
#######################################################
#                                                     #
#                        LGA                          #
#                  ---------------                    #
#                                                     #
#               Local-Global Alignment                #
#        A Method for Finding 3-D Similarities        #
#               in Protein Structures                 #
#                                                     #
#                  ------------ 10/2009               #
#                                                     #
#      Adam Zemla (adamz@llnl.gov)                    #
#      Lawrence Livermore National Laboratory, CA     #
#                                                     #
#######################################################

!!!   License for LGA program has expired  !!!
#   For updated version of the LGA program   #
# please contact Adam Zemla:  adamz@llnl.gov #

# Molecule1: number of CA atoms  124 (  959),  selected  108 , name one
# Molecule2: number of CA atoms  108 (  820),  selected  108 , name two
# PARAMETERS: input.pdb  -ie  -3  -d:4  -sda  -swap  -ch1:A  -ch2:A  
# FIXED Atom-Atom correspondence
# GDT and LCS analysis 

LCS - RMSD CUTOFF   5.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:   108      17_A - 124_A       0.70     0.70
  LCS_AVERAGE:    100.00

LCS - RMSD CUTOFF   2.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:   108      17_A - 124_A       0.70     0.70
  LCS_AVERAGE:    100.00

LCS - RMSD CUTOFF   1.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:   108      17_A - 124_A       0.70     0.70
  LCS_AVERAGE:    100.00

LCS_GDT    MOLECULE-1    MOLECULE-2     LCS_DETAILS     GDT_DETAILS                                                    TOTAL NUMBER OF RESIDUE PAIRS:  108
LCS_GDT     RESIDUE       RESIDUE       SEGMENT_SIZE    GLOBAL DISTANCE TEST COLUMNS: number of residues under the threshold assigned to each residue pair
LCS_GDT   NAME NUMBER   NAME NUMBER    1.0  2.0  5.0    0.5  1.0  1.5  2.0  2.5  3.0  3.5  4.0  4.5  5.0  5.5  6.0  6.5  7.0  7.5  8.0  8.5  9.0  9.5 10.0
LCS_GDT     S    17_A     S    17_A    108  108  108      0    3   17  103  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K    18_A     K    18_A    108  108  108      3    3    4  103  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     I    19_A     I    19_A    108  108  108     41  103  105  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     T    20_A     T    20_A    108  108  108     78  103  105  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     S    21_A     S    21_A    108  108  108     60  103  105  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     I    22_A     I    22_A    108  108  108     20  103  105  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    23_A     L    23_A    108  108  108     78  103  105  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     N    24_A     N    24_A    108  108  108     78  103  105  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     P    25_A     P    25_A    108  108  108     78  103  105  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A    26_A     A    26_A    108  108  108     78  103  105  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     D    27_A     D    27_A    108  108  108     78  103  105  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     I    28_A     I    28_A    108  108  108     78  103  105  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     T    29_A     T    29_A    108  108  108     78  103  105  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K    30_A     K    30_A    108  108  108     52  103  105  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A    31_A     A    31_A    108  108  108     60  103  105  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    32_A     L    32_A    108  108  108     78  103  105  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    33_A     E    33_A    108  108  108     68  103  105  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     Q    34_A     Q    34_A    108  108  108     30  103  105  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     C    35_A     C    35_A    108  108  108     78  103  105  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A    36_A     A    36_A    108  108  108      6   54  105  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A    37_A     A    37_A    108  108  108      6   53  105  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     G    38_A     G    38_A    108  108  108     78  103  105  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     F    39_A     F    39_A    108  108  108     78  103  105  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     H    40_A     H    40_A    108  108  108     78  103  105  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     H    41_A     H    41_A    108  108  108     78  103  105  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     T    42_A     T    42_A    108  108  108     78  103  105  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A    43_A     A    43_A    108  108  108     78  103  105  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     F    44_A     F    44_A    108  108  108     78  103  105  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     F    45_A     F    45_A    108  108  108     78  103  105  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K    46_A     K    46_A    108  108  108     78  103  105  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A    47_A     A    47_A    108  108  108     78  103  105  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     S    48_A     S    48_A    108  108  108     78  103  105  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     G    49_A     G    49_A    108  108  108     78  103  105  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    50_A     L    50_A    108  108  108     78  103  105  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     S    51_A     S    51_A    108  108  108     78  103  105  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K    52_A     K    52_A    108  108  108     78  103  105  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K    53_A     K    53_A    108  108  108     78  103  105  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     S    54_A     S    54_A    108  108  108     78  103  105  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     D    55_A     D    55_A    108  108  108     42  103  105  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A    56_A     A    56_A    108  108  108     69  103  105  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    57_A     E    57_A    108  108  108     76  103  105  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    58_A     L    58_A    108  108  108     78  103  105  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A    59_A     A    59_A    108  108  108     76  103  105  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    60_A     E    60_A    108  108  108     60  103  105  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     I    61_A     I    61_A    108  108  108     69  103  105  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     F    62_A     F    62_A    108  108  108     78  103  105  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     N    63_A     N    63_A    108  108  108     76  103  105  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     V    64_A     V    64_A    108  108  108     42  103  105  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    65_A     L    65_A    108  108  108     42  103  105  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     D    66_A     D    66_A    108  108  108     69  103  105  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     G    67_A     G    67_A    108  108  108     69  103  105  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     D    68_A     D    68_A    108  108  108     42  103  105  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     Q    69_A     Q    69_A    108  108  108     76  103  105  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     S    70_A     S    70_A    108  108  108     78  103  105  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     G    71_A     G    71_A    108  108  108     78  103  105  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     Y    72_A     Y    72_A    108  108  108     78  103  105  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     I    73_A     I    73_A    108  108  108     78  103  105  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    74_A     E    74_A    108  108  108     78  103  105  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     V    75_A     V    75_A    108  108  108     78  103  105  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    76_A     E    76_A    108  108  108     78  103  105  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    77_A     E    77_A    108  108  108     78  103  105  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    78_A     L    78_A    108  108  108     78  103  105  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K    79_A     K    79_A    108  108  108     78  103  105  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     N    80_A     N    80_A    108  108  108     78  103  105  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     F    81_A     F    81_A    108  108  108     78  103  105  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    82_A     L    82_A    108  108  108     78  103  105  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K    83_A     K    83_A    108  108  108     78  103  105  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     C    84_A     C    84_A    108  108  108     78  103  105  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     F    85_A     F    85_A    108  108  108     78  103  105  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     S    86_A     S    86_A    108  108  108     78  103  105  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     D    87_A     D    87_A    108  108  108     74  103  105  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     G    88_A     G    88_A    108  108  108     73  103  105  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A    89_A     A    89_A    108  108  108     78  103  105  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     R    90_A     R    90_A    108  108  108     78  103  105  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     V    91_A     V    91_A    108  108  108     78  103  105  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    92_A     L    92_A    108  108  108     78  103  105  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     N    93_A     N    93_A    108  108  108     78  103  105  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     D    94_A     D    94_A    108  108  108     78  103  105  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K    95_A     K    95_A    108  108  108     78  103  105  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    96_A     E    96_A    108  108  108     78  103  105  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     T    97_A     T    97_A    108  108  108     78  103  105  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     S    98_A     S    98_A    108  108  108     78  103  105  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     N    99_A     N    99_A    108  108  108     78  103  105  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     F   100_A     F   100_A    108  108  108     78  103  105  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L   101_A     L   101_A    108  108  108     78  103  105  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A   102_A     A   102_A    108  108  108     78  103  105  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A   103_A     A   103_A    108  108  108     78  103  105  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     G   104_A     G   104_A    108  108  108     78  103  105  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     D   105_A     D   105_A    108  108  108     78  103  105  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     S   106_A     S   106_A    108  108  108     78  103  105  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     D   107_A     D   107_A    108  108  108     78  103  105  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     G   108_A     G   108_A    108  108  108     78  103  105  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     D   109_A     D   109_A    108  108  108     78  103  105  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     H   110_A     H   110_A    108  108  108     78  103  105  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K   111_A     K   111_A    108  108  108     60  103  105  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     I   112_A     I   112_A    108  108  108     78  103  105  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     G   113_A     G   113_A    108  108  108     78  103  105  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     V   114_A     V   114_A    108  108  108     78  103  105  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     D   115_A     D   115_A    108  108  108     78  103  105  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E   116_A     E   116_A    108  108  108     78  103  105  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     F   117_A     F   117_A    108  108  108     78  103  105  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K   118_A     K   118_A    108  108  108     78  103  105  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     S   119_A     S   119_A    108  108  108     78  103  105  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     M   120_A     M   120_A    108  108  108     78  103  105  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A   121_A     A   121_A    108  108  108     78  103  105  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K   122_A     K   122_A    108  108  108     67  103  105  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     M   123_A     M   123_A    108  108  108     36  103  105  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     T   124_A     T   124_A    108  108  108      3   28   93  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_AVERAGE  LCS_A: 100.00  ( 100.00  100.00  100.00 )

GLOBAL_DISTANCE_TEST (summary information about detected largest sets of residues (represented by selected AToms) that can fit under specified thresholds)
GDT DIST_CUTOFF  0.50   1.00   1.50   2.00   2.50   3.00   3.50   4.00   4.50   5.00   5.50   6.00   6.50   7.00   7.50   8.00   8.50   9.00   9.50  10.00
GDT NUMBER_AT     78    103    105    106    107    107    108    108    108    108    108    108    108    108    108    108    108    108    108    108 
GDT PERCENT_AT  72.22  95.37  97.22  98.15  99.07  99.07 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00
GDT RMS_LOCAL    0.33   0.46   0.52   0.56   0.64   0.63   0.70   0.70   0.70   0.70   0.70   0.70   0.70   0.70   0.70   0.70   0.70   0.70   0.70   0.70
GDT RMS_ALL_AT   0.72   0.71   0.70   0.70   0.70   0.70   0.70   0.70   0.70   0.70   0.70   0.70   0.70   0.70   0.70   0.70   0.70   0.70   0.70   0.70

# Checking swapping
#   possible swapping detected:  E    33_A      E    33_A
#   possible swapping detected:  F    44_A      F    44_A
#   possible swapping detected:  F    45_A      F    45_A

#      Molecule1      Molecule2  DISTANCE    Mis    MC     All    Dist_max   GDC_mc  GDC_all
LGA    S    17_A      S    17_A     3.253     0    0.394   0.887     6.446   48.095   42.143
LGA    K    18_A      K    18_A     3.091     0    0.614   1.536    10.558   67.262   33.757
LGA    I    19_A      I    19_A     0.695     0    0.112   0.868     2.761   90.833   83.095
LGA    T    20_A      T    20_A     0.595     0    0.104   0.124     1.249   88.214   85.306
LGA    S    21_A      S    21_A     0.619     0    0.030   0.571     1.077   92.857   89.048
LGA    I    22_A      I    22_A     0.729     0    0.055   0.663     1.583   95.238   87.262
LGA    L    23_A      L    23_A     0.367     0    0.063   0.089     1.188  100.000   94.107
LGA    N    24_A      N    24_A     0.298     0    0.038   1.060     3.579  100.000   83.274
LGA    P    25_A      P    25_A     0.389     0    0.036   0.305     1.523  100.000   93.469
LGA    A    26_A      A    26_A     0.342     0    0.054   0.058     0.439  100.000  100.000
LGA    D    27_A      D    27_A     0.436     0    0.028   0.081     0.514   97.619   98.810
LGA    I    28_A      I    28_A     0.385     0    0.024   0.589     1.952  100.000   94.226
LGA    T    29_A      T    29_A     0.276     0    0.031   0.098     0.481  100.000  100.000
LGA    K    30_A      K    30_A     0.680     0    0.034   0.877     3.704   92.857   82.328
LGA    A    31_A      A    31_A     0.613     0    0.037   0.045     0.661   90.476   90.476
LGA    L    32_A      L    32_A     0.202     0    0.012   0.088     0.763  100.000   98.810
LGA    E    33_A      E    33_A     0.604     0    0.018   0.630     2.029   92.857   83.757
LGA    Q    34_A      Q    34_A     1.053     0    0.079   1.104     3.287   85.952   76.190
LGA    C    35_A      C    35_A     0.573     0    0.027   0.073     1.628   92.857   87.619
LGA    A    36_A      A    36_A     1.670     0    0.044   0.049     2.359   75.238   74.762
LGA    A    37_A      A    37_A     1.945     0    0.311   0.309     3.196   67.143   66.667
LGA    G    38_A      G    38_A     0.146     0    0.055   0.055     0.513   97.619   97.619
LGA    F    39_A      F    39_A     0.182     0    0.043   0.050     0.818  100.000   95.671
LGA    H    40_A      H    40_A     0.190     0    0.051   0.205     1.316  100.000   92.524
LGA    H    41_A      H    41_A     0.370     0    0.024   0.393     2.093  100.000   88.238
LGA    T    42_A      T    42_A     0.489     0    0.016   1.148     2.292  100.000   88.571
LGA    A    43_A      A    43_A     0.393     0    0.028   0.042     0.496  100.000  100.000
LGA    F    44_A      F    44_A     0.188     0    0.019   0.133     0.900  100.000   97.403
LGA    F    45_A      F    45_A     0.173     0    0.057   0.644     2.111  100.000   88.398
LGA    K    46_A      K    46_A     0.259     0    0.031   0.957     3.931  100.000   85.714
LGA    A    47_A      A    47_A     0.361     0    0.039   0.049     0.452  100.000  100.000
LGA    S    48_A      S    48_A     0.380     0    0.044   0.046     0.700   97.619   98.413
LGA    G    49_A      G    49_A     0.526     0    0.079   0.079     0.526   97.619   97.619
LGA    L    50_A      L    50_A     0.421     0    0.027   0.178     0.842  100.000   97.619
LGA    S    51_A      S    51_A     0.387     0    0.174   0.161     1.215   97.619   93.730
LGA    K    52_A      K    52_A     0.437     0    0.135   1.171     4.340   97.619   81.217
LGA    K    53_A      K    53_A     0.178     0    0.032   0.095     0.286  100.000  100.000
LGA    S    54_A      S    54_A     0.238     0    0.043   0.050     0.420  100.000  100.000
LGA    D    55_A      D    55_A     0.700     0    0.072   0.864     3.230   90.476   77.917
LGA    A    56_A      A    56_A     0.595     0    0.025   0.046     0.773   90.476   90.476
LGA    E    57_A      E    57_A     0.501     0    0.021   0.321     1.215   95.238   93.704
LGA    L    58_A      L    58_A     0.362     0    0.035   0.167     0.435  100.000  100.000
LGA    A    59_A      A    59_A     0.484     0    0.035   0.053     0.673   95.238   94.286
LGA    E    60_A      E    60_A     0.649     0    0.036   0.489     2.482   90.476   82.698
LGA    I    61_A      I    61_A     0.596     0    0.041   0.688     2.648   90.476   86.310
LGA    F    62_A      F    62_A     0.269     0    0.030   0.120     0.710  100.000   97.403
LGA    N    63_A      N    63_A     0.542     0    0.066   1.128     4.658   92.857   75.060
LGA    V    64_A      V    64_A     0.890     0    0.071   0.090     1.724   90.476   84.150
LGA    L    65_A      L    65_A     0.730     0    0.057   0.089     0.989   90.476   90.476
LGA    D    66_A      D    66_A     0.544     0    0.046   0.131     0.615   90.476   92.857
LGA    G    67_A      G    67_A     0.637     0    0.082   0.082     0.701   90.476   90.476
LGA    D    68_A      D    68_A     0.939     0    0.092   0.195     1.247   90.476   88.214
LGA    Q    69_A      Q    69_A     0.564     0    0.072   1.395     6.615   95.238   65.026
LGA    S    70_A      S    70_A     0.300     0    0.041   0.052     0.516  100.000   98.413
LGA    G    71_A      G    71_A     0.318     0    0.037   0.037     0.318  100.000  100.000
LGA    Y    72_A      Y    72_A     0.337     0    0.046   0.066     0.884  100.000   96.032
LGA    I    73_A      I    73_A     0.390     0    0.022   0.103     0.475  100.000  100.000
LGA    E    74_A      E    74_A     0.323     0    0.038   0.153     0.758  100.000   94.709
LGA    V    75_A      V    75_A     0.142     0    0.031   1.205     2.692  100.000   87.755
LGA    E    76_A      E    76_A     0.367     0    0.027   1.326     7.146   97.619   67.884
LGA    E    77_A      E    77_A     0.418     0    0.054   0.508     1.417   97.619   91.640
LGA    L    78_A      L    78_A     0.300     0    0.033   1.336     2.612  100.000   85.774
LGA    K    79_A      K    79_A     0.329     0    0.092   1.118     2.886  100.000   85.344
LGA    N    80_A      N    80_A     0.332     0    0.100   0.516     1.551   97.619   91.905
LGA    F    81_A      F    81_A     0.172     0    0.045   0.119     0.560  100.000   99.134
LGA    L    82_A      L    82_A     0.293     0    0.026   0.099     0.623  100.000   98.810
LGA    K    83_A      K    83_A     0.425     0    0.061   0.722     2.591   97.619   86.032
LGA    C    84_A      C    84_A     0.581     0    0.067   0.064     0.930   92.857   92.063
LGA    F    85_A      F    85_A     0.467     0    0.058   0.126     0.789   97.619   96.537
LGA    S    86_A      S    86_A     0.370     0    0.088   0.091     0.507   97.619   98.413
LGA    D    87_A      D    87_A     0.679     0    0.063   1.256     3.460   90.476   80.952
LGA    G    88_A      G    88_A     0.775     0    0.120   0.120     0.775   95.238   95.238
LGA    A    89_A      A    89_A     0.402     0    0.038   0.050     0.544   97.619   98.095
LGA    R    90_A      R    90_A     0.321     0    0.019   0.168     0.523  100.000   99.134
LGA    V    91_A      V    91_A     0.301     0    0.020   0.149     0.623  100.000   98.639
LGA    L    92_A      L    92_A     0.361     0    0.060   0.086     0.482  100.000  100.000
LGA    N    93_A      N    93_A     0.568     0    0.036   0.813     2.190   90.476   81.786
LGA    D    94_A      D    94_A     0.522     0    0.057   0.894     3.459   92.857   80.417
LGA    K    95_A      K    95_A     0.413     0    0.021   1.297     6.065  100.000   78.413
LGA    E    96_A      E    96_A     0.380     0    0.039   0.163     1.032  100.000   95.820
LGA    T    97_A      T    97_A     0.368     0    0.027   0.097     0.598  100.000   98.639
LGA    S    98_A      S    98_A     0.165     0    0.043   0.729     2.143  100.000   94.127
LGA    N    99_A      N    99_A     0.331     0    0.036   0.846     3.449  100.000   82.143
LGA    F   100_A      F   100_A     0.414     0    0.018   0.586     1.459  100.000   91.472
LGA    L   101_A      L   101_A     0.342     0    0.022   0.079     0.508  100.000   98.810
LGA    A   102_A      A   102_A     0.313     0    0.045   0.048     0.544   97.619   98.095
LGA    A   103_A      A   103_A     0.582     0    0.022   0.035     0.821   92.857   92.381
LGA    G   104_A      G   104_A     0.397     0    0.035   0.035     0.436  100.000  100.000
LGA    D   105_A      D   105_A     0.339     0    0.043   0.147     0.464  100.000  100.000
LGA    S   106_A      S   106_A     0.292     0    0.141   0.625     1.232   97.619   93.730
LGA    D   107_A      D   107_A     0.432     0    0.159   0.185     1.234   92.976   90.595
LGA    G   108_A      G   108_A     0.356     0    0.042   0.042     0.356  100.000  100.000
LGA    D   109_A      D   109_A     0.476     0    0.096   0.129     0.749   95.238   97.619
LGA    H   110_A      H   110_A     0.522     0    0.020   1.296     5.900   92.857   68.952
LGA    K   111_A      K   111_A     0.569     0    0.034   0.588     1.520   95.238   91.693
LGA    I   112_A      I   112_A     0.470     0    0.018   0.073     0.641  100.000   95.238
LGA    G   113_A      G   113_A     0.213     0    0.025   0.025     0.332  100.000  100.000
LGA    V   114_A      V   114_A     0.167     0    0.027   1.120     2.671  100.000   88.844
LGA    D   115_A      D   115_A     0.165     0    0.030   0.114     0.430  100.000  100.000
LGA    E   116_A      E   116_A     0.310     0    0.029   0.120     0.589  100.000   98.942
LGA    F   117_A      F   117_A     0.322     0    0.024   0.115     0.910  100.000   95.671
LGA    K   118_A      K   118_A     0.234     0    0.025   0.211     1.589  100.000   94.868
LGA    S   119_A      S   119_A     0.242     0    0.015   0.726     2.170  100.000   94.127
LGA    M   120_A      M   120_A     0.405     0    0.019   0.970     3.387   97.619   90.179
LGA    A   121_A      A   121_A     0.503     0    0.041   0.046     0.809   92.857   94.286
LGA    K   122_A      K   122_A     0.618     0    0.102   0.787     5.054   92.857   71.217
LGA    M   123_A      M   123_A     0.740     0    0.321   1.176     9.413   81.786   54.762
LGA    T   124_A      T   124_A     2.101     0    0.703   1.062     4.347   69.286   58.367

# RMSD_GDC results:       CA      MC common percent     ALL common percent   GDC_mc  GDC_all
NUMBER_OF_ATOMS_AA:      108     432    432  100.00     820    820  100.00               108
SUMMARY(RMSD_GDC):     0.703          0.718                  1.509           95.394   89.542

#CA            N1   N2   DIST      N    RMSD    GDT_TS    LGA_S3     LGA_Q 
SUMMARY(GDT)  124  108    4.0    108    0.70    98.380    99.180    13.455

LGA_LOCAL      RMSD:   0.703  Number of atoms:  108  under DIST:   4.00
LGA_ASGN_ATOMS RMSD:   0.703  Number of assigned atoms:  108 
Std_ASGN_ATOMS RMSD:   0.703  Standard rmsd on all 108 assigned CA atoms 

Unitary ROTATION matrix and the SHIFT vector superimpose molecules  (1=>2)
  X_new =  -0.865581 * X  +  -0.377525 * Y  +   0.329005 * Z  +  -4.816087
  Y_new =  -0.155804 * X  +   0.827420 * Y  +   0.539538 * Z  + -38.166988
  Z_new =  -0.475915 * X  +   0.415753 * Y  +  -0.775019 * Z  +  67.405365 

Euler angles from the ROTATION matrix. Conventions XYZ and ZXZ:
           Phi     Theta       Psi   [DEG:       Phi     Theta       Psi ]
XYZ: -2.963500  0.496004  2.649217   [DEG: -169.7960   28.4189  151.7890 ]
ZXZ:  2.594006  2.457541 -0.852766   [DEG:  148.6256  140.8067  -48.8599 ]
 
# END of job
