
#######################################################
#                                                     #
#                        LGA                          #
#                  ---------------                    #
#                                                     #
#               Local-Global Alignment                #
#        A Method for Finding 3-D Similarities        #
#               in Protein Structures                 #
#                                                     #
#                  ------------ 10/2009               #
#                                                     #
#      Adam Zemla (adamz@llnl.gov)                    #
#      Lawrence Livermore National Laboratory, CA     #
#                                                     #
#######################################################

!!!   License for LGA program has expired  !!!
#   For updated version of the LGA program   #
# please contact Adam Zemla:  adamz@llnl.gov #

# Molecule1: number of CA atoms  109 (  826),  selected  108 , name one
# Molecule2: number of CA atoms  108 (  820),  selected  108 , name two
# PARAMETERS: input.pdb  -ie  -3  -d:4  -sda  -swap  -ch1:A  -ch2:A  
# FIXED Atom-Atom correspondence
# GDT and LCS analysis 

LCS - RMSD CUTOFF   5.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:   108      17_A - 124_A       0.69     0.69
  LCS_AVERAGE:    100.00

LCS - RMSD CUTOFF   2.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:   108      17_A - 124_A       0.69     0.69
  LCS_AVERAGE:    100.00

LCS - RMSD CUTOFF   1.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:   108      17_A - 124_A       0.69     0.69
  LCS_AVERAGE:    100.00

LCS_GDT    MOLECULE-1    MOLECULE-2     LCS_DETAILS     GDT_DETAILS                                                    TOTAL NUMBER OF RESIDUE PAIRS:  108
LCS_GDT     RESIDUE       RESIDUE       SEGMENT_SIZE    GLOBAL DISTANCE TEST COLUMNS: number of residues under the threshold assigned to each residue pair
LCS_GDT   NAME NUMBER   NAME NUMBER    1.0  2.0  5.0    0.5  1.0  1.5  2.0  2.5  3.0  3.5  4.0  4.5  5.0  5.5  6.0  6.5  7.0  7.5  8.0  8.5  9.0  9.5 10.0
LCS_GDT     S    17_A     S    17_A    108  108  108      4   40   71  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K    18_A     K    18_A    108  108  108     10   34  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     I    19_A     I    19_A    108  108  108     80  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     T    20_A     T    20_A    108  108  108     80  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     S    21_A     S    21_A    108  108  108     80  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     I    22_A     I    22_A    108  108  108     80  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    23_A     L    23_A    108  108  108     80  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     N    24_A     N    24_A    108  108  108     80  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     P    25_A     P    25_A    108  108  108     80  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A    26_A     A    26_A    108  108  108     80  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     D    27_A     D    27_A    108  108  108     80  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     I    28_A     I    28_A    108  108  108     80  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     T    29_A     T    29_A    108  108  108     80  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K    30_A     K    30_A    108  108  108     80  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A    31_A     A    31_A    108  108  108     80  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    32_A     L    32_A    108  108  108     80  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    33_A     E    33_A    108  108  108     80  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     Q    34_A     Q    34_A    108  108  108     80  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     C    35_A     C    35_A    108  108  108     80  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A    36_A     A    36_A    108  108  108     78  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A    37_A     A    37_A    108  108  108     80  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     G    38_A     G    38_A    108  108  108     80  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     F    39_A     F    39_A    108  108  108     80  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     H    40_A     H    40_A    108  108  108     80  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     H    41_A     H    41_A    108  108  108     80  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     T    42_A     T    42_A    108  108  108     80  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A    43_A     A    43_A    108  108  108     80  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     F    44_A     F    44_A    108  108  108     80  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     F    45_A     F    45_A    108  108  108     80  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K    46_A     K    46_A    108  108  108     80  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A    47_A     A    47_A    108  108  108     80  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     S    48_A     S    48_A    108  108  108     80  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     G    49_A     G    49_A    108  108  108     80  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    50_A     L    50_A    108  108  108     80  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     S    51_A     S    51_A    108  108  108     80  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K    52_A     K    52_A    108  108  108     80  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K    53_A     K    53_A    108  108  108     80  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     S    54_A     S    54_A    108  108  108     74  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     D    55_A     D    55_A    108  108  108     66  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A    56_A     A    56_A    108  108  108     66  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    57_A     E    57_A    108  108  108     75  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    58_A     L    58_A    108  108  108     78  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A    59_A     A    59_A    108  108  108     78  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    60_A     E    60_A    108  108  108     76  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     I    61_A     I    61_A    108  108  108     78  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     F    62_A     F    62_A    108  108  108     80  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     N    63_A     N    63_A    108  108  108     78  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     V    64_A     V    64_A    108  108  108     50  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    65_A     L    65_A    108  108  108     58  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     D    66_A     D    66_A    108  108  108     64  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     G    67_A     G    67_A    108  108  108     75  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     D    68_A     D    68_A    108  108  108     64  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     Q    69_A     Q    69_A    108  108  108     75  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     S    70_A     S    70_A    108  108  108     64  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     G    71_A     G    71_A    108  108  108     80  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     Y    72_A     Y    72_A    108  108  108     80  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     I    73_A     I    73_A    108  108  108     80  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    74_A     E    74_A    108  108  108     80  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     V    75_A     V    75_A    108  108  108     80  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    76_A     E    76_A    108  108  108     80  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    77_A     E    77_A    108  108  108     80  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    78_A     L    78_A    108  108  108     80  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K    79_A     K    79_A    108  108  108     80  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     N    80_A     N    80_A    108  108  108     80  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     F    81_A     F    81_A    108  108  108     80  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    82_A     L    82_A    108  108  108     80  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K    83_A     K    83_A    108  108  108     80  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     C    84_A     C    84_A    108  108  108     80  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     F    85_A     F    85_A    108  108  108     80  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     S    86_A     S    86_A    108  108  108     80  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     D    87_A     D    87_A    108  108  108     74  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     G    88_A     G    88_A    108  108  108     50  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A    89_A     A    89_A    108  108  108     80  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     R    90_A     R    90_A    108  108  108     80  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     V    91_A     V    91_A    108  108  108     80  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    92_A     L    92_A    108  108  108     80  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     N    93_A     N    93_A    108  108  108     80  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     D    94_A     D    94_A    108  108  108     79  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K    95_A     K    95_A    108  108  108     79  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    96_A     E    96_A    108  108  108     80  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     T    97_A     T    97_A    108  108  108     80  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     S    98_A     S    98_A    108  108  108     80  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     N    99_A     N    99_A    108  108  108     80  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     F   100_A     F   100_A    108  108  108     80  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L   101_A     L   101_A    108  108  108     80  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A   102_A     A   102_A    108  108  108     80  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A   103_A     A   103_A    108  108  108     80  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     G   104_A     G   104_A    108  108  108     80  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     D   105_A     D   105_A    108  108  108     80  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     S   106_A     S   106_A    108  108  108     80  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     D   107_A     D   107_A    108  108  108     57  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     G   108_A     G   108_A    108  108  108     80  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     D   109_A     D   109_A    108  108  108     80  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     H   110_A     H   110_A    108  108  108     80  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K   111_A     K   111_A    108  108  108     80  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     I   112_A     I   112_A    108  108  108     80  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     G   113_A     G   113_A    108  108  108     80  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     V   114_A     V   114_A    108  108  108     80  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     D   115_A     D   115_A    108  108  108     50  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E   116_A     E   116_A    108  108  108     80  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     F   117_A     F   117_A    108  108  108     80  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K   118_A     K   118_A    108  108  108     80  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     S   119_A     S   119_A    108  108  108     80  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     M   120_A     M   120_A    108  108  108     64  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A   121_A     A   121_A    108  108  108     80  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K   122_A     K   122_A    108  108  108     80  104  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     M   123_A     M   123_A    108  108  108      3   40  105  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     T   124_A     T   124_A    108  108  108      3    3    5   16  103  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_AVERAGE  LCS_A: 100.00  ( 100.00  100.00  100.00 )

GLOBAL_DISTANCE_TEST (summary information about detected largest sets of residues (represented by selected AToms) that can fit under specified thresholds)
GDT DIST_CUTOFF  0.50   1.00   1.50   2.00   2.50   3.00   3.50   4.00   4.50   5.00   5.50   6.00   6.50   7.00   7.50   8.00   8.50   9.00   9.50  10.00
GDT NUMBER_AT     80    104    105    107    107    108    108    108    108    108    108    108    108    108    108    108    108    108    108    108 
GDT PERCENT_AT  74.07  96.30  97.22  99.07  99.07 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00
GDT RMS_LOCAL    0.34   0.45   0.47   0.58   0.58   0.69   0.69   0.69   0.69   0.69   0.69   0.69   0.69   0.69   0.69   0.69   0.69   0.69   0.69   0.69
GDT RMS_ALL_AT   0.73   0.70   0.69   0.69   0.69   0.69   0.69   0.69   0.69   0.69   0.69   0.69   0.69   0.69   0.69   0.69   0.69   0.69   0.69   0.69

# Checking swapping
#   possible swapping detected:  E    33_A      E    33_A
#   possible swapping detected:  F    39_A      F    39_A
#   possible swapping detected:  E    57_A      E    57_A
#   possible swapping detected:  F    62_A      F    62_A
#   possible swapping detected:  E    74_A      E    74_A
#   possible swapping detected:  E    77_A      E    77_A
#   possible swapping detected:  F    81_A      F    81_A
#   possible swapping detected:  F    85_A      F    85_A
#   possible swapping detected:  E    96_A      E    96_A
#   possible swapping detected:  F   100_A      F   100_A
#   possible swapping detected:  E   116_A      E   116_A
#   possible swapping detected:  F   117_A      F   117_A

#      Molecule1      Molecule2  DISTANCE    Mis    MC     All    Dist_max   GDC_mc  GDC_all
LGA    S    17_A      S    17_A     2.746     0    0.119   0.171     3.226   64.881   59.921
LGA    K    18_A      K    18_A     2.130     0    0.071   0.107     4.927   70.952   55.873
LGA    I    19_A      I    19_A     0.219     0    0.097   0.607     1.559   97.619   90.714
LGA    T    20_A      T    20_A     0.449     0    0.022   0.082     1.136  100.000   94.626
LGA    S    21_A      S    21_A     0.306     0    0.135   0.197     1.207   92.976   92.222
LGA    I    22_A      I    22_A     0.180     0    0.016   0.088     0.601  100.000   97.619
LGA    L    23_A      L    23_A     0.419     0    0.018   0.057     0.533  100.000   98.810
LGA    N    24_A      N    24_A     0.676     0    0.017   0.177     1.577   92.857   89.464
LGA    P    25_A      P    25_A     0.618     0    0.009   0.137     0.764   95.238   93.197
LGA    A    26_A      A    26_A     0.369     0    0.050   0.056     0.455  100.000  100.000
LGA    D    27_A      D    27_A     0.549     0    0.023   0.104     0.791   92.857   91.667
LGA    I    28_A      I    28_A     0.561     0    0.028   0.099     0.740   95.238   92.857
LGA    T    29_A      T    29_A     0.325     0    0.038   0.051     0.547  100.000   98.639
LGA    K    30_A      K    30_A     0.347     0    0.046   0.670     2.431  100.000   86.984
LGA    A    31_A      A    31_A     0.468     0    0.035   0.042     0.593  100.000   98.095
LGA    L    32_A      L    32_A     0.445     0    0.025   0.056     0.852  100.000   95.238
LGA    E    33_A      E    33_A     0.250     0    0.025   0.986     4.171  100.000   81.958
LGA    Q    34_A      Q    34_A     0.134     0    0.041   0.239     1.304  100.000   93.757
LGA    C    35_A      C    35_A     0.478     0    0.070   0.090     0.919   95.238   93.651
LGA    A    36_A      A    36_A     0.633     0    0.025   0.023     0.689   90.476   90.476
LGA    A    37_A      A    37_A     0.493     0    0.076   0.085     0.725   95.238   94.286
LGA    G    38_A      G    38_A     0.460     0    0.042   0.042     0.564   95.238   95.238
LGA    F    39_A      F    39_A     0.543     0    0.051   0.118     0.630   92.857   94.805
LGA    H    40_A      H    40_A     0.241     0    0.032   0.085     0.580  100.000   98.095
LGA    H    41_A      H    41_A     0.262     0    0.034   0.129     0.451  100.000  100.000
LGA    T    42_A      T    42_A     0.324     0    0.047   0.136     0.677  100.000   98.639
LGA    A    43_A      A    43_A     0.335     0    0.039   0.042     0.410  100.000  100.000
LGA    F    44_A      F    44_A     0.225     0    0.023   0.155     0.553  100.000   98.268
LGA    F    45_A      F    45_A     0.202     0    0.034   0.472     1.665  100.000   92.468
LGA    K    46_A      K    46_A     0.344     0    0.068   0.195     2.189   97.619   88.889
LGA    A    47_A      A    47_A     0.355     0    0.012   0.021     0.482  100.000  100.000
LGA    S    48_A      S    48_A     0.292     0    0.061   0.101     0.376  100.000  100.000
LGA    G    49_A      G    49_A     0.345     0    0.054   0.054     0.345  100.000  100.000
LGA    L    50_A      L    50_A     0.221     0    0.018   0.095     0.478  100.000  100.000
LGA    S    51_A      S    51_A     0.343     0    0.082   0.115     0.640   97.619   95.238
LGA    K    52_A      K    52_A     0.437     0    0.075   0.657     2.503  100.000   91.323
LGA    K    53_A      K    53_A     0.314     0    0.045   0.336     1.474   97.619   94.762
LGA    S    54_A      S    54_A     0.563     0    0.013   0.140     0.766   95.238   93.651
LGA    D    55_A      D    55_A     0.796     0    0.100   1.020     3.332   90.476   82.083
LGA    A    56_A      A    56_A     0.729     0    0.076   0.080     0.737   90.476   90.476
LGA    E    57_A      E    57_A     0.496     0    0.034   0.142     0.616   97.619   97.884
LGA    L    58_A      L    58_A     0.380     0    0.021   0.039     0.459  100.000  100.000
LGA    A    59_A      A    59_A     0.463     0    0.023   0.023     0.483  100.000  100.000
LGA    E    60_A      E    60_A     0.498     0    0.024   0.497     1.634  100.000   91.746
LGA    I    61_A      I    61_A     0.415     0    0.025   0.603     1.627  100.000   93.036
LGA    F    62_A      F    62_A     0.274     0    0.021   0.095     0.345  100.000  100.000
LGA    N    63_A      N    63_A     0.431     0    0.136   0.249     0.733   97.619   97.619
LGA    V    64_A      V    64_A     0.748     0    0.024   1.149     3.464   90.476   82.177
LGA    L    65_A      L    65_A     0.639     0    0.075   0.096     0.815   90.476   91.667
LGA    D    66_A      D    66_A     0.562     0    0.101   0.157     0.716   92.857   92.857
LGA    G    67_A      G    67_A     0.521     0    0.050   0.050     0.630   90.476   90.476
LGA    D    68_A      D    68_A     0.612     0    0.131   0.139     0.971   95.238   92.857
LGA    Q    69_A      Q    69_A     0.490     0    0.045   1.193     4.531   92.857   80.317
LGA    S    70_A      S    70_A     0.653     0    0.035   0.106     1.076   90.476   88.968
LGA    G    71_A      G    71_A     0.404     0    0.082   0.082     0.437  100.000  100.000
LGA    Y    72_A      Y    72_A     0.498     0    0.023   0.139     1.120   95.238   90.556
LGA    I    73_A      I    73_A     0.426     0    0.025   0.049     0.488  100.000  100.000
LGA    E    74_A      E    74_A     0.330     0    0.068   0.757     2.742  100.000   89.101
LGA    V    75_A      V    75_A     0.454     0    0.067   1.115     2.957  100.000   88.639
LGA    E    76_A      E    76_A     0.549     0    0.026   0.578     1.356   95.238   91.587
LGA    E    77_A      E    77_A     0.359     0    0.028   0.192     0.697   97.619   97.884
LGA    L    78_A      L    78_A     0.115     0    0.040   1.319     2.876  100.000   87.917
LGA    K    79_A      K    79_A     0.494     0    0.056   1.108     4.908   97.619   77.937
LGA    N    80_A      N    80_A     0.506     0    0.029   0.085     1.063   97.619   92.917
LGA    F    81_A      F    81_A     0.321     0    0.030   0.102     0.388  100.000  100.000
LGA    L    82_A      L    82_A     0.348     0    0.017   0.091     0.762  100.000   96.429
LGA    K    83_A      K    83_A     0.315     0    0.064   0.630     1.917   97.619   94.868
LGA    C    84_A      C    84_A     0.283     0    0.025   0.075     0.557  100.000   98.413
LGA    F    85_A      F    85_A     0.316     0    0.032   0.043     0.467  100.000  100.000
LGA    S    86_A      S    86_A     0.333     0    0.008   0.071     0.365  100.000  100.000
LGA    D    87_A      D    87_A     0.540     0    0.042   1.130     3.597   92.857   81.369
LGA    G    88_A      G    88_A     0.955     0    0.019   0.019     1.187   88.214   88.214
LGA    A    89_A      A    89_A     0.525     0    0.081   0.082     0.652   95.238   96.190
LGA    R    90_A      R    90_A     0.449     0    0.053   0.120     0.650  100.000   96.537
LGA    V    91_A      V    91_A     0.486     0    0.032   0.107     0.876   97.619   94.558
LGA    L    92_A      L    92_A     0.455     0    0.026   0.059     0.557   95.238   97.619
LGA    N    93_A      N    93_A     0.594     0    0.035   0.201     0.772   92.857   91.667
LGA    D    94_A      D    94_A     0.720     0    0.036   0.145     0.881   90.476   90.476
LGA    K    95_A      K    95_A     0.703     0    0.030   0.081     1.281   95.238   90.582
LGA    E    96_A      E    96_A     0.412     0    0.022   0.143     0.556  100.000   98.942
LGA    T    97_A      T    97_A     0.410     0    0.024   0.074     0.551  100.000   98.639
LGA    S    98_A      S    98_A     0.448     0    0.037   0.704     2.601   97.619   91.270
LGA    N    99_A      N    99_A     0.470     0    0.043   0.070     0.681  100.000   95.238
LGA    F   100_A      F   100_A     0.369     0    0.036   0.102     0.661  100.000   97.403
LGA    L   101_A      L   101_A     0.362     0    0.031   0.047     0.491  100.000  100.000
LGA    A   102_A      A   102_A     0.537     0    0.091   0.092     0.800   92.857   92.381
LGA    A   103_A      A   103_A     0.515     0    0.131   0.131     0.599   97.619   96.190
LGA    G   104_A      G   104_A     0.458     0    0.076   0.076     0.496  100.000  100.000
LGA    D   105_A      D   105_A     0.423     0    0.114   0.316     1.339   95.238   92.917
LGA    S   106_A      S   106_A     0.160     0    0.026   0.194     0.574  100.000   98.413
LGA    D   107_A      D   107_A     0.751     0    0.118   0.132     1.380   88.214   85.952
LGA    G   108_A      G   108_A     0.408     0    0.080   0.080     0.485  100.000  100.000
LGA    D   109_A      D   109_A     0.400     0    0.064   0.188     0.644   97.619   96.429
LGA    H   110_A      H   110_A     0.567     0    0.019   0.990     2.248   97.619   88.190
LGA    K   111_A      K   111_A     0.162     0    0.077   0.197     1.859   97.619   92.804
LGA    I   112_A      I   112_A     0.431     0    0.030   0.050     0.686  100.000   97.619
LGA    G   113_A      G   113_A     0.441     0    0.061   0.061     0.441  100.000  100.000
LGA    V   114_A      V   114_A     0.392     0    0.041   0.051     0.600  100.000   98.639
LGA    D   115_A      D   115_A     0.630     0    0.030   0.174     1.881   95.238   87.321
LGA    E   116_A      E   116_A     0.387     0    0.063   0.175     0.639  100.000   98.942
LGA    F   117_A      F   117_A     0.452     0    0.030   0.064     0.465  100.000  100.000
LGA    K   118_A      K   118_A     0.417     0    0.037   0.266     1.240  100.000   97.937
LGA    S   119_A      S   119_A     0.370     0    0.043   0.646     2.475  100.000   94.127
LGA    M   120_A      M   120_A     0.531     0    0.036   1.112     2.986   95.238   86.488
LGA    A   121_A      A   121_A     0.295     0    0.029   0.037     0.397  100.000  100.000
LGA    K   122_A      K   122_A     0.109     0    0.033   0.795     4.244  100.000   79.048
LGA    M   123_A      M   123_A     1.541     0    0.021   0.204     4.884   69.524   57.619
LGA    T   124_A      T   124_A     3.775     0    0.063   1.213     7.599   48.452   39.592

# RMSD_GDC results:       CA      MC common percent     ALL common percent   GDC_mc  GDC_all
NUMBER_OF_ATOMS_AA:      108     432    432  100.00     820    820  100.00               108
SUMMARY(RMSD_GDC):     0.686          0.664                  1.049           96.114   92.585

#CA            N1   N2   DIST      N    RMSD    GDT_TS    LGA_S3     LGA_Q 
SUMMARY(GDT)  109  108    4.0    108    0.69    98.843    99.375    13.742

LGA_LOCAL      RMSD:   0.686  Number of atoms:  108  under DIST:   4.00
LGA_ASGN_ATOMS RMSD:   0.686  Number of assigned atoms:  108 
Std_ASGN_ATOMS RMSD:   0.686  Standard rmsd on all 108 assigned CA atoms 

Unitary ROTATION matrix and the SHIFT vector superimpose molecules  (1=>2)
  X_new =   0.326056 * X  +   0.765514 * Y  +   0.554686 * Z  +  -1.795220
  Y_new =   0.007113 * X  +  -0.588722 * Y  +   0.808304 * Z  +   1.071887
  Z_new =   0.945324 * X  +  -0.259607 * Y  +  -0.197401 * Z  +  10.160566 

Euler angles from the ROTATION matrix. Conventions XYZ and ZXZ:
           Phi     Theta       Psi   [DEG:       Phi     Theta       Psi ]
XYZ:  0.021812 -1.238586 -2.220911   [DEG:    1.2497  -70.9658 -127.2488 ]
ZXZ:  2.540165  1.769503  1.838811   [DEG:  145.5408  101.3850  105.3561 ]
 
# END of job
