
#######################################################
#                                                     #
#                        LGA                          #
#                  ---------------                    #
#                                                     #
#               Local-Global Alignment                #
#        A Method for Finding 3-D Similarities        #
#               in Protein Structures                 #
#                                                     #
#                  ------------ 10/2009               #
#                                                     #
#      Adam Zemla (adamz@llnl.gov)                    #
#      Lawrence Livermore National Laboratory, CA     #
#                                                     #
#######################################################

!!!   License for LGA program has expired  !!!
#   For updated version of the LGA program   #
# please contact Adam Zemla:  adamz@llnl.gov #

# Molecule1: number of CA atoms  124 (  959),  selected  108 , name one
# Molecule2: number of CA atoms  108 (  820),  selected  108 , name two
# PARAMETERS: input.pdb  -ie  -3  -d:4  -sda  -swap  -ch1:A  -ch2:A  
# FIXED Atom-Atom correspondence
# GDT and LCS analysis 

LCS - RMSD CUTOFF   5.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:   108      17_A - 124_A       1.12     1.12
  LCS_AVERAGE:    100.00

LCS - RMSD CUTOFF   2.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:   108      17_A - 124_A       1.12     1.12
  LCS_AVERAGE:    100.00

LCS - RMSD CUTOFF   1.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:   107      17_A - 123_A       0.89     1.13
  LCS_AVERAGE:     99.07

LCS_GDT    MOLECULE-1    MOLECULE-2     LCS_DETAILS     GDT_DETAILS                                                    TOTAL NUMBER OF RESIDUE PAIRS:  108
LCS_GDT     RESIDUE       RESIDUE       SEGMENT_SIZE    GLOBAL DISTANCE TEST COLUMNS: number of residues under the threshold assigned to each residue pair
LCS_GDT   NAME NUMBER   NAME NUMBER    1.0  2.0  5.0    0.5  1.0  1.5  2.0  2.5  3.0  3.5  4.0  4.5  5.0  5.5  6.0  6.5  7.0  7.5  8.0  8.5  9.0  9.5 10.0
LCS_GDT     S    17_A     S    17_A    107  108  108      3    4    6   53   68   95  105  107  107  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K    18_A     K    18_A    107  108  108      3    4    6   20   92  105  106  107  107  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     I    19_A     I    19_A    107  108  108     31  101  103  105  105  105  106  107  107  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     T    20_A     T    20_A    107  108  108     53  101  103  105  105  105  106  107  107  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     S    21_A     S    21_A    107  108  108     65  101  103  105  105  105  106  107  107  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     I    22_A     I    22_A    107  108  108     29  101  103  105  105  105  106  107  107  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    23_A     L    23_A    107  108  108     65  101  103  105  105  105  106  107  107  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     N    24_A     N    24_A    107  108  108     65  101  103  105  105  105  106  107  107  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     P    25_A     P    25_A    107  108  108     65  101  103  105  105  105  106  107  107  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A    26_A     A    26_A    107  108  108     65  101  103  105  105  105  106  107  107  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     D    27_A     D    27_A    107  108  108     65  101  103  105  105  105  106  107  107  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     I    28_A     I    28_A    107  108  108     65  101  103  105  105  105  106  107  107  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     T    29_A     T    29_A    107  108  108     65  101  103  105  105  105  106  107  107  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K    30_A     K    30_A    107  108  108     53  101  103  105  105  105  106  107  107  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A    31_A     A    31_A    107  108  108     58  101  103  105  105  105  106  107  107  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    32_A     L    32_A    107  108  108     65  101  103  105  105  105  106  107  107  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    33_A     E    33_A    107  108  108     55  101  103  105  105  105  106  107  107  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     Q    34_A     Q    34_A    107  108  108     25  101  103  105  105  105  106  107  107  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     C    35_A     C    35_A    107  108  108     54  101  103  105  105  105  106  107  107  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A    36_A     A    36_A    107  108  108      4   38  102  105  105  105  106  107  107  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A    37_A     A    37_A    107  108  108      4   42   95  105  105  105  106  107  107  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     G    38_A     G    38_A    107  108  108     65  101  103  105  105  105  106  107  107  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     F    39_A     F    39_A    107  108  108     65  101  103  105  105  105  106  107  107  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     H    40_A     H    40_A    107  108  108     65  101  103  105  105  105  106  107  107  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     H    41_A     H    41_A    107  108  108     53  101  103  105  105  105  106  107  107  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     T    42_A     T    42_A    107  108  108     26  101  103  105  105  105  106  107  107  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A    43_A     A    43_A    107  108  108     65  101  103  105  105  105  106  107  107  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     F    44_A     F    44_A    107  108  108     65  101  103  105  105  105  106  107  107  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     F    45_A     F    45_A    107  108  108     65  101  103  105  105  105  106  107  107  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K    46_A     K    46_A    107  108  108     65  101  103  105  105  105  106  107  107  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A    47_A     A    47_A    107  108  108     65  101  103  105  105  105  106  107  107  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     S    48_A     S    48_A    107  108  108     65  101  103  105  105  105  106  107  107  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     G    49_A     G    49_A    107  108  108     65  101  103  105  105  105  106  107  107  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    50_A     L    50_A    107  108  108     65  101  103  105  105  105  106  107  107  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     S    51_A     S    51_A    107  108  108     65  101  103  105  105  105  106  107  107  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K    52_A     K    52_A    107  108  108     26   77  103  105  105  105  106  107  107  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K    53_A     K    53_A    107  108  108     65  101  103  105  105  105  106  107  107  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     S    54_A     S    54_A    107  108  108     61  101  103  105  105  105  106  107  107  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     D    55_A     D    55_A    107  108  108     27  101  103  105  105  105  106  107  107  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A    56_A     A    56_A    107  108  108     50  101  103  105  105  105  106  107  107  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    57_A     E    57_A    107  108  108     57  101  103  105  105  105  106  107  107  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    58_A     L    58_A    107  108  108     59  101  103  105  105  105  106  107  107  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A    59_A     A    59_A    107  108  108     57  101  103  105  105  105  106  107  107  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    60_A     E    60_A    107  108  108     49  101  103  105  105  105  106  107  107  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     I    61_A     I    61_A    107  108  108     46  101  103  105  105  105  106  107  107  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     F    62_A     F    62_A    107  108  108     62  101  103  105  105  105  106  107  107  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     N    63_A     N    63_A    107  108  108     49  101  103  105  105  105  106  107  107  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     V    64_A     V    64_A    107  108  108     39  101  103  105  105  105  106  107  107  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    65_A     L    65_A    107  108  108     46  101  103  105  105  105  106  107  107  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     D    66_A     D    66_A    107  108  108     46  101  103  105  105  105  106  107  107  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     G    67_A     G    67_A    107  108  108     59  101  103  105  105  105  106  107  107  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     D    68_A     D    68_A    107  108  108     34  101  103  105  105  105  106  107  107  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     Q    69_A     Q    69_A    107  108  108     60  101  103  105  105  105  106  107  107  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     S    70_A     S    70_A    107  108  108     58  101  103  105  105  105  106  107  107  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     G    71_A     G    71_A    107  108  108     61  101  103  105  105  105  106  107  107  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     Y    72_A     Y    72_A    107  108  108     65  101  103  105  105  105  106  107  107  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     I    73_A     I    73_A    107  108  108     65  101  103  105  105  105  106  107  107  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    74_A     E    74_A    107  108  108     65  101  103  105  105  105  106  107  107  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     V    75_A     V    75_A    107  108  108     65  101  103  105  105  105  106  107  107  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    76_A     E    76_A    107  108  108     65  101  103  105  105  105  106  107  107  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    77_A     E    77_A    107  108  108     65  101  103  105  105  105  106  107  107  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    78_A     L    78_A    107  108  108     65  101  103  105  105  105  106  107  107  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K    79_A     K    79_A    107  108  108     65  101  103  105  105  105  106  107  107  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     N    80_A     N    80_A    107  108  108     65  101  103  105  105  105  106  107  107  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     F    81_A     F    81_A    107  108  108     65  101  103  105  105  105  106  107  107  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    82_A     L    82_A    107  108  108     65  101  103  105  105  105  106  107  107  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K    83_A     K    83_A    107  108  108     65  101  103  105  105  105  106  107  107  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     C    84_A     C    84_A    107  108  108     65  101  103  105  105  105  106  107  107  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     F    85_A     F    85_A    107  108  108     65  101  103  105  105  105  106  107  107  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     S    86_A     S    86_A    107  108  108     65  101  103  105  105  105  106  107  107  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     D    87_A     D    87_A    107  108  108     24  101  103  105  105  105  106  107  107  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     G    88_A     G    88_A    107  108  108     65  101  103  105  105  105  106  107  107  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A    89_A     A    89_A    107  108  108     65  101  103  105  105  105  106  107  107  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     R    90_A     R    90_A    107  108  108     65  101  103  105  105  105  106  107  107  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     V    91_A     V    91_A    107  108  108     65  101  103  105  105  105  106  107  107  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    92_A     L    92_A    107  108  108     65  101  103  105  105  105  106  107  107  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     N    93_A     N    93_A    107  108  108     46  101  103  105  105  105  106  107  107  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     D    94_A     D    94_A    107  108  108     65  101  103  105  105  105  106  107  107  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K    95_A     K    95_A    107  108  108     65  101  103  105  105  105  106  107  107  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    96_A     E    96_A    107  108  108     65  101  103  105  105  105  106  107  107  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     T    97_A     T    97_A    107  108  108     65  101  103  105  105  105  106  107  107  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     S    98_A     S    98_A    107  108  108     65  101  103  105  105  105  106  107  107  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     N    99_A     N    99_A    107  108  108     65  101  103  105  105  105  106  107  107  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     F   100_A     F   100_A    107  108  108     65  101  103  105  105  105  106  107  107  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L   101_A     L   101_A    107  108  108     65  101  103  105  105  105  106  107  107  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A   102_A     A   102_A    107  108  108     65  101  103  105  105  105  106  107  107  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A   103_A     A   103_A    107  108  108     65  101  103  105  105  105  106  107  107  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     G   104_A     G   104_A    107  108  108     65  101  103  105  105  105  106  107  107  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     D   105_A     D   105_A    107  108  108     65  101  103  105  105  105  106  107  107  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     S   106_A     S   106_A    107  108  108     65  101  103  105  105  105  106  107  107  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     D   107_A     D   107_A    107  108  108     58  101  103  105  105  105  106  107  107  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     G   108_A     G   108_A    107  108  108     58  101  103  105  105  105  106  107  107  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     D   109_A     D   109_A    107  108  108     65  101  103  105  105  105  106  107  107  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     H   110_A     H   110_A    107  108  108     65  101  103  105  105  105  106  107  107  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K   111_A     K   111_A    107  108  108     65  101  103  105  105  105  106  107  107  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     I   112_A     I   112_A    107  108  108     65  101  103  105  105  105  106  107  107  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     G   113_A     G   113_A    107  108  108     65  101  103  105  105  105  106  107  107  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     V   114_A     V   114_A    107  108  108     61  101  103  105  105  105  106  107  107  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     D   115_A     D   115_A    107  108  108     65  101  103  105  105  105  106  107  107  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E   116_A     E   116_A    107  108  108     65  101  103  105  105  105  106  107  107  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     F   117_A     F   117_A    107  108  108     65  101  103  105  105  105  106  107  107  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K   118_A     K   118_A    107  108  108     60  101  103  105  105  105  106  107  107  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     S   119_A     S   119_A    107  108  108     65  101  103  105  105  105  106  107  107  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     M   120_A     M   120_A    107  108  108     65  101  103  105  105  105  106  107  107  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A   121_A     A   121_A    107  108  108     27  101  103  105  105  105  106  107  107  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K   122_A     K   122_A    107  108  108     19  101  103  105  105  105  106  107  107  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     M   123_A     M   123_A    107  108  108      3   47  103  105  105  105  106  107  107  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     T   124_A     T   124_A    106  108  108      2    5    5    5    5    5    5   30  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_AVERAGE  LCS_A:  99.69  (  99.07  100.00  100.00 )

GLOBAL_DISTANCE_TEST (summary information about detected largest sets of residues (represented by selected AToms) that can fit under specified thresholds)
GDT DIST_CUTOFF  0.50   1.00   1.50   2.00   2.50   3.00   3.50   4.00   4.50   5.00   5.50   6.00   6.50   7.00   7.50   8.00   8.50   9.00   9.50  10.00
GDT NUMBER_AT     65    101    103    105    105    105    106    107    107    107    107    108    108    108    108    108    108    108    108    108 
GDT PERCENT_AT  60.19  93.52  95.37  97.22  97.22  97.22  98.15  99.07  99.07  99.07  99.07 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00
GDT RMS_LOCAL    0.34   0.51   0.55   0.61   0.61   0.61   0.73   0.89   0.89   0.89   0.89   1.12   1.12   1.12   1.12   1.12   1.12   1.12   1.12   1.12
GDT RMS_ALL_AT   1.16   1.13   1.13   1.14   1.14   1.14   1.13   1.13   1.13   1.13   1.13   1.12   1.12   1.12   1.12   1.12   1.12   1.12   1.12   1.12

# Checking swapping
#   possible swapping detected:  E    33_A      E    33_A
#   possible swapping detected:  F    45_A      F    45_A
#   possible swapping detected:  E    57_A      E    57_A
#   possible swapping detected:  Y    72_A      Y    72_A
#   possible swapping detected:  E    76_A      E    76_A
#   possible swapping detected:  D   115_A      D   115_A

#      Molecule1      Molecule2  DISTANCE    Mis    MC     All    Dist_max   GDC_mc  GDC_all
LGA    S    17_A      S    17_A     5.305     0    0.504   0.727     6.053   31.667   28.333
LGA    K    18_A      K    18_A     4.030     0    0.108   1.178    11.383   47.143   28.307
LGA    I    19_A      I    19_A     0.754     0    0.174   0.942     3.026   90.833   79.167
LGA    T    20_A      T    20_A     0.827     0    0.104   0.999     3.993   88.214   77.483
LGA    S    21_A      S    21_A     0.529     0    0.033   0.663     1.771   92.857   89.127
LGA    I    22_A      I    22_A     0.802     0    0.070   0.153     2.972   97.619   83.333
LGA    L    23_A      L    23_A     0.567     0    0.070   0.094     1.739   97.619   89.583
LGA    N    24_A      N    24_A     0.394     0    0.084   1.148     3.775   97.619   80.893
LGA    P    25_A      P    25_A     0.520     0    0.041   0.123     0.554   90.476   93.197
LGA    A    26_A      A    26_A     0.510     0    0.042   0.048     0.587   95.238   94.286
LGA    D    27_A      D    27_A     0.441     0    0.023   0.130     0.822   97.619   97.619
LGA    I    28_A      I    28_A     0.436     0    0.024   0.155     0.930  100.000   97.619
LGA    T    29_A      T    29_A     0.398     0    0.033   0.097     0.643  100.000   98.639
LGA    K    30_A      K    30_A     0.564     0    0.029   0.799     2.994   95.238   85.873
LGA    A    31_A      A    31_A     0.550     0    0.038   0.046     0.604   90.476   92.381
LGA    L    32_A      L    32_A     0.358     0    0.018   0.103     0.902  100.000   98.810
LGA    E    33_A      E    33_A     0.649     0    0.019   1.043     4.235   92.857   73.915
LGA    Q    34_A      Q    34_A     0.903     0    0.068   1.043     2.821   88.214   81.799
LGA    C    35_A      C    35_A     0.697     0    0.182   0.848     1.771   90.595   87.619
LGA    A    36_A      A    36_A     1.886     0    0.056   0.060     2.709   69.048   68.190
LGA    A    37_A      A    37_A     2.210     0    0.291   0.289     3.285   63.095   63.429
LGA    G    38_A      G    38_A     0.295     0    0.043   0.043     0.670   95.238   95.238
LGA    F    39_A      F    39_A     0.141     0    0.021   0.037     0.270  100.000  100.000
LGA    H    40_A      H    40_A     0.349     0    0.050   0.228     1.724  100.000   89.857
LGA    H    41_A      H    41_A     0.578     0    0.028   0.155     1.057   90.476   89.571
LGA    T    42_A      T    42_A     0.778     0    0.021   1.158     2.750   90.476   83.197
LGA    A    43_A      A    43_A     0.505     0    0.041   0.048     0.577   92.857   94.286
LGA    F    44_A      F    44_A     0.260     0    0.028   0.060     0.665  100.000   97.403
LGA    F    45_A      F    45_A     0.222     0    0.048   0.576     1.766  100.000   91.645
LGA    K    46_A      K    46_A     0.500     0    0.057   1.191     6.159   97.619   71.376
LGA    A    47_A      A    47_A     0.495     0    0.045   0.052     0.524   97.619   98.095
LGA    S    48_A      S    48_A     0.290     0    0.053   0.053     0.685   97.619   98.413
LGA    G    49_A      G    49_A     0.403     0    0.052   0.052     0.403  100.000  100.000
LGA    L    50_A      L    50_A     0.182     0    0.037   0.138     1.146  100.000   94.167
LGA    S    51_A      S    51_A     0.078     0    0.712   0.618     2.678   89.286   92.857
LGA    K    52_A      K    52_A     1.361     0    0.058   1.188     8.599   86.190   58.677
LGA    K    53_A      K    53_A     0.446     0    0.068   0.480     0.954   97.619   94.709
LGA    S    54_A      S    54_A     0.281     0    0.030   0.050     0.517  100.000   98.413
LGA    D    55_A      D    55_A     0.875     0    0.095   0.787     3.576   90.476   75.179
LGA    A    56_A      A    56_A     0.512     0    0.034   0.044     0.569   92.857   92.381
LGA    E    57_A      E    57_A     0.478     0    0.042   0.924     3.909  100.000   80.952
LGA    L    58_A      L    58_A     0.428     0    0.043   0.237     0.607  100.000   98.810
LGA    A    59_A      A    59_A     0.446     0    0.036   0.050     0.562   95.238   94.286
LGA    E    60_A      E    60_A     0.645     0    0.033   0.124     1.291   90.476   87.460
LGA    I    61_A      I    61_A     0.644     0    0.044   0.164     0.972   90.476   90.476
LGA    F    62_A      F    62_A     0.315     0    0.026   0.103     0.592  100.000   98.268
LGA    N    63_A      N    63_A     0.662     0    0.068   0.350     2.022   92.857   85.060
LGA    V    64_A      V    64_A     0.824     0    0.068   0.095     1.688   90.476   84.150
LGA    L    65_A      L    65_A     0.600     0    0.045   0.089     1.016   90.476   89.345
LGA    D    66_A      D    66_A     0.628     0    0.080   1.101     3.220   95.238   85.536
LGA    G    67_A      G    67_A     0.512     0    0.074   0.074     0.648   90.476   90.476
LGA    D    68_A      D    68_A     0.686     0    0.146   0.194     1.100   95.238   92.917
LGA    Q    69_A      Q    69_A     0.491     0    0.064   0.405     1.546   97.619   92.751
LGA    S    70_A      S    70_A     0.549     0    0.042   0.047     0.586   95.238   95.238
LGA    G    71_A      G    71_A     0.417     0    0.036   0.036     0.463  100.000  100.000
LGA    Y    72_A      Y    72_A     0.425     0    0.032   0.242     1.944   95.238   87.579
LGA    I    73_A      I    73_A     0.452     0    0.020   0.099     0.549   97.619   97.619
LGA    E    74_A      E    74_A     0.240     0    0.032   0.286     1.330  100.000   92.751
LGA    V    75_A      V    75_A     0.085     0    0.022   0.123     0.566  100.000   98.639
LGA    E    76_A      E    76_A     0.233     0    0.049   1.493     6.005  100.000   74.127
LGA    E    77_A      E    77_A     0.328     0    0.041   0.155     0.966   97.619   95.767
LGA    L    78_A      L    78_A     0.069     0    0.014   1.322     2.780  100.000   87.917
LGA    K    79_A      K    79_A     0.412     0    0.098   0.887     3.252   97.619   81.481
LGA    N    80_A      N    80_A     0.424     0    0.072   0.245     1.146   97.619   92.917
LGA    F    81_A      F    81_A     0.253     0    0.053   0.073     0.468  100.000  100.000
LGA    L    82_A      L    82_A     0.448     0    0.030   0.095     0.683  100.000   96.429
LGA    K    83_A      K    83_A     0.578     0    0.045   0.864     4.684   90.476   69.947
LGA    C    84_A      C    84_A     0.666     0    0.028   0.047     0.766   90.476   90.476
LGA    F    85_A      F    85_A     0.594     0    0.046   0.121     0.936   90.476   93.939
LGA    S    86_A      S    86_A     0.820     0    0.107   0.109     1.055   88.214   88.968
LGA    D    87_A      D    87_A     1.057     0    0.688   0.669     3.903   69.762   76.786
LGA    G    88_A      G    88_A     0.592     0    0.049   0.049     0.747   90.476   90.476
LGA    A    89_A      A    89_A     0.590     0    0.025   0.042     0.741   90.476   90.476
LGA    R    90_A      R    90_A     0.546     0    0.035   0.376     0.855   90.476   93.939
LGA    V    91_A      V    91_A     0.518     0    0.031   1.137     3.034   95.238   83.742
LGA    L    92_A      L    92_A     0.479     0    0.053   0.100     0.541   97.619   97.619
LGA    N    93_A      N    93_A     0.669     0    0.031   0.918     2.668   90.476   82.917
LGA    D    94_A      D    94_A     0.522     0    0.070   0.451     1.514   90.476   88.274
LGA    K    95_A      K    95_A     0.650     0    0.023   0.148     1.384   90.476   86.455
LGA    E    96_A      E    96_A     0.578     0    0.030   0.164     1.081   90.476   90.529
LGA    T    97_A      T    97_A     0.654     0    0.031   1.020     2.041   92.857   85.646
LGA    S    98_A      S    98_A     0.373     0    0.048   0.734     2.285  100.000   94.127
LGA    N    99_A      N    99_A     0.483     0    0.036   1.045     4.197   97.619   80.000
LGA    F   100_A      F   100_A     0.559     0    0.028   0.752     2.239   95.238   87.532
LGA    L   101_A      L   101_A     0.461     0    0.019   0.825     2.871  100.000   89.940
LGA    A   102_A      A   102_A     0.269     0    0.040   0.045     0.339  100.000  100.000
LGA    A   103_A      A   103_A     0.412     0    0.025   0.035     0.615   97.619   98.095
LGA    G   104_A      G   104_A     0.473     0    0.048   0.048     0.672   97.619   97.619
LGA    D   105_A      D   105_A     0.297     0    0.045   0.199     0.805  100.000   97.619
LGA    S   106_A      S   106_A     0.281     0    0.112   0.109     0.945   97.619   95.238
LGA    D   107_A      D   107_A     0.635     0    0.158   0.267     1.798   88.452   85.000
LGA    G   108_A      G   108_A     0.622     0    0.056   0.056     0.622   95.238   95.238
LGA    D   109_A      D   109_A     0.534     0    0.110   0.168     1.048   92.857   90.536
LGA    H   110_A      H   110_A     0.550     0    0.022   1.564     5.799   92.857   66.952
LGA    K   111_A      K   111_A     0.574     0    0.031   0.615     1.171   95.238   92.698
LGA    I   112_A      I   112_A     0.467     0    0.019   0.075     0.747  100.000   95.238
LGA    G   113_A      G   113_A     0.136     0    0.034   0.034     0.328  100.000  100.000
LGA    V   114_A      V   114_A     0.362     0    0.015   0.114     0.703  100.000   97.279
LGA    D   115_A      D   115_A     0.236     0    0.041   1.117     4.488  100.000   83.333
LGA    E   116_A      E   116_A     0.140     0    0.039   0.397     1.244  100.000   96.878
LGA    F   117_A      F   117_A     0.319     0    0.022   0.130     0.637  100.000   95.671
LGA    K   118_A      K   118_A     0.417     0    0.036   0.737     2.123  100.000   90.053
LGA    S   119_A      S   119_A     0.179     0    0.017   0.652     2.190  100.000   94.127
LGA    M   120_A      M   120_A     0.474     0    0.046   1.084     2.005   95.238   85.238
LGA    A   121_A      A   121_A     0.712     0    0.057   0.059     1.013   88.214   88.667
LGA    K   122_A      K   122_A     0.677     0    0.682   0.877     2.787   82.143   77.354
LGA    M   123_A      M   123_A     1.833     0    0.305   0.845    10.021   66.905   40.417
LGA    T   124_A      T   124_A     7.187     0    0.324   0.959    10.864   13.333    7.755

# RMSD_GDC results:       CA      MC common percent     ALL common percent   GDC_mc  GDC_all
NUMBER_OF_ATOMS_AA:      108     432    432  100.00     820    820  100.00               108
SUMMARY(RMSD_GDC):     1.121          1.128                  1.766           92.490   87.119

#CA            N1   N2   DIST      N    RMSD    GDT_TS    LGA_S3     LGA_Q 
SUMMARY(GDT)  124  108    4.0    107    0.89    97.454    98.319    10.769

LGA_LOCAL      RMSD:   0.894  Number of atoms:  107  under DIST:   4.00
LGA_ASGN_ATOMS RMSD:   1.127  Number of assigned atoms:  108 
Std_ASGN_ATOMS RMSD:   1.121  Standard rmsd on all 108 assigned CA atoms 

Unitary ROTATION matrix and the SHIFT vector superimpose molecules  (1=>2)
  X_new =  -0.656676 * X  +  -0.324209 * Y  +   0.680930 * Z  +  -5.261042
  Y_new =   0.201550 * X  +   0.794601 * Y  +   0.572702 * Z  +   0.684272
  Z_new =  -0.726742 * X  +   0.513321 * Y  +  -0.456451 * Z  +  20.543097 

Euler angles from the ROTATION matrix. Conventions XYZ and ZXZ:
           Phi     Theta       Psi   [DEG:       Phi     Theta       Psi ]
XYZ:  2.843795  0.813568  2.297619   [DEG:  162.9374   46.6140  131.6439 ]
ZXZ:  2.270076  2.044798 -0.955834   [DEG:  130.0658  117.1583  -54.7653 ]
 
# END of job
