
#######################################################
#                                                     #
#                        LGA                          #
#                  ---------------                    #
#                                                     #
#               Local-Global Alignment                #
#        A Method for Finding 3-D Similarities        #
#               in Protein Structures                 #
#                                                     #
#                  ------------ 10/2009               #
#                                                     #
#      Adam Zemla (adamz@llnl.gov)                    #
#      Lawrence Livermore National Laboratory, CA     #
#                                                     #
#######################################################

!!!   License for LGA program has expired  !!!
#   For updated version of the LGA program   #
# please contact Adam Zemla:  adamz@llnl.gov #

# Molecule1: number of CA atoms  115 (  972),  selected  108 , name one
# Molecule2: number of CA atoms  108 (  908),  selected  108 , name two
# PARAMETERS: input.pdb  -ie  -3  -d:4  -sda  -swap  -ch1:C  -ch2:C  
# FIXED Atom-Atom correspondence
# GDT and LCS analysis 

LCS - RMSD CUTOFF   5.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:   108       2_C - 109_C       0.60     0.60
  LCS_AVERAGE:    100.00

LCS - RMSD CUTOFF   2.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:   108       2_C - 109_C       0.60     0.60
  LCS_AVERAGE:    100.00

LCS - RMSD CUTOFF   1.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:   108       2_C - 109_C       0.60     0.60
  LCS_AVERAGE:    100.00

LCS_GDT    MOLECULE-1    MOLECULE-2     LCS_DETAILS     GDT_DETAILS                                                    TOTAL NUMBER OF RESIDUE PAIRS:  108
LCS_GDT     RESIDUE       RESIDUE       SEGMENT_SIZE    GLOBAL DISTANCE TEST COLUMNS: number of residues under the threshold assigned to each residue pair
LCS_GDT   NAME NUMBER   NAME NUMBER    1.0  2.0  5.0    0.5  1.0  1.5  2.0  2.5  3.0  3.5  4.0  4.5  5.0  5.5  6.0  6.5  7.0  7.5  8.0  8.5  9.0  9.5 10.0
LCS_GDT     L     2_C     L     2_C    108  108  108     71  101  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     P     3_C     P     3_C    108  108  108     71  101  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     D     4_C     D     4_C    108  108  108     71  101  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E     5_C     E     5_C    108  108  108     71  101  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E     6_C     E     6_C    108  108  108     71  101  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K     7_C     K     7_C    108  108  108     71  101  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L     8_C     L     8_C    108  108  108     71  101  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K     9_C     K     9_C    108  108  108     71  101  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    10_C     L    10_C    108  108  108     71  101  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    11_C     L    11_C    108  108  108     71  101  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     D    12_C     D    12_C    108  108  108     71  101  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     T    13_C     T    13_C    108  108  108     71  101  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    14_C     L    14_C    108  108  108     71  101  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    15_C     L    15_C    108  108  108     71  101  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     T    16_C     T    16_C    108  108  108     71  101  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     M    17_C     M    17_C    108  108  108     71  101  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     V    18_C     V    18_C    108  108  108     71  101  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    19_C     E    19_C    108  108  108     71  101  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     W    20_C     W    20_C    108  108  108     71  101  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     V    21_C     V    21_C    108  108  108     71  101  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K    22_C     K    22_C    108  108  108     71  101  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    23_C     E    23_C    108  108  108     70  101  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    24_C     L    24_C    108  108  108     71  101  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    25_C     L    25_C    108  108  108     71  101  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    26_C     E    26_C    108  108  108     64  101  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    27_C     E    27_C    108  108  108     52  101  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     S    28_C     S    28_C    108  108  108     71  101  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     V    29_C     V    29_C    108  108  108     68  101  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    30_C     E    30_C    108  108  108     52  101  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K    31_C     K    31_C    108  108  108     52  101  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     N    32_C     N    32_C    108  108  108     71  101  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     S    33_C     S    33_C    108  108  108     11   74  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     R    34_C     R    34_C    108  108  108     11   78  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     M    35_C     M    35_C    108  108  108     11   74  103  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     R    36_C     R    36_C    108  108  108     27   78  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     H    37_C     H    37_C    108  108  108     45  101  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     I    38_C     I    38_C    108  108  108     30   99  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     R    39_C     R    39_C    108  108  108     27   99  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A    40_C     A    40_C    108  108  108     62  101  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     V    41_C     V    41_C    108  108  108     71  101  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     M    42_C     M    42_C    108  108  108     71  101  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     W    43_C     W    43_C    108  108  108     70  101  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A    44_C     A    44_C    108  108  108     71  101  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    45_C     E    45_C    108  108  108     71  101  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     Y    46_C     Y    46_C    108  108  108     71  101  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     M    47_C     M    47_C    108  108  108     45  101  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    48_C     L    48_C    108  108  108     56  101  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    49_C     E    49_C    108  108  108     29  101  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     I    50_C     I    50_C    108  108  108     43  101  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A    51_C     A    51_C    108  108  108     45  101  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     R    52_C     R    52_C    108  108  108     71  101  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     S    53_C     S    53_C    108  108  108     71  101  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    54_C     L    54_C    108  108  108     71  101  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    55_C     E    55_C    108  108  108     71  101  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     D    56_C     D    56_C    108  108  108     71  101  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    57_C     E    57_C    108  108  108     71  101  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K    58_C     K    58_C    108  108  108     71  101  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     I    59_C     I    59_C    108  108  108     71  101  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    60_C     L    60_C    108  108  108     71  101  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    61_C     E    61_C    108  108  108     71  101  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     I    62_C     I    62_C    108  108  108     71  101  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A    63_C     A    63_C    108  108  108     71  101  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    64_C     E    64_C    108  108  108     71  101  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K    65_C     K    65_C    108  108  108     71  101  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    66_C     L    66_C    108  108  108     71  101  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    67_C     E    67_C    108  108  108     71  101  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K    68_C     K    68_C    108  108  108     71  101  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A    69_C     A    69_C    108  108  108     70  101  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    70_C     L    70_C    108  108  108     70  101  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     P    71_C     P    71_C    108  108  108     71  101  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    72_C     E    72_C    108  108  108     71  101  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K    73_C     K    73_C    108  108  108     71  101  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     S    74_C     S    74_C    108  108  108     36  101  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K    75_C     K    75_C    108  108  108     71  101  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     M    76_C     M    76_C    108  108  108     71  101  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     F    77_C     F    77_C    108  108  108     63  101  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     T    78_C     T    78_C    108  108  108     70  101  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K    79_C     K    79_C    108  108  108     71  101  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    80_C     E    80_C    108  108  108     51  101  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    81_C     E    81_C    108  108  108     51  101  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     Y    82_C     Y    82_C    108  108  108     71  101  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    83_C     E    83_C    108  108  108     71  101  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K    84_C     K    84_C    108  108  108     71  101  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    85_C     L    85_C    108  108  108     71  101  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     M    86_C     M    86_C    108  108  108     71  101  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    87_C     E    87_C    108  108  108     71  101  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     V    88_C     V    88_C    108  108  108     71  101  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    89_C     L    89_C    108  108  108     71  101  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    90_C     E    90_C    108  108  108     71  101  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    91_C     E    91_C    108  108  108     71  101  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    92_C     L    92_C    108  108  108     71  101  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    93_C     E    93_C    108  108  108     71  101  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    94_C     E    94_C    108  108  108     71  101  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     V    95_C     V    95_C    108  108  108     71  101  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    96_C     L    96_C    108  108  108     71  101  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    97_C     E    97_C    108  108  108     71  101  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    98_C     E    98_C    108  108  108     60  101  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K    99_C     K    99_C    108  108  108     71  101  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K   100_C     K   100_C    108  108  108     71  101  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E   101_C     E   101_C    108  108  108     71  101  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E   102_C     E   102_C    108  108  108     71  101  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     V   103_C     V   103_C    108  108  108     71  101  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E   104_C     E   104_C    108  108  108     71  101  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E   105_C     E   105_C    108  108  108     40  101  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     R   106_C     R   106_C    108  108  108     41  101  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     I   107_C     I   107_C    108  108  108     46  101  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E   108_C     E   108_C    108  108  108     40  101  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     G   109_C     G   109_C    108  108  108     46  101  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_AVERAGE  LCS_A: 100.00  ( 100.00  100.00  100.00 )

GLOBAL_DISTANCE_TEST (summary information about detected largest sets of residues (represented by selected AToms) that can fit under specified thresholds)
GDT DIST_CUTOFF  0.50   1.00   1.50   2.00   2.50   3.00   3.50   4.00   4.50   5.00   5.50   6.00   6.50   7.00   7.50   8.00   8.50   9.00   9.50  10.00
GDT NUMBER_AT     71    101    106    108    108    108    108    108    108    108    108    108    108    108    108    108    108    108    108    108 
GDT PERCENT_AT  65.74  93.52  98.15 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00
GDT RMS_LOCAL    0.34   0.48   0.55   0.60   0.60   0.60   0.60   0.60   0.60   0.60   0.60   0.60   0.60   0.60   0.60   0.60   0.60   0.60   0.60   0.60
GDT RMS_ALL_AT   0.64   0.62   0.61   0.60   0.60   0.60   0.60   0.60   0.60   0.60   0.60   0.60   0.60   0.60   0.60   0.60   0.60   0.60   0.60   0.60

# Checking swapping
#   possible swapping detected:  E     5_C      E     5_C
#   possible swapping detected:  E     6_C      E     6_C
#   possible swapping detected:  E    19_C      E    19_C
#   possible swapping detected:  E    23_C      E    23_C
#   possible swapping detected:  E    26_C      E    26_C
#   possible swapping detected:  E    27_C      E    27_C
#   possible swapping detected:  E    30_C      E    30_C
#   possible swapping detected:  E    45_C      E    45_C
#   possible swapping detected:  Y    46_C      Y    46_C
#   possible swapping detected:  D    56_C      D    56_C
#   possible swapping detected:  E    72_C      E    72_C
#   possible swapping detected:  E    80_C      E    80_C
#   possible swapping detected:  E    81_C      E    81_C
#   possible swapping detected:  Y    82_C      Y    82_C
#   possible swapping detected:  E    83_C      E    83_C
#   possible swapping detected:  E    87_C      E    87_C
#   possible swapping detected:  E    90_C      E    90_C
#   possible swapping detected:  E    91_C      E    91_C
#   possible swapping detected:  E    93_C      E    93_C
#   possible swapping detected:  E    94_C      E    94_C
#   possible swapping detected:  E    97_C      E    97_C
#   possible swapping detected:  E    98_C      E    98_C
#   possible swapping detected:  E   102_C      E   102_C
#   possible swapping detected:  E   104_C      E   104_C
#   possible swapping detected:  E   105_C      E   105_C
#   possible swapping detected:  E   108_C      E   108_C

#      Molecule1      Molecule2  DISTANCE    Mis    MC     All    Dist_max   GDC_mc  GDC_all
LGA    L     2_C      L     2_C     0.458     0    0.079   0.284     1.407   97.619   95.298
LGA    P     3_C      P     3_C     0.482     0    0.027   0.034     0.651  100.000   95.918
LGA    D     4_C      D     4_C     0.283     0    0.080   0.157     0.502   97.619   98.810
LGA    E     5_C      E     5_C     0.339     0    0.094   0.922     3.673   97.619   82.328
LGA    E     6_C      E     6_C     0.408     0    0.063   0.817     4.169  100.000   83.069
LGA    K     7_C      K     7_C     0.322     0    0.040   0.267     1.774  100.000   94.868
LGA    L     8_C      L     8_C     0.304     0    0.050   0.065     0.441  100.000  100.000
LGA    K     9_C      K     9_C     0.468     0    0.042   0.761     2.245  100.000   89.894
LGA    L    10_C      L    10_C     0.515     0    0.015   1.291     2.722   95.238   84.345
LGA    L    11_C      L    11_C     0.365     0    0.074   0.093     0.450  100.000  100.000
LGA    D    12_C      D    12_C     0.343     0    0.041   0.123     0.616  100.000   97.619
LGA    T    13_C      T    13_C     0.359     0    0.020   0.054     0.430  100.000  100.000
LGA    L    14_C      L    14_C     0.530     0    0.022   0.148     0.992   97.619   95.238
LGA    L    15_C      L    15_C     0.416     0    0.066   0.126     0.445  100.000  100.000
LGA    T    16_C      T    16_C     0.395     0    0.020   1.021     2.108  100.000   89.728
LGA    M    17_C      M    17_C     0.460     0    0.034   0.741     2.165  100.000   92.024
LGA    V    18_C      V    18_C     0.535     0    0.048   0.057     0.761   92.857   91.837
LGA    E    19_C      E    19_C     0.533     0    0.035   0.806     2.706   90.476   83.810
LGA    W    20_C      W    20_C     0.559     0    0.020   1.622     6.004   90.476   55.408
LGA    V    21_C      V    21_C     0.516     0    0.058   0.064     0.544   95.238   93.197
LGA    K    22_C      K    22_C     0.524     0    0.061   0.830     2.878   90.476   85.185
LGA    E    23_C      E    23_C     0.618     0    0.040   0.088     1.020   90.476   89.471
LGA    L    24_C      L    24_C     0.569     0    0.035   0.127     0.588   90.476   95.238
LGA    L    25_C      L    25_C     0.524     0    0.053   0.192     0.659   90.476   94.048
LGA    E    26_C      E    26_C     0.855     0    0.075   0.252     1.019   88.214   90.529
LGA    E    27_C      E    27_C     0.874     0    0.076   0.545     2.563   92.857   84.815
LGA    S    28_C      S    28_C     0.511     0    0.059   0.437     1.685   92.857   89.127
LGA    V    29_C      V    29_C     0.894     0    0.058   0.145     1.634   90.476   86.667
LGA    E    30_C      E    30_C     1.076     0    0.045   0.353     2.640   85.952   77.884
LGA    K    31_C      K    31_C     0.617     0    0.094   0.638     3.411   95.238   79.577
LGA    N    32_C      N    32_C     0.386     0    0.040   0.111     1.455   92.976   88.333
LGA    S    33_C      S    33_C     1.490     0    0.170   0.169     2.405   83.690   78.730
LGA    R    34_C      R    34_C     1.642     0    0.016   0.646     2.090   72.857   78.788
LGA    M    35_C      M    35_C     1.970     0    0.013   1.403     9.024   72.857   51.488
LGA    R    36_C      R    36_C     1.306     0    0.057   0.259     3.849   81.548   70.519
LGA    H    37_C      H    37_C     0.790     0    0.030   1.133     5.668   90.476   64.524
LGA    I    38_C      I    38_C     1.076     0    0.011   0.108     1.765   85.952   81.548
LGA    R    39_C      R    39_C     1.085     0    0.027   1.006     2.595   85.952   77.836
LGA    A    40_C      A    40_C     0.530     0    0.062   0.068     0.659   95.238   96.190
LGA    V    41_C      V    41_C     0.315     0    0.048   0.061     0.507  100.000   98.639
LGA    M    42_C      M    42_C     0.425     0    0.037   0.984     3.287  100.000   86.964
LGA    W    43_C      W    43_C     0.499     0    0.030   0.390     2.270  100.000   88.197
LGA    A    44_C      A    44_C     0.369     0    0.017   0.026     0.424  100.000  100.000
LGA    E    45_C      E    45_C     0.239     0    0.011   0.271     1.004  100.000   97.937
LGA    Y    46_C      Y    46_C     0.368     0    0.014   0.173     0.787  100.000   96.825
LGA    M    47_C      M    47_C     0.667     0    0.015   1.028     1.817   90.476   84.940
LGA    L    48_C      L    48_C     0.668     0    0.028   0.042     1.003   90.476   89.345
LGA    E    49_C      E    49_C     0.680     0    0.047   0.928     2.074   90.476   83.651
LGA    I    50_C      I    50_C     0.820     0    0.043   0.077     1.103   90.476   89.345
LGA    A    51_C      A    51_C     0.748     0    0.075   0.092     0.748   90.476   90.476
LGA    R    52_C      R    52_C     0.451     0    0.069   0.410     1.737   97.619   91.558
LGA    S    53_C      S    53_C     0.264     0    0.055   0.058     0.360  100.000  100.000
LGA    L    54_C      L    54_C     0.367     0    0.011   0.154     0.716  100.000   97.619
LGA    E    55_C      E    55_C     0.364     0    0.027   0.664     2.230  100.000   87.037
LGA    D    56_C      D    56_C     0.339     0    0.039   0.145     0.691   97.619   97.619
LGA    E    57_C      E    57_C     0.280     0    0.018   1.064     4.003  100.000   80.476
LGA    K    58_C      K    58_C     0.468     0    0.043   0.878     2.164  100.000   86.931
LGA    I    59_C      I    59_C     0.382     0    0.033   0.626     1.777  100.000   95.417
LGA    L    60_C      L    60_C     0.443     0    0.038   0.060     0.535  100.000   98.810
LGA    E    61_C      E    61_C     0.496     0    0.011   0.856     2.477  100.000   85.079
LGA    I    62_C      I    62_C     0.148     0    0.040   0.243     0.734  100.000   98.810
LGA    A    63_C      A    63_C     0.239     0    0.015   0.026     0.294  100.000  100.000
LGA    E    64_C      E    64_C     0.326     0    0.051   0.629     1.515  100.000   91.799
LGA    K    65_C      K    65_C     0.217     0    0.013   0.089     0.529  100.000   98.942
LGA    L    66_C      L    66_C     0.219     0    0.035   0.158     1.148  100.000   95.298
LGA    E    67_C      E    67_C     0.259     0    0.023   0.347     0.711  100.000   97.884
LGA    K    68_C      K    68_C     0.379     0    0.095   1.373     7.370   97.619   72.169
LGA    A    69_C      A    69_C     0.469     0    0.057   0.072     0.507   97.619   98.095
LGA    L    70_C      L    70_C     0.481     0    0.051   0.083     0.642   97.619   97.619
LGA    P    71_C      P    71_C     0.407     0    0.090   0.130     0.781   97.619   98.639
LGA    E    72_C      E    72_C     0.320     0    0.104   0.910     4.705   97.619   78.095
LGA    K    73_C      K    73_C     0.547     0    0.248   0.229     1.833   88.452   89.630
LGA    S    74_C      S    74_C     1.468     0    0.028   0.565     4.057   79.286   69.841
LGA    K    75_C      K    75_C     0.490     0    0.028   0.779     3.877   97.619   79.259
LGA    M    76_C      M    76_C     0.396     0    0.067   0.721     2.298   97.619   92.024
LGA    F    77_C      F    77_C     0.628     0    0.037   0.635     2.566   90.476   81.948
LGA    T    78_C      T    78_C     0.467     0    0.032   0.071     0.618   97.619   97.279
LGA    K    79_C      K    79_C     0.390     0    0.046   0.596     2.020   97.619   92.910
LGA    E    80_C      E    80_C     0.785     0    0.044   0.209     2.105   90.476   82.698
LGA    E    81_C      E    81_C     0.647     0    0.043   0.653     2.180   92.857   85.714
LGA    Y    82_C      Y    82_C     0.120     0    0.068   0.132     0.584  100.000   99.206
LGA    E    83_C      E    83_C     0.243     0    0.040   0.210     0.767  100.000   98.942
LGA    K    84_C      K    84_C     0.419     0    0.013   1.000     5.541  100.000   78.836
LGA    L    85_C      L    85_C     0.409     0    0.031   1.305     3.112  100.000   85.833
LGA    M    86_C      M    86_C     0.363     0    0.060   0.850     2.416  100.000   93.214
LGA    E    87_C      E    87_C     0.119     0    0.034   0.244     0.916  100.000   98.942
LGA    V    88_C      V    88_C     0.200     0    0.020   0.132     0.372  100.000  100.000
LGA    L    89_C      L    89_C     0.248     0    0.037   0.127     0.428  100.000  100.000
LGA    E    90_C      E    90_C     0.201     0    0.076   0.931     4.273  100.000   82.698
LGA    E    91_C      E    91_C     0.227     0    0.029   0.129     0.665  100.000   98.942
LGA    L    92_C      L    92_C     0.144     0    0.017   0.079     0.357  100.000  100.000
LGA    E    93_C      E    93_C     0.140     0    0.077   0.408     1.288  100.000   96.878
LGA    E    94_C      E    94_C     0.252     0    0.016   0.090     0.620  100.000   97.884
LGA    V    95_C      V    95_C     0.222     0    0.025   0.080     0.305  100.000  100.000
LGA    L    96_C      L    96_C     0.367     0    0.021   0.083     0.378  100.000  100.000
LGA    E    97_C      E    97_C     0.402     0    0.095   0.166     0.887  100.000   96.825
LGA    E    98_C      E    98_C     0.645     0    0.021   0.064     1.054   92.857   90.529
LGA    K    99_C      K    99_C     0.496     0    0.048   0.989     4.747   97.619   79.630
LGA    K   100_C      K   100_C     0.233     0    0.054   0.142     1.834  100.000   91.799
LGA    E   101_C      E   101_C     0.496     0    0.044   0.884     3.270  100.000   79.101
LGA    E   102_C      E   102_C     0.191     0    0.036   0.794     2.016  100.000   89.947
LGA    V   103_C      V   103_C     0.232     0    0.015   0.055     0.532   97.619   97.279
LGA    E   104_C      E   104_C     0.454     0    0.088   0.218     0.967   95.238   95.767
LGA    E   105_C      E   105_C     0.724     0    0.027   0.231     1.977   90.476   86.508
LGA    R   106_C      R   106_C     0.652     0    0.017   0.402     1.067   90.476   93.117
LGA    I   107_C      I   107_C     0.721     0    0.118   0.201     0.908   90.476   90.476
LGA    E   108_C      E   108_C     0.977     0    0.452   0.465     3.167   78.095   81.111
LGA    G   109_C      G   109_C     0.684     0    0.572   0.572     1.222   90.595   90.595

# RMSD_GDC results:       CA      MC common percent     ALL common percent   GDC_mc  GDC_all
NUMBER_OF_ATOMS_AA:      108     432    432  100.00     908    908  100.00               108
SUMMARY(RMSD_GDC):     0.603          0.615                  1.317           95.509   89.847

#CA            N1   N2   DIST      N    RMSD    GDT_TS    LGA_S3     LGA_Q 
SUMMARY(GDT)  115  108    4.0    108    0.60    98.380    99.350    15.361

LGA_LOCAL      RMSD:   0.603  Number of atoms:  108  under DIST:   4.00
LGA_ASGN_ATOMS RMSD:   0.603  Number of assigned atoms:  108 
Std_ASGN_ATOMS RMSD:   0.603  Standard rmsd on all 108 assigned CA atoms 

Unitary ROTATION matrix and the SHIFT vector superimpose molecules  (1=>2)
  X_new =   0.949225 * X  +  -0.314393 * Y  +  -0.011390 * Z  +  12.433402
  Y_new =  -0.310825 * X  +  -0.942814 * Y  +   0.120376 * Z  +  -1.518928
  Z_new =  -0.048584 * X  +  -0.110723 * Y  +  -0.992663 * Z  +  -9.260777 

Euler angles from the ROTATION matrix. Conventions XYZ and ZXZ:
           Phi     Theta       Psi   [DEG:       Phi     Theta       Psi ]
XYZ: -0.316447  0.048603 -3.030510   [DEG:  -18.1311    2.7847 -173.6354 ]
ZXZ: -3.047254  3.020383 -2.728104   [DEG: -174.5948  173.0552 -156.3089 ]
 
# END of job
