
#######################################################
#                                                     #
#                        LGA                          #
#                  ---------------                    #
#                                                     #
#               Local-Global Alignment                #
#        A Method for Finding 3-D Similarities        #
#               in Protein Structures                 #
#                                                     #
#                  ------------ 10/2009               #
#                                                     #
#      Adam Zemla (adamz@llnl.gov)                    #
#      Lawrence Livermore National Laboratory, CA     #
#                                                     #
#######################################################

!!!   License for LGA program has expired  !!!
#   For updated version of the LGA program   #
# please contact Adam Zemla:  adamz@llnl.gov #

# Molecule1: number of CA atoms  173 ( 1303),  selected  127 , name one
# Molecule2: number of CA atoms  127 (  962),  selected  127 , name two
# PARAMETERS: input.pdb  -ie  -3  -d:4  -sda  -swap  -ch1:A  -ch2:A  
# FIXED Atom-Atom correspondence
# GDT and LCS analysis 

LCS - RMSD CUTOFF   5.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:   127      23_A - 149_A       0.69     0.69
  LCS_AVERAGE:    100.00

LCS - RMSD CUTOFF   2.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:   127      23_A - 149_A       0.69     0.69
  LCS_AVERAGE:    100.00

LCS - RMSD CUTOFF   1.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:   127      23_A - 149_A       0.69     0.69
  LCS_AVERAGE:    100.00

LCS_GDT    MOLECULE-1    MOLECULE-2     LCS_DETAILS     GDT_DETAILS                                                    TOTAL NUMBER OF RESIDUE PAIRS:  127
LCS_GDT     RESIDUE       RESIDUE       SEGMENT_SIZE    GLOBAL DISTANCE TEST COLUMNS: number of residues under the threshold assigned to each residue pair
LCS_GDT   NAME NUMBER   NAME NUMBER    1.0  2.0  5.0    0.5  1.0  1.5  2.0  2.5  3.0  3.5  4.0  4.5  5.0  5.5  6.0  6.5  7.0  7.5  8.0  8.5  9.0  9.5 10.0
LCS_GDT     E    23_A     E    23_A    127  127  127      4   11   95  119  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     V    24_A     V    24_A    127  127  127     45  115  120  125  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     Q    25_A     Q    25_A    127  127  127    104  116  121  125  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     L    26_A     L    26_A    127  127  127    104  116  121  125  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     V    27_A     V    27_A    127  127  127    104  116  121  125  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     E    28_A     E    28_A    127  127  127    104  116  121  125  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     S    29_A     S    29_A    127  127  127    104  116  121  125  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     G    30_A     G    30_A    127  127  127     91  116  121  125  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     G    31_A     G    31_A    127  127  127    104  116  121  125  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     G    32_A     G    32_A    127  127  127    104  116  121  125  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     S    33_A     S    33_A    127  127  127    104  116  121  125  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     V    34_A     V    34_A    127  127  127    104  116  121  125  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     Q    35_A     Q    35_A    127  127  127    104  116  121  125  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     A    36_A     A    36_A    127  127  127    104  116  121  125  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     G    37_A     G    37_A    127  127  127    104  116  121  125  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     G    38_A     G    38_A    127  127  127    104  116  121  125  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     S    39_A     S    39_A    127  127  127    104  116  121  125  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     L    40_A     L    40_A    127  127  127    104  116  121  125  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     R    41_A     R    41_A    127  127  127    104  116  121  125  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     L    42_A     L    42_A    127  127  127    104  116  121  125  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     S    43_A     S    43_A    127  127  127    104  116  121  125  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     C    44_A     C    44_A    127  127  127    104  116  121  125  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     A    45_A     A    45_A    127  127  127    104  116  121  125  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     A    46_A     A    46_A    127  127  127    104  116  121  125  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     S    47_A     S    47_A    127  127  127    104  116  121  125  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     A    48_A     A    48_A    127  127  127     95  116  121  125  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     F    49_A     F    49_A    127  127  127    104  116  121  125  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     G    50_A     G    50_A    127  127  127    104  116  121  125  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     N    51_A     N    51_A    127  127  127    104  116  121  125  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     Y    52_A     Y    52_A    127  127  127    103  116  121  125  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     M    53_A     M    53_A    127  127  127    104  116  121  125  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     G    54_A     G    54_A    127  127  127    104  116  121  125  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     W    55_A     W    55_A    127  127  127    104  116  121  125  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     F    56_A     F    56_A    127  127  127    104  116  121  125  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     R    57_A     R    57_A    127  127  127    104  116  121  125  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     Q    58_A     Q    58_A    127  127  127    104  116  121  125  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     A    59_A     A    59_A    127  127  127    104  116  121  125  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     P    60_A     P    60_A    127  127  127    104  116  121  125  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     G    61_A     G    61_A    127  127  127    100  116  121  125  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     K    62_A     K    62_A    127  127  127    104  116  121  125  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     E    63_A     E    63_A    127  127  127    104  116  121  125  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     R    64_A     R    64_A    127  127  127    104  116  121  125  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     E    65_A     E    65_A    127  127  127    104  116  121  125  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     G    66_A     G    66_A    127  127  127    104  116  121  125  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     V    67_A     V    67_A    127  127  127    104  116  121  125  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     A    68_A     A    68_A    127  127  127    104  116  121  125  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     A    69_A     A    69_A    127  127  127    104  116  121  125  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     I    70_A     I    70_A    127  127  127    104  116  121  125  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     R    71_A     R    71_A    127  127  127    104  116  121  125  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     T    72_A     T    72_A    127  127  127    104  116  121  125  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     G    73_A     G    73_A    127  127  127    104  116  121  125  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     G    74_A     G    74_A    127  127  127     31   90  121  125  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     G    75_A     G    75_A    127  127  127     33  116  121  125  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     S    76_A     S    76_A    127  127  127    103  116  121  125  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     T    77_A     T    77_A    127  127  127    104  116  121  125  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     Y    78_A     Y    78_A    127  127  127    104  116  121  125  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     Y    79_A     Y    79_A    127  127  127    104  116  121  125  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     T    80_A     T    80_A    127  127  127    104  116  121  125  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     D    81_A     D    81_A    127  127  127     94  116  121  125  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     S    82_A     S    82_A    127  127  127     90  116  121  125  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     V    83_A     V    83_A    127  127  127    103  116  121  125  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     K    84_A     K    84_A    127  127  127     90  116  121  125  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     G    85_A     G    85_A    127  127  127     90  116  121  125  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     R    86_A     R    86_A    127  127  127    104  116  121  125  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     F    87_A     F    87_A    127  127  127    104  116  121  125  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     T    88_A     T    88_A    127  127  127    104  116  121  125  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     I    89_A     I    89_A    127  127  127    104  116  121  125  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     S    90_A     S    90_A    127  127  127    104  116  121  125  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     Q    91_A     Q    91_A    127  127  127    104  116  121  125  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     D    92_A     D    92_A    127  127  127    104  116  121  125  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     K    93_A     K    93_A    127  127  127    104  116  121  125  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     A    94_A     A    94_A    127  127  127    104  116  121  125  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     K    95_A     K    95_A    127  127  127    104  116  121  125  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     N    96_A     N    96_A    127  127  127    104  116  121  125  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     T    97_A     T    97_A    127  127  127    104  116  121  125  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     V    98_A     V    98_A    127  127  127    104  116  121  125  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     Y    99_A     Y    99_A    127  127  127    104  116  121  125  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     L   100_A     L   100_A    127  127  127    104  116  121  125  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     Q   101_A     Q   101_A    127  127  127    104  116  121  125  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     M   102_A     M   102_A    127  127  127    104  116  121  125  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     N   103_A     N   103_A    127  127  127    104  116  121  125  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     S   104_A     S   104_A    127  127  127    104  116  121  125  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     L   105_A     L   105_A    127  127  127    104  116  121  125  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     K   106_A     K   106_A    127  127  127    104  116  121  125  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     P   107_A     P   107_A    127  127  127    104  116  121  125  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     E   108_A     E   108_A    127  127  127    104  116  121  125  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     D   109_A     D   109_A    127  127  127    104  116  121  125  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     T   110_A     T   110_A    127  127  127    104  116  121  125  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     A   111_A     A   111_A    127  127  127    104  116  121  125  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     M   112_A     M   112_A    127  127  127    104  116  121  125  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     Y   113_A     Y   113_A    127  127  127    104  116  121  125  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     V   114_A     V   114_A    127  127  127    104  116  121  125  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     C   115_A     C   115_A    127  127  127    104  116  121  125  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     A   116_A     A   116_A    127  127  127    104  116  121  125  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     T   117_A     T   117_A    127  127  127    104  116  121  125  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     A   118_A     A   118_A    127  127  127      4    9  121  125  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     G   119_A     G   119_A    127  127  127      3   97  121  125  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     D   120_A     D   120_A    127  127  127      4   97  121  125  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     R   121_A     R   121_A    127  127  127      3  116  121  125  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     W   122_A     W   122_A    127  127  127      3   98  121  125  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     H   123_A     H   123_A    127  127  127      3   47  120  125  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     A   124_A     A   124_A    127  127  127      5    9  121  125  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     T   125_A     T   125_A    127  127  127      5  116  121  125  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     D   126_A     D   126_A    127  127  127    104  116  121  125  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     A   127_A     A   127_A    127  127  127    104  116  121  125  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     F   128_A     F   128_A    127  127  127    104  116  121  125  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     I   129_A     I   129_A    127  127  127    104  116  121  125  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     L   130_A     L   130_A    127  127  127    104  116  121  125  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     R   131_A     R   131_A    127  127  127    104  116  121  125  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     D   132_A     D   132_A    127  127  127    104  116  121  125  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     F   133_A     F   133_A    127  127  127    104  116  121  125  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     V   134_A     V   134_A    127  127  127    104  116  121  125  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     Y   135_A     Y   135_A    127  127  127    104  116  121  125  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     E   136_A     E   136_A    127  127  127    104  116  121  125  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     Y   137_A     Y   137_A    127  127  127    104  116  121  125  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     W   138_A     W   138_A    127  127  127    104  116  121  125  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     G   139_A     G   139_A    127  127  127    104  116  121  125  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     Q   140_A     Q   140_A    127  127  127    104  116  121  125  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     G   141_A     G   141_A    127  127  127    104  116  121  125  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     T   142_A     T   142_A    127  127  127    104  116  121  125  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     Q   143_A     Q   143_A    127  127  127    104  116  121  125  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     V   144_A     V   144_A    127  127  127    104  116  121  125  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     T   145_A     T   145_A    127  127  127    104  116  121  125  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     V   146_A     V   146_A    127  127  127    104  116  121  125  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     S   147_A     S   147_A    127  127  127    104  116  121  125  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     S   148_A     S   148_A    127  127  127    104  116  121  125  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     A   149_A     A   149_A    127  127  127      3    3   76  108  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_AVERAGE  LCS_A: 100.00  ( 100.00  100.00  100.00 )

GLOBAL_DISTANCE_TEST (summary information about detected largest sets of residues (represented by selected AToms) that can fit under specified thresholds)
GDT DIST_CUTOFF  0.50   1.00   1.50   2.00   2.50   3.00   3.50   4.00   4.50   5.00   5.50   6.00   6.50   7.00   7.50   8.00   8.50   9.00   9.50  10.00
GDT NUMBER_AT    104    116    121    125    126    127    127    127    127    127    127    127    127    127    127    127    127    127    127    127 
GDT PERCENT_AT  81.89  91.34  95.28  98.43  99.21 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00
GDT RMS_LOCAL    0.27   0.35   0.47   0.56   0.62   0.69   0.69   0.69   0.69   0.69   0.69   0.69   0.69   0.69   0.69   0.69   0.69   0.69   0.69   0.69
GDT RMS_ALL_AT   0.70   0.70   0.69   0.69   0.69   0.69   0.69   0.69   0.69   0.69   0.69   0.69   0.69   0.69   0.69   0.69   0.69   0.69   0.69   0.69

# Checking swapping
#   possible swapping detected:  E    23_A      E    23_A
#   possible swapping detected:  F    56_A      F    56_A
#   possible swapping detected:  E    65_A      E    65_A
#   possible swapping detected:  Y    78_A      Y    78_A
#   possible swapping detected:  E   108_A      E   108_A
#   possible swapping detected:  Y   113_A      Y   113_A
#   possible swapping detected:  F   128_A      F   128_A
#   possible swapping detected:  F   133_A      F   133_A
#   possible swapping detected:  Y   135_A      Y   135_A
#   possible swapping detected:  E   136_A      E   136_A

#      Molecule1      Molecule2  DISTANCE    Mis    MC     All    Dist_max   GDC_mc  GDC_all
LGA    E    23_A      E    23_A     2.958     0    0.177   0.699     4.332   57.500   51.958
LGA    V    24_A      V    24_A     1.365     0    0.039   0.069     2.012   77.262   76.599
LGA    Q    25_A      Q    25_A     0.600     0    0.071   1.233     5.963   92.857   68.307
LGA    L    26_A      L    26_A     0.221     0    0.084   0.486     1.417  100.000   96.488
LGA    V    27_A      V    27_A     0.451     0    0.060   0.100     0.866   97.619   94.558
LGA    E    28_A      E    28_A     0.376     0    0.060   0.149     0.749  100.000   96.825
LGA    S    29_A      S    29_A     0.538     0    0.035   0.039     0.538   92.857   93.651
LGA    G    30_A      G    30_A     0.676     0    0.597   0.597     3.299   78.095   78.095
LGA    G    31_A      G    31_A     0.334     0    0.123   0.123     1.128   92.976   92.976
LGA    G    32_A      G    32_A     0.561     0    0.091   0.091     0.561   97.619   97.619
LGA    S    33_A      S    33_A     0.239     0    0.040   0.097     0.310  100.000  100.000
LGA    V    34_A      V    34_A     0.154     0    0.019   1.273     2.597  100.000   87.755
LGA    Q    35_A      Q    35_A     0.105     0    0.045   1.160     4.631  100.000   77.407
LGA    A    36_A      A    36_A     0.219     0    0.023   0.024     0.267  100.000  100.000
LGA    G    37_A      G    37_A     0.206     0    0.011   0.011     0.270  100.000  100.000
LGA    G    38_A      G    38_A     0.081     0    0.058   0.058     0.387  100.000  100.000
LGA    S    39_A      S    39_A     0.166     0    0.014   0.158     0.585  100.000   98.413
LGA    L    40_A      L    40_A     0.115     0    0.041   0.086     0.403  100.000  100.000
LGA    R    41_A      R    41_A     0.319     0    0.034   0.797     3.130  100.000   92.857
LGA    L    42_A      L    42_A     0.166     0    0.040   0.092     0.284  100.000  100.000
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LGA    L   130_A      L   130_A     0.307     0    0.052   0.128     0.362  100.000  100.000
LGA    R   131_A      R   131_A     0.356     0    0.020   0.970     5.216  100.000   79.048
LGA    D   132_A      D   132_A     0.222     0    0.027   0.191     0.912  100.000   96.429
LGA    F   133_A      F   133_A     0.363     0    0.038   0.186     2.155   97.619   85.065
LGA    V   134_A      V   134_A     0.405     0    0.140   1.246     3.226   97.619   86.258
LGA    Y   135_A      Y   135_A     0.269     0    0.064   0.134     0.527   97.619   99.206
LGA    E   136_A      E   136_A     0.284     0    0.013   0.866     2.379  100.000   88.942
LGA    Y   137_A      Y   137_A     0.182     0    0.044   0.245     0.802  100.000   98.413
LGA    W   138_A      W   138_A     0.205     0    0.018   0.095     0.299  100.000  100.000
LGA    G   139_A      G   139_A     0.140     0    0.056   0.056     0.346  100.000  100.000
LGA    Q   140_A      Q   140_A     0.387     0    0.122   0.271     1.976  100.000   87.831
LGA    G   141_A      G   141_A     0.479     0    0.072   0.072     0.479  100.000  100.000
LGA    T   142_A      T   142_A     0.409     0    0.048   0.059     0.626  100.000   98.639
LGA    Q   143_A      Q   143_A     0.237     0    0.050   0.119     0.419  100.000  100.000
LGA    V   144_A      V   144_A     0.157     0    0.027   0.026     0.187  100.000  100.000
LGA    T   145_A      T   145_A     0.224     0    0.015   0.055     0.386  100.000  100.000
LGA    V   146_A      V   146_A     0.250     0    0.030   0.045     0.350  100.000  100.000
LGA    S   147_A      S   147_A     0.168     0    0.041   0.633     2.309  100.000   94.127
LGA    S   148_A      S   148_A     0.514     0    0.521   0.697     1.682   88.452   86.190
LGA    A   149_A      A   149_A     3.384     0    0.139   0.206     5.820   42.619   38.381

# RMSD_GDC results:       CA      MC common percent     ALL common percent   GDC_mc  GDC_all
NUMBER_OF_ATOMS_AA:      127     508    508  100.00     962    962  100.00               127
SUMMARY(RMSD_GDC):     0.688          0.734                  1.195           96.092   92.404

#CA            N1   N2   DIST      N    RMSD    GDT_TS    LGA_S3     LGA_Q 
SUMMARY(GDT)  173  127    4.0    127    0.69    97.441    98.802    16.122

LGA_LOCAL      RMSD:   0.688  Number of atoms:  127  under DIST:   4.00
LGA_ASGN_ATOMS RMSD:   0.688  Number of assigned atoms:  127 
Std_ASGN_ATOMS RMSD:   0.688  Standard rmsd on all 127 assigned CA atoms 

Unitary ROTATION matrix and the SHIFT vector superimpose molecules  (1=>2)
  X_new =   0.462912 * X  +   0.367807 * Y  +   0.806493 * Z  +   9.162543
  Y_new =   0.653512 * X  +  -0.756314 * Y  +  -0.030182 * Z  + -27.125406
  Z_new =   0.598861 * X  +   0.541024 * Y  +  -0.590473 * Z  +  11.352769 

Euler angles from the ROTATION matrix. Conventions XYZ and ZXZ:
           Phi     Theta       Psi   [DEG:       Phi     Theta       Psi ]
XYZ:  0.954491 -0.642078  2.399869   [DEG:   54.6883  -36.7883  137.5024 ]
ZXZ:  1.533390  2.202441  0.836093   [DEG:   87.8568  126.1906   47.9046 ]
 
# END of job
