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     M    86_C     M    86_C    108  108  108     76  104  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    87_C     E    87_C    108  108  108     76  104  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     V    88_C     V    88_C    108  108  108     76  104  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    89_C     L    89_C    108  108  108     76  104  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    90_C     E    90_C    108  108  108     76  104  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    91_C     E    91_C    108  108  108     76  104  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    92_C     L    92_C    108  108  108     76  104  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    93_C     E    93_C    108  108  108     76  104  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    94_C     E    94_C    108  108  108     76  104  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     V    95_C     V    95_C    108  108  108     76  104  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    96_C     L    96_C    108  108  108     76  104  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    97_C     E    97_C    108  108  108     76  104  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    98_C     E    98_C    108  108  108     76  104  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K    99_C     K    99_C    108  108  108     76  104  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K   100_C     K   100_C    108  108  108     76  104  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E   101_C     E   101_C    108  108  108     76  104  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E   102_C     E   102_C    108  108  108     76  104  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     V   103_C     V   103_C    108  108  108     76  104  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E   104_C     E   104_C    108  108  108     76  104  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E   105_C     E   105_C    108  108  108     62  104  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     R   106_C     R   106_C    108  108  108     62  104  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     I   107_C     I   107_C    108  108  108     76  104  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E   108_C     E   108_C    108  108  108     76  104  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     G   109_C     G   109_C    108  108  108     74  104  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_AVERAGE  LCS_A: 100.00  ( 100.00  100.00  100.00 )

GLOBAL_DISTANCE_TEST (summary information about detected largest sets of residues (represented by selected AToms) that can fit under specified thresholds)
GDT DIST_CUTOFF  0.50   1.00   1.50   2.00   2.50   3.00   3.50   4.00   4.50   5.00   5.50   6.00   6.50   7.00   7.50   8.00   8.50   9.00   9.50  10.00
GDT NUMBER_AT     76    104    107    108    108    108    108    108    108    108    108    108    108    108    108    108    108    108    108    108 
GDT PERCENT_AT  70.37  96.30  99.07 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00
GDT RMS_LOCAL    0.35   0.47   0.51   0.54   0.54   0.54   0.54   0.54   0.54   0.54   0.54   0.54   0.54   0.54   0.54   0.54   0.54   0.54   0.54   0.54
GDT RMS_ALL_AT   0.56   0.54   0.54   0.54   0.54   0.54   0.54   0.54   0.54   0.54   0.54   0.54   0.54   0.54   0.54   0.54   0.54   0.54   0.54   0.54

# Checking swapping
#   possible swapping detected:  E     5_C      E     5_C
#   possible swapping detected:  E     6_C      E     6_C
#   possible swapping detected:  E    19_C      E    19_C
#   possible swapping detected:  E    23_C      E    23_C
#   possible swapping detected:  E    26_C      E    26_C
#   possible swapping detected:  E    27_C      E    27_C
#   possible swapping detected:  E    30_C      E    30_C
#   possible swapping detected:  E    45_C      E    45_C
#   possible swapping detected:  Y    46_C      Y    46_C
#   possible swapping detected:  D    56_C      D    56_C
#   possible swapping detected:  E    57_C      E    57_C
#   possible swapping detected:  E    72_C      E    72_C
#   possible swapping detected:  E    81_C      E    81_C
#   possible swapping detected:  Y    82_C      Y    82_C
#   possible swapping detected:  E    83_C      E    83_C
#   possible swapping detected:  E    87_C      E    87_C
#   possible swapping detected:  E    90_C      E    90_C
#   possible swapping detected:  E    91_C      E    91_C
#   possible swapping detected:  E    93_C      E    93_C
#   possible swapping detected:  E    94_C      E    94_C
#   possible swapping detected:  E    97_C      E    97_C
#   possible swapping detected:  E    98_C      E    98_C
#   possible swapping detected:  E   104_C      E   104_C
#   possible swapping detected:  E   105_C      E   105_C
#   possible swapping detected:  E   108_C      E   108_C

#      Molecule1      Molecule2  DISTANCE    Mis    MC     All    Dist_max   GDC_mc  GDC_all
LGA    L     2_C      L     2_C     0.246     0    0.073   0.337     1.642  100.000   93.095
LGA    P     3_C      P     3_C     0.509     0    0.027   0.034     0.681   97.619   95.918
LGA    D     4_C      D     4_C     0.269     0    0.090   0.136     0.397  100.000  100.000
LGA    E     5_C      E     5_C     0.450     0    0.089   0.964     4.157  100.000   79.841
LGA    E     6_C      E     6_C     0.114     0    0.053   0.809     3.876  100.000   86.772
LGA    K     7_C      K     7_C     0.320     0    0.045   0.746     3.389  100.000   83.810
LGA    L     8_C      L     8_C     0.480     0    0.050   1.362     2.812   97.619   84.583
LGA    K     9_C      K     9_C     0.504     0    0.036   0.741     2.164   95.238   88.836
LGA    L    10_C      L    10_C     0.428     0    0.019   1.266     2.589  100.000   87.917
LGA    L    11_C      L    11_C     0.351     0    0.079   0.103     0.518   97.619   98.810
LGA    D    12_C      D    12_C     0.411     0    0.038   0.126     0.685  100.000   96.429
LGA    T    13_C      T    13_C     0.394     0    0.027   0.045     0.469  100.000  100.000
LGA    L    14_C      L    14_C     0.482     0    0.021   0.114     0.778  100.000   96.429
LGA    L    15_C      L    15_C     0.338     0    0.072   0.129     0.521  100.000   98.810
LGA    T    16_C      T    16_C     0.474     0    0.021   1.008     2.004   97.619   88.367
LGA    M    17_C      M    17_C     0.476     0    0.033   0.746     2.234  100.000   92.024
LGA    V    18_C      V    18_C     0.445     0    0.052   0.065     0.620   97.619   95.918
LGA    E    19_C      E    19_C     0.549     0    0.052   0.773     2.629   90.476   83.810
LGA    W    20_C      W    20_C     0.677     0    0.023   1.597     6.399   90.476   55.442
LGA    V    21_C      V    21_C     0.581     0    0.070   0.074     0.667   92.857   91.837
LGA    K    22_C      K    22_C     0.482     0    0.059   0.827     2.823   92.857   87.302
LGA    E    23_C      E    23_C     0.559     0    0.048   0.811     2.807   90.476   83.810
LGA    L    24_C      L    24_C     0.620     0    0.025   0.133     0.648   90.476   94.048
LGA    L    25_C      L    25_C     0.533     0    0.075   0.194     0.648   90.476   92.857
LGA    E    26_C      E    26_C     0.762     0    0.070   0.253     0.915   90.476   92.593
LGA    E    27_C      E    27_C     0.751     0    0.070   0.499     1.938   92.857   89.577
LGA    S    28_C      S    28_C     0.559     0    0.028   0.063     0.633   92.857   92.063
LGA    V    29_C      V    29_C     0.749     0    0.082   0.169     1.113   90.476   89.184
LGA    E    30_C      E    30_C     0.669     0    0.037   0.331     1.840   90.476   87.513
LGA    K    31_C      K    31_C     0.395     0    0.089   0.677     3.506   95.238   81.534
LGA    N    32_C      N    32_C     0.223     0    0.049   0.093     1.106   95.238   91.726
LGA    S    33_C      S    33_C     1.282     0    0.158   0.161     2.020   83.690   78.730
LGA    R    34_C      R    34_C     1.230     0    0.021   0.620     1.613   81.429   84.026
LGA    M    35_C      M    35_C     1.507     0    0.018   1.424     8.551   79.286   57.202
LGA    R    36_C      R    36_C     1.020     0    0.056   0.227     2.637   85.952   76.277
LGA    H    37_C      H    37_C     0.545     0    0.028   1.172     5.621   95.238   67.048
LGA    I    38_C      I    38_C     0.673     0    0.010   0.107     1.225   92.857   89.405
LGA    R    39_C      R    39_C     0.773     0    0.029   1.030     3.359   90.476   78.095
LGA    A    40_C      A    40_C     0.510     0    0.072   0.079     0.517   95.238   94.286
LGA    V    41_C      V    41_C     0.263     0    0.050   0.066     0.346  100.000  100.000
LGA    M    42_C      M    42_C     0.196     0    0.036   0.993     2.877  100.000   88.929
LGA    W    43_C      W    43_C     0.416     0    0.036   0.355     2.316  100.000   88.333
LGA    A    44_C      A    44_C     0.389     0    0.017   0.029     0.437  100.000  100.000
LGA    E    45_C      E    45_C     0.374     0    0.009   0.267     0.982  100.000   98.942
LGA    Y    46_C      Y    46_C     0.351     0    0.015   0.163     0.544  100.000   98.413
LGA    M    47_C      M    47_C     0.606     0    0.017   1.032     1.966   92.857   85.060
LGA    L    48_C      L    48_C     0.745     0    0.029   0.052     1.156   90.476   87.083
LGA    E    49_C      E    49_C     0.631     0    0.038   0.935     2.071   90.476   82.698
LGA    I    50_C      I    50_C     0.585     0    0.041   0.106     0.775   90.476   90.476
LGA    A    51_C      A    51_C     0.594     0    0.084   0.102     0.693   95.238   94.286
LGA    R    52_C      R    52_C     0.423     0    0.063   0.430     2.019  100.000   90.043
LGA    S    53_C      S    53_C     0.274     0    0.040   0.049     0.460  100.000  100.000
LGA    L    54_C      L    54_C     0.339     0    0.025   0.147     0.816  100.000   98.810
LGA    E    55_C      E    55_C     0.335     0    0.017   0.675     2.438  100.000   84.339
LGA    D    56_C      D    56_C     0.363     0    0.037   0.170     0.653  100.000   98.810
LGA    E    57_C      E    57_C     0.236     0    0.028   0.906     3.919  100.000   83.968
LGA    K    58_C      K    58_C     0.404     0    0.049   0.875     2.125  100.000   86.931
LGA    I    59_C      I    59_C     0.271     0    0.030   0.669     2.034  100.000   94.405
LGA    L    60_C      L    60_C     0.282     0    0.033   0.051     0.394  100.000  100.000
LGA    E    61_C      E    61_C     0.313     0    0.010   0.832     2.400  100.000   84.339
LGA    I    62_C      I    62_C     0.076     0    0.038   0.226     0.822  100.000   98.810
LGA    A    63_C      A    63_C     0.333     0    0.016   0.029     0.376  100.000  100.000
LGA    E    64_C      E    64_C     0.359     0    0.046   0.638     1.475  100.000   91.746
LGA    K    65_C      K    65_C     0.192     0    0.013   0.075     0.585  100.000   98.942
LGA    L    66_C      L    66_C     0.303     0    0.039   0.152     1.303  100.000   93.036
LGA    E    67_C      E    67_C     0.380     0    0.016   0.356     0.934  100.000   96.825
LGA    K    68_C      K    68_C     0.531     0    0.097   1.343     7.081   92.857   69.947
LGA    A    69_C      A    69_C     0.612     0    0.083   0.097     0.625   92.857   92.381
LGA    L    70_C      L    70_C     0.537     0    0.051   0.082     0.656   90.476   94.048
LGA    P    71_C      P    71_C     0.656     0    0.083   0.133     0.812   90.476   90.476
LGA    E    72_C      E    72_C     0.532     0    0.116   0.900     4.744   92.857   73.545
LGA    K    73_C      K    73_C     0.469     0    0.238   0.228     1.723   90.833   90.688
LGA    S    74_C      S    74_C     1.718     0    0.029   0.619     4.553   77.143   67.460
LGA    K    75_C      K    75_C     0.628     0    0.016   0.813     3.671   95.238   79.153
LGA    M    76_C      M    76_C     0.435     0    0.065   0.267     0.839   95.238   96.429
LGA    F    77_C      F    77_C     0.723     0    0.032   0.606     2.433   90.476   83.290
LGA    T    78_C      T    78_C     0.501     0    0.043   0.068     0.613   90.476   93.197
LGA    K    79_C      K    79_C     0.618     0    0.051   0.616     2.176   92.857   89.735
LGA    E    80_C      E    80_C     0.709     0    0.056   0.821     3.092   90.476   77.302
LGA    E    81_C      E    81_C     0.671     0    0.041   0.651     1.968   90.476   86.508
LGA    Y    82_C      Y    82_C     0.295     0    0.074   0.122     0.746  100.000   97.619
LGA    E    83_C      E    83_C     0.107     0    0.045   0.244     0.685  100.000   97.884
LGA    K    84_C      K    84_C     0.272     0    0.012   1.021     5.699  100.000   79.153
LGA    L    85_C      L    85_C     0.352     0    0.025   1.310     3.169  100.000   84.762
LGA    M    86_C      M    86_C     0.360     0    0.064   0.823     2.349   97.619   90.893
LGA    E    87_C      E    87_C     0.191     0    0.029   0.252     0.863  100.000   98.942
LGA    V    88_C      V    88_C     0.263     0    0.018   0.111     0.395  100.000  100.000
LGA    L    89_C      L    89_C     0.345     0    0.036   0.117     0.463  100.000  100.000
LGA    E    90_C      E    90_C     0.199     0    0.077   0.936     4.187  100.000   82.698
LGA    E    91_C      E    91_C     0.274     0    0.024   0.127     0.729  100.000   98.942
LGA    L    92_C      L    92_C     0.236     0    0.019   0.084     0.370  100.000  100.000
LGA    E    93_C      E    93_C     0.190     0    0.078   0.441     1.431  100.000   96.878
LGA    E    94_C      E    94_C     0.217     0    0.013   0.111     0.499  100.000  100.000
LGA    V    95_C      V    95_C     0.196     0    0.019   0.082     0.336  100.000  100.000
LGA    L    96_C      L    96_C     0.311     0    0.016   0.078     0.345  100.000  100.000
LGA    E    97_C      E    97_C     0.297     0    0.099   0.152     0.740  100.000   96.825
LGA    E    98_C      E    98_C     0.422     0    0.012   0.062     0.598  100.000   97.884
LGA    K    99_C      K    99_C     0.378     0    0.037   0.975     4.745  100.000   81.746
LGA    K   100_C      K   100_C     0.433     0    0.053   0.125     1.920   97.619   89.788
LGA    E   101_C      E   101_C     0.447     0    0.055   0.890     2.972   97.619   80.741
LGA    E   102_C      E   102_C     0.346     0    0.044   0.753     2.315   97.619   85.079
LGA    V   103_C      V   103_C     0.338     0    0.013   0.144     0.788  100.000   98.639
LGA    E   104_C      E   104_C     0.409     0    0.088   0.250     0.748   97.619   96.825
LGA    E   105_C      E   105_C     0.524     0    0.035   0.252     1.679   92.857   87.566
LGA    R   106_C      R   106_C     0.607     0    0.035   0.458     1.401   90.476   90.563
LGA    I   107_C      I   107_C     0.390     0    0.107   0.158     0.508   97.619   98.810
LGA    E   108_C      E   108_C     0.294     0    0.464   0.468     2.285   88.810   86.825
LGA    G   109_C      G   109_C     0.474     0    0.577   0.577     2.059   88.810   88.810

# RMSD_GDC results:       CA      MC common percent     ALL common percent   GDC_mc  GDC_all
NUMBER_OF_ATOMS_AA:      108     432    432  100.00     908    908  100.00               108
SUMMARY(RMSD_GDC):     0.536          0.549                  1.299           95.853   89.937

#CA            N1   N2   DIST      N    RMSD    GDT_TS    LGA_S3     LGA_Q 
SUMMARY(GDT)  115  108    4.0    108    0.54    99.074    99.639    16.976

LGA_LOCAL      RMSD:   0.536  Number of atoms:  108  under DIST:   4.00
LGA_ASGN_ATOMS RMSD:   0.536  Number of assigned atoms:  108 
Std_ASGN_ATOMS RMSD:   0.536  Standard rmsd on all 108 assigned CA atoms 

Unitary ROTATION matrix and the SHIFT vector superimpose molecules  (1=>2)
  X_new =   0.091869 * X  +  -0.168727 * Y  +  -0.981372 * Z  +  11.237883
  Y_new =  -0.616694 * X  +   0.764150 * Y  +  -0.189110 * Z  +  -0.069543
  Z_new =   0.781824 * X  +   0.622580 * Y  +  -0.033851 * Z  +  -9.807141 

Euler angles from the ROTATION matrix. Conventions XYZ and ZXZ:
           Phi     Theta       Psi   [DEG:       Phi     Theta       Psi ]
XYZ: -1.422914 -0.897585  1.625116   [DEG:  -81.5270  -51.4279   93.1123 ]
ZXZ: -1.380430  1.604654  0.898305   [DEG:  -79.0928   91.9399   51.4691 ]
 
# END of job
