
#######################################################
#                                                     #
#                        LGA                          #
#                  ---------------                    #
#                                                     #
#               Local-Global Alignment                #
#        A Method for Finding 3-D Similarities        #
#               in Protein Structures                 #
#                                                     #
#                  ------------ 10/2009               #
#                                                     #
#      Adam Zemla (adamz@llnl.gov)                    #
#      Lawrence Livermore National Laboratory, CA     #
#                                                     #
#######################################################

!!!   License for LGA program has expired  !!!
#   For updated version of the LGA program   #
# please contact Adam Zemla:  adamz@llnl.gov #

# Molecule1: number of CA atoms  139 ( 1107),  selected  118 , name one
# Molecule2: number of CA atoms  118 (  945),  selected  118 , name two
# PARAMETERS: input.pdb  -ie  -3  -d:4  -sda  -swap  -ch1:B  -ch2:B  
# FIXED Atom-Atom correspondence
# GDT and LCS analysis 

LCS - RMSD CUTOFF   5.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:   118      21_B - 138_B       0.65     0.65
  LCS_AVERAGE:    100.00

LCS - RMSD CUTOFF   2.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:   118      21_B - 138_B       0.65     0.65
  LCS_AVERAGE:    100.00

LCS - RMSD CUTOFF   1.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:   118      21_B - 138_B       0.65     0.65
  LCS_AVERAGE:    100.00

LCS_GDT    MOLECULE-1    MOLECULE-2     LCS_DETAILS     GDT_DETAILS                                                    TOTAL NUMBER OF RESIDUE PAIRS:  118
LCS_GDT     RESIDUE       RESIDUE       SEGMENT_SIZE    GLOBAL DISTANCE TEST COLUMNS: number of residues under the threshold assigned to each residue pair
LCS_GDT   NAME NUMBER   NAME NUMBER    1.0  2.0  5.0    0.5  1.0  1.5  2.0  2.5  3.0  3.5  4.0  4.5  5.0  5.5  6.0  6.5  7.0  7.5  8.0  8.5  9.0  9.5 10.0
LCS_GDT     M    21_B     M    21_B    118  118  118      2    3   34   71  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     A    22_B     A    22_B    118  118  118      3    5   24   45  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     S    23_B     S    23_B    118  118  118      3  114  116  116  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     M    24_B     M    24_B    118  118  118     70  114  116  116  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     Y    25_B     Y    25_B    118  118  118     70  114  116  116  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     A    26_B     A    26_B    118  118  118     91  114  116  116  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     K    27_B     K    27_B    118  118  118     54  114  116  116  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     H    28_B     H    28_B    118  118  118     50  114  116  116  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     S    29_B     S    29_B    118  118  118     52  114  116  116  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     A    30_B     A    30_B    118  118  118     45  114  116  116  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     Q    31_B     Q    31_B    118  118  118     24  114  116  116  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     N    32_B     N    32_B    118  118  118     91  114  116  116  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     Y    33_B     Y    33_B    118  118  118     91  114  116  116  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     Q    34_B     Q    34_B    118  118  118     90  114  116  116  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     P    35_B     P    35_B    118  118  118     91  114  116  116  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     L    36_B     L    36_B    118  118  118     91  114  116  116  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     L    37_B     L    37_B    118  118  118     91  114  116  116  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     P    38_B     P    38_B    118  118  118     89  114  116  116  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     G    39_B     G    39_B    118  118  118     91  114  116  116  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     I    40_B     I    40_B    118  118  118     91  114  116  116  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     K    41_B     K    41_B    118  118  118     91  114  116  116  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     I    42_B     I    42_B    118  118  118     91  114  116  116  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     K    43_B     K    43_B    118  118  118     91  114  116  116  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     T    44_B     T    44_B    118  118  118     91  114  116  116  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     L    45_B     L    45_B    118  118  118     91  114  116  116  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     V    46_B     V    46_B    118  118  118     91  114  116  116  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     Y    47_B     Y    47_B    118  118  118     91  114  116  116  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     G    48_B     G    48_B    118  118  118     91  114  116  116  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     E    49_B     E    49_B    118  118  118     91  114  116  116  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     L    50_B     L    50_B    118  118  118     91  114  116  116  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     T    51_B     T    51_B    118  118  118     91  114  116  116  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     L    52_B     L    52_B    118  118  118     91  114  116  116  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     M    53_B     M    53_B    118  118  118     91  114  116  116  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     T    54_B     T    54_B    118  118  118     91  114  116  116  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     E    55_B     E    55_B    118  118  118     91  114  116  116  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     F    56_B     F    56_B    118  118  118     91  114  116  116  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     V    57_B     V    57_B    118  118  118     91  114  116  116  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     M    58_B     M    58_B    118  118  118     91  114  116  116  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     D    59_B     D    59_B    118  118  118     91  114  116  116  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     K    60_B     K    60_B    118  118  118     91  114  116  116  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     G    61_B     G    61_B    118  118  118     91  114  116  116  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     S    62_B     S    62_B    118  118  118     91  114  116  116  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     S    63_B     S    63_B    118  118  118     91  114  116  116  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     L    64_B     L    64_B    118  118  118     91  114  116  116  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     P    65_B     P    65_B    118  118  118     91  114  116  116  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     D    66_B     D    66_B    118  118  118     91  114  116  116  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     H    67_B     H    67_B    118  118  118     91  114  116  116  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     T    68_B     T    68_B    118  118  118     91  114  116  116  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     H    69_B     H    69_B    118  118  118     51  114  116  116  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     P    70_B     P    70_B    118  118  118     51  114  116  116  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     Y    71_B     Y    71_B    118  118  118     91  114  116  116  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     E    72_B     E    72_B    118  118  118     91  114  116  116  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     Q    73_B     Q    73_B    118  118  118     91  114  116  116  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     T    74_B     T    74_B    118  118  118     91  114  116  116  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     G    75_B     G    75_B    118  118  118     91  114  116  116  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     Y    76_B     Y    76_B    118  118  118     91  114  116  116  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     L    77_B     L    77_B    118  118  118     91  114  116  116  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     V    78_B     V    78_B    118  118  118     91  114  116  116  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     S    79_B     S    79_B    118  118  118     91  114  116  116  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     G    80_B     G    80_B    118  118  118     91  114  116  116  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     K    81_B     K    81_B    118  118  118     91  114  116  116  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     I    82_B     I    82_B    118  118  118     91  114  116  116  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     I    83_B     I    83_B    118  118  118     91  114  116  116  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     L    84_B     L    84_B    118  118  118     91  114  116  116  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     Y    85_B     Y    85_B    118  118  118     91  114  116  116  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     I    86_B     I    86_B    118  118  118     91  114  116  116  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     E    87_B     E    87_B    118  118  118     91  114  116  116  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     D    88_B     D    88_B    118  118  118     91  114  116  116  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     K    89_B     K    89_B    118  118  118     91  114  116  116  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     K    90_B     K    90_B    118  118  118     91  114  116  116  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     Q    91_B     Q    91_B    118  118  118     91  114  116  116  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     Q    92_B     Q    92_B    118  118  118     91  114  116  116  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     I    93_B     I    93_B    118  118  118     91  114  116  116  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     M    94_B     M    94_B    118  118  118     90  114  116  116  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     A    95_B     A    95_B    118  118  118     90  114  116  116  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     G    96_B     G    96_B    118  118  118     60  114  116  116  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     D    97_B     D    97_B    118  118  118     91  114  116  116  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     S    98_B     S    98_B    118  118  118     91  114  116  116  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     W    99_B     W    99_B    118  118  118     91  114  116  116  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     C   100_B     C   100_B    118  118  118     90  114  116  116  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     I   101_B     I   101_B    118  118  118     91  114  116  116  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     P   102_B     P   102_B    118  118  118     46  114  116  116  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     K   103_B     K   103_B    118  118  118     24  114  116  116  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     N   104_B     N   104_B    118  118  118     35  114  116  116  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     V   105_B     V   105_B    118  118  118     91  114  116  116  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     H   106_B     H   106_B    118  118  118     91  114  116  116  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     H   107_B     H   107_B    118  118  118     91  114  116  116  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     H   108_B     H   108_B    118  118  118     91  114  116  116  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     A   109_B     A   109_B    118  118  118     91  114  116  116  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     E   110_B     E   110_B    118  118  118     91  114  116  116  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     I   111_B     I   111_B    118  118  118     91  114  116  116  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     L   112_B     L   112_B    118  118  118     91  114  116  116  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     E   113_B     E   113_B    118  118  118     91  114  116  116  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     N   114_B     N   114_B    118  118  118     91  114  116  116  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     S   115_B     S   115_B    118  118  118     91  114  116  116  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     V   116_B     V   116_B    118  118  118     91  114  116  116  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     A   117_B     A   117_B    118  118  118     91  114  116  116  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     V   118_B     V   118_B    118  118  118     91  114  116  116  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     E   119_B     E   119_B    118  118  118     91  114  116  116  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     V   120_B     V   120_B    118  118  118     91  114  116  116  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     F   121_B     F   121_B    118  118  118     91  114  116  116  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     A   122_B     A   122_B    118  118  118     91  114  116  116  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     P   123_B     P   123_B    118  118  118     91  114  116  116  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     T   124_B     T   124_B    118  118  118     91  114  116  116  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     R   125_B     R   125_B    118  118  118     91  114  116  116  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     E   126_B     E   126_B    118  118  118     91  114  116  116  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     E   127_B     E   127_B    118  118  118     91  114  116  116  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     Y   128_B     Y   128_B    118  118  118     91  114  116  116  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     I   129_B     I   129_B    118  118  118     90  114  116  116  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     K   130_B     K   130_B    118  118  118     45  114  116  116  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     Y   131_B     Y   131_B    118  118  118     90  114  116  116  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     L   132_B     L   132_B    118  118  118     91  114  116  116  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     D   133_B     D   133_B    118  118  118     91  114  116  116  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     R   134_B     R   134_B    118  118  118     86  114  116  116  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     T   135_B     T   135_B    118  118  118     91  114  116  116  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     T   136_B     T   136_B    118  118  118     91  114  116  116  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     V   137_B     V   137_B    118  118  118     70  114  116  116  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_GDT     V   138_B     V   138_B    118  118  118     16   70  116  116  117  117  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118  118 
LCS_AVERAGE  LCS_A: 100.00  ( 100.00  100.00  100.00 )

GLOBAL_DISTANCE_TEST (summary information about detected largest sets of residues (represented by selected AToms) that can fit under specified thresholds)
GDT DIST_CUTOFF  0.50   1.00   1.50   2.00   2.50   3.00   3.50   4.00   4.50   5.00   5.50   6.00   6.50   7.00   7.50   8.00   8.50   9.00   9.50  10.00
GDT NUMBER_AT     91    114    116    116    117    117    118    118    118    118    118    118    118    118    118    118    118    118    118    118 
GDT PERCENT_AT  77.12  96.61  98.31  98.31  99.15  99.15 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00
GDT RMS_LOCAL    0.35   0.46   0.49   0.49   0.58   0.56   0.65   0.65   0.65   0.65   0.65   0.65   0.65   0.65   0.65   0.65   0.65   0.65   0.65   0.65
GDT RMS_ALL_AT   0.67   0.65   0.65   0.65   0.65   0.65   0.65   0.65   0.65   0.65   0.65   0.65   0.65   0.65   0.65   0.65   0.65   0.65   0.65   0.65

# Checking swapping
#   possible swapping detected:  E    55_B      E    55_B
#   possible swapping detected:  F    56_B      F    56_B
#   possible swapping detected:  E    72_B      E    72_B
#   possible swapping detected:  Y    85_B      Y    85_B
#   possible swapping detected:  E    87_B      E    87_B
#   possible swapping detected:  E   110_B      E   110_B
#   possible swapping detected:  E   119_B      E   119_B
#   possible swapping detected:  E   126_B      E   126_B
#   possible swapping detected:  E   127_B      E   127_B

#      Molecule1      Molecule2  DISTANCE    Mis    MC     All    Dist_max   GDC_mc  GDC_all
LGA    M    21_B      M    21_B     3.506     0    0.248   1.062     8.412   53.333   32.798
LGA    A    22_B      A    22_B     3.086     0    0.615   0.601     5.752   63.095   54.762
LGA    S    23_B      S    23_B     0.997     0    0.022   0.183     1.733   83.810   86.032
LGA    M    24_B      M    24_B     0.616     0    0.066   0.550     1.771   90.476   84.940
LGA    Y    25_B      Y    25_B     0.706     0    0.130   0.154     1.509   90.476   85.238
LGA    A    26_B      A    26_B     0.443     0    0.051   0.056     0.605   92.857   94.286
LGA    K    27_B      K    27_B     0.740     0    0.060   0.644     3.254   90.476   81.481
LGA    H    28_B      H    28_B     0.739     0    0.063   0.188     1.002   90.476   89.571
LGA    S    29_B      S    29_B     0.732     0    0.058   0.104     0.913   90.476   90.476
LGA    A    30_B      A    30_B     0.725     0    0.018   0.036     0.784   90.476   90.476
LGA    Q    31_B      Q    31_B     1.058     0    0.036   1.067     4.380   90.595   75.926
LGA    N    32_B      N    32_B     0.534     0    0.086   0.517     1.648   92.857   89.464
LGA    Y    33_B      Y    33_B     0.537     0    0.057   0.131     1.027   88.214   92.897
LGA    Q    34_B      Q    34_B     0.591     0    0.029   1.320     3.594   90.476   79.577
LGA    P    35_B      P    35_B     0.422     0    0.063   0.208     0.495  100.000  100.000
LGA    L    36_B      L    36_B     0.525     0    0.009   0.235     0.643   92.857   92.857
LGA    L    37_B      L    37_B     0.540     0    0.018   0.083     0.766   95.238   92.857
LGA    P    38_B      P    38_B     0.553     0    0.015   0.046     0.853   95.238   93.197
LGA    G    39_B      G    39_B     0.345     0    0.044   0.044     0.459  100.000  100.000
LGA    I    40_B      I    40_B     0.351     0    0.021   0.625     1.668  100.000   95.417
LGA    K    41_B      K    41_B     0.142     0    0.010   0.822     2.134  100.000   91.111
LGA    I    42_B      I    42_B     0.262     0    0.011   0.096     0.370  100.000  100.000
LGA    K    43_B      K    43_B     0.424     0    0.038   0.630     1.961  100.000   91.852
LGA    T    44_B      T    44_B     0.226     0    0.016   0.101     0.368  100.000  100.000
LGA    L    45_B      L    45_B     0.302     0    0.051   0.052     0.510   97.619   98.810
LGA    V    46_B      V    46_B     0.253     0    0.053   1.201     2.549  100.000   88.844
LGA    Y    47_B      Y    47_B     0.432     0    0.053   0.163     0.898  100.000   97.619
LGA    G    48_B      G    48_B     0.485     0    0.086   0.086     0.503   97.619   97.619
LGA    E    49_B      E    49_B     0.424     0    0.049   0.718     2.539   97.619   82.434
LGA    L    50_B      L    50_B     0.136     0    0.016   0.133     0.592  100.000   98.810
LGA    T    51_B      T    51_B     0.163     0    0.071   0.114     0.523   97.619   98.639
LGA    L    52_B      L    52_B     0.232     0    0.022   0.117     0.628  100.000   97.619
LGA    M    53_B      M    53_B     0.219     0    0.011   0.101     0.402  100.000  100.000
LGA    T    54_B      T    54_B     0.350     0    0.072   0.118     0.404  100.000  100.000
LGA    E    55_B      E    55_B     0.292     0    0.042   0.367     1.394  100.000   95.820
LGA    F    56_B      F    56_B     0.457     0    0.067   0.223     0.650   97.619   93.939
LGA    V    57_B      V    57_B     0.388     0    0.030   0.086     0.571  100.000   98.639
LGA    M    58_B      M    58_B     0.249     0    0.076   0.208     0.492  100.000  100.000
LGA    D    59_B      D    59_B     0.290     0    0.038   0.555     1.617  100.000   93.095
LGA    K    60_B      K    60_B     0.343     0    0.030   0.085     1.219  100.000   93.757
LGA    G    61_B      G    61_B     0.476     0    0.054   0.054     0.569   97.619   97.619
LGA    S    62_B      S    62_B     0.376     0    0.052   0.093     0.454  100.000  100.000
LGA    S    63_B      S    63_B     0.390     0    0.011   0.034     0.660  100.000   96.825
LGA    L    64_B      L    64_B     0.513     0    0.023   0.739     3.090   92.857   84.464
LGA    P    65_B      P    65_B     0.410     0    0.039   0.050     0.520  100.000   97.279
LGA    D    66_B      D    66_B     0.129     0    0.026   0.522     1.436  100.000   96.488
LGA    H    67_B      H    67_B     0.325     0    0.066   0.133     0.658   97.619   96.190
LGA    T    68_B      T    68_B     0.303     0    0.067   1.084     2.698  100.000   88.844
LGA    H    69_B      H    69_B     0.672     0    0.053   0.121     0.820   90.476   90.476
LGA    P    70_B      P    70_B     0.735     0    0.209   0.201     1.709   86.071   87.959
LGA    Y    71_B      Y    71_B     0.470     0    0.059   0.181     0.977   95.238   93.651
LGA    E    72_B      E    72_B     0.465     0    0.021   0.174     1.094  100.000   95.820
LGA    Q    73_B      Q    73_B     0.350     0    0.029   0.122     0.425  100.000  100.000
LGA    T    74_B      T    74_B     0.347     0    0.043   1.171     2.254   97.619   87.211
LGA    G    75_B      G    75_B     0.433     0    0.036   0.036     0.489  100.000  100.000
LGA    Y    76_B      Y    76_B     0.368     0    0.024   0.146     1.077  100.000   93.730
LGA    L    77_B      L    77_B     0.409     0    0.020   0.208     0.949   97.619   95.238
LGA    V    78_B      V    78_B     0.454     0    0.014   0.030     0.484  100.000  100.000
LGA    S    79_B      S    79_B     0.438     0    0.063   0.092     0.525   97.619   98.413
LGA    G    80_B      G    80_B     0.441     0    0.015   0.015     0.441  100.000  100.000
LGA    K    81_B      K    81_B     0.359     0    0.012   0.367     1.179  100.000   95.820
LGA    I    82_B      I    82_B     0.365     0    0.037   0.054     0.435  100.000  100.000
LGA    I    83_B      I    83_B     0.409     0    0.058   0.093     0.777  100.000   95.238
LGA    L    84_B      L    84_B     0.419     0    0.039   0.123     0.693  100.000   97.619
LGA    Y    85_B      Y    85_B     0.472     0    0.025   0.070     0.510  100.000   99.206
LGA    I    86_B      I    86_B     0.431     0    0.027   0.079     0.491  100.000  100.000
LGA    E    87_B      E    87_B     0.391     0    0.054   0.456     3.130  100.000   83.651
LGA    D    88_B      D    88_B     0.457     0    0.041   0.149     1.219   97.619   94.107
LGA    K    89_B      K    89_B     0.401     0    0.070   0.546     2.652   97.619   87.302
LGA    K    90_B      K    90_B     0.496     0    0.089   0.523     2.422   92.857   85.714
LGA    Q    91_B      Q    91_B     0.369     0    0.004   0.579     2.252  100.000   84.339
LGA    Q    92_B      Q    92_B     0.340     0    0.030   0.238     0.887  100.000   98.942
LGA    I    93_B      I    93_B     0.363     0    0.009   0.219     0.980  100.000   97.619
LGA    M    94_B      M    94_B     0.714     0    0.066   0.483     2.675   92.857   81.071
LGA    A    95_B      A    95_B     0.728     0    0.017   0.022     0.993   90.476   90.476
LGA    G    96_B      G    96_B     0.716     0    0.045   0.045     0.716   90.476   90.476
LGA    D    97_B      D    97_B     0.432     0    0.025   0.164     0.844   97.619   94.048
LGA    S    98_B      S    98_B     0.361     0    0.040   0.075     0.686   97.619   96.825
LGA    W    99_B      W    99_B     0.399     0    0.050   0.141     0.632  100.000   98.639
LGA    C   100_B      C   100_B     0.552     0    0.061   0.079     1.010   90.595   90.556
LGA    I   101_B      I   101_B     0.265     0    0.004   0.128     0.498  100.000  100.000
LGA    P   102_B      P   102_B     0.703     0    0.035   0.048     0.834   90.476   90.476
LGA    K   103_B      K   103_B     1.013     0    0.057   1.223     3.829   88.214   78.307
LGA    N   104_B      N   104_B     0.820     0    0.017   0.358     1.198   90.476   88.214
LGA    V   105_B      V   105_B     0.312     0    0.023   0.056     0.567  100.000   98.639
LGA    H   106_B      H   106_B     0.407     0    0.032   0.100     1.063   97.619   91.524
LGA    H   107_B      H   107_B     0.408     0    0.041   0.095     0.416  100.000  100.000
LGA    H   108_B      H   108_B     0.308     0    0.060   1.154     2.489  100.000   90.095
LGA    A   109_B      A   109_B     0.429     0    0.044   0.041     0.449  100.000  100.000
LGA    E   110_B      E   110_B     0.281     0    0.024   0.783     3.326  100.000   85.767
LGA    I   111_B      I   111_B     0.105     0    0.024   0.112     0.443  100.000  100.000
LGA    L   112_B      L   112_B     0.321     0    0.022   0.053     0.651   97.619   95.238
LGA    E   113_B      E   113_B     0.286     0    0.058   1.037     4.216  100.000   82.169
LGA    N   114_B      N   114_B     0.240     0    0.074   0.297     0.850  100.000   97.619
LGA    S   115_B      S   115_B     0.274     0    0.041   0.111     0.451  100.000  100.000
LGA    V   116_B      V   116_B     0.257     0    0.052   0.063     0.501  100.000   98.639
LGA    A   117_B      A   117_B     0.250     0    0.025   0.030     0.361  100.000  100.000
LGA    V   118_B      V   118_B     0.227     0    0.039   0.081     0.399  100.000  100.000
LGA    E   119_B      E   119_B     0.289     0    0.069   0.712     2.391   97.619   90.847
LGA    V   120_B      V   120_B     0.341     0    0.038   0.080     0.499  100.000  100.000
LGA    F   121_B      F   121_B     0.271     0    0.056   0.101     0.612  100.000   98.268
LGA    A   122_B      A   122_B     0.363     0    0.070   0.069     0.495  100.000  100.000
LGA    P   123_B      P   123_B     0.173     0    0.023   0.039     0.348  100.000  100.000
LGA    T   124_B      T   124_B     0.459     0    0.014   0.205     1.069  100.000   94.626
LGA    R   125_B      R   125_B     0.463     0    0.061   0.119     0.574   97.619   97.403
LGA    E   126_B      E   126_B     0.531     0    0.019   0.975     3.910   97.619   81.852
LGA    E   127_B      E   127_B     0.169     0    0.082   0.831     4.973   97.619   74.815
LGA    Y   128_B      Y   128_B     0.373     0    0.099   0.151     0.671   97.619   96.032
LGA    I   129_B      I   129_B     0.577     0    0.033   0.117     0.705   92.857   91.667
LGA    K   130_B      K   130_B     0.872     0    0.032   0.212     2.842   90.476   79.947
LGA    Y   131_B      Y   131_B     0.647     0    0.017   0.119     1.407   92.857   88.254
LGA    L   132_B      L   132_B     0.209     0    0.030   0.166     0.498  100.000  100.000
LGA    D   133_B      D   133_B     0.261     0    0.022   0.139     0.798  100.000   96.429
LGA    R   134_B      R   134_B     0.464     0    0.041   1.079     8.530  100.000   60.996
LGA    T   135_B      T   135_B     0.447     0    0.011   0.084     0.865  100.000   95.918
LGA    T   136_B      T   136_B     0.406     0    0.032   0.125     0.686  100.000   95.918
LGA    V   137_B      V   137_B     0.566     0    0.016   0.055     0.944   92.857   93.197
LGA    V   138_B      V   138_B     1.545     0    0.041   0.220     2.059   79.286   75.374

# RMSD_GDC results:       CA      MC common percent     ALL common percent   GDC_mc  GDC_all
NUMBER_OF_ATOMS_AA:      118     472    472  100.00     945    945  100.00               118
SUMMARY(RMSD_GDC):     0.649          0.628                  1.155           96.363   92.296

#CA            N1   N2   DIST      N    RMSD    GDT_TS    LGA_S3     LGA_Q 
SUMMARY(GDT)  139  118    4.0    118    0.65    98.729    99.379    15.764

LGA_LOCAL      RMSD:   0.649  Number of atoms:  118  under DIST:   4.00
LGA_ASGN_ATOMS RMSD:   0.649  Number of assigned atoms:  118 
Std_ASGN_ATOMS RMSD:   0.649  Standard rmsd on all 118 assigned CA atoms 

Unitary ROTATION matrix and the SHIFT vector superimpose molecules  (1=>2)
  X_new =  -0.785950 * X  +  -0.203488 * Y  +  -0.583846 * Z  + -37.902340
  Y_new =   0.147931 * X  +  -0.978752 * Y  +   0.141986 * Z  +  29.732958
  Z_new =  -0.600333 * X  +   0.025225 * Y  +   0.799352 * Z  +   2.044787 

Euler angles from the ROTATION matrix. Conventions XYZ and ZXZ:
           Phi     Theta       Psi   [DEG:       Phi     Theta       Psi ]
XYZ:  2.955550  0.643917  0.031546   [DEG:  169.3405   36.8937    1.8075 ]
ZXZ: -1.809356  0.644580 -1.528803   [DEG: -103.6685   36.9317  -87.5939 ]
 
# END of job
