
#######################################################
#                                                     #
#                        LGA                          #
#                  ---------------                    #
#                                                     #
#               Local-Global Alignment                #
#        A Method for Finding 3-D Similarities        #
#               in Protein Structures                 #
#                                                     #
#                  ------------ 10/2009               #
#                                                     #
#      Adam Zemla (adamz@llnl.gov)                    #
#      Lawrence Livermore National Laboratory, CA     #
#                                                     #
#######################################################

!!!   License for LGA program has expired  !!!
#   For updated version of the LGA program   #
# please contact Adam Zemla:  adamz@llnl.gov #

# Molecule1: number of CA atoms  124 (  959),  selected  108 , name one
# Molecule2: number of CA atoms  108 (  820),  selected  108 , name two
# PARAMETERS: input.pdb  -ie  -3  -d:4  -sda  -swap  -ch1:A  -ch2:A  
# FIXED Atom-Atom correspondence
# GDT and LCS analysis 

LCS - RMSD CUTOFF   5.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:   108      17_A - 124_A       0.78     0.78
  LCS_AVERAGE:    100.00

LCS - RMSD CUTOFF   2.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:   108      17_A - 124_A       0.78     0.78
  LCS_AVERAGE:    100.00

LCS - RMSD CUTOFF   1.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:   108      17_A - 124_A       0.78     0.78
  LCS_AVERAGE:    100.00

LCS_GDT    MOLECULE-1    MOLECULE-2     LCS_DETAILS     GDT_DETAILS                                                    TOTAL NUMBER OF RESIDUE PAIRS:  108
LCS_GDT     RESIDUE       RESIDUE       SEGMENT_SIZE    GLOBAL DISTANCE TEST COLUMNS: number of residues under the threshold assigned to each residue pair
LCS_GDT   NAME NUMBER   NAME NUMBER    1.0  2.0  5.0    0.5  1.0  1.5  2.0  2.5  3.0  3.5  4.0  4.5  5.0  5.5  6.0  6.5  7.0  7.5  8.0  8.5  9.0  9.5 10.0
LCS_GDT     S    17_A     S    17_A    108  108  108      0   26   59   87  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K    18_A     K    18_A    108  108  108      3    3    4  102  105  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     I    19_A     I    19_A    108  108  108     53  101  104  105  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     T    20_A     T    20_A    108  108  108     75  101  104  105  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     S    21_A     S    21_A    108  108  108     31  101  104  105  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     I    22_A     I    22_A    108  108  108     42  101  104  105  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    23_A     L    23_A    108  108  108     75  101  104  105  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     N    24_A     N    24_A    108  108  108     75  101  104  105  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     P    25_A     P    25_A    108  108  108     75  101  104  105  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A    26_A     A    26_A    108  108  108     75  101  104  105  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     D    27_A     D    27_A    108  108  108     75  101  104  105  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     I    28_A     I    28_A    108  108  108     75  101  104  105  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     T    29_A     T    29_A    108  108  108     75  101  104  105  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K    30_A     K    30_A    108  108  108     66  101  104  105  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A    31_A     A    31_A    108  108  108     72  101  104  105  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    32_A     L    32_A    108  108  108     75  101  104  105  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    33_A     E    33_A    108  108  108     67  101  104  105  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     Q    34_A     Q    34_A    108  108  108     40  101  104  105  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     C    35_A     C    35_A    108  108  108     74  101  104  105  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A    36_A     A    36_A    108  108  108     15   37  104  105  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A    37_A     A    37_A    108  108  108      4    6  104  105  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     G    38_A     G    38_A    108  108  108     75  101  104  105  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     F    39_A     F    39_A    108  108  108     75  101  104  105  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     H    40_A     H    40_A    108  108  108     75  101  104  105  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     H    41_A     H    41_A    108  108  108     75  101  104  105  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     T    42_A     T    42_A    108  108  108     75  101  104  105  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A    43_A     A    43_A    108  108  108     75  101  104  105  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     F    44_A     F    44_A    108  108  108     75  101  104  105  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     F    45_A     F    45_A    108  108  108     75  101  104  105  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K    46_A     K    46_A    108  108  108     75  101  104  105  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A    47_A     A    47_A    108  108  108     75  101  104  105  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     S    48_A     S    48_A    108  108  108     75  101  104  105  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     G    49_A     G    49_A    108  108  108     75  101  104  105  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    50_A     L    50_A    108  108  108     67  101  104  105  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     S    51_A     S    51_A    108  108  108      5  101  104  105  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K    52_A     K    52_A    108  108  108      4   74  103  105  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K    53_A     K    53_A    108  108  108     75  101  104  105  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     S    54_A     S    54_A    108  108  108     75  101  104  105  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     D    55_A     D    55_A    108  108  108     65  101  104  105  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A    56_A     A    56_A    108  108  108     65  101  104  105  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    57_A     E    57_A    108  108  108     75  101  104  105  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    58_A     L    58_A    108  108  108     75  101  104  105  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A    59_A     A    59_A    108  108  108     49  101  104  105  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    60_A     E    60_A    108  108  108     38  101  104  105  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     I    61_A     I    61_A    108  108  108     38  101  104  105  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     F    62_A     F    62_A    108  108  108     75  101  104  105  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     N    63_A     N    63_A    108  108  108     49  101  104  105  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     V    64_A     V    64_A    108  108  108     38  101  104  105  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    65_A     L    65_A    108  108  108     42  101  104  105  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     D    66_A     D    66_A    108  108  108     75  101  104  105  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     G    67_A     G    67_A    108  108  108     68  101  104  105  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     D    68_A     D    68_A    108  108  108     67  101  104  105  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     Q    69_A     Q    69_A    108  108  108     75  101  104  105  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     S    70_A     S    70_A    108  108  108     75  101  104  105  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     G    71_A     G    71_A    108  108  108     75  101  104  105  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     Y    72_A     Y    72_A    108  108  108     75  101  104  105  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     I    73_A     I    73_A    108  108  108     75  101  104  105  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    74_A     E    74_A    108  108  108     75  101  104  105  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     V    75_A     V    75_A    108  108  108     75  101  104  105  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    76_A     E    76_A    108  108  108     75  101  104  105  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    77_A     E    77_A    108  108  108     75  101  104  105  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    78_A     L    78_A    108  108  108     75  101  104  105  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K    79_A     K    79_A    108  108  108     75  101  104  105  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     N    80_A     N    80_A    108  108  108     75  101  104  105  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     F    81_A     F    81_A    108  108  108     75  101  104  105  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    82_A     L    82_A    108  108  108     75  101  104  105  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K    83_A     K    83_A    108  108  108     75  101  104  105  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     C    84_A     C    84_A    108  108  108     75  101  104  105  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     F    85_A     F    85_A    108  108  108     75  101  104  105  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     S    86_A     S    86_A    108  108  108     75  101  104  105  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     D    87_A     D    87_A    108  108  108     68  101  104  105  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     G    88_A     G    88_A    108  108  108     59  101  104  105  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A    89_A     A    89_A    108  108  108     75  101  104  105  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     R    90_A     R    90_A    108  108  108     75  101  104  105  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     V    91_A     V    91_A    108  108  108     75  101  104  105  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    92_A     L    92_A    108  108  108     75  101  104  105  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     N    93_A     N    93_A    108  108  108     75  101  104  105  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     D    94_A     D    94_A    108  108  108     75  101  104  105  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K    95_A     K    95_A    108  108  108     75  101  104  105  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    96_A     E    96_A    108  108  108     75  101  104  105  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     T    97_A     T    97_A    108  108  108     75  101  104  105  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     S    98_A     S    98_A    108  108  108     75  101  104  105  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     N    99_A     N    99_A    108  108  108     75  101  104  105  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     F   100_A     F   100_A    108  108  108     75  101  104  105  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L   101_A     L   101_A    108  108  108     75  101  104  105  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A   102_A     A   102_A    108  108  108     75  101  104  105  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A   103_A     A   103_A    108  108  108     75  101  104  105  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     G   104_A     G   104_A    108  108  108     75  101  104  105  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     D   105_A     D   105_A    108  108  108     75  101  104  105  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     S   106_A     S   106_A    108  108  108     75  101  104  105  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     D   107_A     D   107_A    108  108  108     75  101  104  105  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     G   108_A     G   108_A    108  108  108     75  101  104  105  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     D   109_A     D   109_A    108  108  108     75  101  104  105  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     H   110_A     H   110_A    108  108  108     75  101  104  105  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K   111_A     K   111_A    108  108  108     75  101  104  105  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     I   112_A     I   112_A    108  108  108     75  101  104  105  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     G   113_A     G   113_A    108  108  108     75  101  104  105  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     V   114_A     V   114_A    108  108  108     75  101  104  105  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     D   115_A     D   115_A    108  108  108     75  101  104  105  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E   116_A     E   116_A    108  108  108     75  101  104  105  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     F   117_A     F   117_A    108  108  108     75  101  104  105  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K   118_A     K   118_A    108  108  108     75  101  104  105  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     S   119_A     S   119_A    108  108  108     75  101  104  105  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     M   120_A     M   120_A    108  108  108     75  101  104  105  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A   121_A     A   121_A    108  108  108     75  101  104  105  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K   122_A     K   122_A    108  108  108     73  101  104  105  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     M   123_A     M   123_A    108  108  108      3   59  104  105  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     T   124_A     T   124_A    108  108  108      3    3    4   25  103  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_AVERAGE  LCS_A: 100.00  ( 100.00  100.00  100.00 )

GLOBAL_DISTANCE_TEST (summary information about detected largest sets of residues (represented by selected AToms) that can fit under specified thresholds)
GDT DIST_CUTOFF  0.50   1.00   1.50   2.00   2.50   3.00   3.50   4.00   4.50   5.00   5.50   6.00   6.50   7.00   7.50   8.00   8.50   9.00   9.50  10.00
GDT NUMBER_AT     75    101    104    105    106    107    108    108    108    108    108    108    108    108    108    108    108    108    108    108 
GDT PERCENT_AT  69.44  93.52  96.30  97.22  98.15  99.07 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00
GDT RMS_LOCAL    0.30   0.45   0.55   0.57   0.66   0.70   0.78   0.78   0.78   0.78   0.78   0.78   0.78   0.78   0.78   0.78   0.78   0.78   0.78   0.78
GDT RMS_ALL_AT   0.80   0.79   0.78   0.78   0.78   0.78   0.78   0.78   0.78   0.78   0.78   0.78   0.78   0.78   0.78   0.78   0.78   0.78   0.78   0.78

# Checking swapping
#   possible swapping detected:  F    44_A      F    44_A
#   possible swapping detected:  F    45_A      F    45_A
#   possible swapping detected:  E    60_A      E    60_A
#   possible swapping detected:  E    76_A      E    76_A
#   possible swapping detected:  F    85_A      F    85_A

#      Molecule1      Molecule2  DISTANCE    Mis    MC     All    Dist_max   GDC_mc  GDC_all
LGA    S    17_A      S    17_A     3.579     0    0.092   0.679     7.162   44.167   35.476
LGA    K    18_A      K    18_A     3.021     0    0.618   1.213     9.896   67.262   33.810
LGA    I    19_A      I    19_A     0.796     0    0.099   0.931     2.823   90.833   80.952
LGA    T    20_A      T    20_A     0.613     0    0.097   0.147     1.495   90.595   86.667
LGA    S    21_A      S    21_A     0.758     0    0.024   0.571     1.196   92.857   89.048
LGA    I    22_A      I    22_A     0.634     0    0.054   0.068     1.588   95.238   89.524
LGA    L    23_A      L    23_A     0.268     0    0.044   0.066     0.853  100.000   96.429
LGA    N    24_A      N    24_A     0.197     0    0.060   1.088     3.733  100.000   82.262
LGA    P    25_A      P    25_A     0.344     0    0.029   0.146     0.407  100.000  100.000
LGA    A    26_A      A    26_A     0.235     0    0.042   0.049     0.329  100.000  100.000
LGA    D    27_A      D    27_A     0.277     0    0.029   0.092     0.420  100.000  100.000
LGA    I    28_A      I    28_A     0.265     0    0.022   0.134     0.646  100.000   97.619
LGA    T    29_A      T    29_A     0.281     0    0.032   0.917     1.970  100.000   92.245
LGA    K    30_A      K    30_A     0.573     0    0.031   1.046     3.872   95.238   82.646
LGA    A    31_A      A    31_A     0.512     0    0.041   0.047     0.646   95.238   96.190
LGA    L    32_A      L    32_A     0.121     0    0.015   0.104     0.854  100.000   97.619
LGA    E    33_A      E    33_A     0.567     0    0.029   0.900     3.410   92.857   79.683
LGA    Q    34_A      Q    34_A     0.862     0    0.089   1.016     2.509   88.214   79.841
LGA    C    35_A      C    35_A     0.671     0    0.207   0.862     1.820   90.595   87.619
LGA    A    36_A      A    36_A     1.720     0    0.058   0.062     2.600   71.310   70.000
LGA    A    37_A      A    37_A     2.051     0    0.301   0.298     3.152   65.119   65.048
LGA    G    38_A      G    38_A     0.074     0    0.045   0.045     0.452  100.000  100.000
LGA    F    39_A      F    39_A     0.184     0    0.039   0.049     0.500  100.000  100.000
LGA    H    40_A      H    40_A     0.255     0    0.040   1.121     2.509  100.000   87.476
LGA    H    41_A      H    41_A     0.312     0    0.024   0.217     1.090  100.000   94.381
LGA    T    42_A      T    42_A     0.416     0    0.015   0.051     0.482  100.000  100.000
LGA    A    43_A      A    43_A     0.407     0    0.034   0.044     0.542   97.619   98.095
LGA    F    44_A      F    44_A     0.204     0    0.023   0.130     0.713  100.000   97.403
LGA    F    45_A      F    45_A     0.138     0    0.047   0.731     2.139  100.000   87.619
LGA    K    46_A      K    46_A     0.277     0    0.041   0.173     2.414  100.000   88.995
LGA    A    47_A      A    47_A     0.314     0    0.038   0.048     0.376  100.000  100.000
LGA    S    48_A      S    48_A     0.301     0    0.034   0.051     0.576   97.619   98.413
LGA    G    49_A      G    49_A     0.454     0    0.085   0.085     0.484  100.000  100.000
LGA    L    50_A      L    50_A     0.582     0    0.039   0.194     1.098   92.857   90.536
LGA    S    51_A      S    51_A     1.134     0    0.654   0.834     3.029   75.833   72.222
LGA    K    52_A      K    52_A     1.717     0    0.115   1.440     9.876   79.405   52.910
LGA    K    53_A      K    53_A     0.566     0    0.066   0.516     1.024   92.857   90.529
LGA    S    54_A      S    54_A     0.502     0    0.040   0.053     0.605   97.619   95.238
LGA    D    55_A      D    55_A     0.668     0    0.079   0.728     2.542   90.476   80.833
LGA    A    56_A      A    56_A     0.699     0    0.025   0.045     0.913   90.476   90.476
LGA    E    57_A      E    57_A     0.424     0    0.021   0.040     0.481  100.000  100.000
LGA    L    58_A      L    58_A     0.381     0    0.037   0.196     0.746   95.238   96.429
LGA    A    59_A      A    59_A     0.654     0    0.033   0.054     0.815   90.476   90.476
LGA    E    60_A      E    60_A     0.887     0    0.036   0.977     3.249   90.476   77.407
LGA    I    61_A      I    61_A     0.768     0    0.038   0.742     3.061   90.476   85.417
LGA    F    62_A      F    62_A     0.375     0    0.031   0.115     0.622  100.000   98.268
LGA    N    63_A      N    63_A     0.722     0    0.067   1.128     2.735   88.214   79.702
LGA    V    64_A      V    64_A     1.023     0    0.069   0.088     1.843   88.214   81.633
LGA    L    65_A      L    65_A     0.767     0    0.048   0.090     1.133   90.476   88.214
LGA    D    66_A      D    66_A     0.516     0    0.045   0.095     0.570   90.476   95.238
LGA    G    67_A      G    67_A     0.611     0    0.080   0.080     0.632   90.476   90.476
LGA    D    68_A      D    68_A     0.679     0    0.120   0.216     0.897   90.476   91.667
LGA    Q    69_A      Q    69_A     0.489     0    0.070   1.196     4.501   97.619   78.519
LGA    S    70_A      S    70_A     0.179     0    0.032   0.038     0.416  100.000  100.000
LGA    G    71_A      G    71_A     0.410     0    0.034   0.034     0.410  100.000  100.000
LGA    Y    72_A      Y    72_A     0.267     0    0.043   0.084     0.761  100.000   97.619
LGA    I    73_A      I    73_A     0.329     0    0.023   0.080     0.418  100.000  100.000
LGA    E    74_A      E    74_A     0.183     0    0.027   0.122     0.452  100.000  100.000
LGA    V    75_A      V    75_A     0.059     0    0.034   0.094     0.361  100.000  100.000
LGA    E    76_A      E    76_A     0.236     0    0.041   1.498     6.082  100.000   73.439
LGA    E    77_A      E    77_A     0.332     0    0.043   0.137     0.633   97.619   95.767
LGA    L    78_A      L    78_A     0.236     0    0.030   1.333     2.638  100.000   86.964
LGA    K    79_A      K    79_A     0.253     0    0.076   0.652     2.257  100.000   93.968
LGA    N    80_A      N    80_A     0.238     0    0.088   0.525     1.644   97.619   94.226
LGA    F    81_A      F    81_A     0.108     0    0.040   0.124     0.794  100.000   95.671
LGA    L    82_A      L    82_A     0.203     0    0.023   0.050     0.309  100.000  100.000
LGA    K    83_A      K    83_A     0.290     0    0.064   0.661     3.428   97.619   87.143
LGA    C    84_A      C    84_A     0.419     0    0.054   0.762     3.225   97.619   88.492
LGA    F    85_A      F    85_A     0.377     0    0.059   0.060     0.706  100.000   96.537
LGA    S    86_A      S    86_A     0.260     0    0.104   0.567     2.211  100.000   94.127
LGA    D    87_A      D    87_A     0.617     0    0.042   1.104     3.430   92.857   83.214
LGA    G    88_A      G    88_A     0.781     0    0.116   0.116     0.781   95.238   95.238
LGA    A    89_A      A    89_A     0.332     0    0.039   0.056     0.455  100.000  100.000
LGA    R    90_A      R    90_A     0.246     0    0.022   0.126     0.403  100.000  100.000
LGA    V    91_A      V    91_A     0.217     0    0.023   1.113     2.708  100.000   88.844
LGA    L    92_A      L    92_A     0.320     0    0.040   0.065     0.340  100.000  100.000
LGA    N    93_A      N    93_A     0.569     0    0.050   0.825     2.765   95.238   84.226
LGA    D    94_A      D    94_A     0.321     0    0.074   0.129     0.754  100.000   98.810
LGA    K    95_A      K    95_A     0.467     0    0.029   0.852     5.246  100.000   75.503
LGA    E    96_A      E    96_A     0.379     0    0.039   0.145     0.585  100.000   98.942
LGA    T    97_A      T    97_A     0.408     0    0.022   0.108     0.750  100.000   95.918
LGA    S    98_A      S    98_A     0.220     0    0.045   0.086     0.300  100.000  100.000
LGA    N    99_A      N    99_A     0.323     0    0.041   0.926     2.052   97.619   90.000
LGA    F   100_A      F   100_A     0.503     0    0.026   0.597     1.636   97.619   90.649
LGA    L   101_A      L   101_A     0.474     0    0.028   0.103     0.879   97.619   94.048
LGA    A   102_A      A   102_A     0.325     0    0.045   0.047     0.486  100.000  100.000
LGA    A   103_A      A   103_A     0.601     0    0.023   0.040     0.870   92.857   92.381
LGA    G   104_A      G   104_A     0.465     0    0.038   0.038     0.517   97.619   97.619
LGA    D   105_A      D   105_A     0.404     0    0.040   0.108     0.603  100.000   95.238
LGA    S   106_A      S   106_A     0.264     0    0.148   0.140     1.079   97.619   93.730
LGA    D   107_A      D   107_A     0.478     0    0.158   0.240     1.389   92.976   90.595
LGA    G   108_A      G   108_A     0.377     0    0.043   0.043     0.377  100.000  100.000
LGA    D   109_A      D   109_A     0.496     0    0.095   0.158     0.807   95.238   96.429
LGA    H   110_A      H   110_A     0.531     0    0.024   1.463     5.734   97.619   68.190
LGA    K   111_A      K   111_A     0.380     0    0.035   0.162     1.462  100.000   92.751
LGA    I   112_A      I   112_A     0.361     0    0.016   0.595     2.483  100.000   94.405
LGA    G   113_A      G   113_A     0.159     0    0.024   0.024     0.267  100.000  100.000
LGA    V   114_A      V   114_A     0.199     0    0.018   1.106     2.558  100.000   88.844
LGA    D   115_A      D   115_A     0.147     0    0.028   0.140     0.410  100.000  100.000
LGA    E   116_A      E   116_A     0.245     0    0.043   0.589     1.553  100.000   94.921
LGA    F   117_A      F   117_A     0.281     0    0.025   0.105     0.670  100.000   97.403
LGA    K   118_A      K   118_A     0.239     0    0.025   0.753     2.028  100.000   91.005
LGA    S   119_A      S   119_A     0.103     0    0.020   0.653     2.432  100.000   94.127
LGA    M   120_A      M   120_A     0.215     0    0.028   0.760     2.138  100.000   92.083
LGA    A   121_A      A   121_A     0.308     0    0.049   0.051     0.577   97.619   98.095
LGA    K   122_A      K   122_A     0.654     0    0.067   1.047     6.802   92.857   66.402
LGA    M   123_A      M   123_A     1.626     0    0.302   1.257     7.844   73.333   53.095
LGA    T   124_A      T   124_A     3.047     0    0.629   1.059     6.233   57.500   45.918

# RMSD_GDC results:       CA      MC common percent     ALL common percent   GDC_mc  GDC_all
NUMBER_OF_ATOMS_AA:      108     432    432  100.00     820    820  100.00               108
SUMMARY(RMSD_GDC):     0.780          0.794                  1.540           94.989   89.480

#CA            N1   N2   DIST      N    RMSD    GDT_TS    LGA_S3     LGA_Q 
SUMMARY(GDT)  124  108    4.0    108    0.78    97.685    98.839    12.273

LGA_LOCAL      RMSD:   0.780  Number of atoms:  108  under DIST:   4.00
LGA_ASGN_ATOMS RMSD:   0.780  Number of assigned atoms:  108 
Std_ASGN_ATOMS RMSD:   0.780  Standard rmsd on all 108 assigned CA atoms 

Unitary ROTATION matrix and the SHIFT vector superimpose molecules  (1=>2)
  X_new =  -0.870977 * X  +  -0.360169 * Y  +   0.334181 * Z  +  -4.723697
  Y_new =  -0.128239 * X  +   0.823236 * Y  +   0.553026 * Z  + -39.374653
  Z_new =  -0.474293 * X  +   0.438818 * Y  +  -0.763207 * Z  +  66.530884 

Euler angles from the ROTATION matrix. Conventions XYZ and ZXZ:
           Phi     Theta       Psi   [DEG:       Phi     Theta       Psi ]
XYZ: -2.995407  0.494161  2.619784   [DEG: -171.6242   28.3133  150.1026 ]
ZXZ:  2.598034  2.439058 -0.824229   [DEG:  148.8564  139.7477  -47.2249 ]
 
# END of job
