
#######################################################
#                                                     #
#                        LGA                          #
#                  ---------------                    #
#                                                     #
#               Local-Global Alignment                #
#        A Method for Finding 3-D Similarities        #
#               in Protein Structures                 #
#                                                     #
#                  ------------ 10/2009               #
#                                                     #
#      Adam Zemla (adamz@llnl.gov)                    #
#      Lawrence Livermore National Laboratory, CA     #
#                                                     #
#######################################################

!!!   License for LGA program has expired  !!!
#   For updated version of the LGA program   #
# please contact Adam Zemla:  adamz@llnl.gov #

# Molecule1: number of CA atoms  173 ( 1303),  selected  127 , name one
# Molecule2: number of CA atoms  127 (  962),  selected  127 , name two
# PARAMETERS: input.pdb  -ie  -3  -d:4  -sda  -swap  -ch1:A  -ch2:A  
# FIXED Atom-Atom correspondence
# GDT and LCS analysis 

LCS - RMSD CUTOFF   5.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:   127      23_A - 149_A       1.53     1.53
  LCS_AVERAGE:    100.00

LCS - RMSD CUTOFF   2.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:   127      23_A - 149_A       1.53     1.53
  LCS_AVERAGE:    100.00

LCS - RMSD CUTOFF   1.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:    96      24_A - 119_A       0.98     1.58
  LCS_AVERAGE:     61.86

LCS_GDT    MOLECULE-1    MOLECULE-2     LCS_DETAILS     GDT_DETAILS                                                    TOTAL NUMBER OF RESIDUE PAIRS:  127
LCS_GDT     RESIDUE       RESIDUE       SEGMENT_SIZE    GLOBAL DISTANCE TEST COLUMNS: number of residues under the threshold assigned to each residue pair
LCS_GDT   NAME NUMBER   NAME NUMBER    1.0  2.0  5.0    0.5  1.0  1.5  2.0  2.5  3.0  3.5  4.0  4.5  5.0  5.5  6.0  6.5  7.0  7.5  8.0  8.5  9.0  9.5 10.0
LCS_GDT     E    23_A     E    23_A     25  127  127      3    5   11   26  109  116  119  121  123  125  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     V    24_A     V    24_A     96  127  127      6   67  111  114  117  118  119  123  124  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     Q    25_A     Q    25_A     96  127  127     82  108  111  114  117  118  119  123  124  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     L    26_A     L    26_A     96  127  127     82  108  111  114  117  118  119  123  124  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     V    27_A     V    27_A     96  127  127     82  108  111  114  117  118  119  123  124  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     E    28_A     E    28_A     96  127  127     82  108  111  114  117  118  119  123  124  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     S    29_A     S    29_A     96  127  127     82  108  111  114  117  118  119  123  124  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     G    30_A     G    30_A     96  127  127     82  108  111  114  117  118  119  123  124  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     G    31_A     G    31_A     96  127  127     82  108  111  114  117  118  119  123  124  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     G    32_A     G    32_A     96  127  127     81  108  111  114  117  118  119  123  124  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     S    33_A     S    33_A     96  127  127     82  108  111  114  117  118  119  123  124  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     V    34_A     V    34_A     96  127  127     82  108  111  114  117  118  119  123  124  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     Q    35_A     Q    35_A     96  127  127     82  108  111  114  117  118  119  123  124  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     A    36_A     A    36_A     96  127  127     82  108  111  114  117  118  119  123  124  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     G    37_A     G    37_A     96  127  127     82  108  111  114  117  118  119  123  124  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     G    38_A     G    38_A     96  127  127     82  108  111  114  117  118  119  123  124  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     S    39_A     S    39_A     96  127  127     82  108  111  114  117  118  119  123  124  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     L    40_A     L    40_A     96  127  127     82  108  111  114  117  118  119  123  124  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     R    41_A     R    41_A     96  127  127     82  108  111  114  117  118  119  123  124  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     L    42_A     L    42_A     96  127  127     82  108  111  114  117  118  119  123  124  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     S    43_A     S    43_A     96  127  127     82  108  111  114  117  118  119  123  124  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     C    44_A     C    44_A     96  127  127     82  108  111  114  117  118  119  123  124  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     A    45_A     A    45_A     96  127  127     82  108  111  114  117  118  119  123  124  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     A    46_A     A    46_A     96  127  127     82  108  111  114  117  118  119  123  124  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     S    47_A     S    47_A     96  127  127     75  108  111  114  117  118  119  123  124  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     A    48_A     A    48_A     96  127  127      0    4    5   11   97  115  119  121  124  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     F    49_A     F    49_A     96  127  127      2    4    4   17   24   33  118  121  123  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     G    50_A     G    50_A     96  127  127      2   18   32   50  113  118  119  121  124  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     N    51_A     N    51_A     96  127  127      3   30  105  114  117  118  119  123  124  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     Y    52_A     Y    52_A     96  127  127     82  108  111  114  117  118  119  123  124  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     M    53_A     M    53_A     96  127  127     82  108  111  114  117  118  119  123  124  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     G    54_A     G    54_A     96  127  127     82  108  111  114  117  118  119  123  124  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     W    55_A     W    55_A     96  127  127     82  108  111  114  117  118  119  123  124  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     F    56_A     F    56_A     96  127  127     82  108  111  114  117  118  119  123  124  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     R    57_A     R    57_A     96  127  127     82  108  111  114  117  118  119  123  124  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     Q    58_A     Q    58_A     96  127  127     82  108  111  114  117  118  119  123  124  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     A    59_A     A    59_A     96  127  127     82  108  111  114  117  118  119  123  124  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     P    60_A     P    60_A     96  127  127     82  108  111  114  117  118  119  123  124  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     G    61_A     G    61_A     96  127  127     82  108  111  114  117  118  119  123  124  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     K    62_A     K    62_A     96  127  127     82  108  111  114  117  118  119  123  124  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     E    63_A     E    63_A     96  127  127     82  108  111  114  117  118  119  123  124  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     R    64_A     R    64_A     96  127  127     81  108  111  114  117  118  119  123  124  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     E    65_A     E    65_A     96  127  127     82  108  111  114  117  118  119  123  124  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     G    66_A     G    66_A     96  127  127     70  108  111  114  117  118  119  123  124  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     V    67_A     V    67_A     96  127  127     82  108  111  114  117  118  119  123  124  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     A    68_A     A    68_A     96  127  127     82  108  111  114  117  118  119  123  124  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     A    69_A     A    69_A     96  127  127     82  108  111  114  117  118  119  123  124  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     I    70_A     I    70_A     96  127  127     82  108  111  114  117  118  119  123  124  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     R    71_A     R    71_A     96  127  127     82  108  111  114  117  118  119  123  124  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     T    72_A     T    72_A     96  127  127     69  108  111  114  117  118  119  123  124  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     G    73_A     G    73_A     96  127  127     27  103  111  114  117  118  119  123  124  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     G    74_A     G    74_A     96  127  127      4  108  111  114  117  118  119  123  124  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     G    75_A     G    75_A     96  127  127     82  108  111  114  117  118  119  123  124  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     S    76_A     S    76_A     96  127  127     82  108  111  114  117  118  119  123  124  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     T    77_A     T    77_A     96  127  127     82  108  111  114  117  118  119  123  124  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     Y    78_A     Y    78_A     96  127  127     82  108  111  114  117  118  119  123  124  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     Y    79_A     Y    79_A     96  127  127     82  108  111  114  117  118  119  123  124  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     T    80_A     T    80_A     96  127  127     82  108  111  114  117  118  119  123  124  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     D    81_A     D    81_A     96  127  127     82  108  111  114  117  118  119  123  124  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     S    82_A     S    82_A     96  127  127     82  108  111  114  117  118  119  123  124  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     V    83_A     V    83_A     96  127  127     82  108  111  114  117  118  119  123  124  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     K    84_A     K    84_A     96  127  127     69  108  111  114  117  118  119  123  124  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     G    85_A     G    85_A     96  127  127     55  108  111  114  117  118  119  123  124  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     R    86_A     R    86_A     96  127  127     82  108  111  114  117  118  119  123  124  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     F    87_A     F    87_A     96  127  127     82  108  111  114  117  118  119  123  124  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     T    88_A     T    88_A     96  127  127     82  108  111  114  117  118  119  123  124  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     I    89_A     I    89_A     96  127  127     82  108  111  114  117  118  119  123  124  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     S    90_A     S    90_A     96  127  127     82  108  111  114  117  118  119  123  124  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     Q    91_A     Q    91_A     96  127  127     82  108  111  114  117  118  119  123  124  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     D    92_A     D    92_A     96  127  127     82  108  111  114  117  118  119  123  124  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     K    93_A     K    93_A     96  127  127     81  108  111  114  117  118  119  123  124  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     A    94_A     A    94_A     96  127  127     82  108  111  114  117  118  119  123  124  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     K    95_A     K    95_A     96  127  127     82  108  111  114  117  118  119  123  124  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     N    96_A     N    96_A     96  127  127     82  108  111  114  117  118  119  123  124  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     T    97_A     T    97_A     96  127  127     82  108  111  114  117  118  119  123  124  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     V    98_A     V    98_A     96  127  127     82  108  111  114  117  118  119  123  124  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     Y    99_A     Y    99_A     96  127  127     82  108  111  114  117  118  119  123  124  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     L   100_A     L   100_A     96  127  127     82  108  111  114  117  118  119  123  124  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     Q   101_A     Q   101_A     96  127  127     82  108  111  114  117  118  119  123  124  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     M   102_A     M   102_A     96  127  127     82  108  111  114  117  118  119  123  124  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     N   103_A     N   103_A     96  127  127     82  108  111  114  117  118  119  123  124  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     S   104_A     S   104_A     96  127  127     82  108  111  114  117  118  119  123  124  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     L   105_A     L   105_A     96  127  127     82  108  111  114  117  118  119  123  124  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     K   106_A     K   106_A     96  127  127     81  108  111  114  117  118  119  123  124  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     P   107_A     P   107_A     96  127  127     82  108  111  114  117  118  119  123  124  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     E   108_A     E   108_A     96  127  127     82  108  111  114  117  118  119  123  124  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     D   109_A     D   109_A     96  127  127     82  108  111  114  117  118  119  123  124  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     T   110_A     T   110_A     96  127  127     82  108  111  114  117  118  119  123  124  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     A   111_A     A   111_A     96  127  127     82  108  111  114  117  118  119  123  124  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     M   112_A     M   112_A     96  127  127     82  108  111  114  117  118  119  123  124  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     Y   113_A     Y   113_A     96  127  127     82  108  111  114  117  118  119  123  124  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     V   114_A     V   114_A     96  127  127     82  108  111  114  117  118  119  123  124  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     C   115_A     C   115_A     96  127  127     82  108  111  114  117  118  119  123  124  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     A   116_A     A   116_A     96  127  127     82  108  111  114  117  118  119  123  124  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     T   117_A     T   117_A     96  127  127     82  108  111  114  117  118  119  123  124  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     A   118_A     A   118_A     96  127  127      4   39  107  113  117  118  119  123  124  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     G   119_A     G   119_A     96  127  127      0    7  109  114  117  118  119  123  124  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     D   120_A     D   120_A     71  127  127      3    4    4   20  110  116  119  123  124  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     R   121_A     R   121_A     71  127  127      3    4    5   11   57  110  119  123  124  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     W   122_A     W   122_A      4  127  127      3    4   10   24   42  107  118  123  124  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     H   123_A     H   123_A      4  127  127      4    4    8   17   26   50  118  123  124  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     A   124_A     A   124_A      4  127  127      4    4    4   11   21  110  118  123  124  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     T   125_A     T   125_A      7  127  127      4    5   11   71  113  118  119  123  124  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     D   126_A     D   126_A     24  127  127      4    6   74  114  117  118  119  123  124  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     A   127_A     A   127_A     24  127  127     21  108  111  114  117  118  119  123  124  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     F   128_A     F   128_A     24  127  127     12   71  111  114  117  118  119  123  124  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     I   129_A     I   129_A     24  127  127     77  108  111  114  117  118  119  123  124  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     L   130_A     L   130_A     24  127  127      4   72  110  114  117  118  119  123  124  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     R   131_A     R   131_A     24  127  127      8  108  111  114  117  118  119  123  124  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     D   132_A     D   132_A     24  127  127     82  108  111  114  117  118  119  123  124  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     F   133_A     F   133_A     24  127  127     82  108  111  114  117  118  119  123  124  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     V   134_A     V   134_A     24  127  127     82  108  111  114  117  118  119  123  124  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     Y   135_A     Y   135_A     24  127  127     82  108  111  114  117  118  119  123  124  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     E   136_A     E   136_A     24  127  127     82  108  111  114  117  118  119  123  124  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     Y   137_A     Y   137_A     24  127  127     82  108  111  114  117  118  119  123  124  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     W   138_A     W   138_A     24  127  127     77  108  111  114  117  118  119  123  124  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     G   139_A     G   139_A     24  127  127     82  108  111  114  117  118  119  123  124  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     Q   140_A     Q   140_A     24  127  127     82  108  111  114  117  118  119  123  124  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     G   141_A     G   141_A     24  127  127     82  108  111  114  117  118  119  123  124  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     T   142_A     T   142_A     24  127  127     82  108  111  114  117  118  119  123  124  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     Q   143_A     Q   143_A     24  127  127     81  108  111  114  117  118  119  123  124  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     V   144_A     V   144_A     24  127  127     82  108  111  114  117  118  119  123  124  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     T   145_A     T   145_A     24  127  127     82  108  111  114  117  118  119  123  124  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     V   146_A     V   146_A     24  127  127     82  108  111  114  117  118  119  123  124  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     S   147_A     S   147_A     24  127  127     82  108  111  114  117  118  119  123  124  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     S   148_A     S   148_A     24  127  127     82  108  111  114  117  118  119  123  124  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     A   149_A     A   149_A     24  127  127      0   10   96  114  117  118  119  123  124  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_AVERAGE  LCS_A:  87.29  (  61.86  100.00  100.00 )

GLOBAL_DISTANCE_TEST (summary information about detected largest sets of residues (represented by selected AToms) that can fit under specified thresholds)
GDT DIST_CUTOFF  0.50   1.00   1.50   2.00   2.50   3.00   3.50   4.00   4.50   5.00   5.50   6.00   6.50   7.00   7.50   8.00   8.50   9.00   9.50  10.00
GDT NUMBER_AT     82    108    111    114    117    118    119    123    124    126    127    127    127    127    127    127    127    127    127    127 
GDT PERCENT_AT  64.57  85.04  87.40  89.76  92.13  92.91  93.70  96.85  97.64  99.21 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00
GDT RMS_LOCAL    0.30   0.43   0.53   0.60   0.73   0.80   0.89   1.32   1.36   1.48   1.53   1.53   1.53   1.53   1.53   1.53   1.53   1.53   1.53   1.53
GDT RMS_ALL_AT   1.59   1.58   1.57   1.57   1.56   1.56   1.55   1.54   1.54   1.53   1.53   1.53   1.53   1.53   1.53   1.53   1.53   1.53   1.53   1.53

# Checking swapping
#   possible swapping detected:  E    23_A      E    23_A
#   possible swapping detected:  E    28_A      E    28_A
#   possible swapping detected:  Y    52_A      Y    52_A
#   possible swapping detected:  Y    78_A      Y    78_A
#   possible swapping detected:  E   108_A      E   108_A
#   possible swapping detected:  D   120_A      D   120_A
#   possible swapping detected:  F   128_A      F   128_A
#   possible swapping detected:  F   133_A      F   133_A
#   possible swapping detected:  Y   135_A      Y   135_A
#   possible swapping detected:  E   136_A      E   136_A

#      Molecule1      Molecule2  DISTANCE    Mis    MC     All    Dist_max   GDC_mc  GDC_all
LGA    E    23_A      E    23_A     5.016     0    0.608   1.248     8.181   37.500   24.180
LGA    V    24_A      V    24_A     2.526     0    0.000   0.109     3.470   57.262   57.279
LGA    Q    25_A      Q    25_A     0.852     0    0.055   1.238     7.123   88.214   61.323
LGA    L    26_A      L    26_A     0.198     0    0.035   0.476     1.374  100.000   95.357
LGA    V    27_A      V    27_A     0.241     0    0.028   0.103     0.441  100.000  100.000
LGA    E    28_A      E    28_A     0.223     0    0.034   0.081     0.228  100.000  100.000
LGA    S    29_A      S    29_A     0.207     0    0.000   0.649     2.177  100.000   94.127
LGA    G    30_A      G    30_A     0.235     0    0.015   0.015     0.314  100.000  100.000
LGA    G    31_A      G    31_A     0.234     0    0.049   0.049     0.321  100.000  100.000
LGA    G    32_A      G    32_A     0.365     0    0.057   0.057     0.365  100.000  100.000
LGA    S    33_A      S    33_A     0.409     0    0.068   0.097     0.645   97.619   98.413
LGA    V    34_A      V    34_A     0.623     0    0.000   1.282     2.745   90.476   80.952
LGA    Q    35_A      Q    35_A     0.748     0    0.060   0.755     1.688   90.476   84.550
LGA    A    36_A      A    36_A     0.660     0    0.042   0.054     0.783   90.476   90.476
LGA    G    37_A      G    37_A     0.622     0    0.049   0.049     0.710   90.476   90.476
LGA    G    38_A      G    38_A     0.724     0    0.028   0.028     0.822   90.476   90.476
LGA    S    39_A      S    39_A     0.637     0    0.041   0.681     2.155   90.476   86.190
LGA    L    40_A      L    40_A     0.250     0    0.080   0.951     3.500   95.238   84.821
LGA    R    41_A      R    41_A     0.245     0    0.000   0.502     1.470  100.000   94.892
LGA    L    42_A      L    42_A     0.165     0    0.037   0.167     0.842  100.000   97.619
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LGA    L   130_A      L   130_A     1.433     0    0.151   1.436     6.560   83.690   60.714
LGA    R   131_A      R   131_A     1.130     0    0.047   1.186     5.361   85.952   59.091
LGA    D   132_A      D   132_A     0.238     0    0.055   0.325     0.757   97.619   97.619
LGA    F   133_A      F   133_A     0.797     0    0.111   1.168     8.014   83.810   52.944
LGA    V   134_A      V   134_A     1.005     0    0.176   0.183     1.852   81.548   80.272
LGA    Y   135_A      Y   135_A     0.753     0    0.102   1.483     9.434   88.214   52.460
LGA    E   136_A      E   136_A     0.625     0    0.039   1.127     4.102   90.476   77.407
LGA    Y   137_A      Y   137_A     0.476     0    0.054   0.327     1.726  100.000   88.452
LGA    W   138_A      W   138_A     0.495     0    0.063   1.056     6.888   97.619   55.816
LGA    G   139_A      G   139_A     0.456     0    0.055   0.055     0.503   97.619   97.619
LGA    Q   140_A      Q   140_A     0.391     0    0.037   0.857     3.407   97.619   81.799
LGA    G   141_A      G   141_A     0.185     0    0.023   0.023     0.443  100.000  100.000
LGA    T   142_A      T   142_A     0.428     0    0.033   1.057     2.432  100.000   88.571
LGA    Q   143_A      Q   143_A     0.410     0    0.025   1.122     3.567   97.619   86.402
LGA    V   144_A      V   144_A     0.166     0    0.039   0.104     0.475  100.000  100.000
LGA    T   145_A      T   145_A     0.089     0    0.065   0.077     0.361  100.000  100.000
LGA    V   146_A      V   146_A     0.397     0    0.041   0.095     0.625   95.238   95.918
LGA    S   147_A      S   147_A     0.766     0    0.030   0.605     1.297   90.476   87.460
LGA    S   148_A      S   148_A     0.426     0    0.500   0.615     2.821   84.524   83.492
LGA    A   149_A      A   149_A     3.076     0    0.586   0.595     6.702   37.381   37.333

# RMSD_GDC results:       CA      MC common percent     ALL common percent   GDC_mc  GDC_all
NUMBER_OF_ATOMS_AA:      127     508    508  100.00     962    962  100.00               127
SUMMARY(RMSD_GDC):     1.532          1.523                  2.666           88.056   81.277

#CA            N1   N2   DIST      N    RMSD    GDT_TS    LGA_S3     LGA_Q 
SUMMARY(GDT)  173  127    4.0    123    1.32    92.913    95.535     8.658

LGA_LOCAL      RMSD:   1.321  Number of atoms:  123  under DIST:   4.00
LGA_ASGN_ATOMS RMSD:   1.542  Number of assigned atoms:  127 
Std_ASGN_ATOMS RMSD:   1.532  Standard rmsd on all 127 assigned CA atoms 

Unitary ROTATION matrix and the SHIFT vector superimpose molecules  (1=>2)
  X_new =   0.796602 * X  +   0.541719 * Y  +  -0.268265 * Z  + -150.007462
  Y_new =   0.396725 * X  +  -0.803332 * Y  +  -0.444147 * Z  + 115.513237
  Z_new =  -0.456109 * X  +   0.247381 * Y  +  -0.854849 * Z  + 268.214630 

Euler angles from the ROTATION matrix. Conventions XYZ and ZXZ:
           Phi     Theta       Psi   [DEG:       Phi     Theta       Psi ]
XYZ:  0.462064  0.473618  2.859902   [DEG:   26.4743   27.1363  163.8603 ]
ZXZ: -0.543355  2.596057 -1.073828   [DEG:  -31.1320  148.7431  -61.5258 ]
 
# END of job
