
#######################################################
#                                                     #
#                        LGA                          #
#                  ---------------                    #
#                                                     #
#               Local-Global Alignment                #
#        A Method for Finding 3-D Similarities        #
#               in Protein Structures                 #
#                                                     #
#                  ------------ 10/2009               #
#                                                     #
#      Adam Zemla (adamz@llnl.gov)                    #
#      Lawrence Livermore National Laboratory, CA     #
#                                                     #
#######################################################

!!!   License for LGA program has expired  !!!
#   For updated version of the LGA program   #
# please contact Adam Zemla:  adamz@llnl.gov #

# Molecule1: number of CA atoms  115 (  972),  selected  108 , name one
# Molecule2: number of CA atoms  108 (  908),  selected  108 , name two
# PARAMETERS: input.pdb  -ie  -3  -d:4  -sda  -swap  -ch1:C  -ch2:C  
# FIXED Atom-Atom correspondence
# GDT and LCS analysis 

LCS - RMSD CUTOFF   5.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:   108       2_C - 109_C       0.66     0.66
  LCS_AVERAGE:    100.00

LCS - RMSD CUTOFF   2.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:   108       2_C - 109_C       0.66     0.66
  LCS_AVERAGE:    100.00

LCS - RMSD CUTOFF   1.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:   108       2_C - 109_C       0.66     0.66
  LCS_AVERAGE:    100.00

LCS_GDT    MOLECULE-1    MOLECULE-2     LCS_DETAILS     GDT_DETAILS                                                    TOTAL NUMBER OF RESIDUE PAIRS:  108
LCS_GDT     RESIDUE       RESIDUE       SEGMENT_SIZE    GLOBAL DISTANCE TEST COLUMNS: number of residues under the threshold assigned to each residue pair
LCS_GDT   NAME NUMBER   NAME NUMBER    1.0  2.0  5.0    0.5  1.0  1.5  2.0  2.5  3.0  3.5  4.0  4.5  5.0  5.5  6.0  6.5  7.0  7.5  8.0  8.5  9.0  9.5 10.0
LCS_GDT     L     2_C     L     2_C    108  108  108     66   98  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     P     3_C     P     3_C    108  108  108     66   98  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     D     4_C     D     4_C    108  108  108     66   98  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E     5_C     E     5_C    108  108  108     66   98  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E     6_C     E     6_C    108  108  108     66   98  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K     7_C     K     7_C    108  108  108     66   98  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L     8_C     L     8_C    108  108  108     66   98  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K     9_C     K     9_C    108  108  108     66   98  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    10_C     L    10_C    108  108  108     66   98  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    11_C     L    11_C    108  108  108     66   98  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     D    12_C     D    12_C    108  108  108     66   98  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     T    13_C     T    13_C    108  108  108     66   98  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    14_C     L    14_C    108  108  108     66   98  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    15_C     L    15_C    108  108  108     66   98  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     T    16_C     T    16_C    108  108  108     66   98  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     M    17_C     M    17_C    108  108  108     66   98  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     V    18_C     V    18_C    108  108  108     66   98  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    19_C     E    19_C    108  108  108     66   98  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     W    20_C     W    20_C    108  108  108     66   98  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     V    21_C     V    21_C    108  108  108     66   98  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K    22_C     K    22_C    108  108  108     66   98  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    23_C     E    23_C    108  108  108     64   98  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    24_C     L    24_C    108  108  108     66   98  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    25_C     L    25_C    108  108  108     66   98  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    26_C     E    26_C    108  108  108     54   97  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    27_C     E    27_C    108  108  108     54   98  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     S    28_C     S    28_C    108  108  108     66   98  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     V    29_C     V    29_C    108  108  108     55   98  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    30_C     E    30_C    108  108  108     54   97  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K    31_C     K    31_C    108  108  108     66   98  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     N    32_C     N    32_C    108  108  108     63   98  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     S    33_C     S    33_C    108  108  108     22   50  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     R    34_C     R    34_C    108  108  108     10   72  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     M    35_C     M    35_C    108  108  108     10   50  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     R    36_C     R    36_C    108  108  108     22   88  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     H    37_C     H    37_C    108  108  108     34   98  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     I    38_C     I    38_C    108  108  108     22   98  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     R    39_C     R    39_C    108  108  108     22   93  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A    40_C     A    40_C    108  108  108     29   98  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     V    41_C     V    41_C    108  108  108     66   98  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     M    42_C     M    42_C    108  108  108     57   98  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     W    43_C     W    43_C    108  108  108     46   98  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A    44_C     A    44_C    108  108  108     65   98  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    45_C     E    45_C    108  108  108     66   98  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     Y    46_C     Y    46_C    108  108  108     66   98  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     M    47_C     M    47_C    108  108  108     55   98  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    48_C     L    48_C    108  108  108     32   98  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    49_C     E    49_C    108  108  108     34   98  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     I    50_C     I    50_C    108  108  108     34   98  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A    51_C     A    51_C    108  108  108     34   98  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     R    52_C     R    52_C    108  108  108     55   98  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     S    53_C     S    53_C    108  108  108     66   98  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    54_C     L    54_C    108  108  108     66   98  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    55_C     E    55_C    108  108  108     66   98  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     D    56_C     D    56_C    108  108  108     66   98  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    57_C     E    57_C    108  108  108     66   98  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K    58_C     K    58_C    108  108  108     66   98  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     I    59_C     I    59_C    108  108  108     66   98  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    60_C     L    60_C    108  108  108     66   98  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    61_C     E    61_C    108  108  108     66   98  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     I    62_C     I    62_C    108  108  108     66   98  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A    63_C     A    63_C    108  108  108     66   98  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    64_C     E    64_C    108  108  108     66   98  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K    65_C     K    65_C    108  108  108     66   98  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    66_C     L    66_C    108  108  108     66   98  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    67_C     E    67_C    108  108  108     66   98  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K    68_C     K    68_C    108  108  108     64   98  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A    69_C     A    69_C    108  108  108     54   98  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    70_C     L    70_C    108  108  108     39   98  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     P    71_C     P    71_C    108  108  108     26   98  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    72_C     E    72_C    108  108  108     39   98  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K    73_C     K    73_C    108  108  108     53   98  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     S    74_C     S    74_C    108  108  108     37   98  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K    75_C     K    75_C    108  108  108     66   98  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     M    76_C     M    76_C    108  108  108     34   98  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     F    77_C     F    77_C    108  108  108     26   98  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     T    78_C     T    78_C    108  108  108     34   98  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K    79_C     K    79_C    108  108  108     33   98  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    80_C     E    80_C    108  108  108     34   98  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    81_C     E    81_C    108  108  108     34   98  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     Y    82_C     Y    82_C    108  108  108     66   98  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    83_C     E    83_C    108  108  108     66   98  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K    84_C     K    84_C    108  108  108     66   98  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    85_C     L    85_C    108  108  108     66   98  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     M    86_C     M    86_C    108  108  108     66   98  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    87_C     E    87_C    108  108  108     66   98  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     V    88_C     V    88_C    108  108  108     66   98  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    89_C     L    89_C    108  108  108     66   98  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    90_C     E    90_C    108  108  108     66   98  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    91_C     E    91_C    108  108  108     66   98  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    92_C     L    92_C    108  108  108     66   98  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    93_C     E    93_C    108  108  108     66   98  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    94_C     E    94_C    108  108  108     66   98  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     V    95_C     V    95_C    108  108  108     66   98  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    96_C     L    96_C    108  108  108     66   98  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    97_C     E    97_C    108  108  108     66   98  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    98_C     E    98_C    108  108  108     57   98  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K    99_C     K    99_C    108  108  108     66   98  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K   100_C     K   100_C    108  108  108     66   98  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E   101_C     E   101_C    108  108  108     66   98  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E   102_C     E   102_C    108  108  108     66   98  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     V   103_C     V   103_C    108  108  108     66   98  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E   104_C     E   104_C    108  108  108     66   98  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E   105_C     E   105_C    108  108  108     31   98  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     R   106_C     R   106_C    108  108  108     37   98  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     I   107_C     I   107_C    108  108  108     45   98  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E   108_C     E   108_C    108  108  108     37   98  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     G   109_C     G   109_C    108  108  108     66   98  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_AVERAGE  LCS_A: 100.00  ( 100.00  100.00  100.00 )

GLOBAL_DISTANCE_TEST (summary information about detected largest sets of residues (represented by selected AToms) that can fit under specified thresholds)
GDT DIST_CUTOFF  0.50   1.00   1.50   2.00   2.50   3.00   3.50   4.00   4.50   5.00   5.50   6.00   6.50   7.00   7.50   8.00   8.50   9.00   9.50  10.00
GDT NUMBER_AT     66     98    106    108    108    108    108    108    108    108    108    108    108    108    108    108    108    108    108    108 
GDT PERCENT_AT  61.11  90.74  98.15 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00
GDT RMS_LOCAL    0.33   0.52   0.61   0.66   0.66   0.66   0.66   0.66   0.66   0.66   0.66   0.66   0.66   0.66   0.66   0.66   0.66   0.66   0.66   0.66
GDT RMS_ALL_AT   0.73   0.68   0.66   0.66   0.66   0.66   0.66   0.66   0.66   0.66   0.66   0.66   0.66   0.66   0.66   0.66   0.66   0.66   0.66   0.66

# Checking swapping
#   possible swapping detected:  E     5_C      E     5_C
#   possible swapping detected:  E     6_C      E     6_C
#   possible swapping detected:  E    19_C      E    19_C
#   possible swapping detected:  E    23_C      E    23_C
#   possible swapping detected:  E    26_C      E    26_C
#   possible swapping detected:  E    27_C      E    27_C
#   possible swapping detected:  E    30_C      E    30_C
#   possible swapping detected:  E    45_C      E    45_C
#   possible swapping detected:  Y    46_C      Y    46_C
#   possible swapping detected:  D    56_C      D    56_C
#   possible swapping detected:  E    72_C      E    72_C
#   possible swapping detected:  E    81_C      E    81_C
#   possible swapping detected:  Y    82_C      Y    82_C
#   possible swapping detected:  E    83_C      E    83_C
#   possible swapping detected:  E    87_C      E    87_C
#   possible swapping detected:  E    90_C      E    90_C
#   possible swapping detected:  E    91_C      E    91_C
#   possible swapping detected:  E    93_C      E    93_C
#   possible swapping detected:  E    94_C      E    94_C
#   possible swapping detected:  E    97_C      E    97_C
#   possible swapping detected:  E    98_C      E    98_C
#   possible swapping detected:  E   104_C      E   104_C
#   possible swapping detected:  E   105_C      E   105_C
#   possible swapping detected:  E   108_C      E   108_C

#      Molecule1      Molecule2  DISTANCE    Mis    MC     All    Dist_max   GDC_mc  GDC_all
LGA    L     2_C      L     2_C     0.493     0    0.072   0.344     1.801   97.619   90.714
LGA    P     3_C      P     3_C     0.579     0    0.026   0.033     0.771   95.238   93.197
LGA    D     4_C      D     4_C     0.332     0    0.092   0.154     0.548   97.619   98.810
LGA    E     5_C      E     5_C     0.416     0    0.097   0.978     4.136   97.619   80.582
LGA    E     6_C      E     6_C     0.290     0    0.067   0.796     3.876  100.000   84.815
LGA    K     7_C      K     7_C     0.452     0    0.045   0.718     3.342   97.619   82.487
LGA    L     8_C      L     8_C     0.384     0    0.061   0.062     0.507   97.619   98.810
LGA    K     9_C      K     9_C     0.523     0    0.044   0.760     2.398   92.857   85.820
LGA    L    10_C      L    10_C     0.527     0    0.015   1.289     3.017   92.857   83.274
LGA    L    11_C      L    11_C     0.418     0    0.079   0.094     0.519   95.238   97.619
LGA    D    12_C      D    12_C     0.438     0    0.034   0.129     0.716  100.000   96.429
LGA    T    13_C      T    13_C     0.406     0    0.013   0.046     0.461  100.000  100.000
LGA    L    14_C      L    14_C     0.528     0    0.025   0.135     0.965   95.238   92.857
LGA    L    15_C      L    15_C     0.384     0    0.072   0.121     0.475  100.000  100.000
LGA    T    16_C      T    16_C     0.421     0    0.017   0.999     2.032  100.000   89.728
LGA    M    17_C      M    17_C     0.500     0    0.037   0.532     1.702   95.238   93.036
LGA    V    18_C      V    18_C     0.520     0    0.050   0.063     0.613   90.476   93.197
LGA    E    19_C      E    19_C     0.559     0    0.036   0.792     2.896   90.476   82.857
LGA    W    20_C      W    20_C     0.654     0    0.015   1.586     6.486   90.476   54.660
LGA    V    21_C      V    21_C     0.598     0    0.067   0.071     0.651   92.857   91.837
LGA    K    22_C      K    22_C     0.620     0    0.053   0.840     3.079   90.476   84.392
LGA    E    23_C      E    23_C     0.765     0    0.049   0.092     1.131   90.476   89.471
LGA    L    24_C      L    24_C     0.646     0    0.021   0.134     0.686   90.476   94.048
LGA    L    25_C      L    25_C     0.672     0    0.073   0.198     0.878   90.476   91.667
LGA    E    26_C      E    26_C     1.186     0    0.075   0.703     3.402   81.429   75.132
LGA    E    27_C      E    27_C     1.140     0    0.076   0.518     2.393   85.952   81.587
LGA    S    28_C      S    28_C     0.715     0    0.029   0.062     0.846   90.476   90.476
LGA    V    29_C      V    29_C     1.127     0    0.079   0.158     1.769   81.429   80.204
LGA    E    30_C      E    30_C     1.271     0    0.041   0.399     2.809   85.952   76.984
LGA    K    31_C      K    31_C     0.655     0    0.095   0.663     3.850   92.857   76.984
LGA    N    32_C      N    32_C     0.510     0    0.051   0.074     1.894   90.595   83.869
LGA    S    33_C      S    33_C     1.556     0    0.164   0.165     2.499   81.548   75.952
LGA    R    34_C      R    34_C     1.731     0    0.017   0.655     2.296   72.857   77.922
LGA    M    35_C      M    35_C     2.045     0    0.022   0.726     6.312   70.833   52.857
LGA    R    36_C      R    36_C     1.335     0    0.061   0.181     3.366   81.548   70.390
LGA    H    37_C      H    37_C     0.733     0    0.036   1.127     5.952   90.476   64.048
LGA    I    38_C      I    38_C     1.050     0    0.011   0.110     1.784   88.214   82.679
LGA    R    39_C      R    39_C     1.104     0    0.030   0.988     2.576   85.952   77.836
LGA    A    40_C      A    40_C     0.642     0    0.072   0.080     0.730   90.476   90.476
LGA    V    41_C      V    41_C     0.457     0    0.040   0.072     0.540  100.000   97.279
LGA    M    42_C      M    42_C     0.469     0    0.032   0.975     3.221  100.000   87.976
LGA    W    43_C      W    43_C     0.603     0    0.032   0.406     2.439   90.476   84.252
LGA    A    44_C      A    44_C     0.526     0    0.017   0.026     0.555   90.476   92.381
LGA    E    45_C      E    45_C     0.428     0    0.011   0.229     0.918  100.000   97.884
LGA    Y    46_C      Y    46_C     0.425     0    0.018   0.195     0.914  100.000   96.825
LGA    M    47_C      M    47_C     0.701     0    0.021   1.025     1.890   90.476   84.940
LGA    L    48_C      L    48_C     0.776     0    0.033   0.052     1.103   90.476   88.214
LGA    E    49_C      E    49_C     0.793     0    0.046   0.933     1.980   90.476   84.550
LGA    I    50_C      I    50_C     0.865     0    0.048   0.086     1.166   90.476   87.083
LGA    A    51_C      A    51_C     0.813     0    0.078   0.096     0.869   90.476   90.476
LGA    R    52_C      R    52_C     0.575     0    0.084   0.460     2.278   92.857   85.801
LGA    S    53_C      S    53_C     0.251     0    0.054   0.057     0.401  100.000  100.000
LGA    L    54_C      L    54_C     0.369     0    0.038   0.151     0.868  100.000   96.429
LGA    E    55_C      E    55_C     0.369     0    0.016   0.675     2.420  100.000   84.339
LGA    D    56_C      D    56_C     0.420     0    0.041   0.159     0.687   97.619   97.619
LGA    E    57_C      E    57_C     0.298     0    0.020   1.066     4.018  100.000   80.476
LGA    K    58_C      K    58_C     0.518     0    0.045   0.891     2.235   97.619   84.021
LGA    I    59_C      I    59_C     0.385     0    0.022   0.625     1.871  100.000   95.417
LGA    L    60_C      L    60_C     0.448     0    0.034   0.057     0.521  100.000   98.810
LGA    E    61_C      E    61_C     0.516     0    0.011   0.857     2.547   95.238   80.317
LGA    I    62_C      I    62_C     0.243     0    0.036   0.236     0.585  100.000   98.810
LGA    A    63_C      A    63_C     0.301     0    0.011   0.023     0.349  100.000  100.000
LGA    E    64_C      E    64_C     0.425     0    0.045   0.637     1.496  100.000   90.688
LGA    K    65_C      K    65_C     0.301     0    0.013   0.084     0.557  100.000   98.942
LGA    L    66_C      L    66_C     0.182     0    0.044   0.172     1.248  100.000   94.167
LGA    E    67_C      E    67_C     0.366     0    0.016   0.389     0.889  100.000   96.825
LGA    K    68_C      K    68_C     0.488     0    0.084   1.364     7.126   97.619   72.063
LGA    A    69_C      A    69_C     0.487     0    0.088   0.102     0.546   97.619   98.095
LGA    L    70_C      L    70_C     0.644     0    0.057   0.087     0.699   90.476   90.476
LGA    P    71_C      P    71_C     0.788     0    0.080   0.142     1.189   88.214   89.184
LGA    E    72_C      E    72_C     0.608     0    0.114   0.917     3.926   92.857   77.354
LGA    K    73_C      K    73_C     0.543     0    0.202   0.265     1.380   90.595   88.519
LGA    S    74_C      S    74_C     1.103     0    0.032   0.643     3.842   85.952   76.667
LGA    K    75_C      K    75_C     0.379     0    0.021   0.792     4.078  100.000   80.000
LGA    M    76_C      M    76_C     0.660     0    0.078   0.718     2.479   92.857   86.250
LGA    F    77_C      F    77_C     1.057     0    0.039   0.663     2.358   85.952   80.043
LGA    T    78_C      T    78_C     0.859     0    0.040   0.079     0.927   90.476   90.476
LGA    K    79_C      K    79_C     0.824     0    0.057   0.608     1.794   92.857   88.571
LGA    E    80_C      E    80_C     0.832     0    0.063   0.814     3.105   90.476   78.254
LGA    E    81_C      E    81_C     0.623     0    0.036   0.648     2.038   95.238   87.725
LGA    Y    82_C      Y    82_C     0.281     0    0.079   0.118     0.717  100.000   96.825
LGA    E    83_C      E    83_C     0.101     0    0.041   0.223     0.769  100.000   98.942
LGA    K    84_C      K    84_C     0.307     0    0.015   1.031     5.665  100.000   79.894
LGA    L    85_C      L    85_C     0.349     0    0.028   1.312     3.212  100.000   86.845
LGA    M    86_C      M    86_C     0.271     0    0.065   0.827     2.433  100.000   94.405
LGA    E    87_C      E    87_C     0.099     0    0.024   0.222     0.879  100.000   98.942
LGA    V    88_C      V    88_C     0.128     0    0.014   0.112     0.281  100.000  100.000
LGA    L    89_C      L    89_C     0.216     0    0.047   0.114     0.469  100.000  100.000
LGA    E    90_C      E    90_C     0.225     0    0.065   0.921     4.242  100.000   82.698
LGA    E    91_C      E    91_C     0.240     0    0.016   0.099     0.624  100.000   98.942
LGA    L    92_C      L    92_C     0.045     0    0.020   0.078     0.365  100.000  100.000
LGA    E    93_C      E    93_C     0.094     0    0.072   0.420     1.240  100.000   96.878
LGA    E    94_C      E    94_C     0.195     0    0.010   0.791     3.273  100.000   86.455
LGA    V    95_C      V    95_C     0.163     0    0.014   0.081     0.280  100.000  100.000
LGA    L    96_C      L    96_C     0.266     0    0.017   0.074     0.332  100.000  100.000
LGA    E    97_C      E    97_C     0.310     0    0.092   0.142     0.708  100.000   97.884
LGA    E    98_C      E    98_C     0.504     0    0.013   0.084     0.774   95.238   93.651
LGA    K    99_C      K    99_C     0.362     0    0.043   0.713     2.950  100.000   92.063
LGA    K   100_C      K   100_C     0.229     0    0.056   0.142     1.750  100.000   91.799
LGA    E   101_C      E   101_C     0.426     0    0.052   0.891     3.120   97.619   79.947
LGA    E   102_C      E   102_C     0.197     0    0.055   0.764     2.566   97.619   83.333
LGA    V   103_C      V   103_C     0.230     0    0.012   0.062     0.489  100.000  100.000
LGA    E   104_C      E   104_C     0.416     0    0.090   0.220     0.927   95.238   95.767
LGA    E   105_C      E   105_C     0.696     0    0.031   0.242     1.873   90.476   85.556
LGA    R   106_C      R   106_C     0.690     0    0.021   0.423     1.283   90.476   90.563
LGA    I   107_C      I   107_C     0.698     0    0.118   0.204     0.804   90.476   91.667
LGA    E   108_C      E   108_C     0.955     0    0.463   0.476     3.151   78.095   84.021
LGA    G   109_C      G   109_C     0.584     0    0.581   0.581     1.358   90.595   90.595

# RMSD_GDC results:       CA      MC common percent     ALL common percent   GDC_mc  GDC_all
NUMBER_OF_ATOMS_AA:      108     432    432  100.00     908    908  100.00               108
SUMMARY(RMSD_GDC):     0.658          0.666                  1.349           94.308   88.552

#CA            N1   N2   DIST      N    RMSD    GDT_TS    LGA_S3     LGA_Q 
SUMMARY(GDT)  115  108    4.0    108    0.66    97.685    99.131    14.239

LGA_LOCAL      RMSD:   0.658  Number of atoms:  108  under DIST:   4.00
LGA_ASGN_ATOMS RMSD:   0.658  Number of assigned atoms:  108 
Std_ASGN_ATOMS RMSD:   0.658  Standard rmsd on all 108 assigned CA atoms 

Unitary ROTATION matrix and the SHIFT vector superimpose molecules  (1=>2)
  X_new =   0.402256 * X  +   0.868466 * Y  +  -0.289753 * Z  +  11.253992
  Y_new =   0.413695 * X  +   0.109912 * Y  +   0.903756 * Z  +  -1.208047
  Z_new =   0.816729 * X  +  -0.483410 * Y  +  -0.315068 * Z  + -11.542208 

Euler angles from the ROTATION matrix. Conventions XYZ and ZXZ:
           Phi     Theta       Psi   [DEG:       Phi     Theta       Psi ]
XYZ:  0.799417 -0.955720 -2.148408   [DEG:   45.8032  -54.7587 -123.0947 ]
ZXZ: -2.831337  1.891324  2.105228   [DEG: -162.2237  108.3649  120.6207 ]
 
# END of job
