
#######################################################
#                                                     #
#                        LGA                          #
#                  ---------------                    #
#                                                     #
#               Local-Global Alignment                #
#        A Method for Finding 3-D Similarities        #
#               in Protein Structures                 #
#                                                     #
#                  ------------ 10/2009               #
#                                                     #
#      Adam Zemla (adamz@llnl.gov)                    #
#      Lawrence Livermore National Laboratory, CA     #
#                                                     #
#######################################################

!!!   License for LGA program has expired  !!!
#   For updated version of the LGA program   #
# please contact Adam Zemla:  adamz@llnl.gov #

# Molecule1: number of CA atoms  115 (  972),  selected  108 , name one
# Molecule2: number of CA atoms  108 (  908),  selected  108 , name two
# PARAMETERS: input.pdb  -ie  -3  -d:4  -sda  -swap  -ch1:C  -ch2:C  
# FIXED Atom-Atom correspondence
# GDT and LCS analysis 

LCS - RMSD CUTOFF   5.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:   108       2_C - 109_C       0.57     0.57
  LCS_AVERAGE:    100.00

LCS - RMSD CUTOFF   2.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:   108       2_C - 109_C       0.57     0.57
  LCS_AVERAGE:    100.00

LCS - RMSD CUTOFF   1.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:   108       2_C - 109_C       0.57     0.57
  LCS_AVERAGE:    100.00

LCS_GDT    MOLECULE-1    MOLECULE-2     LCS_DETAILS     GDT_DETAILS                                                    TOTAL NUMBER OF RESIDUE PAIRS:  108
LCS_GDT     RESIDUE       RESIDUE       SEGMENT_SIZE    GLOBAL DISTANCE TEST COLUMNS: number of residues under the threshold assigned to each residue pair
LCS_GDT   NAME NUMBER   NAME NUMBER    1.0  2.0  5.0    0.5  1.0  1.5  2.0  2.5  3.0  3.5  4.0  4.5  5.0  5.5  6.0  6.5  7.0  7.5  8.0  8.5  9.0  9.5 10.0
LCS_GDT     L     2_C     L     2_C    108  108  108     71  103  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     P     3_C     P     3_C    108  108  108     71  103  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     D     4_C     D     4_C    108  108  108     71  103  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E     5_C     E     5_C    108  108  108     71  103  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E     6_C     E     6_C    108  108  108     71  103  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K     7_C     K     7_C    108  108  108     71  103  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L     8_C     L     8_C    108  108  108     71  103  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K     9_C     K     9_C    108  108  108     71  103  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    10_C     L    10_C    108  108  108     71  103  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    11_C     L    11_C    108  108  108     71  103  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     D    12_C     D    12_C    108  108  108     71  103  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     T    13_C     T    13_C    108  108  108     71  103  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    14_C     L    14_C    108  108  108     71  103  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    15_C     L    15_C    108  108  108     71  103  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     T    16_C     T    16_C    108  108  108     71  103  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     M    17_C     M    17_C    108  108  108     71  103  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     V    18_C     V    18_C    108  108  108     71  103  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    19_C     E    19_C    108  108  108     71  103  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     W    20_C     W    20_C    108  108  108     71  103  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     V    21_C     V    21_C    108  108  108     71  103  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K    22_C     K    22_C    108  108  108     71  103  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    23_C     E    23_C    108  108  108     71  103  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    24_C     L    24_C    108  108  108     71  103  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    25_C     L    25_C    108  108  108     71  103  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    26_C     E    26_C    108  108  108     63  103  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    27_C     E    27_C    108  108  108     60  103  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     S    28_C     S    28_C    108  108  108     71  103  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     V    29_C     V    29_C    108  108  108     66  103  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    30_C     E    30_C    108  108  108     67  103  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K    31_C     K    31_C    108  108  108     71  103  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     N    32_C     N    32_C    108  108  108     71  103  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     S    33_C     S    33_C    108  108  108     14   90  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     R    34_C     R    34_C    108  108  108     31   98  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     M    35_C     M    35_C    108  108  108     14   73  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     R    36_C     R    36_C    108  108  108     22   98  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     H    37_C     H    37_C    108  108  108     59  103  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     I    38_C     I    38_C    108  108  108     38  103  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     R    39_C     R    39_C    108  108  108     29  103  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A    40_C     A    40_C    108  108  108     32  103  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     V    41_C     V    41_C    108  108  108     71  103  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     M    42_C     M    42_C    108  108  108     71  103  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     W    43_C     W    43_C    108  108  108     40  103  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A    44_C     A    44_C    108  108  108     67  103  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    45_C     E    45_C    108  108  108     71  103  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     Y    46_C     Y    46_C    108  108  108     71  103  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     M    47_C     M    47_C    108  108  108     35  103  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    48_C     L    48_C    108  108  108     40  103  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    49_C     E    49_C    108  108  108     26  103  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     I    50_C     I    50_C    108  108  108     40  103  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A    51_C     A    51_C    108  108  108     40  103  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     R    52_C     R    52_C    108  108  108     40  103  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     S    53_C     S    53_C    108  108  108     71  103  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    54_C     L    54_C    108  108  108     71  103  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    55_C     E    55_C    108  108  108     71  103  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     D    56_C     D    56_C    108  108  108     71  103  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    57_C     E    57_C    108  108  108     71  103  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K    58_C     K    58_C    108  108  108     71  103  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     I    59_C     I    59_C    108  108  108     71  103  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    60_C     L    60_C    108  108  108     71  103  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    61_C     E    61_C    108  108  108     71  103  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     I    62_C     I    62_C    108  108  108     71  103  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A    63_C     A    63_C    108  108  108     71  103  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    64_C     E    64_C    108  108  108     71  103  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K    65_C     K    65_C    108  108  108     71  103  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    66_C     L    66_C    108  108  108     71  103  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    67_C     E    67_C    108  108  108     71  103  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K    68_C     K    68_C    108  108  108     71  103  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A    69_C     A    69_C    108  108  108     60  103  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    70_C     L    70_C    108  108  108     59  103  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     P    71_C     P    71_C    108  108  108     20  103  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    72_C     E    72_C    108  108  108     62  103  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K    73_C     K    73_C    108  108  108      5  103  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     S    74_C     S    74_C    108  108  108     29   98  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K    75_C     K    75_C    108  108  108      3  103  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     M    76_C     M    76_C    108  108  108     20  103  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     F    77_C     F    77_C    108  108  108     36  103  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     T    78_C     T    78_C    108  108  108     69  103  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K    79_C     K    79_C    108  108  108     60  103  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    80_C     E    80_C    108  108  108     31  103  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    81_C     E    81_C    108  108  108     38  103  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     Y    82_C     Y    82_C    108  108  108     71  103  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    83_C     E    83_C    108  108  108     71  103  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K    84_C     K    84_C    108  108  108     71  103  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    85_C     L    85_C    108  108  108     71  103  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     M    86_C     M    86_C    108  108  108     71  103  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    87_C     E    87_C    108  108  108     71  103  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     V    88_C     V    88_C    108  108  108     71  103  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    89_C     L    89_C    108  108  108     71  103  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    90_C     E    90_C    108  108  108     71  103  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    91_C     E    91_C    108  108  108     71  103  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    92_C     L    92_C    108  108  108     71  103  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    93_C     E    93_C    108  108  108     71  103  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    94_C     E    94_C    108  108  108     71  103  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     V    95_C     V    95_C    108  108  108     71  103  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    96_C     L    96_C    108  108  108     71  103  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    97_C     E    97_C    108  108  108     71  103  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    98_C     E    98_C    108  108  108     71  103  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K    99_C     K    99_C    108  108  108     71  103  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K   100_C     K   100_C    108  108  108     71  103  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E   101_C     E   101_C    108  108  108     71  103  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E   102_C     E   102_C    108  108  108     71  103  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     V   103_C     V   103_C    108  108  108     71  103  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E   104_C     E   104_C    108  108  108     71  103  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E   105_C     E   105_C    108  108  108     62  103  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     R   106_C     R   106_C    108  108  108     62  103  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     I   107_C     I   107_C    108  108  108     71  103  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E   108_C     E   108_C    108  108  108     62  103  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     G   109_C     G   109_C    108  108  108     71  103  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_AVERAGE  LCS_A: 100.00  ( 100.00  100.00  100.00 )

GLOBAL_DISTANCE_TEST (summary information about detected largest sets of residues (represented by selected AToms) that can fit under specified thresholds)
GDT DIST_CUTOFF  0.50   1.00   1.50   2.00   2.50   3.00   3.50   4.00   4.50   5.00   5.50   6.00   6.50   7.00   7.50   8.00   8.50   9.00   9.50  10.00
GDT NUMBER_AT     71    103    107    108    108    108    108    108    108    108    108    108    108    108    108    108    108    108    108    108 
GDT PERCENT_AT  65.74  95.37  99.07 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00
GDT RMS_LOCAL    0.34   0.49   0.55   0.57   0.57   0.57   0.57   0.57   0.57   0.57   0.57   0.57   0.57   0.57   0.57   0.57   0.57   0.57   0.57   0.57
GDT RMS_ALL_AT   0.60   0.57   0.57   0.57   0.57   0.57   0.57   0.57   0.57   0.57   0.57   0.57   0.57   0.57   0.57   0.57   0.57   0.57   0.57   0.57

# Checking swapping
#   possible swapping detected:  E     5_C      E     5_C
#   possible swapping detected:  E     6_C      E     6_C
#   possible swapping detected:  E    19_C      E    19_C
#   possible swapping detected:  E    23_C      E    23_C
#   possible swapping detected:  E    26_C      E    26_C
#   possible swapping detected:  E    27_C      E    27_C
#   possible swapping detected:  E    30_C      E    30_C
#   possible swapping detected:  E    45_C      E    45_C
#   possible swapping detected:  Y    46_C      Y    46_C
#   possible swapping detected:  E    49_C      E    49_C
#   possible swapping detected:  D    56_C      D    56_C
#   possible swapping detected:  E    72_C      E    72_C
#   possible swapping detected:  E    81_C      E    81_C
#   possible swapping detected:  Y    82_C      Y    82_C
#   possible swapping detected:  E    83_C      E    83_C
#   possible swapping detected:  E    87_C      E    87_C
#   possible swapping detected:  E    90_C      E    90_C
#   possible swapping detected:  E    91_C      E    91_C
#   possible swapping detected:  E    93_C      E    93_C
#   possible swapping detected:  E    94_C      E    94_C
#   possible swapping detected:  E    97_C      E    97_C
#   possible swapping detected:  E    98_C      E    98_C
#   possible swapping detected:  E   102_C      E   102_C
#   possible swapping detected:  E   104_C      E   104_C
#   possible swapping detected:  E   105_C      E   105_C
#   possible swapping detected:  E   108_C      E   108_C

#      Molecule1      Molecule2  DISTANCE    Mis    MC     All    Dist_max   GDC_mc  GDC_all
LGA    L     2_C      L     2_C     0.384     0    0.071   0.325     1.617  100.000   93.095
LGA    P     3_C      P     3_C     0.574     0    0.028   0.036     0.765   97.619   94.558
LGA    D     4_C      D     4_C     0.345     0    0.076   0.119     0.469  100.000  100.000
LGA    E     5_C      E     5_C     0.419     0    0.089   0.981     4.184   97.619   79.524
LGA    E     6_C      E     6_C     0.264     0    0.069   0.820     3.907  100.000   84.815
LGA    K     7_C      K     7_C     0.382     0    0.046   0.738     3.384  100.000   83.810
LGA    L     8_C      L     8_C     0.337     0    0.058   0.060     0.418  100.000  100.000
LGA    K     9_C      K     9_C     0.461     0    0.041   0.739     2.201  100.000   90.952
LGA    L    10_C      L    10_C     0.466     0    0.015   1.283     2.904  100.000   87.917
LGA    L    11_C      L    11_C     0.352     0    0.076   0.097     0.430  100.000  100.000
LGA    D    12_C      D    12_C     0.386     0    0.036   0.117     0.677  100.000   96.429
LGA    T    13_C      T    13_C     0.328     0    0.026   0.049     0.375  100.000  100.000
LGA    L    14_C      L    14_C     0.472     0    0.022   0.139     0.792  100.000   96.429
LGA    L    15_C      L    15_C     0.376     0    0.066   0.125     0.419  100.000  100.000
LGA    T    16_C      T    16_C     0.390     0    0.017   1.018     2.098  100.000   89.728
LGA    M    17_C      M    17_C     0.435     0    0.039   0.746     2.148  100.000   92.024
LGA    V    18_C      V    18_C     0.475     0    0.051   0.060     0.683  100.000   95.918
LGA    E    19_C      E    19_C     0.499     0    0.042   0.800     2.760   92.857   84.868
LGA    W    20_C      W    20_C     0.552     0    0.013   1.619     5.990   90.476   55.714
LGA    V    21_C      V    21_C     0.481     0    0.070   0.073     0.505  100.000   98.639
LGA    K    22_C      K    22_C     0.511     0    0.053   0.831     2.979   90.476   86.243
LGA    E    23_C      E    23_C     0.587     0    0.053   0.082     0.933   90.476   90.476
LGA    L    24_C      L    24_C     0.496     0    0.019   0.133     0.523   95.238   97.619
LGA    L    25_C      L    25_C     0.484     0    0.072   0.189     0.628   95.238   95.238
LGA    E    26_C      E    26_C     0.847     0    0.074   0.242     1.014   88.214   88.466
LGA    E    27_C      E    27_C     0.796     0    0.066   0.528     2.091   92.857   87.672
LGA    S    28_C      S    28_C     0.440     0    0.035   0.071     0.566   95.238   96.825
LGA    V    29_C      V    29_C     0.777     0    0.074   0.157     1.350   90.476   89.184
LGA    E    30_C      E    30_C     0.801     0    0.031   0.334     2.121   92.857   85.661
LGA    K    31_C      K    31_C     0.380     0    0.088   0.656     3.466   95.238   81.429
LGA    N    32_C      N    32_C     0.360     0    0.058   0.150     1.244   92.976   88.333
LGA    S    33_C      S    33_C     1.392     0    0.172   0.175     2.195   83.690   78.730
LGA    R    34_C      R    34_C     1.328     0    0.016   0.632     1.695   81.429   83.203
LGA    M    35_C      M    35_C     1.615     0    0.025   1.008     7.103   77.143   57.500
LGA    R    36_C      R    36_C     1.181     0    0.055   0.195     2.755   85.952   74.762
LGA    H    37_C      H    37_C     0.644     0    0.031   1.163     5.685   92.857   65.000
LGA    I    38_C      I    38_C     0.736     0    0.011   0.101     1.217   90.476   88.214
LGA    R    39_C      R    39_C     0.943     0    0.028   0.981     2.605   90.476   80.216
LGA    A    40_C      A    40_C     0.641     0    0.067   0.075     0.695   90.476   90.476
LGA    V    41_C      V    41_C     0.365     0    0.048   0.067     0.448  100.000  100.000
LGA    M    42_C      M    42_C     0.387     0    0.035   0.989     3.000  100.000   89.167
LGA    W    43_C      W    43_C     0.578     0    0.032   0.400     2.619   90.476   83.129
LGA    A    44_C      A    44_C     0.518     0    0.021   0.033     0.550   95.238   96.190
LGA    E    45_C      E    45_C     0.432     0    0.011   0.266     0.939  100.000   98.942
LGA    Y    46_C      Y    46_C     0.432     0    0.013   0.210     0.680  100.000   98.413
LGA    M    47_C      M    47_C     0.697     0    0.015   1.030     1.826   90.476   84.940
LGA    L    48_C      L    48_C     0.767     0    0.030   0.053     1.028   90.476   89.345
LGA    E    49_C      E    49_C     0.769     0    0.043   0.869     2.697   90.476   85.820
LGA    I    50_C      I    50_C     0.756     0    0.048   0.090     0.985   90.476   90.476
LGA    A    51_C      A    51_C     0.674     0    0.081   0.100     0.690   90.476   90.476
LGA    R    52_C      R    52_C     0.566     0    0.069   0.450     2.136   92.857   85.801
LGA    S    53_C      S    53_C     0.329     0    0.047   0.050     0.433  100.000  100.000
LGA    L    54_C      L    54_C     0.383     0    0.030   0.155     0.804  100.000   97.619
LGA    E    55_C      E    55_C     0.370     0    0.016   0.669     2.245  100.000   87.037
LGA    D    56_C      D    56_C     0.371     0    0.037   0.153     0.607   97.619   97.619
LGA    E    57_C      E    57_C     0.294     0    0.021   1.067     3.994  100.000   82.011
LGA    K    58_C      K    58_C     0.493     0    0.046   0.886     2.204  100.000   86.032
LGA    I    59_C      I    59_C     0.351     0    0.026   0.628     1.862  100.000   95.417
LGA    L    60_C      L    60_C     0.392     0    0.033   0.059     0.490  100.000  100.000
LGA    E    61_C      E    61_C     0.459     0    0.011   0.844     2.510  100.000   83.333
LGA    I    62_C      I    62_C     0.127     0    0.036   0.225     0.587  100.000   98.810
LGA    A    63_C      A    63_C     0.217     0    0.020   0.033     0.292  100.000  100.000
LGA    E    64_C      E    64_C     0.320     0    0.046   0.634     1.531  100.000   90.794
LGA    K    65_C      K    65_C     0.207     0    0.013   0.078     0.586  100.000   98.942
LGA    L    66_C      L    66_C     0.218     0    0.044   0.169     1.175  100.000   95.298
LGA    E    67_C      E    67_C     0.327     0    0.019   0.386     0.921  100.000   96.825
LGA    K    68_C      K    68_C     0.401     0    0.088   1.390     7.423   97.619   72.169
LGA    A    69_C      A    69_C     0.511     0    0.071   0.085     0.560   92.857   94.286
LGA    L    70_C      L    70_C     0.586     0    0.065   0.079     0.681   90.476   94.048
LGA    P    71_C      P    71_C     0.695     0    0.071   0.144     0.969   90.476   90.476
LGA    E    72_C      E    72_C     0.636     0    0.154   0.892     4.747   90.476   72.487
LGA    K    73_C      K    73_C     0.640     0    0.225   0.291     1.533   86.071   85.503
LGA    S    74_C      S    74_C     1.510     0    0.055   0.638     4.387   79.405   69.921
LGA    K    75_C      K    75_C     0.849     0    0.036   0.845     4.066   90.476   73.492
LGA    M    76_C      M    76_C     0.694     0    0.060   0.681     2.024   88.214   86.131
LGA    F    77_C      F    77_C     0.765     0    0.031   0.594     2.251   90.476   84.113
LGA    T    78_C      T    78_C     0.476     0    0.049   0.083     0.644   92.857   94.558
LGA    K    79_C      K    79_C     0.555     0    0.048   0.618     1.971   92.857   90.635
LGA    E    80_C      E    80_C     0.842     0    0.058   0.816     3.269   90.476   77.302
LGA    E    81_C      E    81_C     0.716     0    0.041   0.631     2.030   90.476   85.608
LGA    Y    82_C      Y    82_C     0.246     0    0.071   0.107     0.577  100.000   99.206
LGA    E    83_C      E    83_C     0.188     0    0.043   0.270     0.980  100.000   98.942
LGA    K    84_C      K    84_C     0.423     0    0.013   1.007     5.647  100.000   78.042
LGA    L    85_C      L    85_C     0.411     0    0.026   1.307     3.060  100.000   85.833
LGA    M    86_C      M    86_C     0.408     0    0.066   0.842     2.365   97.619   92.024
LGA    E    87_C      E    87_C     0.163     0    0.024   0.178     0.600  100.000   98.942
LGA    V    88_C      V    88_C     0.205     0    0.017   0.108     0.301  100.000  100.000
LGA    L    89_C      L    89_C     0.279     0    0.041   0.125     0.481  100.000  100.000
LGA    E    90_C      E    90_C     0.230     0    0.076   0.930     4.309  100.000   82.698
LGA    E    91_C      E    91_C     0.231     0    0.021   0.106     0.604  100.000   98.942
LGA    L    92_C      L    92_C     0.105     0    0.015   0.077     0.353  100.000  100.000
LGA    E    93_C      E    93_C     0.074     0    0.079   0.430     1.333  100.000   96.878
LGA    E    94_C      E    94_C     0.153     0    0.014   0.119     0.533  100.000   98.942
LGA    V    95_C      V    95_C     0.083     0    0.017   0.098     0.310  100.000  100.000
LGA    L    96_C      L    96_C     0.235     0    0.018   0.079     0.253  100.000  100.000
LGA    E    97_C      E    97_C     0.262     0    0.093   0.158     0.714  100.000   97.884
LGA    E    98_C      E    98_C     0.494     0    0.017   0.070     0.778  100.000   94.709
LGA    K    99_C      K    99_C     0.434     0    0.030   0.996     4.763  100.000   80.688
LGA    K   100_C      K   100_C     0.287     0    0.049   0.137     1.772  100.000   91.799
LGA    E   101_C      E   101_C     0.398     0    0.048   0.882     3.072  100.000   81.005
LGA    E   102_C      E   102_C     0.249     0    0.023   0.786     1.954  100.000   90.847
LGA    V   103_C      V   103_C     0.272     0    0.013   0.054     0.556  100.000   98.639
LGA    E   104_C      E   104_C     0.396     0    0.082   0.203     0.858   95.238   95.767
LGA    E   105_C      E   105_C     0.594     0    0.023   0.234     1.773   90.476   86.508
LGA    R   106_C      R   106_C     0.587     0    0.014   0.420     1.067   90.476   93.983
LGA    I   107_C      I   107_C     0.520     0    0.119   0.211     0.688   90.476   92.857
LGA    E   108_C      E   108_C     0.675     0    0.461   0.464     2.893   79.881   82.963
LGA    G   109_C      G   109_C     0.454     0    0.594   0.594     1.335   92.976   92.976

# RMSD_GDC results:       CA      MC common percent     ALL common percent   GDC_mc  GDC_all
NUMBER_OF_ATOMS_AA:      108     432    432  100.00     908    908  100.00               108
SUMMARY(RMSD_GDC):     0.571          0.585                  1.290           95.549   89.944

#CA            N1   N2   DIST      N    RMSD    GDT_TS    LGA_S3     LGA_Q 
SUMMARY(GDT)  115  108    4.0    108    0.57    98.843    99.565    16.092

LGA_LOCAL      RMSD:   0.571  Number of atoms:  108  under DIST:   4.00
LGA_ASGN_ATOMS RMSD:   0.571  Number of assigned atoms:  108 
Std_ASGN_ATOMS RMSD:   0.571  Standard rmsd on all 108 assigned CA atoms 

Unitary ROTATION matrix and the SHIFT vector superimpose molecules  (1=>2)
  X_new =   0.313497 * X  +  -0.854381 * Y  +  -0.414431 * Z  +  15.595610
  Y_new =  -0.948424 * X  +  -0.260110 * Y  +  -0.181201 * Z  +  -0.420212
  Z_new =   0.047017 * X  +   0.449863 * Y  +  -0.891859 * Z  + -12.624308 

Euler angles from the ROTATION matrix. Conventions XYZ and ZXZ:
           Phi     Theta       Psi   [DEG:       Phi     Theta       Psi ]
XYZ: -1.251557 -0.047034  2.674423   [DEG:  -71.7089   -2.6948  153.2332 ]
ZXZ: -1.158614  2.672236  0.104135   [DEG:  -66.3837  153.1078    5.9665 ]
 
# END of job
