
#######################################################
#                                                     #
#                        LGA                          #
#                  ---------------                    #
#                                                     #
#               Local-Global Alignment                #
#        A Method for Finding 3-D Similarities        #
#               in Protein Structures                 #
#                                                     #
#                  ------------ 10/2009               #
#                                                     #
#      Adam Zemla (adamz@llnl.gov)                    #
#      Lawrence Livermore National Laboratory, CA     #
#                                                     #
#######################################################

!!!   License for LGA program has expired  !!!
#   For updated version of the LGA program   #
# please contact Adam Zemla:  adamz@llnl.gov #

# Molecule1: number of CA atoms  115 (  972),  selected  108 , name one
# Molecule2: number of CA atoms  108 (  908),  selected  108 , name two
# PARAMETERS: input.pdb  -ie  -3  -d:4  -sda  -swap  -ch1:C  -ch2:C  
# FIXED Atom-Atom correspondence
# GDT and LCS analysis 

LCS - RMSD CUTOFF   5.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:   108       2_C - 109_C       0.58     0.58
  LCS_AVERAGE:    100.00

LCS - RMSD CUTOFF   2.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:   108       2_C - 109_C       0.58     0.58
  LCS_AVERAGE:    100.00

LCS - RMSD CUTOFF   1.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:   108       2_C - 109_C       0.58     0.58
  LCS_AVERAGE:    100.00

LCS_GDT    MOLECULE-1    MOLECULE-2     LCS_DETAILS     GDT_DETAILS                                                    TOTAL NUMBER OF RESIDUE PAIRS:  108
LCS_GDT     RESIDUE       RESIDUE       SEGMENT_SIZE    GLOBAL DISTANCE TEST COLUMNS: number of residues under the threshold assigned to each residue pair
LCS_GDT   NAME NUMBER   NAME NUMBER    1.0  2.0  5.0    0.5  1.0  1.5  2.0  2.5  3.0  3.5  4.0  4.5  5.0  5.5  6.0  6.5  7.0  7.5  8.0  8.5  9.0  9.5 10.0
LCS_GDT     L     2_C     L     2_C    108  108  108     75  103  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     P     3_C     P     3_C    108  108  108     75  103  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     D     4_C     D     4_C    108  108  108     75  103  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E     5_C     E     5_C    108  108  108     75  103  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E     6_C     E     6_C    108  108  108     75  103  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K     7_C     K     7_C    108  108  108     75  103  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L     8_C     L     8_C    108  108  108     75  103  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K     9_C     K     9_C    108  108  108     75  103  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    10_C     L    10_C    108  108  108     75  103  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    11_C     L    11_C    108  108  108     75  103  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     D    12_C     D    12_C    108  108  108     75  103  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     T    13_C     T    13_C    108  108  108     75  103  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    14_C     L    14_C    108  108  108     75  103  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    15_C     L    15_C    108  108  108     75  103  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     T    16_C     T    16_C    108  108  108     75  103  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     M    17_C     M    17_C    108  108  108     75  103  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     V    18_C     V    18_C    108  108  108     75  103  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    19_C     E    19_C    108  108  108     75  103  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     W    20_C     W    20_C    108  108  108     75  103  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     V    21_C     V    21_C    108  108  108     75  103  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K    22_C     K    22_C    108  108  108     75  103  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    23_C     E    23_C    108  108  108     75  103  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    24_C     L    24_C    108  108  108     75  103  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    25_C     L    25_C    108  108  108     75  103  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    26_C     E    26_C    108  108  108     72  103  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    27_C     E    27_C    108  108  108     75  103  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     S    28_C     S    28_C    108  108  108     75  103  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     V    29_C     V    29_C    108  108  108     75  103  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    30_C     E    30_C    108  108  108     75  103  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K    31_C     K    31_C    108  108  108     75  103  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     N    32_C     N    32_C    108  108  108     74  103  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     S    33_C     S    33_C    108  108  108      7   70  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     R    34_C     R    34_C    108  108  108     13   70  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     M    35_C     M    35_C    108  108  108     11   63  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     R    36_C     R    36_C    108  108  108     26   96  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     H    37_C     H    37_C    108  108  108     44  103  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     I    38_C     I    38_C    108  108  108     26  103  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     R    39_C     R    39_C    108  108  108     26  103  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A    40_C     A    40_C    108  108  108     42  103  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     V    41_C     V    41_C    108  108  108     75  103  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     M    42_C     M    42_C    108  108  108     74  103  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     W    43_C     W    43_C    108  108  108     74  103  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A    44_C     A    44_C    108  108  108     75  103  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    45_C     E    45_C    108  108  108     75  103  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     Y    46_C     Y    46_C    108  108  108     75  103  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     M    47_C     M    47_C    108  108  108     27  103  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    48_C     L    48_C    108  108  108     41  103  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    49_C     E    49_C    108  108  108     53  103  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     I    50_C     I    50_C    108  108  108     42  103  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A    51_C     A    51_C    108  108  108     39  103  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     R    52_C     R    52_C    108  108  108     43  103  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     S    53_C     S    53_C    108  108  108     75  103  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    54_C     L    54_C    108  108  108     75  103  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    55_C     E    55_C    108  108  108     75  103  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     D    56_C     D    56_C    108  108  108     75  103  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    57_C     E    57_C    108  108  108     75  103  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K    58_C     K    58_C    108  108  108     75  103  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     I    59_C     I    59_C    108  108  108     75  103  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    60_C     L    60_C    108  108  108     75  103  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    61_C     E    61_C    108  108  108     75  103  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     I    62_C     I    62_C    108  108  108     75  103  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A    63_C     A    63_C    108  108  108     75  103  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    64_C     E    64_C    108  108  108     75  103  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K    65_C     K    65_C    108  108  108     75  103  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    66_C     L    66_C    108  108  108     75  103  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    67_C     E    67_C    108  108  108     75  103  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K    68_C     K    68_C    108  108  108     75  103  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A    69_C     A    69_C    108  108  108     74  103  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    70_C     L    70_C    108  108  108     74  103  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     P    71_C     P    71_C    108  108  108     74  103  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    72_C     E    72_C    108  108  108     75  103  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K    73_C     K    73_C    108  108  108     75  103  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     S    74_C     S    74_C    108  108  108     16   97  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K    75_C     K    75_C    108  108  108     75  103  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     M    76_C     M    76_C    108  108  108     74  103  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     F    77_C     F    77_C    108  108  108     64  103  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     T    78_C     T    78_C    108  108  108     74  103  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K    79_C     K    79_C    108  108  108     64  103  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    80_C     E    80_C    108  108  108     48  103  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    81_C     E    81_C    108  108  108     48  103  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     Y    82_C     Y    82_C    108  108  108     75  103  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    83_C     E    83_C    108  108  108     75  103  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K    84_C     K    84_C    108  108  108     75  103  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    85_C     L    85_C    108  108  108     75  103  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     M    86_C     M    86_C    108  108  108     75  103  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    87_C     E    87_C    108  108  108     75  103  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     V    88_C     V    88_C    108  108  108     75  103  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    89_C     L    89_C    108  108  108     75  103  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    90_C     E    90_C    108  108  108     75  103  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    91_C     E    91_C    108  108  108     75  103  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    92_C     L    92_C    108  108  108     75  103  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    93_C     E    93_C    108  108  108     75  103  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    94_C     E    94_C    108  108  108     75  103  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     V    95_C     V    95_C    108  108  108     75  103  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    96_C     L    96_C    108  108  108     75  103  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    97_C     E    97_C    108  108  108     75  103  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    98_C     E    98_C    108  108  108     53  103  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K    99_C     K    99_C    108  108  108     74  103  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K   100_C     K   100_C    108  108  108     75  103  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E   101_C     E   101_C    108  108  108     75  103  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E   102_C     E   102_C    108  108  108     75  103  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     V   103_C     V   103_C    108  108  108     75  103  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E   104_C     E   104_C    108  108  108     75  103  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E   105_C     E   105_C    108  108  108     66  103  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     R   106_C     R   106_C    108  108  108     53  103  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     I   107_C     I   107_C    108  108  108     75  103  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E   108_C     E   108_C    108  108  108     55  103  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     G   109_C     G   109_C    108  108  108     75  103  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_AVERAGE  LCS_A: 100.00  ( 100.00  100.00  100.00 )

GLOBAL_DISTANCE_TEST (summary information about detected largest sets of residues (represented by selected AToms) that can fit under specified thresholds)
GDT DIST_CUTOFF  0.50   1.00   1.50   2.00   2.50   3.00   3.50   4.00   4.50   5.00   5.50   6.00   6.50   7.00   7.50   8.00   8.50   9.00   9.50  10.00
GDT NUMBER_AT     75    103    107    108    108    108    108    108    108    108    108    108    108    108    108    108    108    108    108    108 
GDT PERCENT_AT  69.44  95.37  99.07 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00
GDT RMS_LOCAL    0.33   0.47   0.56   0.58   0.58   0.58   0.58   0.58   0.58   0.58   0.58   0.58   0.58   0.58   0.58   0.58   0.58   0.58   0.58   0.58
GDT RMS_ALL_AT   0.63   0.58   0.58   0.58   0.58   0.58   0.58   0.58   0.58   0.58   0.58   0.58   0.58   0.58   0.58   0.58   0.58   0.58   0.58   0.58

# Checking swapping
#   possible swapping detected:  E     5_C      E     5_C
#   possible swapping detected:  E     6_C      E     6_C
#   possible swapping detected:  E    19_C      E    19_C
#   possible swapping detected:  E    26_C      E    26_C
#   possible swapping detected:  E    27_C      E    27_C
#   possible swapping detected:  E    30_C      E    30_C
#   possible swapping detected:  E    45_C      E    45_C
#   possible swapping detected:  Y    46_C      Y    46_C
#   possible swapping detected:  D    56_C      D    56_C
#   possible swapping detected:  E    72_C      E    72_C
#   possible swapping detected:  E    81_C      E    81_C
#   possible swapping detected:  Y    82_C      Y    82_C
#   possible swapping detected:  E    83_C      E    83_C
#   possible swapping detected:  E    87_C      E    87_C
#   possible swapping detected:  E    90_C      E    90_C
#   possible swapping detected:  E    91_C      E    91_C
#   possible swapping detected:  E    93_C      E    93_C
#   possible swapping detected:  E    94_C      E    94_C
#   possible swapping detected:  E    97_C      E    97_C
#   possible swapping detected:  E    98_C      E    98_C
#   possible swapping detected:  E   101_C      E   101_C
#   possible swapping detected:  E   104_C      E   104_C
#   possible swapping detected:  E   105_C      E   105_C
#   possible swapping detected:  E   108_C      E   108_C

#      Molecule1      Molecule2  DISTANCE    Mis    MC     All    Dist_max   GDC_mc  GDC_all
LGA    L     2_C      L     2_C     0.448     0    0.070   0.376     1.535   97.619   93.095
LGA    P     3_C      P     3_C     0.560     0    0.026   0.035     0.731   97.619   94.558
LGA    D     4_C      D     4_C     0.357     0    0.079   0.103     0.523   97.619   98.810
LGA    E     5_C      E     5_C     0.430     0    0.100   0.976     4.041   97.619   79.524
LGA    E     6_C      E     6_C     0.426     0    0.061   0.805     4.123  100.000   83.069
LGA    K     7_C      K     7_C     0.432     0    0.041   0.751     3.397  100.000   82.751
LGA    L     8_C      L     8_C     0.381     0    0.055   0.063     0.502   97.619   98.810
LGA    K     9_C      K     9_C     0.541     0    0.042   0.751     2.053   92.857   86.720
LGA    L    10_C      L    10_C     0.557     0    0.014   1.265     2.655   90.476   81.964
LGA    L    11_C      L    11_C     0.394     0    0.081   0.096     0.504   97.619   98.810
LGA    D    12_C      D    12_C     0.380     0    0.035   0.114     0.592  100.000   97.619
LGA    T    13_C      T    13_C     0.387     0    0.019   0.053     0.423  100.000  100.000
LGA    L    14_C      L    14_C     0.513     0    0.022   0.129     0.993   97.619   94.048
LGA    L    15_C      L    15_C     0.322     0    0.074   0.126     0.412  100.000  100.000
LGA    T    16_C      T    16_C     0.355     0    0.019   0.982     2.031  100.000   89.728
LGA    M    17_C      M    17_C     0.474     0    0.033   0.686     2.121  100.000   92.024
LGA    V    18_C      V    18_C     0.492     0    0.052   0.059     0.673   97.619   94.558
LGA    E    19_C      E    19_C     0.427     0    0.054   0.788     2.955   97.619   87.090
LGA    W    20_C      W    20_C     0.477     0    0.021   1.615     6.165  100.000   58.061
LGA    V    21_C      V    21_C     0.453     0    0.061   0.066     0.485  100.000  100.000
LGA    K    22_C      K    22_C     0.475     0    0.063   0.832     3.008   95.238   87.566
LGA    E    23_C      E    23_C     0.524     0    0.040   0.924     2.274   90.476   80.847
LGA    L    24_C      L    24_C     0.433     0    0.023   0.135     0.534  100.000   98.810
LGA    L    25_C      L    25_C     0.434     0    0.075   0.204     0.655   95.238   95.238
LGA    E    26_C      E    26_C     0.823     0    0.073   0.253     0.989   90.476   91.534
LGA    E    27_C      E    27_C     0.780     0    0.070   0.496     2.010   92.857   87.672
LGA    S    28_C      S    28_C     0.408     0    0.036   0.073     0.543   97.619   98.413
LGA    V    29_C      V    29_C     0.712     0    0.071   0.156     1.293   90.476   89.184
LGA    E    30_C      E    30_C     0.773     0    0.041   0.324     2.018   92.857   85.661
LGA    K    31_C      K    31_C     0.410     0    0.094   0.659     3.648   95.238   79.788
LGA    N    32_C      N    32_C     0.415     0    0.054   0.133     1.367   92.976   88.333
LGA    S    33_C      S    33_C     1.548     0    0.163   0.165     2.383   81.548   75.952
LGA    R    34_C      R    34_C     1.538     0    0.017   0.635     2.017   77.143   81.861
LGA    M    35_C      M    35_C     1.863     0    0.029   0.716     5.924   72.857   55.774
LGA    R    36_C      R    36_C     1.300     0    0.046   0.169     2.869   83.690   73.247
LGA    H    37_C      H    37_C     0.721     0    0.030   1.164     5.610   90.476   64.524
LGA    I    38_C      I    38_C     0.891     0    0.010   0.111     1.549   90.476   84.881
LGA    R    39_C      R    39_C     0.998     0    0.029   0.997     2.601   90.476   79.481
LGA    A    40_C      A    40_C     0.598     0    0.062   0.069     0.666   95.238   94.286
LGA    V    41_C      V    41_C     0.291     0    0.052   0.066     0.426  100.000  100.000
LGA    M    42_C      M    42_C     0.322     0    0.035   0.982     3.101  100.000   89.167
LGA    W    43_C      W    43_C     0.489     0    0.037   0.388     2.259  100.000   88.878
LGA    A    44_C      A    44_C     0.415     0    0.018   0.027     0.447  100.000  100.000
LGA    E    45_C      E    45_C     0.316     0    0.012   0.287     1.032  100.000   97.937
LGA    Y    46_C      Y    46_C     0.357     0    0.014   0.197     0.903  100.000   96.825
LGA    M    47_C      M    47_C     0.740     0    0.015   1.050     1.752   90.476   84.940
LGA    L    48_C      L    48_C     0.800     0    0.030   0.073     1.282   90.476   87.083
LGA    E    49_C      E    49_C     0.733     0    0.043   0.925     2.168   90.476   84.603
LGA    I    50_C      I    50_C     0.798     0    0.041   0.109     1.093   90.476   88.214
LGA    A    51_C      A    51_C     0.760     0    0.076   0.094     0.849   90.476   90.476
LGA    R    52_C      R    52_C     0.515     0    0.070   0.469     2.424   92.857   84.242
LGA    S    53_C      S    53_C     0.421     0    0.065   0.072     0.506   97.619   98.413
LGA    L    54_C      L    54_C     0.454     0    0.027   0.149     0.819  100.000   97.619
LGA    E    55_C      E    55_C     0.456     0    0.019   0.661     2.155  100.000   87.037
LGA    D    56_C      D    56_C     0.411     0    0.039   0.164     0.791   97.619   96.429
LGA    E    57_C      E    57_C     0.250     0    0.026   1.061     3.881  100.000   82.011
LGA    K    58_C      K    58_C     0.448     0    0.047   0.829     2.928  100.000   87.143
LGA    I    59_C      I    59_C     0.430     0    0.034   0.614     1.707  100.000   94.226
LGA    L    60_C      L    60_C     0.403     0    0.033   0.052     0.461  100.000  100.000
LGA    E    61_C      E    61_C     0.443     0    0.011   0.847     2.449  100.000   85.079
LGA    I    62_C      I    62_C     0.191     0    0.039   0.238     0.628  100.000   98.810
LGA    A    63_C      A    63_C     0.227     0    0.012   0.022     0.280  100.000  100.000
LGA    E    64_C      E    64_C     0.356     0    0.046   0.631     1.409  100.000   91.693
LGA    K    65_C      K    65_C     0.295     0    0.013   0.081     0.569  100.000   98.942
LGA    L    66_C      L    66_C     0.247     0    0.043   0.157     1.267  100.000   94.167
LGA    E    67_C      E    67_C     0.366     0    0.017   0.443     1.036  100.000   95.820
LGA    K    68_C      K    68_C     0.424     0    0.090   1.388     7.343   97.619   72.169
LGA    A    69_C      A    69_C     0.456     0    0.077   0.091     0.488  100.000  100.000
LGA    L    70_C      L    70_C     0.504     0    0.054   0.099     0.656   95.238   96.429
LGA    P    71_C      P    71_C     0.439     0    0.082   0.134     0.776   97.619   97.279
LGA    E    72_C      E    72_C     0.204     0    0.109   0.903     4.489  100.000   81.640
LGA    K    73_C      K    73_C     0.298     0    0.238   0.229     1.690   90.833   91.746
LGA    S    74_C      S    74_C     1.445     0    0.026   0.545     4.025   81.548   71.349
LGA    K    75_C      K    75_C     0.393     0    0.033   0.773     4.029  100.000   79.630
LGA    M    76_C      M    76_C     0.351     0    0.070   0.812     2.832   97.619   92.262
LGA    F    77_C      F    77_C     0.599     0    0.030   0.547     2.259   90.476   84.113
LGA    T    78_C      T    78_C     0.475     0    0.040   0.081     0.599   95.238   95.918
LGA    K    79_C      K    79_C     0.533     0    0.051   0.602     1.935   95.238   91.693
LGA    E    80_C      E    80_C     0.747     0    0.058   0.812     3.178   90.476   77.302
LGA    E    81_C      E    81_C     0.635     0    0.044   0.645     2.154   92.857   85.714
LGA    Y    82_C      Y    82_C     0.160     0    0.070   0.155     0.631  100.000   98.413
LGA    E    83_C      E    83_C     0.180     0    0.044   0.219     0.807  100.000   98.942
LGA    K    84_C      K    84_C     0.350     0    0.013   1.011     5.678  100.000   79.153
LGA    L    85_C      L    85_C     0.389     0    0.029   1.308     3.130  100.000   85.833
LGA    M    86_C      M    86_C     0.348     0    0.064   0.839     2.378  100.000   93.214
LGA    E    87_C      E    87_C     0.113     0    0.031   0.222     0.771  100.000   98.942
LGA    V    88_C      V    88_C     0.182     0    0.015   0.125     0.371  100.000  100.000
LGA    L    89_C      L    89_C     0.246     0    0.040   0.122     0.398  100.000  100.000
LGA    E    90_C      E    90_C     0.225     0    0.083   0.930     4.373  100.000   82.698
LGA    E    91_C      E    91_C     0.222     0    0.019   0.112     0.704  100.000   98.942
LGA    L    92_C      L    92_C     0.084     0    0.018   0.078     0.314  100.000  100.000
LGA    E    93_C      E    93_C     0.116     0    0.082   0.465     1.375  100.000   96.878
LGA    E    94_C      E    94_C     0.260     0    0.028   0.106     0.506  100.000   98.942
LGA    V    95_C      V    95_C     0.211     0    0.016   0.062     0.366  100.000  100.000
LGA    L    96_C      L    96_C     0.348     0    0.016   0.083     0.357  100.000  100.000
LGA    E    97_C      E    97_C     0.380     0    0.110   0.150     0.663  100.000   96.825
LGA    E    98_C      E    98_C     0.654     0    0.011   0.120     0.945   92.857   91.534
LGA    K    99_C      K    99_C     0.490     0    0.041   0.948     4.482   97.619   80.265
LGA    K   100_C      K   100_C     0.189     0    0.054   0.148     1.763  100.000   92.857
LGA    E   101_C      E   101_C     0.406     0    0.048   0.139     1.342  100.000   93.704
LGA    E   102_C      E   102_C     0.157     0    0.039   0.746     2.326  100.000   85.238
LGA    V   103_C      V   103_C     0.208     0    0.012   0.048     0.505  100.000   98.639
LGA    E   104_C      E   104_C     0.390     0    0.091   0.239     0.877   95.238   95.767
LGA    E   105_C      E   105_C     0.608     0    0.025   0.217     1.613   90.476   86.508
LGA    R   106_C      R   106_C     0.590     0    0.015   0.424     1.171   90.476   91.385
LGA    I   107_C      I   107_C     0.644     0    0.146   0.220     0.765   90.476   90.476
LGA    E   108_C      E   108_C     0.839     0    0.480   0.483     3.039   78.095   84.021
LGA    G   109_C      G   109_C     0.545     0    0.614   0.614     1.228   88.214   88.214

# RMSD_GDC results:       CA      MC common percent     ALL common percent   GDC_mc  GDC_all
NUMBER_OF_ATOMS_AA:      108     432    432  100.00     908    908  100.00               108
SUMMARY(RMSD_GDC):     0.576          0.587                  1.289           95.981   90.080

#CA            N1   N2   DIST      N    RMSD    GDT_TS    LGA_S3     LGA_Q 
SUMMARY(GDT)  115  108    4.0    108    0.58    98.843    99.565    15.970

LGA_LOCAL      RMSD:   0.576  Number of atoms:  108  under DIST:   4.00
LGA_ASGN_ATOMS RMSD:   0.576  Number of assigned atoms:  108 
Std_ASGN_ATOMS RMSD:   0.576  Standard rmsd on all 108 assigned CA atoms 

Unitary ROTATION matrix and the SHIFT vector superimpose molecules  (1=>2)
  X_new =   0.821516 * X  +  -0.561865 * Y  +   0.097048 * Z  +  13.365654
  Y_new =  -0.569043 * X  +  -0.818676 * Y  +   0.077198 * Z  +  -0.950170
  Z_new =   0.036076 * X  +  -0.118643 * Y  +  -0.992281 * Z  + -11.110686 

Euler angles from the ROTATION matrix. Conventions XYZ and ZXZ:
           Phi     Theta       Psi   [DEG:       Phi     Theta       Psi ]
XYZ: -0.605792 -0.036084 -3.022591   [DEG:  -34.7093   -2.0675 -173.1817 ]
ZXZ:  2.242762  3.017266  2.846405   [DEG:  128.5008  172.8766  163.0870 ]
 
# END of job
