
#######################################################
#                                                     #
#                        LGA                          #
#                  ---------------                    #
#                                                     #
#               Local-Global Alignment                #
#        A Method for Finding 3-D Similarities        #
#               in Protein Structures                 #
#                                                     #
#                  ------------ 10/2009               #
#                                                     #
#      Adam Zemla (adamz@llnl.gov)                    #
#      Lawrence Livermore National Laboratory, CA     #
#                                                     #
#######################################################

!!!   License for LGA program has expired  !!!
#   For updated version of the LGA program   #
# please contact Adam Zemla:  adamz@llnl.gov #

# Molecule1: number of CA atoms  115 (  972),  selected  108 , name one
# Molecule2: number of CA atoms  108 (  908),  selected  108 , name two
# PARAMETERS: input.pdb  -ie  -3  -d:4  -sda  -swap  -ch1:C  -ch2:C  
# FIXED Atom-Atom correspondence
# GDT and LCS analysis 

LCS - RMSD CUTOFF   5.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:   108       2_C - 109_C       0.63     0.63
  LCS_AVERAGE:    100.00

LCS - RMSD CUTOFF   2.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:   108       2_C - 109_C       0.63     0.63
  LCS_AVERAGE:    100.00

LCS - RMSD CUTOFF   1.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:   108       2_C - 109_C       0.63     0.63
  LCS_AVERAGE:    100.00

LCS_GDT    MOLECULE-1    MOLECULE-2     LCS_DETAILS     GDT_DETAILS                                                    TOTAL NUMBER OF RESIDUE PAIRS:  108
LCS_GDT     RESIDUE       RESIDUE       SEGMENT_SIZE    GLOBAL DISTANCE TEST COLUMNS: number of residues under the threshold assigned to each residue pair
LCS_GDT   NAME NUMBER   NAME NUMBER    1.0  2.0  5.0    0.5  1.0  1.5  2.0  2.5  3.0  3.5  4.0  4.5  5.0  5.5  6.0  6.5  7.0  7.5  8.0  8.5  9.0  9.5 10.0
LCS_GDT     L     2_C     L     2_C    108  108  108     68  101  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     P     3_C     P     3_C    108  108  108     67  101  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     D     4_C     D     4_C    108  108  108     68  101  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E     5_C     E     5_C    108  108  108     68  101  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E     6_C     E     6_C    108  108  108     68  101  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K     7_C     K     7_C    108  108  108     68  101  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L     8_C     L     8_C    108  108  108     68  101  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K     9_C     K     9_C    108  108  108     68  101  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    10_C     L    10_C    108  108  108     68  101  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    11_C     L    11_C    108  108  108     68  101  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     D    12_C     D    12_C    108  108  108     68  101  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     T    13_C     T    13_C    108  108  108     68  101  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    14_C     L    14_C    108  108  108     68  101  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    15_C     L    15_C    108  108  108     68  101  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     T    16_C     T    16_C    108  108  108     68  101  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     M    17_C     M    17_C    108  108  108     68  101  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     V    18_C     V    18_C    108  108  108     68  101  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    19_C     E    19_C    108  108  108     68  101  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     W    20_C     W    20_C    108  108  108     68  101  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     V    21_C     V    21_C    108  108  108     68  101  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K    22_C     K    22_C    108  108  108     68  101  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    23_C     E    23_C    108  108  108     67  101  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    24_C     L    24_C    108  108  108     68  101  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    25_C     L    25_C    108  108  108     68  101  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    26_C     E    26_C    108  108  108     63  101  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    27_C     E    27_C    108  108  108     65  101  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     S    28_C     S    28_C    108  108  108     68  101  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     V    29_C     V    29_C    108  108  108     63  101  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    30_C     E    30_C    108  108  108     54  101  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K    31_C     K    31_C    108  108  108     67  101  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     N    32_C     N    32_C    108  108  108     68  101  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     S    33_C     S    33_C    108  108  108     26   67  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     R    34_C     R    34_C    108  108  108     25   79  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     M    35_C     M    35_C    108  108  108     12   67  104  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     R    36_C     R    36_C    108  108  108     26   67  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     H    37_C     H    37_C    108  108  108     33  101  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     I    38_C     I    38_C    108  108  108     29  100  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     R    39_C     R    39_C    108  108  108     27   99  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A    40_C     A    40_C    108  108  108     39  101  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     V    41_C     V    41_C    108  108  108     68  101  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     M    42_C     M    42_C    108  108  108     68  101  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     W    43_C     W    43_C    108  108  108     58  101  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A    44_C     A    44_C    108  108  108     68  101  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    45_C     E    45_C    108  108  108     68  101  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     Y    46_C     Y    46_C    108  108  108     68  101  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     M    47_C     M    47_C    108  108  108     54  101  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    48_C     L    48_C    108  108  108     36  101  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    49_C     E    49_C    108  108  108     50  101  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     I    50_C     I    50_C    108  108  108     36  101  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A    51_C     A    51_C    108  108  108     33  101  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     R    52_C     R    52_C    108  108  108     68  101  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     S    53_C     S    53_C    108  108  108     68  101  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    54_C     L    54_C    108  108  108     68  101  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    55_C     E    55_C    108  108  108     68  101  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     D    56_C     D    56_C    108  108  108     68  101  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    57_C     E    57_C    108  108  108     68  101  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K    58_C     K    58_C    108  108  108     68  101  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     I    59_C     I    59_C    108  108  108     68  101  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    60_C     L    60_C    108  108  108     68  101  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    61_C     E    61_C    108  108  108     68  101  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     I    62_C     I    62_C    108  108  108     68  101  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A    63_C     A    63_C    108  108  108     68  101  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    64_C     E    64_C    108  108  108     68  101  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K    65_C     K    65_C    108  108  108     68  101  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    66_C     L    66_C    108  108  108     68  101  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    67_C     E    67_C    108  108  108     68  101  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K    68_C     K    68_C    108  108  108     68  101  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A    69_C     A    69_C    108  108  108     68  101  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    70_C     L    70_C    108  108  108     61  101  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     P    71_C     P    71_C    108  108  108     56  101  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    72_C     E    72_C    108  108  108     67  101  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K    73_C     K    73_C    108  108  108     62  101  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     S    74_C     S    74_C    108  108  108      4  101  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K    75_C     K    75_C    108  108  108     68  101  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     M    76_C     M    76_C    108  108  108     55  101  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     F    77_C     F    77_C    108  108  108     33  100  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     T    78_C     T    78_C    108  108  108     45  101  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K    79_C     K    79_C    108  108  108     58  101  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    80_C     E    80_C    108  108  108     39  101  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    81_C     E    81_C    108  108  108     34  101  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     Y    82_C     Y    82_C    108  108  108     68  101  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    83_C     E    83_C    108  108  108     68  101  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K    84_C     K    84_C    108  108  108     68  101  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    85_C     L    85_C    108  108  108     68  101  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     M    86_C     M    86_C    108  108  108     68  101  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    87_C     E    87_C    108  108  108     68  101  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     V    88_C     V    88_C    108  108  108     68  101  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    89_C     L    89_C    108  108  108     68  101  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    90_C     E    90_C    108  108  108     68  101  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    91_C     E    91_C    108  108  108     68  101  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    92_C     L    92_C    108  108  108     68  101  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    93_C     E    93_C    108  108  108     68  101  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    94_C     E    94_C    108  108  108     68  101  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     V    95_C     V    95_C    108  108  108     68  101  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    96_C     L    96_C    108  108  108     68  101  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    97_C     E    97_C    108  108  108     68  101  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    98_C     E    98_C    108  108  108     54  101  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K    99_C     K    99_C    108  108  108     68  101  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K   100_C     K   100_C    108  108  108     68  101  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E   101_C     E   101_C    108  108  108     56  101  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E   102_C     E   102_C    108  108  108     68  101  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     V   103_C     V   103_C    108  108  108     68  101  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E   104_C     E   104_C    108  108  108     56  101  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E   105_C     E   105_C    108  108  108     41  101  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     R   106_C     R   106_C    108  108  108     47  101  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     I   107_C     I   107_C    108  108  108     47  101  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E   108_C     E   108_C    108  108  108     33  101  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     G   109_C     G   109_C    108  108  108     68  101  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_AVERAGE  LCS_A: 100.00  ( 100.00  100.00  100.00 )

GLOBAL_DISTANCE_TEST (summary information about detected largest sets of residues (represented by selected AToms) that can fit under specified thresholds)
GDT DIST_CUTOFF  0.50   1.00   1.50   2.00   2.50   3.00   3.50   4.00   4.50   5.00   5.50   6.00   6.50   7.00   7.50   8.00   8.50   9.00   9.50  10.00
GDT NUMBER_AT     68    101    106    108    108    108    108    108    108    108    108    108    108    108    108    108    108    108    108    108 
GDT PERCENT_AT  62.96  93.52  98.15 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00
GDT RMS_LOCAL    0.34   0.51   0.57   0.63   0.63   0.63   0.63   0.63   0.63   0.63   0.63   0.63   0.63   0.63   0.63   0.63   0.63   0.63   0.63   0.63
GDT RMS_ALL_AT   0.67   0.65   0.63   0.63   0.63   0.63   0.63   0.63   0.63   0.63   0.63   0.63   0.63   0.63   0.63   0.63   0.63   0.63   0.63   0.63

# Checking swapping
#   possible swapping detected:  E     5_C      E     5_C
#   possible swapping detected:  E     6_C      E     6_C
#   possible swapping detected:  E    19_C      E    19_C
#   possible swapping detected:  E    23_C      E    23_C
#   possible swapping detected:  E    26_C      E    26_C
#   possible swapping detected:  E    27_C      E    27_C
#   possible swapping detected:  E    30_C      E    30_C
#   possible swapping detected:  E    45_C      E    45_C
#   possible swapping detected:  Y    46_C      Y    46_C
#   possible swapping detected:  D    56_C      D    56_C
#   possible swapping detected:  E    72_C      E    72_C
#   possible swapping detected:  E    80_C      E    80_C
#   possible swapping detected:  E    81_C      E    81_C
#   possible swapping detected:  Y    82_C      Y    82_C
#   possible swapping detected:  E    83_C      E    83_C
#   possible swapping detected:  E    87_C      E    87_C
#   possible swapping detected:  E    90_C      E    90_C
#   possible swapping detected:  E    91_C      E    91_C
#   possible swapping detected:  E    93_C      E    93_C
#   possible swapping detected:  E    94_C      E    94_C
#   possible swapping detected:  E    97_C      E    97_C
#   possible swapping detected:  E    98_C      E    98_C
#   possible swapping detected:  E   104_C      E   104_C
#   possible swapping detected:  E   105_C      E   105_C
#   possible swapping detected:  E   108_C      E   108_C

#      Molecule1      Molecule2  DISTANCE    Mis    MC     All    Dist_max   GDC_mc  GDC_all
LGA    L     2_C      L     2_C     0.447     0    0.075   0.327     1.546   97.619   94.226
LGA    P     3_C      P     3_C     0.612     0    0.028   0.036     0.834   95.238   93.197
LGA    D     4_C      D     4_C     0.394     0    0.089   0.099     0.580   97.619   95.238
LGA    E     5_C      E     5_C     0.462     0    0.088   0.979     4.160   97.619   78.783
LGA    E     6_C      E     6_C     0.384     0    0.067   0.825     4.055  100.000   84.127
LGA    K     7_C      K     7_C     0.340     0    0.046   0.251     2.018  100.000   91.905
LGA    L     8_C      L     8_C     0.333     0    0.055   0.061     0.489  100.000  100.000
LGA    K     9_C      K     9_C     0.458     0    0.042   0.755     2.250  100.000   90.952
LGA    L    10_C      L    10_C     0.494     0    0.016   1.278     2.918  100.000   86.726
LGA    L    11_C      L    11_C     0.363     0    0.077   0.099     0.469  100.000  100.000
LGA    D    12_C      D    12_C     0.366     0    0.039   0.117     0.654  100.000   97.619
LGA    T    13_C      T    13_C     0.368     0    0.016   0.055     0.407  100.000  100.000
LGA    L    14_C      L    14_C     0.465     0    0.017   1.213     2.745  100.000   83.690
LGA    L    15_C      L    15_C     0.332     0    0.073   0.121     0.421  100.000  100.000
LGA    T    16_C      T    16_C     0.368     0    0.017   1.013     2.138  100.000   89.728
LGA    M    17_C      M    17_C     0.485     0    0.035   0.707     2.055  100.000   92.024
LGA    V    18_C      V    18_C     0.510     0    0.050   0.062     0.660   90.476   90.476
LGA    E    19_C      E    19_C     0.544     0    0.037   0.790     2.768   90.476   83.915
LGA    W    20_C      W    20_C     0.579     0    0.016   1.614     6.112   90.476   55.102
LGA    V    21_C      V    21_C     0.550     0    0.068   0.072     0.585   92.857   91.837
LGA    K    22_C      K    22_C     0.581     0    0.060   0.831     3.007   90.476   84.392
LGA    E    23_C      E    23_C     0.711     0    0.027   0.699     2.484   90.476   84.656
LGA    L    24_C      L    24_C     0.558     0    0.023   0.135     0.609   90.476   95.238
LGA    L    25_C      L    25_C     0.586     0    0.079   0.194     0.749   90.476   92.857
LGA    E    26_C      E    26_C     0.969     0    0.068   0.253     1.216   88.214   87.460
LGA    E    27_C      E    27_C     0.837     0    0.052   0.435     2.469   90.476   86.614
LGA    S    28_C      S    28_C     0.556     0    0.037   0.076     0.672   90.476   93.651
LGA    V    29_C      V    29_C     0.970     0    0.069   0.150     1.681   90.476   85.374
LGA    E    30_C      E    30_C     1.157     0    0.035   0.397     2.784   85.952   76.984
LGA    K    31_C      K    31_C     0.629     0    0.094   0.647     3.456   95.238   79.577
LGA    N    32_C      N    32_C     0.437     0    0.033   0.114     1.585   92.976   87.262
LGA    S    33_C      S    33_C     1.517     0    0.163   0.161     2.432   81.548   75.952
LGA    R    34_C      R    34_C     1.681     0    0.020   0.646     2.205   72.857   77.922
LGA    M    35_C      M    35_C     2.007     0    0.013   1.374     8.924   70.833   50.655
LGA    R    36_C      R    36_C     1.330     0    0.067   0.543     4.083   81.548   65.887
LGA    H    37_C      H    37_C     0.787     0    0.030   1.184     5.841   90.476   64.048
LGA    I    38_C      I    38_C     1.008     0    0.012   0.100     1.714   88.214   82.679
LGA    R    39_C      R    39_C     1.052     0    0.036   1.013     2.445   88.214   79.351
LGA    A    40_C      A    40_C     0.559     0    0.069   0.075     0.658   95.238   96.190
LGA    V    41_C      V    41_C     0.285     0    0.041   0.069     0.477  100.000  100.000
LGA    M    42_C      M    42_C     0.391     0    0.038   0.982     3.224  100.000   87.976
LGA    W    43_C      W    43_C     0.537     0    0.030   0.287     1.775   90.476   86.667
LGA    A    44_C      A    44_C     0.426     0    0.018   0.027     0.476  100.000  100.000
LGA    E    45_C      E    45_C     0.352     0    0.010   0.203     0.773  100.000   98.942
LGA    Y    46_C      Y    46_C     0.417     0    0.012   0.101     0.576  100.000   97.619
LGA    M    47_C      M    47_C     0.772     0    0.016   1.011     1.749   90.476   84.940
LGA    L    48_C      L    48_C     0.776     0    0.037   0.060     1.114   90.476   88.214
LGA    E    49_C      E    49_C     0.672     0    0.046   0.907     2.050   90.476   83.651
LGA    I    50_C      I    50_C     0.836     0    0.046   0.096     1.177   90.476   88.214
LGA    A    51_C      A    51_C     0.850     0    0.080   0.096     0.973   90.476   90.476
LGA    R    52_C      R    52_C     0.508     0    0.074   0.397     1.927   95.238   88.182
LGA    S    53_C      S    53_C     0.284     0    0.057   0.063     0.437  100.000  100.000
LGA    L    54_C      L    54_C     0.395     0    0.010   0.176     1.038  100.000   95.298
LGA    E    55_C      E    55_C     0.380     0    0.042   0.655     2.328  100.000   84.339
LGA    D    56_C      D    56_C     0.416     0    0.044   0.063     0.696   97.619   95.238
LGA    E    57_C      E    57_C     0.360     0    0.013   1.068     4.069  100.000   80.476
LGA    K    58_C      K    58_C     0.546     0    0.052   0.876     2.181   97.619   84.974
LGA    I    59_C      I    59_C     0.490     0    0.033   0.636     1.711  100.000   93.036
LGA    L    60_C      L    60_C     0.488     0    0.032   0.052     0.558  100.000   97.619
LGA    E    61_C      E    61_C     0.556     0    0.010   0.875     2.602   92.857   80.159
LGA    I    62_C      I    62_C     0.266     0    0.040   0.237     0.634  100.000   98.810
LGA    A    63_C      A    63_C     0.320     0    0.011   0.020     0.371  100.000  100.000
LGA    E    64_C      E    64_C     0.446     0    0.048   0.630     1.495   97.619   89.630
LGA    K    65_C      K    65_C     0.300     0    0.012   0.094     0.570  100.000   98.942
LGA    L    66_C      L    66_C     0.151     0    0.034   0.151     1.024  100.000   95.298
LGA    E    67_C      E    67_C     0.351     0    0.021   0.367     0.821  100.000   96.825
LGA    K    68_C      K    68_C     0.376     0    0.089   1.378     7.363   97.619   72.169
LGA    A    69_C      A    69_C     0.362     0    0.076   0.090     0.401  100.000  100.000
LGA    L    70_C      L    70_C     0.487     0    0.065   0.131     0.618   92.857   94.048
LGA    P    71_C      P    71_C     0.526     0    0.073   0.132     1.052   90.595   91.905
LGA    E    72_C      E    72_C     0.380     0    0.115   0.917     4.375  100.000   82.434
LGA    K    73_C      K    73_C     0.460     0    0.231   0.265     1.517   88.452   89.630
LGA    S    74_C      S    74_C     1.080     0    0.025   0.600     3.727   85.952   76.667
LGA    K    75_C      K    75_C     0.388     0    0.042   0.759     4.057  100.000   79.630
LGA    M    76_C      M    76_C     0.588     0    0.063   0.723     1.871   92.857   88.333
LGA    F    77_C      F    77_C     0.844     0    0.035   0.531     1.919   90.476   85.584
LGA    T    78_C      T    78_C     0.661     0    0.037   0.071     0.848   90.476   90.476
LGA    K    79_C      K    79_C     0.553     0    0.040   0.586     1.886   92.857   90.635
LGA    E    80_C      E    80_C     0.886     0    0.045   0.182     2.038   90.476   82.698
LGA    E    81_C      E    81_C     0.734     0    0.032   0.664     2.122   90.476   85.608
LGA    Y    82_C      Y    82_C     0.214     0    0.069   0.113     0.537  100.000   98.413
LGA    E    83_C      E    83_C     0.233     0    0.044   0.236     0.935  100.000   98.942
LGA    K    84_C      K    84_C     0.402     0    0.010   0.987     5.415  100.000   79.365
LGA    L    85_C      L    85_C     0.405     0    0.025   1.297     3.092  100.000   85.833
LGA    M    86_C      M    86_C     0.371     0    0.062   0.868     2.510  100.000   92.262
LGA    E    87_C      E    87_C     0.082     0    0.023   0.213     0.820  100.000   98.942
LGA    V    88_C      V    88_C     0.115     0    0.019   0.103     0.302  100.000  100.000
LGA    L    89_C      L    89_C     0.222     0    0.043   0.115     0.456  100.000  100.000
LGA    E    90_C      E    90_C     0.199     0    0.078   0.926     4.247  100.000   82.698
LGA    E    91_C      E    91_C     0.205     0    0.020   0.090     0.547  100.000   98.942
LGA    L    92_C      L    92_C     0.040     0    0.022   0.078     0.412  100.000  100.000
LGA    E    93_C      E    93_C     0.092     0    0.071   0.464     1.625  100.000   95.926
LGA    E    94_C      E    94_C     0.290     0    0.012   0.073     0.704  100.000   96.825
LGA    V    95_C      V    95_C     0.253     0    0.022   0.080     0.310  100.000  100.000
LGA    L    96_C      L    96_C     0.390     0    0.019   0.085     0.563  100.000   98.810
LGA    E    97_C      E    97_C     0.417     0    0.091   0.182     0.917  100.000   96.825
LGA    E    98_C      E    98_C     0.647     0    0.012   0.070     1.024   92.857   90.529
LGA    K    99_C      K    99_C     0.476     0    0.040   1.002     4.671   97.619   80.635
LGA    K   100_C      K   100_C     0.221     0    0.050   0.131     1.794  100.000   91.799
LGA    E   101_C      E   101_C     0.530     0    0.050   0.869     3.324   95.238   77.831
LGA    E   102_C      E   102_C     0.219     0    0.043   0.749     2.542  100.000   83.492
LGA    V   103_C      V   103_C     0.241     0    0.017   0.053     0.694   97.619   97.279
LGA    E   104_C      E   104_C     0.535     0    0.088   0.225     1.050   90.595   90.529
LGA    E   105_C      E   105_C     0.802     0    0.030   0.271     2.219   90.476   83.704
LGA    R   106_C      R   106_C     0.641     0    0.017   0.951     3.580   90.476   81.558
LGA    I   107_C      I   107_C     0.746     0    0.118   0.205     0.953   90.476   91.667
LGA    E   108_C      E   108_C     1.074     0    0.459   0.473     3.249   73.690   79.153
LGA    G   109_C      G   109_C     0.526     0    0.597   0.597     1.347   90.595   90.595

# RMSD_GDC results:       CA      MC common percent     ALL common percent   GDC_mc  GDC_all
NUMBER_OF_ATOMS_AA:      108     432    432  100.00     908    908  100.00               108
SUMMARY(RMSD_GDC):     0.625          0.638                  1.357           94.940   88.928

#CA            N1   N2   DIST      N    RMSD    GDT_TS    LGA_S3     LGA_Q 
SUMMARY(GDT)  115  108    4.0    108    0.63    98.380    99.350    14.887

LGA_LOCAL      RMSD:   0.625  Number of atoms:  108  under DIST:   4.00
LGA_ASGN_ATOMS RMSD:   0.625  Number of assigned atoms:  108 
Std_ASGN_ATOMS RMSD:   0.625  Standard rmsd on all 108 assigned CA atoms 

Unitary ROTATION matrix and the SHIFT vector superimpose molecules  (1=>2)
  X_new =  -0.139011 * X  +  -0.889804 * Y  +   0.434655 * Z  +  15.328903
  Y_new =   0.988194 * X  +  -0.096094 * Y  +   0.119323 * Z  +  -0.747680
  Z_new =  -0.064407 * X  +   0.446111 * Y  +   0.892657 * Z  +  -9.642735 

Euler angles from the ROTATION matrix. Conventions XYZ and ZXZ:
           Phi     Theta       Psi   [DEG:       Phi     Theta       Psi ]
XYZ:  1.710551  0.064451  0.463453   [DEG:   98.0073    3.6928   26.5539 ]
ZXZ:  1.838720  0.467590 -0.143383   [DEG:  105.3509   26.7909   -8.2152 ]
 
# END of job
