
#######################################################
#                                                     #
#                        LGA                          #
#                  ---------------                    #
#                                                     #
#               Local-Global Alignment                #
#        A Method for Finding 3-D Similarities        #
#               in Protein Structures                 #
#                                                     #
#                  ------------ 10/2009               #
#                                                     #
#      Adam Zemla (adamz@llnl.gov)                    #
#      Lawrence Livermore National Laboratory, CA     #
#                                                     #
#######################################################

!!!   License for LGA program has expired  !!!
#   For updated version of the LGA program   #
# please contact Adam Zemla:  adamz@llnl.gov #

# Molecule1: number of CA atoms  173 ( 1303),  selected  127 , name one
# Molecule2: number of CA atoms  127 (  962),  selected  127 , name two
# PARAMETERS: input.pdb  -ie  -3  -d:4  -sda  -swap  -ch1:A  -ch2:A  
# FIXED Atom-Atom correspondence
# GDT and LCS analysis 

LCS - RMSD CUTOFF   5.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:   127      23_A - 149_A       0.69     0.69
  LCS_AVERAGE:    100.00

LCS - RMSD CUTOFF   2.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:   127      23_A - 149_A       0.69     0.69
  LCS_AVERAGE:    100.00

LCS - RMSD CUTOFF   1.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:   127      23_A - 149_A       0.69     0.69
  LCS_AVERAGE:    100.00

LCS_GDT    MOLECULE-1    MOLECULE-2     LCS_DETAILS     GDT_DETAILS                                                    TOTAL NUMBER OF RESIDUE PAIRS:  127
LCS_GDT     RESIDUE       RESIDUE       SEGMENT_SIZE    GLOBAL DISTANCE TEST COLUMNS: number of residues under the threshold assigned to each residue pair
LCS_GDT   NAME NUMBER   NAME NUMBER    1.0  2.0  5.0    0.5  1.0  1.5  2.0  2.5  3.0  3.5  4.0  4.5  5.0  5.5  6.0  6.5  7.0  7.5  8.0  8.5  9.0  9.5 10.0
LCS_GDT     E    23_A     E    23_A    127  127  127      5   13   99  119  125  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     V    24_A     V    24_A    127  127  127     45  115  120  125  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     Q    25_A     Q    25_A    127  127  127     98  115  121  125  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     L    26_A     L    26_A    127  127  127     99  115  121  125  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     V    27_A     V    27_A    127  127  127     99  115  121  125  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     E    28_A     E    28_A    127  127  127     99  115  121  125  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     S    29_A     S    29_A    127  127  127     99  115  121  125  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     G    30_A     G    30_A    127  127  127     99  115  121  125  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     G    31_A     G    31_A    127  127  127     99  115  121  125  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     G    32_A     G    32_A    127  127  127     99  115  121  125  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     S    33_A     S    33_A    127  127  127     99  115  121  125  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     V    34_A     V    34_A    127  127  127     99  115  121  125  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     Q    35_A     Q    35_A    127  127  127     99  115  121  125  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     A    36_A     A    36_A    127  127  127     99  115  121  125  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     G    37_A     G    37_A    127  127  127     99  115  121  125  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     G    38_A     G    38_A    127  127  127     99  115  121  125  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     S    39_A     S    39_A    127  127  127     99  115  121  125  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     L    40_A     L    40_A    127  127  127     99  115  121  125  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     R    41_A     R    41_A    127  127  127     99  115  121  125  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     L    42_A     L    42_A    127  127  127     99  115  121  125  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     S    43_A     S    43_A    127  127  127     99  115  121  125  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     C    44_A     C    44_A    127  127  127     99  115  121  125  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     A    45_A     A    45_A    127  127  127     99  115  121  125  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     A    46_A     A    46_A    127  127  127     99  115  121  125  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     S    47_A     S    47_A    127  127  127     99  115  121  125  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     A    48_A     A    48_A    127  127  127     97  115  121  125  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     F    49_A     F    49_A    127  127  127     99  115  121  125  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     G    50_A     G    50_A    127  127  127     99  115  121  125  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     N    51_A     N    51_A    127  127  127     99  115  121  125  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     Y    52_A     Y    52_A    127  127  127     99  115  121  125  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     M    53_A     M    53_A    127  127  127     99  115  121  125  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     G    54_A     G    54_A    127  127  127     99  115  121  125  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     W    55_A     W    55_A    127  127  127     99  115  121  125  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     F    56_A     F    56_A    127  127  127     99  115  121  125  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     R    57_A     R    57_A    127  127  127     99  115  121  125  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     Q    58_A     Q    58_A    127  127  127     99  115  121  125  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     A    59_A     A    59_A    127  127  127     82  115  121  125  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     P    60_A     P    60_A    127  127  127     13  114  121  125  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     G    61_A     G    61_A    127  127  127     56  115  121  125  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     K    62_A     K    62_A    127  127  127     99  115  121  125  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     E    63_A     E    63_A    127  127  127     99  115  121  125  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     R    64_A     R    64_A    127  127  127     99  115  121  125  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     E    65_A     E    65_A    127  127  127     99  115  121  125  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     G    66_A     G    66_A    127  127  127     99  115  121  125  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     V    67_A     V    67_A    127  127  127     99  115  121  125  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     A    68_A     A    68_A    127  127  127     99  115  121  125  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     A    69_A     A    69_A    127  127  127     99  115  121  125  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     I    70_A     I    70_A    127  127  127     99  115  121  125  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     R    71_A     R    71_A    127  127  127     99  115  121  125  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     T    72_A     T    72_A    127  127  127     99  115  121  125  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     G    73_A     G    73_A    127  127  127     96  115  121  125  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     G    74_A     G    74_A    127  127  127     48  115  121  125  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     G    75_A     G    75_A    127  127  127     99  115  121  125  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     S    76_A     S    76_A    127  127  127     99  115  121  125  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     T    77_A     T    77_A    127  127  127     99  115  121  125  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     Y    78_A     Y    78_A    127  127  127     99  115  121  125  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     Y    79_A     Y    79_A    127  127  127     99  115  121  125  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     T    80_A     T    80_A    127  127  127     99  115  121  125  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     D    81_A     D    81_A    127  127  127     99  115  121  125  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     S    82_A     S    82_A    127  127  127     72  115  120  125  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     V    83_A     V    83_A    127  127  127     99  115  121  125  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     K    84_A     K    84_A    127  127  127     95  115  121  125  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     G    85_A     G    85_A    127  127  127     95  115  121  125  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     R    86_A     R    86_A    127  127  127     99  115  121  125  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     F    87_A     F    87_A    127  127  127     99  115  121  125  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     T    88_A     T    88_A    127  127  127     99  115  121  125  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     I    89_A     I    89_A    127  127  127     99  115  121  125  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     S    90_A     S    90_A    127  127  127     99  115  121  125  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     Q    91_A     Q    91_A    127  127  127     99  115  121  125  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     D    92_A     D    92_A    127  127  127     99  115  121  125  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     K    93_A     K    93_A    127  127  127     99  115  121  125  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     A    94_A     A    94_A    127  127  127     99  115  121  125  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     K    95_A     K    95_A    127  127  127     99  115  121  125  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     N    96_A     N    96_A    127  127  127     99  115  121  125  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     T    97_A     T    97_A    127  127  127     99  115  121  125  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     V    98_A     V    98_A    127  127  127     99  115  121  125  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     Y    99_A     Y    99_A    127  127  127     99  115  121  125  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     L   100_A     L   100_A    127  127  127     99  115  121  125  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     Q   101_A     Q   101_A    127  127  127     99  115  121  125  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     M   102_A     M   102_A    127  127  127     99  115  121  125  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     N   103_A     N   103_A    127  127  127     99  115  121  125  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     S   104_A     S   104_A    127  127  127     99  115  121  125  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     L   105_A     L   105_A    127  127  127     99  115  121  125  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     K   106_A     K   106_A    127  127  127     99  115  121  125  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     P   107_A     P   107_A    127  127  127     99  115  121  125  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     E   108_A     E   108_A    127  127  127     99  115  121  125  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     D   109_A     D   109_A    127  127  127     99  115  121  125  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     T   110_A     T   110_A    127  127  127     99  115  121  125  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     A   111_A     A   111_A    127  127  127     99  115  121  125  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     M   112_A     M   112_A    127  127  127     99  115  121  125  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     Y   113_A     Y   113_A    127  127  127     99  115  121  125  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     V   114_A     V   114_A    127  127  127     99  115  121  125  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     C   115_A     C   115_A    127  127  127     99  115  121  125  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     A   116_A     A   116_A    127  127  127     99  115  121  125  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     T   117_A     T   117_A    127  127  127     97  115  121  125  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     A   118_A     A   118_A    127  127  127      4   44  121  125  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     G   119_A     G   119_A    127  127  127      4   98  121  125  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     D   120_A     D   120_A    127  127  127      4  104  121  125  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     R   121_A     R   121_A    127  127  127      4   56  117  125  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     W   122_A     W   122_A    127  127  127     13   62  121  125  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     H   123_A     H   123_A    127  127  127      4    6  107  125  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     A   124_A     A   124_A    127  127  127      5   32  121  125  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     T   125_A     T   125_A    127  127  127      5  112  121  125  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     D   126_A     D   126_A    127  127  127     97  115  121  125  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     A   127_A     A   127_A    127  127  127     82  115  121  125  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     F   128_A     F   128_A    127  127  127     99  115  121  125  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     I   129_A     I   129_A    127  127  127     99  115  121  125  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     L   130_A     L   130_A    127  127  127     99  115  121  125  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     R   131_A     R   131_A    127  127  127     99  115  121  125  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     D   132_A     D   132_A    127  127  127     99  115  121  125  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     F   133_A     F   133_A    127  127  127     99  115  121  125  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     V   134_A     V   134_A    127  127  127     99  115  121  125  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     Y   135_A     Y   135_A    127  127  127     99  115  121  125  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     E   136_A     E   136_A    127  127  127     99  115  121  125  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     Y   137_A     Y   137_A    127  127  127     99  115  121  125  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     W   138_A     W   138_A    127  127  127     99  115  121  125  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     G   139_A     G   139_A    127  127  127     99  115  121  125  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     Q   140_A     Q   140_A    127  127  127     99  115  121  125  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     G   141_A     G   141_A    127  127  127     95  115  121  125  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     T   142_A     T   142_A    127  127  127     99  115  121  125  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     Q   143_A     Q   143_A    127  127  127     99  115  121  125  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     V   144_A     V   144_A    127  127  127     99  115  121  125  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     T   145_A     T   145_A    127  127  127     99  115  121  125  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     V   146_A     V   146_A    127  127  127     99  115  121  125  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     S   147_A     S   147_A    127  127  127     99  115  121  125  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     S   148_A     S   148_A    127  127  127     96  115  121  125  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_GDT     A   149_A     A   149_A    127  127  127      3    3   51  117  126  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127  127 
LCS_AVERAGE  LCS_A: 100.00  ( 100.00  100.00  100.00 )

GLOBAL_DISTANCE_TEST (summary information about detected largest sets of residues (represented by selected AToms) that can fit under specified thresholds)
GDT DIST_CUTOFF  0.50   1.00   1.50   2.00   2.50   3.00   3.50   4.00   4.50   5.00   5.50   6.00   6.50   7.00   7.50   8.00   8.50   9.00   9.50  10.00
GDT NUMBER_AT     99    115    121    125    126    127    127    127    127    127    127    127    127    127    127    127    127    127    127    127 
GDT PERCENT_AT  77.95  90.55  95.28  98.43  99.21 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00
GDT RMS_LOCAL    0.25   0.35   0.52   0.60   0.65   0.69   0.69   0.69   0.69   0.69   0.69   0.69   0.69   0.69   0.69   0.69   0.69   0.69   0.69   0.69
GDT RMS_ALL_AT   0.70   0.71   0.70   0.70   0.70   0.69   0.69   0.69   0.69   0.69   0.69   0.69   0.69   0.69   0.69   0.69   0.69   0.69   0.69   0.69

# Checking swapping
#   possible swapping detected:  E    23_A      E    23_A
#   possible swapping detected:  F    56_A      F    56_A
#   possible swapping detected:  E    63_A      E    63_A
#   possible swapping detected:  Y    78_A      Y    78_A
#   possible swapping detected:  E   108_A      E   108_A
#   possible swapping detected:  Y   113_A      Y   113_A
#   possible swapping detected:  F   128_A      F   128_A
#   possible swapping detected:  F   133_A      F   133_A
#   possible swapping detected:  Y   135_A      Y   135_A
#   possible swapping detected:  E   136_A      E   136_A

#      Molecule1      Molecule2  DISTANCE    Mis    MC     All    Dist_max   GDC_mc  GDC_all
LGA    E    23_A      E    23_A     2.925     0    0.168   0.730     4.445   57.500   53.492
LGA    V    24_A      V    24_A     1.267     0    0.068   0.085     1.916   83.810   81.565
LGA    Q    25_A      Q    25_A     0.656     0    0.065   0.983     4.719   95.238   74.603
LGA    L    26_A      L    26_A     0.126     0    0.048   0.510     1.250  100.000   95.357
LGA    V    27_A      V    27_A     0.323     0    0.075   0.103     0.792  100.000   95.918
LGA    E    28_A      E    28_A     0.221     0    0.104   0.182     0.523  100.000   98.942
LGA    S    29_A      S    29_A     0.113     0    0.043   0.045     0.153  100.000  100.000
LGA    G    30_A      G    30_A     0.094     0    0.044   0.044     0.420  100.000  100.000
LGA    G    31_A      G    31_A     0.278     0    0.030   0.030     0.304  100.000  100.000
LGA    G    32_A      G    32_A     0.521     0    0.051   0.051     0.581   95.238   95.238
LGA    S    33_A      S    33_A     0.225     0    0.024   0.081     0.331  100.000  100.000
LGA    V    34_A      V    34_A     0.074     0    0.032   1.281     2.580  100.000   87.755
LGA    Q    35_A      Q    35_A     0.157     0    0.038   1.179     4.603  100.000   78.148
LGA    A    36_A      A    36_A     0.294     0    0.031   0.032     0.355  100.000  100.000
LGA    G    37_A      G    37_A     0.190     0    0.022   0.022     0.239  100.000  100.000
LGA    G    38_A      G    38_A     0.246     0    0.065   0.065     0.246  100.000  100.000
LGA    S    39_A      S    39_A     0.152     0    0.020   0.145     0.655  100.000   98.413
LGA    L    40_A      L    40_A     0.132     0    0.026   0.087     0.317  100.000  100.000
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LGA    L    42_A      L    42_A     0.152     0    0.029   0.068     0.303  100.000  100.000
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LGA    L   130_A      L   130_A     0.388     0    0.069   0.115     0.624   97.619   97.619
LGA    R   131_A      R   131_A     0.389     0    0.020   1.055     5.478  100.000   78.398
LGA    D   132_A      D   132_A     0.299     0    0.055   0.111     0.879  100.000   96.429
LGA    F   133_A      F   133_A     0.462     0    0.024   0.183     2.066   95.238   84.199
LGA    V   134_A      V   134_A     0.497     0    0.099   1.228     3.197  100.000   87.619
LGA    Y   135_A      Y   135_A     0.329     0    0.132   0.156     0.763   97.619   98.413
LGA    E   136_A      E   136_A     0.274     0    0.026   0.890     2.593  100.000   85.291
LGA    Y   137_A      Y   137_A     0.172     0    0.040   0.282     0.841  100.000   98.413
LGA    W   138_A      W   138_A     0.192     0    0.025   0.084     0.332  100.000  100.000
LGA    G   139_A      G   139_A     0.125     0    0.064   0.064     0.242  100.000  100.000
LGA    Q   140_A      Q   140_A     0.271     0    0.103   0.172     1.537  100.000   90.741
LGA    G   141_A      G   141_A     0.555     0    0.080   0.080     0.555   97.619   97.619
LGA    T   142_A      T   142_A     0.395     0    0.053   0.065     0.502  100.000   98.639
LGA    Q   143_A      Q   143_A     0.328     0    0.065   0.090     0.506   97.619   98.942
LGA    V   144_A      V   144_A     0.203     0    0.016   0.040     0.242  100.000  100.000
LGA    T   145_A      T   145_A     0.263     0    0.008   0.069     0.467  100.000  100.000
LGA    V   146_A      V   146_A     0.228     0    0.047   0.051     0.303  100.000  100.000
LGA    S   147_A      S   147_A     0.356     0    0.085   0.632     2.464  100.000   94.127
LGA    S   148_A      S   148_A     0.661     0    0.562   0.998     2.889   84.048   80.635
LGA    A   149_A      A   149_A     2.754     0    0.202   0.291     5.193   50.833   45.905

# RMSD_GDC results:       CA      MC common percent     ALL common percent   GDC_mc  GDC_all
NUMBER_OF_ATOMS_AA:      127     508    508  100.00     962    962  100.00               127
SUMMARY(RMSD_GDC):     0.695          0.731                  1.268           95.814   92.140

#CA            N1   N2   DIST      N    RMSD    GDT_TS    LGA_S3     LGA_Q 
SUMMARY(GDT)  173  127    4.0    127    0.69    97.244    98.739    15.981

LGA_LOCAL      RMSD:   0.695  Number of atoms:  127  under DIST:   4.00
LGA_ASGN_ATOMS RMSD:   0.695  Number of assigned atoms:  127 
Std_ASGN_ATOMS RMSD:   0.695  Standard rmsd on all 127 assigned CA atoms 

Unitary ROTATION matrix and the SHIFT vector superimpose molecules  (1=>2)
  X_new =  -0.607821 * X  +   0.565811 * Y  +  -0.557146 * Z  +  10.866558
  Y_new =   0.685318 * X  +   0.728198 * Y  +  -0.008127 * Z  + -25.819027
  Z_new =   0.401115 * X  +  -0.386762 * Y  +  -0.830374 * Z  +  10.394798 

Euler angles from the ROTATION matrix. Conventions XYZ and ZXZ:
           Phi     Theta       Psi   [DEG:       Phi     Theta       Psi ]
XYZ:  2.296336 -0.412734 -2.705703   [DEG:  131.5704  -23.6479 -155.0254 ]
ZXZ: -1.556211  2.550576  2.337979   [DEG:  -89.1643  146.1372  133.9563 ]
 
# END of job
