
#######################################################
#                                                     #
#                        LGA                          #
#                  ---------------                    #
#                                                     #
#               Local-Global Alignment                #
#        A Method for Finding 3-D Similarities        #
#               in Protein Structures                 #
#                                                     #
#                  ------------ 10/2009               #
#                                                     #
#      Adam Zemla (adamz@llnl.gov)                    #
#      Lawrence Livermore National Laboratory, CA     #
#                                                     #
#######################################################

!!!   License for LGA program has expired  !!!
#   For updated version of the LGA program   #
# please contact Adam Zemla:  adamz@llnl.gov #

# Molecule1: number of CA atoms  124 (  959),  selected  108 , name one
# Molecule2: number of CA atoms  108 (  820),  selected  108 , name two
# PARAMETERS: input.pdb  -ie  -3  -d:4  -sda  -swap  -ch1:A  -ch2:A  
# FIXED Atom-Atom correspondence
# GDT and LCS analysis 

LCS - RMSD CUTOFF   5.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:   108      17_A - 124_A       0.91     0.91
  LCS_AVERAGE:    100.00

LCS - RMSD CUTOFF   2.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:   108      17_A - 124_A       0.91     0.91
  LCS_AVERAGE:    100.00

LCS - RMSD CUTOFF   1.00      length       segment         l_RMS    g_RMS
  LONGEST_CONTINUOUS_SEGMENT:   108      17_A - 124_A       0.91     0.91
  LCS_AVERAGE:    100.00

LCS_GDT    MOLECULE-1    MOLECULE-2     LCS_DETAILS     GDT_DETAILS                                                    TOTAL NUMBER OF RESIDUE PAIRS:  108
LCS_GDT     RESIDUE       RESIDUE       SEGMENT_SIZE    GLOBAL DISTANCE TEST COLUMNS: number of residues under the threshold assigned to each residue pair
LCS_GDT   NAME NUMBER   NAME NUMBER    1.0  2.0  5.0    0.5  1.0  1.5  2.0  2.5  3.0  3.5  4.0  4.5  5.0  5.5  6.0  6.5  7.0  7.5  8.0  8.5  9.0  9.5 10.0
LCS_GDT     S    17_A     S    17_A    108  108  108      4    4    5   13   25   78  103  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K    18_A     K    18_A    108  108  108      4    4    9   46   65  104  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     I    19_A     I    19_A    108  108  108     36  101  104  105  106  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     T    20_A     T    20_A    108  108  108     45  101  104  105  106  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     S    21_A     S    21_A    108  108  108     42  101  104  105  106  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     I    22_A     I    22_A    108  108  108     73  101  104  105  106  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    23_A     L    23_A    108  108  108     76  101  104  105  106  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     N    24_A     N    24_A    108  108  108     76  101  104  105  106  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     P    25_A     P    25_A    108  108  108     76  101  104  105  106  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A    26_A     A    26_A    108  108  108     76  101  104  105  106  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     D    27_A     D    27_A    108  108  108     76  101  104  105  106  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     I    28_A     I    28_A    108  108  108     76  101  104  105  106  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     T    29_A     T    29_A    108  108  108     76  101  104  105  106  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K    30_A     K    30_A    108  108  108     47  101  104  105  106  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A    31_A     A    31_A    108  108  108     67  101  104  105  106  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    32_A     L    32_A    108  108  108     76  101  104  105  106  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    33_A     E    33_A    108  108  108     73  101  104  105  106  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     Q    34_A     Q    34_A    108  108  108     18  101  104  105  106  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     C    35_A     C    35_A    108  108  108     76  101  104  105  106  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A    36_A     A    36_A    108  108  108     11   72  104  105  106  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A    37_A     A    37_A    108  108  108     14   35  104  105  106  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     G    38_A     G    38_A    108  108  108     76  101  104  105  106  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     F    39_A     F    39_A    108  108  108     76  101  104  105  106  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     H    40_A     H    40_A    108  108  108     76  101  104  105  106  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     H    41_A     H    41_A    108  108  108     76  101  104  105  106  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     T    42_A     T    42_A    108  108  108     76  101  104  105  106  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A    43_A     A    43_A    108  108  108     76  101  104  105  106  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     F    44_A     F    44_A    108  108  108     76  101  104  105  106  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     F    45_A     F    45_A    108  108  108     76  101  104  105  106  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K    46_A     K    46_A    108  108  108     76  101  104  105  106  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A    47_A     A    47_A    108  108  108     76  101  104  105  106  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     S    48_A     S    48_A    108  108  108     76  101  104  105  106  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     G    49_A     G    49_A    108  108  108     76  101  104  105  106  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    50_A     L    50_A    108  108  108     60  101  104  105  106  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     S    51_A     S    51_A    108  108  108     60  101  104  105  106  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K    52_A     K    52_A    108  108  108     23  101  104  105  106  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K    53_A     K    53_A    108  108  108     76  101  104  105  106  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     S    54_A     S    54_A    108  108  108     76  101  104  105  106  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     D    55_A     D    55_A    108  108  108     73  101  104  105  106  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A    56_A     A    56_A    108  108  108     76  101  104  105  106  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    57_A     E    57_A    108  108  108     76  101  104  105  106  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    58_A     L    58_A    108  108  108     76  101  104  105  106  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A    59_A     A    59_A    108  108  108     76  101  104  105  106  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    60_A     E    60_A    108  108  108     67  101  104  105  106  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     I    61_A     I    61_A    108  108  108     49  101  104  105  106  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     F    62_A     F    62_A    108  108  108     76  101  104  105  106  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     N    63_A     N    63_A    108  108  108     59  101  104  105  106  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     V    64_A     V    64_A    108  108  108     43  101  104  105  106  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    65_A     L    65_A    108  108  108     73  101  104  105  106  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     D    66_A     D    66_A    108  108  108     76  101  104  105  106  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     G    67_A     G    67_A    108  108  108     76  101  104  105  106  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     D    68_A     D    68_A    108  108  108     73  101  104  105  106  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     Q    69_A     Q    69_A    108  108  108     76  101  104  105  106  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     S    70_A     S    70_A    108  108  108     76  101  104  105  106  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     G    71_A     G    71_A    108  108  108     76  101  104  105  106  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     Y    72_A     Y    72_A    108  108  108     76  101  104  105  106  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     I    73_A     I    73_A    108  108  108     76  101  104  105  106  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    74_A     E    74_A    108  108  108     76  101  104  105  106  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     V    75_A     V    75_A    108  108  108     76  101  104  105  106  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    76_A     E    76_A    108  108  108     76  101  104  105  106  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    77_A     E    77_A    108  108  108     76  101  104  105  106  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    78_A     L    78_A    108  108  108     76  101  104  105  106  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K    79_A     K    79_A    108  108  108     76  101  104  105  106  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     N    80_A     N    80_A    108  108  108     76  101  104  105  106  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     F    81_A     F    81_A    108  108  108     76  101  104  105  106  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    82_A     L    82_A    108  108  108     76  101  104  105  106  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K    83_A     K    83_A    108  108  108     76  101  104  105  106  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     C    84_A     C    84_A    108  108  108     76  101  104  105  106  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     F    85_A     F    85_A    108  108  108     76  101  104  105  106  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     S    86_A     S    86_A    108  108  108     76  101  104  105  106  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     D    87_A     D    87_A    108  108  108     17  101  104  105  106  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     G    88_A     G    88_A    108  108  108     76  101  104  105  106  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A    89_A     A    89_A    108  108  108     71  101  104  105  106  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     R    90_A     R    90_A    108  108  108     76  101  104  105  106  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     V    91_A     V    91_A    108  108  108     76  101  104  105  106  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L    92_A     L    92_A    108  108  108     76  101  104  105  106  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     N    93_A     N    93_A    108  108  108     67  101  104  105  106  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     D    94_A     D    94_A    108  108  108     76  101  104  105  106  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K    95_A     K    95_A    108  108  108     60  101  104  105  106  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E    96_A     E    96_A    108  108  108     76  101  104  105  106  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     T    97_A     T    97_A    108  108  108     76  101  104  105  106  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     S    98_A     S    98_A    108  108  108     76  101  104  105  106  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     N    99_A     N    99_A    108  108  108     76  101  104  105  106  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     F   100_A     F   100_A    108  108  108     76  101  104  105  106  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     L   101_A     L   101_A    108  108  108     76  101  104  105  106  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A   102_A     A   102_A    108  108  108     76  101  104  105  106  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A   103_A     A   103_A    108  108  108     47  101  104  105  106  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     G   104_A     G   104_A    108  108  108     76  101  104  105  106  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     D   105_A     D   105_A    108  108  108     76  101  104  105  106  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     S   106_A     S   106_A    108  108  108     76  101  104  105  106  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     D   107_A     D   107_A    108  108  108     60  101  104  105  106  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     G   108_A     G   108_A    108  108  108     75  101  104  105  106  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     D   109_A     D   109_A    108  108  108     76  101  104  105  106  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     H   110_A     H   110_A    108  108  108     76  101  104  105  106  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K   111_A     K   111_A    108  108  108     76  101  104  105  106  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     I   112_A     I   112_A    108  108  108     76  101  104  105  106  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     G   113_A     G   113_A    108  108  108     76  101  104  105  106  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     V   114_A     V   114_A    108  108  108     76  101  104  105  106  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     D   115_A     D   115_A    108  108  108     76  101  104  105  106  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     E   116_A     E   116_A    108  108  108     76  101  104  105  106  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     F   117_A     F   117_A    108  108  108     76  101  104  105  106  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K   118_A     K   118_A    108  108  108     76  101  104  105  106  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     S   119_A     S   119_A    108  108  108     76  101  104  105  106  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     M   120_A     M   120_A    108  108  108     76  101  104  105  106  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     A   121_A     A   121_A    108  108  108     76  101  104  105  106  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     K   122_A     K   122_A    108  108  108     53  101  104  105  106  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     M   123_A     M   123_A    108  108  108     14   44  104  105  106  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_GDT     T   124_A     T   124_A    108  108  108      3    4   19   33  106  106  107  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108  108 
LCS_AVERAGE  LCS_A: 100.00  ( 100.00  100.00  100.00 )

GLOBAL_DISTANCE_TEST (summary information about detected largest sets of residues (represented by selected AToms) that can fit under specified thresholds)
GDT DIST_CUTOFF  0.50   1.00   1.50   2.00   2.50   3.00   3.50   4.00   4.50   5.00   5.50   6.00   6.50   7.00   7.50   8.00   8.50   9.00   9.50  10.00
GDT NUMBER_AT     76    101    104    105    106    106    107    108    108    108    108    108    108    108    108    108    108    108    108    108 
GDT PERCENT_AT  70.37  93.52  96.30  97.22  98.15  98.15  99.07 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00 100.00
GDT RMS_LOCAL    0.34   0.45   0.52   0.54   0.61   0.61   0.75   0.91   0.91   0.91   0.91   0.91   0.91   0.91   0.91   0.91   0.91   0.91   0.91   0.91
GDT RMS_ALL_AT   0.93   0.93   0.93   0.93   0.92   0.92   0.92   0.91   0.91   0.91   0.91   0.91   0.91   0.91   0.91   0.91   0.91   0.91   0.91   0.91

# Checking swapping
#   possible swapping detected:  F    44_A      F    44_A
#   possible swapping detected:  F    45_A      F    45_A
#   possible swapping detected:  E    57_A      E    57_A

#      Molecule1      Molecule2  DISTANCE    Mis    MC     All    Dist_max   GDC_mc  GDC_all
LGA    S    17_A      S    17_A     5.411     0    0.648   0.646     5.603   31.786   30.000
LGA    K    18_A      K    18_A     4.357     0    0.025   0.902     7.775   45.714   32.381
LGA    I    19_A      I    19_A     0.900     0    0.185   1.536     4.868   86.429   71.071
LGA    T    20_A      T    20_A     0.723     0    0.119   0.985     3.961   88.214   78.639
LGA    S    21_A      S    21_A     0.882     0    0.018   0.671     1.723   90.595   86.111
LGA    I    22_A      I    22_A     0.530     0    0.051   1.148     3.851   95.238   77.738
LGA    L    23_A      L    23_A     0.479     0    0.060   0.080     0.712   97.619   94.048
LGA    N    24_A      N    24_A     0.487     0    0.036   1.154     4.151  100.000   81.488
LGA    P    25_A      P    25_A     0.585     0    0.038   0.310     1.576   95.238   89.388
LGA    A    26_A      A    26_A     0.269     0    0.027   0.041     0.360  100.000  100.000
LGA    D    27_A      D    27_A     0.359     0    0.035   0.076     0.643  100.000   97.619
LGA    I    28_A      I    28_A     0.317     0    0.022   0.220     1.177  100.000   96.488
LGA    T    29_A      T    29_A     0.407     0    0.028   0.120     0.578   97.619   97.279
LGA    K    30_A      K    30_A     0.656     0    0.039   1.288     6.527   92.857   70.899
LGA    A    31_A      A    31_A     0.560     0    0.049   0.055     0.637   90.476   92.381
LGA    L    32_A      L    32_A     0.212     0    0.034   0.224     1.336  100.000   94.167
LGA    E    33_A      E    33_A     0.536     0    0.017   0.846     3.382   92.857   80.476
LGA    Q    34_A      Q    34_A     0.936     0    0.055   1.086     2.313   88.214   81.746
LGA    C    35_A      C    35_A     0.687     0    0.032   0.824     1.243   90.595   87.540
LGA    A    36_A      A    36_A     1.800     0    0.040   0.047     2.417   72.976   71.333
LGA    A    37_A      A    37_A     1.871     0    0.318   0.316     3.071   67.143   68.286
LGA    G    38_A      G    38_A     0.139     0    0.053   0.053     0.422  100.000  100.000
LGA    F    39_A      F    39_A     0.233     0    0.028   0.067     0.581  100.000   98.268
LGA    H    40_A      H    40_A     0.356     0    0.037   0.303     2.169  100.000   86.381
LGA    H    41_A      H    41_A     0.380     0    0.037   0.200     0.944  100.000   96.190
LGA    T    42_A      T    42_A     0.521     0    0.027   1.115     2.438   92.857   85.850
LGA    A    43_A      A    43_A     0.489     0    0.029   0.045     0.581   97.619   98.095
LGA    F    44_A      F    44_A     0.373     0    0.029   0.090     0.643  100.000   97.403
LGA    F    45_A      F    45_A     0.348     0    0.047   0.586     1.664  100.000   90.823
LGA    K    46_A      K    46_A     0.431     0    0.044   0.987     6.670  100.000   70.582
LGA    A    47_A      A    47_A     0.361     0    0.042   0.050     0.387  100.000  100.000
LGA    S    48_A      S    48_A     0.333     0    0.036   0.040     0.636   97.619   98.413
LGA    G    49_A      G    49_A     0.441     0    0.075   0.075     0.561   97.619   97.619
LGA    L    50_A      L    50_A     0.682     0    0.026   0.240     1.321   90.476   88.214
LGA    S    51_A      S    51_A     0.637     0    0.155   0.143     1.426   88.214   85.952
LGA    K    52_A      K    52_A     0.847     0    0.133   0.714     2.229   88.214   81.640
LGA    K    53_A      K    53_A     0.456     0    0.028   0.333     0.948   97.619   94.709
LGA    S    54_A      S    54_A     0.256     0    0.040   0.613     2.077  100.000   94.127
LGA    D    55_A      D    55_A     0.407     0    0.075   1.014     3.936  100.000   82.917
LGA    A    56_A      A    56_A     0.242     0    0.028   0.043     0.281  100.000  100.000
LGA    E    57_A      E    57_A     0.069     0    0.021   0.379     0.898  100.000   97.884
LGA    L    58_A      L    58_A     0.155     0    0.044   0.214     0.997  100.000   96.429
LGA    A    59_A      A    59_A     0.278     0    0.036   0.051     0.502  100.000   98.095
LGA    E    60_A      E    60_A     0.549     0    0.031   0.594     3.373   92.857   76.772
LGA    I    61_A      I    61_A     0.594     0    0.036   0.160     0.860   90.476   90.476
LGA    F    62_A      F    62_A     0.243     0    0.034   0.114     0.789  100.000   96.537
LGA    N    63_A      N    63_A     0.605     0    0.084   0.097     1.770   92.857   86.071
LGA    V    64_A      V    64_A     0.850     0    0.074   1.163     3.966   90.476   78.776
LGA    L    65_A      L    65_A     0.568     0    0.037   0.092     1.057   95.238   91.726
LGA    D    66_A      D    66_A     0.435     0    0.080   0.199     1.226  100.000   95.298
LGA    G    67_A      G    67_A     0.417     0    0.101   0.101     0.613   97.619   97.619
LGA    D    68_A      D    68_A     0.478     0    0.126   0.266     0.734  100.000   95.238
LGA    Q    69_A      Q    69_A     0.341     0    0.067   0.887     4.289   97.619   83.069
LGA    S    70_A      S    70_A     0.169     0    0.040   0.046     0.436  100.000  100.000
LGA    G    71_A      G    71_A     0.253     0    0.041   0.041     0.253  100.000  100.000
LGA    Y    72_A      Y    72_A     0.306     0    0.034   0.150     1.169  100.000   95.278
LGA    I    73_A      I    73_A     0.371     0    0.028   0.079     0.527  100.000   98.810
LGA    E    74_A      E    74_A     0.166     0    0.025   0.121     0.408  100.000  100.000
LGA    V    75_A      V    75_A     0.107     0    0.020   0.130     0.567  100.000   98.639
LGA    E    76_A      E    76_A     0.251     0    0.026   0.351     0.980  100.000   95.767
LGA    E    77_A      E    77_A     0.265     0    0.054   0.124     0.617   97.619   98.942
LGA    L    78_A      L    78_A     0.183     0    0.037   1.326     3.103  100.000   87.024
LGA    K    79_A      K    79_A     0.312     0    0.062   0.791     2.434   97.619   91.111
LGA    N    80_A      N    80_A     0.387     0    0.075   1.245     4.074   97.619   78.512
LGA    F    81_A      F    81_A     0.346     0    0.034   0.093     0.460  100.000  100.000
LGA    L    82_A      L    82_A     0.406     0    0.017   0.129     0.625  100.000   96.429
LGA    K    83_A      K    83_A     0.476     0    0.047   0.823     3.056   95.238   76.984
LGA    C    84_A      C    84_A     0.501     0    0.040   0.818     3.296   97.619   88.492
LGA    F    85_A      F    85_A     0.547     0    0.044   0.144     0.706   90.476   92.208
LGA    S    86_A      S    86_A     0.699     0    0.086   0.101     0.985   90.476   93.651
LGA    D    87_A      D    87_A     1.059     0    0.670   0.991     4.340   72.024   64.226
LGA    G    88_A      G    88_A     0.615     0    0.051   0.051     0.793   90.476   90.476
LGA    A    89_A      A    89_A     0.737     0    0.032   0.045     0.808   90.476   90.476
LGA    R    90_A      R    90_A     0.586     0    0.027   0.237     0.633   90.476   95.671
LGA    V    91_A      V    91_A     0.323     0    0.029   1.036     2.444  100.000   89.932
LGA    L    92_A      L    92_A     0.332     0    0.053   0.594     1.551  100.000   93.214
LGA    N    93_A      N    93_A     0.617     0    0.054   0.785     2.451   95.238   87.381
LGA    D    94_A      D    94_A     0.401     0    0.053   1.083     4.022   97.619   81.190
LGA    K    95_A      K    95_A     0.620     0    0.048   0.720     4.470   92.857   79.788
LGA    E    96_A      E    96_A     0.430     0    0.030   0.106     0.516  100.000   98.942
LGA    T    97_A      T    97_A     0.520     0    0.031   1.023     2.215   97.619   88.367
LGA    S    98_A      S    98_A     0.353     0    0.034   0.595     1.923  100.000   95.476
LGA    N    99_A      N    99_A     0.320     0    0.048   0.888     3.535  100.000   82.917
LGA    F   100_A      F   100_A     0.468     0    0.027   0.676     1.619  100.000   89.870
LGA    L   101_A      L   101_A     0.369     0    0.018   1.173     2.680  100.000   89.286
LGA    A   102_A      A   102_A     0.361     0    0.041   0.047     0.559   97.619   98.095
LGA    A   103_A      A   103_A     0.732     0    0.013   0.037     0.920   90.476   90.476
LGA    G   104_A      G   104_A     0.559     0    0.038   0.038     0.638   92.857   92.857
LGA    D   105_A      D   105_A     0.462     0    0.039   0.091     0.626   97.619   97.619
LGA    S   106_A      S   106_A     0.409     0    0.145   0.624     1.089   97.619   93.730
LGA    D   107_A      D   107_A     0.677     0    0.142   0.250     1.897   90.595   86.071
LGA    G   108_A      G   108_A     0.548     0    0.048   0.048     0.548   97.619   97.619
LGA    D   109_A      D   109_A     0.293     0    0.117   0.168     0.781   97.619   96.429
LGA    H   110_A      H   110_A     0.346     0    0.021   1.124     2.221  100.000   89.238
LGA    K   111_A      K   111_A     0.426     0    0.046   0.593     1.573  100.000   92.751
LGA    I   112_A      I   112_A     0.491     0    0.015   0.077     0.855  100.000   95.238
LGA    G   113_A      G   113_A     0.238     0    0.028   0.028     0.346  100.000  100.000
LGA    V   114_A      V   114_A     0.323     0    0.023   1.120     2.594  100.000   88.844
LGA    D   115_A      D   115_A     0.279     0    0.047   0.433     2.097  100.000   90.952
LGA    E   116_A      E   116_A     0.377     0    0.049   0.353     0.954  100.000   96.825
LGA    F   117_A      F   117_A     0.440     0    0.032   0.107     0.777  100.000   94.805
LGA    K   118_A      K   118_A     0.388     0    0.031   0.157     1.244  100.000   95.820
LGA    S   119_A      S   119_A     0.173     0    0.020   0.717     2.480  100.000   94.127
LGA    M   120_A      M   120_A     0.239     0    0.028   0.963     3.346  100.000   93.750
LGA    A   121_A      A   121_A     0.383     0    0.043   0.047     0.639   97.619   98.095
LGA    K   122_A      K   122_A     0.655     0    0.115   0.761     6.012   90.595   66.931
LGA    M   123_A      M   123_A     1.557     0    0.251   1.348     7.299   73.333   50.714
LGA    T   124_A      T   124_A     2.900     0    0.215   1.168     6.819   64.881   51.429

# RMSD_GDC results:       CA      MC common percent     ALL common percent   GDC_mc  GDC_all
NUMBER_OF_ATOMS_AA:      108     432    432  100.00     820    820  100.00               108
SUMMARY(RMSD_GDC):     0.911          0.882                  1.488           94.564   88.627

#CA            N1   N2   DIST      N    RMSD    GDT_TS    LGA_S3     LGA_Q 
SUMMARY(GDT)  124  108    4.0    108    0.91    97.685    98.729    10.678

LGA_LOCAL      RMSD:   0.911  Number of atoms:  108  under DIST:   4.00
LGA_ASGN_ATOMS RMSD:   0.911  Number of assigned atoms:  108 
Std_ASGN_ATOMS RMSD:   0.911  Standard rmsd on all 108 assigned CA atoms 

Unitary ROTATION matrix and the SHIFT vector superimpose molecules  (1=>2)
  X_new =   0.201285 * X  +  -0.945134 * Y  +  -0.257305 * Z  +  24.158701
  Y_new =  -0.339903 * X  +  -0.313753 * Y  +   0.886580 * Z  +   1.982940
  Z_new =  -0.918668 * X  +  -0.090997 * Y  +  -0.384408 * Z  +  35.234966 

Euler angles from the ROTATION matrix. Conventions XYZ and ZXZ:
           Phi     Theta       Psi   [DEG:       Phi     Theta       Psi ]
XYZ: -1.036144  1.164694 -2.909152   [DEG:  -59.3666   66.7321 -166.6821 ]
ZXZ: -2.859131  1.965362 -1.669527   [DEG: -163.8161  112.6070  -95.6569 ]
 
# END of job
