
#######################################################
#                                                     #
#                        LGA                          #
#                  ---------------                    #
#                                                     #
#               Local-Global Alignment                #
#        A Method for Finding 3-D Similarities        #
#               in Protein Structures                 #
#                                                     #
#                  ------------ 10/2009               #
#                                                     #
#      Adam Zemla (adamz@llnl.gov)                    #
#      Lawrence Livermore National Laboratory, CA     #
#                                                     #
#######################################################

!!!   License for LGA program has expired  !!!
#   For updated version of the LGA program   #
# please contact Adam Zemla:  adamz@llnl.gov #

# Molecule1: number of CA atoms  115 (  972),  selected  108 , name one
# Molecule2: number of CA atoms  108 (  908),  selected  108 , name two
# PARAMETERS: input.pdb  -ie  -3  -d:4  -sda  -swap  -ch1:C  -ch2:C  
# FIXED Atom-Atom correspondence
# GDT and LCS analysis 

LCS - RMSD CUTOFF   5.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:   108       2_C - 109_C       0.57     0.57
  LCS_AVERAGE:    100.00

LCS - RMSD CUTOFF   2.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:   108       2_C - 109_C       0.57     0.57
  LCS_AVERAGE:    100.00

LCS - RMSD CUTOFF   1.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:   108       2_C - 109_C       0.57     0.57
  LCS_AVERAGE:    100.00

LCS_GDT    MOLECULE-1    MOLECULE-2     LCS_DETAILS     GDT_DETAILS                                                    TOTAL NUMBER OF RESIDUE PAIRS:  108
LCS_GDT     RESIDUE       RESIDUE       SEGMENT_SIZE    GLOBAL DISTANCE TEST COLUMNS: number of residues under the threshold assigned to each residue pair
LCS_GDT   NAME NUMBER   NAME NUMBER    1.0  2.0  5.0    0.5  1.0  1.5  2.0  2.5  3.0  3.5  4.0  4.5  5.0  5.5  6.0  6.5  7.0  7.5  8.0  8.5  9.0  9.5 10.0
LCS_GDT     L     2_C     L     2_C    108  108  108     71  103  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     P     3_C     P     3_C    108  108  108     71  103  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     D     4_C     D     4_C    108  108  108     71  103  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E     5_C     E     5_C    108  108  108     71  103  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E     6_C     E     6_C    108  108  108     71  103  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K     7_C     K     7_C    108  108  108     71  103  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L     8_C     L     8_C    108  108  108     71  103  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K     9_C     K     9_C    108  108  108     71  103  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    10_C     L    10_C    108  108  108     71  103  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    11_C     L    11_C    108  108  108     71  103  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     D    12_C     D    12_C    108  108  108     71  103  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     T    13_C     T    13_C    108  108  108     71  103  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    14_C     L    14_C    108  108  108     71  103  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    15_C     L    15_C    108  108  108     71  103  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     T    16_C     T    16_C    108  108  108     71  103  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     M    17_C     M    17_C    108  108  108     71  103  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     V    18_C     V    18_C    108  108  108     71  103  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    19_C     E    19_C    108  108  108     71  103  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     W    20_C     W    20_C    108  108  108     71  103  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     V    21_C     V    21_C    108  108  108     71  103  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K    22_C     K    22_C    108  108  108     71  103  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    23_C     E    23_C    108  108  108     71  103  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    24_C     L    24_C    108  108  108     71  103  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    25_C     L    25_C    108  108  108     71  103  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    26_C     E    26_C    108  108  108     53  103  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    27_C     E    27_C    108  108  108     53  103  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     S    28_C     S    28_C    108  108  108     69  103  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     V    29_C     V    29_C    108  108  108     53  103  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    30_C     E    30_C    108  108  108     53  103  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K    31_C     K    31_C    108  108  108     61  103  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     N    32_C     N    32_C    108  108  108     71  103  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     S    33_C     S    33_C    108  108  108     12   63  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     R    34_C     R    34_C    108  108  108     17  103  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     M    35_C     M    35_C    108  108  108     12   82  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     R    36_C     R    36_C    108  108  108     12  103  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     H    37_C     H    37_C    108  108  108     34  103  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     I    38_C     I    38_C    108  108  108     59  103  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     R    39_C     R    39_C    108  108  108     15  103  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A    40_C     A    40_C    108  108  108     15  103  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     V    41_C     V    41_C    108  108  108     71  103  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     M    42_C     M    42_C    108  108  108     71  103  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     W    43_C     W    43_C    108  108  108     71  103  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A    44_C     A    44_C    108  108  108     71  103  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    45_C     E    45_C    108  108  108     71  103  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     Y    46_C     Y    46_C    108  108  108     71  103  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     M    47_C     M    47_C    108  108  108     60  103  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    48_C     L    48_C    108  108  108     40  103  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    49_C     E    49_C    108  108  108     30  103  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     I    50_C     I    50_C    108  108  108     25  103  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A    51_C     A    51_C    108  108  108     47  103  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     R    52_C     R    52_C    108  108  108     30  103  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     S    53_C     S    53_C    108  108  108     66  103  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    54_C     L    54_C    108  108  108     70  103  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    55_C     E    55_C    108  108  108     71  103  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     D    56_C     D    56_C    108  108  108     71  103  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    57_C     E    57_C    108  108  108     71  103  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K    58_C     K    58_C    108  108  108     70  103  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     I    59_C     I    59_C    108  108  108     71  103  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    60_C     L    60_C    108  108  108     71  103  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    61_C     E    61_C    108  108  108     71  103  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     I    62_C     I    62_C    108  108  108     71  103  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A    63_C     A    63_C    108  108  108     71  103  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    64_C     E    64_C    108  108  108     71  103  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K    65_C     K    65_C    108  108  108     71  103  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    66_C     L    66_C    108  108  108     71  103  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    67_C     E    67_C    108  108  108     71  103  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K    68_C     K    68_C    108  108  108     71  103  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A    69_C     A    69_C    108  108  108     66  103  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    70_C     L    70_C    108  108  108     67  103  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     P    71_C     P    71_C    108  108  108      9  103  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    72_C     E    72_C    108  108  108     28  103  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K    73_C     K    73_C    108  108  108     52  103  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     S    74_C     S    74_C    108  108  108      3   93  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K    75_C     K    75_C    108  108  108     34  103  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     M    76_C     M    76_C    108  108  108      9  103  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     F    77_C     F    77_C    108  108  108     28  103  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     T    78_C     T    78_C    108  108  108     70  103  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K    79_C     K    79_C    108  108  108     67  103  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    80_C     E    80_C    108  108  108     43  103  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    81_C     E    81_C    108  108  108     43  103  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     Y    82_C     Y    82_C    108  108  108     71  103  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    83_C     E    83_C    108  108  108     71  103  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K    84_C     K    84_C    108  108  108     71  103  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    85_C     L    85_C    108  108  108     71  103  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     M    86_C     M    86_C    108  108  108     71  103  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    87_C     E    87_C    108  108  108     71  103  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     V    88_C     V    88_C    108  108  108     71  103  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    89_C     L    89_C    108  108  108     71  103  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    90_C     E    90_C    108  108  108     71  103  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    91_C     E    91_C    108  108  108     71  103  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    92_C     L    92_C    108  108  108     71  103  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    93_C     E    93_C    108  108  108     71  103  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    94_C     E    94_C    108  108  108     71  103  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     V    95_C     V    95_C    108  108  108     71  103  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    96_C     L    96_C    108  108  108     71  103  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    97_C     E    97_C    108  108  108     71  103  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    98_C     E    98_C    108  108  108     53  103  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K    99_C     K    99_C    108  108  108     71  103  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K   100_C     K   100_C    108  108  108     71  103  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E   101_C     E   101_C    108  108  108     71  103  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E   102_C     E   102_C    108  108  108     71  103  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     V   103_C     V   103_C    108  108  108     71  103  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E   104_C     E   104_C    108  108  108     71  103  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E   105_C     E   105_C    108  108  108     71  103  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     R   106_C     R   106_C    108  108  108     71  103  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     I   107_C     I   107_C    108  108  108     71  103  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E   108_C     E   108_C    108  108  108     71  103  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     G   109_C     G   109_C    108  108  108     71  103  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_AVERAGE  LCS_A: 100.00  ( 100.00  100.00  100.00 )

GLOBAL_DISTANCE_TEST (summary information about detected largest sets of residues (represented by selected AToms) that can fit under specified thresholds)
GDT DIST_CUTOFF  0.50   1.00   1.50   2.00   2.50   3.00   3.50   4.00   4.50   5.00   5.50   6.00   6.50   7.00   7.50   8.00   8.50   9.00   9.50  10.00
GDT NUMBER_AT     71    103    107    108    108    108    108    108    108    108    108    108    108    108    108    108    108    108    108    108 
GDT PERCENT_AT  65.74  95.37  99.07 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00
GDT RMS_LOCAL    0.33   0.50   0.56   0.57   0.57   0.57   0.57   0.57   0.57   0.57   0.57   0.57   0.57   0.57   0.57   0.57   0.57   0.57   0.57   0.57
GDT RMS_ALL_AT   0.62   0.58   0.58   0.57   0.57   0.57   0.57   0.57   0.57   0.57   0.57   0.57   0.57   0.57   0.57   0.57   0.57   0.57   0.57   0.57

# Checking swapping
#   possible swapping detected:  E     5_C      E     5_C
#   possible swapping detected:  E     6_C      E     6_C
#   possible swapping detected:  E    19_C      E    19_C
#   possible swapping detected:  E    23_C      E    23_C
#   possible swapping detected:  E    26_C      E    26_C
#   possible swapping detected:  E    27_C      E    27_C
#   possible swapping detected:  E    45_C      E    45_C
#   possible swapping detected:  Y    46_C      Y    46_C
#   possible swapping detected:  D    56_C      D    56_C
#   possible swapping detected:  E    57_C      E    57_C
#   possible swapping detected:  E    61_C      E    61_C
#   possible swapping detected:  E    72_C      E    72_C
#   possible swapping detected:  E    81_C      E    81_C
#   possible swapping detected:  Y    82_C      Y    82_C
#   possible swapping detected:  E    83_C      E    83_C
#   possible swapping detected:  E    87_C      E    87_C
#   possible swapping detected:  E    90_C      E    90_C
#   possible swapping detected:  E    91_C      E    91_C
#   possible swapping detected:  E    93_C      E    93_C
#   possible swapping detected:  E    94_C      E    94_C
#   possible swapping detected:  E    97_C      E    97_C
#   possible swapping detected:  E    98_C      E    98_C
#   possible swapping detected:  E   104_C      E   104_C
#   possible swapping detected:  E   105_C      E   105_C
#   possible swapping detected:  E   108_C      E   108_C

#      Molecule1      Molecule2  DISTANCE    Mis    MC     All    Dist_max   GDC_mc  GDC_all
LGA    L     2_C      L     2_C     0.110     0    0.075   0.347     1.499  100.000   95.357
LGA    P     3_C      P     3_C     0.130     0    0.020   0.030     0.294  100.000  100.000
LGA    D     4_C      D     4_C     0.144     0    0.083   0.135     0.354  100.000  100.000
LGA    E     5_C      E     5_C     0.302     0    0.092   0.977     3.909  100.000   82.328
LGA    E     6_C      E     6_C     0.405     0    0.064   0.818     4.298  100.000   84.127
LGA    K     7_C      K     7_C     0.388     0    0.043   0.728     3.139  100.000   83.545
LGA    L     8_C      L     8_C     0.324     0    0.058   0.083     0.476  100.000  100.000
LGA    K     9_C      K     9_C     0.423     0    0.040   0.755     2.449   97.619   90.053
LGA    L    10_C      L    10_C     0.428     0    0.014   1.274     2.517  100.000   87.917
LGA    L    11_C      L    11_C     0.387     0    0.079   0.096     0.570   97.619   98.810
LGA    D    12_C      D    12_C     0.412     0    0.036   0.130     0.665  100.000   96.429
LGA    T    13_C      T    13_C     0.470     0    0.023   0.057     0.570  100.000   98.639
LGA    L    14_C      L    14_C     0.507     0    0.022   0.132     0.894   95.238   94.048
LGA    L    15_C      L    15_C     0.362     0    0.071   0.117     0.530   97.619   97.619
LGA    T    16_C      T    16_C     0.517     0    0.020   1.015     2.018   95.238   87.007
LGA    M    17_C      M    17_C     0.475     0    0.043   0.717     2.195  100.000   92.024
LGA    V    18_C      V    18_C     0.429     0    0.060   0.070     0.534  100.000   98.639
LGA    E    19_C      E    19_C     0.439     0    0.056   0.789     2.956   97.619   86.032
LGA    W    20_C      W    20_C     0.613     0    0.025   1.603     6.244   90.476   55.306
LGA    V    21_C      V    21_C     0.531     0    0.069   0.077     0.584   95.238   93.197
LGA    K    22_C      K    22_C     0.439     0    0.055   0.363     1.743  100.000   94.921
LGA    E    23_C      E    23_C     0.461     0    0.052   0.794     2.919   95.238   86.032
LGA    L    24_C      L    24_C     0.526     0    0.020   0.129     0.526   92.857   95.238
LGA    L    25_C      L    25_C     0.448     0    0.082   0.203     0.575   97.619   96.429
LGA    E    26_C      E    26_C     0.773     0    0.057   0.274     0.944   90.476   92.593
LGA    E    27_C      E    27_C     0.789     0    0.070   0.455     1.877   92.857   89.577
LGA    S    28_C      S    28_C     0.537     0    0.030   0.059     0.654   92.857   93.651
LGA    V    29_C      V    29_C     0.694     0    0.065   0.147     1.056   90.476   89.184
LGA    E    30_C      E    30_C     0.764     0    0.019   1.022     3.119   90.476   76.561
LGA    K    31_C      K    31_C     0.608     0    0.101   0.647     2.919   95.238   82.222
LGA    N    32_C      N    32_C     0.139     0    0.044   0.095     1.078   95.238   92.917
LGA    S    33_C      S    33_C     1.459     0    0.175   0.177     2.413   83.690   77.381
LGA    R    34_C      R    34_C     1.187     0    0.016   0.632     1.481   81.429   83.074
LGA    M    35_C      M    35_C     1.473     0    0.031   0.771     5.617   81.429   62.560
LGA    R    36_C      R    36_C     1.219     0    0.046   0.792     3.842   83.690   70.043
LGA    H    37_C      H    37_C     0.694     0    0.037   0.695     3.204   92.857   78.810
LGA    I    38_C      I    38_C     0.568     0    0.014   0.102     0.919   92.857   91.667
LGA    R    39_C      R    39_C     0.884     0    0.032   1.058     3.491   90.476   78.095
LGA    A    40_C      A    40_C     0.710     0    0.066   0.074     0.710   90.476   90.476
LGA    V    41_C      V    41_C     0.415     0    0.052   0.088     0.503   97.619   98.639
LGA    M    42_C      M    42_C     0.364     0    0.037   0.980     2.774  100.000   90.000
LGA    W    43_C      W    43_C     0.577     0    0.037   0.378     2.410   90.476   84.252
LGA    A    44_C      A    44_C     0.554     0    0.017   0.030     0.580   90.476   92.381
LGA    E    45_C      E    45_C     0.508     0    0.011   0.263     0.956   90.476   93.651
LGA    Y    46_C      Y    46_C     0.440     0    0.012   0.255     0.652   97.619   96.032
LGA    M    47_C      M    47_C     0.783     0    0.015   1.026     1.847   90.476   84.940
LGA    L    48_C      L    48_C     0.982     0    0.039   0.076     1.454   90.476   85.952
LGA    E    49_C      E    49_C     0.860     0    0.043   0.925     1.924   90.476   84.550
LGA    I    50_C      I    50_C     0.735     0    0.043   0.101     0.938   90.476   90.476
LGA    A    51_C      A    51_C     0.747     0    0.080   0.099     0.914   90.476   90.476
LGA    R    52_C      R    52_C     0.727     0    0.082   0.469     2.599   90.476   81.039
LGA    S    53_C      S    53_C     0.507     0    0.058   0.066     0.641   92.857   95.238
LGA    L    54_C      L    54_C     0.494     0    0.036   0.175     0.863   95.238   94.048
LGA    E    55_C      E    55_C     0.455     0    0.023   0.678     2.454  100.000   84.339
LGA    D    56_C      D    56_C     0.467     0    0.051   0.179     0.754   97.619   95.238
LGA    E    57_C      E    57_C     0.355     0    0.049   0.883     3.812  100.000   83.968
LGA    K    58_C      K    58_C     0.578     0    0.062   0.883     2.473   97.619   83.122
LGA    I    59_C      I    59_C     0.374     0    0.028   0.631     1.912  100.000   93.036
LGA    L    60_C      L    60_C     0.325     0    0.024   0.062     0.429  100.000  100.000
LGA    E    61_C      E    61_C     0.383     0    0.014   0.104     0.617  100.000   98.942
LGA    I    62_C      I    62_C     0.066     0    0.036   0.226     0.693  100.000   98.810
LGA    A    63_C      A    63_C     0.217     0    0.011   0.023     0.315  100.000  100.000
LGA    E    64_C      E    64_C     0.287     0    0.043   0.633     1.587  100.000   90.794
LGA    K    65_C      K    65_C     0.138     0    0.014   0.081     0.539  100.000   98.942
LGA    L    66_C      L    66_C     0.346     0    0.053   0.149     1.324  100.000   91.845
LGA    E    67_C      E    67_C     0.417     0    0.019   0.445     1.046  100.000   95.820
LGA    K    68_C      K    68_C     0.368     0    0.108   1.371     7.487   97.619   72.169
LGA    A    69_C      A    69_C     0.514     0    0.062   0.076     0.545   92.857   92.381
LGA    L    70_C      L    70_C     0.480     0    0.046   0.058     0.731   92.857   95.238
LGA    P    71_C      P    71_C     0.793     0    0.077   0.182     0.934   90.476   90.476
LGA    E    72_C      E    72_C     0.717     0    0.136   0.911     4.783   90.476   71.111
LGA    K    73_C      K    73_C     0.622     0    0.219   0.284     1.671   86.071   87.566
LGA    S    74_C      S    74_C     1.575     0    0.035   0.640     4.427   77.143   68.413
LGA    K    75_C      K    75_C     0.830     0    0.117   0.914     3.730   88.214   74.074
LGA    M    76_C      M    76_C     0.807     0    0.074   0.769     2.852   88.214   85.179
LGA    F    77_C      F    77_C     0.766     0    0.044   0.689     2.933   90.476   80.433
LGA    T    78_C      T    78_C     0.405     0    0.062   0.093     0.644   97.619   97.279
LGA    K    79_C      K    79_C     0.484     0    0.052   0.607     2.217   97.619   91.852
LGA    E    80_C      E    80_C     0.831     0    0.065   0.825     3.389   90.476   76.455
LGA    E    81_C      E    81_C     0.745     0    0.046   0.635     2.018   90.476   84.656
LGA    Y    82_C      Y    82_C     0.286     0    0.061   0.165     0.582  100.000   99.206
LGA    E    83_C      E    83_C     0.252     0    0.049   0.271     0.941  100.000   98.942
LGA    K    84_C      K    84_C     0.502     0    0.019   1.033     6.004   97.619   75.767
LGA    L    85_C      L    85_C     0.508     0    0.030   1.313     3.139   92.857   81.190
LGA    M    86_C      M    86_C     0.534     0    0.065   0.800     1.651   92.857   86.131
LGA    E    87_C      E    87_C     0.294     0    0.027   0.191     0.617  100.000   98.942
LGA    V    88_C      V    88_C     0.342     0    0.020   0.116     0.449  100.000  100.000
LGA    L    89_C      L    89_C     0.432     0    0.015   0.131     0.583  100.000   98.810
LGA    E    90_C      E    90_C     0.297     0    0.046   0.915     4.171  100.000   81.640
LGA    E    91_C      E    91_C     0.231     0    0.017   0.110     0.628  100.000   98.942
LGA    L    92_C      L    92_C     0.190     0    0.017   0.076     0.458  100.000  100.000
LGA    E    93_C      E    93_C     0.133     0    0.084   0.329     1.248  100.000   95.820
LGA    E    94_C      E    94_C     0.217     0    0.010   0.754     2.977  100.000   88.148
LGA    V    95_C      V    95_C     0.172     0    0.019   0.077     0.235  100.000  100.000
LGA    L    96_C      L    96_C     0.267     0    0.016   0.075     0.275  100.000  100.000
LGA    E    97_C      E    97_C     0.287     0    0.096   0.150     0.698  100.000   97.884
LGA    E    98_C      E    98_C     0.573     0    0.012   0.074     0.873   95.238   92.593
LGA    K    99_C      K    99_C     0.459     0    0.031   0.979     4.421   97.619   81.270
LGA    K   100_C      K   100_C     0.223     0    0.049   0.151     1.952  100.000   91.799
LGA    E   101_C      E   101_C     0.351     0    0.058   0.872     3.007  100.000   82.698
LGA    E   102_C      E   102_C     0.116     0    0.073   0.750     2.685   97.619   81.587
LGA    V   103_C      V   103_C     0.080     0    0.017   0.071     0.392  100.000  100.000
LGA    E   104_C      E   104_C     0.258     0    0.092   0.271     0.860   97.619   96.825
LGA    E   105_C      E   105_C     0.485     0    0.033   0.247     1.737  100.000   90.741
LGA    R   106_C      R   106_C     0.361     0    0.035   1.007     2.343  100.000   89.221
LGA    I   107_C      I   107_C     0.285     0    0.114   0.205     0.672  100.000   98.810
LGA    E   108_C      E   108_C     0.520     0    0.472   0.492     2.687   82.143   84.921
LGA    G   109_C      G   109_C     0.278     0    0.582   0.582     1.667   88.452   88.452

# RMSD_GDC results:       CA      MC common percent     ALL common percent   GDC_mc  GDC_all
NUMBER_OF_ATOMS_AA:      108     432    432  100.00     908    908  100.00               108
SUMMARY(RMSD_GDC):     0.574          0.589                  1.293           95.392   89.506

#CA            N1   N2   DIST      N    RMSD    GDT_TS    LGA_S3     LGA_Q 
SUMMARY(GDT)  115  108    4.0    108    0.57    98.843    99.565    16.014

LGA_LOCAL      RMSD:   0.574  Number of atoms:  108  under DIST:   4.00
LGA_ASGN_ATOMS RMSD:   0.574  Number of assigned atoms:  108 
Std_ASGN_ATOMS RMSD:   0.574  Standard rmsd on all 108 assigned CA atoms 

Unitary ROTATION matrix and the SHIFT vector superimpose molecules  (1=>2)
  X_new =   0.209752 * X  +   0.000574 * Y  +   0.977755 * Z  +  12.399467
  Y_new =   0.336470 * X  +   0.938881 * Y  +  -0.072732 * Z  +  -0.359001
  Z_new =  -0.918037 * X  +   0.344240 * Y  +   0.196739 * Z  + -10.597799 

Euler angles from the ROTATION matrix. Conventions XYZ and ZXZ:
           Phi     Theta       Psi   [DEG:       Phi     Theta       Psi ]
XYZ:  1.013356  1.163102  1.051585   [DEG:   58.0610   66.6408   60.2514 ]
ZXZ:  1.496546  1.372766 -1.212048   [DEG:   85.7458   78.6537  -69.4453 ]
 
# END of job
