
#######################################################
#                                                     #
#                        LGA                          #
#                  ---------------                    #
#                                                     #
#               Local-Global Alignment                #
#        A Method for Finding 3-D Similarities        #
#               in Protein Structures                 #
#                                                     #
#                  ------------ 10/2009               #
#                                                     #
#      Adam Zemla (adamz@llnl.gov)                    #
#      Lawrence Livermore National Laboratory, CA     #
#                                                     #
#######################################################

!!!   License for LGA program has expired  !!!
#   For updated version of the LGA program   #
# please contact Adam Zemla:  adamz@llnl.gov #

# Molecule1: number of CA atoms  173 ( 1303),  selected  127 , name one
# Molecule2: number of CA atoms  127 (  962),  selected  127 , name two
# PARAMETERS: input.pdb  -ie  -3  -d:4  -sda  -swap  -ch1:A  -ch2:A  
# FIXED Atom-Atom correspondence
# GDT and LCS analysis 

LCS - RMSD CUTOFF   5.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:   127      23_A - 149_A       0.61     0.61
  LCS_AVERAGE:    100.00

LCS - RMSD CUTOFF   2.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:   127      23_A - 149_A       0.61     0.61
  LCS_AVERAGE:    100.00

LCS - RMSD CUTOFF   1.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:   127      23_A - 149_A       0.61     0.61
  LCS_AVERAGE:    100.00

LCS_GDT    MOLECULE-1    MOLECULE-2     LCS_DETAILS     GDT_DETAILS                                                    TOTAL NUMBER OF RESIDUE PAIRS:  127
LCS_GDT     RESIDUE       RESIDUE       SEGMENT_SIZE    GLOBAL DISTANCE TEST COLUMNS: number of residues under the threshold assigned to each residue pair
LCS_GDT   NAME NUMBER   NAME NUMBER    1.0  2.0  5.0    0.5  1.0  1.5  2.0  2.5  3.0  3.5  4.0  4.5  5.0  5.5  6.0  6.5  7.0  7.5  8.0  8.5  9.0  9.5 10.0
LCS_GDT     E    23_A     E    23_A    127  127  127      4    9   76  122  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     V    24_A     V    24_A    127  127  127     44  117  123  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     Q    25_A     Q    25_A    127  127  127    105  117  123  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     L    26_A     L    26_A    127  127  127    105  117  123  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     V    27_A     V    27_A    127  127  127    105  117  123  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     E    28_A     E    28_A    127  127  127    105  117  123  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     S    29_A     S    29_A    127  127  127    105  117  123  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     G    30_A     G    30_A    127  127  127    105  117  123  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     G    31_A     G    31_A    127  127  127    105  117  123  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     G    32_A     G    32_A    127  127  127    105  117  123  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     S    33_A     S    33_A    127  127  127    105  117  123  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     V    34_A     V    34_A    127  127  127    105  117  123  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     Q    35_A     Q    35_A    127  127  127    105  117  123  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     A    36_A     A    36_A    127  127  127    105  117  123  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     G    37_A     G    37_A    127  127  127    105  117  123  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     G    38_A     G    38_A    127  127  127    105  117  123  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     S    39_A     S    39_A    127  127  127    105  117  123  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     L    40_A     L    40_A    127  127  127    105  117  123  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     R    41_A     R    41_A    127  127  127    105  117  123  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     L    42_A     L    42_A    127  127  127    105  117  123  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     S    43_A     S    43_A    127  127  127    105  117  123  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     C    44_A     C    44_A    127  127  127    105  117  123  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     A    45_A     A    45_A    127  127  127    105  117  123  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     A    46_A     A    46_A    127  127  127    105  117  123  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     S    47_A     S    47_A    127  127  127    105  117  123  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     A    48_A     A    48_A    127  127  127     96  117  123  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     F    49_A     F    49_A    127  127  127     96  117  123  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     G    50_A     G    50_A    127  127  127    105  117  123  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     N    51_A     N    51_A    127  127  127    105  117  123  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     Y    52_A     Y    52_A    127  127  127    105  117  123  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     M    53_A     M    53_A    127  127  127    105  117  123  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     G    54_A     G    54_A    127  127  127    105  117  123  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     W    55_A     W    55_A    127  127  127    105  117  123  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     F    56_A     F    56_A    127  127  127    105  117  123  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     R    57_A     R    57_A    127  127  127    105  117  123  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     Q    58_A     Q    58_A    127  127  127    105  117  123  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     A    59_A     A    59_A    127  127  127     83  117  123  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     P    60_A     P    60_A    127  127  127     17  117  123  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     G    61_A     G    61_A    127  127  127     53  117  123  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     K    62_A     K    62_A    127  127  127    105  117  123  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     E    63_A     E    63_A    127  127  127    105  117  123  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     R    64_A     R    64_A    127  127  127    105  117  123  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     E    65_A     E    65_A    127  127  127    105  117  123  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     G    66_A     G    66_A    127  127  127    105  117  123  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     V    67_A     V    67_A    127  127  127    105  117  123  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     A    68_A     A    68_A    127  127  127    105  117  123  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     A    69_A     A    69_A    127  127  127    105  117  123  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     I    70_A     I    70_A    127  127  127    105  117  123  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     R    71_A     R    71_A    127  127  127    105  117  123  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     T    72_A     T    72_A    127  127  127    105  117  123  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     G    73_A     G    73_A    127  127  127    100  117  123  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     G    74_A     G    74_A    127  127  127     47  117  123  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     G    75_A     G    75_A    127  127  127    105  117  123  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     S    76_A     S    76_A    127  127  127    105  117  123  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     T    77_A     T    77_A    127  127  127    105  117  123  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     Y    78_A     Y    78_A    127  127  127    105  117  123  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     Y    79_A     Y    79_A    127  127  127    105  117  123  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     T    80_A     T    80_A    127  127  127    105  117  123  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     D    81_A     D    81_A    127  127  127    105  117  123  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     S    82_A     S    82_A    127  127  127     86  117  123  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     V    83_A     V    83_A    127  127  127    105  117  123  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     K    84_A     K    84_A    127  127  127    105  117  123  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     G    85_A     G    85_A    127  127  127    103  117  123  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     R    86_A     R    86_A    127  127  127    105  117  123  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     F    87_A     F    87_A    127  127  127    105  117  123  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     T    88_A     T    88_A    127  127  127    105  117  123  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     I    89_A     I    89_A    127  127  127    105  117  123  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     S    90_A     S    90_A    127  127  127    105  117  123  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     Q    91_A     Q    91_A    127  127  127    105  117  123  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     D    92_A     D    92_A    127  127  127    105  117  123  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     K    93_A     K    93_A    127  127  127    105  117  123  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     A    94_A     A    94_A    127  127  127    105  117  123  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     K    95_A     K    95_A    127  127  127    105  117  123  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     N    96_A     N    96_A    127  127  127    105  117  123  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     T    97_A     T    97_A    127  127  127    105  117  123  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     V    98_A     V    98_A    127  127  127    105  117  123  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     Y    99_A     Y    99_A    127  127  127    105  117  123  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     L   100_A     L   100_A    127  127  127    105  117  123  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     Q   101_A     Q   101_A    127  127  127    105  117  123  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     M   102_A     M   102_A    127  127  127    105  117  123  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     N   103_A     N   103_A    127  127  127    105  117  123  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     S   104_A     S   104_A    127  127  127    105  117  123  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     L   105_A     L   105_A    127  127  127    105  117  123  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     K   106_A     K   106_A    127  127  127    105  117  123  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     P   107_A     P   107_A    127  127  127    105  117  123  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     E   108_A     E   108_A    127  127  127    105  117  123  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     D   109_A     D   109_A    127  127  127    105  117  123  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     T   110_A     T   110_A    127  127  127    105  117  123  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     A   111_A     A   111_A    127  127  127    105  117  123  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     M   112_A     M   112_A    127  127  127    105  117  123  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     Y   113_A     Y   113_A    127  127  127    105  117  123  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     V   114_A     V   114_A    127  127  127    105  117  123  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     C   115_A     C   115_A    127  127  127    105  117  123  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     A   116_A     A   116_A    127  127  127    105  117  123  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     T   117_A     T   117_A    127  127  127    105  117  123  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     A   118_A     A   118_A    127  127  127      3    6  123  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     G   119_A     G   119_A    127  127  127      3   96  123  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     D   120_A     D   120_A    127  127  127      3  117  123  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     R   121_A     R   121_A    127  127  127     17  117  123  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     W   122_A     W   122_A    127  127  127     33  109  123  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     H   123_A     H   123_A    127  127  127      3   79  122  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     A   124_A     A   124_A    127  127  127      5  113  123  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     T   125_A     T   125_A    127  127  127      5  117  123  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     D   126_A     D   126_A    127  127  127    105  117  123  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     A   127_A     A   127_A    127  127  127    105  117  123  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     F   128_A     F   128_A    127  127  127    105  117  123  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     I   129_A     I   129_A    127  127  127    105  117  123  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     L   130_A     L   130_A    127  127  127    105  117  123  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     R   131_A     R   131_A    127  127  127    105  117  123  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     D   132_A     D   132_A    127  127  127    105  117  123  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     F   133_A     F   133_A    127  127  127     96  117  123  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     V   134_A     V   134_A    127  127  127     96  117  123  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     Y   135_A     Y   135_A    127  127  127    105  117  123  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     E   136_A     E   136_A    127  127  127    105  117  123  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     Y   137_A     Y   137_A    127  127  127    105  117  123  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     W   138_A     W   138_A    127  127  127    105  117  123  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     G   139_A     G   139_A    127  127  127    105  117  123  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     Q   140_A     Q   140_A    127  127  127    105  117  123  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     G   141_A     G   141_A    127  127  127    105  117  123  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     T   142_A     T   142_A    127  127  127    105  117  123  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     Q   143_A     Q   143_A    127  127  127    105  117  123  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     V   144_A     V   144_A    127  127  127    105  117  123  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     T   145_A     T   145_A    127  127  127    105  117  123  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     V   146_A     V   146_A    127  127  127    105  117  123  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     S   147_A     S   147_A    127  127  127    105  117  123  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     S   148_A     S   148_A    127  127  127    105  117  123  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     A   149_A     A   149_A    127  127  127     17  117  123  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_AVERAGE  LCS_A: 100.00  ( 100.00  100.00  100.00 )

GLOBAL_DISTANCE_TEST (summary information about detected largest sets of residues (represented by selected AToms) that can fit under specified thresholds)
GDT DIST_CUTOFF  0.50   1.00   1.50   2.00   2.50   3.00   3.50   4.00   4.50   5.00   5.50   6.00   6.50   7.00   7.50   8.00   8.50   9.00   9.50  10.00
GDT NUMBER_AT    105    117    123    126    127    127    127    127    127    127    127    127    127    127    127    127    127    127    127    127 
GDT PERCENT_AT  82.68  92.13  96.85  99.21 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00
GDT RMS_LOCAL    0.27   0.36   0.46   0.54   0.61   0.61   0.61   0.61   0.61   0.61   0.61   0.61   0.61   0.61   0.61   0.61   0.61   0.61   0.61   0.61
GDT RMS_ALL_AT   0.61   0.61   0.61   0.61   0.61   0.61   0.61   0.61   0.61   0.61   0.61   0.61   0.61   0.61   0.61   0.61   0.61   0.61   0.61   0.61

# Checking swapping
#   possible swapping detected:  E    23_A      E    23_A
#   possible swapping detected:  Y    52_A      Y    52_A
#   possible swapping detected:  F    56_A      F    56_A
#   possible swapping detected:  Y    78_A      Y    78_A
#   possible swapping detected:  E   108_A      E   108_A
#   possible swapping detected:  Y   113_A      Y   113_A
#   possible swapping detected:  F   128_A      F   128_A
#   possible swapping detected:  F   133_A      F   133_A
#   possible swapping detected:  Y   135_A      Y   135_A
#   possible swapping detected:  E   136_A      E   136_A

#      Molecule1      Molecule2  DISTANCE    Mis    MC     All    Dist_max   GDC_mc  GDC_all
LGA    E    23_A      E    23_A     3.027     0    0.157   0.708     4.330   55.714   51.905
LGA    V    24_A      V    24_A     1.261     0    0.071   0.090     1.945   83.810   81.565
LGA    Q    25_A      Q    25_A     0.531     0    0.057   0.956     4.397   95.238   76.931
LGA    L    26_A      L    26_A     0.093     0    0.040   0.511     1.245  100.000   95.357
LGA    V    27_A      V    27_A     0.335     0    0.077   0.106     0.867  100.000   95.918
LGA    E    28_A      E    28_A     0.178     0    0.098   0.158     0.474  100.000  100.000
LGA    S    29_A      S    29_A     0.106     0    0.042   0.041     0.137  100.000  100.000
LGA    G    30_A      G    30_A     0.107     0    0.041   0.041     0.409  100.000  100.000
LGA    G    31_A      G    31_A     0.210     0    0.035   0.035     0.245  100.000  100.000
LGA    G    32_A      G    32_A     0.438     0    0.049   0.049     0.481  100.000  100.000
LGA    S    33_A      S    33_A     0.262     0    0.024   0.089     0.353  100.000  100.000
LGA    V    34_A      V    34_A     0.168     0    0.029   1.267     2.558  100.000   88.844
LGA    Q    35_A      Q    35_A     0.220     0    0.035   1.138     4.338  100.000   78.783
LGA    A    36_A      A    36_A     0.327     0    0.039   0.038     0.403  100.000  100.000
LGA    G    37_A      G    37_A     0.101     0    0.025   0.025     0.263  100.000  100.000
LGA    G    38_A      G    38_A     0.144     0    0.069   0.069     0.314  100.000  100.000
LGA    S    39_A      S    39_A     0.149     0    0.032   0.099     0.406  100.000  100.000
LGA    L    40_A      L    40_A     0.046     0    0.022   0.103     0.222  100.000  100.000
LGA    R    41_A      R    41_A     0.124     0    0.073   0.865     3.116  100.000   93.723
LGA    L    42_A      L    42_A     0.125     0    0.028   0.064     0.291  100.000  100.000
LGA    S    43_A      S    43_A     0.187     0    0.020   0.675     1.834  100.000   95.476
LGA    C    44_A      C    44_A     0.261     0    0.012   0.037     0.546  100.000   98.413
LGA    A    45_A      A    45_A     0.304     0    0.024   0.050     0.454  100.000  100.000
LGA    A    46_A      A    46_A     0.372     0    0.046   0.069     0.445  100.000  100.000
LGA    S    47_A      S    47_A     0.512     0    0.010   0.112     0.856   95.238   93.651
LGA    A    48_A      A    48_A     0.680     0    0.023   0.048     0.978   90.476   90.476
LGA    F    49_A      F    49_A     0.615     0    0.008   0.345     1.507   92.857   88.918
LGA    G    50_A      G    50_A     0.355     0    0.045   0.045     0.408  100.000  100.000
LGA    N    51_A      N    51_A     0.347     0    0.032   0.141     0.842  100.000   96.429
LGA    Y    52_A      Y    52_A     0.397     0    0.020   1.341     6.237  100.000   71.230
LGA    M    53_A      M    53_A     0.123     0    0.029   0.281     1.454  100.000   94.167
LGA    G    54_A      G    54_A     0.181     0    0.023   0.023     0.304  100.000  100.000
LGA    W    55_A      W    55_A     0.160     0    0.012   0.061     0.408  100.000  100.000
LGA    F    56_A      F    56_A     0.107     0    0.017   0.063     0.398  100.000  100.000
LGA    R    57_A      R    57_A     0.276     0    0.026   0.086     0.903  100.000   96.537
LGA    Q    58_A      Q    58_A     0.139     0    0.051   0.106     0.703  100.000   98.942
LGA    A    59_A      A    59_A     0.689     0    0.049   0.058     0.760   92.857   92.381
LGA    P    60_A      P    60_A     1.031     0    0.037   0.108     1.309   88.214   86.599
LGA    G    61_A      G    61_A     0.780     0    0.147   0.147     1.093   88.214   88.214
LGA    K    62_A      K    62_A     0.356     2    0.027   0.649     1.743  100.000   73.704
LGA    E    63_A      E    63_A     0.286     0    0.034   0.651     2.493  100.000   89.841
LGA    R    64_A      R    64_A     0.316     0    0.049   1.110     2.200   97.619   87.489
LGA    E    65_A      E    65_A     0.539     0    0.087   0.468     1.413   97.619   90.635
LGA    G    66_A      G    66_A     0.326     0    0.036   0.036     0.326  100.000  100.000
LGA    V    67_A      V    67_A     0.285     0    0.048   0.284     0.980  100.000   97.279
LGA    A    68_A      A    68_A     0.189     0    0.035   0.042     0.333  100.000  100.000
LGA    A    69_A      A    69_A     0.274     0    0.044   0.044     0.322  100.000  100.000
LGA    I    70_A      I    70_A     0.254     0    0.030   0.061     0.318  100.000  100.000
LGA    R    71_A      R    71_A     0.149     0    0.058   1.145     4.469  100.000   75.108
LGA    T    72_A      T    72_A     0.434     0    0.062   0.072     0.675  100.000   98.639
LGA    G    73_A      G    73_A     0.663     0    0.566   0.566     3.136   80.357   80.357
LGA    G    74_A      G    74_A     1.212     0    0.077   0.077     1.404   83.690   83.690
LGA    G    75_A      G    75_A     0.258     0    0.086   0.086     0.397  100.000  100.000
LGA    S    76_A      S    76_A     0.249     0    0.041   0.062     0.491  100.000  100.000
LGA    T    77_A      T    77_A     0.163     0    0.038   0.064     0.217  100.000  100.000
LGA    Y    78_A      Y    78_A     0.318     0    0.023   0.064     0.520  100.000   99.206
LGA    Y    79_A      Y    79_A     0.170     0    0.026   0.044     0.251  100.000  100.000
LGA    T    80_A      T    80_A     0.233     0    0.034   0.140     0.349  100.000  100.000
LGA    D    81_A      D    81_A     0.484     0    0.039   0.264     1.109   95.238   92.917
LGA    S    82_A      S    82_A     0.820     0    0.036   0.043     0.989   90.476   90.476
LGA    V    83_A      V    83_A     0.397     0    0.029   0.064     0.497  100.000  100.000
LGA    K    84_A      K    84_A     0.537     0    0.022   0.610     2.329   97.619   88.836
LGA    G    85_A      G    85_A     0.558     0    0.036   0.036     0.590   92.857   92.857
LGA    R    86_A      R    86_A     0.239     0    0.098   0.117     0.339  100.000  100.000
LGA    F    87_A      F    87_A     0.207     0    0.008   0.113     0.528  100.000   99.134
LGA    T    88_A      T    88_A     0.151     0    0.021   0.052     0.221  100.000  100.000
LGA    I    89_A      I    89_A     0.067     0    0.011   0.038     0.195  100.000  100.000
LGA    S    90_A      S    90_A     0.143     0    0.025   0.063     0.264  100.000  100.000
LGA    Q    91_A      Q    91_A     0.265     0    0.007   0.178     0.587  100.000   98.942
LGA    D    92_A      D    92_A     0.311     0    0.036   0.082     0.713  100.000   96.429
LGA    K    93_A      K    93_A     0.458     0    0.025   0.345     1.717   97.619   90.688
LGA    A    94_A      A    94_A     0.164     0    0.095   0.090     0.356  100.000  100.000
LGA    K    95_A      K    95_A     0.161     0    0.031   0.557     1.332  100.000   95.820
LGA    N    96_A      N    96_A     0.231     0    0.020   1.190     4.789  100.000   80.714
LGA    T    97_A      T    97_A     0.146     0    0.056   0.076     0.178  100.000  100.000
LGA    V    98_A      V    98_A     0.096     0    0.049   0.114     0.284  100.000  100.000
LGA    Y    99_A      Y    99_A     0.130     0    0.035   0.094     0.601  100.000   99.206
LGA    L   100_A      L   100_A     0.125     0    0.016   0.064     0.152  100.000  100.000
LGA    Q   101_A      Q   101_A     0.147     0    0.013   0.107     0.362  100.000  100.000
LGA    M   102_A      M   102_A     0.092     0    0.045   0.696     2.544  100.000   94.643
LGA    N   103_A      N   103_A     0.087     0    0.030   0.189     0.540  100.000   98.810
LGA    S   104_A      S   104_A     0.160     0    0.017   0.033     0.258  100.000  100.000
LGA    L   105_A      L   105_A     0.182     0    0.032   0.079     0.336  100.000  100.000
LGA    K   106_A      K   106_A     0.145     0    0.024   0.196     0.624  100.000   98.942
LGA    P   107_A      P   107_A     0.376     0    0.031   0.108     0.596  100.000   98.639
LGA    E   108_A      E   108_A     0.295     0    0.030   0.838     2.353  100.000   86.138
LGA    D   109_A      D   109_A     0.131     0    0.017   0.048     0.300  100.000  100.000
LGA    T   110_A      T   110_A     0.196     0    0.090   0.153     0.564   97.619   97.279
LGA    A   111_A      A   111_A     0.224     0    0.019   0.027     0.312  100.000  100.000
LGA    M   112_A      M   112_A     0.279     0    0.017   0.086     0.460  100.000  100.000
LGA    Y   113_A      Y   113_A     0.148     0    0.038   0.103     0.395  100.000  100.000
LGA    V   114_A      V   114_A     0.177     0    0.024   0.041     0.275  100.000  100.000
LGA    C   115_A      C   115_A     0.166     0    0.047   0.064     0.339  100.000  100.000
LGA    A   116_A      A   116_A     0.177     0    0.056   0.071     0.241  100.000  100.000
LGA    T   117_A      T   117_A     0.514     0    0.191   0.219     0.683   92.857   91.837
LGA    A   118_A      A   118_A     2.029     0    0.091   0.109     2.511   72.976   69.810
LGA    G   119_A      G   119_A     1.892     0    0.083   0.083     1.916   75.000   75.000
LGA    D   120_A      D   120_A     1.133     0    0.028   1.126     4.601   85.952   71.369
LGA    R   121_A      R   121_A     1.007     0    0.286   0.749     6.815   79.286   53.636
LGA    W   122_A      W   122_A     1.645     0    0.097   0.400     6.113   77.143   50.034
LGA    H   123_A      H   123_A     1.906     0    0.258   0.321     3.557   63.452   64.286
LGA    A   124_A      A   124_A     1.282     0    0.020   0.022     1.408   83.690   83.238
LGA    T   125_A      T   125_A     1.000     0    0.083   0.142     1.476   85.952   84.014
LGA    D   126_A      D   126_A     0.325     0    0.058   0.204     1.078   97.619   94.107
LGA    A   127_A      A   127_A     0.419     0    0.056   0.065     0.503  100.000   98.095
LGA    F   128_A      F   128_A     0.408     0    0.039   0.344     1.237  100.000   93.160
LGA    I   129_A      I   129_A     0.286     0    0.076   0.944     2.218  100.000   87.798
LGA    L   130_A      L   130_A     0.307     0    0.029   0.095     0.329  100.000  100.000
LGA    R   131_A      R   131_A     0.447     0    0.015   1.248     4.900  100.000   80.173
LGA    D   132_A      D   132_A     0.385     0    0.051   0.113     0.950   97.619   95.238
LGA    F   133_A      F   133_A     0.590     0    0.021   0.164     2.067   92.857   82.554
LGA    V   134_A      V   134_A     0.576     0    0.088   1.224     3.265   95.238   84.898
LGA    Y   135_A      Y   135_A     0.329     0    0.097   0.119     0.531   97.619   99.206
LGA    E   136_A      E   136_A     0.308     0    0.047   0.859     2.358  100.000   86.138
LGA    Y   137_A      Y   137_A     0.246     0    0.036   0.302     0.975  100.000   98.413
LGA    W   138_A      W   138_A     0.194     0    0.028   0.090     0.325  100.000  100.000
LGA    G   139_A      G   139_A     0.052     0    0.054   0.054     0.260  100.000  100.000
LGA    Q   140_A      Q   140_A     0.352     0    0.113   0.166     1.940  100.000   87.831
LGA    G   141_A      G   141_A     0.506     0    0.082   0.082     0.506   97.619   97.619
LGA    T   142_A      T   142_A     0.344     0    0.048   0.060     0.403  100.000  100.000
LGA    Q   143_A      Q   143_A     0.256     0    0.064   0.102     0.480  100.000  100.000
LGA    V   144_A      V   144_A     0.081     0    0.017   0.042     0.198  100.000  100.000
LGA    T   145_A      T   145_A     0.217     0    0.028   0.084     0.442  100.000  100.000
LGA    V   146_A      V   146_A     0.238     0    0.047   0.050     0.309  100.000  100.000
LGA    S   147_A      S   147_A     0.267     0    0.067   0.117     0.378  100.000  100.000
LGA    S   148_A      S   148_A     0.393     0    0.541   0.964     3.672   81.190   81.349
LGA    A   149_A      A   149_A     1.431     0    0.583   0.579     5.308   56.548   56.667

# RMSD_GDC results:       CA      MC common percent     ALL common percent   GDC_mc  GDC_all
NUMBER_OF_ATOMS_AA:      127     508    508  100.00     962    962  100.00               127
SUMMARY(RMSD_GDC):     0.605          0.695                  1.173           96.425   92.893

#CA            N1   N2   DIST      N    RMSD    GDT_TS    LGA_S3     LGA_Q 
SUMMARY(GDT)  173  127    4.0    127    0.61    97.835    99.088    18.008

LGA_LOCAL      RMSD:   0.605  Number of atoms:  127  under DIST:   4.00
LGA_ASGN_ATOMS RMSD:   0.605  Number of assigned atoms:  127 
Std_ASGN_ATOMS RMSD:   0.605  Standard rmsd on all 127 assigned CA atoms 

Unitary ROTATION matrix and the SHIFT vector superimpose molecules  (1=>2)
  X_new =  -0.527970 * X  +   0.648169 * Y  +  -0.548749 * Z  +  10.989726
  Y_new =   0.766033 * X  +   0.642432 * Y  +   0.021798 * Z  + -29.731165
  Z_new =   0.366662 * X  +  -0.408851 * Y  +  -0.835703 * Z  +  14.190109 

Euler angles from the ROTATION matrix. Conventions XYZ and ZXZ:
           Phi     Theta       Psi   [DEG:       Phi     Theta       Psi ]
XYZ:  2.174255 -0.375419 -2.686598   [DEG:  124.5756  -21.5099 -153.9307 ]
ZXZ: -1.610499  2.560208  2.410542   [DEG:  -92.2748  146.6891  138.1139 ]
 
# END of job
