
#######################################################
#                                                     #
#                        LGA                          #
#                  ---------------                    #
#                                                     #
#               Local-Global Alignment                #
#        A Method for Finding 3-D Similarities        #
#               in Protein Structures                 #
#                                                     #
#                  ------------ 10/2009               #
#                                                     #
#      Adam Zemla (adamz@llnl.gov)                    #
#      Lawrence Livermore National Laboratory, CA     #
#                                                     #
#######################################################

!!!   License for LGA program has expired  !!!
#   For updated version of the LGA program   #
# please contact Adam Zemla:  adamz@llnl.gov #

# Molecule1: number of CA atoms  124 (  959),  selected  108 , name one
# Molecule2: number of CA atoms  108 (  820),  selected  108 , name two
# PARAMETERS: input.pdb  -ie  -3  -d:4  -sda  -swap  -ch1:A  -ch2:A  
# FIXED Atom-Atom correspondence
# GDT and LCS analysis 

LCS - RMSD CUTOFF   5.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:   108      17_A - 124_A       0.76     0.76
  LCS_AVERAGE:    100.00

LCS - RMSD CUTOFF   2.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:   108      17_A - 124_A       0.76     0.76
  LCS_AVERAGE:    100.00

LCS - RMSD CUTOFF   1.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:   108      17_A - 124_A       0.76     0.76
  LCS_AVERAGE:    100.00

LCS_GDT    MOLECULE-1    MOLECULE-2     LCS_DETAILS     GDT_DETAILS                                                    TOTAL NUMBER OF RESIDUE PAIRS:  108
LCS_GDT     RESIDUE       RESIDUE       SEGMENT_SIZE    GLOBAL DISTANCE TEST COLUMNS: number of residues under the threshold assigned to each residue pair
LCS_GDT   NAME NUMBER   NAME NUMBER    1.0  2.0  5.0    0.5  1.0  1.5  2.0  2.5  3.0  3.5  4.0  4.5  5.0  5.5  6.0  6.5  7.0  7.5  8.0  8.5  9.0  9.5 10.0
LCS_GDT     S    17_A     S    17_A    108  108  108      0    3   55   81  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K    18_A     K    18_A    108  108  108      3    3    4  101  105  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     I    19_A     I    19_A    108  108  108     57  100  104  105  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     T    20_A     T    20_A    108  108  108     73  100  104  105  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     S    21_A     S    21_A    108  108  108      4  100  104  105  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     I    22_A     I    22_A    108  108  108     16  100  104  105  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    23_A     L    23_A    108  108  108     73  100  104  105  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     N    24_A     N    24_A    108  108  108     73  100  104  105  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     P    25_A     P    25_A    108  108  108     73  100  104  105  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A    26_A     A    26_A    108  108  108     73  100  104  105  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     D    27_A     D    27_A    108  108  108     73  100  104  105  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     I    28_A     I    28_A    108  108  108     73  100  104  105  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     T    29_A     T    29_A    108  108  108     73  100  104  105  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K    30_A     K    30_A    108  108  108     62  100  104  105  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A    31_A     A    31_A    108  108  108     68  100  104  105  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    32_A     L    32_A    108  108  108     73  100  104  105  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    33_A     E    33_A    108  108  108     67  100  104  105  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     Q    34_A     Q    34_A    108  108  108     29  100  104  105  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     C    35_A     C    35_A    108  108  108     52  100  104  105  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A    36_A     A    36_A    108  108  108     12   35  104  105  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A    37_A     A    37_A    108  108  108      4    6  104  105  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     G    38_A     G    38_A    108  108  108     73  100  104  105  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     F    39_A     F    39_A    108  108  108     73  100  104  105  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     H    40_A     H    40_A    108  108  108     73  100  104  105  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     H    41_A     H    41_A    108  108  108     73  100  104  105  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     T    42_A     T    42_A    108  108  108     73  100  104  105  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A    43_A     A    43_A    108  108  108     73  100  104  105  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     F    44_A     F    44_A    108  108  108     73  100  104  105  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     F    45_A     F    45_A    108  108  108     73  100  104  105  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K    46_A     K    46_A    108  108  108     73  100  104  105  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A    47_A     A    47_A    108  108  108     73  100  104  105  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     S    48_A     S    48_A    108  108  108     73  100  104  105  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     G    49_A     G    49_A    108  108  108     73  100  104  105  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    50_A     L    50_A    108  108  108     62  100  104  105  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     S    51_A     S    51_A    108  108  108      5   96  104  105  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K    52_A     K    52_A    108  108  108     10   80  103  105  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K    53_A     K    53_A    108  108  108     73  100  104  105  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     S    54_A     S    54_A    108  108  108     73  100  104  105  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     D    55_A     D    55_A    108  108  108     57  100  104  105  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A    56_A     A    56_A    108  108  108     57  100  104  105  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    57_A     E    57_A    108  108  108     73  100  104  105  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    58_A     L    58_A    108  108  108     73  100  104  105  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A    59_A     A    59_A    108  108  108     57  100  104  105  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    60_A     E    60_A    108  108  108     39  100  104  105  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     I    61_A     I    61_A    108  108  108     39  100  104  105  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     F    62_A     F    62_A    108  108  108     73  100  104  105  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     N    63_A     N    63_A    108  108  108     57  100  104  105  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     V    64_A     V    64_A    108  108  108     36  100  104  105  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    65_A     L    65_A    108  108  108     36  100  104  105  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     D    66_A     D    66_A    108  108  108     68  100  104  105  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     G    67_A     G    67_A    108  108  108     68  100  104  105  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     D    68_A     D    68_A    108  108  108     51  100  104  105  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     Q    69_A     Q    69_A    108  108  108     73  100  104  105  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     S    70_A     S    70_A    108  108  108     73  100  104  105  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     G    71_A     G    71_A    108  108  108     73  100  104  105  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     Y    72_A     Y    72_A    108  108  108     73  100  104  105  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     I    73_A     I    73_A    108  108  108     73  100  104  105  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    74_A     E    74_A    108  108  108     73  100  104  105  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     V    75_A     V    75_A    108  108  108     73  100  104  105  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    76_A     E    76_A    108  108  108     73  100  104  105  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    77_A     E    77_A    108  108  108     73  100  104  105  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    78_A     L    78_A    108  108  108     73  100  104  105  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K    79_A     K    79_A    108  108  108     73  100  104  105  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     N    80_A     N    80_A    108  108  108     73  100  104  105  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     F    81_A     F    81_A    108  108  108     73  100  104  105  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    82_A     L    82_A    108  108  108     73  100  104  105  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K    83_A     K    83_A    108  108  108     73  100  104  105  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     C    84_A     C    84_A    108  108  108     73  100  104  105  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     F    85_A     F    85_A    108  108  108     73  100  104  105  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     S    86_A     S    86_A    108  108  108     73  100  104  105  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     D    87_A     D    87_A    108  108  108     54  100  104  105  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     G    88_A     G    88_A    108  108  108     53  100  104  105  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A    89_A     A    89_A    108  108  108     73  100  104  105  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     R    90_A     R    90_A    108  108  108     73  100  104  105  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     V    91_A     V    91_A    108  108  108     73  100  104  105  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    92_A     L    92_A    108  108  108     73  100  104  105  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     N    93_A     N    93_A    108  108  108     26  100  104  105  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     D    94_A     D    94_A    108  108  108     73  100  104  105  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K    95_A     K    95_A    108  108  108     73  100  104  105  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    96_A     E    96_A    108  108  108     73  100  104  105  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     T    97_A     T    97_A    108  108  108     73  100  104  105  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     S    98_A     S    98_A    108  108  108     73  100  104  105  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     N    99_A     N    99_A    108  108  108     73  100  104  105  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     F   100_A     F   100_A    108  108  108     73  100  104  105  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L   101_A     L   101_A    108  108  108     73  100  104  105  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A   102_A     A   102_A    108  108  108     73  100  104  105  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A   103_A     A   103_A    108  108  108     53  100  104  105  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     G   104_A     G   104_A    108  108  108     73  100  104  105  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     D   105_A     D   105_A    108  108  108     73  100  104  105  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     S   106_A     S   106_A    108  108  108     73  100  104  105  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     D   107_A     D   107_A    108  108  108     73  100  104  105  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     G   108_A     G   108_A    108  108  108     73  100  104  105  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     D   109_A     D   109_A    108  108  108     73  100  104  105  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     H   110_A     H   110_A    108  108  108     73  100  104  105  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K   111_A     K   111_A    108  108  108     73  100  104  105  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     I   112_A     I   112_A    108  108  108     73  100  104  105  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     G   113_A     G   113_A    108  108  108     73  100  104  105  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     V   114_A     V   114_A    108  108  108     73  100  104  105  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     D   115_A     D   115_A    108  108  108     73  100  104  105  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E   116_A     E   116_A    108  108  108     73  100  104  105  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     F   117_A     F   117_A    108  108  108     73  100  104  105  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K   118_A     K   118_A    108  108  108     73  100  104  105  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     S   119_A     S   119_A    108  108  108     73  100  104  105  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     M   120_A     M   120_A    108  108  108     73  100  104  105  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A   121_A     A   121_A    108  108  108     73  100  104  105  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K   122_A     K   122_A    108  108  108     71  100  104  105  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     M   123_A     M   123_A    108  108  108     16   99  104  105  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     T   124_A     T   124_A    108  108  108      3    3    4   64  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_AVERAGE  LCS_A: 100.00  ( 100.00  100.00  100.00 )

GLOBAL_DISTANCE_TEST (summary information about detected largest sets of residues (represented by selected AToms) that can fit under specified thresholds)
GDT DIST_CUTOFF  0.50   1.00   1.50   2.00   2.50   3.00   3.50   4.00   4.50   5.00   5.50   6.00   6.50   7.00   7.50   8.00   8.50   9.00   9.50  10.00
GDT NUMBER_AT     73    100    104    105    106    107    108    108    108    108    108    108    108    108    108    108    108    108    108    108 
GDT PERCENT_AT  67.59  92.59  96.30  97.22  98.15  99.07 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00
GDT RMS_LOCAL    0.31   0.46   0.55   0.57   0.63   0.69   0.76   0.76   0.76   0.76   0.76   0.76   0.76   0.76   0.76   0.76   0.76   0.76   0.76   0.76
GDT RMS_ALL_AT   0.78   0.77   0.77   0.77   0.76   0.77   0.76   0.76   0.76   0.76   0.76   0.76   0.76   0.76   0.76   0.76   0.76   0.76   0.76   0.76

# Checking swapping
#   possible swapping detected:  E    33_A      E    33_A
#   possible swapping detected:  F    44_A      F    44_A
#   possible swapping detected:  F    45_A      F    45_A
#   possible swapping detected:  E    60_A      E    60_A
#   possible swapping detected:  D    87_A      D    87_A

#      Molecule1      Molecule2  DISTANCE    Mis    MC     All    Dist_max   GDC_mc  GDC_all
LGA    S    17_A      S    17_A     3.438     0    0.032   0.723     6.857   45.833   38.016
LGA    K    18_A      K    18_A     3.050     0    0.615   1.169    12.625   65.238   32.487
LGA    I    19_A      I    19_A     0.680     0    0.108   0.921     2.720   90.833   83.155
LGA    T    20_A      T    20_A     0.452     0    0.092   0.154     1.301   92.976   90.612
LGA    S    21_A      S    21_A     0.858     0    0.025   0.566     1.350   92.857   90.556
LGA    I    22_A      I    22_A     0.723     0    0.055   0.071     1.850   95.238   87.262
LGA    L    23_A      L    23_A     0.289     0    0.062   0.746     1.757  100.000   91.905
LGA    N    24_A      N    24_A     0.191     0    0.065   1.083     3.702  100.000   84.167
LGA    P    25_A      P    25_A     0.287     0    0.038   0.171     0.824  100.000   98.639
LGA    A    26_A      A    26_A     0.297     0    0.051   0.055     0.382  100.000  100.000
LGA    D    27_A      D    27_A     0.307     0    0.026   0.074     0.433  100.000  100.000
LGA    I    28_A      I    28_A     0.316     0    0.022   0.580     1.719  100.000   95.417
LGA    T    29_A      T    29_A     0.255     0    0.031   0.953     2.098  100.000   91.088
LGA    K    30_A      K    30_A     0.598     0    0.036   0.777     3.275   92.857   81.534
LGA    A    31_A      A    31_A     0.529     0    0.036   0.047     0.604   92.857   94.286
LGA    L    32_A      L    32_A     0.125     0    0.014   0.086     0.677  100.000   98.810
LGA    E    33_A      E    33_A     0.584     0    0.023   0.982     3.605   92.857   76.138
LGA    Q    34_A      Q    34_A     0.939     0    0.074   1.145     3.587   88.214   77.354
LGA    C    35_A      C    35_A     0.718     0    0.200   0.848     1.840   90.595   87.619
LGA    A    36_A      A    36_A     1.666     0    0.059   0.063     2.520   73.333   73.238
LGA    A    37_A      A    37_A     1.985     0    0.303   0.301     3.157   67.143   66.667
LGA    G    38_A      G    38_A     0.076     0    0.048   0.048     0.446  100.000  100.000
LGA    F    39_A      F    39_A     0.129     0    0.040   0.050     0.347  100.000  100.000
LGA    H    40_A      H    40_A     0.328     0    0.042   1.135     2.484  100.000   89.190
LGA    H    41_A      H    41_A     0.360     0    0.024   0.328     1.778  100.000   89.905
LGA    T    42_A      T    42_A     0.441     0    0.027   0.048     0.561  100.000   97.279
LGA    A    43_A      A    43_A     0.404     0    0.030   0.044     0.506   97.619   98.095
LGA    F    44_A      F    44_A     0.200     0    0.024   0.117     0.504  100.000   99.134
LGA    F    45_A      F    45_A     0.176     0    0.046   0.645     1.989  100.000   90.823
LGA    K    46_A      K    46_A     0.237     0    0.033   0.665     3.123  100.000   80.159
LGA    A    47_A      A    47_A     0.303     0    0.041   0.048     0.384  100.000  100.000
LGA    S    48_A      S    48_A     0.310     0    0.028   0.046     0.577   97.619   98.413
LGA    G    49_A      G    49_A     0.514     0    0.080   0.080     0.582   95.238   95.238
LGA    L    50_A      L    50_A     0.669     0    0.037   0.223     1.091   90.476   88.214
LGA    S    51_A      S    51_A     1.179     0    0.677   0.802     3.057   75.833   76.270
LGA    K    52_A      K    52_A     1.610     0    0.079   1.174     7.812   81.667   56.931
LGA    K    53_A      K    53_A     0.527     0    0.051   0.738     1.526   92.857   88.624
LGA    S    54_A      S    54_A     0.446     0    0.051   0.060     0.534  100.000   98.413
LGA    D    55_A      D    55_A     0.672     0    0.075   0.834     2.575   90.476   80.833
LGA    A    56_A      A    56_A     0.725     0    0.035   0.052     0.982   90.476   90.476
LGA    E    57_A      E    57_A     0.494     0    0.018   0.110     0.754   95.238   93.651
LGA    L    58_A      L    58_A     0.380     0    0.041   0.241     0.855   95.238   96.429
LGA    A    59_A      A    59_A     0.599     0    0.033   0.049     0.747   90.476   90.476
LGA    E    60_A      E    60_A     0.828     0    0.038   1.092     3.563   90.476   79.418
LGA    I    61_A      I    61_A     0.736     0    0.041   0.731     2.758   90.476   86.310
LGA    F    62_A      F    62_A     0.413     0    0.032   0.097     0.743  100.000   95.671
LGA    N    63_A      N    63_A     0.681     0    0.070   0.193     1.312   88.214   87.083
LGA    V    64_A      V    64_A     0.948     0    0.061   0.074     1.651   90.476   84.150
LGA    L    65_A      L    65_A     0.728     0    0.044   0.071     0.843   90.476   90.476
LGA    D    66_A      D    66_A     0.539     0    0.047   0.269     1.190   90.476   91.726
LGA    G    67_A      G    67_A     0.612     0    0.079   0.079     0.656   90.476   90.476
LGA    D    68_A      D    68_A     0.816     0    0.124   0.266     1.247   90.476   89.345
LGA    Q    69_A      Q    69_A     0.412     0    0.112   0.144     1.759   97.619   86.772
LGA    S    70_A      S    70_A     0.096     0    0.035   0.039     0.343  100.000  100.000
LGA    G    71_A      G    71_A     0.385     0    0.041   0.041     0.385  100.000  100.000
LGA    Y    72_A      Y    72_A     0.253     0    0.043   0.095     0.821  100.000   96.825
LGA    I    73_A      I    73_A     0.321     0    0.022   0.095     0.415  100.000  100.000
LGA    E    74_A      E    74_A     0.195     0    0.028   0.166     0.572  100.000   98.942
LGA    V    75_A      V    75_A     0.081     0    0.036   1.025     2.370  100.000   89.932
LGA    E    76_A      E    76_A     0.265     0    0.030   1.256     6.810  100.000   70.370
LGA    E    77_A      E    77_A     0.314     0    0.058   0.241     0.840   97.619   97.884
LGA    L    78_A      L    78_A     0.211     0    0.034   1.334     2.925  100.000   86.726
LGA    K    79_A      K    79_A     0.313     0    0.089   1.183     4.340  100.000   76.296
LGA    N    80_A      N    80_A     0.314     0    0.094   0.250     1.087   97.619   95.298
LGA    F    81_A      F    81_A     0.153     0    0.047   0.095     0.426  100.000  100.000
LGA    L    82_A      L    82_A     0.213     0    0.024   0.052     0.247  100.000  100.000
LGA    K    83_A      K    83_A     0.355     0    0.074   0.556     1.409  100.000   92.698
LGA    C    84_A      C    84_A     0.438     0    0.074   0.819     3.564   97.619   87.381
LGA    F    85_A      F    85_A     0.405     0    0.057   0.173     1.005  100.000   96.580
LGA    S    86_A      S    86_A     0.283     0    0.091   0.098     0.396  100.000  100.000
LGA    D    87_A      D    87_A     0.723     0    0.059   0.908     2.638   90.476   80.833
LGA    G    88_A      G    88_A     0.797     0    0.110   0.110     0.797   95.238   95.238
LGA    A    89_A      A    89_A     0.364     0    0.030   0.040     0.495  100.000  100.000
LGA    R    90_A      R    90_A     0.267     0    0.024   0.157     0.322  100.000  100.000
LGA    V    91_A      V    91_A     0.274     0    0.019   1.141     2.871  100.000   88.844
LGA    L    92_A      L    92_A     0.353     0    0.037   0.073     0.380  100.000  100.000
LGA    N    93_A      N    93_A     0.673     0    0.061   0.714     1.804   95.238   87.321
LGA    D    94_A      D    94_A     0.282     0    0.071   0.823     2.840  100.000   87.857
LGA    K    95_A      K    95_A     0.433     0    0.041   0.637     3.491  100.000   83.545
LGA    E    96_A      E    96_A     0.363     0    0.033   0.183     0.778  100.000   97.884
LGA    T    97_A      T    97_A     0.371     0    0.025   0.092     0.651  100.000   95.918
LGA    S    98_A      S    98_A     0.190     0    0.043   0.723     2.130  100.000   94.127
LGA    N    99_A      N    99_A     0.371     0    0.024   1.181     4.888   97.619   79.524
LGA    F   100_A      F   100_A     0.551     0    0.028   0.595     1.715   92.857   87.316
LGA    L   101_A      L   101_A     0.547     0    0.023   0.110     0.656   90.476   91.667
LGA    A   102_A      A   102_A     0.475     0    0.047   0.048     0.647   95.238   96.190
LGA    A   103_A      A   103_A     0.723     0    0.018   0.035     0.909   90.476   90.476
LGA    G   104_A      G   104_A     0.484     0    0.032   0.032     0.523   97.619   97.619
LGA    D   105_A      D   105_A     0.407     0    0.041   0.142     0.556   97.619   97.619
LGA    S   106_A      S   106_A     0.373     0    0.159   0.630     1.085   97.619   93.730
LGA    D   107_A      D   107_A     0.424     0    0.158   0.207     1.157   95.357   91.786
LGA    G   108_A      G   108_A     0.278     0    0.038   0.038     0.278  100.000  100.000
LGA    D   109_A      D   109_A     0.554     0    0.101   0.135     0.730   92.857   95.238
LGA    H   110_A      H   110_A     0.582     0    0.028   1.385     5.266   92.857   68.571
LGA    K   111_A      K   111_A     0.482     0    0.031   0.580     1.128  100.000   94.815
LGA    I   112_A      I   112_A     0.341     0    0.020   0.604     2.529  100.000   94.643
LGA    G   113_A      G   113_A     0.116     0    0.027   0.027     0.250  100.000  100.000
LGA    V   114_A      V   114_A     0.253     0    0.024   1.083     2.591  100.000   88.844
LGA    D   115_A      D   115_A     0.116     0    0.031   0.096     0.349  100.000  100.000
LGA    E   116_A      E   116_A     0.195     0    0.035   0.304     0.830  100.000   97.884
LGA    F   117_A      F   117_A     0.334     0    0.021   0.121     0.669  100.000   97.403
LGA    K   118_A      K   118_A     0.281     0    0.044   0.570     1.955  100.000   89.841
LGA    S   119_A      S   119_A     0.151     0    0.017   0.651     2.401  100.000   94.127
LGA    M   120_A      M   120_A     0.359     0    0.026   1.077     2.147  100.000   88.690
LGA    A   121_A      A   121_A     0.357     0    0.051   0.054     0.634   97.619   98.095
LGA    K   122_A      K   122_A     0.684     0    0.089   0.943     4.265   92.857   73.968
LGA    M   123_A      M   123_A     1.325     0    0.304   0.760     6.314   75.476   56.369
LGA    T   124_A      T   124_A     2.768     0    0.604   1.006     5.560   61.190   50.408

# RMSD_GDC results:       CA      MC common percent     ALL common percent   GDC_mc  GDC_all
NUMBER_OF_ATOMS_AA:      108     432    432  100.00     820    820  100.00               108
SUMMARY(RMSD_GDC):     0.764          0.786                  1.535           94.766   89.206

#CA            N1   N2   DIST      N    RMSD    GDT_TS    LGA_S3     LGA_Q 
SUMMARY(GDT)  124  108    4.0    108    0.76    97.454    98.765    12.496

LGA_LOCAL      RMSD:   0.764  Number of atoms:  108  under DIST:   4.00
LGA_ASGN_ATOMS RMSD:   0.764  Number of assigned atoms:  108 
Std_ASGN_ATOMS RMSD:   0.764  Standard rmsd on all 108 assigned CA atoms 

Unitary ROTATION matrix and the SHIFT vector superimpose molecules  (1=>2)
  X_new =  -0.848273 * X  +  -0.424826 * Y  +   0.316159 * Z  +  -4.297623
  Y_new =  -0.199419 * X  +   0.809335 * Y  +   0.552457 * Z  + -37.708599
  Z_new =  -0.490577 * X  +   0.405586 * Y  +  -0.771255 * Z  +  67.397957 

Euler angles from the ROTATION matrix. Conventions XYZ and ZXZ:
           Phi     Theta       Psi   [DEG:       Phi     Theta       Psi ]
XYZ: -2.910697  0.512751  2.657458   [DEG: -166.7706   29.3785  152.2611 ]
ZXZ:  2.621806  2.451607 -0.879954   [DEG:  150.2184  140.4668  -50.4176 ]
 
# END of job
