
#######################################################
#                                                     #
#                        LGA                          #
#                  ---------------                    #
#                                                     #
#               Local-Global Alignment                #
#        A Method for Finding 3-D Similarities        #
#               in Protein Structures                 #
#                                                     #
#                  ------------ 10/2009               #
#                                                     #
#      Adam Zemla (adamz@llnl.gov)                    #
#      Lawrence Livermore National Laboratory, CA     #
#                                                     #
#######################################################

!!!   License for LGA program has expired  !!!
#   For updated version of the LGA program   #
# please contact Adam Zemla:  adamz@llnl.gov #

# Molecule1: number of CA atoms  124 (  959),  selected  108 , name one
# Molecule2: number of CA atoms  108 (  820),  selected  108 , name two
# PARAMETERS: input.pdb  -ie  -3  -d:4  -sda  -swap  -ch1:A  -ch2:A  
# FIXED Atom-Atom correspondence
# GDT and LCS analysis 

LCS - RMSD CUTOFF   5.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:   108      17_A - 124_A       0.71     0.71
  LCS_AVERAGE:    100.00

LCS - RMSD CUTOFF   2.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:   108      17_A - 124_A       0.71     0.71
  LCS_AVERAGE:    100.00

LCS - RMSD CUTOFF   1.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:   108      17_A - 124_A       0.71     0.71
  LCS_AVERAGE:    100.00

LCS_GDT    MOLECULE-1    MOLECULE-2     LCS_DETAILS     GDT_DETAILS                                                    TOTAL NUMBER OF RESIDUE PAIRS:  108
LCS_GDT     RESIDUE       RESIDUE       SEGMENT_SIZE    GLOBAL DISTANCE TEST COLUMNS: number of residues under the threshold assigned to each residue pair
LCS_GDT   NAME NUMBER   NAME NUMBER    1.0  2.0  5.0    0.5  1.0  1.5  2.0  2.5  3.0  3.5  4.0  4.5  5.0  5.5  6.0  6.5  7.0  7.5  8.0  8.5  9.0  9.5 10.0
LCS_GDT     S    17_A     S    17_A    108  108  108      0    3   21  104  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K    18_A     K    18_A    108  108  108      3    4    4  105  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     I    19_A     I    19_A    108  108  108     21  102  105  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     T    20_A     T    20_A    108  108  108     46  102  105  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     S    21_A     S    21_A    108  108  108     75  102  105  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     I    22_A     I    22_A    108  108  108     40  102  105  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    23_A     L    23_A    108  108  108     75  102  105  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     N    24_A     N    24_A    108  108  108     75  102  105  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     P    25_A     P    25_A    108  108  108     54  102  105  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A    26_A     A    26_A    108  108  108     73  102  105  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     D    27_A     D    27_A    108  108  108     75  102  105  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     I    28_A     I    28_A    108  108  108     75  102  105  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     T    29_A     T    29_A    108  108  108     75  102  105  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K    30_A     K    30_A    108  108  108     40  102  105  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A    31_A     A    31_A    108  108  108     48  102  105  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    32_A     L    32_A    108  108  108     75  102  105  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    33_A     E    33_A    108  108  108     75  102  105  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     Q    34_A     Q    34_A    108  108  108     26  102  105  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     C    35_A     C    35_A    108  108  108     74  102  105  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A    36_A     A    36_A    108  108  108      6   50  105  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A    37_A     A    37_A    108  108  108      6   64  104  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     G    38_A     G    38_A    108  108  108     75  102  105  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     F    39_A     F    39_A    108  108  108     75  102  105  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     H    40_A     H    40_A    108  108  108     75  102  105  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     H    41_A     H    41_A    108  108  108     75  102  105  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     T    42_A     T    42_A    108  108  108     75  102  105  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A    43_A     A    43_A    108  108  108     75  102  105  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     F    44_A     F    44_A    108  108  108     75  102  105  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     F    45_A     F    45_A    108  108  108     75  102  105  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K    46_A     K    46_A    108  108  108     75  102  105  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A    47_A     A    47_A    108  108  108     75  102  105  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     S    48_A     S    48_A    108  108  108     75  102  105  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     G    49_A     G    49_A    108  108  108     75  102  105  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    50_A     L    50_A    108  108  108     75  102  105  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     S    51_A     S    51_A    108  108  108     75  102  105  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K    52_A     K    52_A    108  108  108     75  102  105  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K    53_A     K    53_A    108  108  108     75  102  105  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     S    54_A     S    54_A    108  108  108     75  102  105  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     D    55_A     D    55_A    108  108  108     55  102  105  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A    56_A     A    56_A    108  108  108     57  102  105  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    57_A     E    57_A    108  108  108     70  102  105  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    58_A     L    58_A    108  108  108     75  102  105  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A    59_A     A    59_A    108  108  108     75  102  105  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    60_A     E    60_A    108  108  108     57  102  105  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     I    61_A     I    61_A    108  108  108     43  102  105  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     F    62_A     F    62_A    108  108  108     75  102  105  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     N    63_A     N    63_A    108  108  108     73  102  105  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     V    64_A     V    64_A    108  108  108     43  102  105  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    65_A     L    65_A    108  108  108     40  102  105  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     D    66_A     D    66_A    108  108  108     60  102  105  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     G    67_A     G    67_A    108  108  108     40  102  105  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     D    68_A     D    68_A    108  108  108     33  102  105  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     Q    69_A     Q    69_A    108  108  108     61  102  105  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     S    70_A     S    70_A    108  108  108     75  102  105  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     G    71_A     G    71_A    108  108  108     75  102  105  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     Y    72_A     Y    72_A    108  108  108     75  102  105  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     I    73_A     I    73_A    108  108  108     75  102  105  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    74_A     E    74_A    108  108  108     75  102  105  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     V    75_A     V    75_A    108  108  108     75  102  105  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    76_A     E    76_A    108  108  108     75  102  105  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    77_A     E    77_A    108  108  108     75  102  105  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    78_A     L    78_A    108  108  108     75  102  105  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K    79_A     K    79_A    108  108  108     75  102  105  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     N    80_A     N    80_A    108  108  108     75  102  105  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     F    81_A     F    81_A    108  108  108     75  102  105  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    82_A     L    82_A    108  108  108     75  102  105  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K    83_A     K    83_A    108  108  108     75  102  105  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     C    84_A     C    84_A    108  108  108     70  102  105  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     F    85_A     F    85_A    108  108  108     75  102  105  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     S    86_A     S    86_A    108  108  108     75  102  105  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     D    87_A     D    87_A    108  108  108     64  102  105  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     G    88_A     G    88_A    108  108  108     71  102  105  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A    89_A     A    89_A    108  108  108     75  102  105  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     R    90_A     R    90_A    108  108  108     75  102  105  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     V    91_A     V    91_A    108  108  108     75  102  105  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    92_A     L    92_A    108  108  108     75  102  105  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     N    93_A     N    93_A    108  108  108     75  102  105  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     D    94_A     D    94_A    108  108  108     75  102  105  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K    95_A     K    95_A    108  108  108     75  102  105  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    96_A     E    96_A    108  108  108     75  102  105  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     T    97_A     T    97_A    108  108  108     75  102  105  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     S    98_A     S    98_A    108  108  108     75  102  105  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     N    99_A     N    99_A    108  108  108     75  102  105  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     F   100_A     F   100_A    108  108  108     75  102  105  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L   101_A     L   101_A    108  108  108     75  102  105  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A   102_A     A   102_A    108  108  108     75  102  105  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A   103_A     A   103_A    108  108  108     74  102  105  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     G   104_A     G   104_A    108  108  108     75  102  105  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     D   105_A     D   105_A    108  108  108     75  102  105  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     S   106_A     S   106_A    108  108  108     75  102  105  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     D   107_A     D   107_A    108  108  108     74  102  105  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     G   108_A     G   108_A    108  108  108     64  102  105  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     D   109_A     D   109_A    108  108  108     75  102  105  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     H   110_A     H   110_A    108  108  108     75  102  105  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K   111_A     K   111_A    108  108  108     75  102  105  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     I   112_A     I   112_A    108  108  108     75  102  105  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     G   113_A     G   113_A    108  108  108     75  102  105  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     V   114_A     V   114_A    108  108  108     75  102  105  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     D   115_A     D   115_A    108  108  108     75  102  105  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E   116_A     E   116_A    108  108  108     75  102  105  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     F   117_A     F   117_A    108  108  108     75  102  105  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K   118_A     K   118_A    108  108  108     75  102  105  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     S   119_A     S   119_A    108  108  108     75  102  105  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     M   120_A     M   120_A    108  108  108     75  102  105  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A   121_A     A   121_A    108  108  108     75  102  105  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K   122_A     K   122_A    108  108  108     75  102  105  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     M   123_A     M   123_A    108  108  108     57  102  105  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     T   124_A     T   124_A    108  108  108     25   95  105  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_AVERAGE  LCS_A: 100.00  ( 100.00  100.00  100.00 )

GLOBAL_DISTANCE_TEST (summary information about detected largest sets of residues (represented by selected AToms) that can fit under specified thresholds)
GDT DIST_CUTOFF  0.50   1.00   1.50   2.00   2.50   3.00   3.50   4.00   4.50   5.00   5.50   6.00   6.50   7.00   7.50   8.00   8.50   9.00   9.50  10.00
GDT NUMBER_AT     75    102    105    106    107    107    108    108    108    108    108    108    108    108    108    108    108    108    108    108 
GDT PERCENT_AT  69.44  94.44  97.22  98.15  99.07  99.07 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00
GDT RMS_LOCAL    0.35   0.47   0.52   0.55   0.63   0.63   0.71   0.71   0.71   0.71   0.71   0.71   0.71   0.71   0.71   0.71   0.71   0.71   0.71   0.71
GDT RMS_ALL_AT   0.72   0.71   0.71   0.71   0.71   0.71   0.71   0.71   0.71   0.71   0.71   0.71   0.71   0.71   0.71   0.71   0.71   0.71   0.71   0.71

# Checking swapping
#   possible swapping detected:  E    33_A      E    33_A
#   possible swapping detected:  F    45_A      F    45_A
#   possible swapping detected:  E    76_A      E    76_A
#   possible swapping detected:  E    96_A      E    96_A

#      Molecule1      Molecule2  DISTANCE    Mis    MC     All    Dist_max   GDC_mc  GDC_all
LGA    S    17_A      S    17_A     3.359     0    0.149   0.660     7.020   48.571   38.413
LGA    K    18_A      K    18_A     3.312     0    0.627   0.680    14.430   65.238   32.487
LGA    I    19_A      I    19_A     1.245     0    0.097   1.064     4.292   84.167   72.143
LGA    T    20_A      T    20_A     0.834     0    0.101   0.147     1.776   88.214   82.857
LGA    S    21_A      S    21_A     0.356     0    0.030   0.656     1.947   97.619   92.302
LGA    I    22_A      I    22_A     0.818     0    0.064   0.085     2.357   95.238   85.179
LGA    L    23_A      L    23_A     0.441     0    0.062   0.873     2.225   97.619   86.488
LGA    N    24_A      N    24_A     0.439     0    0.066   1.137     3.860  100.000   82.262
LGA    P    25_A      P    25_A     0.696     0    0.025   0.144     0.738   90.476   91.837
LGA    A    26_A      A    26_A     0.564     0    0.044   0.050     0.709   95.238   94.286
LGA    D    27_A      D    27_A     0.479     0    0.024   0.086     0.555   95.238   96.429
LGA    I    28_A      I    28_A     0.462     0    0.021   0.134     0.809   97.619   95.238
LGA    T    29_A      T    29_A     0.307     0    0.029   0.941     2.132  100.000   91.088
LGA    K    30_A      K    30_A     0.718     0    0.034   0.818     3.335   92.857   83.069
LGA    A    31_A      A    31_A     0.659     0    0.036   0.047     0.689   90.476   90.476
LGA    L    32_A      L    32_A     0.270     0    0.021   0.127     0.790  100.000   98.810
LGA    E    33_A      E    33_A     0.485     0    0.018   0.998     5.240   95.238   71.429
LGA    Q    34_A      Q    34_A     0.989     0    0.094   0.962     2.973   88.214   80.794
LGA    C    35_A      C    35_A     0.606     0    0.017   0.803     1.264   90.476   87.460
LGA    A    36_A      A    36_A     1.660     0    0.044   0.048     2.376   75.238   74.762
LGA    A    37_A      A    37_A     1.945     0    0.308   0.305     3.177   67.143   66.667
LGA    G    38_A      G    38_A     0.123     0    0.050   0.050     0.481  100.000  100.000
LGA    F    39_A      F    39_A     0.181     0    0.040   0.043     0.504  100.000   99.134
LGA    H    40_A      H    40_A     0.177     0    0.045   0.154     1.141  100.000   94.333
LGA    H    41_A      H    41_A     0.331     0    0.043   0.317     1.696  100.000   91.667
LGA    T    42_A      T    42_A     0.452     0    0.019   1.116     2.301  100.000   89.932
LGA    A    43_A      A    43_A     0.368     0    0.026   0.040     0.481  100.000  100.000
LGA    F    44_A      F    44_A     0.204     0    0.022   0.059     0.521  100.000   98.268
LGA    F    45_A      F    45_A     0.137     0    0.056   0.377     1.443  100.000   94.892
LGA    K    46_A      K    46_A     0.320     0    0.040   0.270     3.244  100.000   83.545
LGA    A    47_A      A    47_A     0.384     0    0.036   0.051     0.450  100.000  100.000
LGA    S    48_A      S    48_A     0.359     0    0.038   0.047     0.625   97.619   98.413
LGA    G    49_A      G    49_A     0.390     0    0.053   0.053     0.458  100.000  100.000
LGA    L    50_A      L    50_A     0.431     0    0.023   0.177     1.054   97.619   95.298
LGA    S    51_A      S    51_A     0.372     0    0.170   0.576     2.175   95.357   89.444
LGA    K    52_A      K    52_A     0.410     0    0.134   0.745     1.878   97.619   90.688
LGA    K    53_A      K    53_A     0.340     0    0.033   0.934     3.342  100.000   83.915
LGA    S    54_A      S    54_A     0.431     0    0.039   0.052     0.508   97.619   96.825
LGA    D    55_A      D    55_A     0.684     0    0.063   0.898     3.054   90.476   80.000
LGA    A    56_A      A    56_A     0.685     0    0.028   0.045     0.887   90.476   90.476
LGA    E    57_A      E    57_A     0.563     0    0.027   1.051     4.237   90.476   79.894
LGA    L    58_A      L    58_A     0.417     0    0.036   0.211     0.508  100.000   98.810
LGA    A    59_A      A    59_A     0.501     0    0.035   0.052     0.721   90.476   90.476
LGA    E    60_A      E    60_A     0.730     0    0.039   1.098     3.845   90.476   73.333
LGA    I    61_A      I    61_A     0.675     0    0.038   0.701     2.635   90.476   86.310
LGA    F    62_A      F    62_A     0.326     0    0.026   0.072     0.410  100.000  100.000
LGA    N    63_A      N    63_A     0.555     0    0.069   0.870     3.857   92.857   75.714
LGA    V    64_A      V    64_A     0.876     0    0.088   1.154     3.934   90.476   82.449
LGA    L    65_A      L    65_A     0.728     0    0.044   0.058     0.899   90.476   90.476
LGA    D    66_A      D    66_A     0.581     0    0.044   0.228     1.278   90.476   90.536
LGA    G    67_A      G    67_A     0.655     0    0.088   0.088     0.805   90.476   90.476
LGA    D    68_A      D    68_A     0.935     0    0.106   0.224     1.190   92.857   89.405
LGA    Q    69_A      Q    69_A     0.574     0    0.043   0.999     5.611   95.238   68.730
LGA    S    70_A      S    70_A     0.433     0    0.032   0.037     0.636   97.619   95.238
LGA    G    71_A      G    71_A     0.159     0    0.039   0.039     0.292  100.000  100.000
LGA    Y    72_A      Y    72_A     0.387     0    0.032   0.199     1.983   95.238   87.579
LGA    I    73_A      I    73_A     0.402     0    0.027   0.074     0.516   97.619   98.810
LGA    E    74_A      E    74_A     0.251     0    0.031   0.151     0.661  100.000   95.767
LGA    V    75_A      V    75_A     0.053     0    0.031   0.101     0.513  100.000   98.639
LGA    E    76_A      E    76_A     0.220     0    0.048   1.122     5.047  100.000   75.873
LGA    E    77_A      E    77_A     0.311     0    0.043   0.134     0.637   97.619   97.884
LGA    L    78_A      L    78_A     0.116     0    0.025   1.327     2.711  100.000   86.964
LGA    K    79_A      K    79_A     0.312     0    0.065   0.234     1.013  100.000   96.878
LGA    N    80_A      N    80_A     0.269     0    0.066   0.256     1.117  100.000   97.679
LGA    F    81_A      F    81_A     0.212     0    0.034   0.100     0.378  100.000  100.000
LGA    L    82_A      L    82_A     0.390     0    0.026   0.092     0.542  100.000   98.810
LGA    K    83_A      K    83_A     0.500     0    0.074   1.155     3.442   90.476   72.275
LGA    C    84_A      C    84_A     0.635     0    0.060   0.062     0.896   90.476   90.476
LGA    F    85_A      F    85_A     0.496     0    0.058   0.103     0.735   97.619   96.537
LGA    S    86_A      S    86_A     0.486     0    0.087   0.089     0.664   95.238   96.825
LGA    D    87_A      D    87_A     0.705     0    0.064   1.134     3.811   90.476   79.048
LGA    G    88_A      G    88_A     0.649     0    0.102   0.102     0.649   92.857   92.857
LGA    A    89_A      A    89_A     0.440     0    0.041   0.047     0.506   97.619   98.095
LGA    R    90_A      R    90_A     0.466     0    0.028   0.619     1.445  100.000   92.294
LGA    V    91_A      V    91_A     0.381     0    0.029   1.168     2.721  100.000   88.844
LGA    L    92_A      L    92_A     0.326     0    0.050   0.062     0.371  100.000  100.000
LGA    N    93_A      N    93_A     0.463     0    0.027   0.132     0.761  100.000   96.429
LGA    D    94_A      D    94_A     0.514     0    0.041   1.098     3.861   92.857   78.393
LGA    K    95_A      K    95_A     0.405     0    0.016   0.740     3.440  100.000   81.005
LGA    E    96_A      E    96_A     0.452     0    0.061   0.692     1.939  100.000   90.847
LGA    T    97_A      T    97_A     0.476     0    0.035   1.022     2.053  100.000   88.571
LGA    S    98_A      S    98_A     0.224     0    0.045   0.087     0.313  100.000  100.000
LGA    N    99_A      N    99_A     0.328     0    0.039   0.896     3.677  100.000   81.310
LGA    F   100_A      F   100_A     0.427     0    0.022   0.590     1.565  100.000   90.693
LGA    L   101_A      L   101_A     0.328     0    0.024   1.094     2.693  100.000   90.238
LGA    A   102_A      A   102_A     0.270     0    0.042   0.045     0.458  100.000  100.000
LGA    A   103_A      A   103_A     0.537     0    0.016   0.035     0.736   92.857   92.381
LGA    G   104_A      G   104_A     0.442     0    0.029   0.029     0.501   97.619   97.619
LGA    D   105_A      D   105_A     0.350     0    0.047   0.125     0.494  100.000  100.000
LGA    S   106_A      S   106_A     0.277     0    0.122   0.114     0.986   97.619   95.238
LGA    D   107_A      D   107_A     0.510     0    0.168   0.207     1.501   88.452   88.333
LGA    G   108_A      G   108_A     0.568     0    0.044   0.044     0.568   97.619   97.619
LGA    D   109_A      D   109_A     0.498     0    0.081   0.138     0.835   95.238   94.048
LGA    H   110_A      H   110_A     0.422     0    0.012   1.055     4.943  100.000   73.571
LGA    K   111_A      K   111_A     0.437     0    0.027   0.184     1.631  100.000   90.741
LGA    I   112_A      I   112_A     0.441     0    0.015   0.594     2.615  100.000   93.452
LGA    G   113_A      G   113_A     0.242     0    0.027   0.027     0.348  100.000  100.000
LGA    V   114_A      V   114_A     0.161     0    0.024   1.112     2.505  100.000   88.844
LGA    D   115_A      D   115_A     0.154     0    0.029   0.283     0.723  100.000   97.619
LGA    E   116_A      E   116_A     0.218     0    0.033   0.143     0.460  100.000  100.000
LGA    F   117_A      F   117_A     0.286     0    0.021   0.101     0.655  100.000   96.537
LGA    K   118_A      K   118_A     0.320     0    0.025   0.696     2.338  100.000   92.169
LGA    S   119_A      S   119_A     0.234     0    0.016   0.727     2.187  100.000   94.127
LGA    M   120_A      M   120_A     0.280     0    0.021   0.386     1.336  100.000   96.488
LGA    A   121_A      A   121_A     0.423     0    0.046   0.049     0.639   97.619   98.095
LGA    K   122_A      K   122_A     0.361     0    0.140   0.934     3.306   97.619   83.651
LGA    M   123_A      M   123_A     0.574     0    0.588   0.710     5.398   84.524   67.738
LGA    T   124_A      T   124_A     1.146     0    0.107   1.085     5.639   56.905   48.639

# RMSD_GDC results:       CA      MC common percent     ALL common percent   GDC_mc  GDC_all
NUMBER_OF_ATOMS_AA:      108     432    432  100.00     820    820  100.00               108
SUMMARY(RMSD_GDC):     0.709          0.787                  1.569           95.076   88.979

#CA            N1   N2   DIST      N    RMSD    GDT_TS    LGA_S3     LGA_Q 
SUMMARY(GDT)  124  108    4.0    108    0.71    98.148    99.107    13.344

LGA_LOCAL      RMSD:   0.709  Number of atoms:  108  under DIST:   4.00
LGA_ASGN_ATOMS RMSD:   0.709  Number of assigned atoms:  108 
Std_ASGN_ATOMS RMSD:   0.709  Standard rmsd on all 108 assigned CA atoms 

Unitary ROTATION matrix and the SHIFT vector superimpose molecules  (1=>2)
  X_new =  -0.411297 * X  +  -0.884679 * Y  +  -0.219494 * Z  +  38.325161
  Y_new =  -0.218242 * X  +  -0.138221 * Y  +   0.966057 * Z  +  -6.500687
  Z_new =  -0.884989 * X  +   0.445239 * Y  +  -0.136224 * Z  +  20.810236 

Euler angles from the ROTATION matrix. Conventions XYZ and ZXZ:
           Phi     Theta       Psi   [DEG:       Phi     Theta       Psi ]
XYZ: -2.653751  1.086470  1.867709   [DEG: -152.0488   62.2501  107.0119 ]
ZXZ: -2.918179  1.707445 -1.104670   [DEG: -167.1994   97.8294  -63.2930 ]
 
# END of job
