
#######################################################
#                                                     #
#                        LGA                          #
#                  ---------------                    #
#                                                     #
#               Local-Global Alignment                #
#        A Method for Finding 3-D Similarities        #
#               in Protein Structures                 #
#                                                     #
#                  ------------ 10/2009               #
#                                                     #
#      Adam Zemla (adamz@llnl.gov)                    #
#      Lawrence Livermore National Laboratory, CA     #
#                                                     #
#######################################################

!!!   License for LGA program has expired  !!!
#   For updated version of the LGA program   #
# please contact Adam Zemla:  adamz@llnl.gov #

# Molecule1: number of CA atoms  115 (  972),  selected  108 , name one
# Molecule2: number of CA atoms  108 (  908),  selected  108 , name two
# PARAMETERS: input.pdb  -ie  -3  -d:4  -sda  -swap  -ch1:C  -ch2:C  
# FIXED Atom-Atom correspondence
# GDT and LCS analysis 

LCS - RMSD CUTOFF   5.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:   108       2_C - 109_C       0.64     0.64
  LCS_AVERAGE:    100.00

LCS - RMSD CUTOFF   2.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:   108       2_C - 109_C       0.64     0.64
  LCS_AVERAGE:    100.00

LCS - RMSD CUTOFF   1.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:   108       2_C - 109_C       0.64     0.64
  LCS_AVERAGE:    100.00

LCS_GDT    MOLECULE-1    MOLECULE-2     LCS_DETAILS     GDT_DETAILS                                                    TOTAL NUMBER OF RESIDUE PAIRS:  108
LCS_GDT     RESIDUE       RESIDUE       SEGMENT_SIZE    GLOBAL DISTANCE TEST COLUMNS: number of residues under the threshold assigned to each residue pair
LCS_GDT   NAME NUMBER   NAME NUMBER    1.0  2.0  5.0    0.5  1.0  1.5  2.0  2.5  3.0  3.5  4.0  4.5  5.0  5.5  6.0  6.5  7.0  7.5  8.0  8.5  9.0  9.5 10.0
LCS_GDT     L     2_C     L     2_C    108  108  108     70  101  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     P     3_C     P     3_C    108  108  108     70  101  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     D     4_C     D     4_C    108  108  108     70  101  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E     5_C     E     5_C    108  108  108     70  101  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E     6_C     E     6_C    108  108  108     70  101  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K     7_C     K     7_C    108  108  108     70  101  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L     8_C     L     8_C    108  108  108     70  101  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K     9_C     K     9_C    108  108  108     70  101  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    10_C     L    10_C    108  108  108     70  101  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    11_C     L    11_C    108  108  108     70  101  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     D    12_C     D    12_C    108  108  108     70  101  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     T    13_C     T    13_C    108  108  108     70  101  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    14_C     L    14_C    108  108  108     70  101  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    15_C     L    15_C    108  108  108     70  101  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     T    16_C     T    16_C    108  108  108     70  101  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     M    17_C     M    17_C    108  108  108     70  101  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     V    18_C     V    18_C    108  108  108     70  101  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    19_C     E    19_C    108  108  108     70  101  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     W    20_C     W    20_C    108  108  108     70  101  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     V    21_C     V    21_C    108  108  108     70  101  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K    22_C     K    22_C    108  108  108     70  101  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    23_C     E    23_C    108  108  108     68  101  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    24_C     L    24_C    108  108  108     70  101  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    25_C     L    25_C    108  108  108     70  101  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    26_C     E    26_C    108  108  108     54  101  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    27_C     E    27_C    108  108  108     59  101  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     S    28_C     S    28_C    108  108  108     70  101  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     V    29_C     V    29_C    108  108  108     58  101  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    30_C     E    30_C    108  108  108     55  101  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K    31_C     K    31_C    108  108  108     59  101  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     N    32_C     N    32_C    108  108  108     70  101  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     S    33_C     S    33_C    108  108  108     10   53  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     R    34_C     R    34_C    108  108  108     10   91  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     M    35_C     M    35_C    108  108  108     10   53  103  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     R    36_C     R    36_C    108  108  108     21   91  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     H    37_C     H    37_C    108  108  108     41  101  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     I    38_C     I    38_C    108  108  108     41  101  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     R    39_C     R    39_C    108  108  108     21   96  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A    40_C     A    40_C    108  108  108     20  101  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     V    41_C     V    41_C    108  108  108     70  101  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     M    42_C     M    42_C    108  108  108     60  101  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     W    43_C     W    43_C    108  108  108     40  101  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A    44_C     A    44_C    108  108  108     66  101  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    45_C     E    45_C    108  108  108     70  101  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     Y    46_C     Y    46_C    108  108  108     70  101  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     M    47_C     M    47_C    108  108  108     40  101  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    48_C     L    48_C    108  108  108     39  101  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    49_C     E    49_C    108  108  108     32  101  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     I    50_C     I    50_C    108  108  108     36  101  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A    51_C     A    51_C    108  108  108     59  101  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     R    52_C     R    52_C    108  108  108     39  101  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     S    53_C     S    53_C    108  108  108     70  101  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    54_C     L    54_C    108  108  108     70  101  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    55_C     E    55_C    108  108  108     70  101  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     D    56_C     D    56_C    108  108  108     70  101  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    57_C     E    57_C    108  108  108     70  101  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K    58_C     K    58_C    108  108  108     70  101  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     I    59_C     I    59_C    108  108  108     70  101  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    60_C     L    60_C    108  108  108     70  101  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    61_C     E    61_C    108  108  108     70  101  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     I    62_C     I    62_C    108  108  108     70  101  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A    63_C     A    63_C    108  108  108     70  101  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    64_C     E    64_C    108  108  108     70  101  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K    65_C     K    65_C    108  108  108     70  101  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    66_C     L    66_C    108  108  108     70  101  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    67_C     E    67_C    108  108  108     70  101  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K    68_C     K    68_C    108  108  108     70  101  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A    69_C     A    69_C    108  108  108     69  101  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    70_C     L    70_C    108  108  108     41  101  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     P    71_C     P    71_C    108  108  108     40  101  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    72_C     E    72_C    108  108  108     40  101  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K    73_C     K    73_C    108  108  108     12  101  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     S    74_C     S    74_C    108  108  108     34  100  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K    75_C     K    75_C    108  108  108     70  101  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     M    76_C     M    76_C    108  108  108     56  101  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     F    77_C     F    77_C    108  108  108     41  101  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     T    78_C     T    78_C    108  108  108     41  101  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K    79_C     K    79_C    108  108  108     41  100  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    80_C     E    80_C    108  108  108     41  101  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    81_C     E    81_C    108  108  108     60  101  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     Y    82_C     Y    82_C    108  108  108     70  101  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    83_C     E    83_C    108  108  108     70  101  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K    84_C     K    84_C    108  108  108     70  101  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    85_C     L    85_C    108  108  108     70  101  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     M    86_C     M    86_C    108  108  108     70  101  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    87_C     E    87_C    108  108  108     70  101  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     V    88_C     V    88_C    108  108  108     70  101  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    89_C     L    89_C    108  108  108     70  101  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    90_C     E    90_C    108  108  108     70  101  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    91_C     E    91_C    108  108  108     70  101  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    92_C     L    92_C    108  108  108     70  101  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    93_C     E    93_C    108  108  108     70  101  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    94_C     E    94_C    108  108  108     70  101  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     V    95_C     V    95_C    108  108  108     70  101  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    96_C     L    96_C    108  108  108     70  101  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    97_C     E    97_C    108  108  108     70  101  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    98_C     E    98_C    108  108  108     70  101  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K    99_C     K    99_C    108  108  108     70  101  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K   100_C     K   100_C    108  108  108     70  101  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E   101_C     E   101_C    108  108  108     70  101  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E   102_C     E   102_C    108  108  108     70  101  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     V   103_C     V   103_C    108  108  108     70  101  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E   104_C     E   104_C    108  108  108     70  101  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E   105_C     E   105_C    108  108  108     59  101  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     R   106_C     R   106_C    108  108  108     59  101  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     I   107_C     I   107_C    108  108  108     70  101  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E   108_C     E   108_C    108  108  108     59  101  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     G   109_C     G   109_C    108  108  108     70  101  106  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_AVERAGE  LCS_A: 100.00  ( 100.00  100.00  100.00 )

GLOBAL_DISTANCE_TEST (summary information about detected largest sets of residues (represented by selected AToms) that can fit under specified thresholds)
GDT DIST_CUTOFF  0.50   1.00   1.50   2.00   2.50   3.00   3.50   4.00   4.50   5.00   5.50   6.00   6.50   7.00   7.50   8.00   8.50   9.00   9.50  10.00
GDT NUMBER_AT     70    101    106    108    108    108    108    108    108    108    108    108    108    108    108    108    108    108    108    108 
GDT PERCENT_AT  64.81  93.52  98.15 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00
GDT RMS_LOCAL    0.33   0.53   0.59   0.64   0.64   0.64   0.64   0.64   0.64   0.64   0.64   0.64   0.64   0.64   0.64   0.64   0.64   0.64   0.64   0.64
GDT RMS_ALL_AT   0.69   0.65   0.64   0.64   0.64   0.64   0.64   0.64   0.64   0.64   0.64   0.64   0.64   0.64   0.64   0.64   0.64   0.64   0.64   0.64

# Checking swapping
#   possible swapping detected:  E     5_C      E     5_C
#   possible swapping detected:  E     6_C      E     6_C
#   possible swapping detected:  E    19_C      E    19_C
#   possible swapping detected:  E    26_C      E    26_C
#   possible swapping detected:  E    27_C      E    27_C
#   possible swapping detected:  E    30_C      E    30_C
#   possible swapping detected:  E    45_C      E    45_C
#   possible swapping detected:  Y    46_C      Y    46_C
#   possible swapping detected:  D    56_C      D    56_C
#   possible swapping detected:  E    72_C      E    72_C
#   possible swapping detected:  E    81_C      E    81_C
#   possible swapping detected:  Y    82_C      Y    82_C
#   possible swapping detected:  E    83_C      E    83_C
#   possible swapping detected:  E    87_C      E    87_C
#   possible swapping detected:  E    90_C      E    90_C
#   possible swapping detected:  E    91_C      E    91_C
#   possible swapping detected:  E    93_C      E    93_C
#   possible swapping detected:  E    94_C      E    94_C
#   possible swapping detected:  E    97_C      E    97_C
#   possible swapping detected:  E    98_C      E    98_C
#   possible swapping detected:  E   104_C      E   104_C
#   possible swapping detected:  E   105_C      E   105_C
#   possible swapping detected:  E   108_C      E   108_C

#      Molecule1      Molecule2  DISTANCE    Mis    MC     All    Dist_max   GDC_mc  GDC_all
LGA    L     2_C      L     2_C     0.515     0    0.075   0.390     1.956   92.857   88.333
LGA    P     3_C      P     3_C     0.583     0    0.023   0.030     0.753   95.238   93.197
LGA    D     4_C      D     4_C     0.374     0    0.086   0.142     0.562   97.619   97.619
LGA    E     5_C      E     5_C     0.444     0    0.094   0.987     4.214   97.619   79.524
LGA    E     6_C      E     6_C     0.301     0    0.065   0.803     3.913  100.000   84.815
LGA    K     7_C      K     7_C     0.469     0    0.043   0.731     3.350   97.619   82.487
LGA    L     8_C      L     8_C     0.419     0    0.059   0.065     0.500  100.000  100.000
LGA    K     9_C      K     9_C     0.534     0    0.040   0.749     2.227   90.476   85.661
LGA    L    10_C      L    10_C     0.540     0    0.016   1.290     3.009   90.476   82.083
LGA    L    11_C      L    11_C     0.417     0    0.077   0.093     0.523   95.238   97.619
LGA    D    12_C      D    12_C     0.423     0    0.035   0.118     0.678  100.000   96.429
LGA    T    13_C      T    13_C     0.381     0    0.027   0.053     0.421  100.000  100.000
LGA    L    14_C      L    14_C     0.512     0    0.025   0.142     0.873   97.619   95.238
LGA    L    15_C      L    15_C     0.384     0    0.068   0.122     0.466  100.000  100.000
LGA    T    16_C      T    16_C     0.419     0    0.018   1.007     2.085  100.000   89.728
LGA    M    17_C      M    17_C     0.470     0    0.036   0.740     2.207  100.000   94.405
LGA    V    18_C      V    18_C     0.486     0    0.052   0.066     0.574   92.857   94.558
LGA    E    19_C      E    19_C     0.536     0    0.056   0.805     2.897   90.476   82.857
LGA    W    20_C      W    20_C     0.639     0    0.020   1.592     6.357   90.476   54.660
LGA    V    21_C      V    21_C     0.554     0    0.071   0.074     0.573   92.857   91.837
LGA    K    22_C      K    22_C     0.605     0    0.053   0.353     1.838   90.476   88.677
LGA    E    23_C      E    23_C     0.725     0    0.038   0.929     2.303   90.476   80.847
LGA    L    24_C      L    24_C     0.582     0    0.017   0.136     0.620   90.476   95.238
LGA    L    25_C      L    25_C     0.628     0    0.073   0.197     0.798   90.476   91.667
LGA    E    26_C      E    26_C     1.092     0    0.077   0.695     3.307   83.690   77.989
LGA    E    27_C      E    27_C     1.034     0    0.081   0.541     2.484   85.952   81.587
LGA    S    28_C      S    28_C     0.687     0    0.032   0.063     0.798   90.476   90.476
LGA    V    29_C      V    29_C     1.054     0    0.076   0.163     1.773   85.952   82.789
LGA    E    30_C      E    30_C     1.267     0    0.044   0.417     2.787   83.690   75.979
LGA    K    31_C      K    31_C     0.749     0    0.095   0.638     3.802   92.857   75.979
LGA    N    32_C      N    32_C     0.455     0    0.045   0.072     1.868   92.976   87.262
LGA    S    33_C      S    33_C     1.605     0    0.164   0.162     2.613   81.548   74.683
LGA    R    34_C      R    34_C     1.702     0    0.018   0.644     2.192   72.857   77.922
LGA    M    35_C      M    35_C     2.029     0    0.013   0.750     6.458   70.833   52.857
LGA    R    36_C      R    36_C     1.345     0    0.063   0.252     3.909   81.548   69.784
LGA    H    37_C      H    37_C     0.740     0    0.035   1.108     5.911   90.476   64.048
LGA    I    38_C      I    38_C     1.046     0    0.011   0.105     1.755   88.214   82.679
LGA    R    39_C      R    39_C     1.133     0    0.029   0.993     2.509   85.952   77.836
LGA    A    40_C      A    40_C     0.699     0    0.075   0.082     0.783   90.476   90.476
LGA    V    41_C      V    41_C     0.484     0    0.041   0.069     0.515   97.619   97.279
LGA    M    42_C      M    42_C     0.476     0    0.034   0.973     3.217   95.238   85.595
LGA    W    43_C      W    43_C     0.641     0    0.032   0.411     2.508   90.476   83.129
LGA    A    44_C      A    44_C     0.558     0    0.027   0.036     0.591   90.476   92.381
LGA    E    45_C      E    45_C     0.462     0    0.010   0.208     0.770   95.238   95.767
LGA    Y    46_C      Y    46_C     0.467     0    0.016   0.189     0.727   97.619   96.825
LGA    M    47_C      M    47_C     0.722     0    0.017   1.012     2.010   90.476   85.000
LGA    L    48_C      L    48_C     0.816     0    0.031   0.051     1.113   90.476   88.214
LGA    E    49_C      E    49_C     0.824     0    0.046   0.928     1.875   90.476   84.550
LGA    I    50_C      I    50_C     0.790     0    0.052   0.132     1.013   90.476   89.345
LGA    A    51_C      A    51_C     0.723     0    0.079   0.098     0.753   90.476   90.476
LGA    R    52_C      R    52_C     0.592     0    0.077   0.425     2.041   92.857   86.580
LGA    S    53_C      S    53_C     0.294     0    0.044   0.047     0.436  100.000  100.000
LGA    L    54_C      L    54_C     0.345     0    0.032   0.147     0.751  100.000   98.810
LGA    E    55_C      E    55_C     0.311     0    0.014   0.681     2.349  100.000   84.339
LGA    D    56_C      D    56_C     0.343     0    0.039   0.173     0.687   97.619   97.619
LGA    E    57_C      E    57_C     0.245     0    0.020   1.062     3.911  100.000   82.011
LGA    K    58_C      K    58_C     0.495     0    0.050   0.882     2.242  100.000   86.032
LGA    I    59_C      I    59_C     0.399     0    0.023   0.622     1.825  100.000   95.417
LGA    L    60_C      L    60_C     0.439     0    0.035   0.064     0.517  100.000   98.810
LGA    E    61_C      E    61_C     0.486     0    0.011   0.850     2.464  100.000   83.280
LGA    I    62_C      I    62_C     0.247     0    0.041   0.238     0.557  100.000   98.810
LGA    A    63_C      A    63_C     0.240     0    0.012   0.025     0.299  100.000  100.000
LGA    E    64_C      E    64_C     0.326     0    0.047   0.634     1.516  100.000   90.794
LGA    K    65_C      K    65_C     0.259     0    0.013   0.094     0.517  100.000   98.942
LGA    L    66_C      L    66_C     0.160     0    0.044   0.170     1.155  100.000   95.298
LGA    E    67_C      E    67_C     0.308     0    0.019   0.362     0.838  100.000   96.825
LGA    K    68_C      K    68_C     0.391     0    0.070   1.378     7.292   97.619   72.169
LGA    A    69_C      A    69_C     0.397     0    0.081   0.096     0.475  100.000  100.000
LGA    L    70_C      L    70_C     0.623     0    0.053   0.091     0.674   90.476   90.476
LGA    P    71_C      P    71_C     0.764     0    0.082   0.147     1.240   88.214   89.184
LGA    E    72_C      E    72_C     0.629     0    0.105   0.918     3.795   90.476   76.296
LGA    K    73_C      K    73_C     0.655     0    0.202   0.280     1.478   88.214   87.460
LGA    S    74_C      S    74_C     1.153     0    0.033   0.610     3.914   88.333   78.254
LGA    K    75_C      K    75_C     0.396     0    0.027   0.796     4.266  100.000   79.101
LGA    M    76_C      M    76_C     0.545     0    0.077   0.711     2.561   92.857   85.298
LGA    F    77_C      F    77_C     0.880     0    0.032   0.619     2.369   88.214   82.468
LGA    T    78_C      T    78_C     0.757     0    0.040   0.077     0.800   90.476   90.476
LGA    K    79_C      K    79_C     0.855     0    0.056   0.596     1.588   92.857   87.566
LGA    E    80_C      E    80_C     0.751     0    0.059   0.814     2.750   90.476   80.847
LGA    E    81_C      E    81_C     0.480     0    0.036   0.646     2.275   97.619   87.831
LGA    Y    82_C      Y    82_C     0.255     0    0.073   0.103     0.701  100.000   97.619
LGA    E    83_C      E    83_C     0.093     0    0.040   0.207     0.683  100.000   97.884
LGA    K    84_C      K    84_C     0.279     0    0.014   1.012     5.340  100.000   80.423
LGA    L    85_C      L    85_C     0.373     0    0.029   1.312     3.155  100.000   86.845
LGA    M    86_C      M    86_C     0.309     0    0.062   0.843     2.420  100.000   94.405
LGA    E    87_C      E    87_C     0.048     0    0.032   0.220     1.062  100.000   95.820
LGA    V    88_C      V    88_C     0.137     0    0.015   0.110     0.302  100.000  100.000
LGA    L    89_C      L    89_C     0.264     0    0.016   0.125     0.536  100.000   98.810
LGA    E    90_C      E    90_C     0.199     0    0.047   0.922     4.188  100.000   82.698
LGA    E    91_C      E    91_C     0.212     0    0.020   0.116     0.613  100.000   98.942
LGA    L    92_C      L    92_C     0.059     0    0.019   0.070     0.357  100.000  100.000
LGA    E    93_C      E    93_C     0.021     0    0.084   0.312     1.155  100.000   95.820
LGA    E    94_C      E    94_C     0.165     0    0.011   0.777     3.169  100.000   86.455
LGA    V    95_C      V    95_C     0.109     0    0.019   0.079     0.213  100.000  100.000
LGA    L    96_C      L    96_C     0.191     0    0.017   0.074     0.248  100.000  100.000
LGA    E    97_C      E    97_C     0.228     0    0.096   0.141     0.593  100.000   98.942
LGA    E    98_C      E    98_C     0.500     0    0.011   0.076     0.840  100.000   94.709
LGA    K    99_C      K    99_C     0.411     0    0.039   0.972     4.620  100.000   80.688
LGA    K   100_C      K   100_C     0.223     0    0.053   0.131     1.793  100.000   91.799
LGA    E   101_C      E   101_C     0.356     0    0.053   0.893     3.030  100.000   81.852
LGA    E   102_C      E   102_C     0.153     0    0.052   0.756     2.395   97.619   84.180
LGA    V   103_C      V   103_C     0.216     0    0.015   0.066     0.488  100.000  100.000
LGA    E   104_C      E   104_C     0.376     0    0.091   0.202     0.868   95.238   96.825
LGA    E   105_C      E   105_C     0.584     0    0.028   0.241     1.724   92.857   87.566
LGA    R   106_C      R   106_C     0.561     0    0.025   0.452     1.485   90.476   91.429
LGA    I   107_C      I   107_C     0.553     0    0.124   0.207     0.700   90.476   92.857
LGA    E   108_C      E   108_C     0.767     0    0.467   0.477     2.934   79.881   85.873
LGA    G   109_C      G   109_C     0.441     0    0.578   0.578     1.334   92.976   92.976

# RMSD_GDC results:       CA      MC common percent     ALL common percent   GDC_mc  GDC_all
NUMBER_OF_ATOMS_AA:      108     432    432  100.00     908    908  100.00               108
SUMMARY(RMSD_GDC):     0.638          0.646                  1.348           94.497   88.655

#CA            N1   N2   DIST      N    RMSD    GDT_TS    LGA_S3     LGA_Q 
SUMMARY(GDT)  115  108    4.0    108    0.64    98.380    99.350    14.640

LGA_LOCAL      RMSD:   0.638  Number of atoms:  108  under DIST:   4.00
LGA_ASGN_ATOMS RMSD:   0.638  Number of assigned atoms:  108 
Std_ASGN_ATOMS RMSD:   0.638  Standard rmsd on all 108 assigned CA atoms 

Unitary ROTATION matrix and the SHIFT vector superimpose molecules  (1=>2)
  X_new =   0.196518 * X  +   0.858219 * Y  +  -0.474174 * Z  +  11.339879
  Y_new =   0.243474 * X  +   0.425744 * Y  +   0.871471 * Z  +  -1.101892
  Z_new =   0.949790 * X  +  -0.286708 * Y  +  -0.125287 * Z  + -11.328247 

Euler angles from the ROTATION matrix. Conventions XYZ and ZXZ:
           Phi     Theta       Psi   [DEG:       Phi     Theta       Psi ]
XYZ:  0.891716 -1.252565 -1.982775   [DEG:   51.0916  -71.7667 -113.6047 ]
ZXZ: -2.643285  1.696414  1.863963   [DEG: -151.4491   97.1974  106.7972 ]
 
# END of job
