
#######################################################
#                                                     #
#                        LGA                          #
#                  ---------------                    #
#                                                     #
#               Local-Global Alignment                #
#        A Method for Finding 3-D Similarities        #
#               in Protein Structures                 #
#                                                     #
#                  ------------ 10/2009               #
#                                                     #
#      Adam Zemla (adamz@llnl.gov)                    #
#      Lawrence Livermore National Laboratory, CA     #
#                                                     #
#######################################################

!!!   License for LGA program has expired  !!!
#   For updated version of the LGA program   #
# please contact Adam Zemla:  adamz@llnl.gov #

# Molecule1: number of CA atoms  124 (  959),  selected  108 , name one
# Molecule2: number of CA atoms  108 (  820),  selected  108 , name two
# PARAMETERS: input.pdb  -ie  -3  -d:4  -sda  -swap  -ch1:A  -ch2:A  
# FIXED Atom-Atom correspondence
# GDT and LCS analysis 

LCS - RMSD CUTOFF   5.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:   108      17_A - 124_A       0.70     0.70
  LCS_AVERAGE:    100.00

LCS - RMSD CUTOFF   2.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:   108      17_A - 124_A       0.70     0.70
  LCS_AVERAGE:    100.00

LCS - RMSD CUTOFF   1.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:   108      17_A - 124_A       0.70     0.70
  LCS_AVERAGE:    100.00

LCS_GDT    MOLECULE-1    MOLECULE-2     LCS_DETAILS     GDT_DETAILS                                                    TOTAL NUMBER OF RESIDUE PAIRS:  108
LCS_GDT     RESIDUE       RESIDUE       SEGMENT_SIZE    GLOBAL DISTANCE TEST COLUMNS: number of residues under the threshold assigned to each residue pair
LCS_GDT   NAME NUMBER   NAME NUMBER    1.0  2.0  5.0    0.5  1.0  1.5  2.0  2.5  3.0  3.5  4.0  4.5  5.0  5.5  6.0  6.5  7.0  7.5  8.0  8.5  9.0  9.5 10.0
LCS_GDT     S    17_A     S    17_A    108  108  108      0   17   59  104  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K    18_A     K    18_A    108  108  108      3    3   30  104  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     I    19_A     I    19_A    108  108  108     19  103  106  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     T    20_A     T    20_A    108  108  108     76  103  106  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     S    21_A     S    21_A    108  108  108     73  103  106  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     I    22_A     I    22_A    108  108  108     61  103  106  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    23_A     L    23_A    108  108  108     77  103  106  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     N    24_A     N    24_A    108  108  108     77  103  106  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     P    25_A     P    25_A    108  108  108     77  103  106  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A    26_A     A    26_A    108  108  108     77  103  106  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     D    27_A     D    27_A    108  108  108     77  103  106  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     I    28_A     I    28_A    108  108  108     77  103  106  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     T    29_A     T    29_A    108  108  108     77  103  106  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K    30_A     K    30_A    108  108  108     49  103  106  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A    31_A     A    31_A    108  108  108     35  103  106  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    32_A     L    32_A    108  108  108     77  103  106  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    33_A     E    33_A    108  108  108     64  103  106  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     Q    34_A     Q    34_A    108  108  108     25  103  106  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     C    35_A     C    35_A    108  108  108     72  103  106  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A    36_A     A    36_A    108  108  108      4   59  106  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A    37_A     A    37_A    108  108  108      4    5  106  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     G    38_A     G    38_A    108  108  108     77  103  106  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     F    39_A     F    39_A    108  108  108     77  103  106  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     H    40_A     H    40_A    108  108  108     77  103  106  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     H    41_A     H    41_A    108  108  108     77  103  106  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     T    42_A     T    42_A    108  108  108     77  103  106  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A    43_A     A    43_A    108  108  108     77  103  106  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     F    44_A     F    44_A    108  108  108     77  103  106  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     F    45_A     F    45_A    108  108  108     77  103  106  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K    46_A     K    46_A    108  108  108     77  103  106  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A    47_A     A    47_A    108  108  108     77  103  106  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     S    48_A     S    48_A    108  108  108     77  103  106  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     G    49_A     G    49_A    108  108  108     77  103  106  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    50_A     L    50_A    108  108  108     77  103  106  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     S    51_A     S    51_A    108  108  108     77  103  106  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K    52_A     K    52_A    108  108  108     77  103  106  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K    53_A     K    53_A    108  108  108     77  103  106  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     S    54_A     S    54_A    108  108  108     77  103  106  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     D    55_A     D    55_A    108  108  108     64  103  106  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A    56_A     A    56_A    108  108  108     67  103  106  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    57_A     E    57_A    108  108  108     72  103  106  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    58_A     L    58_A    108  108  108     77  103  106  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A    59_A     A    59_A    108  108  108     77  103  106  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    60_A     E    60_A    108  108  108     61  103  106  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     I    61_A     I    61_A    108  108  108     65  103  106  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     F    62_A     F    62_A    108  108  108     77  103  106  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     N    63_A     N    63_A    108  108  108     77  103  106  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     V    64_A     V    64_A    108  108  108     35  103  106  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    65_A     L    65_A    108  108  108     35  103  106  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     D    66_A     D    66_A    108  108  108     35  103  106  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     G    67_A     G    67_A    108  108  108     68  103  106  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     D    68_A     D    68_A    108  108  108     35  103  106  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     Q    69_A     Q    69_A    108  108  108     77  103  106  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     S    70_A     S    70_A    108  108  108     77  103  106  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     G    71_A     G    71_A    108  108  108     37  103  106  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     Y    72_A     Y    72_A    108  108  108     77  103  106  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     I    73_A     I    73_A    108  108  108     77  103  106  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    74_A     E    74_A    108  108  108     77  103  106  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     V    75_A     V    75_A    108  108  108     77  103  106  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    76_A     E    76_A    108  108  108     77  103  106  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    77_A     E    77_A    108  108  108     77  103  106  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    78_A     L    78_A    108  108  108     77  103  106  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K    79_A     K    79_A    108  108  108     77  103  106  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     N    80_A     N    80_A    108  108  108     77  103  106  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     F    81_A     F    81_A    108  108  108     77  103  106  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    82_A     L    82_A    108  108  108     77  103  106  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K    83_A     K    83_A    108  108  108     77  103  106  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     C    84_A     C    84_A    108  108  108     77  103  106  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     F    85_A     F    85_A    108  108  108     77  103  106  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     S    86_A     S    86_A    108  108  108     77  103  106  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     D    87_A     D    87_A    108  108  108     77  103  106  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     G    88_A     G    88_A    108  108  108     73  103  106  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A    89_A     A    89_A    108  108  108     77  103  106  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     R    90_A     R    90_A    108  108  108     77  103  106  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     V    91_A     V    91_A    108  108  108     77  103  106  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    92_A     L    92_A    108  108  108     77  103  106  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     N    93_A     N    93_A    108  108  108     77  103  106  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     D    94_A     D    94_A    108  108  108     77  103  106  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K    95_A     K    95_A    108  108  108     77  103  106  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    96_A     E    96_A    108  108  108     77  103  106  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     T    97_A     T    97_A    108  108  108     77  103  106  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     S    98_A     S    98_A    108  108  108     77  103  106  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     N    99_A     N    99_A    108  108  108     77  103  106  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     F   100_A     F   100_A    108  108  108     77  103  106  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L   101_A     L   101_A    108  108  108     77  103  106  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A   102_A     A   102_A    108  108  108     77  103  106  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A   103_A     A   103_A    108  108  108     77  103  106  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     G   104_A     G   104_A    108  108  108     77  103  106  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     D   105_A     D   105_A    108  108  108     77  103  106  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     S   106_A     S   106_A    108  108  108     77  103  106  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     D   107_A     D   107_A    108  108  108     64  103  106  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     G   108_A     G   108_A    108  108  108     57  103  106  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     D   109_A     D   109_A    108  108  108     77  103  106  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     H   110_A     H   110_A    108  108  108     77  103  106  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K   111_A     K   111_A    108  108  108     75  103  106  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     I   112_A     I   112_A    108  108  108     77  103  106  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     G   113_A     G   113_A    108  108  108     77  103  106  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     V   114_A     V   114_A    108  108  108     77  103  106  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     D   115_A     D   115_A    108  108  108     77  103  106  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E   116_A     E   116_A    108  108  108     77  103  106  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     F   117_A     F   117_A    108  108  108     77  103  106  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K   118_A     K   118_A    108  108  108     77  103  106  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     S   119_A     S   119_A    108  108  108     77  103  106  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     M   120_A     M   120_A    108  108  108     77  103  106  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A   121_A     A   121_A    108  108  108     77  103  106  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K   122_A     K   122_A    108  108  108     77  103  106  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     M   123_A     M   123_A    108  108  108     77  103  106  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     T   124_A     T   124_A    108  108  108     31  103  106  106  107  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_AVERAGE  LCS_A: 100.00  ( 100.00  100.00  100.00 )

GLOBAL_DISTANCE_TEST (summary information about detected largest sets of residues (represented by selected AToms) that can fit under specified thresholds)
GDT DIST_CUTOFF  0.50   1.00   1.50   2.00   2.50   3.00   3.50   4.00   4.50   5.00   5.50   6.00   6.50   7.00   7.50   8.00   8.50   9.00   9.50  10.00
GDT NUMBER_AT     77    103    106    106    107    107    108    108    108    108    108    108    108    108    108    108    108    108    108    108 
GDT PERCENT_AT  71.30  95.37  98.15  98.15  99.07  99.07 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00
GDT RMS_LOCAL    0.31   0.46   0.54   0.54   0.62   0.62   0.70   0.70   0.70   0.70   0.70   0.70   0.70   0.70   0.70   0.70   0.70   0.70   0.70   0.70
GDT RMS_ALL_AT   0.72   0.70   0.70   0.70   0.70   0.70   0.70   0.70   0.70   0.70   0.70   0.70   0.70   0.70   0.70   0.70   0.70   0.70   0.70   0.70

# Checking swapping
#   possible swapping detected:  E    33_A      E    33_A
#   possible swapping detected:  F    44_A      F    44_A
#   possible swapping detected:  F    45_A      F    45_A
#   possible swapping detected:  D    66_A      D    66_A
#   possible swapping detected:  Y    72_A      Y    72_A
#   possible swapping detected:  E    74_A      E    74_A
#   possible swapping detected:  E    76_A      E    76_A

#      Molecule1      Molecule2  DISTANCE    Mis    MC     All    Dist_max   GDC_mc  GDC_all
LGA    S    17_A      S    17_A     3.314     0    0.667   0.855     6.761   54.048   43.492
LGA    K    18_A      K    18_A     3.301     0    0.614   0.618    15.167   63.095   31.217
LGA    I    19_A      I    19_A     1.009     0    0.075   0.152     1.864   86.190   83.869
LGA    T    20_A      T    20_A     0.676     0    0.095   0.158     1.653   90.595   85.442
LGA    S    21_A      S    21_A     0.475     0    0.047   0.556     0.997   95.238   93.651
LGA    I    22_A      I    22_A     0.696     0    0.073   0.680     1.514   95.238   87.262
LGA    L    23_A      L    23_A     0.324     0    0.041   0.958     2.593  100.000   88.869
LGA    N    24_A      N    24_A     0.302     0    0.070   0.974     3.554  100.000   81.071
LGA    P    25_A      P    25_A     0.408     0    0.047   0.139     0.477  100.000  100.000
LGA    A    26_A      A    26_A     0.382     0    0.051   0.054     0.510  100.000   98.095
LGA    D    27_A      D    27_A     0.405     0    0.028   0.098     0.705   97.619   97.619
LGA    I    28_A      I    28_A     0.422     0    0.038   1.174     2.794  100.000   85.655
LGA    T    29_A      T    29_A     0.335     0    0.029   0.946     1.998   97.619   90.884
LGA    K    30_A      K    30_A     0.788     0    0.034   1.115     4.712   90.476   71.693
LGA    A    31_A      A    31_A     0.699     0    0.037   0.044     0.780   90.476   90.476
LGA    L    32_A      L    32_A     0.180     0    0.019   0.827     2.150  100.000   92.083
LGA    E    33_A      E    33_A     0.666     0    0.027   1.483     5.220   92.857   72.698
LGA    Q    34_A      Q    34_A     0.997     0    0.100   1.101     2.749   88.214   78.942
LGA    C    35_A      C    35_A     0.652     0    0.199   0.231     2.343   90.595   83.333
LGA    A    36_A      A    36_A     1.588     0    0.064   0.068     2.526   73.333   73.238
LGA    A    37_A      A    37_A     2.033     0    0.308   0.304     3.218   65.119   65.048
LGA    G    38_A      G    38_A     0.042     0    0.043   0.043     0.496  100.000  100.000
LGA    F    39_A      F    39_A     0.163     0    0.040   0.050     0.637  100.000   97.403
LGA    H    40_A      H    40_A     0.291     0    0.048   1.124     6.336  100.000   69.667
LGA    H    41_A      H    41_A     0.387     0    0.023   0.226     1.094  100.000   96.238
LGA    T    42_A      T    42_A     0.520     0    0.021   0.071     0.570   97.619   94.558
LGA    A    43_A      A    43_A     0.404     0    0.036   0.044     0.511   97.619   98.095
LGA    F    44_A      F    44_A     0.266     0    0.022   0.170     0.890  100.000   97.403
LGA    F    45_A      F    45_A     0.217     0    0.049   0.659     2.121  100.000   88.398
LGA    K    46_A      K    46_A     0.344     0    0.038   0.892     5.213  100.000   74.074
LGA    A    47_A      A    47_A     0.343     0    0.040   0.049     0.443  100.000  100.000
LGA    S    48_A      S    48_A     0.429     0    0.024   0.037     0.665   97.619   96.825
LGA    G    49_A      G    49_A     0.411     0    0.081   0.081     0.542   97.619   97.619
LGA    L    50_A      L    50_A     0.513     0    0.023   0.134     0.956   95.238   92.857
LGA    S    51_A      S    51_A     0.422     0    0.178   0.668     1.180   95.357   92.222
LGA    K    52_A      K    52_A     0.580     0    0.135   0.911     6.778   88.214   65.344
LGA    K    53_A      K    53_A     0.459     0    0.040   1.088     4.265  100.000   74.762
LGA    S    54_A      S    54_A     0.198     0    0.044   0.631     2.190  100.000   94.127
LGA    D    55_A      D    55_A     0.645     0    0.092   0.880     3.043   92.857   80.238
LGA    A    56_A      A    56_A     0.644     0    0.043   0.051     0.916   90.476   90.476
LGA    E    57_A      E    57_A     0.582     0    0.026   0.934     2.860   95.238   85.926
LGA    L    58_A      L    58_A     0.300     0    0.036   0.172     0.656  100.000   98.810
LGA    A    59_A      A    59_A     0.478     0    0.038   0.053     0.743   95.238   94.286
LGA    E    60_A      E    60_A     0.719     0    0.040   0.761     4.325   90.476   71.852
LGA    I    61_A      I    61_A     0.620     0    0.037   0.718     1.668   90.476   87.143
LGA    F    62_A      F    62_A     0.283     0    0.034   0.083     0.347  100.000  100.000
LGA    N    63_A      N    63_A     0.534     0    0.074   0.836     3.622   92.857   76.548
LGA    V    64_A      V    64_A     0.889     0    0.071   1.149     3.886   90.476   82.449
LGA    L    65_A      L    65_A     0.718     0    0.062   0.092     0.720   90.476   90.476
LGA    D    66_A      D    66_A     0.814     0    0.121   0.762     2.387   90.476   83.929
LGA    G    67_A      G    67_A     0.629     0    0.079   0.079     0.722   90.476   90.476
LGA    D    68_A      D    68_A     0.875     0    0.129   0.225     1.501   92.857   87.202
LGA    Q    69_A      Q    69_A     0.503     0    0.065   0.976     3.487   92.857   86.032
LGA    S    70_A      S    70_A     0.326     0    0.645   0.578     2.899   86.905   91.270
LGA    G    71_A      G    71_A     1.023     0    0.091   0.091     1.366   90.714   90.714
LGA    Y    72_A      Y    72_A     0.318     0    0.080   0.117     1.679   97.619   87.619
LGA    I    73_A      I    73_A     0.326     0    0.026   0.059     0.417  100.000  100.000
LGA    E    74_A      E    74_A     0.116     0    0.030   0.838     2.722  100.000   88.201
LGA    V    75_A      V    75_A     0.196     0    0.016   1.212     2.756  100.000   88.844
LGA    E    76_A      E    76_A     0.276     0    0.038   1.502     6.267  100.000   71.852
LGA    E    77_A      E    77_A     0.322     0    0.038   0.284     0.962   97.619   96.825
LGA    L    78_A      L    78_A     0.193     0    0.029   1.327     2.651  100.000   86.964
LGA    K    79_A      K    79_A     0.341     0    0.076   1.129     4.910   97.619   76.508
LGA    N    80_A      N    80_A     0.339     0    0.108   0.344     1.345   97.619   95.298
LGA    F    81_A      F    81_A     0.141     0    0.041   0.096     0.288  100.000  100.000
LGA    L    82_A      L    82_A     0.305     0    0.027   0.095     0.767  100.000   96.429
LGA    K    83_A      K    83_A     0.302     0    0.071   0.625     2.102   97.619   84.974
LGA    C    84_A      C    84_A     0.511     0    0.076   0.078     0.782   95.238   93.651
LGA    F    85_A      F    85_A     0.383     0    0.069   0.208     1.004  100.000   93.983
LGA    S    86_A      S    86_A     0.323     0    0.094   0.098     0.438  100.000  100.000
LGA    D    87_A      D    87_A     0.621     0    0.063   1.105     3.433   90.476   82.024
LGA    G    88_A      G    88_A     0.711     0    0.113   0.113     0.711   95.238   95.238
LGA    A    89_A      A    89_A     0.315     0    0.037   0.050     0.454  100.000  100.000
LGA    R    90_A      R    90_A     0.207     0    0.020   0.162     0.641  100.000   99.134
LGA    V    91_A      V    91_A     0.261     0    0.029   1.093     2.741  100.000   88.844
LGA    L    92_A      L    92_A     0.280     0    0.052   0.062     0.346  100.000  100.000
LGA    N    93_A      N    93_A     0.417     0    0.023   0.389     1.322  100.000   94.167
LGA    D    94_A      D    94_A     0.523     0    0.034   0.092     0.994   92.857   91.667
LGA    K    95_A      K    95_A     0.448     0    0.023   1.151     7.703  100.000   70.741
LGA    E    96_A      E    96_A     0.353     0    0.035   0.120     0.689  100.000   96.825
LGA    T    97_A      T    97_A     0.379     0    0.024   0.102     0.728  100.000   95.918
LGA    S    98_A      S    98_A     0.190     0    0.045   0.559     2.118  100.000   94.127
LGA    N    99_A      N    99_A     0.267     0    0.046   1.107     2.377  100.000   91.190
LGA    F   100_A      F   100_A     0.349     0    0.024   0.524     1.357  100.000   91.472
LGA    L   101_A      L   101_A     0.279     0    0.024   1.097     2.508  100.000   89.048
LGA    A   102_A      A   102_A     0.294     0    0.047   0.049     0.529   97.619   98.095
LGA    A   103_A      A   103_A     0.559     0    0.013   0.034     0.727   92.857   92.381
LGA    G   104_A      G   104_A     0.323     0    0.036   0.036     0.380  100.000  100.000
LGA    D   105_A      D   105_A     0.260     0    0.019   0.128     0.361  100.000  100.000
LGA    S   106_A      S   106_A     0.274     0    0.111   0.612     1.166   97.619   93.730
LGA    D   107_A      D   107_A     0.625     0    0.231   1.133     2.764   88.452   83.095
LGA    G   108_A      G   108_A     0.679     0    0.063   0.063     0.679   92.857   92.857
LGA    D   109_A      D   109_A     0.335     0    0.119   0.187     0.813   97.619   96.429
LGA    H   110_A      H   110_A     0.311     0    0.022   1.301     6.294  100.000   69.667
LGA    K   111_A      K   111_A     0.560     0    0.043   0.713     2.341   97.619   88.783
LGA    I   112_A      I   112_A     0.448     0    0.022   0.119     0.614  100.000   96.429
LGA    G   113_A      G   113_A     0.251     0    0.031   0.031     0.349  100.000  100.000
LGA    V   114_A      V   114_A     0.203     0    0.029   0.125     0.402  100.000  100.000
LGA    D   115_A      D   115_A     0.159     0    0.029   0.203     0.496  100.000  100.000
LGA    E   116_A      E   116_A     0.270     0    0.032   0.193     0.778  100.000   98.942
LGA    F   117_A      F   117_A     0.356     0    0.025   0.086     0.656  100.000   96.537
LGA    K   118_A      K   118_A     0.298     0    0.028   0.689     2.294  100.000   92.169
LGA    S   119_A      S   119_A     0.151     0    0.021   0.046     0.232  100.000  100.000
LGA    M   120_A      M   120_A     0.227     0    0.031   1.084     2.281  100.000   87.798
LGA    A   121_A      A   121_A     0.321     0    0.054   0.056     0.605   97.619   98.095
LGA    K   122_A      K   122_A     0.417     0    0.114   0.997     6.938   97.619   66.243
LGA    M   123_A      M   123_A     0.449     0    0.527   0.781     3.946   86.429   75.536
LGA    T   124_A      T   124_A     0.952     0    0.690   1.085     5.484   63.333   52.381

# RMSD_GDC results:       CA      MC common percent     ALL common percent   GDC_mc  GDC_all
NUMBER_OF_ATOMS_AA:      108     432    432  100.00     820    820  100.00               108
SUMMARY(RMSD_GDC):     0.696          0.752                  1.712           95.226   88.266

#CA            N1   N2   DIST      N    RMSD    GDT_TS    LGA_S3     LGA_Q 
SUMMARY(GDT)  124  108    4.0    108    0.70    98.380    99.249    13.566

LGA_LOCAL      RMSD:   0.696  Number of atoms:  108  under DIST:   4.00
LGA_ASGN_ATOMS RMSD:   0.696  Number of assigned atoms:  108 
Std_ASGN_ATOMS RMSD:   0.696  Standard rmsd on all 108 assigned CA atoms 

Unitary ROTATION matrix and the SHIFT vector superimpose molecules  (1=>2)
  X_new =   0.594885 * X  +  -0.753818 * Y  +  -0.279052 * Z  + -19.862350
  Y_new =   0.518743 * X  +   0.625225 * Y  +  -0.583095 * Z  +  -9.816357
  Z_new =   0.614017 * X  +   0.202118 * Y  +   0.762975 * Z  +  16.028063 

Euler angles from the ROTATION matrix. Conventions XYZ and ZXZ:
           Phi     Theta       Psi   [DEG:       Phi     Theta       Psi ]
XYZ:  0.717131 -0.661140  0.258960   [DEG:   41.0886  -37.8806   14.8373 ]
ZXZ: -0.446357  0.702893  1.252794   [DEG:  -25.5744   40.2728   71.7798 ]
 
# END of job
